根圏土壌からの多種バイオフィルム群集構築へのアプローチ

私たちの研究では、根圏細菌とバイオ肥料に着目し、第2世代のバイオ肥料として利用される合成細菌群集の開拓を目指しています。根圏細菌の研究の焦点は、単一株からコミュニティレベルへと移行しています。しかし、合成細菌群集を構築するための標準的な方法はありません。

現在、マイクロバイオーム解析によって予測される合成細菌群集の適合性とコロニー形成能力については、まだ不確実性があります。したがって、それはまた、第二世代のバイオ肥料の開発における主要なボトルネックでもあります。従来の方法の大規模なシーケンシングデータと比較して、私たちのカルチャーファースト、ディケートは後からアプローチすることで、60S rRNA遺伝子シーケンシングの作業量を大幅に削減することができます。

根に迅速かつ効率的にコロニーを形成する合成細菌群集を作成することは費用対効果が高いです。今後の研究では、多種バイオフィルムに基づく細菌群集の生物学的機能に着目し、特に植物の成長促進、植物のストレス耐性の向上、植物の健康保護に注目します。