저자 스포트라이트: 자원이 제한된 환경에서 광견병 통제를 발전시키기 위한 비용 효율적인 게놈 워크플로우

우리의 연구는 저소득 및 중간 소득 국가의 병원체 감시를 강화하기 위해 고급 유전체학을 사용합니다. 이를 통해 현지 연구자들은 누가, 무엇을, 어디서, 왜, 언제라는 다섯 가지 큰 질문에 답할 수 있습니다. 그리고 이것은 현장의 실용적인 솔루션을 알려줄 수 있습니다.

우리는 나노 기공 기술을 사용하여 시퀀싱을 분산시킵니다. 사용 용이성, 휴대성 및 다른 플랫폼에 비해 저렴한 비용으로 인해 리소스가 적은 설정에 이상적입니다. 또한 시료 공급원에서 신속하게 염기서열을 분석할 수 있다는 것은 동물-인간 환경 인터페이스에서 감시를 수행할 수 있다는 것을 의미합니다.

우리는 다양한 품질의 샘플에서 전체 게놈을 얻는 데 어려움을 겪고 있습니다. 외딴 지역에서 제출된 자료는 보관 상태가 좋지 않은 상태로 운송되는 경우가 많았습니다. 또한 데이터를 해석하는 데 유용한 생물정보학 도구에 대한 전문 지식도 제한적입니다.

따라서 이러한 도구는 MADDOG 및 drug-V GLUE와 같습니다. 이것은 제어를 시작하는 데 도움이 되는 보편적인 방식으로 데이터를 해석하는 데 사용할 수 있습니다. 우리는 광견병의 빠른 염기서열 또는 전체 게놈 염기서열에 대해 프로토콜을 최적화하는 방법을 보여주고, 광견병이 실제로 어떻게 순환하는지, 무엇이 순환하는지, 언제 순환하는지에 대한 다양한 질문에 답하기 위해 저소득 국가에서 광견병 염기서열 분석을 위해 어떻게 적응하고 사용할 수 있는지 확인하려고 합니다.

그리고 이 정보는 광견병 퇴치 전략에 필요합니다. 이제 바이러스 게놈 감시에 더 쉽게 접근할 수 있습니다. 그러나 지역 통제 노력을 위한 데이터 분석 및 해석에 대한 지침은 더 제한적입니다.

당사의 프로토콜은 엔드 투 엔드 파이프라인을 제공하여 현지 과학자들에게 최전선 감시 기능을 제공합니다. 바이러스 게놈의 가용성과 이러한 데이터를 해석하는 방법을 통해 연구자들은 역학적 통찰력을 정부 부처 또는 질병 통제 프로그램을 위한 실행 가능한 정보로 변환하고 의사 결정 프로세스를 안내할 수 있습니다.