Method Article
In this paper, an experimental framework to perform closed-loop experiments is presented, in which information processing (i.e., coding and decoding) and learning of neuronal assemblies are studied during the continuous interaction with a robotic body.
Information coding in the Central Nervous System (CNS) remains unexplored. There is mounting evidence that, even at a very low level, the representation of a given stimulus might be dependent on context and history. If this is actually the case, bi-directional interactions between the brain (or if need be a reduced model of it) and sensory-motor system can shed a light on how encoding and decoding of information is performed. Here an experimental system is introduced and described in which the activity of a neuronal element (i.e., a network of neurons extracted from embryonic mammalian hippocampi) is given context and used to control the movement of an artificial agent, while environmental information is fed back to the culture as a sequence of electrical stimuli. This architecture allows a quick selection of diverse encoding, decoding, and learning algorithms to test different hypotheses on the computational properties of neuronal networks.
뇌 기능의 많은 기능은 인공 시스템에 복제 할 현재 불가능하다. 응답하여, 빠르게 복잡한 감각 정보를 처리 및 생성하는 뇌의 능력은, 정확한 모터 명령은 이미 현재의 최첨단 넘어 자체이다. 그러나 과거의 경험에서 학습에 의해 서로 다른 조건에 적응하는 능력은 인간 개발 한 제어 시스템에 그렇게 크게 우수합니다. 지금까지, 복제하거나이 가소성이 작은 성공을 충족 악용하려는 시도는, 뇌의 내부 동작의 이해는 연구자의 이해를 회피하고있다. 주요 이슈 중 하나는 뇌와 행동 사이의 관계를 조사하는 것은 적절 시스템의 모든 변수에 액세스 할 수 없다는 것이다 동안 : 이상적으로, 최적의 실험 구성은 뉴런의 다수의 동시 기록 및 자극을 허용하는, 장기 안정성 시냅스 위치와 무게, 제어 가능한 양방향 된 directio의 모니터링환경과 최종 상호 작용. 동시에 모든 변수를 추적의 어려움은 매우 다른 두 규모에서 뇌 - 행동 관계의 연구에지도 : 두 실험 조건 1-7 이상 또는 부분 작은, 절연 부품, 아니 잘 제어, 동물을 행동으로 시스템 8의 전반적인 볼 수있는 신경 조직,. 더 고안 실험 구성도 간단한 신경망의 동작에 관련된 모든 파라미터의 완전한 모니터링 할 수 없을 때, 후자의 경우에는, 좋은 트레이드 오프는 마이크로 전극 어레이 (다자간) 9 위에 성장 해리 뉴런에 의해 제공된다. 70의 (10)의 단부에 태어난 장치는, 전통적인 전기 생리학 기술에 비해 몇 가지 장점이있다 : 첫째, 기록 가능성의 일단 (일반적으로 전극 (60))에서 다수의 상이한 위치에서 신경망을 자극. 또한, 셀의 MEA 결합 거의 비 침습적 인몇 달 11 일까지 장시간을위한 동일한 네트워크의 관찰을 허용한다. 해리 문화에 전기 자극의 생리적 효과는 광범위 아키텍처의 손실에도 불구하고 보존 많은 속성 (예, 소성를 들어, 다음과 같은 간단한 메모리가 12 ~ 14 처리) 이상 규모에서 관찰 드러내는, 이러한 장치 덕분에 연구되어왔다. 문화 성장하는 동안, 그 네트워크는 시험 관내 (DIV)에서 7 일 정도 (15, 16)에서 자발적인 활동을 보여주는 시작합니다. 네트워크 작동이 더욱 성장 라디칼 변화 경향; 첫 싱글 스파이크는 네트워크의 성숙 상태를 나타내는 18 버스트 동기 비주기적인 네트워크의 매우 복잡한 패턴으로 변경 이후로, 17 (둘째 주의 끝으로) 버스트에 모여있다. 그것은 19 일으키는 것으로 시사되어왔다 생체 레코드에서 관찰 된 것과 다소 유사한 동작이 동기,잠자는 동물 INGS는 감각 입력의 부족에 의해 발생합니다.
다른 방법은 다른 유형의 신호가 신경 네트워크 자체 11,20-23의 자극을 제어하는 데 사용 된 폐쇄 루프 실험을 수행함으로써 촬영 된 코딩 정보의 더 나은 이해를 얻기 위해 시도했다. 이들 실험에서, 환경과의 상호 작용을 할 수있는 외부 에이전트가 차례로 이펙터기구 용 모터 명령을 생성, 신경 네트워크에 공급 감각 정보를 생성하는 데 사용되어왔다. 이 신경 시스템의 동적 적응 특성은 환경에 의한 변화에 따라 진화 방법의 관찰을 허용했다.
수행 할 수있는 설정이 실험 바퀴 달린 센서 플랫폼 (실제 로봇을 사용하거나 가상 모델) 분야에 대한 이동 및 속도 프로파일이 신경 세포의 활동에 의해 결정되는 경우, 개발 된 '신경 생리학이 구현'시스템 (즉, MEA를 통해 배양 된 쥐의 신경 세포의 인구). 로봇은 두 개의 독립적으로 제어되는 바퀴의 속도 프로파일과의 거리에 의해 센서의 판독 전류에 의해 특징된다. 거리 센서의 정확한 특성은 관련이 없다; 그들은 광학 센서 또는 초음파 센서 능동 또는 수동 수있다. 분명히,이 문제는 센서가 임의의 원하는 형상으로 설계 될 수있는 가상 로봇의 경우에는 적용되지 않는다.
본원에 기재된 실험에서 사용 된 로봇은 30 °를 가리키는 6 거리 센서, 양 방향으로 향하고 로봇으로부터 60 ° 및 90 °로, 항상 가상 구현이다. 세 좌우 센서의 활성은 평균화 및 생물학적 배양의 활성은 단지 '왼쪽'및 '오른쪽'센서 나머지로 지칭 될 것이다 예컨대 '슈퍼 센서'(의해 수집 된 정보에 의해 구동되고 이 작품의). 프로토설명 COL은 실제로 상당히 약간의 조정과 실제 로봇에 적용 할 수있다. 로봇 (실제 또는 가상 하나)에 의해 수집 된 정보는 물리적으로 분리된다 로봇 생물학적 신경망의 활성을 조작하는 데 사용되는 자극의 직렬로 인코딩된다. 자극 자체는 모두 동일하며, 따라서 어떤 정보를 코딩하지 않습니다. 어떤 중요한 것은 그들의 주파수 : 자극 속도가 증가 로봇 다른 배달 사이트 로봇의 좌우의 눈 '로부터 감각 정보를 부호화하여, 장애물에 접근 할 때. 신경망은 자극의 트레인으로 들어오는 다른 응답을 제공한다 : 복호화 알고리즘의 작업 로봇의 바퀴를 제어하기 위해 사용하는 명령으로 인한 네트워크 활동을 변환하는 것이다. (즉, 신뢰성과 완전히 다른 전극으로부터 자극에 대한 반응을 분리)와 함께 '완벽한'네트워크 동작을 감안할 때,이 resul 것로봇의 t은 장애물을 타격하지 않고 경기장에서 운전. 따라서 간단한 학습 프로토콜을 도입 관념성에서 존재하는 문제를 매우 다른 대부분의 네트워크, (24, 25에 기술 된 프로토콜에 의해 영감을 고주파 자극에 대한 간단한 주문, 2 초 동안 20 Hz의 자극) 활성화, 파상풍의 자극 다음 장애물과 충돌이 전달된다. 네트워크 연결 로컬 강화 파상풍 자극의 결과는,이 로봇의 네비게이션 기능의 점진적인 증가를 초래한다면.
HyBrainWare2 26 출판 맞춤형 소프트웨어의 개선 된 버전이 시스템 (자극기, 데이터 수집, 처리 및 시각화 로봇 통신 또는 시뮬레이션)의 다른 장치들의 제어를 처리하기 위해 개발 코어 아키텍처이다. 이 소프트웨어는 우리가 실험실에서 개발 요청시 무료로 사용할 수있다. 이는 소프트웨어 인터페이스를 제공한다데이터 획득 보드는 : 사용자가 GUI에서 데이터 수집을 시작하면, 소프트웨어는 샘플링 및 기록 전극으로부터 데이터의 A / D 변환을 시작하는 수집 보드를 제어한다. 이 데이터는 그 다음 사용자가 설정 한 옵션에 따라, 녹화 된 화면 또는 스파이크를 검출하도록 실시간으로 분석 할 수있는 표시 (자세한 절차 섹션 참조). 또한, 소프트웨어 내에서, (로봇 모터 명령에 기록 된 활동의 번역) (전기 자극으로 감각 정보의 번역) 및 디코딩을 코딩의 정의 알고리즘을 지정해야합니다. 모든 기록 된 정보를 자동 호환 형식으로 저장되는 동안 특히, 우리의 설치, 우측 실제 실험을 시작하기 전에 거의 모든 변수는 사용자가 액세스 할 수 있기 때문에, 과거 27 년 설계 유사한 시스템에 비하여 상대적으로 사용자 친화적 인 신경 데이터 분석 도구 상자 (28).
다음 절차 섹션은 해리 된 래트 해마의 배양 학습 실험을 설명하는 모든 배양 실험 매개 변수는 특정 제조에 대해 제공되며, 다른 생물학적 기판이 사용되는 경우에 변형 될 필요가있다. 유사하게, 설명 된 실험은 파상풍 자극의 학습 효과를 조사하기 위해 폐쇄 루프 아키텍처를 활용하지만, 구조 자체가 충분한가요 성 해리 신경망의 다른 기능 연구에 사용한다. 제안 된 실험의 주요 변종이 더 토론 섹션에 설명되어 있습니다.
MEA를 통해 신경 세포의 문화 1. 준비
MEA 취득에 대한 기록 매개 변수의 2. 선택
신경 세포 문화 및 응답지도 계산을 자극하는 MEA 전극 3. 선택
4. 로봇과의 연결을 문화의 인터페이스 : 코딩 및 디코딩 방식의 선택
로봇에 대한 탐색 아레나 5. 디자인
문화에서 녹음 신경 세포 활동에 MEA 전극 6. 선택
7. 신경 로봇 실험을 수행
8. 두 번째 응답지도 계산
개발 실험 프레임 워크는 뉴런의 문화와 실제 로봇의 가상 실현 사이의 정보 교환이 가능 여부의 테스트를 허용 (34).도 1은 상이한 조건에서 20 분간 실험에서 가상 로봇에 의해 이동 수득 경로의 여러 샘플을 나타낸다 : 적절한 폐쇄 루프 실험, '비어있는 MEA'로봇 실험 (어떤 셀이 제어 실험 MEA에 도금되지 않는다) 및 개방 루프 로봇 실험을 좌에서 우로 (자극 레이트 대신 부호화 센서 정보 상수) 표시됩니다. 대표적인 트레이스 인공 신경 요소 간의 양방향 상호 작용이 좋은 로봇의 탐색 성능을 얻기 위해 필요하다는 것을 확인한다. 그렇지만, 로봇은 장애물에 대해 여러 히트 경험한다.
도 2 로봇의 탐색 성능을 E후속 안타 사이에 여행을 픽셀로 xpressed, 다른 조건에 표시됩니다. 세 번째와 네 번째 열이없이 각각과 성능을 표시하면서 첫 번째 두 열은, 각각 다음 파상풍 자극의 전달 ( '빈 MEA'및 개방 루프 구성) 상술 한 대조 실험에서 주행 거리의 분포를 표시 장애물에 명중했다. 파상풍의 자극 (참조, 절차, 포인트 7.2)의 도입은 거리가 이렇게 로봇 (35)의 탐색 성능을 향상, 두 개의 연속 안타 사이에 여행을 크게 향상시킨다.
도 3에서, 상이한 복호 상태와 로봇의 탐색 성능이 제공된다. 이를 위해, 다양한 분야 구성이 채택되고있다. 이 분야에서 로봇 (36)의 성공적인 탐색 정량화 도왔다 절차의 단계 4.1에 기재된 바와 같이, 로봇은짧은 트랙의 시리즈를 선보였다. 성공률은 단순히 제시 트랙 수가 성공적 위에 교차 트랙 수의 비율이다. 특히, 실험 중에 버스트 절연 스파이크 실시간 확인을 실시 하였다. 디코딩 패러다임 때문에 버스트 및 격리 된 스파이크의 상대적 무게의 다른 다를 (참조, 절차, 3.5-3.6 및 토론 포인트).
그림 1 : 신경 네트워크와 로봇은 정보의 양방향 교환을 가지고이 그림은 실험 20 분에 걸쳐 로봇에 의해 여행 대표적인 3 가지 경로를 보여줍니다.. 짙은 녹색 픽셀이 로봇은 거리 센서를 통해 감지 할 수있는 지나갈 장애물을 나타내는 반면, 로봇,에 이동하는 특히, 밝은 녹색 지역은 무료입니다. 각각의 시험에서, 로봇 내가 시작n은 경기장의 좌측 상단과 큰 핑크 점으로 묘사 된 최종 위치로 이동합니다. 컬러 코딩 패스가 이동 로봇의 시간 변화의 표시를 제공하면서보다 작은 검은 점은, 히트 장해물을 나타낸다. 오른쪽 색상 막대는 시간 (분) 실험의 선두로부터 경과 된 표현한다. (A) 경로는 폐쇄 루프 실험 중에 하였다. (B) 경로가 '비어있는'MEA 실험 중에 다음 (더 셀 MEA 배양 없다 표면) (자극 속도가 실험을하는 동안 일정) 오픈 루프 실험 기간 동안 다음에. (C)의 경로입니다. 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2 : 성능 결과를 폐쇄에 의해 영향을받는-loop 및 파상풍의 자극.이 그래프는 서로 다른 조건에서 연속 안타의 로봇에 의해 덮여 거리의 분포를보고합니다. 특히, 처음 두 배포판 대표 제어 실험 (MEA, '블라인드'로봇 실험 '열기 루프'(OL)에 도금없이 신경 세포와 레코딩을위한 '빈')가. 마지막 두 열은 장애물에 대한 히트 다음 문화에 전달되는, (CL)없이 (CL + TS) 파상풍의 자극 (TS)를 통해 구현 학습 프로토콜 '폐쇄 형 루프'상태를 나타냅니다. 각각의 박스에서, 세그먼트는 중앙 수평 분포, 평균값, 중앙 바 첫번째와 세번째 분위수 연장 수염 다섯 번째 및 95 번째 백분위 수에 연장 빈 사각형의 중앙값을 나타낸다. 이상 점은 다이아몬드로 표시됩니다. 통계 분산 채택 Kruskall-월리스 편도 분석을 사용하여 수행 된순위에 : 학생 - 뉴먼 - Keuls 페어 와이즈 비교 모든 중간 값은 P <0.05 유의 한 차이가 있음을 알 수있다.
도 3 : 로봇 복호 성능에 영향을 그래프 상기 확률을 나타내고, 소정의 복호 알고리즘, 로봇이 제한된 시간에 짧은 트랙을 통해 성공적으로 이동할.. 버스트 및 절연 스파이크의 확인 실험 자체 동안에 실시간으로 수행된다. 첫 번째 경우 ( '스파이크')에서 검출 된 모든 스파이크에 속하는 버스트 0의 가중치가, 각각에 설정 한 두 번째 및 세 번째 분포 절연 스파이크와 스파이크, 동일한 상대 가중치를 제시한다. 마지막 두 열은 모든 스파이크가 회계 경우에 얻어진 결과를 나타내지 만 상이한 상대적인 중량으로 위치에 따라.가중치가 다섯 번째 열 데이터에 대하여 복호화를위한 반전되는 동안 열 넷째 절연 스파이크 특히, 버스트 이벤트보다 상대적 가중치를 부여 하였다. 중앙 바는 첫 번째와 세 번째 분위수 연장 수염 다섯 번째 및 95 번째 백분위 수를 확장하면서 각 그래프에서, 중심선은, 분포, 빈 사각형 평균값의 중앙값을 나타낸다. 통계 순위에 분산 채택 Kruskall-월리스 편도 분석을 이용하여 수행되었다. 페어 와이즈 비교 (학생 뉴만-Keuls 방법은)으로 유의 한 차이 (p <0.05), 4 열 1, 2, 4, 2, 5, 2, 3 사이에서 관찰 될 수 있다는 것을 보여준다.
본 논문에서는 신경 로봇 아키텍처 (즉, 피질 또는 배아 쥐의 해마에서 오는 신경 세포의 네트워크), 양방향 가상 로봇에 연결된 신경 컨트롤러를 기반으로 제공됩니다. 센서와 바퀴가 로봇은 장애물과 정적 경기장에서 강제 이동 및 작업은 충돌을 피하는 구성되어 있습니다.
실패율도 기술적 조건에서 가장 중요한 경향 기재된 바와 같이 프로 시저의 첫 번째 및 아마도 가장 중요한 측면은, 배양 물 자체의 제조이다. 배양 기술의 상세한 설명은 본 작업의 범위 밖에 있지만,이다. 네트워크 연소율 보통 시험관 3 주 후, 안정된 상태에 도달하면 일반적인 지침으로서, 기록이 발생한다. 건강한 문화의 거친 표시는 여러 기록 chann의 자발적인 전기 생리 활동의 존재입니다ELS (적어도 20 개의 채널을 사용할 수 60). 이러한 배양 신경 간 연결 높은 것을 특징으로한다. 이러한 조건에서 신경 활동은 일반적으로 강하게 시간에, 그것은 분 동안 침묵 기간 (37)에 의해 다음에 강렬한 스파이크와 함께, 간질 이벤트를 표시, 동기화된다. 이러한 기능은 모두 문제가 제시 : 과도한 동기화가 간질 활성을 나타내는 문화가 침묵 기간 다음에 활동의 긴 폭발되게 최초의 자극에 반응하면서 불가능에 관계없이, 다른 전극에서 자극에 대한 반응을 구별하는 것 어떤 연속적인 자극 전달했다. 이러한 두 문제는 강하게 신경 인구가 두 개 이상의 약하게 상호 서브 그룹으로 분할되어있는 패터닝 된 배양 물 (35)의 채용에 의하여 개선 될 수있다.
또 다른 문제는 신경 응답이 강하게 들어오는 STIMUL의 분포에 의존한다는 것입니다난 (38, 39). 폐쇄 루프 실험에서 자극 전달은 차례로, 이동 로봇의 결과 때문에 신경 자체의 응답이며, 센서 판독의 함수이다. 이는 실제 실험 기간 동안 관찰됩니다 어떤 반응을 사전에 구축하는 쉬운 방법이 없다는 것을 의미한다. 그 결과, 입출력 전극의 선택은 연속적인 근사치에 의존한다. 프로토콜 설명에서, 두 단계 과정 (즉, 단계 5.5 및 6.4) 접속 맵을 결정하기 위해 시도하도록 구현된다. 1 단계에서, 자극의 정규 시퀀스 전달 및 자극에 대한 반응은 제 1 연결지도 및 기록 채널 임시 세트를 유도하는데 이용된다. 이 구성은, 단계 6.4에 기재된 시험 운전을 수행하고, 실제 실험 기간 동안 모니터링 할 기록 채널을 선택하는데 사용된다.
결과 섹션, 대표 탐색 입술에서ULT 및 학습 패러다임의 도입에 의해 초래 즉각적인 개선되게됩니다. 프로토콜 설명 전반에 걸쳐 여러 가지 다른 가능한 실험적인 변형이 언급되어있다. 예를 들어, 개발 HyBrainWare2에 구현 된 두 가지 주요 코딩 시스템 (선형 및 확률)은 신경 코드 38 시간 입력 변동의 정확한 역할을 조사합니다. 선형의 경우, 순시 자극 율은 사용자 정의 파라미터 및 로봇 센서 레코딩 함수이다. 스토캐스틱 경우, 각 시간 인스턴스는 주어진 확률을 갖는 자극을 제공하기 위해 선택되어야한다. 예상 자극 요금은 전자의 경우와 일치하도록 이러한 확률은 자동으로 HyBrainWare2에 의해 계산된다. 선형 부호화 상술 두 경우 사이의 원활한 전이를 제공 할 수있는 가능성은 지터를 추가한다. 동일한 방식으로, 복호 부에서 파라미터의 상이한 조합을 탐색하기 PRECI을 밝혀 도움이 될체외 신경 네트워크에 파열의 자체 역할. 흡광 계수는 초 공헌 한 값의 50 %를 상실하는 데 걸리는 시간이별로 나타내고 로봇의 각 휠의 속도는 가중 파라미터에 비례 이벤트가 해당 출력 영역에서 검출 될 때마다 증가 . 붕괴 지수 간단하다. 이러한 변형은 이미 HyBrainWare2의 현재 설계에 고려되었지만, 소프트웨어 나 실험 장치의 추가 수정이 도입 될 수 있다면 더 많은 연구 가능성은 열려있다.
여기에 설명되는 프로토콜의 중요한 한계는 오히려 개발 맞춤형 소프트웨어, HyBrainWare2 (모든 관심 사용자 요청시 자유롭게 사용할 수)의 요구 사항이다. 이 소프트웨어는 특정 모델 및 제조업체의 장치 (자극기, 수집 보드, MEA 증폭기)의 집합에 대한 설계되었습니다. 그것이 정말로 가능하지만이 디 작업에 적응fferent 설정은 변환이 일부 프로그래밍 기술이 소요됩니다. 마찬가지로, 포함 된 옵션은 설치 프로그램을 통해 조사 할 수있는 모든 실험 질문의 제한된 세트를 커버한다. 예를 들어, 제시된 아키텍처로 구현 스파이크 검출 알고리즘 (정확한 시간 스파이크 검출 40) 완전히 등록 피사체 해리 신경망 (예를 들면, 심장 세포에서 매우 다른 경우 변경 될 필요가 여러 하드 코딩 파라미터에 의해 정의되고 또는 슬라이스). 최종적으로, 학습 프로토콜이 짧은 고주파의 전달 이루어져 각 장애물 히트 다음 자극 (2 초 20 Hz에서 자극, 각 자극 펄스가 감각 정보를 코딩하기 위해 사용 된 것과 동일 함)를. 로봇이 우측으로 장애물 안타, 파상풍의 자극은 일반적으로 오른쪽 정보에 대한 코드와 동일 왼쪽 안타도 마찬가지 전극에 전달된다. 이 프로토콜은 하드 코드와 B 없습니다E는 출사 소프트웨어를 수정하지 않고 사용자에 의해 변경.
여기에서 제시된 하이브리드 설치 폐쇄 - 루프 실험 20,23,27,41,42위한 제 구체 시스템 아니지만, 과거에 설계 것들은 유사한 제제의 제한된 수의 데이터에 의해지지 한 논문에 집중시켰다 . 실험 자체가 다른 문제를 해결하면서, 다른 한편으로는, 기재 설정이 (모듈화 및 원점에 대한 상이한 제제 실험 (100 개 이상 배양 2012 년부터 기록되어있는) 다수 사용되어왔다 예 파상풍 자극의 영향 결과에서 제시된 파열의 관련성,). 가까운 미래에, 새로운 실험 세션은 모두 파상풍 및 폐쇄 루프 자극의 지속 효과와 자극 규칙 사이의 관계를 확인하고 반응을 관찰하기 위해 예상된다. 해결해야 할 또 다른 문제로, 자연 관찰 활동 사이의 링크입니다고려 과거 활동 및 자극 (43)의 이력을 얻어 새로운 복호 알고리즘을 첨가 아이디어.
The authors declare they have no competing financial interests.
저자는 감사의 박사하고자 배양 해부 해리 절차에 대한 기술 지원을 NBT-IIT에서 마이크로 전극 배열 및 박사 마리나 난니 박사 클라우디아 Chiabrera 신경 세포 네트워크를 유지하기위한 학생 마르타 비시오을. 이러한 결과로 이어지는 연구는 유럽 연합 (EU)의 일곱 번째 프레임 워크 프로그램에서 자금 지원을받은 (ICT-FET FP7 / 2007-2013, FET 젊은 탐험가 계획) 승인 계약에 따라이 N 284772 두뇌 BOW (° www.brainbowproject.eu을 ). 저자는 또한 도입에 사용 된 그래픽을 생산하는 그녀의 도움 실비아 Chiappalone에게 감사의 말씀을 전합니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Stimulus Generator 4002 | Multi Channel Systems | ||
MEA1060-Inv-BC | Multi Channel Systems | ||
TC02 | Multi Channel Systems | ||
NI 6255 Acquisition Card | National Instruments | ||
Microsoft Visual Studio 2008 | Microsoft | ||
2078P Multichannel System-National Instruments adapter board | Developed at University of Genova (Italy) | ||
Matlab 2010 | Mathworks | ||
HyBrainWare2 | HyBrainWare2: Contact Information |
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