마이클 Bílý와 Ondřej P. 사이먼 보조금에서 체코 대학의 생명 과학 [내부 부여 기관의 학부 환경 과학, CULS 프라하 (42110 1312 3175 (20164236))]에 의해 지원 되었다. 카렐 Douda에 대 한 지원 체코 과학 재단 (13-05872S)에서 왔다. 민물 진주 홍합의 정부에 의해 투자는 체코 공화국의 자연 보존 기관에 의해 관리에 대 한 체코 행동 계획의 구현 동안 bioindication 및 진주 홍합의 현재 발생에 대 한 데이터 수집에 체코 공화국에서 사용할 수

1. 메쉬 케이지
참고: 그림 1을 참조 하십시오.
<ol><li>자료 준비
	<ol>
<li>실험의 실험실에 부분에 대 한 자료 준비: 강 ~ 1-2 L 물 당 메쉬 케이지, 메쉬 케이지 (플라스틱 본체 1, 2 플라스틱 커버, 2 장의 340 µ m, 4 볼트 공과 감 금 소 당 4 견과류와 함께 특별 한 기술 체), 펜 치 스 패너, 파스퇴르 펫, 스 트레이너, 디지털 카메라, 줌 스테레오 현미경, 보정 표 (현미경 장비), 50 mm 직경, 비 커, 2 플라스틱 접시 5 접시를 해 부 trinocular (~ 25 cm x 15 cm x 3-5 cm), 및 플라스틱 상자.</li>
		<li>Hyporheal 설치를 수행 하려면 고무 호스와 100 µ m 기 공 망, 그리고 물 총 병을 준비 합니다. 장치의 건설, 보조 파일 1 참조: S.1. 메쉬 케이지 건설.</li>
	</ol></li>
	<li>아래와 메시 감 금 소의 중앙 부분을 조립. 개인 보유 감 금 소의 부분을 조립 한다. 한 장의 플라스틱 체, 그리고 마지막으로 메인 상단에 몸 한 플라스틱 덮개를 먼저 삽입 합니다. 4 개의 볼트를 사용 하 여 그것을 확보.</li>
	<li>생물 학적 자료를 준비
	<ol>
<li>메쉬 케이지 강 물을 포함 하는 플라스틱 그릇에 넣어. 약 실 전체의 절반 인지 확인 합니다. FWPM 청소년 걸릴 ( 보조 파일 1 참조: S.6. 생물 소재) 열 절연 상자 밖으로 하 고 페 트리 접시에 넣어. 주: 갑작스런 온도 변화 ~ 2 ° c.를 초과 하지 않는 확인 하십시오</li>
		<li>물 총 병 및 여과기 using, 청소년 암 설을 통해 선별.</li>
	</ol></li>
	<li>현미경 및 카메라 설정 합니다. 계기의 캘리브레이션을 수행 (참조 보충 File1: S. 5. 현미경 및 phototechnics)입니다. 현미경 아래에서 약간 물을 포함 하는 페 트리 접시를 놓습니다.</li>
	<li>감 금 소 (실험적인 실험실 작업)에 청소년을 넣어
	<ol>
<li>파스퇴르 피 펫을 사용 하 여 배양 접시에서 한 개인을 제거 하 고 신중 하 게 현미경 페 트리 접시에 그것을 배치.</li>
		<li>접 안 렌즈 (~ 40 배 확대)로 봐서 개인의 적합성을 확인 합니다. 참고: "좋은" 피트 니스 의미는 개별 이동, 회전 측면에서 셸, 등 발 제거 죽 었 거 나 낮은 피트 니스는 파스퇴르와 개인 플라스틱 및 별도 페 트리 접시 (FWPM와는 열린 청소년에에서 배치 하는 민 다 셸, 운동, 발은 하지 꺼내, 조각난된 쉘, 물에 떠 있는 듯이 청소년, 쉘, 부분 decalcification의 보이는 분해).</li>
		<li>FWPM의 2 개의 사진을 보여주는 좋은 피트 니스 ~ 80 X의 지속적인 확대를 사용 하 여 개별 가져가 라. 참조 보조 파일 1: S.5. 현미경 및 phototechnics. 사진을 저장 합니다. 참고: length의 좋은 측정을 위해 청소년 해야 합니다 놓일 세로로 (측면 보기). 주요 목표는 나중 사진을 분석을 가능 하 게 충분히 좋은 최대 포탄 길이의 높은-품질의 사진을 걸릴 것입니다.</li>
		<li>최대한 빨리 사진을 찍은 소년 장에 적절 한 챔버에 삽입 합니다. 사진과 챔버의 번호를 기록 합니다.</li>
		<li>메쉬 케이지에서 사용된 모든 챔버에 대 한 각 개인으로이 단계를 반복 합니다. : 참고 보조 파일 1: S.1. 메쉬 케이지 건설.</li>
		<li>일단 모든 사용된 챔버 진주 홍합, 플라스틱 체 케이지, 다음 부드럽게 플라스틱 커버 넣어 넣고 견과류 함께 모든 부품을 확보.</li>
		<li>Hyporheic 영역에는 설치의 경우 통과 호스 끝의 하나 하나는 챔버의이 위치에서 수정 다음 반대로 막힘 메쉬과 하단 끝에 바인딩 ( 보조 파일 1 참조: S.1. 메쉬 케이지 건설).</li>
	</ol></li>
	<li>스토어 청소년
	<ol>
<li>그는 청소년 완전히 몰입 하는 thermobox에 그것을 계속 케이지 강 물, 플라스틱 상자에 넣어. 설치 하기 전에 제자리에서 강 물 온도에 설치 (점진적 냉각, 최대 24 시간에 5 ° C) 곳에 적응 청소년 하자.</li>
	</ol></li>
	<li>메쉬 케이지 설치
	<ol>
<li>청소년, 강철 스파이크, 볼트와 금속 너트, 스 패너, 메시 케이지를 포함 한 필드 자료 준비, 온도 습도 필드 ( 테이블의 자료 및 보조 파일 1 참조: S.4.2. 측정 물), 문자열, 카메라, 필드 프로토콜 망치, 그리고 스페이드.</li>
		<li>안정적인 수 온 변화 < ~ 2 ° c를 유지 FWPM 청소년 필드 thermobox (절연된 상자)에서 사이트에 전송 메쉬 케이지와 thermobox를 로컬 환경 조건 (pH, 전도도, 등)에 적응 청소년 수 있도록 사이트에 강에 넣습니다.</li>
		<li>메쉬 케이지를 설치 합니다.<ol>
<li>필드 thermobox에서 메시 케이지를 제거 합니다. 2 개의 강철 스파이크와 그것을 제공 하 고 고정 필드 데이터로 거. 연구 영역 (예를 들어, 메인 스트림 흐름 하지 직접적인 햇빛에 있는 서 있는 물에 직접 물 흐름에의 가장자리에)에 FWPMs에 대 한 일반적인 조건 서식 지로 케이지를 앵커.<ol>
<li>오픈 워터, 강철 스파이크의 쌍을 사용 하 여 수정 강 아래쪽에 케이지 강 바닥의 측면과 수준에 누워 강 흐름의 강의 중심을 향해 45 °의 각도에서 다운스트림. 아래쪽 가로 가장자리 강 하단 표면 위에서 약 10-15 cm 이어야 한다. 한 지역에서 각 감 금 소 사이 2 m의 최소 거리를 유지 (참조 보조 파일 1: S.4. 유지 보수 연습장).</li>
				<li>Hyporheic 영역에 대 한 감 금 소의 위쪽 가로 가장자리 강 하단 표면에 평행 하 게가 고 약 실에 위치 하는 hyporheic, 물의 흐름에 수직인 수직 가로 위치에 강 바닥으로 새 장을 발굴합니다 깊이 테스트 해야 합니다. 실험 기간 동안 물 샘플링의 가능성에 대 한 아래쪽 표면 위에 고무 호스의 위쪽 끝에 밖으로 (참조 보조 파일 1: S.4.2. 측정 물). 참고: 것이 좋습니다 감 금 소에 정기적인 검사 및 유지 관리를 수행 하기 위해 (참조 보조 파일 1: 미 4. 유지 보수 연습장).</li>
			</ol>
</li>
		</ol>
</li>
	</ol></li>
	<li>감 금 소를 제거 하 고는 노출 후에 청소년을 수송. 이 위해, 물 감 금 소를 당겨 하 고 떠내려 물자로 정밀한 앙금 뿐만의 그들을 취소 한 강 물으로 채워진 필드 thermobox에 넣어. 실험실에 즉시 새 장을 전송 하 고 사망률과 성장 속도 평가 시작 합니다. : 참고 보조 파일 1: S.3. 노출 기간. 감 금 소 및 실험실 환경 사이 이상 5 ° C의 온도 차이, 경우 온도 균일화를 첫 번째 필요한입니다.</li>
	<li>각 청소년의 생활/피트 니스를 선택 하 여 실험을 평가 (1.5.2와 1.5.3 단계 참조)와 페 트리 접시 ~ 80 X의 지속적인 확대를 사용 하 여 각 라이브 청소년의 2 이미지를 받아. 체력과 사진과 챔버의 번호를 기록 합니다.</li>
	<li>(모든 방법에 공통) 실험을 완료
	<ol>
<li>이미지 분석 소프트웨어에서 측정을 수행 합니다. 이미지 분석 소프트웨어를 사용 하 여 모두 입력된 이미지 (단계 1.5.3)에 고 출력 이미지 (단계 1.9)에 모든 평가 청소년의 신체 크기 결정에 대 한. 최대 총 포탄 길이 사용 하 여 입력 및 출력에서 본문 크기 값으로 두 사진에 기록.</li>
		<li>테이블 프로세서에 측정 된 값을 삽입 하 고 계산 하는 증가분 (%) 각 살아남기 위한 청소년.</li>
		<li>메쉬 케이지에서 모든 실험 개인에 게 살아남은 개인의 수의 비율을 사용 하 여 메쉬 케이지 당 생존 율 (%)를 예상. 참고: 실험 후 반환 생존자 사육 프로그램을 (참조 보조 파일 1: S.6. 생물 소재).</li>
	</ol></li>
</ol>2. 샌 디 케이지
참고: 그림 2를 참조 하십시오.
<ol><li>자료 준비
	<ol>
<li>실험의 실험실에 부분에 대 한 자료 준비: 2 접시 (직경 ~8.5 cm), 파스퇴르 펫, 스 트레이너, 25 L 강 물, 플라스틱 상자, 체 (메쉬 크기 1 및 2 m m), 큰 플라스틱 상자 (25 L), 모래 케이지 (참조 보조 파일 1 : S.2입니다. 샌 디 연습장 건설), 디지털 카메라, 줌 스테레오 현미경, 보정 표 (현미경 장비), 해 부 trinocular 정렬 연구 영역에서 강 모래 (단계 2.1.3 참조) 및 프로토콜. 참조 자료의 테이블 및 보조 파일 1: 미 2. 샌 디 연습장 건설.</li>
		<li>격리 프로세스에 대 한 자료 준비: 둥근 용기 (각 케이지 플러스 1 여분의 1), 2 접시 (직경 ~ 14 cm), 파스퇴르 피 펫, 돋보기 안경, 그리고 강 물 1 L.</li>
		<li>2 mm 체 강 모래를 가려낼 다음 1 mm 체 입자 크기의 1-2 m m.을 통해 모래를 건조 하 고 필요한 때까지 건조 형태로 저장.</li>
	</ol></li>
	<li>가지고 있는 청소년 ( 보조 파일 1 참조: S.6. 생물 소재)는 thermobox의 고 페 트리 접시에 넣어. 물 총 병 및 여과기 using, 청소년 암 설을 통해 선별.</li>
	<li>현미경 및 카메라 설정 (참조 보조 파일 1: S.5. 현미경 및 phototechnics)입니다.</li>
	<li>감 금 소 (실험적인 실험실 작업)에 청소년을 넣어
	<ol>
<li>플라스틱 상자에 모래 케이지를 놓습니다. 정렬 된 모래를 흩어 (참조 단계 2.1.3) 모래 장의 높이의 1 / 3에. 상자에 물을 부 어. 모래 표면 물 수준 아래 약 10 m m 인지 확인 합니다. 강 물 25 L 상자에 모래 케이지를 삽입 하 고 청소년 FWPMs로 동일한 온도에 노출 (참조 보조 파일 1: S.6.2. 생물학 물자의 저장) 12 헤 햇빛에 모래의 어떤 노출 하지.</li>
		<li>페 트리 접시 준비 FWPM 청소년 가져가 라.</li>
		<li>접 안 렌즈에 보고 하 여 개인의 체력을 확인 (단계 1.5.2 참조).</li>
		<li>사진 문서를 다음과 같이 수행 합니다. 모든 개인 발견의 한 사진의 찍을 (단계 1.5.3 참조) 가장 큰 개인의 10을 선택 하십시오. 또는, 대량 평가 대 한 낮은 배율 (~ 40 X) 함께 모든 청소년의 사진을 찍을 하 고 10 가장 큰 개인을 선택 합니다. 모든 사진을 저장 하 고 그들의 숫자를 기록 합니다.</li>
		<li>물 총 병을 사용 하 여, 준비 된 모래으로 FWPM 청소년 이동 합니다.</li>
	</ol></li>
	<li>스토어 청소년
	<ol>
<li>케이지 완전히 포장 되어 강 물으로 큰 플라스틱 상자에 감 금 소를 넣어 고은 thermobox에 그것을 유지. 현장에서 강 물 온도 (점진적 냉각, 최대 24 h를 위한 5 ° C)을 설치 하기 전에 적응 청소년 하자.</li>
	</ol></li>
	<li>모래 케이지 설치
	<ol>
<li>필드 설치에 대 한 자료 준비: 모래 감 금 소, 25 L 필드 thermobox, 평평한 돌 (최소한의 무게 1 k g), 그물 (메쉬 크기 10 x 10 m m), 물 총 병, 필드 온도 습도 (참조 테이블의 재료 와 보충 파일 1: S.4.2. 물 측정), 삽, 그리고 필드 프로토콜.</li>
		<li>안정적인 물 온도 (~ 2 ° C 변화) 유지 필드 thermobox에 있는 사이트에 청소년와 함께 감 금 소를 전송 합니다. FWPM 청소년 지역 환경 조건 (pH, 전도도, 등)에 적응 하도록 필드 사이트에서 강에 모래 연습장과 필드 thermobox를 넣어.</li>
		<li>FWPMs (예를 들어, 메인 스트림 흐름은 meander에서, 직접 물 흐름에, 서 있는 물에서 아닙니다, 직접적인 햇빛에의 가장자리에)에 대 한 일반적인 조건 서식 지로 모래 케이지를 설치 합니다.<ol>
<li>오픈 워터에 대 한 그물을 사용 하 여 평평한 돌으로 모래 케이지를 고정 하 고 강 하단에 배치 합니다. 감 금 소의 넓은 쪽 흐름으로 45 °의 각도 형성 확인 하십시오.</li>
			<li>케이지 덮개는 강 하단 표면 수준 Hyporheal에 대 한 물 흐름에 수직인 강바닥에 감 금 소를 발굴. 참고: 것이 좋습니다 감 금 소에 정기적인 검사 및 유지 관리를 수행 하기 위해 (참조 보조 파일 1: 미 4. 1. 검사 사이트).</li>
		</ol>
</li>
	</ol></li>
	<li>감 금 소 및 전송 청소년 노출 후 제거 : 참고 보조 파일 1: S.3. 노출 기간.<ol>
<li>물 감 금 소를 당겨, 떠내려 물자의 그들을 취소 하 고 강 물으로 채워진 필드 thermobox에 넣어.</li>
		<li>실험실에 연습장을 수송 하 고 사망률과 성장 속도 평가 시작 합니다. 참고: 경우 온도 차이가 5 ℃ 이상 장과 실험실 환경, 그것은 온도 맞춰야 하 게 하는 데 필요한.</li>
	</ol></li>
	<li>모래에서 별도 FWPM 청소년
	<ol>
<li>준비 물 깊이 50 mm의 둥근 용기 (각 케이지 별도로)와 1 개의 여분 라운드 컨테이너. 케이지에서 둥근 용기에 모래를 전송. 소용돌이 치는 모션을 사용 하 여 별도 용기에 더 가벼운 입자를 밖으로 세척.</li>
		<li>점차적으로이 컨테이너에서 내용을 샘플링 하 고 단계별 파스퇴르 피 펫 및 돋보기를 사용 하 여 청소년에 대 한 검색. 파스퇴르 피 펫을 사용 하 여 페 트리 접시에는 청소년을 넣어. 첫 번째 부정적인 발견 후 마지막 소년 발견 되었습니다 때까지이 단계 및 다음 다른 10 배를 반복 합니다. 각 세척 단계 후 깨끗 한 강물 모래와 원래 컨테이너에 추가 합니다. 참고: 특히 씻은 후에 첫번째 밖으로, 제대로 내용을 검사할 및 정밀한 앙금 등 다른 층 밸러스트의 그것을 청소.</li>
	</ol></li>
	<li>실험 평가
	<ol>
<li>각 소년의 적합성을 확인 (단계 2.4.3 1.5.2 참조) 생존자의 수를 계산 하 고.</li>
		<li>사진의 찍을 (단계 2.4.4 참조) 각 개인의 개별적, 즉은 각 개인의 더 명확한 정체성. 또는, 대량 사진을 찍어 하 고 최종 결과에서 10 최고의 성장된 개인의 하위 집합을 선택 합니다. 참고: 두 가능성 비슷한 보고 가치가 있다. 가능성 1 최고의 사진 배율, 따라서 또한 더 중대 한 정확도의 혜택 뿐만 아니라 높은 작업의 한계는 있다.</li>
	</ol></li>
	<li>실험 완료
	<ol>
<li>이미지 분석 소프트웨어에서 측정을 수행 합니다. 다음 예외와 메쉬 케이지 (단계 1.10 참조)에서 실험 완료: 각 소년의 성장 율 (%)를 평가 하지 않습니다 하지만 모래 케이지 실험에서 전체 그룹을 평가. 참고: 실험 후 생존자에 반환 되어야 번 식 프로그램 ( 보조 파일 S.6.1을 참조 하십시오. Se생물 소재의 lection).</li>
	</ol></li>
</ol>

<ol>
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R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Conservation of the freshwater pearl mussel I: captive breeding techniques. 2, (2003).</li><li>Hru&#353;ka, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nahrungsanspr&#252;che+der+Flu&#223;perlmuschel+und+deren+halbnat&#252;rliche+Aufzucht+in+der+Tschechischen+Republik.">Nahrungsanspr&#252;che der Flu&#223;perlmuschel und deren halbnat&#252;rliche Aufzucht in der Tschechischen Republik.</a> Heldia. 4 (6), 69-79 (1999).</li><li>Scheder, C., Lerchegger, B., Jung, M., Csar, D., Gumpinger, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Practical+experience+in+the+rearing+of+freshwater+pearl+mussels+(Margaritifera+margaritifera):+advantages+of+a+work-saving+infection+approach,+survival,+and+growth+of+early+life+stages.">Practical experience in the rearing of freshwater pearl mussels (Margaritifera margaritifera): advantages of a work-saving infection approach, survival, and growth of early life stages.</a> Hydrobiologia. 735 (1), 203-212 (2014).</li><li>Braun, A., Auerswald, K., Geist, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drivers+and+spatio-temporal+extent+of+hyporheic+patch+variation:+implications+for+sampling.">Drivers and spatio-temporal extent of hyporheic patch variation: implications for sampling.</a> PLoS ONE. 7 (7), e42046 (2012).</li><li>Franken, R. J. M., Storey, R. G., Williams, D. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological,+chemical+and+physical+characteristics+of+downwelling+and+upwelling+zones+in+the+hyporheic+zone+of+a+north-temperate+stream.">Biological, chemical and physical characteristics of downwelling and upwelling zones in the hyporheic zone of a north-temperate stream.</a> Hydrobiologia. , 183-195 (2001).</li><li>Roley, S. S., Tank, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pore+water+physicochemical+constraints+on+the+endangered+clubshell+mussel+(Pleurobema+clava).">Pore water physicochemical constraints on the endangered clubshell mussel (Pleurobema clava).</a> Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 73 (12), 1712-1722 (2016).</li><li>Larson, J. H., Eckert, N. L., Bartsch, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intrinsic+variability+in+shell+and+soft+tissue+growth+of+the+freshwater+mussel+Lampsilis+siliquoidea.">Intrinsic variability in shell and soft tissue growth of the freshwater mussel Lampsilis siliquoidea.</a> PLoS ONE. 9 (11), e112252 (2014).</li><li>Lavictoire, L., Moorkens, E., Ramsey, A. D., Sinclair, W., Sweeting, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+substrate+size+and+cleaning+regime+on+growth+and+survival+of+captive-bred+juvenile+freshwater+pearl+mussels,+Margaritifera+(Linnaeus,+1758).">Effects of substrate size and cleaning regime on growth and survival of captive-bred juvenile freshwater pearl mussels, Margaritifera (Linnaeus, 1758).</a> Hydrobiologia. 766 (1), 89-102 (2015).</li><li>Hru&#353;ka, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experience+of+semi-natural+breeding+programme+of+freshwater+pearl+mussel+in+the+Czech+Republic.">Experience of semi-natural breeding programme of freshwater pearl mussel in the Czech Republic.</a> Die Flussperlmuschel in Europa: Bestandssituation und Schutzmassnahmen. , 69-75 (2000).</li><li>Bayne, B. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiological+components+of+growth+differences+between+individual+oysters+(Crassostrea+gigas)+and+a+comparison+with+Saccostrea+commercialis.">Physiological components of growth differences between individual oysters (Crassostrea gigas) and a comparison with Saccostrea commercialis.</a> Physiological and Biochemical Zoology. 72 (6), 705-713 (1999).</li><li>Tamayo, D., Azpeitia, K., Markaide, P., Navarro, E., Ibarrola, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Food+regime+modulates+physiological+processes+underlying+size+differentiation+in+juvenile+intertidal+mussels+Mytilus+galloprovincialis.">Food regime modulates physiological processes underlying size differentiation in juvenile intertidal mussels Mytilus galloprovincialis.</a> Marine Biology. 163 (6), (2016).</li></ol>

저자는 공개 없다.

노출 시간:
심지어 1 개월 노출 메쉬 케이지 표시 보이는 성장 지역 (그림 3), 그래서 그들은 지역 특성화의 신속 하 고 쉽게 검색을 위한 매우 유용 간의 차이 반영. 그럼에도 불구 하 고, 결과의 관련성 조건, 흔들 리 다 수의 단기 상태에 따라 달라 집니다. 특히, 짧은 강우량 이벤트 역할을 재생할 수 있습니다. 반면, 예측할 수 없는 에피소드 오염 수 있습?...

그들의 상태의 후속 평가 함께 현장에서 실험 생물의 노출 종에 대 한 환경 품질 및 사이트 적합성 (특히)에 대 한 정보를 얻으려면 하나의 가능한 방법입니다. 동물, 이내 그런 bioindication는 주로 제한 된 제한 된 공간에서 살 수 있는 작은 무척 추 동물에 대 한 적용 됩니다. Bivalves (이매패류)의 젊은 단계는 한 같은 적당 한 유기 체 그룹1.
가족 Unionidae bivalves 수생 생태계2의 매우 중요 한 구성 요소입니다. 그러나, 이러한 종은 종종 비판적으로 멸종, 스트림 및 강에 특히. 그들 중 일부는 '우산 종'의 보존은 전체 스트림 소 생활권의 보존에 밀접 한 및 포괄적인 접근3필요로로 특징 이다. 이 동물의 홍합 애벌레 호스트6으로 물고기 인구에 있는 변화에 물 화학4,5 에서 많은 환경 구성 요소와 관련 된 라이프 사이클 있다. 홍합 청소년 홍합 라이프 사이클의 중요 한 단계, 수시로 대표 하기 때문에이 단계에서 그들의 개발에 대 한 사이트 적합성은 한 지역에서 성공적인 종 인구 개발에 대 한 중요 합니다.
민물 진주 홍합 (FWPM, Margaritifera margaritifera; Unionida, 이매패류) 비판적으로 멸종 위기에 놓인 쌍 각 조개 oligotrophic 유럽 스트림에서 발생 이다. 그들의 숫자는 20 동안 크게 추락발생 지역에서 세기 . 그것은 그 중앙 유럽 인구의 대다수에 종 복제에 현재 감소는 주로 기인한 매우 낮은 그들의 생활의 처음 몇 년 동안 청소년의 0 생존에 보인다. 그것은 가정 청소년 FWPMs는 얕은 hyporheic 영역7의 조건과 그들의 다양성은 여전히 하지 잘 설명 여러 해 동안 살. 또한, 생활의 그들의 2 학년까지는 청소년만가지고 약 1 m m의 치수 그래서 그들은 매우 자연 조건8에서 앙금의 큰 볼륨에서 찾기 어렵다. 따라서, 실험 포로 청소년은 그들의 생태학의 연구 필요 합니다.
체코 액션 플랜 민물 진주 홍합9, 내 청소년의 수천이 있다 반 자연 번 식 프로그램에서 매년 마다 일어나는. 그럼에도 불구 하 고, 거기에는 지역 및 서식 지는 이러한 청소년에 의해 성공적인 인구 지원 또는 최종 종 재 소개에 대 한 적합 한 질문이 이다. Bioindications 현장에서 답을 찾는 방법을 제시.
노출 장에 청소년 홍합의 일관성 없는 생존 율 bioindicators10청소년 홍합의 적합성을 의심 하는 일부 이전 작품에서 관찰 되었다 사실에도 불구 하 고 여러 최근 연구 결과 확인은 수 질 테스트11,,1213청소년 노출 방법의 응용 성. 또한, 그것은 여러 가지 요인 재고 기원14 및 애벌레 조건15의 지속 효과 등이 특정 연구의 결과 해석할 때 고려해 야 할 입증 되었습니다.
질문 시험된 지역에 있는 실험적인 청소년을 설치 하는 방법과 가장 효과적으로 그들의 상태를 평가 하는 방법의 발생. 청소년 FWPMs 노출 방법 현장에서 의 첫 번째 엄격한 응용 프로그램 Buddensiek16에 의해 출판 되었다. 청소년 FWPM 개인 스트림, 무료 흐르는 물에 노출 시트 장에 보관 했다 그리고 그들의 생존 및 성장 노출의 몇 주 후 계량 했다. 접근 반 인공 번 식 방법으로 원래 개발 되었다 하지만 저자는 또한 서식 지 요구 사항 및 수 질 평가 대 한 그것의 적용을 강조 했다. FWPM 청소년 생존은 자연스럽 게 매우 개월/년, 동물의 단지 아주 작은 수의 규모에 낮은 생존, 생존 율 몇 주16의 규모에 환경 영향의 좋은 표시 될 수 있습니다. 연구의 년간 노출 방법 개발 보류 실험 청소년 홍합에 스트림 서식 지 더 고 평가 하는 그들의 성장 및 생존 율; 모래 상자17, 홍합 사일로 upwelling 원리18및 다양 한 다른 노출 (껌과 동료에 의해 요약) 감 금 소11에 따라 포함 됩니다. 청소년 얕은 hyporheic 영역7에서 자연스럽 게 발생, 때문에 스트림 하단 내 실험 장치의 응용 프로그램 매우 바람직합니다.
우리의 문서에서 설명 하는 FWPMs에 대 한 두 개의 노출 장치를 사용 하 여: 나) Buddensiek 시트 감 금 소 ("메쉬 케이지") bioindication hyporheal 조건;에서 테스트 설정 수정 그리고 ii) Hruška 모래 상자 ("모래 케이지"). 오픈 물과 hyporheic 조건에서 두 가지 방법의 응용 프로그램 프로토콜에 설명 합니다 (즉, 노출의 4 개의 이체 설명). 방법은 점차적으로 수정 및 민물 진주 홍합9 체코 행동 계획 내에서 응용 프로그램의 15 년 이상에 걸쳐 확장 되었고 실험의 세트에 의해 확인.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>biological material maintenance and care</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Freshwater pearl mussel juveniles</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>from a FWPM breeding programme</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic boxes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>thermobox</td>
			<td>MERCI</td>
			<td>212,070,600,030</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field thermobox (ca25 l)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>cold box (insulated box) commonly used for food transport</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>river water</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dishes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic Pasteur pipettes with balloon bulb (droppers)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>hole diameter 1 mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hydrogen peroxide</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic container (ca 50 l) for river water</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic tea strainer</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td>commonly used in kitchen</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>mesh cages construction</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>main plastic bodies</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plactic covers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 340 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 20 T</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 100 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 67 M</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>rubber hose (diameter&#160; 5.5 mm)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel bolts</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel nuts</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>spanner</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>steel spikes</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pliers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>beakers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic dishes (ca. 25x15x3-5cm)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>squirt bottle</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field protocols</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>stationery</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic container</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>string</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hammer</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sandy cages construction and use</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sieve 1 mm</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sieve 2 mm</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>special technical sieves 340 &#181;m</td>
			<td>Silk &#38;Progress</td>
			<td>UHELON 20 T</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic boxes with tight-fitting lid</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>hot melt adhesive</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>plastic box (ca 250 x 150 x 100 cm)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>big plastic box (ca 25 l)</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>flat stone</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>net</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>river sand</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>round containers</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnifying glasses</td>
			<td>Carson</td>
			<td>Carson CP 60</td>
			<td>There ar many possibilities. This is one example only</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cages installation and maintenance</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>field temperature dataloggers</td>
			<td>ONSET</td>
			<td>UA-001-64</td>
			<td>http://www.onsetcomp.com/products/data-loggers/ua-001-64</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>spade</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>toothbrush</td>
			<td>any</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>experiment evaluation</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>trinocular dissecting zoom stereo microscope</td>
			<td>Bresser optic</td>
			<td>ICD 10x-160x</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>digital camera/ electronic eyepiece</td>
			<td>Bresser optic</td>
			<td>MikroCamLab 5M</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calibration&#160; gird</td>
			<td>Am Scope</td>
			<td>SKU: MR100</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>external power source with two movable light guides</td>
			<td>Arsenal</td>
			<td>K1309010150021</td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Image software</td>
			<td>ImageJ software</td>
			<td></td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>table processor</td>
			<td>MS excel</td>
			<td></td>
			<td>There are many possibilities. This is one example only.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

bioindication testing of stream environment suitability for young freshwater pearl mussels using in situ exposure methods

민물 홍합에 대 한 서식 지 적합성의 지식은이 멸종 그룹의 보존에 중요 한 단계 이다. 우리는 이상의 oligotrophic 강 catchments 내 청소년 노출 테스트 현장에서 수행 하기 위한 프로토콜을 설명 1 개월 및 3 개월 기간. 두 가지 방법 (두 수정)에 청소년 성장 및 생존 율을 평가 하 되 게 됩니다. 마다 그 혜택으로 제한과 방법 및 수정 위치 bioindication에 대 한 가치 다. 모래 케이지 방법은 개인의 큰 세트와 함께 하지만 일부 개인의 측정 그리고 결과 대량에서 평가 됩니다. 메쉬 케이지 방법에서 개인 유지와 별도로, 측정 하지만 낮은 개별 번호 평가. 오픈 워터 노출 수정은 상대적으로 쉽게 적용; 청소년 성장 사이트의 잠재력 및 고도 물 독성 테스트에 대 한 효과적일 수 있습니다. 내 침대 노출 수정 부하가 필요 하지만 자연 청소년 환경 조건에 가깝다 고 지 자체의 현실 적합성을 보고 더 나은. 다른 한편으로, 더 많은 복제의 높은 hyporheic 환경 변화 때문이 수정에 필요 합니다.

4 bioindication 방법 (오픈 워터 모래 연습장, 내 침대 모래 감 금 소, 물 메쉬 케이지, 열고 내 침대 메쉬 케이지) FWPMs에는 위 블타바 강 유역 (보헤미안 숲, 체코에 대 한 환경 조건 적합성 조사에 적용 공화국)입니다. 이 강 중앙 유럽19내 한 FWPM 잔여 위치를 나타냅니다. 여기, 우리는 특별히 선택 된 4 가지 방법 중 가장 중요 한 측면을 설명 하는 결과 집합을 ...

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Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

제자리에서 bioindications 위태롭게 한 홍합 종 대는 환경 적합성의 결정을 사용합니다. Oligotrophic 강 서식 지에 장에 민물 진주 홍합의 청소년 노출에 따라 두 가지 방법을 설명 합니다. 두 방법 모두 오픈 워터 및 hyporheic 물 환경에 대 한 변형에 구현 됩니다.

Bioindication 영 민물 진주 홍합에 현장 노출 방법을 사용 하 여에 대 한 스트림 환경 적합성의 테스트

Knowledge of habitat suitability for freshwater mussels is an important step in the conservation of this endangered species group. We describe a protocol ...

bioindication-testing-stream-environment-suitability-for-young

Research

JoVE Journal

Environment

Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

7.2K 조회수.  Czech University of Life Sciences Prague. 제자리에서 bioindications 위태롭게 한 홍합 종 대는 환경 적합성의 결정을 사용합니다. Oligotrophic 강 서식 지에 장에 민물 진주 홍합의 청소년 노출에 따라 두 가지 방법을 설명 합니다. 두 방법 모두 오픈 워터 및 hyporheic 물 환경에 대 한 변형에 구현 됩니다.

비디오: Bioindication Testing of Stream Environment Suitability for Young Freshwater Pearl Mussels Using In Situ Exposure Methods

EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. II. Total Culturable Virus Assay

A standardized method is required when national studies on virus occurrence in environmental and drinking waters utilize multiple analytical laboratories. The U.S Environmental Protection Agency&#8217;s (USEPA) Method 1615 was developed with the goal of providing such a standard for measuring Enterovirus and Norovirus in these waters. Virus is concentrated from water using an electropositive filter, eluted from the filter surface with beef extract, and then concentrated further using organic flocculation. Herein we present the protocol from Method 1615 for filter elution, secondary concentration, and measurement of total culturable viruses. A portion of the concentrated eluate from each sample is inoculated onto ten replicate flasks of Buffalo Green Monkey kidney cells. The number of flasks demonstrating cytopathic effects is used to quantify the most probable number (MPN) of infectious units per liter. The method uses a number of quality controls to increase data quality and to reduce interlaboratory and intralaboratory variation. Laboratories must meet defined performance standards. Method 1615 was evaluated by examining virus recovery from reagent-grade and ground waters seeded with Sabin poliovirus type 3. Mean poliovirus recoveries with the total culturable assay were 111% in reagent grade water and 58% in groundwaters.

Here we present a procedure to measure total culturable viruses using the Buffalo Green Monkey kidney cell line. The procedure provides a standardized tool for measuring the occurrence of infectious viruses in environmental and drinking waters.

엔테로 바이러스 및 문화 RT-qPCR에 의해 물에서 노로 바이러스의 발생의 EPA 방법 1615 측정. II. 총 배양 가능한 바이러스 분석

A standardized method is required when national studies on virus occurrence in environmental and drinking waters utilize multiple analytical laboratories. ...

연구

환경과학

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. Yet the in situ study of DOM is difficult as the molecular complexity of the DOM pool cannot be easily reproduced for experimental purposes. Nutrient additions to streams however, have been shown to repeatedly alter the in situ and ambient DOM pool. Here we demonstrate an easily replicable field-based method for manipulating the ambient pool of DOM at the ecosystem scale. During nutrient pulse experiments changes in the concentration of both dissolved organic carbon and dissolved organic nitrogen can be examined across a wide-range of nutrient concentrations. This method allows researchers to examine the controls on the DOM pool and make inferences regarding the role and function that certain fractions of the DOM pool play within ecosystems. We advocate the use of this method as a technique to help develop a deeper understanding of DOM biogeochemistry and how it interacts with nutrients. With further development this method may help elucidate the dynamics of DOM in other ecosystems.

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter provides an important source of energy and nutrients to stream ecosystems. Here we demonstrate a field-based method to manipulate the ambient pool of dissolved organic matter in situ through easily replicable nutrient pulses.

을 통해 유기 물질 생지 화학을 용해의 이해<em&gt; 현장에서</em&gt; 스트림 생태계에서 영양소 조작을

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Preparation of Authigenic Pyrite from Methane-bearing Sediments for In Situ Sulfur Isotope Analysis Using SIMS

Different sulfur isotope compositions of authigenic pyrite typically result from the sulfate-driven anaerobic oxidation of methane (SO4-AOM) and organiclastic sulfate reduction (OSR) in marine sediments. However, unravelling the complex pyritization sequence is a challenge because of the coexistence of different sequentially formed pyrite phases. This manuscript describes a sample preparation procedure that enables the use of secondary ion mass spectroscopy (SIMS) to obtain in situ &#948;34S values of various pyrite generations. This allows researchers to constrain how SO4-AOM affects pyritization in methane-bearing sediments. SIMS analysis revealed an extreme range in &#948;34S values, spanning from -41.6 to +114.8&#8240;, which is much wider than the range of &#948;34S values obtained by the traditional bulk sulfur isotope analysis of the same samples. Pyrite in the shallow sediment mainly consists of 34S-depleted framboids, suggesting early diagenetic formation by OSR. Deeper in the sediment, more pyrite occurs as overgrowths and euhedral crystals, which display much higher SIMS &#948;34S values than the framboids. Such 34S-enriched pyrite is related to enhanced SO4-AOM at the sulfate-methane transition zone, postdating OSR. High-resolution in situ SIMS sulfur isotope analyses allow for the reconstruction of the pyritization processes, which cannot be resolved by bulk sulfur isotope analysis.

Preparation of Authigenic Pyrite from Methane-bearing Sediments for In Situ Sulfur Isotope Analysis Using SIMS

Analyses of the sulfur isotopic composition (&#948;34S) of pyrite from methane-bearing sediments have typically focused on bulk samples. Here, we applied secondary ion mass spectroscopy to analyze the &#948;34S values of various pyrite generations to understand the diagenetic history of pyritization.

제자리에서 유황 동위 원소 분석 심즈를 사용 하 여 메탄 베어링 퇴적 물에서 Authigenic 황의 준비

Different sulfur isotope compositions of authigenic pyrite typically result from the sulfate-driven anaerobic oxidation of methane (SO4-AOM) and ...

Dispersion of Nanomaterials in Aqueous Media: Towards Protocol Optimization

The sonication process is commonly used for de-agglomerating and dispersing nanomaterials in aqueous based media, necessary to improve homogeneity and stability of the suspension. In this study, a systematic step-wise approach is carried out to identify optimal sonication conditions in order to achieve a stable dispersion. This approach has been adopted and shown to be suitable for several nanomaterials (cerium oxide, zinc oxide, and carbon nanotubes) dispersed in deionized (DI) water. However, with any change in either the nanomaterial type or dispersing medium, there needs to be optimization of the basic protocol by adjusting various factors such as sonication time, power, and sonicator type as well as temperature rise during the process. The approach records the dispersion process in detail. This is necessary to identify the time points as well as other above-mentioned conditions during the sonication process in which there may be undesirable changes, such as damage to the particle surface thus affecting surface properties. Our goal is to offer a harmonized approach that can control the quality of the final, produced dispersion. Such a guideline is instrumental in ensuring dispersion quality repeatability in the nanoscience community, particularly in the field of nanotoxicology.

Here, we present a step-wise protocol for the dispersion of nanomaterials in aqueous media with real-time characterization to identify the optimal sonication conditions, intensity, and duration for improved stability and uniformity of nanoparticle dispersions without impacting the sample integrity.

수성 미디어에 나노 재료의 분산: 프로토콜 최적화 쪽으로

The sonication process is commonly used for de-agglomerating and dispersing nanomaterials in aqueous based media, necessary to improve homogeneity and ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and estimating fish abundance. We developed and implemented a rotating stereo-video camera tool that covers a full 360 degrees of sampling, which maximizes sampling effort compared to stationary camera tools. A variety of studies have detailed the ability of static, stereo-camera systems to obtain highly accurate and precise measurements of fish; the focus here was on the development of methodological approaches to quantify fish density using rotating camera systems. The first approach was to develop a modification of the metric MaxN, which typically is a conservative count of the minimum number of fish observed on a given camera survey. We redefine MaxN to be the maximum number of fish observed in any given rotation of the camera system. When precautions are taken to avoid double counting, this method for MaxN may more accurately reflect true abundance than that obtained from a fixed camera. Secondly, because stereo-video allows fish to be mapped in three-dimensional space, precise estimates of the distance-from-camera can be obtained for each fish. By using the 95% percentile of the observed distance from camera to establish species-specific areas surveyed, we account for differences in detectability among species while avoiding diluting density estimates by using the maximum distance a species was observed. Accounting for this range of detectability is critical to accurately estimate fish abundances. This methodology will facilitate the integration of rotating stereo-video tools in both applied science and management contexts.

We describe a new method for counting fishes, and estimating relative abundance (MaxN) and fish density using rotating stereo-video camera systems. We also demonstrate how to use distance from camera (Z distance) to estimate species-specific detectability.

수 중 스테레오 비디오 도구를 사용 하 여 물고기 밀도 측정을 위한 새로운 방법의 개발

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using three recently developed experiments in which dust particles are exposed to thermal plasma with beam electrons, beam electrons only, or ultraviolet (UV) radiation only. The UV light source has a narrow bandwidth in wavelength centered at 172 nm. The beam electrons with the energy of 120 eV are created with a negatively biased hot filament. When the vacuum chamber is filled with the argon gas, a thermal plasma is created in addition to the electron beam. Insulating dust particles of a few tens of microns in diameter are used in the experiments. Dust particles are recorded to be lofted to a height up to a few centimeters with a launch speed up to 1 m/s. These experiments demonstrate that photo and/or secondary electron emission from a dusty surface changes the charging mechanism of dust particles. According to the recently developed &#34;patched charge model&#34;, the emitted electrons can be re-absorbed inside microcavities between neighboring dust particles below the surface, causing the accumulation of enhanced negative charges on the surrounding dust particles. The repulsive forces between these negatively charged particles may be large enough to mobilize and lift them off the surface. These experiments present the advanced understanding of dust charging and transport on dusty surfaces, and laid a foundation for future investigations of its role in the surface evolution of airless planetary bodies.

Dust charging and mobilization is demonstrated in three experiments with exposure to thermal plasma with beam electrons, beam electrons only, or ultraviolet (UV) radiation only. These experiments present the advanced understanding of electrostatic dust transport and its role in shaping the surfaces of airless planetary bodies.

먼지가 충전 및 자외선 또는 플라즈마에 노출 표면에 동원의 실험 방법

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster (Nephrops norvegicus)

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to individually track cohoused animals. We tested the tracking routine with four cohoused Norway lobsters (Nephrops norvegicus) under light-darkness conditions for 5 days. The lobsters had been individually tagged. The experimental setup and the tracking techniques used are entirely based on the open source software. The comparison of the tracking output with a manual detection indicates that the lobsters were correctly detected 69% of the times. Among the correctly detected lobsters, their individual tags were correctly identified 89.5% of the times. Considering the frame rate used in the protocol and the movement rate of lobsters, the performance of the video tracking has a good quality, and the representative results support the validity of the protocol in producing valuable data for research needs (individual space occupancy or locomotor activity patterns). The protocol presented here can be easily customized and is, hence, transferable to other species where the individual tracking of specimens in a group can be valuable for answering research questions.

Long-term Video Tracking of Cohoused Aquatic Animals: A Case Study of the Daily Locomotor Activity of the Norway Lobster Nephrops norvegicus

Here we present a protocol to individually track animals over a long period of time. It uses computer vision methods to identify a set of manually constructed tags by using a group of lobsters as case study, simultaneously providing information on how to house, manipulate, and mark the lobsters.

Cohoused 수 중 동물의 장기 비디오 추적: 노르웨이 가재 (Nephrops norvegicus)의 매일 운동 활동의 사례 연구

We present a protocol related to a video-tracking technique based on the background subtraction and image thresholding that makes it possible to ...

A New Portable In Vitro Exposure Cassette for Aerosol Sampling

This protocol introduces a new in vitro exposure system, capable of being worn, including its characterization and performance. Air-liquid interface (ALI) in vitro exposure systems are often large and bulky, making transport to the field and operation at the source of emission or within the breathing zone difficult. Through miniaturization of these systems, the lab can be brought to the field, expediting processing time and providing a more appropriate exposure method that does not alter the aerosol prior to contacting the cells. The Portable In vitro Exposure Cassette (PIVEC) adapts a 37 mm filter cassette to allow for in vitro toxicity testing outside of a traditional laboratory setting. The PIVEC was characterized using three sizes of copper nanoparticles to determine deposition efficiency based on gravimetric and particle number concentration analysis. Initial cytotoxicity experiments were performed with exposed lung cells to determine the ability of the system to deposit particles while maintaining cell viability. The PIVEC provides a similar or increased deposition efficiency when comparing to available perpendicular flow in vitro exposure devices. Despite the lower sample throughput, the small size gives some advantages to the current in vitro ALI exposure systems. These include the ability to be worn for personal monitoring, mobility from the laboratory to the source of emission, and the option to set-up multiple systems for spatial resolution while maintaining a lower user cost. The PIVEC is a system capable of collecting aerosols in the field and within the breathing zone onto an air-interfaced, in vitro model.

A New Portable In Vitro Exposure Cassette for Aerosol Sampling

Here, we present a protocol to perform portable cellular aerosol exposures and measure cellular response. The method uses cells, grown at the air-liquid interface, mimicking in vivo physiology. Cellular response to copper nanoparticle aerosols was observed as oxidative stress through reactive oxygen species generation and cytotoxicity as lactate dehydrogenase release.

새로운 휴대용 체 외에 노출 카세트 졸 샘플링에 대 한

This protocol introduces a new in vitro exposure system, capable of being worn, including its characterization and performance. Air-liquid interface (ALI) ...

Identifying Per- and Polyfluorinated Chemical Species with a Combined Targeted and Non-Targeted-Screening High-Resolution Mass Spectrometry Workflow

Historical and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFASs) have garnered significant interest from the public and government agencies from the local to federal levels. The continuing evolution of PFAS chemistries presents a challenge to the environmental monitoring, where ongoing development of targeted methods necessarily lags the discovery of new chemical compounds. There is a need, therefore, to have forward-looking methodologies that can detect emerging and unexpected compounds, monitor these species over time, and resolve details of their chemical structure to enable future work in human health. To this end, non-targeted analysis by high-resolution mass spectrometry offers a broad base detection approach that can be combined with almost any sample preparation scheme and provides significant capabilities for compound identification after detection. Herein, we describe a solid-phase extraction (SPE) based sample concentration method tuned for shorter chain and more hydrophilic PFAS chemistries, such as per fluorinated ether acids and sulfonates, and describe analysis of samples prepared in this fashion in both targeted and non-targeted modes. Targeted methods provide superior quantification when reference standards are available but are intrinsically limited to expected compounds when performing analysis. In contrast, a non-targeted approach can identify the presence of unexpected compounds and provide some information about their chemical structure. Information about chemical features can be used to correlate compounds across sample locations and track abundance and occurrence over time.

Here, we present a protocol for the sequential targeted quantification and non-targeted analysis of fluorinated compounds in water by mass spectrometry. This methodology provides quantitative levels of known fluorochemical compounds and identifies unknown chemicals in related samples with semi-quantitative estimates of their abundance.

당 식별-및 결합된 대상 및 비 대상 심사 고해상도 질량 분석 워크플로 Polyfluorinated 화학 종

Historical and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFASs) have garnered significant interest from the public and government agencies from the ...

Leaf Area Index Estimation Using Three Distinct Methods in Pure Deciduous Stands

Accurate estimations of leaf area index (LAI), defined as half of the total leaf surface area per unit of horizontal ground surface area, are crucial for describing the vegetation structure in the fields of ecology, forestry, and agriculture. Therefore, procedures of three commercially used methods (litter traps, needle technique, and a plant canopy analyzer) for performing LAI estimation were presented step-by-step. Specific methodological approaches were compared, and their current advantages, controversies, challenges, and future perspectives were discussed in this protocol. Litter traps are usually deemed as the reference level. Both the needle technique and the plant canopy analyzer (e.g., LAI-2000) frequently underestimate LAI values in comparison with the reference. The needle technique is easy to use in deciduous stands where the litter completely decomposes each year (e.g., oak and beech stands). However, calibration based on litter traps or direct destructive methods is necessary. The plant canopy analyzer is a commonly used device for performing LAI estimation in ecology, forestry, and agriculture, but is subject to potential error due to foliage clumping and the contribution of woody elements in the field of view (FOV) of the sensor. Eliminating these potential error sources was discussed. The plant canopy analyzer is a very suitable device for performing LAI estimations at the high spatial level, observing a seasonal LAI dynamic, and for long-term monitoring of LAI.

An accurate estimation of leaf area index (LAI) is crucial for many models of material and energy fluxes within plant ecosystems and between an ecosystem and the atmospheric boundary layer. Therefore, three methods (litter traps, needle technique, and PCA) for taking precise LAI measurements were in the presented protocol.

순수 낙엽 스탠드에서 세 가지 뚜렷한 방법을 사용한 잎 영역 지수 추정

Accurate estimations of leaf area index (LAI), defined as half of the total leaf surface area per unit of horizontal ground surface area, are crucial for ...