세포 접착에 대한 자가 조립 펩타이드의 효과를 평가하기 위해 펩타이드 하이드로겔에서 면역염색된 대장암 유래 오가노이드 이미징

먼저 염색된 SW1222 유래 오가노이드 샘플을 10x에서 형광 현미경으로 이미징합니다. Rhod 및 DAPI 채널만 사용합니다. ImageJ 소프트웨어를 실행하고 플러그인을 클릭한 다음 매크로를 클릭합니다.

그런 다음 실행하여 ImageJ ROI 변환기를 실행합니다. py 파일을 가져옵니다. 창이 나타나면 콜론 오가노이드 폴더에서 첫 번째 파일을 선택하고 열기를 클릭합니다.

그런 다음 세그먼트를 선택합니다. npy 파일을 첫 번째 파일에 해당하고 열기를 클릭합니다. 그런 다음 ROI 관리자 창에서 모두 선택을 누르고 측정을 누릅니다.

이제 파일을 클릭한 다음 결과 창에서 다른 이름으로 저장을 클릭하여 결과를 저장합니다. 결장 오가노이드 내강에 대한 폴더에서 동일한 이미지에 대해 이미지 변환을 반복합니다. 그런 다음 Origin Pro 소프트웨어를 로드하고 데이터를 클릭한 다음 파일 가져오기를 클릭하여 가져오기 마법사를 찾습니다.

동일한 이미지에 대해 오가노이드 및 루멘 모양 속성에 해당하는 CSV 파일을 모두 선택합니다. 루멘 모양의 속성을 콜로니 결과 열에 복사하여 각 루멘 측정값을 해당 콜로니와 쌍을 이룹니다. 새 열에서 루멘과 콜로니의 면적을 나누어 해당 콜로니의 상대적 루멘 면적을 산출합니다.

각 콜로니의 원형도와 루멘 영역에 해당하는 열을 선택합니다. 그런 다음 플롯, 기본 2D 및 분산형을 순차적으로 클릭합니다. 플롯 창을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 플롯 세부 정보를 선택합니다.

centroid pro 탭을 클릭하고 하위 집합에 대한 중심점 표시, 데이터 점에 연결 및 타원 표시 옵션을 선택합니다. 2D에서 배양된 세포는 콜로니 순환성에서 매우 높은 변동을 보였습니다. Matrigel에서 배양된 세포는 내강의 상대적 크기에 대해 더 광범위한 분포를 가졌습니다.