iclip-transcriptome-wide-mapping-protein-rna-interactions-with

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

The unique composition and spatial arrangement of RNA-binding proteins (RBPs) on a transcript guide the diverse aspects of post-transcriptional ...

EMBL Heidelberg

Un approccio potente per esplorare la funzione del gene &egrave; l&#39;uso dell&#39;espressione tetraciclina-regolato. Qui, segnaliamo l&#39;istituzione di questo sistema di espressione genica titolabile per Ustilago maydis. Ostacoli di poliadenilazione prematura del gene tetR nativo, ad alta attivit&agrave; basale del promotore della tetraciclina-sensible a reagire e la tossicit&agrave; del dominio di attivazione virale sono stati superati da progettare un gene sintetico tetR * secondo uso dipendente dal contesto codone, rimuovendo gli elementi enhancer criptico dal promotore e utilizzando un dominio di attivazione minimo acide, rispettivamente. Abbiamo verificato tetraciclina-dipendente dalla dose-risposta utilizzando componenti ottimizzati e applicato una cassetta di sostituzione semplice passo singolo promotore per regolare espressione del fattore di risposta del feromone, un fattore di trascrizione chiave che regolano l&#39;accoppiamento. Risposta di feromone in coltura liquida e accoppiamento su terreni solidi &egrave; stata abolita in presenza di tetraciclina e doxiciclina. Cos&igrave;, la funzionalit&agrave; di questo nuovo strumento versatile per l&#39;agente patogeno della pianta &egrave; stata dimostrata in un contesto biologico.

Espressione del gene tetraciclina-regolato in agente patogeno Ustilago maydis.

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x63A2;&#x7D22;&#x3059;&#x308B;&#x5F37;&#x529B;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x5F0F;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x306E;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x7684;&#x767A;&#x73FE;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30CD;&#x30A4;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6; tetR &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6642;&#x671F;&#x5C1A;&#x65E9;&#x306E;&#x8D77;&#x3053;&#x308B;, &#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x57FA;&#x5E95;&#x6D3B;&#x6027;&#x3068;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x6BD2;&#x6027;&#x306E;&#x5408;&#x6210; tetR &#x203B; &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x4F9D;&#x5B58;&#x578B;&#x30B3;&#x30C9;&#x30F3;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x72B6;&#x6CC1;&#x306B;&#x5FDC;&#x3058;&#x3066;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x4E0D;&#x53EF;&#x89E3;&#x306A;&#x5897;&#x5F37;&#x7269;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x3092;&#x524A;&#x9664;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x3001;&#x9178;&#x6027;&#x6700;&#x5C0F;&#x9650;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x514B;&#x670D;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x4F9D;&#x5B58;&#x578B;&#x7528;&#x91CF;-&#x53CD;&#x5FDC;&#x6700;&#x9069;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x691C;&#x8A3C;&#x3057;&#x3001;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x56E0;&#x5B50;&#x3001;&#x4EA4;&#x5C3E;&#x3092;&#x898F;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x30AD;&#x30FC;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x7C21;&#x5358;&#x306A; 1 &#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7; &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x4EA4;&#x63DB;&#x30AB;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x9069;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6DB2;&#x4F53;&#x57F9;&#x990A;&#x3068;&#x56FA;&#x4F53;&#x5A92;&#x4F53;&#x3067;&#x4EA4;&#x5C3E;&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x3068;&#x30C9;&#x30AD;&#x30B7;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x5EC3;&#x6B62;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x6C4E;&#x7528;&#x6027;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3001;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x8A3C;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30C6;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3002;

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xD0D0;&#xAD6C; &#xD558;&#xB294; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xC811;&#xADFC;&#xC740; &#xD56D;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC9C8;&#xC744; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774;&#xD2B8; &#xB41C; &#xC2DD; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xACE0; Ustilago maydis&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C;&#xC774; titratable &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC124;&#xB9BD;. &#xD569;&#xC131; tetR * &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB9DE;&#xB294; codon &#xC0AC;&#xC6A9;&#xB7C9;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xC124;&#xACC4;, &#xBAA8;&#xD130;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xC0C1;&#xD55C; &#xC99D;&#xAC15; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD558; &#xACE0;, &#xAC01;&#xAC01; &#xC0B0; &#xC131; &#xCD5C;&#xC18C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC5EC;&#xB294; &#xB124;&#xC774;&#xD2F0;&#xBE0C; tetR &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC870;&#xAE30; polyadenylation, &#xD56D;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC9C8; &#xC751;&#xB2F5; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC758; &#xB192;&#xC740; &#xAE30;&#xC800; &#xD65C;&#xB3D9;&#xACFC; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xB3C5;&#xC131;&#xC758; &#xC7A5;&#xC560;&#xBB3C; &#xADF9;&#xBCF5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD56D;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC9C8; &#xC885;&#xC18D; &#xBCF5;&#xC6A9;&#xB7C9; &#xC751;&#xB2F5; &#xCD5C;&#xC801;&#xD654; &#xB41C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD655;&#xC778; &#xD558; &#xACE0; &#xAC04;&#xB2E8; &#xD55C; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC529; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xAD50;&#xCCB4; &#xCE74;&#xC138;&#xD2B8; &#xC2DD; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xC751;&#xB2F5; &#xC694;&#xC18C;, &#xD575;&#xC2EC; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; &#xC9DD;&#xC9D3;&#xAE30; &#xADDC;&#xC81C;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C;&#xB97C; &#xC801;&#xC6A9;. &#xC561;&#xCCB4; &#xBB38;&#xD654;&#xC640; &#xACE0;&#xCCB4; &#xBBF8;&#xB514;&#xC5B4;&#xC5D0; &#xC9DD;&#xC9D3;&#xAE30;&#xC5D0; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xC751;&#xB2F5; &#xD56D;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC9C8;&#xACFC; doxycycline &#xC874;&#xC7AC;&#xD560; &#xB54C; &#xD3D0;&#xC9C0; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC2DD;&#xBB3C; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;&#xC774; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xB9E5;&#xB77D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC785;&#xC99D; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;.

&#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; Ustilago maydis&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD56D;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC9C8;&#xC744; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774;&#xD2B8; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;.

Un enfoque de gran alcance para explorar las funciones de los genes es el uso de la expresi&oacute;n regulada de tetraciclina. Aqu&iacute;, Divulgamos el establecimiento de este sistema de expresi&oacute;n del gen titulable para Ustilago maydis. Obst&aacute;culos de poliadenilaci&oacute;n prematura del gen Tet nativa, alta actividad basal del promotor tetraciclina-sensible y toxicidad del dominio de activaci&oacute;n viral fueron superados por dise&ntilde;ar un gen sint&eacute;tico Tet * seg&uacute;n uso contextual cod&oacute;n, quitar elementos cr&iacute;pticos potenciador de la promotora y con un dominio de activaci&oacute;n m&iacute;nima &aacute;cida, respectivamente. Nos hab&iacute;a verificado dependiente de tetraciclina dosis-respuesta utilizando componentes optimizados y aplica un cassette de recambio directo promotor solo paso para regular la expresi&oacute;n del factor de respuesta de feromona, un factor de transcripci&oacute;n clave regulaci&oacute;n de apareamiento. Respuesta de feromona en cultivos l&iacute;quidos y apareamiento en medios s&oacute;lidos fue suprimida en presencia de tetraciclina y doxiciclina. As&iacute;, la funcionalidad de esta nueva herramienta vers&aacute;til para el pat&oacute;geno de la planta fue probada en un contexto biol&oacute;gico.

Expresi&oacute;n de genes regulados por tetraciclina en el pat&oacute;geno Ustilago maydis.

&#x529F;&#x80FD;&#x5F3A;&#x5927;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x63A2;&#x8BA8;&#x57FA;&#x56E0;&#x529F;&#x80FD;&#x662F;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#x56DB;&#x73AF;&#x7D20;&#x8C03;&#x63A7;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x62A5;&#x544A;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x8FD9;&#x53EF;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x3002;&#x8FC7;&#x65E9;&#x7684;&#x672C;&#x673A; tetR &#x57FA;&#x56E0; polyadenylation&#x3001; &#x56DB;&#x73AF;&#x7D20;&#x654F;&#x611F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#xFF0C;&#x9AD8;&#x57FA;&#x5E95;&#x6D3B;&#x52A8;&#x548C;&#x6BD2;&#x6027;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x57DF;&#x7684;&#x969C;&#x788D;&#x88AB;&#x514B;&#x670D;&#x901A;&#x8FC7;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x57FA;&#x56E0;&#x5408;&#x6210; tetR * &#x6839;&#x636E;&#x4E0A;&#x4E0B;&#x6587;&#x76F8;&#x5173;&#x5BC6;&#x7801;&#x5B50;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#x60C5;&#x51B5;&#x3001; &#x4ECE;&#x63A8;&#x9500;&#x5546;&#x5220;&#x9664;&#x795E;&#x79D8;&#x5F3A;&#x5316;&#x5242;&#x5143;&#x7D20;&#x548C;&#x5206;&#x522B;&#x4F7F;&#x7528;&#x9178;&#x6027;&#x6700;&#x5C0F;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x57DF;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5DF2;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x4F9D;&#x8D56;&#x56DB;&#x73AF;&#x7D20;&#x7684;&#x5242;&#x91CF;-&#x53CD;&#x5E94;&#x4F7F;&#x7528;&#x4F18;&#x5316;&#x7684;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x548C;&#x5E94;&#x7528;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x5355;&#x6B65;&#x6267;&#x884C;&#x7B80;&#x5355;&#x66F4;&#x6362;&#x5361;&#x5E26;&#xFF0C;&#x89C4;&#x7BA1;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x53CD;&#x5E94;&#x56E0;&#x5B50;&#xFF0C;&#x8C03;&#x8282;&#x4EA4;&#x914D;&#x5173;&#x952E;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x56DB;&#x73AF;&#x7D20;&#x548C;&#x591A;&#x897F;&#x73AF;&#x7D20;&#x5E9F;&#x9664;&#x4E86;&#x5728;&#x6DB2;&#x4F53;&#x57F9;&#x517B;&#x548C;&#x4EA4;&#x914D;&#x56FA;&#x4F53;&#x4ECB;&#x8D28;&#x4E0A;&#x7684;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x5728;&#x751F;&#x7269;&#x65B9;&#x9762;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x539F;&#x83CC;&#x8FD9;&#x591A;&#x7528;&#x9014;&#x65B0;&#x5DE5;&#x5177;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;

&#x75C5;&#x539F;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x56DB;&#x73AF;&#x7D20;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

A powerful approach to explore gene function is the use of tetracycline-regulated expression. Here, we report the establishment of this titratable gene expression system for Ustilago maydis. Obstacles of premature polyadenylation of the native tetR gene, high basal activity of the tetracycline-responsive promoter, and toxicity of the viral activation domain were overcome by designing a synthetic tetR* gene according to context-dependent codon usage, removing cryptic enhancer elements from the promoter, and using an acidic minimal activation domain, respectively. We verified tetracycline-dependent dose-response using optimised components and applied a straightforward single-step promoter replacement cassette to regulate expression of pheromone response factor, a key transcription factor regulating mating. Pheromone response in liquid culture and mating on solid media was abolished in the presence of tetracycline and doxycycline. Thus, functionality of this versatile new tool for the plant pathogen was proven in a biological context.

Tetracycline-regulated gene expression in the pathogen Ustilago maydis.

Une approche puissante pour &eacute;tudier la fonction du g&egrave;ne est l&#39;utilisation d&#39;expression r&eacute;gl&eacute; par la t&eacute;tracycline. Nous rapportons ici la mise en place de ce syst&egrave;me d&#39;expression de g&egrave;ne titrable pour Ustilago maydis. Obstacles de polyad&eacute;nylation pr&eacute;matur&eacute;e du g&egrave;ne tetR native, haute activit&eacute; basale du promoteur t&eacute;tracycline-sensible et la toxicit&eacute; du domaine d&#39;activation virale ont &eacute;t&eacute; surmont&eacute;s en concevant un g&egrave;ne synth&eacute;tique tetR * selon l&#39;utilisation contextuelle codon, suppression d&#39;&eacute;l&eacute;ments de renforceur cryptiques du promoteur et utiliser un domaine d&#39;activation minimale acides, respectivement. Nous v&eacute;rifi&eacute; t&eacute;tracycline-d&eacute;pendante relation dose-effet &agrave; l&#39;aide de composants optimis&eacute;s et appliqu&eacute; une cassette de remplacement simple promoteur seule &eacute;tape pour la r&eacute;gulation de l&#39;expression du facteur de r&eacute;ponse de ph&eacute;romone, un facteur de transcription cl&eacute; r&eacute;glementant l&#39;accouplement. R&eacute;ponse de ph&eacute;romone en milieu liquide et accouplement sur milieux solides fut abolie en pr&eacute;sence de t&eacute;tracycline et de la doxycycline. Ainsi, les fonctionnalit&eacute;s de ce nouvel outil polyvalent pour le phytopathog&egrave;ne a &eacute;t&eacute; prouv&eacute;e dans un contexte biologique.

Expression g&eacute;nique r&eacute;gl&eacute; par la t&eacute;tracycline dans le pathog&egrave;ne Ustilago maydis.

Ein leistungsf&auml;higen Ansatz Genfunktion zu erkunden ist Tetracyclin-regulierten Ausdruck verwendet. Hier berichten wir &uuml;ber die Einrichtung dieser titrierbaren Gen-Ausdruck-Systems f&uuml;r Ustilago Maydis. Hindernisse der vorzeitigen Polyadenylierung native TetR gen, hohe basale Aktivit&auml;t der Tetracyclin-responsive Promotor und Toxizit&auml;t von der viralen Aktivierungsdom&auml;ne wurden durch ein synthetisches TetR * gen nach kontextabh&auml;ngig Codon Usage entwerfen, Entfernen von kryptischen Enhancer-Elemente aus der Projekttr&auml;ger und unter Verwendung eines sauren minimal Aktivierungsdom&auml;ne, bzw.. Wir Tetracyclin-abh&auml;ngige Dosis-Wirkungs-mit optimierte Komponenten &uuml;berpr&uuml;ft und angewendet eine unkomplizierte einstufige Projekttr&auml;ger Ersatz Kassette zum Ausdruck der Pheromon-Response-Faktor, einen wichtigen Transkriptionsfaktor Regulierung Paarung zu regulieren. Pheromon-Reaktion in fl&uuml;ssiger Kultur und Paarung auf festen Medien wurde in Anwesenheit von Tetracyclin und Doxycyclin abgeschafft. So erwies sich die Funktionalit&auml;t dieses vielseitige neue Tools f&uuml;r die Pflanze-Pathogen in einem biologischen Kontext.

Tetracyclin-regulierten Genexpression in der Erreger Ustilago Maydis.

&#x771F;&#x83CC;&#x751F;&#x957F;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E;&#x5927;&#x5206;&#x5B50;&#x6CBF;&#x808C;&#x52A8;&#x86CB;&#x767D;&#x548C; &#xFF08;&#x6216;&#xFF09; &#x5FAE;&#x7BA1;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9AA8;&#x67B6;&#x7684;&#x4E3B;&#x52A8;&#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;&#x4ECE;&#x800C;&#xFF0C;&#x5982;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3001; &#x8102;&#x7C7B;&#x548C; mRNAs &#x5206;&#x5B50;&#x8D27;&#x7269;&#x88AB;&#x76EE;&#x6807;&#x5B9A;&#x4E49;&#x4E9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;&#x4E3B;&#x52A8;&#x8FD0;&#x8F93;&#x548C;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x7684;&#x5206;&#x6CCC;&#x4F7F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5408;&#x6210;&#x53D1;&#x751F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x529F;&#x80FD;&#x5728;&#x54EA;&#x91CC;&#x9700;&#x8981;&#x8C03;&#x89E3;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x7684;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x3002;&#x5728;&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD;&#xFF0C;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x8089;&#x7684; mRNA &#x8D29;&#x8FD0;&#x53C2;&#x52A0;&#x6781;&#x5730;&#x751F;&#x957F;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x5BF9;&#x79F0;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#xFF0C;&#x9488;&#x5BF9;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x5BFC;&#x5165;&#x3002;Best-understood &#x4E00;&#x4E2A;&#x4F8B;&#x5B50;&#x662F; ASH1 mRNA &#x5230;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x5357;&#x6781;&#x65E9;&#x671F;&#x7684;&#x5973;&#x513F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;&#x72EC;&#x8054;&#x4F53;&#x4EE3;&#x7406; RNA &#x5E8F;&#x5217;&#x90FD;&#x8BA4;&#x53EF;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x901A;&#x8FC7;&#x5206;&#x5B50;&#x9A6C;&#x8FBE; Myo4p She3p &#x9002;&#x914D;&#x5668;&#x6240;&#x8FDE;&#x63A5;&#x7684; She2p&#x3002;&#x5728;&#x4E24;&#x6781;&#x7684;&#x5B50;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x672C;&#x5730;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x5BFC;&#x81F4;&#x4E3B;&#x8981;&#x79EF;&#x7D2F;&#x5728;&#x5B50;&#x7EC6;&#x80DE;&#xFF0C;&#x51E1;&#x6B64;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x6291;&#x5236;&#x4EA4;&#x914D;&#x578B;&#x5F00;&#x5173;&#x7684;&#x539F;&#x5B50;&#x6838;&#x4E2D;&#x7684; Ash1p&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x8089;&#x4F9D;&#x8D56; ASH1 mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x4E2D;&#x7684;&#x767D;&#x8272;&#x5FF5;&#x73E0;&#x83CC;&#x7684;&#x4EBA;&#x4F53;&#x75C5;&#x83CC;&#x7684;&#x7EC6;&#x4E1D;&#x6307;&#x793A;&#x63D0;&#x793A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x539F;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4 &#x7A7F;&#x68AD;&#x662F;&#x6781;&#x6027;&#x7684;&#x5FC5;&#x987B;&#x786E;&#x5B9A;&#x8F74;&#x5728;&#x4F20;&#x67D3;&#x75C5;&#x7684;&#x7EC6;&#x4E1D;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;mRNA &#x8D29;&#x8FD0;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x662F;&#x666E;&#x904D;&#x9700;&#x8981;&#x6781;&#x6027;&#x751F;&#x957F;&#x7684;&#x771F;&#x83CC;&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x8D29;&#x5356;&#x7684; mRNA&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x306F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3068;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x7D30;&#x80DE;&#x9AA8;&#x683C;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x80FD;&#x52D5;&#x8F38;&#x9001;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x5206;&#x5B50;&#x8CA8;&#x7269; Mrna &#x3084;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;&#x8102;&#x8CEA;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x4E0B;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3059;&#x308B;&#x5BFE;&#x8C61;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5408;&#x6210;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x80FD;&#x52D5;&#x8F38;&#x9001;&#x3068;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3; Mrna &#x306E;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x51FA;&#x82BD;&#x9175;&#x6BCD;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C8;&#x30DF;&#x30AA;&#x30B7;&#x30F3;&#x4F9D;&#x5B58; mRNA &#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7;&#x53C2;&#x52A0;&#x6975;&#x5730;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x975E;&#x5BFE;&#x79F0;&#x5206;&#x88C2;&#x3001;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3068;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x8F38;&#x5165;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Best-understood &#x306E;&#x4F8B;&#x306F;&#x3001;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x5A18;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x9060;&#x4F4D;&#x30DD;&#x30FC;&#x30EB; ASH1 mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3067;&#x3059;&#x3002;cis &#x4F5C;&#x7528;&#x3059;&#x308B; RNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5206;&#x5B50;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF; Myo4p &#x306E; She3p &#x30A2;&#x30C0;&#x30D7;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x63A5;&#x7D9A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B; She2p &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A8D;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6975;&#x3067;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EB;&#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5A18;&#x7D30;&#x80DE;&#x304C;&#x4E3B;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x4EA4;&#x914D;&#x578B;&#x30B9;&#x30A4;&#x30C3;&#x30C1;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;&#x5A18;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6838;&#x5185;&#x84C4;&#x7A4D;&#x3059;&#x308B; Ash1p &#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C8;&#x30DF;&#x30AA;&#x30B7;&#x30F3;&#x4F9D;&#x5B58;&#x578B; ASH1 mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x306F;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306E;&#x30AB;&#x30F3;&#x30B8;&#x30C0; &#x30FB; &#x30A2;&#x30EB;&#x30D3;&#x30AB;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x5148;&#x7AEF;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6307;&#x793A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x539F;&#x83CC;&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; Rrm4 &#x306E;&#x5F80;&#x5FA9;&#x611F;&#x67D3;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x6975;&#x6027;&#x8EF8;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;mRNA &#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7;&#x83CC;&#x985E;&#x306E;&#x6975;&#x5730;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x666E;&#x904D;&#x7684;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x83CC;&#x985E;&#x306E;&#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7; mRNA&#x3002;

&#xACF0; &#xD321;&#xC774; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xB9D0;&#xB77C; &#xB610;&#xB294; microtubule cytoskeleton &#xB530;&#xB77C; &#xACE0;&#xBD84;&#xC790;&#xC758; &#xD65C;&#xC131; &#xC804;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, &#xC9C0;&#xC9C8;, mRNAs &#xB4F1; &#xBD84;&#xC790; &#xD654;&#xBB3C; subcellular &#xC601;&#xC5ED; &#xC815;&#xC758; &#xD0C0;&#xAC9F;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD65C;&#xC131; &#xC804;&#xC1A1; &#xBC0F; &#xD604;&#xC9C0;&#xD654; Mrnas&#xC758; &#xD654; &#xB41C; &#xBC88;&#xC5ED;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC; &#xD558; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD569;&#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAE30;&#xB2A5; &#xD574;&#xC57C; &#xD558;&#xB294; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD3F4;&#xB77C; &#xC131;&#xC7A5;, &#xBE44;&#xB300;&#xCE6D; &#xC138;&#xD3EC; &#xBD84;&#xC5F4;&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC38;&#xC5EC; actomyosin &#xC885;&#xC18D; mRNA &#xC778;&#xC2E0; &#xB9E4;&#xB9E4; Saccharomyces cerevisiae&#xC5D0; &#xB9C9; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC;&#xB9AC; &#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC218;&#xC785;&#xC758; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C;. Best-understood &#xC608; &#xCD08;&#xAE30; &#xB538; &#xC140;&#xC758; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xADF9; ASH1 Mrna&#xC758; &#xAD50;&#xD1B5;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. cis &#xC5F0;&#xAE30; RNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBD84;&#xC790; &#xBAA8;&#xD130; Myo4p She3p &#xC5B4;&#xB311;&#xD130;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; she2p&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC778;&#xC815; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB538; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xADF9;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB85C;&#xCEEC; &#xBC88;&#xC5ED; &#xD558;&#xBA74; ash1p&#xC774; &#xD544; &#xC0AC; &#xC694;&#xC18C; &#xC9DD;&#xC9D3;&#xAE30; &#xD615;&#xC2DD; &#xC804;&#xD658; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD55C;&#xB2E4; &#xB538; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xD575;&#xC5D0; &#xC8FC;&#xB85C; &#xCD95;&#xC801;. &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0;, &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xB610;&#xD55C; actomyosin &#xC885;&#xC18D; ASH1 mRNA &#xC804;&#xC1A1; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; Candida albicans&#xC758; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC5D0; &#xD301; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xC9C0;&#xC2DC; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC2DD;&#xBB3C; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4; Ustilago maydis&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xC5FC; &#xC131; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC5D0; &#xADF9;&#xC131;&#xC758; &#xCD95; &#xACB0;&#xC815; &#xD544;&#xC218;&#xC801; &#xC774;&#xB2E4; microtubule &#xC885;&#xC18D; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; rrm4&#xC758; &#xC600;&#xC8E0;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, mRNA &#xBC00;&#xB9E4; &#xBCF4;&#xD3B8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC84;&#xC12F;&#xC758; &#xADF9; &#xC9C0; &#xC131;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0A9;&#xB2C8;&#xB2E4;.

mRNA &#xACF0; &#xD321;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC778;&#xC2E0; &#xB9E4;&#xB9E4;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Fungal growth depends on active transport of macromolecules along the actin and/or microtubule cytoskeleton. Thereby, molecular cargo such as proteins, lipids, and mRNAs is targeted to defined subcellular regions. Active transport and localisation of mRNAs mediate localised translation so that protein synthesis occurs where protein function is required. In Saccharomyces cerevisiae, actomyosin-dependent mRNA trafficking participates in polar growth, asymmetric cell division, targeting of membrane proteins and import of mitochondrial proteins. The best-understood example is transport of ASH1 mRNA to the distal pole of the incipient daughter cell. cis-acting RNA sequences are recognised by the RNA-binding protein She2p that is connected via the adaptor She3p to the molecular motor Myo4p. Local translation at the poles of daughter cells causes Ash1p to accumulate predominantly in nuclei of daughter cells, where this transcription factor inhibits mating-type switching. Recently, it was also shown that actomyosin-dependent ASH1 mRNA transport directs tip cell-specific gene expression in filaments of the human pathogen Candida albicans. Furthermore, in the plant pathogen Ustilago maydis microtubule-dependent shuttling of the RNA-binding protein Rrm4 is essential to determine the axis of polarity in infectious filaments. Thus, mRNA trafficking appears to be universally required for polar growth of fungi.

mRNA trafficking in fungi.

Croissance fongique d&eacute;pend du transport actif des macromol&eacute;cules le long du cytosquelette d&#39;actine et les microtubules. Ainsi, fret mol&eacute;culaire tels que des prot&eacute;ines, des lipides et ARNm s&#39;adresse aux subcellulaires r&eacute;gions d&eacute;finies. Le transport actif et localisation des ARNm de la m&eacute;diation traduction localis&eacute;e afin que la synth&egrave;se des prot&eacute;ines se produit lorsque la fonction de prot&eacute;ine est n&eacute;cessaire. Chez Saccharomyces cerevisiae, traite des ARNm d&#39;actomyosine d&eacute;pendant participe &agrave; la croissance polaire, la division cellulaire asym&eacute;trique, ciblage des prot&eacute;ines membranaires et l&#39;importation des prot&eacute;ines mitochondriales. L&#39;exemple comprenons est le transport de l&#39;ARNm ASH1 au p&ocirc;le distal de la cellule fille naissante. s&eacute;quences d&#39;ARN intramol&eacute;culaires sont reconnus par la prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN She2p qui est connect&eacute; via l&#39;adaptateur She3p au moteur mol&eacute;culaire Myo4p. Traduction locale aux p&ocirc;les des cellules filles provoque Ash1p &agrave; s&#39;accumulent principalement dans les noyaux des cellules filles, o&ugrave; ce facteur de transcription inhibe la commutation de type sexuel. R&eacute;cemment, on a aussi montr&eacute; que le transport ASH1 ARNm actomyosine d&eacute;pendant dirige l&#39;expression de g&egrave;nes sp&eacute;cifiques des cellules pointe en filaments de l&#39;agent pathog&egrave;ne humain Candida albicans. En outre, dans le phytopathog&egrave;ne Ustilago maydis navette de microtubules d&eacute;pendant de la prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN Rrm4 est essentielle pour d&eacute;terminer l&#39;axe de polarit&eacute; dans les filaments infectieuses. Ainsi, traite des ARNm semble &ecirc;tre universellement n&eacute;cessaire pour la croissance des champignons polaire.

ARNm traite des champignons.

Pilzbefall h&auml;ngt von aktiven Transport von Makromolek&uuml;len entlang der Aktin und/oder Microtubule Cytoskeleton. Dabei richtet sich die molekulare Fracht wie Proteine, Lipide und mRNAs subzellulare Regionen zu definieren. Aktiven Transport und Lokalisation von mRNAs vermitteln lokalisierte &Uuml;bersetzung, damit die Proteinsynthese tritt auf, wenn Proteinfunktion erforderlich ist. In Saccharomyces Cerevisiae, Actomyosin-abh&auml;ngige mRNA Menschenhandel nimmt an polar Wachstum, asymmetrische Zellteilung, Platzierung von Membranproteinen und Import der mitochondrialen Proteine. Das Wiedergesundung Beispiel ist Transport von ASH1 mRNA dem distalen Pol der beginnenden Tochter Zelle. CIS wirkende RNA-Sequenzen werden durch das RNS-bindene Protein She2p erfasst, die &uuml;ber den She3p-Adapter an den molekularen Motor Myo4p angeschlossen ist. Lokale &Uuml;bersetzung an den Polen der Tochterzellen f&uuml;hrt dazu, dass die Ash1p vorwiegend in Kernen der Tochterzellen, gesammelt, wo diese &Uuml;bertragungfaktor Paarung-Typ wechseln hemmt. Vor kurzem wurde auch gezeigt, dass Actomyosin-abh&auml;ngige ASH1 mRNA Transport Tipp zellspezifische Genexpression in Filamenten des menschlichen Krankheitserregers Candida Albicans leitet. Dar&uuml;ber hinaus unbedingt in die Pflanze-Pathogen Ustilago Maydis Microtubule-abh&auml;ngige pendelt der RNS-bindene Proteine Rrm4 die Achse der Polarit&auml;t in infekti&ouml;sen Filamente zu bestimmen. So erscheint die mRNA des Menschenhandels universell f&uuml;r polar Wachstum von Pilzen erforderlich.

mRNA Menschenhandel Pilze.

Crescita fungina dipende dal trasporto attivo di macromolecole lungo il citoscheletro di actina e/o dei microtubuli. Quindi, cargo molecolare quali proteine, lipidi e mRNAs si rivolge a regioni sottocellulari definite. Trasporto attivo e localizzazione dei mRNAs mediare localizzate traduzione affinch&eacute; la sintesi proteica si verifica dove &egrave; necessaria la funzione della proteina. In Saccharomyces cerevisiae, actomiosina-dipendente mRNA traffico partecipa alla crescita polar, divisione cellulare asimmetrica, mirata delle proteine di membrana e importazione delle proteine mitocondriali. L&#39;esempio RPA &egrave; trasporto del mRNA ASH1 al polo distale della cellula figlia incipiente. CIS-acting sequenze di RNA sono riconosciuti dalla RNA-binding protein She2p che &egrave; collegato tramite l&#39;adattatore She3p per il motore molecolare Myo4p. Traduzione locale presso i poli di cellule figlie provoca Ash1p ad accumularsi prevalentemente nei nuclei delle cellule della figlia, dove questo fattore di trascrizione inibisce l&#39;accoppiamento di tipo switching. Recentemente, &egrave; stato anche dimostrato che trasporto ASH1 mRNA actomiosina-dipendente dirige punta-specifico gene expression in filamenti dell&#39;agente patogeno umano Candida albicans. Inoltre, l&#39;agente patogeno della pianta Ustilago maydis spola microtubule-dipendente del RNA-binding protein Rrm4 &egrave; essenziale per determinare l&#39;asse della polarit&agrave; in filamenti infettive. Cos&igrave;, traffico di mRNA sembra essere universalmente richiesto per polar crescita di funghi.

mRNA tratta di funghi.

Crecimiento f&uacute;ngico depende del transporte activo de macromol&eacute;culas a lo largo del citoesqueleto de actina y los microt&uacute;bulos. De tal modo, carga molecular como prote&iacute;nas, l&iacute;pidos y mRNAs est&aacute; dirigido a subcelulares regiones definidas. Transporte activo y la localizaci&oacute;n de los mRNAs median traducci&oacute;n localizada para que la s&iacute;ntesis de prote&iacute;nas ocurre donde se requiere la funci&oacute;n de la prote&iacute;na. En Saccharomyces cerevisiae, actomyosin-dependiente trata de mRNA participa en crecimiento polar, divisi&oacute;n celular asim&eacute;trica, dirigidos contra las prote&iacute;nas de la membrana y la importaci&oacute;n de prote&iacute;nas mitocondriales. El ejemplo best-understood es transporte de ARNm ASH1 al Polo distal de la c&eacute;lula hija incipiente. CIS-actuar secuencias de ARN se reconocen por la prote&iacute;na de uni&oacute;n de ARN She2p que se conecta mediante el adaptador She3p para el motor molecular Myo4p. Traducci&oacute;n local en los polos de las c&eacute;lulas de la hija hace Ash1p a acumular predominante en los n&uacute;cleos de c&eacute;lulas de la hija, donde este factor de transcripci&oacute;n inhibe la conmutaci&oacute;n del tipo de acoplamiento. Recientemente, tambi&eacute;n fue demostrado que transporte de actomyosin-dependiente ASH1 mRNA dirige consejos espec&iacute;ficos de c&eacute;lulas genes en filamentos del pat&oacute;geno humano Candida albicans. Adem&aacute;s, en el pat&oacute;geno de la planta Ustilago maydis microtubule-dependiente del transporte de la prote&iacute;na de uni&oacute;n de ARN Rrm4 es esencial para determinar el eje de la polaridad en filamentos infecciosas. Por lo tanto, trata de mRNA parece universalmente necesarios para polar crecimiento de hongos.

mRNA trata de hongos.

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Eukaryotic gene expression begins with transcription and maturation of mRNAs in the nucleus and ends with their translation and degradation in the cytoplasm. Here, we present an inventory of the posttranscriptional machinery of Ustilago maydis that is based on the recently sequenced genome and its comprehensive manual annotation. We used the detailed knowledge available for Saccharomyces cerevisiae and higher eukaryotes to predict posttranscriptional components in this plant pathogen. The comparison to S. cerevisiae revealed that most core components are shared. Both fungi belong to the small group of organisms lacking components of the RNAi machinery. However, a striking difference exists at the level of splicing. U. maydis harbors substantially more intron-containing genes and this correlates with the presence of numerous splice components with human orthologues that are absent or less conserved in S. cerevisiae. In particular, U. maydis contains three out of four core proteins of the exon junction complex, which marks spliced exons and is involved in cytoplasmic mRNA transport. In this context, it is also remarkable that the U. maydis genome displays components involved in microtubule- rather than actin-dependent mRNA transport. Thus, U. maydis might serve as an attractive model system to gain novel insights into posttranscriptional processes.

The posttranscriptional machinery of Ustilago maydis.

L&#39;expression des g&egrave;nes eucaryotes commence avec la transcription et maturation des ARNm dans le noyau et se termine avec leur traduction et de la d&eacute;gradation dans le cytoplasme. Nous pr&eacute;sentons ici un inventaire du m&eacute;canisme post-transcriptionnel de Ustilago maydis qui est bas&eacute;e sur le g&eacute;nome s&eacute;quenc&eacute; r&eacute;cemment et son annotation manuelle compl&egrave;te. Nous avons utilis&eacute; la connaissance d&eacute;taill&eacute;e disponible par Saccharomyces cerevisiae et eucaryotes sup&eacute;rieurs pour pr&eacute;dire les composants post-transcriptionnel dans ce phytopathog&egrave;ne. Comparaison de S. cerevisiae ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; que la plupart des composants de base sont partag&eacute;es. Les deux champignons appartiennent au petit groupe des organismes d&eacute;pourvus de composants de la machinerie de l&#39;ARNi. Cependant, il existe une diff&eacute;rence frappante au niveau de l&#39;&eacute;pissage. U. maydis rec&egrave;le beaucoup plus de g&egrave;nes contenant de l&#39;intron et c&#39;est en corr&eacute;lation avec la pr&eacute;sence de nombreux composants de la jonction avec les orthologues humains qui sont absents ou moins conserv&eacute; chez S. cerevisiae. En particulier, U. maydis contient des prot&eacute;ines de base de trois des quatre de la jonction exon complexe, qui marque des exons &eacute;piss&eacute;s et est impliqu&eacute; dans le transport d&#39;ARNm cytoplasmiques. Dans ce contexte, il est aussi remarquable que le g&eacute;nome de maydis U. affiche les composants impliqu&eacute;s dans microtubule - plut&ocirc;t que le transport de mRNA actine-d&eacute;pendant. Ainsi, U. maydis pourrait servir de syst&egrave;me mod&egrave;le attrayant pour nous &eacute;clairer le roman dans les processus post-transcriptionnelle.

La machinerie post-transcriptionnelle d&#39;Ustilago maydis.

Eukaryotischen Genexpression mit Transkription und Reifung von mRNAs im Zellkern beginnt und endet mit ihrer &Uuml;bersetzung und Abbau im Zytoplasma. Hier pr&auml;sentieren wir eine Bestandsaufnahme der Posttranscriptionale Maschine von Ustilago Maydis, die auf das k&uuml;rzlich sequenzierte Genom und seine umfassende manuelle Annotation basiert. Wir sagten das Detailwissen f&uuml;r Saccharomyces Cerevisiae und h&ouml;heren Eukaryotes Posttranscriptionale Komponenten in dieser Pflanze-Pathogen voraus. Der Vergleich gegen S. Cerevisiae ergab, dass die meisten Kernkomponenten geteilt werden. Beide Pilze geh&ouml;ren zu der kleinen Gruppe von Organismen, die Komponenten der RNAi-Maschine fehlt. Ein auffallender Unterschied besteht jedoch auf der Ebene der Splei&szlig;en. U. Maydis birgt wesentlich mehr Intron-haltigen Gene und dies korreliert mit der Anwesenheit von zahlreichen Splei&szlig;-Komponenten mit menschlichen Orthologues, die nicht vorhanden sind oder weniger konserviert in S. Cerevisiae. Insbesondere enth&auml;lt U. Maydis drei von vier-Kern-Proteine der Exon-Kreuzung Komplex, das kennzeichnet gesplei&szlig;ten Exons und cytoplasmatische mRNA-Transport beteiligt ist. In diesem Zusammenhang ist es auch bemerkenswert, dass U. Maydis Genom in Microtubule - anstatt Aktin-abh&auml;ngige mRNA-Transport beteiligten Komponenten angezeigt. Somit k&ouml;nnte U. Maydis als attraktives Modellsystem neuartige Einblicke in Posttranscriptionale Prozessen dienen.

Die Posttranscriptionale Maschinerie des Ustilago Maydis.

Espressione genica eucarioti inizia con la trascrizione e la maturazione del mRNA nel nucleo e si conclude con la loro traduzione e degradazione nel citoplasma. Qui di seguito, presentiamo un inventario dei macchinari posttranscriptional di Ustilago maydis basato sul genoma recentemente sequenziato e relativa annotazione manuale completo. Abbiamo usato la conoscenza dettagliata disponibile per Saccharomyces cerevisiae ed eucarioti superiori prevedere componenti posttranscriptional in questo patogeno della pianta. Il confronto a S. cerevisiae ha rivelato che la maggior parte dei componenti di base sono condivisi. Entrambi funghi appartengono al piccolo gruppo di organismi privi di componenti del macchinario RNAi. Tuttavia, una notevole differenza esiste a livello della giunzione. U. maydis porti sostanzialmente pi&ugrave; geni contenenti introne e ci&ograve; correla con la presenza di numerosi componenti di giunzione con orthologues umano che sono assenti o meno conservate in S. cerevisiae. In particolare, U. maydis contiene tre dei quattro core proteine della giunzione esone complessa, che &egrave; coinvolto nel trasporto di mRNA citoplasmatici e segna impiombati esoni. In questo contesto, &egrave; anche notevole che il genoma di U. maydis Visualizza componenti coinvolti nel microtubule - piuttosto che trasporto mRNA actina-dipendente. Cos&igrave;, U. maydis potrebbe servire come sistema di modello attraente per acquisire conoscenze romanzo in processi di posttranscriptional.

Le macchine posttranscriptional di Ustilago maydis.

&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x8EE2;&#x5199;&#x3068; Mrna &#x306E;&#x6838;&#x306E;&#x6210;&#x719F;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x52A3;&#x5316;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x304C;&#x7D42;&#x4E86;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x8FD1;&#x914D;&#x5217;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x30DE;&#x30CB;&#x30E5;&#x30A2;&#x30EB;&#x306E;&#x30A2;&#x30CE;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F; Ustilago &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x306E;&#x6A5F;&#x68B0;&#x985E;&#x306E;&#x5728;&#x5EAB;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x51FA;&#x82BD;&#x9175;&#x6BCD;&#x3068;&#x9AD8;&#x7B49;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x77E5;&#x8B58;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3053;&#x306E;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x539F;&#x4F53;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x51FA;&#x82BD;&#x9175;&#x6BCD;&#x306B;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306F;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x30B3;&#x30A2; &#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x304C;&#x5171;&#x6709;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3002;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x83CC;&#x985E; RNAi &#x6A5F;&#x68B0;&#x306E;&#x6210;&#x5206;&#x3092;&#x6B20;&#x304F;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306B;&#x5C5E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x9855;&#x8457;&#x306A;&#x9055;&#x3044;&#x306F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;U. &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x5B9F;&#x8CEA;&#x7684;&#x306B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x6E2F;&#x6E7E;&#x3057;&#x3053;&#x308C;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9; &#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x304C;&#x6B20;&#x5E2D;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x7B2C;&#x30AA;&#x30FC;&#x30BD;&#x30ED;&#x30AC;&#x30B9;&#x3068;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3066;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5C11;&#x306A;&#x3044;&#x51FA;&#x82BD;&#x9175;&#x6BCD;&#x3067;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306B;&#x306F; 3 &#x3046;&#x3061; 4 &#x30B3;&#x30A2;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x3092;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x306E; mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30A8;&#x30AD;&#x30BD;&#x30F3;&#x63A5;&#x5408;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1; - &#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58; mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3; &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x9855;&#x8457;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x529B;&#x3092;&#x5F97;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x9B45;&#x529B;&#x7684;&#x306A;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB; &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5F79;&#x7ACB;&#x3064;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3002;

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&#xC9C4; &#xD575; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xC804;&#xC0AC;&#xC640; &#xD575;&#xC5D0; Mrnas&#xC758; &#xC131;&#xC219; &#xC2DC;&#xC791; &#xD558; &#xACE0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBC88;&#xC5ED; &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8;&#xC758; &#xC800;&#xD558;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xB05D;&#xB0A9;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC120;&#xBB3C;&#xC774; &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB41C; &#xAC8C;&#xB188; &#xBC0F; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; &#xC124;&#xBA85;&#xC11C; &#xC8FC;&#xC11D;&#xC744; &#xADF8;&#xC5D0; &#xAE30;&#xCD08;&#xD55C; Ustilago maydis&#xC758; posttranscriptional &#xAE30;&#xACC4;&#xC758; &#xC778;&#xBCA4;&#xD1A0;&#xB9AC;. &#xC774; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4;&#xC758; posttranscriptional &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC608;&#xCE21; &#xD558;&#xAE30; Saccharomyces cerevisiae&#xC640; &#xB192;&#xC740; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC0C1;&#xC138;&#xD55C; &#xC9C0;&#xC2DD;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. S. cerevisiae&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xACF5;&#xC720; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB450; &#xADE0; RNAi &#xAE30;&#xACC4;&#xC758; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C; &#xBD80;&#xC871; &#xD55C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC791;&#xC740; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC5D0; &#xC18D;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xB208;&#xC5D0; &#xB744;&#xB294; &#xCC28;&#xC774; &#xC811;&#xD569;&#xC758; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC874;&#xC7AC;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC2E4;&#xC9C8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; intron &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xBE44;&#xD638; &#xD558;&#xB294; &#xBBF8;&#xAD6D; maydis&#xC774; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; orthologues &#xACB0; &#xC11D;&#xC73C;&#xB85C; &#xB2E4; &#xBD99;&#xC5EC; &#xC11C; &#xBD80;&#xD488;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xC640; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB610;&#xB294; &#xB35C; S. cerevisiae&#xC5D0; &#xBCF4;&#xC874;. &#xD2B9;&#xD788;, &#xBBF8;&#xAD6D; maydis 3 4 &#xCF54;&#xC5B4; exon &#xC811;&#xD569; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD558; &#xACE0;, &#xC811;&#xD569;&#xB41C; exons &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8; mRNA &#xC804;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD558;&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB9E5;&#xB77D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADF8;&#xAC83;&#xB3C4; &#xB180;&#xB77C;&#xC6B4; &#xBBF8; maydis &#xAC8C;&#xB188; microtubule-&#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; &#xC624;&#xD788;&#xB824; &#xB9D0;&#xB77C; &#xC885;&#xC18D; mRNA &#xC804;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xBBF8;&#xAD6D; maydis posttranscriptional &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC5BB;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xB9E4;&#xB825;&#xC801;&#xC778; &#xBAA8;&#xB378; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Ustilago maydis&#xC758; posttranscriptional &#xAE30;&#xACC4;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Expresi&oacute;n de genes eucariotas comienza con la transcripci&oacute;n y maduraci&oacute;n de mRNAs en el n&uacute;cleo y termina con su traducci&oacute;n y degradaci&oacute;n en el citoplasma. Aqu&iacute;, presentamos un inventario de la maquinaria postranscripcional de Ustilago maydis basada en el genoma secuenciado recientemente y su anotaci&oacute;n manual integral. Utilizamos el conocimiento detallado de Saccharomyces cerevisiae y eucariotas superiores para predecir postranscripcional componentes en este pat&oacute;geno de la planta. La comparaci&oacute;n a S. cerevisiae revel&oacute; que la mayor&iacute;a de componentes b&aacute;sicos son compartidos. Ambos hongos pertenecen al reducido grupo de organismos que carecen de componentes de la maquinaria de RNAi. Sin embargo, una notable diferencia existe a nivel de empalme. U. maydis alberga substancialmente m&aacute;s genes que contienen intr&oacute;n y esto se correlaciona con la presencia de numerosos componentes de empalme con orthologues humano que est&aacute;n ausentes o menos conservadas en S. cerevisiae. En particular, U. maydis contiene prote&iacute;nas de base tres de las cuatro de la ensambladura del ex&oacute;n compleja, que marca los exones empalmados y participa en el transporte de mRNA citopl&aacute;smico. En este contexto, tambi&eacute;n es notable que el genoma de U. maydis muestra los componentes implicados en microt&uacute;bulos - en lugar de transporte del mRNA de actina dependiente. Por lo tanto, U. maydis podr&iacute;a servir como un sistema modelo atractivo para obtener nuevos conocimientos en procesos postranscripcional.

La maquinaria postranscripcional de Ustilago maydis.

&#x6027;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x5728;&#x4EA4;&#x914D;&#x671F;&#x95F4;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x7684;&#x81F4;&#x75C5;&#x6027;&#x81F3;&#x5173;&#x91CD;&#x8981;&#x3002;Prf1 &#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x6D3B;&#x6027;&#x63A7;&#x5236;&#x8F6C;&#x5F55;&#x4E00;&#x7EA7;&#x548C; post-translationally &#x7684;&#x4E1D;&#x88C2;&#x7D20;&#x6D3B;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x6FC0;&#x9176; (MAPK) &#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x6FC0;&#x9176; A &#xFF08;PKA&#xFF09; &#x78F7;&#x9178;&#x5316;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x7CBE;&#x786E;&#x5230;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8F93;&#x51FA;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x89C4;&#x7BA1;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x8D21;&#x732E;&#x662F;&#x672A;&#x77E5;&#x7684;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x57FA;&#x56E0;&#x89E3;&#x5256; Prf1 &#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x5C42;&#x6B21;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x6267;&#x884C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5206;&#x6790;&#x5404;&#x81EA;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x8BC6;&#x522B;&#x548C;&#x5206;&#x7C7B;&#x6307;&#x6807;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x505A;&#x6CD5;&#x663E;&#x793A; prf1 &#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x5BF9;&#x76EE;&#x6807;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x53CA;&#x5176;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7269;&#x9632;&#x6CBB;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#xFF0C;&#x5F3A;&#x8C03;&#x53EA;&#x6709;&#x8F7B;&#x5FAE;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;Prf1 PKA &#x6761;&#x4F8B;&#x662F;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x63A7;&#x5236;&#x5305;&#x62EC;&#x89C4;&#x7BA1;&#x81F4;&#x75C5;&#x4E3B;&#x8981;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x4E5D;&#x4E2A;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x654F;&#x611F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;MAPK &#x8C03;&#x8282;&#x662F;&#x5FC5;&#x8981;&#x7684;&#x4E00;&#x5957; 57 &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;35 &#x4F8B;&#xFF0C;&#x54CD;&#x5E94;&#x6027;&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x662F;&#x5B8C;&#x5168;&#x4E22;&#x5931;&#xFF0C;&#x800C;&#x5176;&#x4F59;&#x7684; 22 &#x4F8B;&#x51CF;&#x8F7B;&#x8C03;&#x8282;&#x4E86;&#x3002;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x65B0;&#x578B;&#x4E2D; MAPK &#x4FE1;&#x53F7;&#x6697;&#x793A;&#x9776;&#x57FA;&#x56E0;&#x5DEE;&#x5F02;&#x56DE;&#x5E94; MAPK &#x78F7;&#x9178;&#x5316;&#x5404;&#x81EA;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x3002;

&#x4FE1;&#x606F;&#x7D20;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x9776;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50; Prf1 MAPK &#x78F7;&#x9178;&#x5316;&#x5DEE;&#x5F02;&#x4F5C;&#x51FA;&#x56DE;&#x5E94;&#x3002;

Pheromone signalling during mating is essential for pathogenicity of Ustilago maydis. The activity of the key transcription factor Prf1 is controlled at the transcriptional level and post-translationally by mitogen-activated protein kinase (MAPK) and protein kinase A (PKA) phosphorylation. However, the precise contribution of these regulatory mechanisms to the transcriptional output is unknown. Here, we genetically dissected the three levels of Prf1 regulation. We performed transcriptional profiling of respective mutants to identify and classify targets. This approach revealed that transcriptional regulation of prf1 had only minor influence on target gene expression stressing the importance of post-translational control. PKA regulation of Prf1 was sufficient to control expression of nine pheromone-responsive genes including the major transcription factor regulating pathogenicity. MAPK regulation was necessary for the pheromone response of a set of 57 genes. In 35 cases, pheromone responsiveness was completely lost, while in the remaining 22 cases regulation was alleviated. This indicated a novel level of complexity in MAPK signalling suggesting that target genes respond differentially to MAPK phosphorylation of the respective transcription factors.

Pheromone-regulated target genes respond differentially to MAPK phosphorylation of transcription factor Prf1.

Ph&eacute;romone signalisation pendant l&#39;accouplement est essentiel pour pathogenicity of Ustilago maydis. L&#39;activit&eacute; du facteur de transcription cl&eacute; Prf1 est contr&ocirc;l&eacute;e au niveau transcriptionnel et post-transcriptionnellement, mitogen-activated protein kinase (MAPK) et de la phosphorylation de la prot&eacute;ine kinase A (PKA). Cependant, la contribution pr&eacute;cise de ces m&eacute;canismes de r&eacute;gulation &agrave; la sortie de transcription est inconnue. Ici, nous avons diss&eacute;qu&eacute; g&eacute;n&eacute;tiquement les trois niveaux de r&eacute;glementation Prf1. Nous avons effectu&eacute; de profilage transcriptionnel de mutants respectifs pour identifier et classer les cibles. Cette approche a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que la r&eacute;gulation transcriptionnelle de prf1 mineur influence sur l&#39;expression de g&egrave;nes cibles soulignant l&#39;importance du contr&ocirc;le de poteau-de translation. R&egrave;glement de PKA de Prf1 ne suffisait pas de contr&ocirc;ler l&#39;expression des g&egrave;nes sensibles aux ph&eacute;romones neuf, dont le facteur de transcription principaux r&eacute;glementant la pathog&eacute;nicit&eacute;. MAPK r&egrave;glement &eacute;tait n&eacute;cessaire pour la r&eacute;action de ph&eacute;romone d&#39;un ensemble de 57 g&egrave;nes. Dans 35 cas, la r&eacute;activit&eacute; de ph&eacute;romone &eacute;tait compl&egrave;tement perdue, tandis que dans les autres 22 cas r&egrave;glement fut all&eacute;g&eacute;e. Ceci indique un nouveau niveau de complexit&eacute; dans MAPK signalisation sugg&eacute;rant que les g&egrave;nes cibles r&eacute;pondent diff&eacute;remment &agrave; la phosphorylation de MAPK des facteurs de transcription respectifs.

G&egrave;nes cibles r&eacute;glement&eacute;es ph&eacute;romone r&eacute;agissent diff&eacute;remment &agrave; la phosphorylation de facteur de transcription Prf1 MAPK.

Pheromon Signalisierung w&auml;hrend der Paarung ist essentiell f&uuml;r die Pathogenit&auml;t von Ustilago Maydis. Die Aktivit&auml;t des wichtigen Transkriptionsfaktors Prf1 wird auf die transkriptionelle Ebene post-translationally von Mitogen-aktivierte Proteinkinase (MAPK) und Kinase A (PKA) Proteinphosphorylierung kontrolliert. Der genaue Beitrag diese Regulierungsmechanismen der transkriptionelle Ausgabe ist jedoch unbekannt. Hier seziert wir genetisch die drei Ebenen der Prf1-Verordnung. Wir spielten transkriptionelle Profilierung der jeweiligen Mutanten zu identifizieren und klassifizieren Ziele. Dieser Ansatz ergab, dass transkriptionelle Regulation von prf1 Ziel Genexpression versprochen, POSTTRANSLATIONELLE Steuerelement nur geringf&uuml;gige beeinflusst. PKA war Prf1 ausreichend zum Ausdruck der neun Pheromon-responsive Gene einschlie&szlig;lich der wichtigen &Uuml;bertragungfaktor Regulierung Pathogenit&auml;t zu steuern. MAPK-Verordnung war notwendig f&uuml;r die Pheromon-Antwort aus einer Reihe von 57 Gene. In 35 F&auml;llen war Pheromon Reaktionsf&auml;higkeit v&ouml;llig verloren, w&auml;hrend in den &uuml;brigen 22 F&auml;llen Verordnung gemildert wurde. Dies angegeben ein neuartiges Ma&szlig; an Komplexit&auml;t in MAPK Signalisierung darauf hindeutet, dass Zielgene differentiell auf MAPK Phosphorylierung von den jeweiligen Transkriptionsfaktoren zu reagieren.

Pheromon regulierte Zielgene reagieren differentiell auf MAPK Phosphorylierung von Transkriptionsfaktor Prf1.

Feromone di segnalazione durante l&#39;accoppiamento &egrave; essenziale per la patogenicit&agrave; di Ustilago maydis. L&#39;attivit&agrave; del fattore di trascrizione chiave Prf1 &egrave; controllato a livello trascrizionale e traduzionali della chinasi di proteina mitogene-attivata (MAPK) e la fosforilazione di proteina chinasi A (PKA). Tuttavia, il contributo di questi meccanismi di regolamentazione per l&#39;output di transcriptional preciso &egrave; sconosciuto. Qui, siamo geneticamente dissecato i tre livelli di regolazione Prf1. Abbiamo eseguito profiling trascrizionale dei rispettivi mutanti per identificare e classificare gli obiettivi. Questo approccio ha rivelato che la regolazione trascrizionale di prf1 aveva solo minore influenza sull&#39;espressione genica sottolineando l&#39;importanza del controllo alberino-di traduzione. Regolamento PKA di Prf1 era sufficiente per controllare l&#39;espressione dei geni feromone-reattive nove, tra cui il fattore di trascrizione importante disciplinare della patogenicit&agrave;. Regolamento MAPK &egrave; stato necessario per la risposta di feromone di una serie di 57 geni. In 35 casi, reattivit&agrave; del feromone &egrave; stato completamente perduto, mentre nei restanti 22 casi regolamento era alleviata. Questo indicato un nuovo livello di complessit&agrave; in MAPK segnalazione suggerendo che geni bersaglio differenzialmente rispondano alla fosforilazione di MAPK i rispettivi fattori di trascrizione.

Geni bersaglio di feromone-regolato differenzialmente rispondono alla fosforilazione di MAPK del fattore di trascrizione Prf1.

&#x4EA4;&#x5C3E;&#x4E2D;&#x306B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3; &#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30AD;&#x30FC;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; Prf1 &#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x3068; post-translationally &#x30DE;&#x30A4;&#x30C8;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC; &#xFF08;MAPK&#xFF09; &#x3068;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC; A(PKA) &#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5236;&#x5FA1;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x8EE2;&#x5199;&#x51FA;&#x529B;&#x306E;&#x6B63;&#x78BA;&#x306A;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x306F;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7D44;&#x307F;&#x63DB;&#x3048; Prf1 &#x898F;&#x5236;&#x306E; 3 &#x3064;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x89E3;&#x5256;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x5206;&#x985E;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F; prf1 &#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x3057;&#x3066;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059;&#x552F;&#x4E00;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CA;&#x30FC;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x304C;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;PKA &#x898F;&#x5236; Prf1 &#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x3092;&#x542B;&#x3080; 9 &#x3064;&#x306E;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x5341;&#x5206;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;MAPK &#x898F;&#x5236;&#x306F; 57 &#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;35 &#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;&#x6B8B;&#x308A;&#x306E; 22 &#x4F8B;&#x3067;&#x898F;&#x5236;&#x7DE9;&#x548C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x4E00;&#x65B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x306F;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x5931;&#x308F;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E; MAPK &#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0; MAPK &#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x3055;&#x306E;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x8868;&#x793A;&#x3002;

&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30F3;&#x8ABF;&#x6574;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; Prf1 &#x306E; MAPK &#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xC9DD;&#xC9D3;&#xAE30; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC2E0;&#xD638; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; Ustilago maydis pathogenicity &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD575;&#xC2EC; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; Prf1 &#xD65C;&#xB3D9; transcriptional &#xC218;&#xC900; &#xBC0F; post-translationally &#xBB3C;&#xC9C8; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD0A4; &#xB2C8; &#xC544; &#xC81C; (MAPK) &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD0A4; &#xB2C8; &#xC544; &#xC81C; A (PKA) &#xC778; &#xC0B0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC81C;&#xC5B4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; transcriptional &#xCD9C;&#xB825;&#xC5D0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xADDC;&#xC81C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC758; &#xC815;&#xD655;&#xD55C; &#xAE30;&#xC5EC;&#xB97C; &#xC54C; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; Prf1 &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158;&#xC758; &#xC138; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xD574; &#xBD80;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xB300;&#xC0C1; &#xBD84;&#xB958;&#xB97C; &#xAC01;&#xAC01; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC758; transcriptional &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;&#xC744; &#xC218;&#xD589; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC774;&#xB807;&#xAC8C; &#xACF5;&#xAC1C; prf1&#xC758; transcriptional &#xADDC;&#xC81C; &#xB2E2; &#xC81C;&#xC5B4;&#xC758; &#xC911;&#xC694;&#xC131;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xC0AC;&#xC18C;&#xD55C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xD588;&#xB2E4;. Prf1&#xC758; PKA &#xADDC;&#xC81C; &#xADDC;&#xC81C; pathogenicity &#xC8FC;&#xC694; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; 9 &#xAC1C;&#xC758; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604; &#xC81C;&#xC5B4; &#xD558;&#xAE30;&#xC5D0; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD588;&#xB2E4;. MAPK &#xADDC;&#xC815; 57 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC9D1;&#xD569; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC694; &#xD588;&#xB2E4;. 35 &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0; &#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xC751;&#xB2F5; &#xB098;&#xBA38;&#xC9C0; 22 &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C; &#xC644;&#xD654;&#xB294; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC644;&#xC804;&#xD788; &#xC190;&#xC2E4; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xBCF5;&#xC7A1;&#xC131; MAPK &#xC2E0;&#xD638; &#xC804;&#xB2EC; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xCC28;&#xB3D9; MAPK &#xAC01;&#xAC01; &#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xC694;&#xC778;&#xC758; &#xC778; &#xC0B0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xC81C;&#xC548;&#xC5D0; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD398;&#xB85C;&#xBAAC; &#xADDC;&#xC81C; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; prf1&#xC758; MAPK &#xC778; &#xC0B0;&#xD654; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC751;&#xB2F5;&#xD560;.

Feromona se&ntilde;alizaci&oacute;n durante el apareamiento es esencial para la patogenicidad de Ustilago maydis. La actividad del factor de transcripci&oacute;n clave Prf1 es controlada a nivel transcripcional y postraduccional por quinasa activada por mit&oacute;geno (MAPK) y fosforilaci&oacute;n de la prote&iacute;na quinasa A (PKA). Sin embargo, la contribuci&oacute;n precisa de estos mecanismos de regulaci&oacute;n a la salida transcripcional se desconoce. Aqu&iacute;, diseccionamos gen&eacute;ticamente los tres niveles de regulaci&oacute;n Prf1. Realizamos perfil transcripcional de mutantes respectivos para identificar y clasificar los objetivos. Este enfoque revel&oacute; que la regulaci&oacute;n transcripcional de prf1 ten&iacute;a s&oacute;lo menor influencia sobre la expresi&oacute;n g&eacute;nica de destino haciendo hincapi&eacute; en la importancia del control poste-de translaci&oacute;n. Reglamento de PKA de Prf1 fue suficiente para controlar la expresi&oacute;n de los genes sensibles al feromonas nueve incluyendo el factor de transcripci&oacute;n mayor patogenicidad de regulaci&oacute;n. Reglamento de MAPK era necesaria para la respuesta de la feromona de un conjunto de genes de 57. En 35 casos, capacidad de respuesta de feromona fue totalmente perdida, mientras que en los 22 casos restantes Reglamento fue aliviada. Esto indica un nuevo nivel de complejidad en MAPK se&ntilde;alizaci&oacute;n sugiriendo que genes diana responden diferencialmente a la fosforilaci&oacute;n de MAPK de los respectivos factores de transcripci&oacute;n.

Genes regulados por feromona Diana responden diferencialmente a la fosforilaci&oacute;n del factor de transcripci&oacute;n Prf1 MAPK.

&#x9AA8;&#x67B6;&#x8FD0;&#x8F93;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x6781;&#x5730;&#x7684;&#x4E1D;&#x72B6;&#x771F;&#x83CC;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#x3002;&#x5728;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#xFF0C;RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4 &#x5F80;&#x8FD4;&#x6CBF;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x548C;&#x4F20;&#x67D3;&#x6027;&#x957F;&#x4E1D;&#x7684;&#x6781;&#x6027;&#x81F3;&#x5173;&#x91CD;&#x8981;&#x3002;RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x57DF;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x5BFC;&#x81F4;&#x4E27;&#x5931;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5C1A;&#x4E0D;&#x6E05;&#x695A;&#x54EA;&#x4E9B; RNAs &#x88AB;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5E76;&#x4F20;&#x8F93;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5E94;&#x7528;&#x4F53;&#x5185; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x7814;&#x7A76;&#x548C;&#x5B9E;&#x65F6;&#x6210;&#x50CF;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#x5206;&#x5B50;&#x7684; Rrm4 &#x51FD;&#x6570;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x65B0;&#x7EC4;&#x5408;&#x663E;&#x793A; Rrm4 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x7F16;&#x7801;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#xFF0C;&#x6CDB;&#x7D20;&#x878D;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Ubi1 &#x548C; Rho3 &#x7684;&#x5C0F; G &#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x72EC;&#x7279; mRNAs &#x4F9D;&#x8D56;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x7684;&#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x7D2F;&#x79EF;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x9897;&#x7C92; &#xFF08;mRNPs&#xFF09;&#xFF0C;&#x79FB;&#x52A8;&#x53CC;&#x5411;&#x6CBF;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x548C; co-localise &#x4E0E;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x5728; 3&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x7684;&#x533A;&#x7684; ubi1 &#x5185;&#x542B;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684; CA mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4F5C;&#x4E3A; zipcode &#x7ED1;&#x5B9A;&#x7AD9;&#x70B9;&#x529F;&#x80FD;&#x3002; Rrm4&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x80FD;&#x52A8;&#x6027; mRNPs &#x4E0D;&#x5F62;&#x6210; Rrm4 &#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x57DF;&#x5220;&#x9664;&#x65F6;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x4ECD;&#x7136;&#x7A7F;&#x68AD;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;Rrm4 &#x6784;&#x6210;&#x8FD0;&#x8F93;&#x673A;&#x68B0;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x8D56; mRNP &#x8D29;&#x8FD0;&#x662F;&#x5F15;&#x8FDB;&#x7F8E;&#x56FD;&#x7389;&#x7C73;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x5438;&#x5F15;&#x4EBA;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x5728;&#x9AD8;&#x7B49;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x7684; mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x83CC;&#x4E1D;&#x751F;&#x957F;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4 &#x4ECB;&#x5BFC; ubi1 &#x548C; rho3 mRNAs &#x7684;&#x957F;&#x9014;&#x7684;&#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;

Cytoskeletal transport promotes polar growth in filamentous fungi. In Ustilago maydis, the RNA-binding protein Rrm4 shuttles along microtubules and is crucial for polarity in infectious filaments. Mutations in the RNA-binding domain cause loss of function. However, it was unclear which RNAs are bound and transported. Here, we applied in vivo RNA binding studies and live imaging to determine the molecular function of Rrm4. This new combination revealed that Rrm4 mediates microtubule-dependent transport of distinct mRNAs encoding, for example, the ubiquitin fusion protein Ubi1 and the small G protein Rho3. These transcripts accumulate in ribonucleoprotein particles (mRNPs) that move bidirectionally along microtubules and co-localise with Rrm4. Importantly, the 3' untranslated region of ubi1 containing a CA-rich binding site functions as zipcode during mRNA transport. Furthermore, motile mRNPs are not formed when the RNA-binding domain of Rrm4 is deleted, although the protein is still shuttling. Thus, Rrm4 constitutes an integral component of the transport machinery. We propose that microtubule-dependent mRNP trafficking is crucial for hyphal growth introducing U. maydis as attractive model for studying mRNA transport in higher eukaryotes.

The fungal RNA-binding protein Rrm4 mediates long-distance transport of ubi1 and rho3 mRNAs.

Transport du cytosquelette favorise la croissance de polaire chez les champignons filamenteuses. En Ustilago maydis, la prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN Rrm4 navettes le long des microtubules et est cruciale pour la polarit&eacute; dans les filaments infectieuses. Mutations dans le domaine de liaison &agrave; l&#39;ARN entra&icirc;ner une perte de fonction. Cependant, on voit mal quels RNAs sont li&eacute;s et transport&eacute;s. Ici, nous avons appliqu&eacute; des &eacute;tudes in vivo de liaison RNA et imagerie direct pour d&eacute;terminer la fonction mol&eacute;culaire de Rrm4. Cette nouvelle combinaison a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que Rrm4 intervient dans le transport d&eacute;pendant du microtubule distinctes ARNm codant, par exemple, la prot&eacute;ine de fusion de l&#39;ubiquitine Ubi1 et la petite prot&eacute;ine G Rho3. Ces transcriptions s&#39;accumulent dans des particules ribonucl&eacute;oprot&eacute;iques (RNPm) qui se d&eacute;placent dans les deux sens le long des microtubules et co-localise avec Rrm4., ce qui est important, la r&eacute;gion 3&#39; non traduite d&#39;ubi1 contenant un riche CA contraignant les fonctions du site comme code postal pendant le transport de l&#39;ARNm. En outre, motile RNPm pas se forment lorsque le domaine de liaison &agrave; l&#39;ARN de Rrm4 est supprim&eacute;, m&ecirc;me si la prot&eacute;ine est toujours la navette. Ainsi, le Rrm4 constitue une partie int&eacute;grante de la machinerie de transport. Nous proposons que le trafic de microtubule-d&eacute;pendante mRNP est crucial pour la croissance des hyphes instaurant une U. maydis mod&egrave;le attrayant pour l&#39;&eacute;tude des transports d&#39;ARNm chez les eucaryotes sup&eacute;rieurs.

La prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN fongique Rrm4 intervient dans le transport &agrave; longue distance des ARNm ubi1 et rho3.

Zytoskelett Transport f&ouml;rdert polare Wachstum in filament&ouml;sen Pilzen. Ustilago Maydis das RNS-bindene Protein Rrm4 Shuttle entlang der Mikrotubuli und ist entscheidend f&uuml;r die Polarit&auml;t in infekti&ouml;sen Filamenten. Mutationen in der RNA-bindende Dom&auml;ne f&uuml;hren Verlust der Funktion. Jedoch war es unklar, welche RNAs gebunden und transportiert werden. Hier wir angewendet, in-vivo RNA-Bindungsstudien und live Imaging die molekulare Funktion des Rrm4 zu bestimmen. Diese neue Kombination ergab, dass Rrm4 Microtubule-abh&auml;ngige Transport unterschiedliche mRNAs Codierung, z. B. der Ubiquitin-Fusionsprotein Ubi1 und die kleinen G-Protein-Rho3 vermittelt. Diese Abschriften sammeln sich in Ribonucleoprotein Partikel (mRNPs), die bewegen bidirektional entlang der Mikrotubuli und co-localise mit Rrm4. wichtiger ist, den 3&#39; Untranslatierter Bereich des ubi1 mit einem CA-reiche Standortfunktionen als Zipcode beim Transport von mRNA binden. Dar&uuml;ber hinaus sind st&auml;bchenf&ouml;rmiges mRNPs nicht gebildet, wenn die RNS-bindene Dom&auml;ne der Rrm4 gel&ouml;scht wird, obwohl das Protein noch pendelt ist. Rrm4 stellt damit, die integralen Bestandteil der Transportmaschinen. Wir schlagen Microtubule-abh&auml;ngige mRNP Handel f&uuml;r geflochtenen Wachstum Einf&uuml;hrung U. Maydis als attraktives Modell f&uuml;r die Untersuchung von mRNA-Transport in den h&ouml;heren Eukaryotes unverzichtbar ist.

Das pilzartige RNS-bindene Protein Rrm4 vermittelt Ferntransport von ubi1 und rho3 mRNAs.

Trasporto del citoscheletro promuove la crescita polare in funghi filamentosi. In Ustilago maydis, il RNA-binding protein Rrm4 la spola lungo i microtubuli ed &egrave; cruciale per la polarit&agrave; in filamenti infettive. Mutazioni nel dominio di RNA-binding causano la perdita di funzione. Tuttavia, non era chiaro quale RNAs sono legati e trasportati. Qui, abbiamo applicato dal vivo imaging per determinare la funzione molecolare di Rrm4 e studi di binding RNA in vivo. Questa nuova combinazione ha rivelato che Rrm4 da intermediario trasporto microtubule-dipendente dei mRNAs distinta codifica, ad esempio, la proteina di fusione di ubiquitin Ubi1 e la piccola proteina G Rho3. Queste trascrizioni si accumulano in particelle di ribonucleoproteina (mRNPs) che si muovono in entrambe le direzioni lungo microtubuli e co-localise con Rrm4. importante, 3&#39; non tradotte regione di ubi1 contenente un ricco CA associazione funzioni del sito come zipcode durante il trasporto di mRNA. Inoltre, mRNPs motili non formano quando viene eliminato il dominio RNA-binding di Rrm4, anche se la proteina &egrave; ancora la spola. Cos&igrave;, Rrm4 costituisce un componente integrale del trasporto macchinari. Proponiamo che il microtubulo-dipendenti mRNP traffico &egrave; cruciale per la crescita ifale introducendo U. maydis come attraente modello per studiare il trasporto di mRNA negli eucarioti superiori.

Il fungine RNA-binding protein Rrm4 media trasporto interurbano dei mRNAs ubi1 e rho3.

&#x7D30;&#x80DE;&#x9AA8;&#x683C;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x7CF8;&#x72B6;&#x83CC;&#x306E;&#x6975;&#x5730;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Ustilago &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA; Rrm4 &#x306F;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x5F80;&#x5FA9;&#x3057;&#x3001;&#x6975;&#x6027;&#x4F1D;&#x67D3;&#x6027;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3069;&#x3061;&#x3089; Rna &#x304C;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x8F38;&#x9001;&#x660E;&#x78BA;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;in vivo RNA &#x7D50;&#x5408;&#x8A66;&#x9A13;&#x3068; Rrm4 &#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6; &#x30A4;&#x30E1;&#x30FC;&#x30B8;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x9069;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B; Rrm4 &#x7570;&#x306A;&#x308B; Mrna &#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3001;&#x305F;&#x3068;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x30E6;&#x30D3;&#x30AD;&#x30C1;&#x30F3;&#x878D;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; Ubi1 &#x3068; G &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; Rho3 &#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58;&#x8F38;&#x9001;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x6210;&#x7E3E;&#x306F;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x3067;&#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x79FB;&#x52D5;&#x3057;&#x3001;Rrm4&#x3002; &#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x306E;&#x306F;&#x3001;co-localise &#x30EA;&#x30DC;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x7C92;&#x5B50; (mRNPs) CA &#x30EA;&#x30C3;&#x30C1;&#x542B;&#x3080; 3&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x9818;&#x57DF; ubi1 &#x306E;&#x84C4;&#x7A4D;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x95A2;&#x6570;&#x3068;&#x3057;&#x3066; zipcode mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x4E2D;&#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Rrm4 &#x306E; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x524A;&#x9664;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x5F80;&#x5FA9;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x904B;&#x52D5; mRNPs &#x5F62;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;Rrm4 &#x306F;&#x8F38;&#x9001;&#x6A5F;&#x68B0;&#x306E;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x306A;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58; mRNP &#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7;&#x304C; U. &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E; mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3092;&#x52C9;&#x5F37;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x9B45;&#x529B;&#x7684;&#x306A;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5C0E;&#x5165;&#x3059;&#x308B;&#x83CC;&#x7CF8;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x306B;&#x3068;&#x3063;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x306E; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; Rrm4 ubi1 &#x3068; rho3 &#x306E; mRNAs &#x306E;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x8F38;&#x9001;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Cytoskeletal &#xC804;&#xC1A1; filamentous &#xACF0; &#xD321;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADF9; &#xC9C0; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xCD09;&#xC9C4;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Ustilago maydis RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rrm4 microtubules &#xB530;&#xB77C; &#xC154;&#xD2C0; &#xACE0; &#xC804;&#xC5FC; &#xC131; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC5D0; &#xADF9;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC911;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. RNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xC774; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC758; &#xC190;&#xC2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xBD88;&#xBD84;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4; &#xC5B4;&#xB5A4; RNAs &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xB41C; &#xBC0F; &#xC774;&#xC1A1;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; rrm4&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9D5; vivo&#xC5D0;&#xC11C; RNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC801;&#xC6A9;. &#xC774; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC870;&#xD569;&#xC744; Rrm4 &#xC720;&#xBE44;&#xD034;&#xD2F4; &#xD4E8;&#xC804; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Ubi1 &#xBC0F; &#xC791;&#xC740; G &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rho3 &#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;, &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xC744; &#xBCC4;&#xAC1C; Mrnas&#xC758; microtubule &#xC885;&#xC18D; &#xC804;&#xC1A1; &#xC911;&#xC7AC; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; microtubules &#xB530;&#xB77C; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xB3D9; &#xD558; &#xACE0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xAC83;&#xC740;, Rrm4. co-localise ribonucleoprotein &#xC785;&#xC790; (mRNPs)&#xC5D0; 3&#39; &#xB9DE;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED; ubi1&#xC758; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; CA&#xC774; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xCD95;&#xC801; mRNA &#xC804;&#xC1A1; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC6B0;&#xD3B8;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;. &#xB610;&#xD55C;, &#xBA54;&#xAD6C;&#xBBF8; Mrnps&#xB294; &#xD615;&#xC131; &#xB418;&#xC9C0; Rrm4 RNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC744; &#xC0AD;&#xC81C; &#xD558;&#xBA74; &#xBE44;&#xB85D; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC5EC;&#xC804;&#xD788; &#xC600;&#xC8E0;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, Rrm4 &#xC804;&#xC1A1; &#xAE30;&#xACC4;&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xAD6C;&#xC131;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; microtubule &#xC885;&#xC18D; mRNP &#xC778;&#xC2E0; &#xB9E4;&#xB9E4;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; mRNA &#xAD50;&#xD1B5; &#xACF5;&#xBD80;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xB9E4;&#xB825;&#xC801;&#xC778; &#xBAA8;&#xB378;&#xB85C; &#xBBF8;&#xAD6D; maydis &#xC18C;&#xAC1C; hyphal &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC81C;&#xC548; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xACF0; &#xD321;&#xC774; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rrm4 ubi1 &#xBC0F; rho3 Mrnas&#xC758; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC218;&#xC1A1;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC;.

Citoesqueleto transporte promueve crecimiento polar en hongos filamentosos. Ustilago maydis, la prote&iacute;na de uni&oacute;n de ARN Rrm4 traslados a lo largo de los microt&uacute;bulos y es crucial para la polaridad en filamentos infecciosas. Las mutaciones en el dominio de uni&oacute;n de ARN causan p&eacute;rdida de la funci&oacute;n. Sin embargo, no estaba claro qu&eacute; RNAs son limitados y transportados. Aqu&iacute;, se aplicaron estudios in vivo de enlace de RNA y en proyecci&oacute;n de imagen para determinar la funci&oacute;n molecular de Rrm4. Esta nueva combinaci&oacute;n revel&oacute; que Rrm4 media transporte dependiente de microt&uacute;bulos de distintos mRNAs que codifican, por ejemplo, la prote&iacute;na de fusi&oacute;n de ubiquitina Ubi1 y la peque&ntilde;a prote&iacute;na G Rho3. Estas transcripciones acumulan part&iacute;culas Ribonucleoprote&iacute;na (mRNPs) que se mueven de forma bidireccional a lo largo de los microt&uacute;bulos y co-localise con Rrm4., la regi&oacute;n 3&#39; no traducida de ubi1 que contiene un CA-rico vinculantes las funciones del sitio como c&oacute;digo postal durante el transporte del mRNA. Adem&aacute;s, mRNPs m&oacute;viles no se forman cuando se elimina el dominio de uni&oacute;n de ARN de Rrm4, aunque todav&iacute;a es trasladar la prote&iacute;na. As&iacute;, Rrm4 constituye un componente integral de la maquinaria de transporte. Proponemos que el tr&aacute;fico de mRNP dependiente de microt&uacute;bulos es crucial para el crecimiento hifal introducci&oacute;n U. maydis como buen modelo para estudiar el transporte de mRNA en eucariotas superiores.

La prote&iacute;na de uni&oacute;n a RNA hongo Rrm4 media de transporte interurbano de ubi1 y rho3.

RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x6784;&#x6210;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8C03;&#x8282;&#x86CB;&#x767D;&#x8BC6;&#x522B;&#x76EE;&#x6807;&#x8A8A;&#x672C;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x3001; &#x6210;&#x719F;&#x3001; &#x7FFB;&#x8BD1;&#x6216;&#x7A33;&#x5B9A;&#x7684;&#x5206;&#x6CCC;&#x4E2D;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5143;&#x7D20;&#x3002;&#x5728;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#xFF0C;&#x8BC1;&#x636E;&#x79EF;&#x7D2F;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#x786E;&#x5B9A;&#x81F4;&#x75C5;&#x6027;&#x3002;&#x5220;&#x9664; khd4&#xFF0C;&#x7F16;&#x7801;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x4E0E;&#x4E94; K &#x540C;&#x6E90; (KH) &#x57DF;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x5F02;&#x5E38;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5F62;&#x6001;&#x548C;&#x51CF;&#x5C11;&#x6BD2;&#x529B;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5C55;&#x793A; Khd4 &#x786E;&#x8BA4;&#x5E8F;&#x5217; AUACCC &#x4F53;&#x5185;&#x901A;&#x8FC7;&#x5176;&#x4E32;&#x8054; KH &#x57DF; 3 &#x548C; 4&#x3002;&#x6B64;&#x5E8F;&#x5217;&#x6700;&#x6709;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x76D1;&#x7BA1; RNA &#x5143;&#x7D20;&#x5728;&#x7F8E;&#x56FD;&#x7389;&#x7C73;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5B83;&#x5728; 3&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x533A;&#x57DF;&#x79EF;&#x7D2F;&#x3002;&#x59CB;&#x7EC8;&#x5982;&#x4E00;&#xFF0C;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684; mRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x65B9;&#x6CD5;&#x663E;&#x793A;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x6BCD;&#x9898;&#x5927;&#x5927;&#x7684;&#x5145;&#x5B9E;&#xFF0C;&#x5728;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x663E;&#x793A;&#x6539;&#x53D8; khd4Delta &#x682A;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;&#x7531;&#x4E8E;&#x7EDD;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7684;&#x6F5C;&#x5728; Khd4 &#x76EE;&#x6807; mRNAs &#x5C55;&#x793A;&#x4E2D;&#x7A81;&#x53D8;&#x7684;&#x589E;&#x52A0;&#x7684;&#x91D1;&#x989D;&#xFF0C;Khd4 &#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x4FC3;&#x8FDB; mRNA &#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x3002;&#x4E0D;&#x80FD;&#x7ED1;&#x5B9A; AUACCC &#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#xFF0C;&#x54EA;&#x4E9B;&#x5C55;&#x54C1;&#x6539;&#x53D8;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5F62;&#x6001;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x5B89;&#x4E1D;&#x72B6;&#x83CC;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#xFF0C;&#x548C;&#x4E25;&#x91CD;&#x51CF;&#x5C11;&#x6BD2;&#x529B;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;RNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x662F;&#x57FA;&#x672C;&#x51FD;&#x6570;&#x7684; Khd4&#xFF0C;&#x5F3A;&#x8C03;&#x5F62;&#x6001;&#x53CA;&#x81F4;&#x75C5;&#x6027;&#x7684;&#x8C03;&#x8282;&#x8F6C;&#x5F55;&#x63A7;&#x5236;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3002;

&#x4E32;&#x8054; KH &#x57DF; Khd4 &#x7684;&#x627F;&#x8BA4; AUACCC &#x548C;&#x81F3;&#x5173;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x5F62;&#x6001;&#x4EE5;&#x53CA;&#x81F4;&#x75C5;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x7684;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;

RNA-binding proteins constitute key factors of the post-transcriptional machinery. These regulatory proteins recognize specific elements within target transcripts to promote, for example, maturation, translation, or stability of mRNAs. In Ustilago maydis, evidence is accumulating that post-transcriptional processes are important to determine pathogenicity. Deletion of khd4, encoding a predicted RNA-binding protein with five K homology (KH) domains, causes aberrant cell morphology and reduced virulence. Here, we demonstrate that Khd4 recognizes the sequence AUACCC in vivo via its tandem KH domains 3 and 4. This sequence most likely functions as a regulatory RNA element in U. maydis, since it accumulates in 3' untranslated regions. Consistently, an independent mRNA expression profiling approach revealed that the binding motif is significantly enriched in transcripts showing altered expression levels in khd4Delta strains. Since the vast majority of potential Khd4 target mRNAs exhibit increased amounts in deletion mutants, Khd4 might promote mRNA instability. Mutants that fail to bind AUACCC resemble deletion mutants, which exhibit altered cell morphology, disturbed filamentous growth, and severely reduced virulence. Hence, RNA binding is essential for function of Khd4, stressing the importance of post-transcriptional control in regulating morphology and pathogenicity.

Tandem KH domains of Khd4 recognize AUACCC and are essential for regulation of morphology as well as pathogenicity in Ustilago maydis.

Prot&eacute;ines de liaison &agrave; l&#39;ARN constituent des facteurs cl&eacute;s de la machinerie post-transcriptionnelle. Ces prot&eacute;ines r&eacute;gulatrices reconnaissent des &eacute;l&eacute;ments sp&eacute;cifiques au sein des transcriptions de la cible &agrave; promouvoir, par exemple, la maturation, la traduction ou stabilit&eacute; des ARNm. En Ustilago maydis, preuves s&#39;accumulent que processus post-transcriptionnelle sont importants d&eacute;terminer la pathog&eacute;nicit&eacute;. Suppression de khd4, codant pour une prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN pr&eacute;dite avec K cinq domaines d&#39;homologie (KH), provoque la morphologie des cellules anormales et r&eacute;duit la virulence. Ici, nous d&eacute;montrons que Khd4 reconna&icirc;t la s&eacute;quence AUACCC in vivo par l&#39;interm&eacute;diaire de ses domaines KH tandem 3 et 4. Cette s&eacute;quence a tr&egrave;s probablement fonctionne comme un &eacute;l&eacute;ment r&eacute;gulateur du RNA dans U. maydis, car il s&#39;accumule dans les r&eacute;gions 3&#39; non traduite. R&eacute;guli&egrave;rement, un ARNm ind&eacute;pendant approche de profilage de l&#39;expression a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que le motif de liaison est consid&eacute;rablement enrichi dans les transcriptions montrant modification des niveaux d&#39;expression chez les souches khd4Delta. &Eacute;tant donn&eacute; que la grande majorit&eacute; des ARNm de cible potentielle Khd4 pi&egrave;ce quantit&eacute;s accrues chez les mutants de d&eacute;l&eacute;tion, Khd4 pourraient favoriser l&#39;instabilit&eacute; ARNm. Mutants qui ne parviennent pas &agrave; lier les AUACCC ressemblent aux mutants de d&eacute;l&eacute;tion, quelle pi&egrave;ce alt&eacute;r&eacute; la morphologie cellulaire, perturb&eacute; la croissance filamenteuse et r&eacute;duit consid&eacute;rablement la virulence. ARN contraignantes est donc essentielle pour la fonction de Khd4, soulignant l&#39;importance du contr&ocirc;le post-transcriptionnels dans la r&eacute;gulation de la morphologie et la pathog&eacute;nicit&eacute;.

Domaines KH en tandem de Khd4 reconnaissent AUACCC et sont essentiels &agrave; la r&eacute;gulation de la morphologie mais aussi de pathog&eacute;n&eacute;cit&eacute; chez Ustilago maydis.

RNA-bindende Proteine bilden die Schl&uuml;sselfaktoren der Posttranskriptionale Maschine. Diese regulatorischen Proteine erkennen bestimmte Elemente innerhalb deiner Abschriften zu f&ouml;rdern, zum Beispiel, Reifung, &Uuml;bersetzung oder Stabilit&auml;t mRNAs. In Ustilago Maydis ist Beweise gesammelt, dass Posttranskriptionale Prozesse wichtig festzustellen, Pathogenit&auml;t sind. L&ouml;schen von khd4, f&uuml;r eine vorhergesagte RNS-bindene Protein mit f&uuml;nf K Homologie (KH) Dom&auml;nen, bewirkt, dass aberrante Zellmorphologie und Virulenz reduziert. Hier zeigen wir, dass Khd4 die Sequenz AUACCC in-vivo &uuml;ber deren Tandem-KH-Dom&auml;nen, 3 und 4 erkennt. Diese Sequenz funktioniert h&ouml;chstwahrscheinlich als regulatorische RNA Element U. Maydis, da es in 3&#39; nicht &uuml;bersetzte Regionen ansammelt. Konsequent, ver&auml;ndert eine unabh&auml;ngige mRNA Ausdruck Profilerstellung Ansatz ergeben, dass das Bindung-Motiv in &quot;Protokolle&quot; zeigen erheblich bereichert wird Ausdruck Niveaus bei den khd4Delta St&auml;mmen. Da die &uuml;berwiegende Mehrheit der potenziellen Khd4 Ziel mRNAs h&ouml;here Betr&auml;ge in L&ouml;schung durch Mutation entstehende Variationen aufweisen, k&ouml;nnte Khd4 mRNA Instabilit&auml;t f&uuml;hren. Mutanten, die nicht AUACCC binden &auml;hneln L&ouml;schung Mutanten, welche Ausstellung ver&auml;ndert Zellmorphologie filament&ouml;sen Wachstum gest&ouml;rt und stark reduziert Virulenz. Daher ist RNA Bindung notwendig f&uuml;r die Funktion des Khd4, betont die Bedeutung der Posttranskriptionale Kontrolle bei der Regulierung von Morphologie und Pathogenit&auml;t.

Tandem-KH-Dom&auml;nen der Khd4 AUACCC zu erkennen und sind unerl&auml;sslich f&uuml;r die Regulierung der Morphologie als auch die Pathogenit&auml;t in Ustilago Maydis.

RNA-binding proteins costituiscono fattori chiave della macchina espresione. Queste proteine regolatorie riconoscono elementi specifici all&#39;interno di trascrizioni di destinazione per promuovere, ad esempio, maturazione, traduzione o stabilit&agrave; dei mRNAs. In Ustilago maydis, sta accumulando prove che i processi di espresione sono importanti per determinare patogenicit&agrave;. Eliminazione di khd4, che codifica per una proteina di RNA-binding prevista con K cinque dominii di omologia (KH), causa la morfologia cellulare aberrante e ridotto virulenza. Qui, noi dimostrare che Khd4 riconosce la sequenza AUACCC in vivo attraverso i suoi domini KH tandem 3 e 4. Questa sequenza probabilmente funziona come un elemento normativo di RNA in U. maydis, dato che si accumula nelle regioni non tradotta 3&#39;. Coerentemente, un indipendente mRNA expression profiling approccio ha rivelato che il motivo di associazione &egrave; notevolmente arricchito in trascrizioni mostrando alterati livelli di espressione nei ceppi di khd4Delta. Dal momento che la stragrande maggioranza dei potenziali Khd4 destinazione mRNAs Mostra maggiore quantit&agrave; di mutanti di delezione, Khd4 potrebbe promuovere instabilit&agrave; di mRNA. Mutanti che non riescono a legare AUACCC assomigliano a mutanti di delezione, quale morfologia cellulare Mostra alterato, disturbato filamentosa crescita e severamente ridotto virulenza. Quindi, RNA binding &egrave; essenziale per la funzione di Khd4, sottolineando l&#39;importanza del controllo posttrascrizionale nel regolare la morfologia e la patogenicit&agrave;.

Tandem KH domini di Khd4 AUACCC di riconoscere e sono essenziali per la regolazione della morfologia, come pure la patogenicit&agrave; in Ustilago maydis.

RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x306E;&#x6A5F;&#x68B0;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x8981;&#x56E0;&#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3001;&#x305F;&#x3068;&#x3048;&#x3070;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x6210;&#x7E3E;&#x8A3C;&#x660E;&#x66F8;&#x3001;&#x6210;&#x719F;&#x3001;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F; Mrna &#x306E;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x5185;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x3092;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Ustilago &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x304C;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x84C4;&#x7A4D;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x306E; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; 5 K &#x30DB;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC; (KH) &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3001;khd4 &#x306E;&#x524A;&#x9664;&#x306F;&#x7570;&#x5E38;&#x306A;&#x7D30;&#x80DE;&#x5F62;&#x614B;&#x306E;&#x539F;&#x56E0;&#x3057;&#x3001;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x3092;&#x524A;&#x6E1B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061; Khd4 AUACCC &#x305D;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0; KH &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; 3 &#x3068; 4 &#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066; in vivo &#x3067;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3092;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;3&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x9818;&#x57DF;&#x306B;&#x84C4;&#x7A4D;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3053;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x3082;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x7C73;&#x56FD;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306E;&#x898F;&#x5236; RNA &#x8981;&#x7D20;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E00;&#x8CAB;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x7D50;&#x5408;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x7E3E;&#x8A3C;&#x660E;&#x66F8;&#x306E;&#x8868;&#x793A;&#x4E2D;&#x306B;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x5BCC;&#x3080;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x5F0F;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x72EC;&#x7ACB;&#x306E; mRNA &#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB; khd4Delta &#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3002;&#x6B20;&#x5931;&#x5909;&#x7570;&#x682A;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x91CF;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A; Khd4 &#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; Mrna &#x306E;&#x5927;&#x534A;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x304C;&#x3001;Khd4 mRNA &#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;AUACCC &#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x306B;&#x5931;&#x6557;&#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x3069;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x5C55;&#x793A;&#x7D30;&#x80DE;&#x5F62;&#x614B;&#x7CF8;&#x72B6;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x90AA;&#x9B54;&#x3057;&#x3001;&#x53B3;&#x3057;&#x304F;&#x6E1B;&#x5C11;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x6B20;&#x5931;&#x5909;&#x7570;&#x3001;&#x4F3C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x6545;&#x306B;&#x3001;RNA &#x7D50;&#x5408;&#x5F62;&#x614B;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x3059;&#x308B;&#x306F;&#x3001;&#x6A5F;&#x80FD; Khd4 &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0; KH &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; Khd4 &#x306E; AUACCC &#x8A8D;&#x8B58;&#x3057;&#x3001;&#x5F62;&#x614B;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

Post-transcriptional &#xAE30;&#xACC4;&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xAD6C;&#xC131; &#xD558;&#xB294; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xADDC;&#xC81C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD64D;&#xBCF4;, &#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4; &#xB300;&#xC0C1; &#xC99D;&#xBA85;&#xC11C;, &#xC131;&#xC219;, &#xBC88;&#xC5ED;, &#xB610;&#xB294; Mrnas&#xC758; &#xC548;&#xC815;&#xC131; &#xB0B4;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xC778;&#xC2DD;. Ustilago maydis&#xC5D0; &#xC99D;&#xAC70; post-transcriptional &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xB294; pathogenicity &#xACB0;&#xC815; &#xCD95;&#xC801; &#xC774;&#xB2E4;. Khd4, 5 K homology (&#xC0AC;&#xC758; KH) &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;, &#xC608;&#xCE21; &#xB41C; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC0AD;&#xC81C; &#xD0C8; &#xC120; &#xC138;&#xD3EC; &#xD615;&#xD0DC;&#xD559; &#xC6D0;&#xC778;&#xACFC; &#xB3C5;&#xC131; &#xAC10;&#xC18C;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; Khd4 &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; AUACCC &#xC5F0;&#xB3D9; KH &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; 3 &#xBC0F; 4&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC778;&#xC2DD; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC774;&#xD6C4; 3&#39; untranslated &#xC601;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD95;&#xC801; &#xBBF8; maydis&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xADDC;&#xC81C; RNA &#xC694;&#xC18C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC791;&#xB3D9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC77C;&#xAD00; &#xB418; &#xAC8C;, &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xC811;&#xADFC; &#xC2DD; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xC131;&#xC801;&#xD45C;&#xC5D0; &#xB18D;&#xCD95; &#xD06C;&#xAC8C; &#xBC1D;&#xD600; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; mRNA khd4Delta &#xBCC0;&#xC885; &#xC2DD; &#xC218;&#xC900; &#xBCC0;&#xACBD;. &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; Khd4 &#xB300;&#xC0C1; Mrnas&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC788;&#xB294; &#xC99D;&#xAC00; &#xAE08;&#xC561; &#xC804;&#xC2DC;, &#xC774;&#xD6C4; Khd4 mRNA &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xC744; &#xC62C;&#xB9AC;&#xAE30;&#xB3C4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. AUACCC &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; &#xC2E4;&#xD328; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xB2EE;&#xC740; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;, &#xC804;&#xC2DC; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC140; &#xD615;&#xD0DC;&#xB294; filamentous &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xBC29;&#xD574; &#xD558; &#xACE0; &#xC2EC;&#xAC01; &#xD558; &#xAC8C; &#xB3C5;&#xC131;&#xC744; &#xAC10;&#xC18C;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; RNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xD615;&#xD0DC;&#xD559; &#xBC0F; pathogenicity &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; post-transcriptional &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864;&#xC758; &#xC911;&#xC694;&#xC131;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD558;&#xBA70; Khd4&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Khd4&#xC758; &#xD611;&#xB3D9; KH &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; AUACCC &#xC778;&#xC2DD; &#xD558; &#xACE0; &#xD615;&#xD0DC;&#xD559; Ustilago maydis&#xC5D0; pathogenicity&#xC758; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Prote&iacute;nas de uni&oacute;n de ARN constituyen factores clave de la maquinaria postranscripcional. Estas prote&iacute;nas reguladoras reconocen elementos espec&iacute;ficos dentro de transcripciones de objetivo promover, por ejemplo, maduraci&oacute;n, traducci&oacute;n o la estabilidad de los mRNAs. En Ustilago maydis, est&aacute; acumulando pruebas que postranscripcional procesos son importantes para determinar la patogenicidad. Eliminaci&oacute;n de khd4, codificando una prote&iacute;na de uni&oacute;n de ARN predijo con K cinco dominios de homolog&iacute;a (KH), provoca la morfolog&iacute;a celular aberrante y reduce la virulencia. Aqu&iacute;, demostramos que Khd4 reconoce la secuencia AUACCC en vivo a trav&eacute;s de sus dominios de t&aacute;ndem KH 3 y 4. Esta secuencia probablemente funciona como un elemento regulador del RNA en U. maydis, puesto que se acumula en las regiones no traducidas 3&#39;. Constantemente, un mRNA independiente expresi&oacute;n perfiles enfoque revel&oacute; que el motivo de Uni&oacute;n se enriquece significativamente en transcripciones mostrando alterado los niveles de expresi&oacute;n en cepas de khd4Delta. Puesto que la mayor&iacute;a de los potenciales Khd4 destino mRNAs exhibe mayores cantidades en mutantes de deleci&oacute;n, Khd4 podr&iacute;a promover la inestabilidad del mRNA. Mutantes que no enlazar AUACCC se asemejan a mutantes de deleci&oacute;n, que morfolog&iacute;a celular alterada de la exposici&oacute;n, disturba crecimiento filamentoso y reducido severamente la virulencia. Por lo tanto, enlace de RNA es esencial para la funci&oacute;n de Khd4, destacando la importancia del control post-transcripcional en la regulaci&oacute;n de la morfolog&iacute;a y patogenicidad.

T&aacute;ndem KH dominios de Khd4 reconocen AUACCC y son esenciales para la regulaci&oacute;n de la morfolog&iacute;a como patogenicidad en Ustilago maydis.

&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x548C;&#x672C;&#x5730;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x7684; mRNAs &#x6784;&#x6210;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x6B63;&#x786E;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9776;&#x5411;&#x3002;mRNA &#x5B9A;&#x4F4D;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684; mRNPs&#xFF0C;&#x5927;&#x578B;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x5206;&#x6CCC;&#x6D3B;&#x52A8;&#x4F20;&#x8F93;&#x548C;&#x76F8;&#x5173;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x7B49;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;&#x5206;&#x5B50;&#x9A6C;&#x8FBE;&#x5206;&#x522B;&#x79FB;&#x6CBF;&#x808C;&#x52A8;&#x86CB;&#x767D;&#x6216;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x9AA8;&#x67B6;&#x7684;&#x77ED;&#x9014;&#x6216;&#x957F;&#x9014;&#x8D29;&#x8FD0;&#x3001; mRNPs&#x3002;&#x5728;&#x4E1D;&#x72B6;&#x771F;&#x83CC;&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x7684;&#x8FDC;&#x8DDD;&#x79BB;&#x8FD0;&#x8F93;&#x7684;&#x6C34;&#x6CE1;&#xFF0C;&#x6240;&#x6D89;&#x53CA;&#x7684;&#x819C;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x7684;&#x6269;&#x5C55;&#xFF0C;&#x652F;&#x6301;&#x9AD8;&#x6548;&#x7684;&#x83CC;&#x4E1D;&#x751F;&#x957F;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5206;&#x6CCC;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x8FD0;&#x8F93;&#x662F;&#x6781;&#x5730;&#x5FEB;&#x901F;&#x751F;&#x957F;&#x7684;&#x7389;&#x7C73;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x75C5;&#x83CC;&#x4F20;&#x67D3;&#x4E1D;&#x7684;&#x5FC5;&#x8981;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x7ED3;&#x5408;&#x4F53;&#x5185;&#x7D2B;&#x5916;&#x5149;&#x4EA4;&#x8054;&#x548C; RNA &#x5B9E;&#x65F6;&#x6210;&#x50CF;&#x663E;&#x793A; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4&#xFF0C;&#x8FD9;&#x662F; mRNP &#x8FD0;&#x8F93;&#x673A;&#x68B0;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x4E0D;&#x540C;&#x5206;&#x6CCC;&#x6781;&#x6027;&#x56E0;&#x7D20;&#x3001; &#x86CB;&#x767D;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x56E0;&#x7D20;&#x548C;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7684; mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x8FDB;&#x5316;&#x5B88;&#x6052;&#x4ECE;&#x771F;&#x83CC;&#x5BF9;&#x9AD8;&#x7B49;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x3002;&#x8FD9;&#x5C31;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E86;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x5174;&#x594B;&#x7684;&#x7F8E;&#x56FD;&#x7389;&#x7C73;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6A21;&#x578B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x63ED;&#x9732;&#x7684; mRNA &#x957F;&#x9014;&#x8FD0;&#x8F93;&#x7684;&#x57FA;&#x672C;&#x6982;&#x5FF5;&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x4E2D;&#x7684;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7684; mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x3002;

The localization and local translation of mRNAs constitute an important mechanism to promote the correct subcellular targeting of proteins. mRNA localization is mediated by the active transport of mRNPs, large assemblies consisting of mRNAs and associated factors such as RNA-binding proteins. Molecular motors move mRNPs along the actin or microtubule cytoskeleton for short-distance or long-distance trafficking, respectively. In filamentous fungi, microtubule-based long-distance transport of vesicles, which are involved in membrane and cell wall expansion, supports efficient hyphal growth. Recently, we discovered that the microtubule-mediated transport of mRNAs is essential for the fast polar growth of infectious filaments in the corn pathogen Ustilago maydis. Combining in vivo UV cross-linking and RNA live imaging revealed that the RNA-binding protein Rrm4, which constitutes an integral part of the mRNP transport machinery, mediates the transport of distinct mRNAs encoding polarity factors, protein synthesis factors, and mitochondrial proteins. Moreover, our results indicate that microtubule-dependent mRNA transport is evolutionarily conserved from fungi to higher eukaryotes. This raises the exciting possibility of U. maydis as a model system to uncover basic concepts of long-distance mRNA transport.

Microtubule-dependent mRNA transport in fungi.

La localisation et la traduction locale des ARNm constituent un m&eacute;canisme important pour promouvoir le bon ciblage subcellulaire des prot&eacute;ines. Localisation de l&#39;ARNm est m&eacute;di&eacute;e par le transport actif de RPN, grands assemblages comprenant des ARNm et associ&eacute;s &agrave; des facteurs tels que les prot&eacute;ines de liaison &agrave; l&#39;ARN. Moteurs mol&eacute;culaires d&eacute;placent RNPm le long du cytosquelette d&#39;actine ou microtubules pour trafic de courte distance ou longue distance, respectivement. Chez les champignons filamenteuses, ax&eacute;e sur les microtubules des transports longue distance de v&eacute;sicules, qui interviennent dans la membrane et l&#39;expansion de la paroi cellulaire, soutient la croissance des hyphes efficace. R&eacute;cemment, nous avons d&eacute;couvert que le transport m&eacute;di&eacute;e par les microtubules des ARNm est essentiels pour la croissance rapide de polaire de filaments infectieuses de l&#39;agent pathog&egrave;ne du ma&iuml;s Ustilago maydis. Combinant la r&eacute;ticulation UV in vivo et imagerie live RNA a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que la prot&eacute;ine de liaison &agrave; l&#39;ARN Rrm4, ce qui constitue une partie int&eacute;grante de la machinerie de transport mRNP, intervient dans le transport de diff&eacute;rents ARNm codant des facteurs de polarit&eacute;, facteurs de la synth&egrave;se des prot&eacute;ines et prot&eacute;ines mitochondriales. En outre, nos r&eacute;sultats indiquent que le transport d&eacute;pendant du microtubule ARNm est &eacute;volutivement conserv&eacute; de champignons aux eucaryotes sup&eacute;rieurs. Cela soul&egrave;ve la possibilit&eacute; passionnante d&#39;u. maydis comme syst&egrave;me mod&egrave;le pour d&eacute;couvrir les concepts de base du transport longue distance de mRNA.

Transport de mRNA microtubule-d&eacute;pendant chez les champignons.

Die Lokalisierungs- und lokalen mRNAs bilden ein wichtiges Instrument zur F&ouml;rderung der richtigen subzellulare Ausrichtung der Proteine. mRNA Lokalisierung wird vermittelt durch den aktiven Transport von mRNPs, gro&szlig;e Baugruppen bestehend aus mRNAs und verbundenen Faktoren wie RNS-bindene Proteine. Molekulare Motoren bewegen mRNPs entlang Actin oder Microtubule Zytoskeletts f&uuml;r Kurzstrecken bzw. Fernverbindungen Menschenhandel, beziehungsweise. Filament&ouml;se Pilze unterst&uuml;tzt Microtubule-basierte G&uuml;terfernverkehr Bl&auml;schen, die Zellmembran und die Zellwand Ausbau beteiligt sind, effiziente geflochtenen Wachstum. Vor kurzem entdeckten wir, dass der Microtubule-vermittelten Transport von mRNAs f&uuml;r das schnelle polar Wachstum infekti&ouml;ser Filamente in der Mais-Erreger Ustilago Maydis wichtig. Kombination von in-vivo-UV-Vernetzung und RNA Leben Bildgebung ergab, dass das RNA-verbindliches Protein Rrm4, die integralen Bestandteil der Transportmaschinen mRNP darstellt, den Transport von unterschiedliche mRNAs Codierung Polarit&auml;t Faktoren, Faktoren der Protein-Synthese und mitochondriale Proteine vermittelt. Dar&uuml;ber hinaus zeigen unsere Ergebnisse, dass Microtubule-abh&auml;ngige mRNA Transport aus Pilzen evolution&auml;r, zu h&ouml;heren Eukaryotes konserviert wird. Dies wirft die spannende M&ouml;glichkeit U. Maydis als Modellsystem Grundkonzepte der mRNA-Ferntransport aufzudecken.

Microtubule-abh&auml;ngige mRNA Transport in Pilzen.

La localizzazione e traduzione locale dei mRNAs costituiscono un importante meccanismo per promuovere il corretto targeting subcellulare delle proteine. localizzazione di mRNA &egrave; mediata dal trasporto attivo di mRNPs, grandi assiemi costituiti mRNAs e associati fattori quali RNA-binding proteins. Motori molecolari spostare mRNPs lungo il citoscheletro di actina o microtubulo per traffico di corto-distanza o interurbano, rispettivamente. Nei funghi filamentosi, trasporto interurbano microtubule-based delle vescicole, che sono coinvolti nella membrana e parete cellulare espansione, sostiene la crescita ifale efficiente. Recentemente, abbiamo scoperto che il trasporto dei mRNAs microtubule-mediata &egrave; essenziale per la crescita veloce polare di filamenti infettive in agente patogeno granoturco Ustilago maydis. Combinando la reticolazione UV in vivo e RNA live imaging ha rivelato che il RNA-binding protein Rrm4, che costituisce parte integrante del macchinario di trasporto mRNP, media il trasporto dei mRNAs distinta codifica polarit&agrave; fattori, fattori di sintesi proteica e le proteine mitocondriali. Inoltre, i nostri risultati indicano che trasporto mRNA microtubule-dipendente &egrave; evolutivamente conservato da funghi a eucarioti superiori. Questo solleva l&#39;eccitante possibilit&agrave; di U. maydis come sistema di modello per scoprire i concetti di base del trasporto a lunga distanza di mRNA.

Trasporto di mRNA microtubulo-dipendenti nei funghi.

&#x5C40;&#x5728;&#x3068; Mrna &#x306E;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EB;&#x7FFB;&#x8A33;&#x6B63;&#x3057;&#x3044;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5BFE;&#x8C61;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;mRNA &#x306E;&#x5C40;&#x5728;&#x306F; mRNPs &#x306E; mRNAs &#x304B;&#x3089;&#x6210;&#x308B;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x306E;&#x80FD;&#x52D5;&#x8F38;&#x9001;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3055;&#x308C;&#x3001;RNA &#x7D50;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5206;&#x5B50;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C; mRNPs &#x306F;&#x77ED;&#x8DDD;&#x96E2;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x4EBA;&#x8EAB;&#x58F2;&#x8CB7;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x7D30;&#x80DE;&#x9AA8;&#x683C;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x79FB;&#x52D5;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7CF8;&#x72B6;&#x83CC;&#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x8F38;&#x9001;&#x819C;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x306E;&#x62E1;&#x5927;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x30D9;&#x30B7;&#x30AF;&#x30EB;&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x83CC;&#x7CF8;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x3001;Mrna &#x306E;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F;&#x7269;&#x8CEA;&#x8F38;&#x9001;&#x304C;&#x9AD8;&#x901F;&#x6975;&#x6027;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x75C5;&#x539F;&#x30C8;&#x30A6;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B3;&#x30B7;&#x9ED2;&#x7A42;&#x75C5;&#x83CC;&#x611F;&#x67D3;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7D2B;&#x5916;&#x7DDA; in vivo &#x67B6;&#x6A4B;&#x3068; RNA &#x30E9;&#x30A4;&#x30D6; &#x30A4;&#x30E1;&#x30FC;&#x30B8;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x305F; RNA &#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; mRNP &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x6A5F;&#x68B0;&#x306E;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x306A;&#x90E8;&#x5206;&#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3059;&#x308B; Rrm4 &#x6975;&#x6027;&#x8981;&#x56E0;&#x3001;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x5408;&#x6210;&#x306E;&#x8981;&#x56E0;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x5225;&#x500B;&#x306E; Mrna &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58; mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x304C;&#x9032;&#x5316;&#x7684;&#x306B;&#x9AD8;&#x7B49;&#x751F;&#x7269;&#x83CC;&#x985E;&#x304B;&#x3089;&#x304C;&#x7BC0;&#x7D04;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2; mRNA &#x8F38;&#x9001;&#x306E;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x6982;&#x5FF5;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB; &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066; U. &#x30A2;&#x30EB;&#x30C6;&#x30EA;&#x30B7;&#x30B8;&#x30F3;&#x306E;&#x30A8;&#x30AD;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306A;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x767A;&#x751F;&#x3055;&#x305B;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x771F;&#x83CC;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58; mRNA &#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3002;

&#xD604;&#xC9C0;&#xD654; &#xBC0F; &#xB85C;&#xCEEC; &#xBC88;&#xC5ED; Mrnas&#xC758; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC62C;&#xBC14;&#xB978; subcellular &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xD64D;&#xBCF4; &#xD558;&#xB294; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xAD6C;&#xC131;. mRNA &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; mRNPs, Mrnas&#xC758;&#xB85C; &#xAD6C;&#xC131; &#xB41C; &#xB300;&#xD615; &#xC5B4;&#xC148;&#xBE14;&#xB9AC;&#xC758; &#xB2A5;&#xB3D9; &#xC218;&#xC1A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC911;&#xC7AC; &#xBC0F; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB4F1;&#xC758; &#xC694;&#xC18C;. &#xBD84;&#xC790; &#xBAA8;&#xD130;&#xB294; &#xAC01;&#xAC01; mRNPs &#xB2E8;&#xAC70;&#xB9AC; &#xB610;&#xB294; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xBC00;&#xB9E4;, &#xB9D0;&#xB77C; &#xB610;&#xB294; microtubule cytoskeleton &#xB530;&#xB77C; &#xC774;&#xB3D9;. Filamentous &#xACF0; &#xD321;&#xC774;, &#xB9C9;&#xACFC; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xD655;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; vesicles&#xC758; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC804;&#xC1A1; microtubule &#xAE30;&#xBC18; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778; hyphal &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; mRNAs microtubule &#xC911;&#xC7AC; &#xC804;&#xC1A1; Ustilago maydis &#xC625;&#xC218;&#xC218; &#xBCD1;&#xC6D0; &#xCCB4;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC5FC; &#xC131; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC758; &#xBE60;&#xB978; &#xADF9; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. RNA &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9D5; vivo&#xC5D0;&#xC11C; &#xC790;&#xC678;&#xC120; &#xAD50;&#xCC28; &#xACB0;&#xD569; &#xACF5;&#xAC1C; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rrm4 mRNP &#xC804;&#xC1A1; &#xAE30;&#xACC4;&#xC758; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xBD80;&#xBD84;&#xC744; &#xAD6C;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; mRNAs &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xADF9;&#xC131; &#xC694;&#xC778;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD569;&#xC131; &#xC694;&#xC18C; &#xBC0F; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC;&#xB9AC; &#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC218;&#xC1A1;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; microtubule &#xC885;&#xC18D; mRNA &#xC804;&#xC1A1; &#xB192;&#xC740; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xACF0; &#xD321;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C4;&#xD654; &#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCF4;&#xC874;&#xC740; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; mRNA &#xC804;&#xC1A1;&#xC758; &#xAE30;&#xBCF8; &#xAC1C;&#xB150;&#xC744; &#xBC1D;&#xD788;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBAA8;&#xB378; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC73C;&#xB85C; &#xBBF8;&#xAD6D; maydis&#xC758; &#xD765;&#xBBF8; &#xC9C4; &#xC9C4;&#xD55C; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC744; &#xC81C;&#xAE30; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;.

&#xACF0; &#xD321;&#xC774;&#xC5D0; microtubule &#xC885;&#xC18D; mRNA &#xC804;&#xC1A1;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

La localizaci&oacute;n y la traducci&oacute;n local de mRNAs constituyen un mecanismo importante para promover la correcta focalizaci&oacute;n subcelular de las prote&iacute;nas. localizaci&oacute;n de mRNA est&aacute; mediada por el transporte activo de mRNPs, grandes ensamblajes de mRNAs y asociado a factores como las prote&iacute;nas de uni&oacute;n de ARN. Motores moleculares mover mRNPs a lo largo del citoesqueleto de actina o microt&uacute;bulos para el tr&aacute;fico de corta distancia o larga distancia, respectivamente. En hongos filamentosos, transporte interurbano basadas en microt&uacute;bulos de ves&iacute;culas, que est&aacute;n implicadas en la membrana y la expansi&oacute;n de la pared celular, apoya el crecimiento hifal eficiente. Recientemente, hemos descubierto que el transporte mediada por microt&uacute;bulos de mRNAs es esencial para el crecimiento r&aacute;pido polar de filamentos infecciosas en el pat&oacute;geno de ma&iacute;z Ustilago maydis. Combinando el Cross-linking de la UV en vivo y proyecci&oacute;n de imagen de RNA vivo revel&oacute; que la prote&iacute;na de uni&oacute;n a RNA Rrm4, que constituye una parte integral de la maquinaria de transporte mRNP, interviene en el transporte de distintos mRNAs que codifican factores de polaridad, factores de s&iacute;ntesis de prote&iacute;na y prote&iacute;nas mitocondriales. Por otra parte, nuestros resultados indican que transporte del mRNA de microt&uacute;bulos dependiente est&aacute; conservada evolutivamente de hongos a eucariotas superiores. Esto plantea la posibilidad emocionante de U. maydis como sistema modelo para descubrir los conceptos b&aacute;sicos de transporte interurbano de mRNA.

Transporte de ARNm de microt&uacute;bulos dependiente en hongos.

&#x771F;&#x6838;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6838;&#x5185;&#x306B;&#x3001;&#x65B0;&#x751F;&#x8EE2;&#x5199;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x306E;hnRNP C&#x3067;&#x6838;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x7C92;&#x5B50;&#x304C;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7C92;&#x5B50;&#x306F;pre-mRNA&#x306E;&#x51E6;&#x7406;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x306F;&#x4E0D;&#x660E;&#x306E;&#x307E;&#x307E;&#x7570;&#x7A2E;&#x6838;&#x30EA;&#x30DC;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#xFF08;&#x306E;hnRNP&#xFF09;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x306E;hnRNP C&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;UV&#x67B6;&#x6A4B;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF08;iCLIP&#xFF09;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; iCLIP&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x306E;hnRNP C&#x306F;&#x306E;hnRNP&#x7C92;&#x5B50;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3068;&#x306E;&#x4E00;&#x8CAB;&#x6027;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9577;&#x671F;&#x306E;&#x9593;&#x9694;&#x3067;&#x30A6;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x7BA1;&#x3092;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x306E;hnRNP&#x7C92;&#x5B50;&#x306F;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3068;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;&#x7D44;&#x307F;&#x7ACB;&#x3066;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x304B;&#x3089;&#x9664;&#x5916;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x307E;&#x307E;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002; &#x26;quot;RNA&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x26;quot;&#x306B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;iCLIP&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3068;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x306F;&#x306E;hnRNP&#x7C92;&#x5B50;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x304C;&#x5225;&#x306E;&#x30A8;&#x30AD;&#x30BD;&#x30F3;&#x3092;&#x542B;&#x3081;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x305D;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;iCLIP&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x80FD;&#x529B;&#x306F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x9AD8;&#x6B21;&#x306E;&#x30EA;&#x30DC;&#x6838;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x79D8;&#x3081;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

ICLIP&#x306F;&#x3001;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;hnRNP&#x7C92;&#x5B50;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;

&#xC9C4; &#xD575; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xD575;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD08;&#xAE30; &#xC131;&#xC801; &#xC99D;&#xBA85;&#xC11C; hnRNP c.&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; nucleated &#xC774;&#xC885; &#xD575; ribonucleoprotein (hnRNP) &#xC785;&#xC790;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD48D;&#xC694;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0;, &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xB0A8;&#xC544; &#xBD88;&#xBD84;&#xBA85;&#xC774; &#xC785;&#xC790; &#xC911; mRNA &#xCC98;&#xB9AC;&#xB97C; &#xC81C;&#xC5B4; &#xD558;&#xB294; &#xC5EC;&#xBD80;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xAC1C;&#xC778; &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC790;&#xC678;&#xC120; &#xAD50;&#xCC28; &#xBC0F; immunoprecipitation (iCLIP) &#xC811;&#xD569; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158;&#xC5D0; hnRNP C&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xAC1C;&#xBC1C;. iCLIP &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC815;&#xC758; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xAC04;&#xACA9;&#xC774; &#xC77C;&#xCE58; hnRNP &#xC785;&#xC790; &#xC870;&#xC9C1; uridine &#xCC45;&#xC790;&#xB97C; &#xC778;&#xC2DD; &#xD558;&#xB294; &#xADF8; hnRNP C &#xD45C;&#xC2DC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. hnRNP &#xC785;&#xC790; &#xB450; introns&#xC5D0; &#xBAA8;&#xC774;&#xACE0; exons &#xC2A4;&#xD50C;&#xB77C;&#xC774;&#xC2A4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC81C;&#xC678; &#xB41C; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC;. Transcriptome &#xC804;&#xCCB4; iCLIP &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC640; &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#39;RNA &#xC9C0;&#xB3C4;&#39;&#xC5D0; &#xC811;&#xD569; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xC548;&#xC758; &#xD1B5;&#xD569; &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xB300;&#xCCB4; exons&#xC758; &#xD3EC;&#xD568;&#xC5D0; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xACB0;&#xC815; hnRNP &#xC785;&#xC790;&#xC758; &#xC704;&#xCE58;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xADDC;&#xC815;&#xC758; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; iCLIP &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xB2E4;&#xB978; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; ribonucleoprotein &#xB2E8;&#xC9C0;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC57D;&#xC18D;&#xC744; &#xBCF4;&#xC720; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;.

iCLIP hnRNP &#xC785;&#xC790; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC811;&#xD569; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xBC1D;&#xD799;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Nel nucleo delle cellule eucariotiche, nascente trascrizioni sono associate con particelle eterogenee ribonucleoproteina nucleare (hnRNP) che sono nucleate dal hnRNP C. Nonostante la loro abbondanza, tuttavia, &egrave; rimasto poco chiaro se queste particelle controllano l&#39;elaborazione pre-mRNA. Qui, abbiamo sviluppato la risoluzione del singolo-nucleotide UV cross-linking e immunoprecipitazione (iCLIP) per studiare il ruolo di hnRNP C regolamento splicing. iCLIP dati mostrano che hnRNP C riconosce tratti uridina con una spaziatura a lungo raggio definito coerenza con l&#39;organizzazione delle particelle hnRNP. hnRNP particelle montare su entrambi gli introni e gli esoni ma rimangono generalmente esclusi dai siti di splicing. Integrazione di dati di livello transcriptome iCLIP e alternative splicing profili in una mappa di&#39; RNA&#39; indica come il posizionamento delle particelle hnRNP determina il loro effetto sull&#39;inclusione degli esoni alternativi. La capacit&agrave; di dati ad alta risoluzione iCLIP per fornire intuizioni, il meccanismo di questo regolamento mantiene la promessa per gli studi di altri complessi di ordine superiore ribonucleoproteina.

iCLIP rivela la funzione di particelle hnRNP nello splicing alla risoluzione di singoli nucleotidi.

&#x5728;&#x771F;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#xFF0C;&#x65B0;&#x751F;&#x7684;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x90FD;&#x7531; hnRNP C.&#x5FAE;&#x6676;&#x7684;&#x5F02;&#x6784;&#x6838;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x86CB;&#x767D; (hnRNP) &#x7C92;&#x5B50;&#x4E0E;&#x5173;&#x8054;&#x5C3D;&#x7BA1;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7684;&#x4E30;&#x5EA6;&#xFF0C;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5B83;&#x4ECD;&#x4E0D;&#x6E05;&#x695A;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7C92;&#x5B50;&#x662F;&#x5426;&#x63A7;&#x5236;&#x9884; mRNA &#x52A0;&#x5DE5;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5236;&#x5B9A;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x51B3;&#x8BAE;&#x7D2B;&#x5916;&#x5149;&#x4EA4;&#x8054;&#x548C;&#x6C89;&#x6DC0; (iCLIP) &#x7814;&#x7A76; hnRNP C &#x62FC;&#x63A5;&#x8C03;&#x63A7;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;iCLIP &#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x663E;&#x793A;&#xFF0C;hnRNP C &#x786E;&#x8BA4;&#x5C3F;&#x82F7;&#x5927;&#x7247;&#x7684;&#x5DF2;&#x5B9A;&#x4E49;&#x7684;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x95F4;&#x8DDD;&#x7B26;&#x5408; hnRNP &#x7C92;&#x5B50;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;hnRNP &#x7C92;&#x5B50;&#x88C5;&#x914D;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x548C;&#x4ECE;&#x63A5;&#x5934;&#x5730;&#x70B9;&#x7528;&#x4F46;&#x4ECD;&#x666E;&#x904D;&#x88AB;&#x6392;&#x9664;&#x5728;&#x5916;&#x3002;&#x96C6;&#x6210;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5168; iCLIP &#x6570;&#x636E;&#x548C;&#x526A;&#x63A5;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x8FDB; &#39;RNA &#x5730;&#x56FE;&#39; &#x6307;&#x793A;&#x5982;&#x4F55;&#x5B9A;&#x4F4D; hnRNP &#x7C92;&#x5B50;&#x786E;&#x5B9A;&#x5B83;&#x4EEC;&#x5BF9;&#x5217;&#x5165;&#x66FF;&#x4EE3;&#x7528;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387; iCLIP &#x6570;&#x636E;&#x80FD;&#x591F;&#x6DF1;&#x5165;&#x4E86;&#x89E3;&#x6B64;&#x8C03;&#x63A7;&#x673A;&#x5236;&#x7814;&#x7A76;&#x5176;&#x4ED6;&#x9AD8;&#x9636;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x590D;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x6709;&#x524D;&#x9014;&#x3002;

iCLIP &#x63ED;&#x793A;&#x4E86; hnRNP &#x4E2D;&#x7684;&#x7C92;&#x5B50;&#x5728;&#x5355;&#x4E2A;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x62FC;&#x63A5;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;

In the nucleus of eukaryotic cells, nascent transcripts are associated with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) particles that are nucleated by hnRNP C. Despite their abundance, however, it remained unclear whether these particles control pre-mRNA processing. Here, we developed individual-nucleotide resolution UV cross-linking and immunoprecipitation (iCLIP) to study the role of hnRNP C in splicing regulation. iCLIP data show that hnRNP C recognizes uridine tracts with a defined long-range spacing consistent with hnRNP particle organization. hnRNP particles assemble on both introns and exons but remain generally excluded from splice sites. Integration of transcriptome-wide iCLIP data and alternative splicing profiles into an 'RNA map' indicates how the positioning of hnRNP particles determines their effect on the inclusion of alternative exons. The ability of high-resolution iCLIP data to provide insights into the mechanism of this regulation holds promise for studies of other higher-order ribonucleoprotein complexes.

iCLIP reveals the function of hnRNP particles in splicing at individual nucleotide resolution.

Dans le noyau des cellules eucaryotes, les transcriptions naissantes sont associ&#xE9;es &#xE0; ribonucl&#xE9;oprot&#xE9;ine nucl&#xE9;aire h&#xE9;t&#xE9;rog&#xE8;ne (hnRNP) des particules qui sont nucl&#xE9;&#xE9;es par hnRNP C. En d&#xE9;pit de leur abondance, cependant, il n&#x26;#39;&#xE9;tait pas &#xE9;vident de savoir si ces particules contr&#xF4;ler pr&#xE9;-ARNm de traitement. Ici, nous avons d&#xE9;velopp&#xE9; UV r&#xE9;solution individuelle-nucl&#xE9;otide r&#xE9;ticulation et immunopr&#xE9;cipitation (iClip) pour &#xE9;tudier le r&#xF4;le de hnRNP C dans la r&#xE9;gulation de l&#x26;#39;&#xE9;pissage. les donn&#xE9;es montrent que iClip hnRNP C reconna&#xEE;t tracts uridine avec une d&#xE9;finition &#xE0; long terme compatible avec l&#x26;#39;espacement organisation de particules hnRNP. particules hnRNP monter sur les deux introns et des exons, mais restent g&#xE9;n&#xE9;ralement exclus des sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage. L&#x26;#39;int&#xE9;gration des donn&#xE9;es du transcriptome &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle iClip et les profils d&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif dans un &#xAB;ARN carte&#xBB; indique la fa&#xE7;on dont le positionnement des particules hnRNP d&#xE9;termine leur effet sur l&#x26;#39;inclusion des exons alternatifs. La capacit&#xE9; de donn&#xE9;es iClip haute r&#xE9;solution pour fournir des indications sur le m&#xE9;canisme de cette r&#xE9;gulation est tr&#xE8;s prometteuse pour les &#xE9;tudes d&#x26;#39;autres complexes ribonucl&#xE9;oprot&#xE9;iques d&#x26;#39;ordre sup&#xE9;rieur.

IClip R&#xE9;v&#xE8;le la fonction des particules hnRNP dans l&#x26;#39;&#xE9;pissage &#xE0; la r&#xE9;solution de nucl&#xE9;otides individuels

Im Zellkern des eukaryotischen Zellen sind entstehende Transkripte heterogene nuclear Ribonucleoprotein (HnRNP) Teilchen, die durch HnRNP C. kernhaltigen sind zugeordnet Trotz ihrer F&uuml;lle blieb jedoch unklar, ob diese Partikel Pre-mRNA-Verarbeitung zu steuern. Hier entwickelten wir individuell-Nukleotid-Aufl&ouml;sung UV Vernetzung und Immunopr&auml;zipitation (iCLIP), die Rolle der HnRNP C Splei&szlig;en Verordnung zu studieren. iCLIP Daten zeigen, dass diese HnRNP C Uridin Landstriche mit einer definierten Langstrecken Abstand mit HnRNP Partikel Organisation erkennt. HnRNP Teilchen montieren auf beiden Introns und Exons bleiben aber generell ausgeschlossen von Splice-Sites. Integration von Transkriptom-weite iCLIP Daten und Alternative Splei&szlig;en Profile in eine &#39;RNA-Zuordnung&#39; gibt an, wie die Positionierung der HnRNP Teilchen ihre Wirkung auf die Einbeziehung des alternativer Exons bestimmt. Die F&auml;higkeit des hochaufl&ouml;senden iCLIP Daten, Einblicke in den Mechanismus dieser Verordnung vielversprechend f&uuml;r Studien der anderen h&ouml;herer Ordnung-Gebiets-komplexe.

iCLIP zeigt die Funktion HnRNP Teilchen in Splei&szlig;en bei einzelnen Nukleotid-Aufl&ouml;sung.

En el n&#xFA;cleo de las c&#xE9;lulas eucariotas, las transcripciones nacientes est&#xE1;n asociadas con ribonucleoprote&#xED;na nuclear heterog&#xE9;neo (hnRNP) las part&#xED;culas que son nucleados por hnRNP C. A pesar de su abundancia, sin embargo, no qued&#xF3; claro si estas part&#xED;culas controlar pre-mRNA de procesamiento. En este sentido, hemos desarrollado el individuo nucle&#xF3;tidos UV resoluci&#xF3;n de entrecruzamiento e inmunoprecipitaci&#xF3;n (iClip) para estudiar el papel de hnRNP C en la regulaci&#xF3;n de empalme. los datos muestran que iClip hnRNP C reconoce extensiones de uridina con una definida a largo plazo en consonancia con la organizaci&#xF3;n de separaci&#xF3;n de part&#xED;culas hnRNP. part&#xED;culas hnRNP montamos en ambos intrones y exones, pero siguen por lo general excluidos de los sitios de empalme. Integraci&#xF3;n de datos de toda la transcriptoma iClip y perfiles de splicing alternativo en un &#x26;#39;mapa de ARN&#x26;#39; indica la posici&#xF3;n de las part&#xED;culas de hnRNP determina su efecto sobre la inclusi&#xF3;n de los exones alternativos. La capacidad de datos de alta resoluci&#xF3;n iClip para proporcionar informaci&#xF3;n sobre el mecanismo de este reglamento es una promesa para los estudios de otros complejos de ribonucleoprote&#xED;na de orden superior.

IClip revela la funci&#xF3;n de las part&#xED;culas hnRNP en el empalme en la Resoluci&#xF3;n Individual de nucle&#xF3;tidos

&#x9009;&#x62E9;&#x6027;&#x526A;&#x63A5;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x6D89;&#x53CA; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x63A5;&#x5934;&#x5730;&#x70B9;&#x9760;&#x8FD1;&#x524D; mRNA &#x9635;&#x5730;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;T &#x7EC6;&#x80DE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5185;&#x6297;&#x539F; 1 (TIA1) &#x548C; TIA1 &#x6837; 1 (TIAL1) &#x672C;&#x5730;&#x62DB;&#x8058;&#x5230; 5&#39; U1 snRNP &#x901A;&#x8FC7;&#x589E;&#x5F3A;&#x5916;&#x663E;&#x5B50;&#x5217;&#x5165;&#x62FC;&#x63A5;&#x7684;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x77ED;&#x6682;&#x6027;&#x8111;&#x7F3A;&#x8840;&#x53D1;&#x4F5C;&#x86CB;&#x767D;&#x5BF9;&#x62FC;&#x63A5;&#x7684;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x7528;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x6709;&#x6CA1;&#x6709;&#x5C1A;&#x672A;&#x63A2;&#x8BA8;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7528;&#x7D2B;&#x5916;&#x5149;&#x4EA4;&#x8054;&#x548C;&#x6C89;&#x6DC0; (iCLIP) &#x6765;&#x67E5;&#x627E; TIA1 &#x548C; TIAL1 &#x7ED1;&#x5B9A;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B; RNAs &#x4E0A;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3002;&#x5177;&#x6709;&#x7EA6;&#x675F;&#x529B;&#x7684;&#x4E0B;&#x6E38; 5 &#39; &#x63A5;&#x5934;&#x5730;&#x70B9;&#x7528;&#x6765;&#x9884;&#x6D4B;&#x5728;&#x52A0;&#x5F3A;&#x7684;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x7528;&#x5305;&#x5BB9;&#x548C;&#x6C89;&#x9ED8;&#x7684;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x7528;&#x5305;&#x5BB9;&#x7684;&#x77ED;&#x6682;&#x6027;&#x8111;&#x7F3A;&#x8840;&#x53D1;&#x4F5C;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x9884;&#x6D4B;&#x7ED3;&#x679C;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x4F7F;&#x7528;&#x63A5;&#x5934;&#x4EA4;&#x754C;&#x82AF;&#x7247;&#x3001; &#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;-&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x548C;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7684;&#x6784;&#x9020;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E; TIA &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4FDD;&#x6301;&#x62FC;&#x63A5;&#x4FDD;&#x771F;&#x5EA6;&#x548C;&#x89C4;&#x7BA1;&#x901A;&#x8FC7;&#x6709;&#x7EA6;&#x675F;&#x529B;&#x7684;&#x4E13;&#x95E8;&#x4E0B;&#x6E38;&#x526A;&#x63A5;&#x4E0D;&#x504F;&#x4E0D;&#x501A;&#x5730; 5 &#39; &#x526A;&#x63A5;&#x7684;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3002;&#x5947;&#x602A;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;TIA &#x62FC;&#x63A5;&#x7AD9;&#x70B9;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5728; 5&#39; &#x6C89;&#x9ED8;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x5361;&#x5E26;&#x548C;&#x4E0D;&#x53D7;&#x89C4;&#x7BA1;&#x7684;&#x66FF;&#x4EE3; 3&#39; &#x63A5;&#x8FD1;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x53D8;&#x91CF;&#x957F;&#x5EA6;&#x7528;&#x62FC;&#x63A5;&#x7684;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528; TIA RNA &#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5168;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x6620;&#x5C04;&#x8BA1;&#x7B97;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x62FC;&#x63A5;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x77ED;&#x6682;&#x6027;&#x8111;&#x7F3A;&#x8840;&#x53D1;&#x4F5C;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x90FD;&#x7B26;&#x5408; TIA &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5728;&#x7F29;&#x77ED;&#x53EF;&#x7528;&#x4E8E;&#x66FF;&#x4EE3;&#x7684;&#x5916;&#x663E;&#x5B50;&#x7684;&#x5B9A;&#x4E49;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x52A0;&#x5F3A;&#x524D;&#x9762;&#x7684; 5&#39; &#x526A;&#x63A5;&#x4F4D;&#x7AD9;&#x70B9;&#x8BC6;&#x522B;&#x6A21;&#x578B;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x62FC;&#x63A5;&#x52A8;&#x529B;&#x5B66;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x53EF;&#x4EE5;&#x8C03;&#x89E3;&#x7684;&#x526A;&#x63A5;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;

iCLIP &#x9884;&#x6D4B; TIA RNA &#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x62FC;&#x63A5;&#x7684;&#x53CC;&#x91CD;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

The regulation of alternative splicing involves interactions between RNA-binding proteins and pre-mRNA positions close to the splice sites. T-cell intracellular antigen 1 (TIA1) and TIA1-like 1 (TIAL1) locally enhance exon inclusion by recruiting U1 snRNP to 5' splice sites. However, effects of TIA proteins on splicing of distal exons have not yet been explored. We used UV-crosslinking and immunoprecipitation (iCLIP) to find that TIA1 and TIAL1 bind at the same positions on human RNAs. Binding downstream of 5' splice sites was used to predict the effects of TIA proteins in enhancing inclusion of proximal exons and silencing inclusion of distal exons. The predictions were validated in an unbiased manner using splice-junction microarrays, RT-PCR, and minigene constructs, which showed that TIA proteins maintain splicing fidelity and regulate alternative splicing by binding exclusively downstream of 5' splice sites. Surprisingly, TIA binding at 5' splice sites silenced distal cassette and variable-length exons without binding in proximity to the regulated alternative 3' splice sites. Using transcriptome-wide high-resolution mapping of TIA-RNA interactions we evaluated the distal splicing effects of TIA proteins. These data are consistent with a model where TIA proteins shorten the time available for definition of an alternative exon by enhancing recognition of the preceding 5' splice site. Thus, our findings indicate that changes in splicing kinetics could mediate the distal regulation of alternative splicing.

iCLIP predicts the dual splicing effects of TIA-RNA interactions.

La r&#xE9;gulation de l&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif implique des interactions entre les prot&#xE9;ines liant l&#x26;#39;ARN et de pr&#xE9;-ARNm des positions proches des sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage. T-antig&#xE8;ne de cellule intracellulaire 1 (TIA1) et TIA1-like 1 (TIAL1) localement renforcer l&#x26;#39;inclusion exon en recrutant U1 snRNP &#xE0; des sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage 5 &#x26;#39;. Cependant, les effets des prot&#xE9;ines TIA sur l&#x26;#39;&#xE9;pissage des exons distales n&#x26;#39;ont pas encore &#xE9;t&#xE9; explor&#xE9;. Nous avons utilis&#xE9; UV-r&#xE9;ticulation et immunopr&#xE9;cipitation (iClip) pour trouver qui se lient et TIA1 TIAL1 aux m&#xEA;mes positions sur des ARN de l&#x26;#39;homme. Aval de liaison de sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage 5 &#x26;#39;a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9; pour pr&#xE9;dire les effets des prot&#xE9;ines TIA dans l&#x26;#39;am&#xE9;lioration de l&#x26;#39;inclusion des exons proximales et faire taire l&#x26;#39;inclusion des exons distales. Les pr&#xE9;dictions ont &#xE9;t&#xE9; valid&#xE9;es de mani&#xE8;re impartiale &#xE0; l&#x26;#39;aide d&#x26;#39;&#xE9;pissage jonction microarrays, RT-PCR, et les constructions minig&#xE8;ne, qui ont montr&#xE9; que les prot&#xE9;ines TIA maintenir la fid&#xE9;lit&#xE9; &#xE9;pissage et de r&#xE9;glementer l&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif en se liant exclusivement en aval de sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage 5 &#x26;#39;. &#xC9;tonnamment, la TIA contraignant &#xE0; 5 &#x26;#39;des sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage silence cassettes distale et de longueur variable exons sans se lier &#xE0; proximit&#xE9; des r&#xE9;glement&#xE9;es solution 3&#x26;#39; des sites d&#x26;#39;&#xE9;pissage. Utilisation du transcriptome &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle cartographie haute r&#xE9;solution de la norme TIA-ARN interactions, nous avons &#xE9;valu&#xE9; les effets d&#x26;#39;&#xE9;pissage distales des prot&#xE9;ines TIA. Ces donn&#xE9;es sont compatibles avec un mod&#xE8;le o&#xF9; les prot&#xE9;ines TIA raccourcir le temps disponible pour la d&#xE9;finition d&#x26;#39;un exon alternatif par la reconnaissance de l&#x26;#39;am&#xE9;lioration du site d&#x26;#39;&#xE9;pissage 5 qui pr&#xE9;c&#xE8;de &#xBB;. Ainsi, nos r&#xE9;sultats indiquent que les changements dans la cin&#xE9;tique d&#x26;#39;&#xE9;pissage pourrait servir de m&#xE9;diateur de la r&#xE9;glementation distale de l&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif.

IClip pr&#xE9;dit les effets d&#x26;#39;&#xE9;pissage double de la norme TIA-ARN Interactions

Die Regulierung der alternatives Splei&szlig;en beinhaltet Interaktionen zwischen RNA-bindende Proteine und Pre-mRNA Positionen nahe der Splei&szlig;-Sehensw&uuml;rdigkeiten. Intrazellul&auml;re T-Zell-Antigen 1 (TIA1) und TIA1 wie 1 (TIAL1) lokal Exon-Integration zu verbessern, durch die Einstellung von U1 SnRNP bis 5&#39; splice Sites. Jedoch haben Auswirkungen der TIA Proteine auf Splei&szlig;en des distalen Exons noch nicht erforscht. UV-Vernetzung und Immunopr&auml;zipitation (iCLIP) k&ouml;nnen wir feststellen, dass TIA1 und TIAL1 an den gleichen Positionen auf menschliche RNAs binden verwendet. Verbindliche stromabw&auml;rts der 5&#39; Splei&szlig;stelle Websites wurde verwendet, um die Auswirkungen des TIA-Proteine in der Verbesserung der Eingliederung des proximalen Exons und Unterdr&uuml;ckender Aufnahme des distalen Exons. Die Vorhersagen waren auf unvoreingenommene Weise mit Splei&szlig;-Kreuzung Microarrays, RT-PCR und Minigene Konstrukte, die zeigte, dass TIA Proteine Splei&szlig;en Treue pflegen und alternatives Splei&szlig;en durch binden ausschlie&szlig;lich stromabw&auml;rts zu Regeln validiert der 5&#39; Splei&szlig;stelle Websites. &Uuml;berraschenderweise TIA Bindung auf 5&#39; Splei&szlig;stelle Websites zum Schweigen distale Kassette und variabler L&auml;nge Exons ohne Bindung in der N&auml;he der geregelten Alternative 3&#39; Splei&szlig;stelle Websites. Transkriptom-weite hochaufl&ouml;sende Zuordnung von TIA-RNA Interaktionen werteten wir die distalen Splei&szlig;en Auswirkungen der TIA Proteine. Diese Daten stehen im Einklang mit einem Modell wo TIA Proteine der Frist f&uuml;r die Definition einer alternative Exon verk&uuml;rzen, durch verst&auml;rkte Anerkennung der vorhergehenden 5&#39; Splice Site. Unsere Einsch&auml;tzungen zufolge somit &Auml;nderungen im Splei&szlig;en Kinetik die distale Regulierung von alternatives Splei&szlig;en vermitteln konnte.

iCLIP prognostiziert die dualen Splei&szlig;en Auswirkungen der TIA-RNA-Interaktionen.

Il regolamento di splicing alternativo coinvolge interazioni tra posizioni pre-mRNA nei pressi dei siti di splicing e RNA-binding proteins. Antigene intracellulare delle cellule T 1 (TIA1) e TIA1-like 1 (TIAL1) localmente migliorare l&#39;inclusione esone reclutando U1 snRNP al 5&#39; impiombare siti. Tuttavia, gli effetti delle proteine di TIA su splicing degli esoni distali non sono ancora stati esplorati. Abbiamo usato la reticolazione UV e immunoprecipitazione (iCLIP) per trovare che la TIA1 e TIAL1 associare presso le stesse posizioni sulla RNAs umana. Associazione a valle di 5&#39; siti splice &egrave; stato utilizzato per prevedere gli effetti delle proteine di TIA nel migliorare l&#39;inclusione degli esoni prossimali e mettendo a tacere l&#39;inclusione degli esoni distali. Le previsioni sono state convalidate in modo imparziale usando i microarrays splice junction, RT-PCR e costrutti minigene, che ha mostrato che le proteine TIA mantengano fedelt&agrave; splicing e regolano lo splicing alternativo legandosi esclusivamente a valle di 5&#39; impiombare siti. Sorprendentemente, TIA vincolante al 5&#39; siti splice tacere cassetta distale e lunghezza variabile esoni senza legame in prossimit&agrave; di regolamentati alternativi 3&#39; impiombare siti. Utilizzando livello transcriptome mappatura ad alta risoluzione delle interazioni TIA-RNA abbiamo valutato gli effetti di splicing distali delle proteine di TIA. Questi dati sono coerenti con un modello dove proteine TIA abbreviare il tempo disponibile per la definizione di un esone alternativo per migliorare il riconoscimento del precedente sito splicing 5&#39;. I nostri risultati indicano quindi che cambiamenti nella cinetica di splicing potrebbero mediare il regolamento distale di splicing alternativo.

iCLIP predice gli effetti dual impionbatura delle interazioni RNA-TIA.

&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306F;&#x3001;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306B;&#x8FD1;&#x3044;RNA&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3068;mRNA&#x524D;&#x99C6;&#x4F53;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002; T&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x6297;&#x539F;1&#xFF08;TIA1&#xFF09;&#x3068;1&#xFF08;TIAL1&#xFF09;TIA1&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x3001;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EB;&#x3067;5 &#x26;#39;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306B;U1 snRNP&#x3092;&#x52DF;&#x96C6;&#x3057;&#x3066;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x5305;&#x542B;&#x3092;&#x5F37;&#x5316;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x9060;&#x4F4D;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;TIA&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306F;&#x307E;&#x3060;&#x691C;&#x8A0E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;RNA&#x306E;&#x540C;&#x3058;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x306B;&#x3001;&#x305D;&#x306E;TIA1&#x3068;TIAL1&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;UV&#x67B6;&#x6A4B;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF08;iCLIP&#xFF09;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; 5 &#x26;#39;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x306E;&#x4E0B;&#x6D41;&#x306F;&#x3001;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x5305;&#x542B;&#x3092;&#x9AD8;&#x3081;&#x3001;&#x9060;&#x4F4D;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x5305;&#x542B;&#x3092;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;TIA&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x306F;&#x3001;TIA&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5FE0;&#x5B9F;&#x6027;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3057;&#x3001;&#x6392;&#x4ED6;&#x7684;&#x306B;&#x4E0B;&#x6D41;&#x306B;5 &#x26;#39;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x306A;&#x3063;&#x305F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x63A5;&#x5408;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3001;RT-PCR&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DF;&#x30CB;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x516C;&#x5E73;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x691C;&#x8A3C;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x9A5A;&#x304F;&#x3079;&#x304D;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;5&#x6642;TIA&#x7D50;&#x5408;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D; &#x26;#39;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306F;&#x3001;&#x898F;&#x5236;&#x4EE3;&#x66FF;&#x624B;&#x6BB5;3&#x306B;&#x8FD1;&#x63A5;&#x3057;&#x3066;&#x7D50;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x9060;&#x4F4D;&#x30AB;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x53EF;&#x5909;&#x9577;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x3092;&#x9ED9;&#x3089;&#x305B;&#x305F; &#x26;quot;&#x3002; TIA-RNA&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;TIA&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x9060;&#x4F4D;&#x306E;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;TIA&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x524D;&#x8FF0;&#x306E;5 &#x26;#39;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B9;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306E;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3092;&#x9AD8;&#x3081;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x5225;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x306E;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306F;&#x3001;&#x4F7F;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x6642;&#x9593;&#x3092;&#x77ED;&#x7E2E;&#x3059;&#x308B;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x53CD;&#x5FDC;&#x901F;&#x5EA6;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x9060;&#x4F4D;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

ICLIP&#x306F;&#x3001;TIA-RNA&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x30C7;&#x30E5;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;

&#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC0F; pre mRNA &#xC704;&#xCE58; &#xAC00;&#xAE4C;&#xC774; &#xBD99;&#xC5EC; &#xC11C; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xAC04; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C;&#xB2E4;. 1 (TIA1) &#xBC0F; TIA1 &#xAC19;&#xC740; 1 (TIAL1) &#xB85C;&#xCEEC;&#xB85C; exon &#xD3EC;&#xD568; 5 &#39; U1 snRNP &#xBAA8;&#xC9D1; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC15;&#xD654; T-&#xC140; &#xC138;&#xD3EC;&#xB0B4; &#xD56D; &#xC6D0; &#xACB0;&#xD569; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC6D0;&#xC2EC; exons&#xC758; &#xC811;&#xD569;&#xC5D0; &#xD2F0;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xC544;&#xC9C1; &#xD0D0;&#xD5D8; &#xB418;&#xC9C0;. &#xC778;&#xAC04;&#xC758; Rnas&#xC5D0; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xC704;&#xCE58;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; TIA1 &#xBC0F; tial1&#xC744; &#xCC3E;&#xC73C;&#xB824;&#xACE0; &#xC790;&#xC678;&#xC120; &#xAC00;&#xAD50; &#xBC0F; immunoprecipitation (iCLIP)&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD558;&#xB958; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC758; 5&#39; &#xC2A4;&#xD50C;&#xB77C;&#xC774;&#xC2A4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xADFC; exons&#xC758; &#xD3EC;&#xD568;&#xC744; &#xAC15;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; &#xC785;&#xC744; &#xC6D0;&#xC2EC; exons&#xC758; &#xD3EC;&#xD568;&#xC5D0; &#xD2F0;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xC608;&#xCE21; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C;. &#xC608;&#xCE21; &#xD3B8;&#xACAC;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD99;&#xC5EC; &#xC11C; &#xC811;&#xD569; microarrays, RT-PCR, &#xD2F0;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC811;&#xD569; &#xCDA9;&#xC2E4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558; &#xACE0; &#xB3C5;&#xC810;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xB958;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD558;&#xC5EC; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569; &#xADDC;&#xC81C; minigene &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131;&#xC744; &#xAC80;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4; 5&#39;&#xC758; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xB97C; &#xACB0;&#xD569; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB180;&#xB78D;&#xAC8C;&#xB3C4;, &#xC6D0;&#xC2EC; &#xCE74;&#xC138;&#xD2B8;&#xB97C; &#xC785; &#xB9C9; &#xC74C; &#xC2A4;&#xD50C;&#xB77C;&#xC774;&#xC2A4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; 5&#39; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xBC0F; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xADDC;&#xC81C; &#xB300;&#xC548; 3&#39;&#xC5D0; &#xADFC;&#xC811; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xACE0; &#xAC00;&#xBCC0; &#xAE38;&#xC774; exons &#xC811;&#xCC29; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xD2F0;&#xC544;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xD2F0;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC811;&#xD569; &#xD6A8;&#xACFC; &#xB4E4;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD2F0;&#xC544; RNA &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; transcriptome &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xB9E4;&#xD551;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xC77C;&#xCE58; &#xD2F0;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC55E; 5&#39; &#xC2A4;&#xD50C;&#xB77C;&#xC774;&#xC2A4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC758; &#xC778;&#xC2DD;&#xC744; &#xAC15;&#xD654; &#xD558; &#xC5EC; &#xB300;&#xCCB4; exon&#xC758; &#xC815;&#xC758; &#xC704;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC2DC;&#xAC04;&#xC744; &#xB2E8;&#xCD95; &#xD558;&#xB294; &#xBAA8;&#xB378;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xBCC0;&#xD654; &#xC18D;&#xB3C4; &#xB860;&#xC744; &#xC811;&#xD569;&#xC5D0; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569;&#xC758; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xADDC;&#xC81C; &#xC911;&#xC7AC;&#xD560; &#xC218; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

iCLIP &#xD2F0;&#xC544; RNA &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC774;&#xC911; &#xC811;&#xD569; &#xD6A8;&#xACFC;&#xB97C; &#xC804;&#xB9DD; &#xD588;&#xB2E4;.

La regulaci&#xF3;n del splicing alternativo implica interacciones entre prote&#xED;nas de uni&#xF3;n a ARN y las posiciones de ARNm de pre-cercanas a los sitios de empalme. De c&#xE9;lulas T ant&#xED;geno intracelular 1 (TIA1) y TIA1 tipo 1 (TIAL1) localmente mejorar la inclusi&#xF3;n del ex&#xF3;n mediante la contrataci&#xF3;n de snRNP U1 de los sitios de empalme 5 &#x26;#39;. Sin embargo, los efectos de las prote&#xED;nas TIA en el empalme de los exones distales a&#xFA;n no han sido exploradas. Se utiliz&#xF3; la radiaci&#xF3;n UV-reticulaci&#xF3;n y la inmunoprecipitaci&#xF3;n (iClip) para encontrar que se unen TIA1 y TIAL1 en las mismas posiciones en ARNs humanos. Aguas abajo de uni&#xF3;n de los sitios de empalme 5 &#x26;#39;se utiliz&#xF3; para predecir los efectos de las prote&#xED;nas de la TIA en la mejora de la inclusi&#xF3;n de los exones proximal y silenciar a la inclusi&#xF3;n de los exones distales. Las predicciones fueron validadas en forma imparcial con uniones de empalme de microarrays, RT-PCR, y los modelos minigene, que mostraron que las prote&#xED;nas de la TIA mantener la fidelidad de empalme y regular el splicing alternativo mediante la uni&#xF3;n exclusivamente de aguas abajo de los sitios de empalme 5 &#x26;#39;. Sorprendentemente, la TIA vinculante a los 5 &#x26;#39;sitios de empalme silenciada casete distal y exones de longitud variable sin trabarse en la proximidad de las reguladas 3 alternativo&#x26;#39; sitios de empalme. Uso de transcriptoma en toda la cartograf&#xED;a de alta resoluci&#xF3;n de la TIA-ARN interacciones se evaluaron los efectos de empalme distales de las prote&#xED;nas de la TIA. Estos datos son consistentes con un modelo en el que las prote&#xED;nas de la TIA acortar el tiempo disponible para la definici&#xF3;n de un ex&#xF3;n alternativo por el refuerzo del reconocimiento del sitio de empalme del anterior 5 &#x26;#39;. Por lo tanto, nuestros resultados indican que los cambios en la cin&#xE9;tica de empalme podr&#xED;a mediar la regulaci&#xF3;n distal de splicing alternativo.

IClip predice los efectos de empalme doble de la norma TIA-ARN interacciones

&#x957F;&#x9014;&#x8FD0;&#x8F93;&#x7684;&#x5206;&#x6CCC;&#x662F;&#x65F6;&#x7A7A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4 &#x6784;&#x6210;&#x9ED1;&#x7C89;&#x75C5;&#x4E1D;&#x4E2D;&#x7684;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7684; mRNA &#x4F20;&#x8F93;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5173;&#x952E;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x53EF;&#x4EE5;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E00;&#x4E9B;&#x6F5C;&#x5728;&#x76EE;&#x6807; mRNAs&#xFF0C;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E; Rrm4 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x8FD0;&#x8F93;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4ECD;&#x7136;&#x5F88;&#x5927;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x672A;&#x77E5;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x5DEE;&#x5F02;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x5B66;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x3001; &#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x3001; &#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x91CD;&#x5851;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7C7B;&#x578B; endochitinase Cts1&#xFF0C;&#x5DEE;&#x5F02;&#x5728; rrm4&Delta; &#x4E1D;&#x53D7;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x7D2B;&#x5916;&#x5149;&#x4EA4;&#x8054;&#x548C;&#x6C89;&#x6DC0;&#x548C;&#x8367;&#x5149;&#x539F;&#x4F4D;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x53D1;&#x73B0; cts1 mRNA &#x8868;&#x793A;&#x7684; Rrm4 cts1&Delta; &#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#x805A;&#x5408;&#x5728;&#x6697;&#x793A;&#x6539;&#x53D8;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x7684;&#x6DB2;&#x4F53;&#x57F9;&#x517B;&#x4E2D;&#x7684;&#x7EC6;&#x4E1D;&#x7684;&#x76F4;&#x63A5;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;&#x5728;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;&#x7EC6;&#x80DE; Cts1 &#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F;&#x5728;&#x751F;&#x957F;&#x9525;&#xFF0C;&#x800C;&#x79EF;&#x7D2F;&#x5728;&#x4E24;&#x6781;&#x4E2D; rrm4&Delta; &#x957F;&#x4E1D;&#x3002;Endochitinase &#x5206;&#x6CCC;&#x51FA;&#x6765;&#x7684;&#x5E76;&#x5C06;&#x5173;&#x8054;&#x6700;&#x53EF;&#x80FD;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x58C1;&#x7684;&#x7EC6;&#x4E1D;&#x3002;&#x5206;&#x6CCC;&#x662F;&#x5927;&#x5927;&#x53D7;&#x635F;&#xFF0C;&#x5728;&#x7F3A;&#x4E4F; Rrm4 &#x6216;&#x5E38;&#x89C4;&#x9A71;&#x52A8;&#x86CB;&#x767D; Kin1 &#x4E1D;&#x4EE5;&#x53CA;&#x957F;&#x4E1D;&#x4E0E;&#x4E2D;&#x65AD;&#x5FAE;&#x7BA1;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;Rrm4 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684; mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x662F;&#x5FC5;&#x4E0D;&#x53EF;&#x5C11;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8; Cts1&#xFF0C;&#x63ED;&#x9732; mRNA &#x8FD0;&#x8F93;&#x548C;&#x5206;&#x6CCC;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x5206;&#x5B50;&#x94FE;&#x63A5;&#x6709;&#x6548;&#x7684;&#x51FA;&#x53E3;&#x3002;

RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; Rrm4 &#x7684;&#x9AD8;&#x6548;&#x5206;&#x6CCC;&#x7684; endochitinase Cts1 &#x81F3;&#x5173;&#x91CD;&#x8981;&#x3002;

Long-distance transport of mRNAs is crucial in determining spatio-temporal gene expression in eukaryotes. The RNA-binding protein Rrm4 constitutes a key component of microtubule-dependent mRNA transport in filaments of Ustilago maydis. Although a number of potential target mRNAs could be identified, cellular processes that depend on Rrm4-mediated transport remain largely unknown. Here, we used differential proteomics to show that ribosomal, mitochondrial, and cell wall-remodeling proteins, including the bacterial-type endochitinase Cts1, are differentially regulated in rrm4Î” filaments. In vivo UV crosslinking and immunoprecipitation and fluorescence in situ hybridization revealed that cts1 mRNA represents a direct target of Rrm4. Filaments of cts1Î” mutants aggregate in liquid culture suggesting an altered cell surface. In wild type cells Cts1 localizes predominantly at the growth cone, whereas it accumulates at both poles in rrm4Î” filaments. The endochitinase is secreted and associates most likely with the cell wall of filaments. Secretion is drastically impaired in filaments lacking Rrm4 or conventional kinesin Kin1 as well as in filaments with disrupted microtubules. Thus, Rrm4-mediated mRNA transport appears to be essential for efficient export of active Cts1, uncovering a novel molecular link between mRNA transport and the mechanism of secretion.

The RNA-binding protein Rrm4 is essential for efficient secretion of endochitinase Cts1.

Transport &#xE0; longue distance des ARNm est crucial dans la d&#xE9;termination de l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes spatio-temporelle chez les eucaryotes. La prot&#xE9;ine de liaison &#xE0; l&#x26;#39;ARN Rrm4 constitue un &#xE9;l&#xE9;ment cl&#xE9; de transport d&#x26;#39;ARNm microtubules d&#xE9;pendante de filaments de maydis Ustilago. Bien qu&#x26;#39;un certain nombre d&#x26;#39;ARNm cibles potentielles ont pu &#xEA;tre identifi&#xE9;s, les processus cellulaires qui d&#xE9;pendent de Rrm4 transport m&#xE9;di&#xE9; restent encore largement inconnus. Ici, nous avons utilis&#xE9; la prot&#xE9;omique diff&#xE9;rentielle pour montrer que les ribosomes, mitochondries, et de la paroi cellulaire de remodelage des prot&#xE9;ines, y compris l&#x26;#39;endochitinase bact&#xE9;rienne de type CTS1, sont r&#xE9;gul&#xE9;s diff&#xE9;remment dans les filaments rrm4&#x394;. En r&#xE9;ticulation UV vivo et immunopr&#xE9;cipitation et hybridation in situ fluorescente a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; que CTS1 ARNm repr&#xE9;sente une cible directe de Rrm4. Les filaments de mutants cts1&#x394; agr&#xE9;ger dans une culture liquide sugg&#xE9;rant une surface de la cellule alt&#xE9;r&#xE9;e. Dans les cellules de type sauvage CTS1 localise principalement au niveau du c&#xF4;ne de croissance, alors qu&#x26;#39;il accumule sur les deux p&#xF4;les dans les filaments rrm4&#x394;. Le endochitinase est s&#xE9;cr&#xE9;t&#xE9;e et associe le plus probable avec la paroi cellulaire des filaments. S&#xE9;cr&#xE9;tion est consid&#xE9;rablement diminu&#xE9;e en filaments d&#xE9;pourvus Rrm4 ou conventionnel kin&#xE9;sine Kin1 ainsi que dans les filaments avec les microtubules perturb&#xE9;. Ainsi, le transport d&#x26;#39;ARNm Rrm4 m&#xE9;diation semble &#xEA;tre essentielle pour l&#x26;#39;exportation efficace de CTS1 active, d&#xE9;couverte d&#x26;#39;un nouveau lien mol&#xE9;culaire entre le transport des ARNm et le m&#xE9;canisme de s&#xE9;cr&#xE9;tion.

Le Rrm4 prot&#xE9;ines fixation &#xE0; l&#x26;#39;ARN est essentielle pour la s&#xE9;cr&#xE9;tion efficace de endochitinase CTS1

Ferntransport von mRNAs ist f&uuml;r r&auml;umlich-zeitliche Genexpression in Eukaryoten entscheidend. Das RNS-bindene Protein Rrm4 bildet eine Schl&uuml;sselkomponente des Microtubule-abh&auml;ngige mRNA Transport in Filamente mit Ustilago Maydis. Obwohl eine Reihe von potenziellen Ziel mRNAs identifiziert werden konnten, bleiben die zellul&auml;re Prozesse, die auf Rrm4-vermittelten Transport abh&auml;ngig sind weitgehend unbekannt. Hier wir differentielle Proteomik verwendet, um zu zeigen, dass ribosomal, mitochondriale und Zellwand-Umbau Proteine, einschlie&szlig;lich der bakteriell-Typ Endochitinase Cts1, werden in rrm4&Delta; Filamente differentiell reguliert. In-vivo-UV-Vernetzung und Immunopr&auml;zipitation und Fluoreszenz in Situ Hybridisierung ergab, dass cts1-mRNA Rrm4. Filamente cts1&Delta; Mutanten Aggregat in fl&uuml;ssiger Kultur schl&auml;gt eine ver&auml;nderte Zelloberfl&auml;che das unmittelbare Ziel darstellt. Im Wildtyp Zellen lokalisiert Cts1 vorwiegend auf dem Wachstumskegel w&auml;hrend es an beiden Polen in rrm4&Delta; Filamente sammelt. Die Endochitinase ist abgesondert und ordnet die meisten vermutlich mit der Zellwand von Filamenten. Sekretion ist drastisch beeintr&auml;chtigt in Filamenten, die weder Rrm4 noch konventionelle Kinesin Kin1 sowie in Filamenten mit gest&ouml;rte Mikrotubuli. Rrm4-mediated mRNA Transport erscheint daher unabdingbar f&uuml;r effiziente Export von aktiven Cts1, Freilegung eine neuartige molekulare Verbindung zwischen mRNA-Transport und der Mechanismus der Sekretion.

Das RNS-bindene Protein Rrm4 ist entscheidend f&uuml;r effiziente Sekretion von Endochitinase Cts1.

Trasporto interurbano dei mRNAs &egrave; cruciale nel determinare l&#39;espressione di gene spazio-temporale negli eucarioti. RNA-binding protein Rrm4 costituisce un componente chiave del trasporto mRNA microtubule-dipendente in filamenti di Ustilago maydis. Anche se potrebbe essere identificato un certo numero di potenziali target mRNA, i processi cellulari che dipendono dal trasporto mediato Rrm4 rimangono in gran parte sconosciuti. Qui, abbiamo utilizzato la proteomica differenziale per mostrare che ribosomiale, mitocondriale, e rimodellamento parete cellulare proteine, tra cui il tipo di batteri endochitinase Cts1, differenzialmente sono regolate in filamenti rrm4&Delta;. Reticolazione UV in vivo e immunoprecipitazione e l&#39;ibridazione in situ ha rivelato che cts1 mRNA rappresenta un bersaglio diretto di filamenti Rrm4. di cts1&Delta; mutanti aggregati in coltura liquida suggerendo una superficie di cellule alterate. Nelle cellule wild type Cts1 localizza prevalentemente presso il cono di crescita, considerando che si accumula a entrambi i poli in filamenti rrm4&Delta;. Il endochitinase viene secreto e associa la maggior parte probabilmente con la parete delle cellule dei filamenti. Secrezione &egrave; drasticamente ridotta in filamenti privi Rrm4 o convenzionale chinesina Kin1 cos&igrave; come in filamenti con microtubuli perturbati. Cos&igrave;, trasporto Rrm4-mediated mRNA sembra essere essenziale per l&#39;esportazione efficiente di Cts1 attivo, scoprendo un romanzo link molecolare tra trasporto mRNA e il meccanismo di secrezione.

RNA-binding protein Rrm4 &egrave; essenziale per secrezione efficiente di endochitinase Cts1.

mRNA&#x306E;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x8F38;&#x9001;&#x306F;&#x3001;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x6642;&#x7A7A;&#x9593;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x4E0A;&#x3067;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002; RNA&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;Rrm4&#x306F;&#x3001;&#x9ED2;&#x7A42;&#x83CC;&#x5C5E;&#x306E;maydis&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x4F9D;&#x5B58;&#x6027;&#x306E;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x6A19;&#x7684;mRNA&#x306E;&#x6570;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;Rrm4&#x5A92;&#x4ECB;&#x8F38;&#x9001;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306E;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#x306F;&#x4E0D;&#x660E;&#x306E;&#x307E;&#x307E;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x578B;endochitinase CTS1&#x3001;&#x5DEE;rrm4&#x394;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x898F;&#x5236;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x3001;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x3001;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x30EA;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x3001;&#x8868;&#x793A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5DEE;&#x52D5;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; in situ&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;in vivo UV&#x67B6;&#x6A4B;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x6CD5;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x86CD;&#x5149;&#x3067;CTS1 mRNA&#x304C;Rrm4&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002; cts1&#x394;&#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x5909;&#x66F4;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x8868;&#x9762;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x6DB2;&#x4F53;&#x57F9;&#x990A;&#x3067;&#x96C6;&#x8A08;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x306F;rrm4&#x394;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x6975;&#x306B;&#x84C4;&#x7A4D;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3001;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306F;CTS1&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x9577;&#x5186;&#x9310;&#x3067;&#x4E3B;&#x306B;&#x5C40;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x3002; endochitinase&#x306F;&#x3001;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x58C1;&#x3067;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x5206;&#x6CCC;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5206;&#x6CCC;&#x304C;&#x6025;&#x6FC0;&#x306B;&#x7834;&#x58CA;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x7BA1;&#x306E;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306A;&#x3069;Rrm4&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5F93;&#x6765;&#x30AD;&#x30CD;&#x30B7;&#x30F3;Kin1&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E9;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306B;&#x640D;&#x306A;&#x308F;&#x308C;&#x3066;&#x3057;&#x307E;&#x3046;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;Rrm4&#x5A92;&#x4ECB;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x306F;&#x3001;mRNA&#x306E;&#x8F38;&#x9001;&#x3068;&#x5206;&#x6CCC;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3092;&#x66B4;&#x304F;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;CTS1&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x8F38;&#x51FA;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

RNA&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;Rrm4&#x306F;Endochitinase CTS1&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x5206;&#x6CCC;&#x306B;&#x5FC5;&#x9808;&#x3067;&#x3042;&#x308B;

Mrnas&#xC758; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC804;&#xC1A1; spatio &#xC77C;&#xC2DC;&#xC801;&#xC778; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACB0;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xACB0;&#xC815;&#xC801; &#xC774;&#xB2E4;. RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rrm4 Ustilago maydis&#xC758; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC758; microtubule &#xC885;&#xC18D; mRNA &#xAD50;&#xD1B5;&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xAD6C;&#xC131;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB300;&#xC0C1; mRNAs &#xC218; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC804;&#xC1A1; Rrm4 &#xC911;&#xC7AC;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C0;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; ribosomal, &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC; &#xB9AC;&#xC544;, &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xCC28;&#xB3D9; proteomics&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xACE0; &#xAC1C;&#xC7A5; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xD615; endochitinase Cts1&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xCC28;&#xB3D9; rrm4&Delta; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xC81C; &#xB41C;&#xB2E4;. Vivo&#xC5D0;&#xC11C; &#xC790;&#xC678;&#xC120; &#xAC00;&#xAD50; &#xBC0F; immunoprecipitation&#xC640; &#xD615;&#xAD11; &#xC81C;&#xC790;&#xB9AC; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACF5;&#xAC1C; cts1 mRNA Rrm4. cts1&Delta; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC561;&#xCCB4; &#xBB38;&#xD654; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xBCC0;&#xACBD;&#xB41C; &#xC140; &#xD45C;&#xBA74;&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9D1;&#xACC4;&#xC758; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC758; &#xC9C1;&#xC811; &#xB300;&#xC0C1;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC640;&#xC77C;&#xB4DC; &#xD615;&#xC2DD; &#xC140;&#xC5D0; Cts1 localizes &#xC8FC;&#xB85C; &#xC131;&#xC7A5; &#xC6D0;&#xBFD4;&#xC5D0;&#xC11C; rrm4&Delta; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC758; &#xB450; &#xAE30;&#xB465;&#xC5D0; &#xCD95;&#xC801; &#xD558;&#xB294; &#xBC18;&#xBA74;. Endochitinase &#xBD84; &#xBE44; &#xB418; &#xACE0; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCBD;&#xC744; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xB192;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBD84; &#xBE44; &#xAD50;&#xB780;&#xB41C; microtubules&#xC640; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xD544; &#xB77C; &#xBA58; &#xD2B8; Rrm4 &#xB610;&#xB294; &#xAE30;&#xC874;&#xC758; kinesin Kin1 &#xBD80;&#xC871;&#xC5D0; &#xACFC;&#xAC10; &#xD558; &#xAC8C; &#xC7A5;&#xC560;&#xC778;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, Rrm4 &#xC911;&#xC7AC; mRNA &#xC804;&#xC1A1; &#xD65C;&#xC131; Cts1, &#xC7A0;&#xBCF5; &#xADFC;&#xBB34; mRNA &#xC804;&#xC1A1; &#xBC0F; &#xBD84; &#xBE44; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xAC04;&#xC758; &#xC18C;&#xC124; &#xBD84;&#xC790; &#xB9C1;&#xD06C;&#xC758; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778; &#xC218;&#xCD9C;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xAC83; &#xAC19;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Rrm4 endochitinase cts1&#xC758; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801; &#xBD84; &#xBE44;&#xC5D0; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Transporte a larga distancia de los ARNm es crucial en la determinaci&#xF3;n espacio-temporal la expresi&#xF3;n de genes en eucariotas. La prote&#xED;na de uni&#xF3;n al ARN Rrm4 constituye un componente clave de transporte del mRNA de los microt&#xFA;bulos dependiente de filamentos de Ustilago maydis. Aunque un n&#xFA;mero de mRNAs diana potenciales podr&#xED;an ser identificados, los procesos celulares que dependen de Rrm4 mediada por el transporte siguen siendo en gran parte desconocido. En este caso, hemos utilizado la prote&#xF3;mica diferencial para demostrar que los ribosomas, las mitocondrias, y la remodelaci&#xF3;n de la pared celular, las prote&#xED;nas, incluyendo la endoquitinasa bacteriana de tipo Cts1, est&#xE1;n regulados diferencialmente en los filamentos rrm4&#x394;. En reticulaci&#xF3;n UV vivo e inmunoprecipitaci&#xF3;n y la fluorescencia de hibridaci&#xF3;n in situ revel&#xF3; que cts1 mRNA representa un objetivo directo de Rrm4. Los filamentos de mutantes cts1&#x394; agregan en cultivo l&#xED;quido que sugiere una alteraci&#xF3;n de la superficie celular. En las c&#xE9;lulas de tipo salvaje Cts1 localiza predominantemente en el cono de crecimiento, mientras que se acumula en los dos polos en filamentos rrm4&#x394;. El endoquitinasa es secretada y asociados muy probablemente con la pared celular de los filamentos. La secreci&#xF3;n es dr&#xE1;sticamente afectada en filamentos que carecen Rrm4 o convencional Kin1 quinesina as&#xED; como en filamentos con microt&#xFA;bulos interrumpidas. As&#xED;, Rrm4 mediada por el transporte del mRNA parece ser esencial para la exportaci&#xF3;n eficiente de sesi&#xF3;n Cts1, descubriendo un enlace molecular nuevo entre el transporte de ARNm y el mecanismo de secreci&#xF3;n.

El Rrm4 prote&#xED;na de uni&#xF3;n al ARN es esencial para la secreci&#xF3;n eficiente de endoquitinasa Cts1

&#x5E74;&#x9F84;&#x662F;&#x4E3A;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D8;&#x6027; &#xFF1B; &#x6700;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x5371;&#x9669;&#x56E0;&#x7D20;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x6700;&#x5E38;&#x5DF2;&#x5206;&#x522B;&#x7814;&#x7A76;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x5927;&#x8111;&#x4E2D;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5BF9;&#x8001;&#x5316;&#x548C;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D8;&#x6027;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5185;&#x5BB9;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x548C;&#x526A;&#x63A5;&#x989E;&#x53F6;&#x76AE;&#x8D28;&#x4EBA;&#x4E0D;&#x540C;&#x5E74;&#x9F84;&#x6BB5;&#x7684;&#x8BA4;&#x77E5;&#x80FD;&#x529B;&#x6B63;&#x5E38;&#xFF0C;&#x53D7;&#x989D;&#x989E;&#x90E8;&#x5927;&#x53F6;&#x6027;&#x53D8;&#x6027; (FTLD) &#x6216;&#x53D7;&#x963F;&#x5C14;&#x8328;&#x6D77;&#x9ED8;&#x75C5; (AD)&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5E74;&#x9F84;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x8BA4;&#x77E5;&#x80FD;&#x529B;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x62FC;&#x63A5;&#x53D8;&#x5316;&#xFF0C;&#x5E76;&#x53D1;&#x73B0;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x662F;&#x76EE;&#x524D;&#x8FD8;&#x5728;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x4E0E; FTLD &#x6216; AD&#xFF0C;&#x72EC;&#x7ACB;&#x4E8E;&#x5176;&#x5E74;&#x9F84;&#x7684; 95%&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x53D8;&#x5316;&#x90FD;&#x7B26;&#x5408;&#x589E;&#x52A0;&#x7684; polypyrimidine &#x9053;&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; (PTB)-&#x4F9D;&#x8D56;&#x62FC;&#x63A5;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x5728;&#x573A;&#x4E2D;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x4E0E; FTLD &#x6216;&#x5E7F;&#x544A;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x5728;&#x8BA4;&#x77E5;&#x80FD;&#x529B;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x7684;&#x5177;&#x4F53;&#x75BE;&#x75C5;&#x62FC;&#x63A5;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x53D8;&#x5316;&#x90FD;&#x7B26;&#x5408; (NOVA) &#x7684;&#x51CF;&#x5C11;&#x8179;&#x795E;&#x7ECF;&#x80BF;&#x7624;&#x6297;&#x539F;-&#x4F9D;&#x8D56;&#x62FC;&#x63A5;&#x76D1;&#x7BA1;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x51CF;&#x5C11;&#x6838;&#x4E30;&#x5EA6;&#x7684; NOVA &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x4E0D;&#x51FA;&#x6240;&#x6599;&#xFF0C;&#x6025;&#x5267;&#x4E0B;&#x964D;&#x8C03;&#x8282;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x57FA;&#x56E0;&#x662F;&#x4E0E;&#x75BE;&#x75C5;&#xFF0C;&#x6709;&#x5173;&#xFF0C;&#x800C;&#x80F6;&#x8D28;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x57FA;&#x56E0;&#x9002;&#x5EA6;&#x4E0B;&#x8C03;&#x662F;&#x4E0E;&#x8001;&#x5316;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x800C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x8868;&#x793A;&#x4E0E;&#x5E74;&#x9F84;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x62FC;&#x63A5;&#x53D8;&#x5316;&#x89C4;&#x8303;&#x72EC;&#x7ACB;&#x8A8A;&#x672C;&#x7EA7;&#x522B;&#x7684;&#x66F4;&#x6539;&#xFF0C;&#x5219;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x5236;&#x5F71;&#x54CD;&#x5177;&#x6709;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x4EE3;&#x8C22;&#x548C; DNA &#x4FEE;&#x590D;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x5728;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x6807;&#x8BC6;&#x7684;&#x66FF;&#x4EE3;&#x62FC;&#x63A5;&#x66F4;&#x6539;&#x63D0;&#x4F9B;&#x8870;&#x8001;&#x4E0E;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D8;&#x6027;&#x7684;&#x65B0;&#x94FE;&#x63A5;&#x3002;

&#x526A;&#x63A5;&#x4E0E;&#x8001;&#x5316;&#x548C;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x5927;&#x8111;&#x4E2D;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D8;&#x6027;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Age is the most important risk factor for neurodegeneration; however, the effects of aging and neurodegeneration on gene expression in the human brain have most often been studied separately. Here, we analyzed changes in transcript levels and alternative splicing in the temporal cortex of individuals of different ages who were cognitively normal, affected by frontotemporal lobar degeneration (FTLD), or affected by Alzheimer's disease (AD). We identified age-related splicing changes in cognitively normal individuals and found that these were present also in 95% of individuals with FTLD or AD, independent of their age. These changes were consistent with increased polypyrimidine tract binding protein (PTB)-dependent splicing activity. We also identified disease-specific splicing changes that were present in individuals with FTLD or AD, but not in cognitively normal individuals. These changes were consistent with the decreased neuro-oncological ventral antigen (NOVA)-dependent splicing regulation, and the decreased nuclear abundance of NOVA proteins. As expected, a dramatic down-regulation of neuronal genes was associated with disease, whereas a modest down-regulation of glial and neuronal genes was associated with aging. Whereas our data indicated that the age-related splicing changes are regulated independently of transcript-level changes, these two regulatory mechanisms affected expression of genes with similar functions, including metabolism and DNA repair. In conclusion, the alternative splicing changes identified in this study provide a new link between aging and neurodegeneration.

Analysis of alternative splicing associated with aging and neurodegeneration in the human brain.

L&#x26;#39;&#xE2;ge est le facteur de risque le plus important pour la neurod&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rescence, mais les effets du vieillissement et de la neurod&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rescence sur l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique dans le cerveau humain ont &#xE9;t&#xE9; le plus souvent &#xE9;tudi&#xE9;s s&#xE9;par&#xE9;ment. Ici, nous avons analys&#xE9; les changements dans les niveaux de transcription et l&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif dans le cortex temporal d&#x26;#39;individus d&#x26;#39;&#xE2;ges diff&#xE9;rents qui &#xE9;taient cognitif normal, la d&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rescence lobaire touch&#xE9;s par frontotemporale (DLFT), ou affect&#xE9;es par la maladie d&#x26;#39;Alzheimer (AD). Nous avons identifi&#xE9; les changements d&#x26;#39;&#xE9;pissage li&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;&#xE2;ge chez les personnes cognitivement normales et a constat&#xE9; que ceux-ci &#xE9;taient aussi pr&#xE9;sents dans 95% des personnes atteintes DLFT ou AD, ind&#xE9;pendamment de leur &#xE2;ge. Ces changements &#xE9;taient compatibles avec la prot&#xE9;ine de liaison accrue des voies polypyrimidine (PTB)-d&#xE9;pendante l&#x26;#39;activit&#xE9; d&#x26;#39;&#xE9;pissage. Nous avons &#xE9;galement identifi&#xE9; des changements d&#x26;#39;&#xE9;pissage sp&#xE9;cifiques &#xE0; certaines maladies qui &#xE9;taient pr&#xE9;sentes chez les personnes atteintes DLFT ou AD, mais pas chez les individus cognitivement normales. Ces changements &#xE9;taient compatibles avec la diminution de neuro-oncologique antig&#xE8;ne ventrale (NOVA)-d&#xE9;pendante r&#xE9;gulation de l&#x26;#39;&#xE9;pissage, et l&#x26;#39;abondance des prot&#xE9;ines a diminu&#xE9; nucl&#xE9;aire NOVA. Comme pr&#xE9;vu, une dramatique sous-r&#xE9;gulation de g&#xE8;nes neuronaux a &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;e &#xE0; la maladie, alors que d&#x26;#39;un modeste sous-r&#xE9;gulation de g&#xE8;nes gliales et neuronales a &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;e au vieillissement. Alors que nos donn&#xE9;es indiquent que les changements d&#x26;#39;&#xE9;pissage li&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;&#xE2;ge sont r&#xE9;glement&#xE9;s de mani&#xE8;re ind&#xE9;pendante de la transcription au niveau des changements, ces deux m&#xE9;canismes de r&#xE9;gulation d&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes affect&#xE9;s &#xE0; des fonctions similaires, y compris le m&#xE9;tabolisme et la r&#xE9;paration de l&#x26;#39;ADN. En conclusion, les changements d&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif identifi&#xE9;s dans cette &#xE9;tude fournira un nouveau lien entre le vieillissement et les maladies neurod&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ratives.

Analyse de l&#x26;#39;&#xE9;pissage alternatif associ&#xE9;e au vieillissement et neurod&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rescence dans le cerveau humain

Alter ist der wichtigste Risikofaktor f&uuml;r Neurodegeneration. Allerdings wurden die Auswirkungen des Alterns und Neurodegeneration auf Genexpression im menschlichen Gehirn am h&auml;ufigsten getrennt untersucht. Hier analysierten wir &Auml;nderungen in Abschrift Ebenen und alternatives Splei&szlig;en im temporalen Kortex von Personen unterschiedlichen Alters, die kognitiv normal, wurden von Frontotemporale lobar Degeneration (FTLD), oder betroffen von der Alzheimer-Krankheit (AD). Wir altersbedingte Splei&szlig;en Ver&auml;nderungen in kognitiv normalen Personen identifiziert und fanden, dass dies auch bei 95 % der Personen mit FTLD oder AD, unabh&auml;ngig von ihrem Alter. Diese &Auml;nderungen wurden mit erh&ouml;hter Polypyrimidine Trakt verbindliches Protein (PTB)-abh&auml;ngige Aktivit&auml;t Splei&szlig;en. Wir wurden auch krankheitsspezifische Splei&szlig;en &Auml;nderungen bei Personen mit FTLD oder AD, aber nicht in kognitiv normalen Personen anwesend waren. Diese &Auml;nderungen waren konsistent mit dem verminderten Neuro-onkologischen ventralen Antigen (NOVA)-abh&auml;ngige Splei&szlig;en, Regulierung und die geringere nukleare F&uuml;lle von NOVA Proteine. Wie erwartet, war eine dramatische Herunterregulation der neuronalen Gene Krankheit zugeordnet, w&auml;hrend eine bescheidene Herunterregulation Gliazellen und neuronaler Gene mit dem &Auml;lterwerden verbunden war. W&auml;hrend unsere Daten angegeben, dass die altersbedingte Splei&szlig;en &Auml;nderungen unabh&auml;ngig von Protokoll-Ebene &Auml;nderungen geregelt sind, beeinflusst diese zwei Regulierungsmechanismen Expression von Genen mit &auml;hnlichen Funktionen wie Stoffwechsel und DNA-Reparatur. Zusammenfassend bieten die alternativen Splei&szlig;en &Auml;nderungen, die in dieser Studie identifiziert eine neue Verbindung zwischen Altern und Neurodegeneration.

Analyse der alternatives Splei&szlig;en Altern und Neurodegeneration im menschlichen Gehirn zugeordnet.

L&#39;et&agrave; &egrave; il pi&ugrave; importante fattore di rischio per la neurodegenerazione; Tuttavia, gli effetti dell&#39;invecchiamento e neurodegenerazione sull&#39;espressione del gene nel cervello umano sono spesso stati studiati separatamente. Qui, abbiamo analizzato le modifiche nei livelli di trascrizione e lo splicing alternativo nella corteccia temporale di individui di et&agrave; diverse che erano cognitivamente normali, affetti da degenerazione lobare frontotemporale (FTLD), o affetti da malattia di Alzheimer (AD). Abbiamo individuato in et&agrave;-correlate modifiche splicing in soggetti cognitivamente normali e trovato che questi erano presenti anche nel 95% dei soggetti affetti da FTLD o annuncio, indipendente della loro et&agrave;. Questi cambiamenti sono stati coerenti con polypyrimidine maggiore del tratto binding protein (PTB)-splicing attivit&agrave; dipendente. Abbiamo anche individuato malattie specifiche modifiche di splicing che erano presenti in individui con FTLD o annuncio, ma non in soggetti cognitivamente normali. Questi cambiamenti sono stati coerenti con l&#39;antigene ventrale neuro-oncologica &egrave; diminuito (NOVA)-dipendente lo splicing regolamento e l&#39;abbondanza di nucleare diminuzione delle proteine NOVA. Come previsto, una drammatica down-regulation dei geni neuronali era associato con la malattia, mentre un modesto down-regulation dei geni neuronali e gliali &egrave; stato associato con l&#39;invecchiamento. Considerando che i nostri dati hanno indicato che i cambiamenti di splicing et&agrave;-correlate sono regolati indipendentemente dalle modifiche a livello di trascrizione, questi due meccanismi di regolamentazione interessate espressione di geni con funzioni simili, tra cui il metabolismo e la riparazione del DNA. In conclusione, i cambiamenti di splicing alternativi identificati in questo studio forniscono un nuovo collegamento tra invecchiamento e neurodegenerazione.

Analisi di splicing alternativo associato con invecchiamento e neurodegenerazione nel cervello umano.

&#x5E74;&#x9F62;&#x306F;&#x795E;&#x7D4C;&#x5909;&#x6027;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5371;&#x967A;&#x56E0;&#x5B50;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x8133;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059;&#x52A0;&#x9F62;&#x3068;&#x795E;&#x7D4C;&#x5909;&#x6027;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x304C;&#x6700;&#x3082;&#x983B;&#x7E41;&#x306B;&#x500B;&#x5225;&#x306B;&#x7814;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x524D;&#x982D;&#x5074;&#x982D;&#x8449;&#x5909;&#x6027;&#x75C7;&#xFF08;FTLD&#xFF09;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068;&#x8A8D;&#x77E5;&#x306F;&#x6B63;&#x5E38;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x5E74;&#x9F62;&#x306E;&#x500B;&#x4F53;&#x306E;&#x5074;&#x982D;&#x8449;&#x76AE;&#x8CEA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x308A;&#x3001;&#x30A2;&#x30EB;&#x30C4;&#x30CF;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x75C5;&#xFF08;AD&#xFF09;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x8A8D;&#x77E5;&#x5065;&#x5E38;&#x8005;&#x306E;&#x52A0;&#x9F62;&#x306B;&#x4F34;&#x3046;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306F;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5E74;&#x9F62;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;FTLD&#x307E;&#x305F;&#x306F;AD&#x60A3;&#x8005;&#x306E;95&#xFF05;&#x306B;&#x3082;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306F;&#x5897;&#x52A0;&#x30DD;&#x30EA;&#x30D4;&#x30EA;&#x30DF;&#x30B8;&#x30F3;&#x9818;&#x57DF;&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#xFF08;PTB&#xFF09;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6D3B;&#x6027;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;FTLD&#x307E;&#x305F;&#x306F;AD&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x8A8D;&#x77E5;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x500B;&#x4F53;&#x306E;&#x500B;&#x4F53;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x305F;&#x75BE;&#x60A3;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306F;&#x3001;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x305F;&#x795E;&#x7D4C;&#x816B;&#x760D;&#x5B66;&#x8179;&#x6297;&#x539F;&#xFF08;NOVA&#xFF09;&#x4F9D;&#x5B58;&#x6027;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3001;NOVA&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3001;&#x6838;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x4E88;&#x60F3;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x30B0;&#x30EA;&#x30A2;&#x7D30;&#x80DE;&#x3068;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x63A7;&#x3048;&#x3081;&#x306A;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x8001;&#x5316;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x306E;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3001;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5287;&#x7684;&#x306A;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x5E74;&#x9F62;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x305F;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x304C;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x306F;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x3066;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x4E00;&#x65B9;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;2&#x3064;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3084;DNA&#x4FEE;&#x5FA9;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x200B;&#x200B;&#x4E0E;&#x3048;&#x305F;&#x3002;&#x7D50;&#x8AD6;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306F;&#x3001;&#x8001;&#x5316;&#x3084;&#x795E;&#x7D4C;&#x5909;&#x6027;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x30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&#x8133;&#x306E;&#x8001;&#x5316;&#x3068;&#x795E;&#x7D4C;&#x5909;&#x6027;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;

&#xC5F0;&#xB839;&#xC740; neurodegeneration;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC704;&#xD5D8; &#xC694;&#xC18C; &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xB1CC;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC5D0; &#xB178;&#xD654; &#xBC0F; neurodegeneration &#xD6A8;&#xACFC; &#xBCC4;&#xB3C4;&#xB85C; &#xACF5;&#xBD80; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC790;&#xC8FC; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB300; &#xBCF8; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD654; &#xBC0F; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569; cognitively &#xC815;&#xC0C1; frontotemporal lobar &#xBCC0;&#xC131; (FTLD)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1B;&#xB294; &#xB610;&#xB294; &#xC54C; &#xCE20; &#xD558;&#xC774; &#xBA38; &#xBCD1; (AD)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xC54A;&#xC740; &#xB2E4;&#xB978; &#xB098;&#xAC00;&#xC758; &#xAC1C;&#xC778;&#xC758; &#xCE21; &#xB450; &#xC5FD; &#xD53C; &#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; cognitively &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAC1C;&#xC778;&#xC758; &#xB098;&#xC774; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC811;&#xD569; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xC774;&#xB4E4; &#xB610;&#xD55C; FTLD &#xB610;&#xB294; &#xAD11;&#xACE0;, &#xC790;&#xC2E0;&#xC758; &#xB098;&#xC774; &#xAD00;&#xACC4; &#xC5C6;&#xC774; &#xAC1C;&#xC778;&#xC758; 95%&#xC5D0; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB0B4;&#xC6A9;&#xC774; &#xC99D;&#xAC00; polypyrimidine&#xB85C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (PTB)&#xC640; &#xC77C;&#xCE58;-&#xC885;&#xC18D; &#xC791;&#xC5C5; &#xC811;&#xD569;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; FTLD &#xB610;&#xB294; &#xAD11;&#xACE0;, &#xAC1C;&#xC778; cognitively &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAC1C;&#xC778;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xC788;&#xB358; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xD2B9;&#xC815; &#xC811;&#xD569; &#xBCC0;&#xACBD; &#xD655;&#xC778;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xD654; &#xD588;&#xB2E4; &#xAC10;&#xC18C; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC885;&#xC591;&#xD559; &#xBCF5; &#xBD80; &#xD56D; (&#xB178;&#xBC14;)&#xC640; &#xC77C;&#xCE58;-&#xC885;&#xC18D; &#xC811;&#xD569; &#xADDC;&#xC815;&#xACFC; &#xB178;&#xBC14; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xAC10;&#xC18C; &#xD575; &#xD48D;&#xBD80;. &#xC608;&#xC0C1; &#xD588;&#xB358; &#xB300;&#xB85C;, &#xAD50; &#xBC0F; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xACB8;&#xC190; &#xD55C; &#xB2E4;&#xC6B4; &#xADDC;&#xC81C;&#xB294; &#xB178;&#xD654;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xBC18;&#xBA74; &#xC5F0;&#xAD00; &#xC9C8;&#xBCD1;, &#xC2E0;&#xACBD; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xADF9;&#xC801;&#xC778; &#xB2E4;&#xC6B4; &#xADDC;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB098;&#xC774; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC811;&#xD569; &#xBCC0;&#xD654; &#xB300; &#xBCF8; &#xC218;&#xC900; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB0B4;&#xC6A9;&#xC744; &#xBCC4;&#xB3C4;&#xB85C; &#xADDC;&#xC81C; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBC18;&#xBA74;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB450; &#xADDC;&#xC81C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xC2E0;&#xC9C4; &#xB300;&#xC0AC; &#xBC0F; DNA &#xBCF5;&#xAD6C;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xAC00;&#xC9C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744;. &#xB05D;&#xC73C;&#xB85C;,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569; &#xBCC0;&#xD654; &#xB178;&#xD654; neurodegeneration &#xC0AC;&#xC774; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB9C1;&#xD06C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xBD84;&#xC11D; &#xB300;&#xCCB4; &#xC811;&#xD569; neurodegeneration &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xB1CC;&#xC758; &#xB178;&#xD654;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C;.

La edad es el factor de riesgo m&#xE1;s importante para la neurodegeneraci&#xF3;n, sin embargo, los efectos del envejecimiento y la neurodegeneraci&#xF3;n en la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica en el cerebro humano han sido estudiados con mayor frecuencia por separado. En este sentido, se analizaron los cambios en los niveles de transcripci&#xF3;n y splicing alternativo en la corteza temporal de individuos de diferentes edades que eran cognitivamente normales, afectados por la degeneraci&#xF3;n lobar frontotemporal (DLFT), o afectados por la enfermedad de Alzheimer (EA). Se identificaron los cambios relacionados con la edad de corte y empalme en personas cognitivamente normales y descubrieron que &#xE9;stos estaban presentes tambi&#xE9;n en el 95% de las personas con DLFT o AD, independientemente de su edad. Estos cambios son compatibles con el aumento de la prote&#xED;na del tracto polypyrimidine vinculante (PTB)-dependiente de la actividad de empalme. Tambi&#xE9;n se identificaron los cambios espec&#xED;ficos de la enfermedad de empalme que estaban presentes en los individuos con DLFT o AD, pero no en personas cognitivamente normales. Estos cambios fueron consistentes con la disminuci&#xF3;n de la neuro-oncol&#xF3;gico del ant&#xED;geno ventral (NOVA) que dependen de la regulaci&#xF3;n de empalme, y la disminuci&#xF3;n de la abundancia de las prote&#xED;nas nucleares NOVA. Como era de esperar, una dram&#xE1;tica baja regulaci&#xF3;n de los genes neuronales se asoci&#xF3; con la enfermedad, mientras que una modesta baja regulaci&#xF3;n de los genes gliales y las neuronas se asocia con el envejecimiento. Mientras que nuestros datos indican que los cambios relacionados con la edad de corte y empalme se regulan de forma independiente de los cambios a nivel de la transcripci&#xF3;n-, estos dos mecanismos de regulaci&#xF3;n de expresi&#xF3;n de los genes afectados con funciones similares, incluyendo el metabolismo y la reparaci&#xF3;n del ADN. En conclusi&#xF3;n, los cambios de splicing alternativo identificados en este estudio proporcionan un nuevo v&#xED;nculo entre el envejecimiento y la neurodegeneraci&#xF3;n.

An&#xE1;lisis de splicing alternativo asociado con el envejecimiento y la neurodegeneraci&#xF3;n en el cerebro humano

RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x4EBA;&#x7269;&#x3002;&#x8FDB;&#x5C55;&#x672C;&#x6587;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x4E86;&#x5148;&#x8FDB;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x7528;&#x6765;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2A;&#x522B;&#x7684; RNA &#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D;&#x6216;&#x5982;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x5927;&#x914D;&#x5408;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x63CF;&#x8FF0;&#x5982;&#x4F55;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x53EF;&#x7528;&#x4E8E;&#x7814;&#x7A76;&#x4E0D;&#x540C;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684; Rna&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x65B0;&#x751F;&#x8A8A;&#x672C;&#x3001; &#x5206;&#x6CCC;&#x3001; Microrna &#x548C;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53; Rna &#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x8C03;&#x67E5;&#x7B14;&#x5F55;&#x3001; RNA &#x52A0;&#x5DE5;&#x53CA;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F3A;&#x8C03;&#x5728;&#x6570;&#x636E;&#x5206;&#x6790;&#x4E2D;&#x7684;&#x5F53;&#x524D;&#x6311;&#x6218;&#x548C;&#x4ECA;&#x540E;&#x7684;&#x6B65;&#x9AA4;&#x6240;&#x9700;&#x83B7;&#x5F97;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28; RNA &#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5BF9;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x89C4;&#x6A21;&#x6570;&#x91CF;&#x548C;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x56FE;&#x7247;&#x3002;

&#x86CB;&#x767D;&#x8D28; RNA &#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF1A; &#x65B0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6280;&#x672F;&#x548C;&#x89C2;&#x70B9;&#x3002;

RNA-binding proteins are key players in the regulation of gene expression. In this Progress article, we discuss state-of-the-art technologies that can be used to study individual RNA-binding proteins or large complexes such as the ribosome. We also describe how these approaches can be used to study interactions with different types of RNAs, including nascent transcripts, mRNAs, microRNAs and ribosomal RNAs, in order to investigate transcription, RNA processing and translation. Finally, we highlight current challenges in data analysis and the future steps that are needed to obtain a quantitative and high-resolution picture of protein-RNA interactions on a genome-wide scale.

Protein-RNA interactions: new genomic technologies and perspectives.

Prot&#xE9;ines liant l&#x26;#39;ARN sont des acteurs cl&#xE9;s dans la r&#xE9;gulation de l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes. Dans cet article, Progr&#xE8;s, nous discutons de l&#x26;#39;&#xE9;tat de l&#x26;#39;art-technologies qui peuvent &#xEA;tre utilis&#xE9;es pour &#xE9;tudier chaque ARN-prot&#xE9;ines de liaison ou de grands complexes tels que le ribosome. Nous d&#xE9;crivons &#xE9;galement comment ces approches peuvent &#xEA;tre utilis&#xE9;es pour &#xE9;tudier les interactions avec diff&#xE9;rents types d&#x26;#39;ARN, y compris les transcriptions naissantes, des ARNm, les microARN et ARN ribosomal, afin d&#x26;#39;enqu&#xEA;ter sur la transcription, la transformation de l&#x26;#39;ARN et la traduction. Enfin, nous mettons en &#xE9;vidence les d&#xE9;fis actuels en mati&#xE8;re d&#x26;#39;analyse de donn&#xE9;es et les &#xE9;tapes futures qui sont n&#xE9;cessaires pour obtenir une image quantitative et &#xE0; haute r&#xE9;solution de la prot&#xE9;ine-ARN interactions &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome entier.

Protein-ARN g&#xE9;nomiques Interactions: Technologies nouvelles et perspectives

RNA-bindende Proteine spielen eine Schl&uuml;sselrolle bei der Regulierung der Genexpression. In diesem Artikel Fortschritte diskutieren wir Zustand-of-the-Art Technologien, die verwendet werden k&ouml;nnen, um einzelne RNA-bindende Proteine oder gro&szlig;e komplexe wie das Ribosom zu studieren. Wir beschreiben auch, wie diese Ans&auml;tze verwendet werden k&ouml;nnen Interaktionen mit verschiedenen Arten von RNAs, einschlie&szlig;lich entstehende Abschriften, mRNAs, MicroRNAs und Ribosomale RNA, zu studieren um die Transkription, RNA-Verarbeitung und &Uuml;bersetzung zu untersuchen. Schlie&szlig;lich wir aktuelle Herausforderungen in der Datenanalyse zu markieren und die k&uuml;nftigen Schritte, die erforderlich sind, um erhalten eine quantitative und hochaufl&ouml;sende Bild von Protein-RNA-Interaktionen auf einer genomweiten-Skala.

Protein-RNA-Interaktionen: neuer genomischer Technologien und Perspektiven.

RNA-binding proteins sono attori chiave nella regolazione dell&#39;espressione genica. In questo articolo di progressi, si discutono dello stato-of-the-art tecnologie che possono essere utilizzati per lo studio individuale RNA-binding proteins o grandi complessi come il ribosoma. Abbiamo anche descrivere come questi approcci possono essere utilizzati per studiare le interazioni con diversi tipi di RNA, compreso le trascrizioni nascente, mRNA, microRNA e RNA ribosomiale (rRNA), al fine di indagare la trascrizione, elaborazione di RNA e di traduzione. Infine, si evidenziano le attuali sfide nell&#39;analisi dei dati e i futuri passi che sono necessari per ottenere un&#39;immagine ad alta risoluzione e quantitativa delle interazioni della proteina-RNA su una scala genome-wide.

Le interazioni della proteina-RNA: nuove tecnologie genomiche e prospettive.

RNA&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30D7;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E4;&#x30FC;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x4E2D;&#x306E;&#x8A18;&#x4E8B;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x500B;&#x3005;&#x306E;RNA&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x6700;&#x5148;&#x7AEF;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x3001;RNA&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x65B0;&#x751F;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x3001;mRNA&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x3068;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;RNA&#x3092;&#x542B;&#x3080;RNA&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7A2E;&#x985E;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x8AB2;&#x984C;&#x3068;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;-RNA&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x304B;&#x3064;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x753B;&#x50CF;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x4ECA;&#x5F8C;&#x306E;&#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;-RNA&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF1A;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x6280;&#x8853;&#x3068;&#x5C55;&#x671B;

RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC120;&#xC218;&#xB294;. &#xC774; &#xC9C4;&#xD589; &#xBB38;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBCC4; RNA &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xB4F1; &#xB300;&#xD615; &#xB2E8;&#xC9C0;&#xB97C; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xCD5C;&#xC2E0;&#xC758; &#xAE30;&#xC220;&#xC5D0; &#xC124;&#xBA85;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB610;&#xD55C; &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC744; &#xCD08;&#xAE30; &#xC131;&#xC801;&#xD45C;, mRNAs, microRNAs &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; RNAs &#xB4F1; Rnas&#xC758; &#xC885;&#xB958;&#xC640; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558; &#xC804;&#xC0AC;, RNA &#xCC98;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xBC88;&#xC5ED;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBD84;&#xC11D; &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xACFC;&#xC81C;&#xB97C; &#xAC15;&#xC870; &#xD558; &#xACE0; &#xBBF8;&#xB798;&#xC758; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB97C; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;-RNA &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xADDC;&#xBAA8;&#xC758; &#xC591;&#xC801; &#xBC0F; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC0AC;&#xC9C4;&#xC758; &#xC5BB;&#xC744;.

&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;-RNA &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;: &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xC220;&#xACFC; &#xAD00;&#xC810;.

ARN-prote&#xED;nas de uni&#xF3;n son actores clave en la regulaci&#xF3;n de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica. En este art&#xED;culo el Progreso, se discute el estado de la tecnolog&#xED;as m&#xE1;s avanzadas que se pueden utilizar para estudiar cada ARN-prote&#xED;nas de uni&#xF3;n o grandes complejos, como el ribosoma. Tambi&#xE9;n describe c&#xF3;mo estos enfoques se pueden utilizar para estudiar las interacciones con distintos tipos de ARN, incluyendo las transcripciones nacientes, mRNAs, los microARNs y ARN ribosomal, a fin de investigar la transcripci&#xF3;n, el procesamiento del ARN y la traducci&#xF3;n. Por &#xFA;ltimo, destacamos los desaf&#xED;os actuales en el an&#xE1;lisis de datos y las futuras medidas que se necesitan para obtener una imagen cuantitativa y de alta resoluci&#xF3;n de las interacciones prote&#xED;na-ARN en una escala del genoma.

Kathi Zarnack

European Bioinformatics Institute

EMBL Heidelberg

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

Kathi Zarnack

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}European Bioinformatics Institute

EMBL Heidelberg

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

European Bioinformatics Institute