유세포 분석에 도움을 주신 UConn Health의 유세포 분석 코어의 Evan Jellison 박사와 Li Zhu 박사, 기기를 지원해 주신 UConn Health 면역학과의 Lynn Puddington 박사, 혈액 샘플 채취에 도움을 주신 UConn Health의 임상 연구 핵심 부서의 Slawa Gajewska 박사와 Paul Appleton 박사에게 감사드립니다. 이 원고의 과학적 집필 및 편집에 도움을 주신 UConn School of Medicine의 Christopher "Kit" Bonin 박사와 Geneva Hargis 박사에게 감사드립니다. 이 연구는 미국 국립보건원(National Institutes of Health), 미국 국립심장폐혈액연구소(National Heart, Lung, and Blood Institute, R01HL145454), 미국 국립종합의학연구소(National Institute of General Medical Sciences, P20GM121176), 미국심장협회(American Heart Association)의 경력개발상(Career Development Award, 18CDA34110426), UConn Health의 스타트업 펀드의 지원을 받았습니다. 그림 1 은 BioRender.com 사용하여 만들었습니다.

헤파린화된 전혈 샘플은 헬싱키 선언의 원칙에 따라 UConn Health의 기관 검토 위원회(Institutional Review Board of UConn Health)에서 승인한 정보에 입각한 동의를 얻은 후 식별되지 않은 건강한 인간 기증자로부터 획득되었습니다. 모든 기증자로부터 정보에 입각한 동의를 얻었습니다. 이 연구의 포함/제외 기준은 참가자의 적합성을 보장하고 잠재적 위험을 최소화하기 위해 신중하게 개발되었습니다. 적격 참가자는 18세에서 65세 사이, 모든 인종, 영어에 능통하고 정보에 입각한 동의를 제공할 수 있는 사람이었습니다. 제외된 참가자에는 법적 권한이 있는 대리인이 필요한 사람, 18세 미만 또는 65세 이상의 개인, 수감자 및 임산부와 같이 정보에 입각한 동의를 제공할 수 없는 사람이 포함되었습니다. 또한 참가자들은 항염증제 사용 및 염증 질환이 없어야 했습니다. 현재 감염 또는 진행 중인 만성 또는 급성 염증 상태도 제외 기준이었습니다. 마지막으로, 현재 또는 최근 COVID-19 감염 이력이 있는 개인은 연구에 부적격했습니다. 이러한 기준은 연구 결과에 영향을 미칠 수 있는 잠재적인 교란 요인을 최소화하면서 참가자의 안전과 적합성을 보장하기 위해 고안되었습니다.
1. 시약의 준비
<ol><li>호중구 배지: 페놀 레드 없이 RPMI-1640에 2% 인간 혈청 알부민을 첨가하여 호중구 배지를 준비합니다( 재료 표 참조).</li>
	<li>fMLP 용액: 페놀 레드가 없는 RPMI 1640으로 10mM fMLP 디메틸 설폭사이드(DMSO) 저장 용액( 재료 표 참조)에서 100배 희석하여 fMLP 용액을 준비합니다.</li>
	<li>항체 용액: β2 integrin의 고친화성 형태를 보고하는 알로피코시아닌(APC)-복합 단클론 항체 mAb24(mAb24-APC) 120μL를 호중구 배지 10mL에 희석하여 1.2μg/mL mAb24-APC 용액을 만듭니다.</li>
	<li>화합물 라이브러리: 액체 처리기를 사용하여 384웰 플레이트에서 10mM 라이브러리( 재료 표 참조) 5μL를 DMSO 45μL에 추가하여 초기 화합물 라이브러리를 10mM에서 1mM 농도로 희석합니다. 그 후, 액체 처리기를 사용하여 1mM 화합물 라이브러리의 웰당 5μL를 빈 384웰 플레이트로 옮깁니다.</li>
	<li>그림 1에서 볼 수 있듯이 4개의 컬럼( 1, 2, 23, 24)에는 DMSO만 포함되고 화합물은 포함되지 않아 스크리닝에서 양성 및 음성 대조군 역할을 했습니다. 페놀 레드 없이 45μL의 RPMI-1640을 추가하여 각 웰을 더 희석하여 모든 화합물에 대해 최종 농도가 100μM가 됩니다.</li>
</ol>2. 인간 혈액에서 호중구 분리
<ol><li>혈청학적 피펫을 사용하여 15mL 원심분리 튜브에 시판되는 밀도 구배 배지( 재료 표 참조) 8mL 위에 4mL의 혈액을 조심스럽게 층층합니다(그림 2A).</li>
	<li>20°C에서 30-50분 동안 550× g 에서 혈액을 원심분리합니다. 로터를 점진적으로 감속합니다(감속 계수 1). 참고: 적혈구에서 호중구( 그림 2B의 밴드 2)를 성공적으로 분리하는 것은 기증자마다 다를 수 있습니다. 대부분의 기증자의 경우 30분의 원심분리로 충분합니다. 그러나 일부 기증자의 경우 분리가 성공하지 못할 경우 추가로 10-30분의 원심분리가 필요할 수 있습니다(그림 2C).</li>
	<li>플라즈마(상단의 노란색 액체)와 단핵 전지(상단의 흐린 띠; 도 2B의 PBMC 밴드)를 1mL 피펫으로 사용하였다.</li>
	<li>하부 탁한 띠( 그림 2B의 호중구 띠)와 맑은 액체 아래 약 3-4mL의 호중구를 10mL의 인산염 완충 식염수(PBS)가 들어 있는 15mL 원심분리 튜브로 수집합니다. 호중구 현탁액을 2-3회 뒤집어 부드럽게 섞습니다.</li>
	<li>현탁액을 400× g 에서 20°C에서 10분 동안 원심분리한 다음 디캔팅하여 상층액을 조심스럽게 제거합니다.</li>
	<li>펠릿을 5mL의 PBS로 부드럽게 재현탁시키고 20°C에서 5분 동안 300× g 으로 원심분리합니다.</li>
	<li>디캔팅으로 상층액을 제거하고 진공 흡입을 사용하여 튜브 입구 주변과 튜브 벽에 남아 있는 상층액을 조심스럽게 제거합니다. 펠릿을 호중구 배지 1mL에 재현탁시킵니다.</li>
	<li>혈구계를 사용하여 세포 수를 계산합니다. 전형적으로, 1 내지 4 × 107 호중구는 8 mL의 인간 혈액으로부터 얻어졌다. 알림: 호중구 현탁액에 적혈구 오염이 있을 수 있습니다. 적혈구는 대부분의 분석에 큰 영향을 미치지 않으며 호중구 활성화/프라이밍을 예방할 수 있다27. 정확한 호중구 농도를 얻기 위해 계산하기 전에 적혈구를 용해해야 합니다. 적혈구를 용해하기 위해 10-30초 동안 891μL의 탈이온수에 세포 현탁액 10μL를 첨가한 다음 99μL의 10× PBS를 추가하여 삼투압의 균형을 유지하여 호중구의 용해를 방지합니다.</li>
	<li>호중구 배지를 추가하여 세포 밀도를 6.25 × 105 cells/mL로 조정합니다.</li>
</ol>3. 384웰 플레이트의 준비
<ol><li>1.5mL 원심분리 튜브에 1mL의 항체 용액(1.2μg/mL mAb24-APC)과 0.2mL의 호중구 배지를 결합하여 1μg/mL mAb24-APC 용액을 만듭니다. 그런 다음 이 혼합물 25μL를 384웰 플레이트의 음성 대조군 웰( 그림 1의 파란색 웰)에 추가합니다.</li>
	<li>15mL 원심분리 튜브에 9mL의 항체 용액을 21.6μL의 fMLP 용액(100μM) 및 1.7784mL의 호중구 배지와 혼합하여 1μg/mL mAb24-APC 및 200nM fMLP를 포함하는 용액을 만듭니다. 다음으로, 이 혼합물 25μL를 384웰 플레이트( 그림 1의 빨간색 및 파란색 웰)의 양성 대조군 및 테스트 웰에 추가합니다.</li>
	<li>멀티 채널 피펫을 사용하여 100μM 화합물 용액 5μL를 화합물 라이브러리 플레이트에서 384웰 플레이트로 옮깁니다.</li>
	<li>실온에서 500× g에서 1분 동안 액체를 원심분리합니다. 알림: 플레이트를 원심분리하려면 스윙 버킷 로터와 플레이트 버킷이 필요합니다.</li>
</ol>4. 세포의 처리
<ol><li>16채널 피펫을 사용하여 각 웰에 20μL의 호중구 현탁액을 추가합니다(384웰 플레이트의 각 컬럼에 대해 5-50μL 범위). 피펫을 사용하여 5-10회 부드럽게 혼합하고 각 피펫팅 사이에 일정한 시간 간격을 유지합니다. 참고: 웰의 최종 농도는 다음과 같습니다: 호중구 2.5 × 105 cells/mL(모든 웰); mAb24-APC 0.5μg/mL(모든 웰); fMLP 100nM(포지티브 대조군 및 테스트 웰); 화합물 10μM(테스트 웰).</li>
	<li>300rpm의 Shaker에서 실온(RT)에서 10분 동안 배양합니다.</li>
	<li>16채널 피펫(최종 PFA 농도 ~0.91%)을 사용하여 각 웰에 16% 파라포름알데히드(PFA) 3μL를 추가하여 셀을 고정합니다. 그런 다음 얼음 위에서 10분 동안 배양합니다. 알림: 호중구와 PFA를 추가할 때 서로 다른 컬럼 사이에 일관된 시간 간격을 유지하는 것이 좋습니다. 이를 통해 각 웰의 호중구가 fMLP 및 mAb24-APC와 동일한 배양 시간을 갖도록 할 수 있습니다.</li>
</ol>5. 유세포 분석
<ol><li>유세포 분석기를 켜고( 재료 표 참조) 기기에 연결된 컴퓨터도 켜져 있는지 확인합니다.</li>
	<li>피복 유체 용기가 채워져 있고 폐기물 용기가 비어 있고 기기에 제대로 연결되어 있는지 확인하십시오.</li>
	<li>384웰 플레이트를 유세포 분석기의 샘플 로더에 로드합니다. 플레이트의 A1 웰이 로더의 A1 표시와 정렬되는지 확인하십시오.</li>
	<li>소프트웨어를 열고 새 실험을 만듭니다. 384 well 을 선택하고 원하는 형광단을 선택합니다. 그런 다음 플레이트 설정(Plate setup)을 클릭하고 드래그하여 모든 웰을 선택한 다음 샘플( Sample)을 클릭합니다. "High throughput(높은 처리량)" 스위치를 켜고 rate 패널에서 High(높음 )를 선택합니다.<ol><li>볼륨 상자에 50을 입력합니다. 홀수 열에서 샘플을 선택한 다음 "교반" 스위치를 활성화합니다. 마지막으로 오른쪽 패널에서 샘플의 이름을 지정합니다.</li>
	</ol></li>
	<li>플롯 및 게이트를 클릭합니다. 그런 다음 적용 버튼(녹색으로 채워진 원에 두 개의 화살표)을 클릭한 다음 재생 버튼(삼각형 모양)을 클릭합니다. 첫 번째 우물에서 일부 세포를 관찰할 때까지 몇 초 동안 기다린 다음 일시 중지 버튼을 클릭합니다.<ol><li>FSC 및 SSC 전압을 조정하여 플롯에서 세포를 적절하게 시각화합니다. Acquisition( 획득)을 클릭한 다음 재생 버튼(삼각형 모양)을 클릭하여 분석을 시작합니다.</li>
	</ol></li>
	<li>유세포 분석기는 각 웰에서 ~50μL의 1000-3000 호중구를 순차적으로 샘플링합니다. 전체 384웰 플레이트를 완성하는 데 약 3시간이 걸립니다.</li>
	<li>모든 샘플을 완료한 후 다음 단계를 위해 .fcs 파일을 내보냅니다.</li>
</ol>6. 데이터 분석
<ol><li>유세포 분석 데이터 분석 소프트웨어를 엽니다( 재료 표 참조). 모든 .fcs 파일이 포함된 폴더를 선택하여 소프트웨어 창으로 드래그한 다음 손을 떼면 데이터가 소프트웨어로 가져옵니다.</li>
	<li>그림 3과 같이 팝업 창에서 FSC 및 SSC28,29,30을 기반으로 하는 단일 호중구를 게이트하는 샘플 하나를 두 번 클릭합니다. 게이트 행을 선택하고 폴더로 끈 다음 놓아 해당 폴더의 모든 샘플에 게이팅을 적용합니다.</li>
	<li>소프트웨어의 테이블 편집기 기능을 사용하여 각 웰에서 호중구의 APC 평균 형광 강도(MFI)를 계산하고 내보낼 수 있습니다. Edit(편집) 탭에서 Add Column(열 추가)을 클릭합니다. 통계량 탭에서 중앙값을 선택하고, 게이트 모집단 호중구를 선택하고, APC를 매개변수로 선택합니다. 확인 버튼을 클릭합니다.</li>
	<li>"Table editor" 탭으로 돌아가서 "Group" 탭에서 All Samples 를 선택하고 Create table 버튼을 누릅니다. 생성된 테이블을 표시하는 새 창이 나타납니다. 텍스트, CSV 또는 Excel 파일로 저장합니다.</li>
	<li>내보낸 표를 열고 양성 및 음성 대조군 샘플에 대한 APC MFI의 평균값과 표준 편차를 계산합니다(그림 4).</li>
	<li>다음 방정식을 사용하여 플레이트의 Z'-계수(Z')를 계산합니다. Z' = 1 - 3(σ p + σ n)/(μp - μn), 여기서σ p와 σ n은 각각 양성 및 음성 대조군의 표준 편차이고,μ p 및 μn은 각각 양성 대조군과 음성 대조군의 평균입니다(31). 참고: Z' 계수는 양성 및 음성 제어 분포의 분리를 나타냅니다. Z'가 0이면 분리가 없음을 의미하고, Z'가 0.5이면 분리가 동일함을 나타냅니다. 이전 연구31에서 언급한 바와 같이, Z' > 0.5는 화합물 스크리닝을 위한 우수한 분석법을 나타낸다. 0.5에서 0 사이의 Z'는 허용되지만 분석에서 강한 적중만 식별할 수 있으므로 2차 분석에서 추가 검증이 필요합니다.</li>
	<li>화합물 처리된 호중구의 APC MFI가 양성 대조군 MFI에서 뺀 양성 대조군 MFI의 표준 편차의 3배 미만인 경우(P = 0.0013, 그림 4의 점선으로 표시) 화합물을 스크리닝을 위한 "히트"로 간주합니다.</li>
</ol>

인간 호중구에서 β2 Integrin Activation Inhibitors의 스크리닝

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	<li>Njus, B. H. et al. Conformational mAb as a tool for integrin ligand discovery. Assay and Drug Development Technologies. 7 (5), 507-515 (2009).</li>
	<li>Chigaev, A., Wu, Y., Williams, D. B., Smagley, Y., Sklar, L. A. Discovery of very late antigen-4 (VLA-4, &#945;4&#946;1 integrin) allosteric antagonists. Journal of Biological Chemistry. 286 (7), 5455-5463 (2011).</li>
	<li>Ghigo, A., De Santi, C., Hart, M., Mitash, N., Swiatecka-Urban, A. Cell signaling and regulation of CFTR expression in cystic fibrosis cells in the era of high efficiency modulator therapy. Journal of Cystic Fibrosis. 22, S12-S16 (2023).</li>
	<li>Van Goor, F., Yu, H., Burton, B., Hoffman, B.J. Effect of ivacaftor on CFTR forms with missense mutations associated with defects in protein processing or function. Journal of Cystic Fibrosis. 13 (1), 29-36 (2014).</li>
</ol>

저자는 경쟁적인 재정적 이익이 없음을 선언합니다.

호중구 자극 및 염색의 시작과 종료는 호중구와 고정제 PFA의 첨가에 의해 결정됩니다. 따라서 호중구 또는 PFA를 각 컬럼에 피펫팅하는 사이에 동일한 시간 간격을 유지하는 것이 중요합니다. 이렇게 하면 각 웰에서 호중구의 자극 및 염색 시간이 일정하게 유지됩니다. 호중구의 수명이 짧기 때문에 기증자로부터 혈액을 채취하는 것부터 유세포 분석 완료에 이르기까지 전체 실험을 같은 날에 수?...

많은 염증성 질환은 부종이나 부상 부위에 호중구가 침윤하는 것이 특징이다1. 이러한 조직에 침투하기 위해 호중구는 내피에 대한 체포, 혈관 벽을 통한 유출 및 조직 내로의 모집을 포함하는 호중구 모집 캐스케이드를 완료해야 합니다2. 순환 호중구는 특히 정지 단계에서 이 캐스케이드를 완료하기 위해 β2 인테그린 활성화가 필요합니다. 따라서 호중구 부착, 외래 및 모집을 감소시키는 인테그린 억제 약물은 염증성 질환을 효과적으로 치료할 수 있습니다 3,4.
β2 인테그린은 이전에도 염증성 질환의 표적이 된 적이 있습니다. 인테그린 αLβ2를 직접 표적으로 하는 단클론 항체인 에팔리주맙(Efalizumab)은 건선5를 치료하기 위해 개발되었습니다. 그러나 에팔리주맙은 JC 바이러스 재활성화로 인한 진행성 다발성 백질뇌병증이라는 치명적인 부작용으로 인해 철회되었다 6,7. 새로운 항염증 인테그린 기반 요법은 부작용을 최소화하기 위해 백혈구의 항감염 기능을 유지하는 것을 고려해야 합니다. 에팔리주맙의 부작용은 혈류 내 단일클론항체의 장기적 순환으로 인해 발생할 수 있으며, 이는 장기적으로 면역 기능을 저해할 수 있다8. 최근 연구에 따르면 에팔리주맙은 αLβ2 교차결합과 α4 인테그린의 원치 않는 내재화를 매개하여 부작용에 대한 대안적 설명을 제공한다9. 따라서 수명이 짧은 저분자 길항제는 이 문제를 피할 수 있습니다.
인간 호중구를 사용하여 저분자 β2 인테그린 길항제를 스크리닝하는 고처리량 분석법이 여기에 제시되어 있습니다. β2 인테그린 활성화는 리간드에 접근하고 결합 친화도를 높이기 위해 인테그린 엑토도메인의 구조적 변화를 필요로 합니다. 표준 스위치블레이드 모델에서, 벤트-클로즈드 인테그린 엑토도메인(benent-closed integrin ectodomain)은 먼저 확장-폐쇄 형태(extended-closed conformation)로 연장된 다음, 완전히 활성화된 확장-개방 형태(10,11,12,13)로 그 헤드피스를 개방한다. 구부러진 닫힘에서 구부러진 열림 및 확장 열림으로 시작하여 결국 14,15,16,17,18,19로 시작하는 대체 경로도 있습니다. 형태 특이적 항체 mAb24는 엑토도메인의 헤드피스가 열려 있을 때 인간 β2-I 유사 도메인의 에피토프에 결합합니다(20,21,22,23).
여기서, mAb24-APC는 β2 인테그린의 활성화 여부를 결정하기 위해 사용된다. 호중구와 인테그린을 활성화하기 위해, 호중구 β2 인테그린을 활성화할 수 있는 박테리아 유래 짧은 화학주성 펩타이드인 N-포르밀메티오닐-류실-페닐알라닌(fMLP)이 이 프로토콜에서 자극제로 사용됩니다. fMLP가 호중구의 Fpr1에 결합하면 G-단백질, 포스포리파제 Cβ 및 포스포이노시티드 3-키나아제 γ와 관련된 다운스트림 신호 캐스케이드가 활성화됩니다. 이러한 신호전달 사건은 궁극적으로 인사이드-아웃(inside-out) 신호전달 경로(18,25)를 통해 인테그린 활성화를 초래한다. β2 인테그린에 직접 결합하고 인테그린 활성화26의 구조적 변화를 방지하는 저분자 길항제 외에도, β2 인테그린 인사이드-아웃 활성화 신호 경로의 성분을 억제할 수 있는 화합물도 이 방법으로 검출할 수 있습니다. 자동 유세포 분석기는 고처리량 스크리닝을 가능하게 합니다. 새로운 길항제를 식별하면 인테그린 생리학에 대한 이해를 심화할 수 있을 뿐만 아니라 인테그린 기반 항염증 요법에 대한 중개적 통찰력을 제공할 수 있습니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>16-channel pipettes</td>
			<td>Thermo</td>
			<td>4661090N</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>384-well plate</td>
			<td>Greiner</td>
			<td>784201</td>
			<td>Materials</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>APC anti-human CD11a/CD18 (LFA-1) Antibody Clone: m24</td>
			<td>BioLegend</td>
			<td>363410</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bravo&#160;Automated Liquid Handling Platform&#160;</td>
			<td>Agilent</td>
			<td>16050-102</td>
			<td>384 multi-channel liquid handler</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>Model 5810R</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FlowJo</td>
			<td>Becton, Dickinson &#38; Company</td>
			<td>NA</td>
			<td>Software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Human Serum Albumin Solution (25%)</td>
			<td>GeminiBio</td>
			<td>800-120</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lifitegrast</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>&#160;50-208-2121</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nexinhib20</td>
			<td>Tocris</td>
			<td>6089</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N-Formyl-Met-Leu-Phe (fMLP)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>F3506</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde 16% solution</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15710</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plate buckets</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>UL155</td>
			<td>Accessory</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plate shaker&#160;</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>88-861-023</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PolymorphPrep</td>
			<td>PROGEN</td>
			<td>1895 (previous 1114683)</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Prestwick Chemical Library Compound Plates (10 mM)</td>
			<td>Prestwick Chemical Libraries</td>
			<td>Ver19_384</td>
			<td>1520 small molecules, 98% marketed approved drugs (FDA, EMA, JAN, and other agencies approved)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI 1640 Medium, no phenol red</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11-835-030</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Swing-bucket rotor&#160;</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>A-4-62</td>
			<td>Rotor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZE5 Cell Analyzer</td>
			<td>Bio-Rad Laboratories</td>
			<td>Model ZE5</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a flow cytometry-based high-throughput technique for screening integrin-inhibitory drugs

이 프로토콜은 구조적 변화 보고 항체 및 고처리량 유세포 분석을 활용하여 β2 인테그린 활성화의 소분자 길항제를 식별하는 방법을 확립하는 것을 목표로 합니다. 이 방법은 또한 다른 항체 기반 고처리량 스크리닝 방법에 대한 가이드 역할을 할 수 있습니다. β2 인테그린은 면역 반응에 중요한 백혈구 특이적 접착 분자입니다. 호중구는 혈류를 빠져나가기 위해 인테그린 활성화에 의존하며, 감염과 싸울 뿐만 아니라 여러 염증성 질환에도 관여합니다. β2 인테그린 활성화를 조절하는 것은 호중구 관련 염증성 질환을 치료하기 위한 실행 가능한 접근법을 제시합니다. 이 프로토콜에서는 β2 인테그린의 고친화성 헤드피스에 특이적으로 결합하는 단클론 항체인 mAb24를 사용하여 분리된 1차 인간 호중구에서 β2 인테그린 활성화를 정량화합니다. N-포르밀메티오닐-류실-페닐알라닌(fMLP)은 호중구 β2 인테그린을 활성화하기 위한 자극제로 사용됩니다. 이 연구에서는 384웰 플레이트 샘플을 자동으로 실행할 수 있는 고처리량 유세포 분석기를 사용했습니다. β2 인테그린 억제에 대한 320가지 화학 물질의 효과는 3시간 이내에 평가됩니다. β2 인테그린을 직접 표적으로 하는 분자 또는 G 단백질 결합 수용체 개시 인테그린 인사이드-아웃 활성화 신호 경로에서 분자를 표적으로 하는 분자는 이 접근법을 통해 식별할 수 있습니다.

대표적인 384웰 플레이트 스크리닝 데이터(그림 4)에 따르면 음성 대조군은 mAb24-APC의 MFI가 3236 ± 110인 반면, 양성 대조군은 mAb24-APC의 MFI가 7588 ± 858이었습니다. 이 플레이트의 Z' 계수는 약 0.33으로, 허용 범위31 내에 있습니다. 그러나 Z'는 2차 분석에서 추가 검증이 필요합니다.
데이터를 정규화하기 위해 양수 평균에 최대값 1을 할당하고...

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저자 스포트라이트: β2 Integrin 활성화의 소분자 길항제를 식별하는 방법 개발 

이 프로토콜은 인간 호중구에서 β2 인테그린 활성화를 억제하는 저분자 약물을 식별하기 위한 유세포 분석 기반의 고처리량 스크리닝 방법을 설명합니다.

인테그린 억제 약물 스크리닝을 위한 유세포 분석 기반 고처리량 기법

This protocol aims to establish a method for identifying small molecular antagonists of &#946;2 integrin activation, utilizing ...

우리의 연구는 호중구 인테그린에 중점을 두고 있으며, 이 연구에서는 베타-2 인테그린 활성화의 작은 분자 길항제를 찾는 방법을 확립하는 것을 목표로 합니다. 우리는 이 방법을 통해 인테그린 생리학에 대한 이해를 심화하고 인테그린 기반 항염증 요법에 대한 중개적 통찰력을 제공할 수 있는 새로운 길항제를 찾을 수 있다고 믿습니다. 앞으로는 새로운 항염증제를 발견하고 그 작용 기전을 해부하는 데 주력할 것입니다.

a-flow-cytometry-based-high-throughput-technique-for-screening

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

A Flow Cytometry-Based High-Throughput Technique for Screening Integrin-Inhibitory Drugs

1.1K 조회수.  UConn Health. 우리의 연구는 호중구 인테그린에 중점을 두고 있으며, 이 연구에서는 베타-2 인테그린 활성화의 작은 분자 길항제를 찾는 방법을 확립하는 것을 목표로 합니다. 우리는 이 방법을 통해 인테그린 생리학에 대한 이해를 심화하고 인테그린 기반 항염증 요법에 대한 중개적 통찰력을 제공할 수 있는 새로운 길항제를 찾을 수 있다고 믿습니다. 앞으로는 새로운 항염증제를 발견?...

비디오: 저자 스포트라이트: β2 Integrin 활성화의 소분자 길항제를 식별하는 방법 개발 

A Microscopic Phenotypic Assay for the Quantification of Intracellular Mycobacteria Adapted for High-throughput/High-content Screening

Despite the availability of therapy and vaccine, tuberculosis (TB) remains one of the most deadly and widespread bacterial infections in the world. Since several decades, the sudden burst of multi- and extensively-drug resistant strains is a serious threat for the control of tuberculosis. Therefore, it is essential to identify new targets and pathways critical for the causative agent of the tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis (Mtb) and to search for novel chemicals that could become TB drugs. One approach is to set&#160;up methods suitable for the genetic and chemical screens of large scale libraries enabling the search of a needle in a haystack. To this end, we developed a phenotypic assay relying on the detection of fluorescently labeled Mtb within fluorescently labeled host&#160;cells using automated confocal microscopy. This in vitro assay allows an image based quantification of the colonization process of Mtb&#160;into the host and was optimized for the 384-well microplate format, which is proper for screens of siRNA-, chemical compound- or Mtb mutant-libraries. The images are then processed for multiparametric analysis, which provides read&#160;out inferring on the pathogenesis of Mtb&#160;within host cells.

Here, we describe a phenotypic assay applicable to the High-throughput/High-content screens of small-interfering synthetic RNA (siRNA), chemical compound, and Mycobacterium tuberculosis mutant libraries. This method relies on the detection of fluorescently labeled Mycobacterium tuberculosis within fluorescently labeled host&#160;cell using automated confocal microscopy.

고처리량/고함량 스크리닝에 적용된 세포내 진균의 정량화를 위한 현미경 표티픽 분석

Despite the availability of therapy and vaccine, tuberculosis (TB) remains one of the most deadly and widespread bacterial infections in the world. Since ...

연구

면역학 및 감염병학

High-throughput Screening for Broad-spectrum Chemical Inhibitors of RNA Viruses

RNA viruses are responsible for major human diseases such as flu, bronchitis, dengue, Hepatitis C or measles. They also represent an emerging threat because of increased worldwide exchanges and human populations penetrating more and more natural ecosystems. A good example of such an emerging situation is chikungunya virus epidemics of 2005-2006 in the Indian Ocean. Recent progresses in our understanding of cellular pathways controlling viral replication suggest that compounds targeting host cell functions, rather than the virus itself, could inhibit a large panel of RNA viruses. Some broad-spectrum antiviral compounds have been identified with host target-oriented assays. However, measuring the inhibition of viral replication in cell cultures using reduction of cytopathic effects as a readout still represents a paramount screening strategy. Such functional screens have been greatly improved by the development of recombinant viruses expressing reporter enzymes capable of bioluminescence such as luciferase. In the present report, we detail a high-throughput screening pipeline, which combines recombinant measles and chikungunya viruses with cellular viability assays, to identify compounds with a broad-spectrum antiviral profile.

In vitro assays to measure virus replication have been greatly improved by the development of recombinant RNA viruses expressing luciferase or other enzymes capable of bioluminescence. Here we detail a high-throughput screening pipeline that combines such recombinant strains of measles and chikungunya viruses to isolate broad-spectrum antivirals from chemical libraries.

RNA 바이러스의 넓은 스펙트럼 화학 억제를위한 높은 처리량 검사

RNA viruses are responsible for major human diseases such as flu, bronchitis, dengue, Hepatitis C or measles. They also represent an emerging threat ...

High Throughput Fluorometric Technique for Assessment of Macrophage Phagocytosis and Actin Polymerization

The goal of fluorometric analysis is to serve as an efficient, cost effective, high throughput method of analyzing phagocytosis and other cellular processes. This technique can be used on a variety of cell types, both adherent and non-adherent, to examine a variety of cellular properties. When studying phagocytosis, fluorometric technique utilizes phagocytic cell types such as macrophages, and fluorescently labeled opsonized particles whose fluorescence can be extinguished in the presence of trypan blue. Following plating of adherent macrophages in 96-well plates, fluorescent particles (green or red) are administered and cells are allowed to phagocytose for varied amounts of time. Following internalization of fluorescent particles, cells are washed with trypan blue, which facilitates extinction of fluorescent signal from bacteria which are not internalized, or are merely adhering to the cell surface. Following the trypan wash, cells are washed with PBS, fixed, and stained with DAPI (nuclear blue fluorescent label), which serves to label nuclei of cells. By a simple fluorometric quantification through plate reading of nuclear (blue) or particle (red/green) fluorescence we can examine the ratio of relative fluorescence units of green:blue and determine a phagocytic index indicative of amount of fluorescent bacteria internalized per cell. The duration of assay using a 96-well method and multichannel pipettes for washing, from end of phagocytosis to end of data acquisition, is less than 45 min. Flow cytometry could be used in a similar manner but the advantage of fluorometry is its high throughput, rapid method of assessment with minimal manipulation of samples and quick quantification of fluorescent intensity per cell. Similar strategies can be applied to non adherent cells, live labeled bacteria, actin polymerization, and essentially any process utilizing fluorescence. Therefore, fluorometry is a promising method for its low cost, high throughput capabilities in the study of cellular processes.

Here we present a protocol to quantify phagocytosis of fluorescent particles by adherent macrophage cell line using a fluorometric method. This method facilitates a high throughput quantification of particle internalization as well as the resulting actin polymerization.

대 식세포 식균 작용과 액틴의 중합의 평가를위한 높은 처리량 형광 측정 기법

The goal of fluorometric analysis is to serve as an efficient, cost effective, high throughput method of analyzing phagocytosis and other cellular ...

Establishment of a High-throughput Setup for Screening Small Molecules That Modulate c-di-GMP Signaling in Pseudomonas aeruginosa

Bacterial resistance to traditional antibiotics has driven research attempts to identify new drug targets in recently discovered regulatory pathways. Regulatory systems that utilize intracellular cyclic di-GMP (c-di-GMP) as a second messenger are one such class of target. c-di-GMP is a signaling molecule found in almost all bacteria that acts to regulate an extensive range of processes including antibiotic resistance, biofilm formation and virulence. The understanding of how c-di-GMP signaling controls aspects of antibiotic resistant biofilm development has suggested approaches whereby alteration of the cellular concentrations of the nucleotide or disruption of these signaling pathways may lead to reduced biofilm formation or increased susceptibility of the biofilms to antibiotics. We describe a simple high-throughput bioreporter protocol, based on green fluorescent protein (GFP), whose expression is under the control of the c-di-GMP responsive promoter cdrA, to rapidly screen for small molecules with the potential to modulate c-di-GMP cellular levels in Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa). This simple protocol can screen upwards of 3,500 compounds within 48 hours and has the ability to be adapted to multiple microorganisms.

Establishment of a High-throughput Setup for Screening Small Molecules That Modulate c-di-GMP Signaling in Pseudomonas aeruginosa

This article describes the high-throughput assay that has been successfully established to screen large libraries of small molecules for their potential ability to manipulate cellular levels of cyclic di-GMP in Pseudomonas aeruginosa, providing a new powerful tool for antibacterial drug discovery and compound testing.

변조 C 디 GMP가에서 시그널링 그건 작은 분자를 스크리닝하기위한 높은 처리량 설정 구축<em&gt; 녹농균</em

Bacterial resistance to traditional antibiotics has driven research attempts to identify new drug targets in recently discovered regulatory pathways. ...

Flow Cytometry-based Assay for the Monitoring of NK Cell Functions

Natural killer (NK) cells are an important part of the human tumor immune surveillance system. NK cells are able to distinguish between healthy and virus-infected or malignantly transformed cells due to a set of germline encoded inhibitory and activating receptors. Upon virus or tumor cell recognition a variety of different NK cell functions are initiated including cytotoxicity against the target cell as well as cytokine and chemokine production leading to the activation of other immune cells. It has been demonstrated that accurate NK cell functions are crucial for the treatment outcome of different virus infections and malignant diseases. Here a simple and reliable method is described to analyze different NK cell functions using a flow cytometry-based assay. NK cell functions can be evaluated not only for the whole NK cell population, but also for different NK cell subsets. This technique enables scientists to easily study NK cell functions in healthy donors or patients in order to reveal their impact on different malignancies and to further discover new therapeutic strategies.

A simple and reliable method is described here to analyze a set of NK cell functions such as degranulation, cytokine and chemokine production within different NK cell subsets.

흐름 NK 세포의 기능을 모니터링 분석을 기반 세포 계측법

Natural killer (NK) cells are an important part of the human tumor immune surveillance system. NK cells are able to distinguish between healthy and ...

Assessing Retinal Microglial Phagocytic Function In Vivo Using a Flow Cytometry-based Assay

Microglia are the tissue resident macrophages of the central nervous system (CNS) and they perform a variety of functions that support CNS homeostasis, including phagocytosis of damaged synapses or cells, debris, and/or invading pathogens. Impaired phagocytic function has been implicated in the pathogenesis of diseases such as Alzheimer's and age-related macular degeneration, where amyloid-&#946; plaque and drusen accumulate, respectively. Despite its importance, microglial phagocytosis has been challenging to assess in vivo. Here, we describe a simple, yet robust, technique for precisely monitoring and quantifying the in vivo phagocytic potential of retinal microglia. Previous methods have relied on immunohistochemical staining and imaging techniques. Our method uses flow cytometry to measure microglial uptake of fluorescently labeled particles after intravitreal delivery to the eye in live rodents. This method replaces conventional practices that involve laborious tissue sectioning, immunostaining, and imaging, allowing for more precise quantification of microglia phagocytic function in just under six hours. This procedure can also be adapted to test how various compounds alter microglial phagocytosis in physiological settings. While this technique was developed in the eye, its use is not limited to vision research.

Assessing Retinal Microglial Phagocytic Function In Vivo Using a Flow Cytometry-based Assay

Microglial phagocytosis is critical for the maintenance of tissue homeostasis and inadequate phagocytic function has been implicated in pathology. However, assessing microglia function in vivo is technically challenging. We have developed a simple but robust technique for precisely monitoring and quantifying the phagocytic potential of microglia in a physiological setting.

망막 미세 아교 식세포의 기능을 평가<em&gt; 생체</em&gt;은 유동 세포 계측법 기반 분석을 사용하여

Microglia are the tissue resident macrophages of the central nervous system (CNS) and they perform a variety of functions that support CNS homeostasis, ...

A Fluorescence-based Lymphocyte Assay Suitable for High-throughput Screening of Small Molecules

High-throughput screening (HTS) is currently the mainstay for the identification of chemical entities capable of modulating biochemical reactions or cellular processes. With the advancement of biotechnologies and the high translational potential of small molecules, a number of innovative approaches in drug discovery have evolved, which explains the resurgent interest in the use of HTS. The oncology field is currently the most active research area for drug screening, with no major breakthrough made for the identification of new immunomodulatory compounds targeting transplantation-related complications or autoimmune ailments. Here, we present a novel in vitro murine fluorescent-based lymphocyte assay easily adapted for the identification of new immunomodulatory compounds. This assay uses T or B cells derived from a transgenic mouse, in which the Nur77 promoter drives GFP expression upon T- or B-cell receptor stimulation. As the GFP intensity reflects the activation/transcriptional activity of the target cell, our assay defines a novel tool to study the effect of given compound(s) on cellular/biological responses. For instance, a primary screening was performed using 4,398 compounds in the absence of a &#34;target hypothesis&#34;, which led to the identification of 160 potential hits displaying immunomodulatory activities. Thus, the use of this assay is suitable for drug discovery programs exploring large chemical libraries prior to further in vitro/in vivo validation studies.

We present in the current study a novel fluorescence-based assay using lymphocytes derived from a transgenic mouse. This assay is suitable for high-throughput screening (HTS) of small molecules endowed with the capacity of either inhibiting or promoting lymphocyte activation.

작은 분자의 높은 처리량 스크리닝 적합한 형광 계 분석 림프구

High-throughput screening (HTS) is currently the mainstay for the identification of chemical entities capable of modulating biochemical reactions or ...

A Flow Cytometry-Based Cytotoxicity Assay for the Assessment of Human NK Cell Activity

Within the innate immune system, effector lymphocytes known as natural killer (NK) cells play an essential role in host defense against aberrant cells, specifically eliminating tumoral and virally infected cells. Approximately 30 known monogenic defects, together with a host of other pathological conditions, cause either functional or classic NK cell deficiency, manifesting in reduced or absent cytotoxic activity. Historically, cytotoxicity has been investigated with radioactive methods, which are cumbersome, expensive and potentially hazardous. This article describes a streamlined, clinically applicable flow cytometry-based method to quantify NK cell cytotoxic activity. In this assay, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or purified NK cell preparations are co-incubated at different ratios with a target tumor cell line known to be sensitive to NK cell-mediated cytotoxicity (NKCC). The target cells are pre-labeled with a fluorescent dye to allow their discrimination from the effector cells (NK cells). After the incubation period, killed target cells are identified by a nucleic acid stain, which specifically permeates dead cells. This method is amenable to both diagnostic and research applications and, thanks to the multi-parameter capabilities of flow cytometry, has the added advantage of potentially enabling a deeper analysis of NK cell phenotype and function.

A flow cytometry-based method to quantitatively determine the cytotoxic activity of human natural killer cells is shown here.

인간 NK 세포 활동의 평가 대 한 흐름 Cytometry 기반 세포 독성 분석 실험

Within the innate immune system, effector lymphocytes known as natural killer (NK) cells play an essential role in host defense against aberrant cells, ...

A High-throughput Platform for the Screening of Salmonella spp./Shigella spp.

Fecal-oral transmission of acute gastroenteritis occurs from time to time, especially when people who handled food and water are infected by Salmonella spp./Shigella spp. The gold standard method for the detection of Salmonella spp./Shigella spp. is direct culture but this is labor-intensive and time-consuming. Here, we describe a high-throughput platform for Salmonella spp./Shigella spp. screening, using real-time polymerase chain reaction (PCR) combined with guided culture. There are two major stages: real-time PCR and the guided culture. For the first stage (real-time PCR), we explain each step of the method: sample collection, pre-enrichment, DNA extraction and real-time PCR. If the real-time PCR result is positive, then the second stage (guided culture) is performed: selective culture, biochemical identification and serological characterization. We also illustrate representative results generated from it. The protocol described here would be a valuable platform for the rapid, specific, sensitive and high-throughput screening of Salmonella spp./Shigella spp.

A High-throughput Platform for the Screening of Salmonella spp./Shigella spp.

Salmonella spp./Shigella spp. are common pathogens attributed to diarrhea. Here, we describe a high-throughput platform for the screening of Salmonella spp./Shigella spp. using real-time PCR combined with guided culture.

살 모 넬 라 종의 심사에 대 한 높은 처리 플랫폼 /Shigella 종

Fecal-oral transmission of acute gastroenteritis occurs from time to time, especially when people who handled food and water are infected by Salmonella ...

Measuring Naturally Acquired Phagocytosis-Inducing Antibodies to Plasmodium falciparum Parasites by a Flow Cytometry-Based Assay

The protocol describes how to set up and run a flow cytometry-based phagocytosis assay of Plasmodium falciparum-infected erythrocytes (IEs) opsonized by naturally acquired IgG antibodies specific for VAR2CSA. VAR2CSA is the parasite antigen that mediates the selective sequestration of IEs in the placenta that can cause a severe form of malaria in pregnant women, called placental malaria (PM). Protection from PM is mediated by VAR2CSA-specific antibodies that are believed to function by inhibiting placental sequestration and/or by opsonizing IEs for phagocytosis. The assay employs late-stage-synchronized IEs that have been selected in vitro to express VAR2CSA, plasma/serum-antibodies from women with naturally acquired PM-specific immunity, and the phagocytic cell line THP-1. However, the protocol can easily be modified to assay the functionality of antibodies to any parasite antigen present on the IE surface, whether induced by natural exposure or by vaccination. The assay offers simple and high-throughput evaluation, with good reproducibility, of an important functional aspect of antibody-mediated immunity in malaria. It is, therefore, useful when evaluating clinical immunity to P. falciparum malaria, a major cause of morbidity and mortality in the tropics, particularly in sub-Saharan Africa.

Measuring Naturally Acquired Phagocytosis-Inducing Antibodies to Plasmodium falciparum Parasites by a Flow Cytometry-Based Assay

The overall goal of this protocol is to provide instruction on how to measure the capacity of antibodies present in sera or plasma of individuals, naturally exposed to Plasmodium falciparum infection, to opsonize and induce phagocytosis of the parasite-infected erythrocytes (IEs).

유동 세포측정 기반 분석체에 의한 플라스모듐 팔시파룸 기생충에 자연적으로 획득된 식세포증-유도 항체 측정

The protocol describes how to set up and run a flow cytometry-based phagocytosis assay of Plasmodium falciparum-infected erythrocytes (IEs) opsonized by ...