9.8 : RNA Polymerase II Accessory Proteins

W komórkach eukariotycznych inicjacja transkrypcji jest złożonym procesem, który wymaga skrupulatnej koordynacji między niektórymi elementami DNA a składnikami białka.

Oprócz polimerazy RNA II i czynników transkrypcyjnych, inne czynniki regulacyjne są również zaangażowane w regulację ekspresji genów podczas inicjacji transkrypcji.

Sekwencje wzmacniające są jednym z takich elementów kontroli transkrypcji, które mogą wywierać swoje działanie niezależnie od ich odległości od promotora.

Są to segmenty regulatorowe DNA o długości około 50 do 200 par zasad, które zawierają wiele miejsc wiązania białek regulatorowych genów, znanych jako aktywatory transkrypcji.

Aktywatory transkrypcji to modułowe białka składające się z dwóch domen, domeny wiążącej DNA i domeny aktywacyjnej.

Domena wiążąca DNA zakotwicza białko w określonej sekwencji wzmacniającej, podczas gdy domena aktywacyjna oddziałuje z różnymi elementami maszynerii transkrypcyjnej w celu stymulacji transkrypcji.

Jednak ta interakcja między aktywatorem a maszynerią transkrypcyjną wymaga obecności kompleksu wielopodjednostkowego zwanego mediatorem.

Strukturalnie elastyczna sieć białek w mediatorze przekazuje sygnały z aktywatora do polimerazy RNA II i czynników transkrypcyjnych, co powoduje regulację w górę transkrypcji połączonego genu, który w przeciwnym razie byłby transkrybowany tylko na poziomie podstawowym.

W przeciwieństwie do aktywatorów, represory regulują ekspresję genów poprzez hamowanie transkrypcji.

Aktywne represory zawierają domeny funkcjonalne, które oddziałują z ogólnymi czynnikami transkrypcyjnymi, zakłócając ich wiązanie z DNA.

Inny typ represora wiąże się w pobliżu miejsca rozpoczęcia transkrypcji, blokując interakcję polimerazy RNA lub ogólnych czynników transkrypcyjnych z promotorem.

Trzeci rodzaj represora konkuruje z aktywatorami o wiązanie się ze wzmacniaczami.

Ogólnie rzecz biorąc, połączone działanie wielu różnych transkrypcyjnych białek regulatorowych jest odpowiedzialne za kontrolę ekspresji genów podczas rozwoju embrionalnego i różnicowania komórek.