著者スポットライト: Streamlining Visual Dynamics to Simplify Molecular Dynamics Simulations Using Gromacs

私たちの目的は、分子動力学を用いた準備とシミュレーションを容易にするツールを学術コミュニティに提供することです。この目標をWebアプリケーションで提供することは可能ですか?初心者でも有効に使うことは可能ですか?

私たちは、これらの質問にソフトウェアで答えようとしています。分子動力学には多くの課題があります。その中でも際立っているのは、リガンドのパラメータ化の準備、シミュレーションガイドラインの学習曲線、シミュレーション時間、および新しい分析の実装です。

私たちは主に、初心者から上級者まで、すべてのユーザーを導く秘密のパイプラインを作成するための研究を始めるための学習曲線に取り組んでいます。このツールへのアクセスに対する高い需要は、バイオサイエンス研究のギャップを示しています。このツールの開発は、分子動力学の使用と学習における大きな進歩を表していると考えています。

その結果、より多くの人々がこれらのテストを研究に実装できるようになります。将来的には、より多くの力場を持つ複雑なシミュレーションのパラメータ化と実行を拡大していく予定です。