analyzing-gene-expression-from-marine-microbial-communities-using

Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics

Analogous to metagenomics, environmental transcriptomics (metatranscriptomics) retrieves and sequences environmental mRNAs from a microbial assemblage ...

University of Georgia (UGA)

&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178; &#xFF08;DMSP&#xFF09; &#x5360;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x5C0F;&#x5B66;&#x5230;&#x4E2D;&#x5B66;&#x751F;&#x4EA7;&#x8005;&#x5728;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x98DF;&#x7269;&#x94FE;&#x4E2D;&#x7684;&#x6709;&#x673A;&#x786B;&#x901A;&#x91CF;&#x3002;&#x81EA;&#x7136;&#x7684;&#x793E;&#x533A;&#x548C;&#x65E0;&#x83CC;&#x6587;&#x5316;&#x4E0E;&#x65E0;&#x7EBF;&#x7535;&#x6807;&#x8BB0; DMSP &#x5B75;&#x5316;&#x8868;&#x660E;&#x6D77;&#x6D0B;&#xFF0C;&#x5355;&#x7EC6;&#x80DE;&#x84DD;&#x85FB;&#x8FD1;&#x6D77;&#x548C;&#x7EC6;&#x957F;&#x7684;&#x7845;&#x85FB;&#x7C7B;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x4E3A;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269;&#x4F18;&#x52BF;&#x7FA4;&#x4F53;&#x5360;&#x7528;&#x548C;&#x540C;&#x5316; DMSP &#x786B;&#xFF0C;&#x56E0;&#x6B64;&#x5206;&#x6D41;&#x7684;&#x6D6E;&#x6E38;&#x751F;&#x7269;&#x4EA7;&#x751F;&#x6392;&#x653E;&#x5230;&#x5927;&#x6C14;&#x4E2D;&#x6709;&#x673A;&#x786B;&#x7684;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x3002;

&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178;&#x7684;&#x6D77;&#x6D0B;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x5438;&#x6536;&#x3002;

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) accounts for most of the organic sulfur fluxes from primary to secondary producers in marine microbial food webs. Incubations of natural communities and axenic cultures with radio-labeled DMSP showed that dominant phytoplankton groups of the ocean, the unicellular cyanobacteria Prochlorococcus and Synechococcus and diatoms, as well as heterotrophic bacteria take up and assimilate DMSP sulfur, thus diverting a proportion of plankton-produced organic sulfur from emission into the atmosphere.

Dimethylsulfoniopropionate uptake by marine phytoplankton.

Dim&eacute;thylsulfoniopropionate (DMSP) repr&eacute;sente la majeure partie des flux de soufre organique du primaire aux producteurs secondaires dans les r&eacute;seaux trophiques marins microbiennes. Incubations de milieux naturels et des cultures ax&eacute;niques avec DMSP radio-marqu&eacute;s a montr&eacute; que les groupes de phytoplancton dominant l&#39;oc&eacute;an, les cyanobact&eacute;ries unicellulaires Prochlorococcus et de Synechococcus et de diatom&eacute;es, aussi bien comme h&eacute;t&eacute;rotrophes bact&eacute;ries relever et assimilent le soufre DMSP, d&eacute;tournant ainsi une proportion de soufre organique &agrave; plancton-produit de l&#39;&eacute;mission dans l&#39;atmosph&egrave;re.

Dim&eacute;thylsulfoniopropionate absorption par le phytoplancton marin.

Dimethylsulfoniumpropionats (DMSP) Konten f&uuml;r die meisten der organische Schwefel Lichtstromwerte von prim&auml;ren sekund&auml;ren Erzeugern in mikrobiellen Nahrungsketten. Inkubationen nat&uuml;rlichen Gemeinschaften und axenic Kulturen mit Radio-beschrifteten DMSP zeigte, dass dominante Phytoplankton-Gruppen auf den Ozean, die einzelligen Cyanobakterien Prochlorococcus marinus und Synechococcus und Kieselalgen, sowie als heterotrophe Bakterien aufnehmen und DMSP Schwefel assimilieren, Ablenkung damit einen Anteil von Plankton produziert organische Schwefel aus Emission in die Atmosph&auml;re.

Dimethylsulfoniumpropionats Aufnahme durch marine Phytoplankton.

Conti Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) per la maggior parte dei flussi di zolfo organico da primaria ai produttori secondari microbica alimenti marini webs. Incubazioni di comunit&agrave; naturali e le culture sono con radio-marcato DMSP ha mostrato che gruppi di fitoplancton dominante dell&#39;oceano, i cianobatteri unicellulari Acinetobacter e Acinetobacter e diatomee, batteri cos&igrave; come eterotrofi prendono e assimilano zolfo DMSP, deviando cos&igrave; una percentuale di zolfo organico plancton-prodotto da emissioni in atmosfera.

Dimethylsulfoniopropionate assorbimento di fitoplancton marino.

&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8; &#xFF08;dmsp &#x885B;&#x661F;&#xFF09; &#x30A2;&#x30AB;&#x30A6;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA;&#x304B;&#x3089;&#x6709;&#x6A5F;&#x786B;&#x9EC4;&#x30D5;&#x30E9;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x306B;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x98DF;&#x7269;&#x7DB2;&#x3067;&#x306E;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3002;&#x5B75;&#x5316;&#x81EA;&#x7136;&#x7FA4;&#x96C6;&#x3068;&#x7121;&#x83CC; DMSP &#x30E9;&#x30B8;&#x30AA;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x30E9;&#x30D9;&#x30EB;&#x4ED8;&#x304D;&#x306E;&#x6D77;&#x3001;&#x5358;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE; &#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2; Prochlorococcus &#x3068;&#x5C0E;&#x5165;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x73EA;&#x85FB;&#x306E;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x690D;&#x7269;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x304C;&#x5360;&#x3081;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3;&#x751F;&#x7523;&#x6709;&#x6A5F;&#x786B;&#x9EC4;&#x5927;&#x6C17;&#x3078;&#x306E;&#x6392;&#x51FA;&#x91CF;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x3092;&#x6D41;&#x7528; DMSP &#x786B;&#x9EC4;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x6D77;&#x6D0B;&#x690D;&#x7269;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8;&#x53D6;&#x308A;&#x8FBC;&#x307F;&#x3002;

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) &#xD574;&#xC591; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC2DD;&#xD488; &#xC6F9; 2 &#xCC28; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC790;&#xC5D0; &#xAC8C; &#xAE30;&#xBCF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xAE30; &#xD669; &#xC6A9;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC744; &#xCC28;&#xC9C0;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC790;&#xC5F0; &#xC0AC;&#xD68C;&#xC640; &#xB77C;&#xB514;&#xC624; &#xB77C;&#xB294; DMSP axenic &#xBB38;&#xD654; &#xC678;&#xD53C; &#xBC14;&#xB2E4;, &#xB2E8; &#xC138;&#xD3EC; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; Prochlorococcus &#xBC0F; Synechococcus&#xC640; &#xADDC;&#xC870;&#xB958;, &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC131; &#xD50C;&#xB791;&#xD06C;&#xD1A4; &#xADF8;&#xB8F9; &#xCC28;&#xC9C0; &#xB3D9;&#xD654; DMSP &#xC720;&#xD669;, &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xB300;&#xAE30;&#xB85C; &#xBC29;&#xCD9C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xAE30; &#xC720;&#xD669; &#xD50C;&#xB791;&#xD06C;&#xD1A4; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xBE44;&#xC728;&#xC744; &#xC6B0;&#xD68C; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;.

&#xD574;&#xC591; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC131; &#xD50C;&#xB791;&#xD06C;&#xD1A4;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; Dimethylsulfoniopropionate &#xAE00;&#xADC0;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Cuentas de Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) para la mayor&iacute;a de los flujos de sulfuro org&aacute;nico de primaria a secundarios productores de marinas tr&oacute;ficas microbianas. Incubaciones de comunidades naturales y cultivos ax&eacute;nicos con marcada con radio DMSP demostraron que grupos dominantes del fitoplancton del oc&eacute;ano, las cianobacterias unicelulares Prochlorococcus Synechococcus y diatomeas, bacterias as&iacute; como heter&oacute;trofas toman y asimilan azufre DMSP, desviando as&iacute; una proporci&oacute;n de azufre org&aacute;nico producido por el plancton de emisi&oacute;n a la atm&oacute;sfera.

Dimethylsulfoniopropionate absorci&oacute;n de fitoplancton marino.

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x6D88;&#x8017;&#x662F;&#x4E3B;&#x8981;&#x6D41;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x5149;&#x89E3;&#x548C;&#x901A;&#x98CE;&#x7684;&#x751F;&#x6E90;&#x75D5;&#x91CF;&#x6C14;&#x4F53;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B; (DMS) &#x53BB;&#x9664;&#x8868;&#x9762;&#x7684;&#x6D77;&#x6D0B;&#x4E4B;&#x4E00;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x51E0;&#x682A;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7EC6;&#x83CC;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x80FD;&#x591F;&#x5229;&#x7528; DMS&#xFF0C;&#x4E86;&#x89E3;&#x751A;&#x5C11;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x6216; DMS &#x6D88;&#x8D39;&#x8005;&#x5728;&#x6D77;&#x6C34;&#x4E2D;&#x7684;&#x4EB2;&#x7F18;&#x5173;&#x7CFB;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4E30;&#x5BCC;&#x4E86;&#x4E0E;&#x4E0D;&#x540C;&#x78B3;&#x6E90;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x523A;&#x6FC0;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7FA4;&#x843D; (&#x8461;&#x8404;&#x7CD6;&#x6D88;&#x8017;&#x7EC6;&#x83CC;&#x3001; &#x7532;&#x57FA;&#x96C6;&#x56E2;&#x6D88;&#x8D39;&#x7EC6;&#x83CC;&#x548C; DMS &#x6D88;&#x8D39;&#x8005;) &#x6D4B;&#x8BD5;&#x8FD9;&#x5982;&#x4F55;&#x5F71;&#x54CD; DMS &#x6D88;&#x8D39;&#xFF0C;&#x5E76;&#x68C0;&#x67E5;&#x54EA;&#x4E9B;&#x751F;&#x7269;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x6D89;&#x53CA;&#x6CBF;&#x6D77;&#x548C;&#x516C;&#x6D77;&#x6C34;&#x57DF;&#x3002;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x6D88;&#x8D39;&#x6781;&#x5927;&#x5730;&#x523A;&#x6FC0;&#x4E86; DMS &#x52A0;&#x6CD5;&#x6CBB;&#x7597;&#x800C;&#x65E0;&#x523A;&#x6FC0;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x6CBB;&#x7597;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x7531;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x6280;&#x672F; &#xFF08;&#x4ECE; DGGE &#x51DD;&#x80F6;&#x548C;&#x514B;&#x9686;&#x5E93;&#x7684;&#x987A;&#x5E8F;&#x4E50;&#x961F;) &#x7684;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269; DNA &#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x4E13;&#x95E8;&#x8BBE;&#x6709; DMS &#x7EC6;&#x83CC;&#x4E0E; Methylophaga &#x5C5E;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4E5F;&#x8DDF;&#x7740;&#x5728;&#x4E00;&#x4E9B;&#x6D53;&#x7F29;&#x6750;&#x6599;&#x6D88;&#x8017; DMS &#x7684;&#x547D;&#x8FD0;&#x3002;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x662F;&#x5927;&#x591A;&#x8F6C;&#x4E3A;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x4E9A;&#x781C;&#x8461;&#x8404;&#x7CD6;&#x6216;&#x7532;&#x9187;&#x7684;&#x6D53;&#x7F29;&#xFF0C;&#x800C;&#x5B83;&#x8F6C;&#x6362;&#x4E3B;&#x8981;&#x4EE5;&#x786B;&#x9178;&#x5728; DMS &#x6D53;&#x7F29;&#xFF0C;&#x540E;&#x8005;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x4F7F;&#x7528; DMS &#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x78B3;&#x548C;&#x80FD;&#x6E90;&#x6765;&#x6E90;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x751F;&#x5316;&#x524D;&#x4F53;&#x7684; DMS&#xFF0C;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B; &#xFF08;DMSP&#xFF09; &#x4E19;&#x9178;&#xFF0C;&#x8017;&#x7528;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269; DMS &#x4F3C;&#x4E4E;&#x7531;&#x4E13;&#x5BB6;&#x5229;&#x7528;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x78B3;&#x548C;&#x7535;&#x5B50;&#x6765;&#x6E90;&#x4E0D;&#x540C;&#x3002;&#x8FD9;&#x662F;&#x7B26;&#x5408; DMSP &#x5708;&#x6570;&#x7387;&#x8FDC;&#x9AD8;&#x4E8E; DMS &#x5728;&#x5E73;&#x65F6;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#x3002;

&#x4EB2;&#x7F18;&#x9274;&#x5B9A;&#x548C;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x6D88;&#x8017;&#x7684;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x3002;

Microbial consumption is one of the main processes, along with photolysis and ventilation, that remove the biogenic trace gas dimethylsulfide (DMS) from the surface ocean. Although a few isolates of marine bacteria have been studied for their ability to utilize DMS, little is known about the characteristics or phylogenetic affiliation of DMS consumers in seawater. We enriched coastal and open-ocean waters with different carbon sources to stimulate different bacterial communities (glucose-consuming bacteria, methyl group-consuming bacteria and DMS consumers) in order to test how this affected DMS consumption and to examine which organisms might be involved. Dimethylsulfide consumption was greatly stimulated in the DMS addition treatments whereas there was no stimulation in the other treatments. Analysis of microbial DNA by two different techniques (sequenced bands from DGGE gels and clone libraries) showed that bacteria grown specifically with the presence of DMS were closely related to the genus Methylophaga. We also followed the fate of consumed DMS in some of the enrichments. Dimethylsulfide was converted mostly to DMSO in glucose or methanol enrichments, whereas it was converted mostly to sulfate in DMS enrichments, the latter suggesting use of DMS as a carbon and energy source. Our results indicate that unlike the biochemical precursor of DMS, dimethylsulfoniopropionate (DMSP), which is consumed by a broad spectrum of marine microorganisms, DMS seems to be utilized as a carbon and electron source by specialists. This is consistent with the usual observation that DMSP turns over at much higher rates than DMS.

Phylogenetic identification and metabolism of marine dimethylsulfide-consuming bacteria.

Consommation microbienne est l&#39;un des principaux processus, ainsi que la photolyse et de ventilation, qui enl&egrave;vent la trace biog&eacute;nique gaz dim&eacute;thylsulfure (DMS) de la surface de l&#39;oc&eacute;an. Bien que quelques isolats de bact&eacute;ries marines ont &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;s pour leur capacit&eacute; &agrave; utiliser les DMS, on en sait peu sur les caract&eacute;ristiques ou l&#39;affiliation phylog&eacute;n&eacute;tique des consommateurs DMS en eau de mer. Nous avons enrichi des eaux c&ocirc;ti&egrave;res et en haute mer avec diff&eacute;rentes sources de carbone pour stimuler diff&eacute;rentes communaut&eacute;s bact&eacute;riennes (bact&eacute;ries consommatrices de glucose, les bact&eacute;ries consommatrices de groupe m&eacute;thyle et consommateurs DMS) afin de v&eacute;rifier comment cela affect&eacute; la consommation DMS et d&#39;examiner quels organismes pourraient &ecirc;tre impliqu&eacute;s. Consommation de sulfure de dim&eacute;thyle est fortement stimul&eacute;e dans les traitements d&#39;ajout de DMS, alors qu&#39;il n&#39;y n&#39;avait aucune stimulation dans les autres traitements. Analyse de l&#39;ADN microbien par deux techniques diff&eacute;rentes (s&eacute;quenc&eacute;es bandes de gel DGGE et biblioth&egrave;ques de clone) a montr&eacute; que les bact&eacute;ries cultiv&eacute;es sp&eacute;cifiquement avec la pr&eacute;sence de DMS &eacute;taient &eacute;troitement apparent&eacute;s au genre Methylophaga. Aussi, nous avons suivi le sort du DMS consomm&eacute;e dans certains les enrichissements. Sulfure de dim&eacute;thyle a &eacute;t&eacute; converti surtout en DMSO en glucose ou m&eacute;thanol enrichissements, alors qu&#39;il a &eacute;t&eacute; converti pour la plupart pour le sulfate dans les enrichissements de DMS, cette derni&egrave;re utilisation sugg&eacute;rant des DMS comme source de carbone et d&#39;&eacute;nergie. Nos r&eacute;sultats indiquent que, contrairement &agrave; la pr&eacute;curseur biochimique du DMS, dim&eacute;thylsulfoniopropionate (DMSP), qui est consomm&eacute;e par un large spectre de microorganismes marins, DMS semble &ecirc;tre utilis&eacute; comme source de carbone et d&#39;&eacute;lectrons par des sp&eacute;cialistes. Cela est compatible avec l&#39;observation habituelle que DMSP confie &agrave; des taux beaucoup plus &eacute;lev&eacute;s que la DMS.

Identification phylog&eacute;n&eacute;tique et le m&eacute;tabolisme des bact&eacute;ries consommatrices de sulfure de dim&eacute;thyle marines.

Mikrobielle Verbrauch ist einer der wichtigsten Prozesse, zusammen mit Photolyse und Bel&uuml;ftung, die der biogenen Trace Gas Dimethylsulfide (DMS) aus der Oberfl&auml;che Ozean entfernt. Obwohl einige Isolate mariner Bakterien f&uuml;r ihre F&auml;higkeit, DMS nutzen gepr&uuml;ft worden sind, ist wenig &uuml;ber die Eigenschaften oder stammesgeschichtliche Zugeh&ouml;rigkeit der DMS-Verbraucher in Meerwasser bekannt. Wir bereichert die K&uuml;sten- und offenen Ozean Gew&auml;sser mit verschiedenen Kohlenstoffquellen zur Stimulierung von verschiedener bakterieller Gemeinschaften (Glukose verbrauchenden Bakterien, Methyl-Gruppe verbrauchenden Bakterien und DMS-Verbraucher) um zu testen, wie das DMS Verbrauch auswirkt und zu pr&uuml;fen, welche Organismen beteiligt sein k&ouml;nnten. Dimethylsulfide Verbrauch war stark in die DMS-Zusatz-Behandlungen stimuliert, w&auml;hrend gab es keine Anregung in den anderen Behandlungen. Analyse der mikrobiellen DNA durch zwei unterschiedliche Techniken (sequenzierte B&auml;nder aus DGGE Gele und Klon-Bibliotheken) zeigte, dass Bakterien gewachsen, speziell mit der Anwesenheit von DMS eng verwandt mit der Gattung Methylophaga war. Wir folgten auch das Schicksal der verbrauchten DMS in einigen der Bereicherungen. Dimethylsulfide wurde meist in DMSO in Glukose oder Methanol Bereicherungen, konvertiert, w&auml;hrend es haupts&auml;chlich um in DMS Bereicherungen, die letzteren vorschlagen Nutzung von DMS als kohlenstoffarme und Sulfat umgewandelt wurde. Unsere Ergebnisse zeigen, dass im Gegensatz zu den biochemischen Vorl&auml;ufer der DMS, Dimethylsulfoniumpropionats (DMSP), die durch ein breites Spektrum von marinen Mikroorganismen, konsumiert wird DMS scheint als Kohlenstoff und Elektron Quelle von Spezialisten genutzt werden. Dies steht im Einklang mit der &uuml;blichen Beobachtung, die DMSP zu viel h&ouml;heren Preisen als DMS dreht.

Phylogenetische Kennzeichnung und Stoffwechsel Mariner Dimethylsulfide verbrauchenden Bakterien.

Consumo microbica &egrave; uno dei principali processi, insieme a fotolisi e ventilazione, che rimuovere la traccia biogenica gas dimethylsulfide (DMS) dall&#39;oceano superficiale. Anche se a pochi isolati di batteri marini sono stati studiati per la loro capacit&agrave; di utilizzare DMS, poco si sa circa le caratteristiche o affiliazione filogenetica dei consumatori DMS in acqua di mare. Abbiamo arricchito le acque costiere e sull&#39;oceano aperto con fonti di carbonio differenti per stimolare diverse comunit&agrave; batterica (batteri che consumano glucosio, batteri che consumano gruppo metile e consumatori DMS) al fine di verificare come questo influenzato consumo DMS ed esaminare quali organismi possono essere coinvolti. Dimethylsulfide consumo era notevolmente stimolato nei trattamenti di aggiunta di DMS considerando che non non c&#39;era nessuna stimolazione in altri trattamenti. Analisi del DNA microbico di due diverse tecniche (sequenziate bande da gel DGGE e librerie clone) ha dimostrato che batteri coltivati in particolare con la presenza di DMS erano strettamente correlati al genere Methylophaga. Abbiamo anche seguito il destino del DMS consumato in alcuni gli arricchimenti. Dimethylsulfide &egrave; stato convertito per la maggior parte di DMSO in glucosio o metanolo arricchimenti, considerando che &egrave; stato convertito per lo pi&ugrave; per solfato in arricchimenti in DMS, quest&#39;ultimo uso suggerendo di DMS come fonte di carbonio ed energia. I nostri risultati indicano che, a differenza della precursore biochimico di DMS, dimethylsulfoniopropionate (DMSP), che viene consumato da un ampio spettro di microrganismi marini, DMS sembra essere utilizzato come fonte di carbonio ed elettrone da specialisti. Questo &egrave; coerenza con l&#39;osservazione usuale che DMSP gira a tassi molto pi&ugrave; alti di DMS.

Identificazione filogenetica e metabolismo di batteri che consumano dimethylsulfide marini.

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x6D88;&#x8CBB;&#x751F;&#x4F53;&#x5FAE;&#x91CF;&#x30AC;&#x30B9; &#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B5;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C9; (DMS) &#x304B;&#x3089;&#x6D77;&#x6D0B;&#x8868;&#x5C64;&#x9664;&#x53BB;&#x3059;&#x308B;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; &#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x3001;&#x5149;&#x5206;&#x89E3;&#x3068;&#x63DB;&#x6C17;&#x3001;&#x3068;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x306E;&#x4E00;&#x3064;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306F; DMS &#x3092;&#x6D3B;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x3067;&#x7814;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3084;&#x6D77;&#x6C34;&#x306E; DMS &#x6D88;&#x8CBB;&#x8005;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x5B66;&#x7684;&#x6240;&#x5C5E;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6CBF;&#x5CB8;&#x3068;&#x5916;&#x6D0B;&#x6C34;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC;&#x7FA4;&#x96C6; (&#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x6D88;&#x8CBB;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3092;&#x6D88;&#x8CBB;&#x7D30;&#x83CC;&#x30FB; DMS &#x6D88;&#x8CBB;&#x8005;&#xFF09; &#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3053;&#x306E; DMS &#x6D88;&#x8CBB;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x3069;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x304C;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x691C;&#x8A0E;&#x3092;&#x523A;&#x6FC0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x70AD;&#x7D20;&#x6E90;&#x3092;&#x8C4A;&#x304B;&#x3002;&#x523A;&#x6FC0;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x6CBB;&#x7642;&#x6CD5;&#x304C;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x4E00;&#x65B9;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B5;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C9;&#x6D88;&#x8CBB;&#x306F;&#x5927;&#x5E45; DMS &#x4ED8;&#x52A0;&#x51E6;&#x7F6E;&#x306B;&#x523A;&#x6FC0;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;2 &#x3064;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30C6;&#x30AF;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF; &#xFF08;DGGE &#x30B2;&#x30EB;&#x3068;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3; &#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C9;&#xFF09; &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E; DNA &#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;DMS &#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3068;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x5897;&#x6B96;&#x3059;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC; Methylophaga &#x5C5E;&#x306B;&#x5BC6;&#x63A5;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x6D88;&#x8CBB;&#x306E; DMS &#x306E;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x306F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x904B;&#x547D;&#x3092;&#x7D9A;&#x3044;&#x3066;&#x304F;&#x3060;&#x3055;&#x3044;&#x3002;&#x5927;&#x62B5; DMS &#x6FC3;&#x7E2E;&#x306F;&#x3001;DMS &#x306E;&#x5F8C;&#x8005;&#x306E;&#x793A;&#x5506;&#x4F7F;&#x7528;&#x70AD;&#x7D20;&#x30FB; &#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30FC;&#x6E90;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x786B;&#x9178;&#x306B;&#x5909;&#x63DB;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B5;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C9; DMSO &#x6FC3;&#x7E2E;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30E1;&#x30BF;&#x30CE;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x306F;&#x4E3B;&#x306B;&#x5909;&#x63DB;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;DMS&#x3001;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x5E83;&#x3044;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; DMS &#x70AD;&#x7D20;&#x3068;&#x96FB;&#x5B50;&#x6E90;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5C02;&#x9580;&#x5BB6;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5229;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x6D88;&#x8CBB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8; &#xFF08;dmsp &#x885B;&#x661F;&#xFF09; &#x306E;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x524D;&#x99C6;&#x4F53;&#x3068;&#x306F;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x4EE5;&#x4E0A; DMS &#x3088;&#x308A;&#x306F;&#x308B;&#x304B;&#x306B;&#x9AD8;&#x3044;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x3067; DMSP &#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x901A;&#x5E38;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3068;&#x77DB;&#x76FE;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3068;&#x786B;&#x5316;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x306E;&#x304B;&#x304B;&#x308B;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3002;

&#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC18C;&#xBE44; &#xC8FC;&#xC694; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;, photolysis &#xBC0F; &#xD658;&#xAE30;, &#xD45C;&#xBA74; &#xBC14;&#xB2E4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xAE30;&#xC6D0; &#xCD94;&#xC801; &#xAC00;&#xC2A4; dimethylsulfide (&#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4;)&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD558;&#xB294; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4;&#xB97C; &#xD65C;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB2A5;&#xB825;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xACA9;&#xB9AC; &#xD574;&#xC591; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xBE44;&#xB85D; &#xC791;&#xC740; &#xD2B9;&#xC131; &#xB610;&#xB294; &#xD574; &#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; DMS &#xC18C;&#xBE44;&#xC790;&#xC758; phylogenetic &#xC81C;&#xD734;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB18D;&#xCD95; &#xC790;&#xADF9; &#xD558;&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; &#xC138;&#xADE0; &#xACF5;&#xB3D9;&#xCCB4; (&#xD3EC;&#xB3C4; &#xB2F9; &#xC18C;&#xBAA8; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;, &#xBA54; &#xD2F8; &#xADF8;&#xB8F9; &#xC18C;&#xBAA8; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC640; DMS &#xC18C;&#xBE44;&#xC790;)&#xC774; DMS &#xC18C;&#xBE44;&#xC5D0; &#xBBF8;&#xCE5C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD558; &#xACE0; &#xAC80;&#xC0AC;&#xB294; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD3EC;&#xD568; &#xB420; &#xC218;&#xB3C4; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB2E4;&#xB978; &#xD0C4;&#xC18C; &#xC18C;&#xC2A4;&#xC640; &#xD574;&#xC548; &#xBC0F; &#xC624;&#xD508; &#xC624;&#xC158; &#xBC14;&#xB2E4;. &#xBC18;&#xBA74;&#xC5D0; &#xB2E4;&#xB978; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5C6;&#xC774; &#xC790;&#xADF9; &#xD588;&#xB2E4; Dimethylsulfide &#xC18C;&#xBE44;&#xB294; DMS &#xCD94;&#xAC00; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC790;&#xADF9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xAE30;&#xBC95; (DGGE &#xC824; &#xBC0F; &#xBCF5;&#xC81C; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB41C; &#xBC34;&#xB4DC;)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; DNA&#xC758; &#xBD84;&#xC11D; &#xD2B9;&#xD788; &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xC131;&#xC7A5; &#xD558;&#xB294; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xC18D; Methylophaga&#xC5D0; &#xBC00;&#xC811; &#xD558; &#xAC8C; &#xAD00;&#xB828;&#xC774; &#xC788;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC77C;&#xBD80;&#xB294; enrichments&#xC5D0;&#xC11C; &#xC18C;&#xBE44; DMS&#xC758; &#xC6B4;&#xBA85;&#xC744; &#xB530; &#xB790; &#xB2E4;. Dimethylsulfide&#xB294; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xD3EC;&#xB3C4; &#xB2F9; &#xB610;&#xB294; &#xBA54;&#xD0C4;&#xC62C; enrichments&#xC5D0;&#xC11C; DMSO &#xBC18;&#xBA74; &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xC8FC;&#xB85C; &#xD669;&#xC0B0; &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4; enrichments, &#xD0C4;&#xC18C; &#xBC0F; &#xC5D0;&#xB108;&#xC9C0; &#xC6D0;&#xC73C;&#xB85C; DMS &#xD6C4;&#xC790; &#xC81C;&#xC548; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xD658; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCC0;&#xD658;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4;, &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4; &#xC804;&#xBB38;&#xAC00; &#xC758;&#xD574; &#xD0C4;&#xC18C; &#xBC0F; &#xC804;&#xC790; &#xC18C;&#xC2A4;&#xB85C; &#xD65C;&#xC6A9; &#xB420; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCF4;&#xC778;&#xB2E4; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xD574;&#xC591; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xB294; dimethylsulfoniopropionate (DMSP)&#xC758; &#xC0DD; &#xD654; &#xD559;&#xC801; &#xC804;&#xC870;&#xC640; &#xB2EC;&#xB9AC;&#xB294; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xAC83;&#xC740; &#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xB192;&#xC740; &#xC18D;&#xB3C4;&#xB85C; DMSP &#xBC15;&#xC0B4; &#xD3C9;&#xC18C; &#xAD00;&#xCC30;&#xACFC; &#xC77C;&#xCE58;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Phylogenetic &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; &#xD574;&#xC591; dimethylsulfide &#xC18C;&#xBAA8; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xB300;&#xC0AC;.

Consumo microbiana es uno de los principales procesos, junto con la fot&oacute;lisis y ventilaci&oacute;n, que eliminan el gas biog&eacute;nico rastro dimethylsulfide (DMS) el oc&eacute;ano superficial. Aunque algunas cepas de bacterias marinas se han estudiado por su capacidad para utilizar DMS, poco se sabe acerca de las caracter&iacute;sticas o afiliaci&oacute;n filogen&eacute;tica de los consumidores DMS en agua de mar. Nos enriquece las aguas costeras y mar abierto con fuentes de carbono diferentes para estimular diferentes comunidades bacterianas (bacterias consumo de glucosa, bacterias de consumo de grupo metilo y los consumidores DMS) para probar c&oacute;mo esto afect&oacute; el consumo de DMS y examinar que organismos podr&iacute;an estar involucrados. Dimethylsulfide consumo fue estimulado enormemente en los tratamientos de la adici&oacute;n de DMS Considerando que no hab&iacute;a ning&uacute;n est&iacute;mulo en los otros tratamientos. An&aacute;lisis de ADN microbiano por dos t&eacute;cnicas diferentes (secuenciados bandas de DGGE geles y bibliotecas de clones) mostr&oacute; que las bacterias cultivadas espec&iacute;ficamente con la presencia de DMS estaban estrechamente relacionadas con el g&eacute;nero Methylophaga. Tambi&eacute;n seguimos el destino de DMS consumida en algunos de los enriquecimientos. Dimethylsulfide fue convertido sobre todo al DMSO en enriquecimientos de glucosa o metanol, que se convirti&oacute; en su mayor parte para sulfato de enriquecimientos de DMS, el &uacute;ltimo uso sugerente de DMS como fuente de carbono y energ&iacute;a. Nuestros resultados indican a diferencia del precursor bioqu&iacute;mico de DMS, dimethylsulfoniopropionate (DMSP), que es consumido por un amplio espectro de microorganismos marinos, DMS parece ser utilizado como fuente de carbono y electr&oacute;n por especialistas. Esto es consistente con la observaci&oacute;n habitual que DMSP voltea a tasas mucho m&aacute;s altas que DMS.

Identificaci&oacute;n filogen&eacute;tica y el metabolismo de bacterias marinas de dimethylsulfide-consumo.

&#x5728;&#x4ECE; Blanes &#x6E7E; (NW &#x5730;&#x4E2D;&#x6D77;) &#x8868;&#x9762;&#x6D77;&#x6C34;&#x5728; 2003 &#x5E74; 3 &#x6708;&#x81F3; 2004 &#x5E74; 4 &#x6708;&#x7684;&#x5E74;&#x5EA6;&#x7814;&#x7A76;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x5438;&#x6536;&#x6EB6;&#x89E3;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178; &#xFF08;DMSP&#xFF09; &#x786B;&#x548C;&#x540C;&#x5316;&#x4EAE;&#x6C28;&#x9178;&#x7684;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x4E3B;&#x8981;&#x56E2;&#x4F53;&#x7684;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5438;&#x6536; DMSP S &#x7684;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x663E;&#x793A;&#x5F3A;&#x70C8;&#x7684;&#x5B63;&#x8282;&#x89C4;&#x5F8B;&#xFF0C;&#x7A33;&#x6B65;&#x589E;&#x81F3;&#x590F;&#x5B63; &#xFF08;23 + /-3%) &#x51AC;&#x5B63; (8 + /-5%)&#x3002;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x5B63;&#x8282;&#x6A21;&#x5F0F;&#x6307;&#x51FA;&#x7387;&#x7684; DMSP S &#x540C;&#x5316;&#x3002;DMSP S &#x6D88;&#x5316;&#x7EC6;&#x83CC; (16 + /-8%&#xFF09; &#x7684;&#x5E74;&#x5EA6;&#x5E73;&#x5747;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x4F4E;&#x4E8E;&#x76F8;&#x5E94;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x7684;&#x4EAE;&#x6C28;&#x9178;&#x5438;&#x6536;&#x7EC6;&#x80DE; (35 + /-16%&#xFF09;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x5E76;&#x4E0D;&#x662F;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5408;&#x6210;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EB3;&#x5165; DMSP S.&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5C0F;&#x5DEE;&#x5F02;&#x5F55;&#x5728;&#x590F;&#x5929;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x5E74; &#xFF08;Roseobacter &#x548C; SAR11&#xFF09; &#x7684; Alphaproteobacteria &#x548C; Gammaproteobacteria &#x7EC4;&#x7684;&#x6210;&#x5458;&#x5360;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7EC6;&#x83CC; DMSP S &#x5438;&#x6536;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3002;&#x6240;&#x6709;&#x4E3B;&#x8981;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7FA4;&#x4F53;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5728;&#x590F;&#x5B63;&#xFF0C;&#x540C;&#x5316; DMSP S &#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x7684;&#x589E;&#x5E45;&#x548C; DMSP S &#x540C;&#x5316;&#x7387;&#x7684;&#x589E;&#x52A0;&#xFF0C;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E00;&#x65F6;&#x671F;&#x4F5C;&#x51FA;&#x4E86;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F; P &#x6709;&#x9650;&#x6C34;&#x57DF;&#xFF0C;&#x6D53;&#x7F29;&#x4E0E; P + DMSP &#x9020;&#x6210;&#x523A;&#x6FC0;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5F02;&#x517B;&#x751F;&#x4EA7;&#x5AB2;&#x7F8E;&#xFF0C;&#x6216;&#x66F4;&#x9AD8;&#xFF0C;&#x4E0E; P + &#x8461;&#x8404;&#x7CD6;&#x5728;&#x590F;&#x5929;&#xFF0C;&#x800C;&#x5728;&#x5176;&#x4F59;&#x7684;&#x5E74; P + &#x8461;&#x8404;&#x7CD6;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x66F4;&#x5F3A;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#x3002;&#x8FD9;&#x5EFA;&#x8BAE; DMSP &#x66F4;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x5206;&#x5C42;&#x6696;&#x5B63; S &#x548C; C &#x6E90;&#x3002;&#x603B;&#x4E4B;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E; DMSP S &#x540C;&#x5316;&#x63A7;&#x5236;&#x7531; DMSP &#x8D21;&#x732E; S &#xFF08;&#x548C; C&#xFF09; &#x7684;&#x6765;&#x6E90;&#x800C;&#x4E0D;&#x662F;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x7684;&#x6D6E;&#x6E38;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7EC4;&#x6210;&#x3002;

&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178;&#x786B;&#x548C;&#x4EAE;&#x6C28;&#x9178;&#x540C;&#x5316;&#x5728;&#x6CBF;&#x6D77;&#x7684; NW Mediterranean &#x4E2D;&#x7684;&#x6D6E;&#x6E38;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x5E74;&#x5EA6;&#x5468;&#x671F;&#x3002;

The contribution of major phylogenetic groups to heterotrophic bacteria assimilating sulfur from dissolved dimethylsulfoniopropionate (DMSP) and assimilating leucine was analysed in surface seawaters from Blanes Bay (NW Mediterranean) over an annual study between March 2003 and April 2004. The percentage of bacteria assimilating DMSP-S showed a strong seasonal pattern, with a steady increase from winter (8 +/- 5%) to summer (23 +/- 3%). The same seasonal pattern was observed for the rate of DMSP-S assimilation. The annual average percentage of DMSP-S-assimilating bacteria (16 +/- 8%) was lower than the corresponding percentage of leucine-assimilating cells (35 +/- 16%), suggesting that not all bacteria synthesizing protein incorporated DMSP-S. Smaller differences between both percentages were recorded in summer. Members of the Alphaproteobacteria (Roseobacter and SAR11) and Gammaproteobacteria groups accounted for most of bacterial DMSP-S-assimilating cells over the year. All major bacterial groups showed an increase of the percentage of cells assimilating DMSP-S during summer, and contributed to the increase of the DMSP-S assimilation rate in this period. In these primarily P-limited waters, enrichment with P + DMSP resulted in a stimulation of bacterial heterotrophic production comparable to, or higher than, that with P + glucose in summer, while during the rest of the year P + glucose induced a stronger response. This suggested that DMSP was more important a S and C source for bacteria in the warm stratified season. Overall, our results suggest that DMSP-S assimilation is controlled by the contribution of DMSP to S (and C) sources rather than by the phylogenetic composition of the bacterioplankton.

An annual cycle of dimethylsulfoniopropionate-sulfur and leucine assimilating bacterioplankton in the coastal NW Mediterranean.

La contribution des grands groupes phylog&eacute;n&eacute;tiques de bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes assimilation de soufre de dissous dim&eacute;thylsulfoniopropionate (DMSP) et assimilant le leucine a &eacute;t&eacute; analys&eacute;e dans les eaux de surface de Blanes Bay (NW M&eacute;diterran&eacute;e) au cours d&#39;une &eacute;tude annuelle entre mars 2003 et avril 2004. Le pourcentage de bact&eacute;ries assimilant DMSP-S ont montr&eacute; un fort profil saisonnier, avec une augmentation constante de l&#39;hiver (8 +/-5 %) &agrave; l&#39;&eacute;t&eacute; (23 &plusmn; 3 %). La m&ecirc;me tendance saisonni&egrave;re a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e pour le taux d&#39;assimilation du DMSP-S. Le pourcentage moyen annuel de DMSP-S-assimilation des bact&eacute;ries (16 +/-8 %) &eacute;tait plus faible que le pourcentage correspondant de leucine-assimilation des cellules (35 &plusmn; 16 %), ce qui sugg&egrave;re que pas toutes les bact&eacute;ries synth&eacute;tisant les prot&eacute;ines incorpor&eacute;es DMSP-S. Diff&eacute;rences entre les deux pourcentages ont &eacute;t&eacute; enregistr&eacute;s en &eacute;t&eacute;. Membres des groupes Gammaproteobacteria et Alphaproteobacteria (catalyser et SAR11) repr&eacute;sentaient pour la plupart des cellules bact&eacute;riennes DMSP-S-assimilation au cours de l&#39;ann&eacute;e. Tous les grands groupes bact&eacute;riens ont montr&eacute; une augmentation du pourcentage de cellules assimilant DMSP-S pendant l&#39;&eacute;t&eacute; et a contribu&eacute; &agrave; l&#39;augmentation du taux d&#39;assimilation DMSP-S au cours de cette p&eacute;riode. Dans ces P limit&eacute;e principalement eaux, enrichissement avec P + DMSP a r&eacute;sult&eacute; en une stimulation de la production bact&eacute;rienne h&eacute;t&eacute;rotrophe comparable &agrave;, ou sup&eacute;rieur, avec P + glucose en &eacute;t&eacute;, tandis que le reste de l&#39;ann&eacute;e P + glucose induit une r&eacute;ponse plus forte. Cela sugg&egrave;re que le DMSP &eacute;tait plus importante source S et C pour les bact&eacute;ries pendant la saison chaude de stratifi&eacute;. Dans l&#39;ensemble, nos r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que l&#39;assimilation du DMSP-S est contr&ocirc;l&eacute;e par la contribution du DMSP aux sources S (et C) plut&ocirc;t que par la composition phylog&eacute;n&eacute;tique du bact&eacute;rioplancton.

Un cycle annuel du dim&eacute;thylsulfoniopropionate-soufre et leucine assimilant bact&eacute;rioplancton en M&eacute;diterran&eacute;e NW c&ocirc;ti&egrave;res.

Der Beitrag der phylogenetischen Hauptgruppen zu heterotrophe Bakterien assimilieren Schwefel aus gel&ouml;sten Dimethylsulfoniumpropionats (DMSP) und assimilieren Leucin wurde in Oberfl&auml;che Seewasser von Blanes Bay (NW Mittelmeer) &uuml;ber eine j&auml;hrliche Studie von M&auml;rz 2003 bis April 2004 analysiert. Der Anteil der Bakterien assimilieren DMSP-S zeigte ein starkes saisonale Muster, mit eine stetige Zunahme von Winter (8 +/-5 %), Sommer (23 +/-3 %). Das gleiche saisonale Muster wurde f&uuml;r die Rate der DMSP-S Assimilation beobachtet. Die j&auml;hrliche durchschnittliche prozentuale DMSP-S-assimilieren Bakterien (16 +/-8 %) lag der entsprechende Prozentsatz der Leucin-assimilieren Zellen (35 +/-16 %), was darauf hindeutet, dass nicht alle Bakterien, die Synthese von Protein DMSP-S. aufgenommen Kleinere Unterschiede zwischen den beiden Prozents&auml;tze wurden im Sommer aufgenommen. Mitglieder der Alphaproteobacteria (Roseobacter und SAR11) und Gammaproteobacteria Gruppen entfielen die meisten Bakterienzellen DMSP-S-Assimilation im Jahr. Alle wichtige bakterielle Gruppen zeigte eine Steigerung des Prozentsatzes der Zellen assimilieren DMSP-S im Sommer, und trugen zu diesem Anstieg der DMSP-S Assimilation Rate in diesem Zeitraum. In diesen Gew&auml;sser in erster Linie P-begrenzte, Anreicherung mit P + DMSP f&uuml;hrte eine Stimulierung der bakteriellen heterotrophe Produktion vergleichbar oder h&ouml;her, mit P + Glukose im Sommer, w&auml;hrend im weiteren Verlauf des Jahres P + Glukose eine st&auml;rkere Reaktion induziert. Dies vorgeschlagen, dass DMSP wichtiger sei eine S und C-Quelle f&uuml;r Bakterien, die in der warmen Jahreszeit der geschichteten. Unseren Ergebnissen zufolge insgesamt DMSP-S Assimilation durch den Beitrag der DMSP S (und C) Quellen nicht durch die phylogenetische Zusammensetzung der Bacterioplankton gesteuert wird.

Einen j&auml;hrlichen Zyklus der Dimethylsulfoniumpropionats-Schwefel und Leucin assimilieren Bacterioplankton im Mittelmeer K&uuml;sten NW.

Il contributo dei principali gruppi filogenetici di batteri eterotrofi assimilare zolfo dal disciolto dimethylsulfoniopropionate (DMSP) e assimilando la leucina &egrave; stato analizzato in superficie acque di mare dalla baia di Blanes (NW Mediterranean) sopra uno studio annuo tra il marzo 2003 e aprile 2004. La percentuale di batteri assimilare DMSP-S ha mostrato un pattern stagionale forte, con un costante aumento dall&#39;inverno (8 + /-5%) di estate (23 + /-3%). Lo stesso modello stagionale &egrave; stato osservato per il tasso di assimilazione DMSP-S. La percentuale media annua di assimilare DMSP-S batteri (16 + 8%) &egrave; stata inferiore rispetto la corrispondente percentuale di cellule di assimilare leucina (35 + /-16%), suggerendo che non tutti i batteri sintetizzano proteine incorporato DMSP-S. Piccole differenze tra due percentuali sono state registrate in estate. Membri dei gruppi Gammaproteobacteria e Alphaproteobacteria (Roseobacter e SAR11) hanno rappresentato per la maggior parte delle cellule batteriche DMSP-S-assimilare nel corso dell&#39;anno. Tutti i principali gruppi batterici hanno mostrato un aumento della percentuale di cellule assimilare DMSP-S durante l&#39;estate e ha contribuito all&#39;aumento del tasso di assimilazione DMSP-S in questo periodo. In questi P-limitata principalmente acque, arricchimento con P + DMSP ha portato in una stimolazione della produzione eterotrofi batterica paragonabile a o superiore, che con P + glucosio in estate, mentre durante il resto dell&#39;anno P + glucosio indotta da una risposta pi&ugrave; forte. Questo ha suggerito che DMSP era pi&ugrave; importante una sorgente S e C per i batteri nella stagione calda stratificata. Nel complesso, i nostri risultati suggeriscono che assimilazione DMSP-S &egrave; controllato dal contributo del DMSP alle fonti S (e C), piuttosto che dalla composizione filogenetica della bacterioplankton.

Un ciclo annuale di dimethylsulfoniopropionate-zolfo e leucina assimilare bacterioplankton nel litorale mediterraneo NW.

&#x6EB6;&#x5B58;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8; &#xFF08;dmsp &#x885B;&#x661F;&#xFF09; &#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x786B;&#x9EC4;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x3068;&#x540C;&#x5316;&#x30ED;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x306E;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x3078;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x7CFB;&#x7D71;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x30D6;&#x30E9;&#x30CD;&#x30B9;&#x6E7E; &#xFF08;NW &#x5730;&#x4E2D;&#x6D77;&#xFF09; &#x304B;&#x3089;&#x63A1;&#x53D6;&#x3057;&#x305F;&#x8868;&#x9762;&#x6D77;&#x6C34;&#x306E;&#x5E74;&#x9593;&#x306E;&#x7814;&#x7A76; 2003 &#x5E74; 3 &#x6708;&#x3068; 2004 &#x5E74; 4 &#x6708;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x5206;&#x6790;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;DMSP S &#x8CC7;&#x5316;&#x6027;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x5F37;&#x3044;&#x5B63;&#x7BC0;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x51AC; &#xFF08;8 +/-5%) &#x304B;&#x3089;&#x590F; (23 &plusmn; 3%) &#x3078;&#x306E;&#x7740;&#x5B9F;&#x306A;&#x5897;&#x52A0;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x540C;&#x3058;&#x5B63;&#x7BC0;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E; DMSP S &#x540C;&#x5316;&#x7387;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;DMSP S &#x8CC7;&#x5316;&#x6027;&#x7D30;&#x83CC; (16 &plusmn; 8%) &#x306E;&#x5E74;&#x6B21;&#x5E73;&#x5747;&#x5272;&#x5408;&#x304C;&#x30ED;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x3092;&#x540C;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE; (35) &plusmn; 16% &#x306E;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x5272;&#x5408;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x4F4E;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x306A;&#x3044;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5408;&#x6210; DMSP S. &#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x306E;&#x5C0F;&#x3055;&#x3044;&#x76F8;&#x9055;&#x306F;&#x590F;&#x306B;&#x8A18;&#x9332;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Alphaproteobacteria &#xFF08;&#x4F7F;&#x3044;&#x5206;&#x3051;&#x3066;&#x3068; SAR11&#xFF09; &#x3068; Gammaproteobacteria &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC; DMSP S &#x8CC7;&#x5316;&#x6027;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3001;1 &#x5E74;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x3092;&#x5360;&#x3081;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x7D30;&#x83CC;&#x7FA4; DMSP S &#x590F;&#x306E;&#x9593;&#x3001;&#x540C;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x671F;&#x9593;&#x306E; DMSP S &#x540C;&#x5316;&#x7387;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x4E3B;&#x306B; P &#x9650;&#x5B9A;&#x6C34;&#x3001;P + DMSP &#x306B;&#x5339;&#x6575;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x751F;&#x7523;&#x306E;&#x523A;&#x6FC0;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x307E;&#x305F;&#x306F; P + &#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x590F;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x9AD8;&#x3044;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x5E74; P + &#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x6B8B;&#x308A;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x5F37;&#x3044;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8A98;&#x767A;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;DMSP &#x3088;&#x308A;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x6696;&#x304B;&#x3044;&#x6210;&#x5C64;&#x671F;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E; S &#x3068; C&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F; DMSP S &#x540C;&#x5316; DMSP &#x306E; S (&#x3068; C&#xFF09; &#x306E;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x7D44;&#x6210;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5236;&#x5FA1;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x304A;&#x52E7;&#x3081;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8;&#x786B;&#x9EC4;&#x3068;&#x6CBF;&#x5CB8;&#x306E; NW &#x5730;&#x4E2D;&#x6D77;&#x3067;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x30ED;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x306E;&#x5E74;&#x9593;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;&#x3002;

&#xC8FC;&#xC694; phylogenetic &#xADF8;&#xB8F9; &#xB179;&#xC544; dimethylsulfoniopropionate (DMSP)&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xD669;&#xC744; &#xB3D9;&#xD654;&#xC640; &#xC2E0; &#xB3D9;&#xD654; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xAE30;&#xC5EC; &#xBE14;&#xB791; &#xC2A4; &#xBCA0;&#xC774; (NW &#xC9C0;&#xC911;&#xD574;)&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xBA74; seawaters&#xC5D0; 2003 &#xB144; 3 &#xC6D4;&#xACFC; 4 &#xC6D4; 2004 &#xB144; &#xC0AC;&#xC774; &#xC5F0;&#xAC04; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. DMSP-S &#xB3D9;&#xD654; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xBE44;&#xC728; &#xACA8;&#xC6B8; (8 &plusmn; 5%)&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5EC;&#xB984; (23 &plusmn; 3%)&#xC758; &#xAFB8;&#xC900;&#xD55C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD568;&#xAED8; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xACC4;&#xC808; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. DMSP-S &#xB3D9;&#xD654;&#xC758; &#xC18D;&#xB3C4; &#xB300; &#xD55C; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xACC4;&#xC808; &#xD328;&#xD134; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. DMSP S &#xB3D9;&#xD654; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; (16 &plusmn; 8%)&#xC758; &#xC5F0;&#xAC04; &#xD3C9;&#xADE0; &#xBC31;&#xBD84;&#xC728;&#xC740; &#xC2E0; &#xB3D9;&#xD654; (35 &plusmn; 16%), &#xC140;&#xC758; &#xD574;&#xB2F9; &#xBE44;&#xC728; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB0AE;&#xC740; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD569;&#xC131; DMSP &#xBBF8; &#xD1B5;&#xD569; &#xC81C;&#xC548; &#xB450; &#xBE44;&#xC728; &#xAC04;&#xC758; &#xC791;&#xC740; &#xCC28;&#xC774; &#xC5EC;&#xB984;&#xC5D0; &#xAE30;&#xB85D; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. Alphaproteobacteria (Roseobacter &#xBC0F; SAR11) &#xBC0F; Gammaproteobacteria &#xADF8;&#xB8F9;&#xC758; &#xBA64;&#xBC84; 1 &#xB144;&#xAC04; &#xC138;&#xADE0; DMSP S &#xB3D9;&#xD654; &#xC140;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC744; &#xCC28;&#xC9C0; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC8FC;&#xC694; &#xC138;&#xADE0;&#xC131; &#xADF8;&#xB8F9; DMSP-S, &#xC5EC;&#xB984; &#xB3D9;&#xD654; &#xC140;&#xC758; &#xBE44;&#xC728;&#xC758; &#xC99D;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC8FC;&#xBA70;&#xC774; &#xAE30;&#xAC04; DMSP S &#xB3D9;&#xD654; &#xC18D;&#xB3C4;&#xC758; &#xC99D;&#xAC00;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xC5D0; &#xC8FC;&#xB85C; P &#xC81C;&#xD55C; &#xBC14;&#xB2E4;, P + DMSP &#xACB0;&#xACFC; &#xBE44;&#xAD50;, &#xC138;&#xADE0;&#xC131; heterotrophic &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC758; &#xC790;&#xADF9; &#xB610;&#xB294; P + &#xC5EC;&#xB984;&#xCCA0;&#xC5D0; &#xD3EC;&#xB3C4; &#xB2F9; &#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; &#xB354; &#xB192;&#xC740; &#xB18D;&#xCD95; &#xB144; P + &#xD3EC;&#xB3C4;&#xC758; &#xB098;&#xBA38;&#xC9C0; &#xAE30;&#xAC04; &#xB3D9;&#xC548; &#xAC15;&#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xC720;&#xB3C4; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548;. &#xC774; &#xC81C;&#xC548; DMSP&#xB294; &#xB354; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xCE35; &#xD654; &#xB530;&#xB73B;&#xD55C; &#xACC4;&#xC808;&#xC5D0;&#xB294; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; S&#xC640; C &#xC18C;&#xC2A4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; DMSP S &#xB3D9;&#xD654; S (&#xBC0F; C) &#xC18C;&#xC2A4; DMSP&#xC758; &#xAE30;&#xC5EC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; bacterioplankton&#xC758; phylogenetic &#xAD6C;&#xC131;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC81C;&#xC5B4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Dimethylsulfoniopropionate &#xD669; &#xC2E0; &#xB3D9;&#xD654; bacterioplankton &#xD574;&#xC548; NW &#xC9C0;&#xC911;&#xD574;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC5F0;&#xAC04; &#xC8FC;&#xAE30;.

La contribuci&oacute;n de los principales grupos filogen&eacute;ticos para bacterias heter&oacute;trofas asimilar azufre de dimethylsulfoniopropionate disuelto (DMSP) y asimilar leucina se analiz&oacute; en superficies aguas de mar de la bah&iacute;a de Blanes (NW Mediterr&aacute;neo) sobre un estudio anual entre marzo de 2003 y abril de 2004. El porcentaje de bacterias asimilando DMSP-S mostr&oacute; un fuerte patr&oacute;n estacional, con un aumento constante de invierno (8 +-5%) a verano (23 +-3%). Se observ&oacute; el mismo patr&oacute;n estacional para la tasa de asimilaci&oacute;n de la DMSP-S. El porcentaje promedio anual de bacterias DMSP-S-apropiaci&oacute;n (16 +-8%) fue menor que el correspondiente porcentaje de c&eacute;lulas asimilaci&oacute;n de la leucina (35 + /-16%), lo que sugiere que no todas las bacterias sintetizar prote&iacute;na incorporaron DMSP-S. En verano se registraron diferencias m&aacute;s peque&ntilde;as entre ambos porcentajes. Miembros del Alphaproteobacteria (Roseobacter y SAR11) y Gammaproteobacteria grupos representaron la mayor parte de las c&eacute;lulas bacterianas DMSP-S-apropiaci&oacute;n durante el a&ntilde;o. Todos los grupos principales de bacterianos mostraron un aumento del porcentaje de c&eacute;lulas asimilar DMSP-S durante el verano y contribuyeron al aumento de la tasa de asimilaci&oacute;n de DMSP-S en este per&iacute;odo. En &eacute;stos principalmente P limitada aguas, enriquecimiento con P + DMSP dio lugar a un est&iacute;mulo de la producci&oacute;n bacteriana de heter&oacute;trofos comparable a o superior, con P + glucosa en verano, mientras que durante el resto del a&ntilde;o P + glucosa indujo una respuesta m&aacute;s fuerte. Esto sugiere que el DMSP era m&aacute;s importante una fuente S y C para las bacterias en la estaci&oacute;n caliente de estratificado. En general, nuestros resultados sugieren que la asimilaci&oacute;n DMSP-S est&aacute; controlada por la contribuci&oacute;n de DMSP a fuentes S (y C) en lugar de la composici&oacute;n filogen&eacute;tica de la vertical.

Un ciclo anual de dimethylsulfoniopropionate-azufre y leucina asimilando vertical en el litoral Mediterr&aacute;neo de NW.

&#x653E;&#x7267;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BA4;&#x8FDB;&#x884C;&#x91CF;&#x5316;&#x786B;&#x540C;&#x5316;&#xFF0C;&#x76EE;&#x7684;&#x662F;&#x8349;&#x98DF;&#x52A8;&#x7269;&#x79CD;&#x9972;&#x5582;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178; &#xFF08;DMSP)-&#x5305;&#x542B; phytoplankter&#x3002;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E0E;&#x6EB6;&#x89E3; (35) S DMSP &#x65F6;, &#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x4E2D;&#x672A;&#x53D8;&#x5F62;&#x65E0;&#x83CC;&#x83CC;&#x682A;&#x7684;&#x7845;&#x85FB;&#x8BFA;&#x6C0F; pseudonana &#x63A5;&#x624B;&#x6DFB;&#x52A0;&#x653E;&#x5C04;&#x6027;&#x540C;&#x4F4D;&#x7D20;&#x7684; 60-95%&#xFF0C;&#x5E76;&#x79EF;&#x7D2F;&#x4E86;&#x5B83;&#x7684;&#x6587;&#x5316;&#x3002;&#x6C1F;&#x7684;&#x7845;&#x85FB;&#x7EC6;&#x80DE;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x730E;&#x7269;&#x5230;&#x5F02;&#x517B;&#x85FB; Oxyrrhis &#x6E38;&#x8247;&#x7801;&#x5934;&#x3002;&#x5728;&#x9ED1;&#x6697;&#x4E2D;&#x7684; 32 &#x5C0F;&#x65F6;&#x540E;, &#x5DF2;&#x64E6;&#x8FC7;&#x5E76;&#x6D88;&#x5316;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x730E;&#x7269;&#xFF0C;&#x53EA;&#x7559;&#x4E0B; radiolabelled O.&#x6E38;&#x8247;&#x7684;&#x653E;&#x7267;&#x74F6;&#x548C;&#x4ECE;&#x800C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684; DMSP &#x786B;&#x7531;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x4FDD;&#x7559;&#x7684;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x4F30;&#x8BA1;&#x3002;&#x968F;&#x540E;&#x964D;&#x6C34;&#x4E0E;&#x51B7;&#x4E09;&#x6C2F;&#x4E59;&#x9178; (TCA) &#x63D0;&#x4F9B; micrograzer &#x5927;&#x5206;&#x5B50;&#x6240;&#x540C;&#x5316;&#x7684;&#x7559;&#x5B58; DMSP S &#x7684;&#x5C0F;&#x6570;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x5728;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x4E0E;&#x6EB6;&#x89E3; (35) S-DMSP &#x53EA; (&#x6CA1;&#x6709;&#x730E;&#x7269;) &#x7684;&#x5E73;&#x884C;&#x5B75;&#x5316;&#xFF0C;O.&#x6E38;&#x8247;&#x7801;&#x5934; (&#x548C;&#x81EA;&#x5DF1;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;) &#x63A5;&#x624B;&#x6C1F;&#x7684;&#x57FA;&#x677F; osmotrophically &#x5230; 0.04 dpm cell(-1) &#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#xFF0C;&#x5E76;&#x90FD;&#x540C;&#x5316;&#x5927;&#x5206;&#x5B50;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x7EA0;&#x6B63;&#x653E;&#x7267; (35) S DMSP &#x540C;&#x5316;&#x4E3A; osmotrophic (35) S DMSP &#x540C;&#x5316;&#xFF0C;&#x5E76;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5B83;&#x4E0E;&#x6444;&#x53D6;&#x653E;&#x5C04;&#x6027;&#x540C;&#x4F4D;&#x7D20;&#xFF0C;&#x6444;&#x53D6; DMSP &#x786B;&#x4FDD;&#x7559;&#x548C;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x6240;&#x540C;&#x5316;&#x7684;&#x767E;&#x5206;&#x6BD4;&#x88AB;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E3A; 32 + /-4%&#x3002;&#x8FD9;&#x5C31;&#x662F;&#x730E;&#x7269;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x76F4;&#x63A5;&#x8BC1;&#x636E;&#x6444;&#x5165;&#x542B;&#x6709; DMSP &#x7684;&#x7528;&#x54C1;&#x7ED3;&#x6784;&#x786B;&#x8349;&#x98DF;&#x5BB6;&#x755C;&#x79CD;&#x4E0E;&#x91CF;&#x5316;&#x6B64;&#x540C;&#x5316;&#x4F9B;&#x5E94;&#x7684;&#x6444;&#x53D6; DMSP &#x4E09;&#x5206;&#x4E4B;&#x4E00;&#x3002;

&#x7531; Oxyrrhis marina &#x9972; 35S DMSP &#x6807;&#x7B7E;&#x7684;&#x730E;&#x7269;&#x7684;&#x786B;&#x540C;&#x5316;&#x3002;

A laboratory grazing experiment was conducted with the aim of quantifying the sulfur assimilation by a herbivore protist feeding on a dimethylsulfoniopropionate (DMSP)-containing phytoplankter. When supplied with dissolved (35)S-DMSP, cultures of an axenic strain of the diatom Thalassiosira pseudonana took up 60-95% of the added radioisotope and accumulated it untransformed in the cytoplasm. Radiolabelled diatom cells were offered as prey to the heterotrophic dinoflagellate Oxyrrhis marina. After 32 h in the dark, all the prey had been grazed and digested, leaving only radiolabelled O. marina in the grazing bottles and thus providing an estimate of the percentage of DMSP-sulfur retained by the predator. Subsequent precipitation with cold trichloroacetic acid (TCA) provided the fraction of retained DMSP-S that had been assimilated into the micrograzer macromolecules. In parallel incubations with predator and dissolved (35)S-DMSP only (no prey), O. marina (and their closely associated bacteria) took up the radiolabelled substrate osmotrophically to an activity of 0.04 dpm cell(-1) and assimilated it all into macromolecules. By correcting grazing (35)S-DMSP assimilation for osmotrophic (35)S-DMSP assimilation, and comparing it with the ingested radioisotope, the percentage of ingested DMSP-sulfur retained and assimilated by the predator was determined to be 32 +/- 4%. This is the first study that provides direct evidence that ingestion of a DMSP-containing prey supplies structural sulfur to a herbivore protist and that quantifies this assimilative supply at one-third of ingested DMSP.

Sulfur assimilation by Oxyrrhis marina feeding on a 35S-DMSP-labelled prey.

Un laboratoire d&#39;exp&eacute;rimentation de p&acirc;turage a &eacute;t&eacute; men&eacute; dans le but de quantifier l&#39;assimilation de soufre par un cili&eacute; herbivore, se nourrissant un dim&eacute;thylsulfoniopropionate (DMSP)-contenant les auteurs. Lorsqu&#39;ils sont sous dissous (35) S-DMSP, cultures d&#39;une souche ax&eacute;nique de la diatom&eacute;e Thalassiosira pseudonana a pris 60 &agrave; 95 % du radio-isotope ajout&eacute; et accumul&eacute; il untransformed dans le cytoplasme. Cellules de diatom&eacute;es radiomarqu&eacute; &eacute;taient offerts en proie &agrave; la marina de Oxyrrhis dinoflagell&eacute; h&eacute;t&eacute;rotrophe. Apr&egrave;s 32 h dans le noir, toutes les proies ont &eacute;t&eacute; brout&eacute;es et dig&eacute;r&eacute;, laissant seulement radiomarqu&eacute;s o. marina dans le p&acirc;turage des bouteilles et ainsi fournir une estimation du pourcentage de DMSP-soufre conserv&eacute;e par le pr&eacute;dateur. Pr&eacute;cipitation subs&eacute;quente avec le froid l&#39;acide trichlorac&eacute;tique (TCA) a fourni la fraction retenue DMSP-s qui avaient &eacute;t&eacute; assimil&eacute;es dans les macromol&eacute;cules de micrograzer. En parall&egrave;le d&#39;incubation avec le pr&eacute;dateur et dissous (35) S-DMSP uniquement (pas de proies), o. marina (et leurs bact&eacute;ries &eacute;troitement associ&eacute;es) a repris l&#39;osmotrophically de substrat radiomarqu&eacute; &agrave; une activit&eacute; de 0,04 dpm cell(-1) et il assimil&eacute; tout dans les macromol&eacute;cules. En rectifiant le p&acirc;turage assimilation de S-DMSP (35) (35) assimilation de DMSP-S osmotrophic et en le comparant avec le radio-isotope ing&eacute;r&eacute;, le pourcentage d&#39;ing&eacute;r&eacute; DMSP-soufre conserv&eacute;e et assimil&eacute; par le pr&eacute;dateur a &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute; 32 &plusmn; 4 %. Il s&#39;agit de la premi&egrave;re &eacute;tude qui fournit une preuve directe que l&#39;ingestion d&#39;une proie contenant du DMSP fournitures soufre structurel &agrave; un cili&eacute; herbivore et qui quantifie cette assimilation offre au tiers du DMSP ing&eacute;r&eacute;.

Assimilation de soufre par Oxyrrhis marina nourrissent une proie marqu&eacute; au 35 s-DMSP.

Ein Labor Beweidung Experiment wurde durchgef&uuml;hrt mit dem Ziel der Quantifizierung der Schwefel-Assimilation durch ein Pflanzenfresser Protisten F&uuml;tterung auf eine Dimethylsulfoniumpropionats (DMSP)-mit Phytoplankter. Wenn mit gel&ouml;stem (35) S-DMSP, untransformed Kulturen ein axenic Stamm um die Kieselalgen Thalassiosira Pseudonana 60-95 % der zus&auml;tzlichen Radioisotop nahm und es akkumuliert im Zytoplasma. Kieselalgen radioaktiv markierten Zellen wurden als Beute in die heterotropher Dinoflagellaten Oxyrrhis Marina angeboten. Nach 32 h im Dunkeln die Beute streifte und verdaut worden war, verlassen nur radioaktiv markierter O. Marina in der Beweidung Flaschen und so f&uuml;r eine Sch&auml;tzung des Prozentsatzes der DMSP-Schwefel vom R&auml;uber beibehalten. Nachfolgende Ausf&auml;llung mit kalten Trichloressigs&auml;ure (TCA) zur Verf&uuml;gung gestellt des Bruchs von zur&uuml;ckbehaltenen DMSP-S, die der Micrograzer Makromolek&uuml;le assimiliert worden war. In parallelen Inkubationen mit Predator und gel&ouml;sten (35) S-DMSP nur (keine Beute) O. Marina (und ihre eng Bakterien) nahm die radioaktiv markierten Substrat-Osmotrophically zu einer Aktivit&auml;t von 0,04 Dpm cell(-1) und assimiliert es alle in Makromolek&uuml;len. Durch Beweidung (35) S-DMSP-Assimilation f&uuml;r Osmotrophic (35) S-DMSP Assimilation zu korrigieren, und den Vergleich mit den aufgenommenen Radioisotop, war der Anteil der aufgenommenen DMSP-Schwefel beibehalten und assimiliert vom R&auml;uber entschlossen, 32 +/-4 %. Dies ist die erste Studie, die erm&ouml;glicht, dass direkte Beweise, dass Einnahme von DMSP-haltiger Beute strukturelle Schwefel ein Pflanzenfresser Protisten und liefert diese assimilative Versorgung bei einem Drittel der aufgenommenen DMSP quantifiziert.

Schwefel-Assimilation von Oxyrrhis Marina F&uuml;tterung auf eine Beute 35S-DMSP-gekennzeichnet.

Un laboratorio di pascolo esperimento &egrave; stato condotto con lo scopo di quantificare l&#39;assimilazione dello zolfo di un protista erbivoro, nutrendosi di un dimethylsulfoniopropionate (DMSP)-contenente phytoplankter. Quando fornito con disciolto (35) S-DMSP, culture di un ceppo sono di diatomee Phaeodactylum tricornutum ha preso il 60-95% del radioisotopo aggiunto e accumulato esso essendo nel citoplasma. Diatomee radiomarcata cellule sono stati offerti come preda Oxyrrhis Marina Dinoflagellata eterotrofi. Dopo 32 ore al buio, tutta la preda era stata sfiorata e digerita, lasciando solo radiomarcata o. marina nel pascolo bottiglie e fornendo cos&igrave; una stima della percentuale di DMSP-zolfo trattenuto da predatore. Successiva precipitazione con freddo acido tricloroacetico (TCA) fornito la frazione trattenuta DMSP-s che era stata assimilata in macromolecole micrograzer. In parallele incubazioni con predator e disciolto (35) S-DMSP solo (nessuna preda), o. marina (e loro batteri strettamente associati) ha preso il osmotrophically radiomarcata substrato ad un&#39;attivit&agrave; di 0,04 dpm cell(-1) e assimilati e tutte le macromolecole. Correggendo pascolo assimilazione S-DMSP (35) per osmotrophic (35) assimilazione S-DMSP, e confrontarlo con il radioisotopo ingerito, la percentuale di ingerito DMSP-zolfo mantenuto e assimilato da predatore era determinata a essere 32 &plusmn; 4%. Questo &egrave; il primo studio che fornisce la prova diretta che l&#39;ingestione di una preda DMSP-contenente rifornimenti zolfo strutturale di un protista erbivoro e che quantifica questa fornitura Assimilativo a un terzo del DMSP ingerito.

Assimilazione dello zolfo Oxyrrhis Marina di alimentazione su una preda 35S-DMSP-etichettati.

&#x653E;&#x7267;&#x5B9F;&#x9A13;&#x5BA4;&#x786B;&#x9EC4;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3092;&#x76EE;&#x6307;&#x3057;&#x3001;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30CA;&#x30FC;&#x30C8; &#xFF08;dmsp &#x885B;&#x661F;&#xFF09; &#x306B;&#x7D66;&#x990C;&#x8349;&#x98DF;&#x52D5;&#x7269;&#x539F;&#x751F;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5B9F;&#x65BD;&#x3055;&#x308C;&#x305F;-phytoplankter &#x3092;&#x542B;&#x307F;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6EB6;&#x5B58; (35) S DMSP &#x3067;&#x4F9B;&#x7D66;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3068;&#x304D;&#x3001;&#x6587;&#x5316;&#x73EA;&#x85FB; pseudonana &#x8FFD;&#x52A0;&#x306E;&#x30A2;&#x30A4;&#x30BD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E; 60-95 &#xFF05; &#x3092;&#x53D6;&#x308A;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3092;&#x84C4;&#x7A4D; Thalassiosira axenic &#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x306B; untransformed&#x3002;&#x653E;&#x5C04;&#x6027;&#x6A19;&#x8B58;&#x73EA;&#x85FB;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x6027;&#x6E26;&#x97AD;&#x6BDB;&#x85FB; Oxyrrhis &#x30DE;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CA;&#x306B;&#x7372;&#x7269;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;32 H &#x306E;&#x6697;&#x95C7;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x5F8C;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x7372;&#x7269;&#x3092;&#x304B;&#x3059;&#x3081;&#x3001;&#x6D88;&#x5316;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3001;&#x6B8B;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x307F; O. &#x30DE;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CA; &#x30DC;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x653E;&#x7267;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x3053;&#x3046;&#x3057;&#x3066; DMSP &#x786B;&#x9EC4;&#x306E;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x3092;&#x4FDD;&#x6301;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x306E;&#x63A8;&#x5B9A;&#x5024;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x5E38;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x51B7;&#x305F;&#x3044;&#x30C8;&#x30EA;&#x30AF;&#x30ED;&#x30ED;&#x9162;&#x9178; (TCA) &#x3068;&#x5F8C;&#x7D9A;&#x306E;&#x6C88;&#x6BBF;&#x7269; micrograzer &#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x306B;&#x540C;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x5270;&#x4F59; DMSP-S &#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E26;&#x5217;&#x306E;&#x5B75;&#x5316;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C7;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x6EB6;&#x5B58; (35) S-DMSP &#x306E;&#x307F; &#xFF08;&#x990C;&#xFF09; O. &#x30DE;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CA; &#xFF08;&#x3068;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5BC6;&#x63A5;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x7D30;&#x83CC;&#xFF09; &#x653E;&#x5C04;&#x6027;&#x6A19;&#x8B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x57FA;&#x677F; osmotrophically &#x30A2;&#x30C3;&#x30D7;&#x3092; 0.04 dpm cell(-1) &#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306B;&#x304B;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3057;&#x3001;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x306B;&#x540C;&#x5316;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Osmotrophic (35) S DMSP &#x540C;&#x5316;&#x3001;&#x653E;&#x7267; (35) S DMSP &#x540C;&#x5316;&#x3092;&#x8A02;&#x6B63;&#x3057;&#x3001;&#x6442;&#x53D6;&#x30A2;&#x30A4;&#x30BD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30D7;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&plusmn; 4% &#x306E; 32 &#x306B;&#x6442;&#x53D6;&#x306E; DMSP &#x786B;&#x9EC4;&#x4FDD;&#x6301;&#x3057;&#x3001;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x304C;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3053;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x4F9B;&#x7D66;&#x6442;&#x53D6; DMSP &#x306E; 3 &#x5206;&#x306E; 1 &#x3067; DMSP &#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x990C;&#x306E;&#x6442;&#x53D6;&#x69CB;&#x9020;&#x786B;&#x9EC4;&#x8349;&#x98DF;&#x52D5;&#x7269;&#x539F;&#x751F;&#x3068;&#x305D;&#x308C;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x7684;&#x306A;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x786B;&#x9EC4;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; 35S DMSP &#x6A19;&#x8B58;&#x306E;&#x7372;&#x7269;&#x306B;&#x7D66;&#x990C; Oxyrrhis &#x30DE;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CA;&#x3002;

&#xC2E4;&#xD5D8;&#xC2E4; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xBC29;&#xBAA9; &#xC720;&#xD669; &#xB3D9;&#xD654; &#xCE21;&#xC815;&#xC758; &#xBAA9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xCD08; &#xC2DD; &#xB3D9;&#xBB3C; &#xC6D0;&#xC0DD;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xBA39;&#xC774; dimethylsulfoniopropionate (DMSP)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2E4;&#xC2DC; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;-phytoplankter &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;. &#xB179;&#xC544; (35) S DMSP&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xC81C;&#xACF5; &#xB41C; Thalassiosira pseudonana &#xCD94;&#xAC00; &#xBC29;&#xC0AC;&#xC131;&#xC758; 60-95%&#xB97C; &#xCC28;&#xC9C0; &#xD558; &#xACE0; &#xADF8;&#xAC83;&#xC744; &#xCD95;&#xC801; &#xADDC;&#xC870;&#xB958;&#xC758; axenic &#xAE34;&#xC7A5;&#xC758; &#xBB38;&#xD654; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8;&#xC5D0; untransformed. Radiolabelled &#xADDC;&#xC870;&#xB958; &#xC140; heterotrophic dinoflagellate Oxyrrhis &#xB9C8;&#xB9AC;&#xB098;&#xB97C; &#xBA39;&#xC774;&#xB85C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC5B4;&#xB460; &#xC18D;&#xC5D0;&#xC11C; 32 h &#xD6C4; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xBA39;&#xC774; &#xD588;&#xB2E4; &#xC2A4;&#xCCD0; &#xD558; &#xACE0; &#xC18C;&#xD654;, &#xBCD1; &#xBC29;&#xBAA9; &#xBC0F; DMSP &#xD669; &#xC721; &#xC2DD; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC720;&#xC9C0; &#xBE44;&#xC728;&#xC758; &#xCD94;&#xC815;&#xCE58;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xC624; &#xB9C8;&#xB9AC;&#xB098; radiolabelled&#xB9CC; &#xB5A0;&#xB098;. &#xC774;&#xD6C4; &#xAC15; &#xC218; &#xCC2C; trichloroacetic &#xC0B0; (TCA)&#xC640; micrograzer &#xACE0;&#xBD84;&#xC790;&#xC5D0; &#xB3D9;&#xD654; &#xB41C; &#xD588;&#xB2E4; &#xC720;&#xC9C0; DMSP-S&#xC758; &#xBD84;&#xC218; &#xC81C;&#xACF5;. &#xD504;&#xB808;&#xB370;&#xD130;&#xC640; &#xB179;&#xC544; (35) S-DMSP&#xB9CC; (&#xBA39;&#xC774;) &#xBCD1;&#xB82C; &#xC678;&#xD53C; &#xC624; &#xB9C8;&#xB9AC;&#xB098; (&#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBC00;&#xC811; &#xD558; &#xAC8C; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;) 0.04 dpm cell(-1)&#xC758; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; radiolabelled &#xAE30;&#xD310; osmotrophically &#xCC28;&#xC9C0;&#xC640; &#xACE0;&#xBD84;&#xC790; &#xBAA8;&#xB450; &#xB3D9;&#xD654;. Osmotrophic (35) S DMSP &#xB3D9;&#xD654;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCD08; &#xC2DD; (35) S DMSP &#xB3D9;&#xD654; &#xC218;&#xC815; &#xC12D;&#xCDE8; &#xB3D9;&#xC704;&#xC640; &#xBE44;&#xAD50; &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368;, &#xC12D;&#xCDE8; DMSP &#xD669; &#xC720;&#xC9C0; &#xBC0F; &#xC721; &#xC2DD; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xB3D9;&#xD654; &#xBE44;&#xC728; 32 &plusmn; 4%&#xB97C; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xAC83;&#xC740; &#xC9C1;&#xC811;&#xC801;&#xC778; &#xC99D;&#xAC70; DMSP &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xBA39;&#xC774;&#xC758; &#xC12D;&#xCDE8; &#xACF5;&#xAE09; &#xAD6C;&#xC870; &#xD669; &#xCD08; &#xC2DD; &#xB3D9;&#xBB3C; &#xC6D0;&#xC0DD;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC744; &#xC218;&#xB7C9;&#xD654; &#xC12D;&#xCDE8; DMSP&#xC758; 3 &#xBD84;&#xC758; 1&#xC5D0;&#xC11C; assimilative &#xACF5;&#xAE09;&#xC774; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC774;&#xB2E4;.

Oxyrrhis &#xB9C8;&#xB9AC;&#xB098; 35S DMSP &#xC154; &#xC11C; &#xBA39;&#xC774;&#xC5D0; &#xBA39;&#xC774;&#xB85C; &#xC720;&#xD669; &#xB3D9;&#xD654;.

Un laboratorio de experimento de pastoreo se realiz&oacute; con el objetivo de cuantificar la asimilaci&oacute;n de azufre por un Protista herb&iacute;voro, aliment&aacute;ndose de una dimethylsulfoniopropionate (DMSP)-que contienen phytoplankter. Cuando se suministra con disuelto (35) S-DMSP, transformaciones cultivos de una cepa ax&eacute;nico de la diatomea Thalassiosira pseudonana tom&oacute; 60-95% del radiois&oacute;topo a&ntilde;adido y lo hab&iacute;a acumulado en el citoplasma. C&eacute;lulas de diatomeas radiomarcados fueron ofrecidas como presa a la marina de Oxyrrhis dinoflagelados heter&oacute;trofos. Despu&eacute;s de 32 h en la oscuridad, todos la presa hab&iacute;a sido pastoreada y digerida, s&oacute;lo dejando marcados radiactivamente o. marina en el pastoreo de botellas y as&iacute; proporcionar una estimaci&oacute;n del porcentaje de azufre DMSP retenido por el depredador. Precipitaci&oacute;n posterior con fr&iacute;o el &aacute;cido tricloroac&eacute;tico (TCA) proporcion&oacute; la fracci&oacute;n de retenidas DMSP-S que hab&iacute;a sido asimilado en las macromol&eacute;culas de micrograzer. En paralelas incubaciones con depredadores y disuelto (35) S-DMSP s&oacute;lo (sin presa), o. marina (y sus bacterias estrechamente) tomaron el sustrato radiomarcados osmotrophically a una actividad de 0,04 cell(-1) dpm y lo asimilaron en macromol&eacute;culas. Correcci&oacute;n de pastoreo asimilaci&oacute;n de S-DMSP (35) para la asimilaci&oacute;n de S-DMSP (35) osmotrophic, y compar&aacute;ndolo con el radiois&oacute;topo ingerido, se determin&oacute; el porcentaje de ingerido DMSP-azufre retenido y asimilado por el depredador que 32 +/-4%. Este es el primer estudio que proporciona evidencia directa de que la ingesti&oacute;n de una presa que contienen DMSP provee azufre estructural a un Protista herb&iacute;voro y cuantifica esta fuente asimilativa en un tercio de DMSP ingerido.

Asimilaci&oacute;n de azufre por marina Oxyrrhis aliment&aacute;ndose de una presa con etiqueta DMSP-35S.

&#x6D77;&#x6D0B; Roseobacter &#x6CBF;&#x88AD;&#x7684;&#x6210;&#x5458;&#x88AB;&#x5B9A;&#x6027;&#x4E3A;&#x751F;&#x6001;&#x901A;&#x624D;&#xFF0C;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x5728;&#x5C06;&#x660E;&#x786E;&#x7684;&#x751F;&#x6001;&#x4F5C;&#x7528;&#x548C;&#x751F;&#x7269;&#x5730;&#x7403;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x804C;&#x80FD;&#x5206;&#x914D;&#x7ED9;&#x5206;&#x7C7B;&#x5C06;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x4E3A;&#x4E86;&#x89E3;&#x51B3;&#x8FD9;&#x4E00;&#x95EE;&#x9898;&#xFF0C;32 Roseobacter &#x83CC;&#x682A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x4E2D;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7279;&#x5F81;&#x3001; &#x57FA;&#x56E0;&#x5E93;&#x5B58;&#x548C;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E09;&#x4E2A;&#x9884;&#x6D4B;&#x6846;&#x67B6;&#x7684;&#x4E2A;&#x522B;&#x57FA;&#x56E0;/&#x901A;&#x8DEF;&#x914D;&#x9001;&#x7684;&#x6A21;&#x5F0F;&#xFF1A; &#x4EB2;&#x7F18;&#x5173;&#x8054;&#x5EA6;&#x3001; &#x751F;&#x6D3B;&#x65B9;&#x5F0F;&#x6218;&#x7565;&#x548C;&#x73AF;&#x5883;&#x9694;&#x79BB;&#x7684;&#x8D77;&#x6E90;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6846;&#x67B6;&#xFF0C;&#x5305;&#x542B;&#x4E94;&#x4E2A;&#x6DF1;&#x5206;&#x652F; clades &#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x88AB;&#x7D22;&#x53D6;&#x7684;&#x4E32;&#x8054;&#x7684; 70 &#x4FDD;&#x5B88;&#x7684;&#x5355;&#x62F7;&#x8D1D;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6709;&#x70B9;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x60CA;&#x8BB6;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x6811;&#x62D3;&#x6251;&#x5E76;&#x4E0D;&#x7528;&#x4E8E;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7279;&#x5F81;&#x6216;&#x4E2A;&#x522B;&#x57FA;&#x56E0;/&#x901A;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x5206;&#x5E03;&#x683C;&#x5C40;&#x7684;&#x6700;&#x4F73;&#x6A21;&#x578B;&#x867D;&#x7136;&#x5B83;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x4E00;&#x4E9B;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x751F;&#x6D3B;&#x65B9;&#x5F0F;&#x6846;&#x67B6;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x5206;&#x7EC4;&#x5206;&#x79BB;&#x6839;&#x636E;&#x5F02;&#x3001; photoheterotrophy &#x6216; autotrophy&#xFF0C;&#x8BC1;&#x636E;&#x7684;&#x89E3;&#x91CA;&#x66F4;&#x591A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5728;&#x6B64;&#x6CBF;&#x88AD;&#x7684;&#x6C47;&#x8F91; &#x300B;&#x3002;&#x73AF;&#x5883;&#x6846;&#x67B6;&#x8584;&#x5F31;&#x7684;&#x9884;&#x6D4B;&#x80FD;&#x529B;&#xFF0C;&#x6574;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5185;&#x5BB9;&#x7684;&#x6BCF;&#x4E00;&#x682A;&#xFF0C;&#x4F46;&#x89E3;&#x91CA;&#x51E0;&#x4E2A;&#x4E2A;&#x522B;&#x57FA;&#x56E0;/&#x901A;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x90A3;&#x4E9B;&#x4E0E;&#x78F7;&#x91C7;&#x96C6;&#x3001; &#x8D8B;&#x5316;&#x6027;&#x548C;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x964D;&#x89E3;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x5206;&#x5E03;&#x3002;&#x5168;&#x7403;&#x6D77;&#x6D0B;&#x53D6;&#x6837;&#x5B8F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x4E2D;&#x7684;&#x88C5;&#x5378;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x72EC;&#x7ACB;&#x6838;&#x5B9E;&#x4E00;&#x4E9B; Roseobacter &#x57FA;&#x56E0;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x5168;&#x7403;&#x89C4;&#x6A21;&#x5730;&#x57DF;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3002;&#x6446;&#x8131;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x7ED3;&#x8BBA;&#x662F;&#x5B97;&#x65CF;&#x7684;&#x6210;&#x5458;&#x4E0D;&#x80FD;&#x8FDB;&#x51E0;&#x4E2A;&#x751F;&#x6001;&#x5206;&#x5316;&#x7C07;&#x8F7B;&#x677E;&#x6298;&#x53E0; &#xFF08;&#x5373;&#x6709;&#x51E0;&#x4E4E;&#x540C;&#x6837;&#x591A;&#x7684;&#x96C6;&#x7FA4;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x5206;&#x79BB;&#xFF09; &#xFF1B;&#x9884;&#x6D4B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5185;&#x5BB9;&#x7684;&#x6700;&#x5F3A;&#x6846;&#x67B6;&#x662F;&#x5BCC;&#x8425;&#x517B;&#x5316;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x4F46;&#x6CA1;&#x6709;&#x5355;&#x4E00;&#x7684;&#x6846;&#x67B6;&#x7ED9;&#x9C81;&#x68D2;&#x9884;&#x6D4B; &#xFF1B;&#x548C;&#x4EE5;&#x524D;&#x672A;&#x77E5;&#x7684;&#x540C;&#x6E90;&#x57FA;&#x56E0; H(2) &#x6C27;&#x5316;&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E; proteorhodopsin &#x7684; phototrophy&#x3001; &#x57FA;&#x4E8E; xanthorhodpsin &#x7684; phototrophy&#xFF0C;&#x548C; CO(2) &#x56FA;&#x5B9A;&#x7684;&#x6838;&#x916E;&#x7CD6;&#x5355;-1.5-&#x4E8C;&#x78F7;&#x9178;&#x7FA7;&#x5316;&#x9176;/&#x52A0;&#x6C27;&#x9176;&#x5F62;&#x5F0F; IC (&#x5149;&#x5408;&#x4F5C;&#x7528;) &#x6269;&#x5927;&#x80FD;&#x6E90;&#x548C;&#x78B3;&#x91C7;&#x96C6;&#x5728;&#x6B64;&#x975E;&#x5E38;&#x591A;&#x624D;&#x591A;&#x827A;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x6CBF;&#x88AD;&#x7684;&#x53EF;&#x80FD;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7279;&#x6027;&#x7684;&#x901A;&#x624D;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7EC6;&#x83CC;&#x6CBF;&#x88AD;&#x3002;

Members of the marine Roseobacter lineage have been characterized as ecological generalists, suggesting that there will be challenges in assigning well-delineated ecological roles and biogeochemical functions to the taxon. To address this issue, genome sequences of 32 Roseobacter isolates were analyzed for patterns in genome characteristics, gene inventory, and individual gene/pathway distribution using three predictive frameworks: phylogenetic relatedness, lifestyle strategy and environmental origin of the isolate. For the first framework, a phylogeny containing five deeply branching clades was obtained from a concatenation of 70 conserved single-copy genes. Somewhat surprisingly, phylogenetic tree topology was not the best model for organizing genome characteristics or distribution patterns of individual genes/pathways, although it provided some predictive power. The lifestyle framework, established by grouping isolates according to evidence for heterotrophy, photoheterotrophy or autotrophy, explained more of the gene repertoire in this lineage. The environment framework had a weak predictive power for the overall genome content of each strain, but explained the distribution of several individual genes/pathways, including those related to phosphorus acquisition, chemotaxis and aromatic compound degradation. Unassembled sequences in the Global Ocean Sampling metagenomic data independently verified this global-scale geographical signal in some Roseobacter genes. The primary findings emerging from this comparative genome analysis are that members of the lineage cannot be easily collapsed into just a few ecologically differentiated clusters (that is, there are almost as many clusters as isolates); the strongest framework for predicting genome content is trophic strategy, but no single framework gives robust predictions; and previously unknown homologs to genes for H(2) oxidation, proteorhodopsin-based phototrophy, xanthorhodpsin-based phototrophy, and CO(2) fixation by Form IC ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO) expand the possible mechanisms for energy and carbon acquisition in this remarkably versatile bacterial lineage.

Genome characteristics of a generalist marine bacterial lineage.

Les membres de la lign&#xE9;e marine Roseobacter ont &#xE9;t&#xE9; caract&#xE9;ris&#xE9;s comme des g&#xE9;n&#xE9;ralistes &#xE9;cologiques, ce qui sugg&#xE8;re qu&#x26;#39;il y aura des d&#xE9;fis dans l&#x26;#39;attribution des r&#xF4;les bien d&#xE9;limit&#xE9;s et fonctions &#xE9;cologiques biog&#xE9;ochimiques au taxon. Pour r&#xE9;soudre ce probl&#xE8;me, des s&#xE9;quences g&#xE9;nomiques des isolats Roseobacter 32 ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;s pour les mod&#xE8;les dans les caract&#xE9;ristiques du g&#xE9;nome, l&#x26;#39;inventaire des g&#xE8;nes, et personne g&#xE8;ne / voie de distribution en utilisant trois cadres pr&#xE9;dictifs: origine parent&#xE9; phylog&#xE9;n&#xE9;tique, la strat&#xE9;gie de mode de vie et l&#x26;#39;environnement de l&#x26;#39;isolat. Pour le premier cadre, une phylog&#xE9;nie contenant cinq clades profond&#xE9;ment branchement a &#xE9;t&#xE9; obtenue &#xE0; partir d&#x26;#39;une concat&#xE9;nation de 70 conserv&#xE9;es &#xE0; copie unique des g&#xE8;nes. Assez &#xE9;tonnamment, arbre phylog&#xE9;n&#xE9;tique topologie n&#x26;#39;&#xE9;tait pas le meilleur mod&#xE8;le pour les caract&#xE9;ristiques du g&#xE9;nome d&#x26;#39;organisation ou modes de distribution des g&#xE8;nes individuels et voies d&#x26;#39;acc&#xE8;s, m&#xEA;me si elle a fourni un certain pouvoir pr&#xE9;dictif. Le cadre de vie, cr&#xE9;&#xE9; par le regroupement des isolats selon de preuve pour h&#xE9;t&#xE9;rotrophie, photoh&#xE9;t&#xE9;rotrophie ou autotrophie, a expliqu&#xE9; plus du r&#xE9;pertoire de g&#xE8;nes dans cette lign&#xE9;e. Le cadre de l&#x26;#39;environnement a eu un faible pouvoir pr&#xE9;dictif de la teneur globale du g&#xE9;nome de chaque souche, mais il a expliqu&#xE9; la distribution de plusieurs g&#xE8;nes individuels et voies d&#x26;#39;acc&#xE8;s, y compris celles li&#xE9;es &#xE0; l&#x26;#39;acquisition de phosphore, la chimiotaxie et la d&#xE9;gradation des compos&#xE9;s aromatiques. S&#xE9;quences non mont&#xE9;s dans les donn&#xE9;es de l&#x26;#39;oc&#xE9;an mondial m&#xE9;tag&#xE9;nomiques d&#x26;#39;&#xE9;chantillonnage v&#xE9;rifi&#xE9;es de fa&#xE7;on ind&#xE9;pendante ce signal &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle plan&#xE9;taire g&#xE9;ographique dans certains g&#xE8;nes Roseobacter. Les principales constatations qui ressortent de cette analyse comparative du g&#xE9;nome sont que les membres de la lign&#xE9;e ne peut pas &#xEA;tre facilement regroup&#xE9;es en seulement quelques grappes &#xE9;cologiquement diff&#xE9;renci&#xE9;es (c&#x26;#39;est &#xE0; dire qu&#x26;#39;il ya des grappes presque aussi nombreux que les isolats); la plus forte du cadre de pr&#xE9;vision contenu g&#xE9;nome est la strat&#xE9;gie trophique , mais pas de cadre unique donne des pr&#xE9;dictions robustes, et des homologues jusque-l&#xE0; inconnues &#xE0; des g&#xE8;nes de H (2) l&#x26;#39;oxydation, &#xE0; base de prot&#xE9;orhodopsine Phototrophie, xanthorhodpsin bas&#xE9;e sur Phototrophie, et de CO (2) la fixation par le formulaire IC ribulose-1 ,5-bisphosphate carboxylase / oxyg&#xE9;nase (Rubisco) de d&#xE9;velopper les m&#xE9;canismes possibles pour l&#x26;#39;&#xE9;nergie et l&#x26;#39;acquisition de carbone dans cette lign&#xE9;e remarquablement polyvalent bact&#xE9;rienne.

Caract&#xE9;ristiques du g&#xE9;nome d&#x26;#39;une lign&#xE9;e Marine g&#xE9;n&#xE9;raliste bact&#xE9;rienne

Mitglieder der marine Roseobacter-Linie waren gepr&auml;gt, als &ouml;kologische Generalisten, die darauf hindeutet, dass es Herausforderungen werden in einem Taxon gut &ouml;kologische Rollen und biogeochemische Funktionen zuweisen. Um dieses Problem zu beheben, wurden die Genomsequenzen von 32 Roseobacter-Isolaten nach Mustern im Genom Merkmale, Gen bestand und einzelne gen/Weg-Distribution mit drei vorausschauende Rahmenbedingungen analysiert: phylogenetische Verwandtschaft, Lebensstil-Strategie und umweltbedingte von Isolat. F&uuml;r den ersten Rahmen war eine Phylogenie, enth&auml;lt f&uuml;nf tief verzweigte Kladen aus einer Verkettung von 70 konservierten Single Copy-Genen bezogen. Etwas &uuml;berraschend, war phylogenetischen Baum-Topologie nicht das beste Modell f&uuml;r die Organisation von Genom Merkmale oder Verteilungsmuster der einzelnen Gene/Wege, obwohl es einige Vorhersagekraft bereitgestellt. Lebensstil Rahmen, Gruppierung Isolate nach Beweise f&uuml;r Heterotrophy, Photoheterotrophy oder Autotrophy, erkl&auml;rte mehr zum gen-Repertoire in dieser Linie. Umwelt Rahmen hatte eine schwache Vorhersagekraft f&uuml;r die Genom-Gesamtinhalt von jeder Sorte, aber erkl&auml;rt die Verteilung der mehrere einzelne Gene/Wege, einschlie&szlig;lich Phosphor-Akquisition, Chemotaxis und aromatische zusammengesetzte Verschlechterung. Unmontierter Sequenzen im globalen Ozean durchgef&uuml;hrte metagenomische Samplingdaten &uuml;berpr&uuml;ft unabh&auml;ngig dieses globalen Ma&szlig;stab geographische Signal in einigen Roseobacter-Genen. Die prim&auml;re Erkenntnisse aus diesem vergleichende Genomanalyse werden, dass Mitglieder der Linie k&ouml;nnen nicht leicht in wenigen &ouml;kologisch differenzierte Cluster reduziert werden (das hei&szlig;t, es gibt fast so viele Cluster als Isolate); st&auml;rksten Rahmen f&uuml;r die Vorhersage von Genom Inhalt trophische Strategie, aber keinen einziger Rahmen gibt zuverl&auml;ssige Vorhersagen; und bisher unbekannte UCP1 Genen H(2) Oxidation, Proteorhodopsin-basierte phototrophy, Xanthorhodpsin-basierte phototrophy und CO(2)-Fixierung durch Form IC Ribulose-1, 5-bisphosphat-Carboxylase/Oxygenase (RuBisCO) erweitern die m&ouml;glichen Mechanismen f&uuml;r die Energie- und CO2-Akquisition in dieser bemerkenswert vielseitige bakterieller Herkunft.

Genom-Merkmale einer Generalist marine bakterielle Linie.

Membri del lignaggio Roseobacter marino sono stati caratterizzati come ecologici generalisti, suggerendo che ci saranno sfide nell&#39;assegnare ruoli ecologici piccole e funzioni biogeochimiche del taxon. Per risolvere questo problema, sequenze di genoma di 32 Roseobacter isolati sono stati analizzati per i modelli in caratteristiche del genoma, gene inventario e distribuzione del gene/percorso individuale utilizzando tre quadri predittivi: parentela filogenetica, strategia di stile di vita e origine ambientale dell&#39;isolato. Per il primo quadro, un phylogeny contenente cinque cladi profondamente ramificazione &egrave; stato ottenuto da una concatenazione di 70 geni singola copia conservate. Abbastanza sorprendentemente, topologia albero filogenetico non era il modello migliore per organizzare le caratteristiche del genoma o modelli di distribuzione di singoli geni/percorsi, anche se ha fornito qualche potere predittivo. Il quadro di lifestyle, istituito dal raggruppamento degli isolati secondo prove per heterotrophy, photoheterotrophy o autotrofia, spiegato pi&ugrave; del repertorio gene in questo lignaggio. Il quadro di ambiente aveva un debole potere predittivo per il contenuto complessivo del genoma di ogni ceppo, ma la distribuzione di diversi singoli geni/percorsi, compresi quelli relativi all&#39;acquisizione di fosforo, chemiotassi e degradazione di composti aromatici, ha spiegato. Sequenze smontati nei dati di campionamento oceano globale metagenomica indipendentemente verificato questo segnale geografico su scala globale in alcuni geni Roseobacter. Primari risultati emergono da questa analisi comparativa del genoma sono che membri del lignaggio non possono essere facilmente compresso in pochi grappoli ecologicamente differenziate (che &egrave;, ci sono quasi come molti ammassi come isolati); il quadro pi&ugrave; forte per predire il contenuto del genoma &egrave; strategia trofica, ma nessun singolo quadro d&agrave; le previsioni affidabili; e in precedenza sconosciuti omologhi ai geni per l&#39;ossidazione del H(2), proteorhodopsin-based phototrophy, xanthorhodpsin-based phototrophy e mentre una fissazione di forma IC 1,5-Ribulosio-bisfosfato carbossilasi/ossigenasi (RuBisCO) espandere i possibili meccanismi per l&#39;acquisizione di energia e di carbonio in questo lignaggio batterico straordinariamente versatile.

Caratteristiche del genoma di un lignaggio batteriche marine generalista.

&#x6D77;&#x6D0B;Roseobacter&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x5206;&#x985E;&#x7FA4;&#x306B;&#x3088;&#x304F;&#x7DDA;&#x5F15;&#x304D;&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3068;&#x751F;&#x7269;&#x5730;&#x7403;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x306A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x308B;&#x969B;&#x306B;&#x8AB2;&#x984C;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3001;&#x751F;&#x614B;&#x5B66;&#x7684;&#x306A;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30E9;&#x30EA;&#x30B9;&#x30C8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x7279;&#x5FB4;&#x3065;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x554F;&#x984C;&#x3092;&#x89E3;&#x6C7A;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;32 Roseobacter&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x7279;&#x5FB4;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;3&#x306E;&#x4E88;&#x6E2C;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;/&#x7D4C;&#x8DEF;&#x5206;&#x5E03;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x767A;&#x751F;&#x7684;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3001;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D5;&#x30B9;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x6226;&#x7565;&#x3068;&#x74B0;&#x5883;&#x7531;&#x6765;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306F;&#x3001;5&#x6DF1;&#x304F;&#x5206;&#x5C90;&#x30AF;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C9;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306F;70&#x306B;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x9023;&#x7D50;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x4E88;&#x6E2C;&#x529B;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x306E;&#x3001;&#x3084;&#x3084;&#x9A5A;&#x304F;&#x3079;&#x304D;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x7CFB;&#x7D71;&#x6A39;&#x306E;&#x30C8;&#x30DD;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;/&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3084;&#x5206;&#x5E03;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x6574;&#x7406;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6700;&#x826F;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x3001;photoheterotrophy&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x72EC;&#x7ACB;&#x6804;&#x990A;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x5316;&#x5206;&#x96E2;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D5;&#x30B9;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30EC;&#x30D1;&#x30FC;&#x30C8;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x74B0;&#x5883;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x5404;&#x83CC;&#x682A;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30F3;&#x30C4;&#x306E;&#x5F31;&#x3044;&#x4E88;&#x6E2C;&#x529B;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x30EA;&#x30F3;&#x306E;&#x53D6;&#x5F97;&#x3001;&#x8D70;&#x5316;&#x6027;&#x3068;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x5206;&#x89E3;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;/&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x5206;&#x5E03;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#xB7;&#x30AA;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E3;&#x30F3;&#xB7;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x30E1;&#x30BF;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x7D44;&#x7ACB;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;Roseobacter&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x5730;&#x7403;&#x898F;&#x6A21;&#x306E;&#x5730;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x304B;&#x3089;&#x51FA;&#x3066;&#x304F;&#x308B;&#x4E3B;&#x306A;&#x6240;&#x898B;&#x306F;&#x3001;&#xFF08;&#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x3068;&#x307B;&#x307C;&#x540C;&#x3058;&#x304F;&#x3089;&#x3044;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x304C;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#xFF09;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x304C;&#x7C21;&#x5358;&#x306B;&#x308F;&#x305A;&#x304B;&#x306A;&#x751F;&#x614B;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x5206;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x306B;&#x307E;&#x3068;&#x3081;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5185;&#x5BB9;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5F37;&#x529B;&#x306A;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6804;&#x990A;&#x6226;&#x7565;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x5805;&#x7262;&#x306A;&#x4E88;&#x6E2C;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;H&#xFF08;2&#xFF09;&#x9178;&#x5316;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30ED;&#x30C9;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;phototrophy&#x3001;xanthorhodpsin&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;phototrophy&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306B;&#x3088;&#x308B;CO&#xFF08;2&#xFF09;&#x56FA;&#x5B9A;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x672A;&#x77E5;&#x306E;&#x76F8;&#x540C;&#x4F53;&#x3092;IC&#x30EA;&#x30D6;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;-1,5  - &#x30D3;&#x30B9;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x30AB;&#x30EB;&#x30DC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;/&#x30AA;&#x30AD;&#x30B7;&#x30B2;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#xFF08;&#x30EB;&#x30D3;&#x30B9;&#x30B3;&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x6C4E;&#x7528;&#x6027;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306B;&#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30FC;&#x3068;&#x70AD;&#x7D20;&#x53D6;&#x5F97;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x5C55;&#x958B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30E9;&#x30EA;&#x30B9;&#x30C8;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x7279;&#x5FB4;

&#xD574;&#xC591; Roseobacter &#xD608;&#xD1B5;&#xC758; &#xAD6C;&#xC131;&#xC6D0; &#xC0DD;&#xD0DC; &#xC804;&#xBB38;&#xAC00;&#xAC00; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; taxon well-delineated &#xC0DD;&#xD0DC; &#xC5ED;&#xD560; &#xBC0F; &#xD654;&#xD559;&#xC801; &#xAE30;&#xB2A5; &#xD560;&#xB2F9;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC804; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBB38;&#xC81C;&#xB97C; &#xD574;&#xACB0; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; 32 Roseobacter &#xACA9;&#xB9AC;&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAC8C;&#xB188; &#xD2B9;&#xC131;, &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC7AC;&#xACE0; &#xBC0F; &#xC138; &#xC608;&#xCE21; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;/&#xD1B5;&#xB85C; &#xBD84;&#xD3EC; &#xD328;&#xD134; &#xBD84;&#xC11D;: phylogenetic relatedness, &#xB77C;&#xC774;&#xD504; &#xC2A4;&#xD0C0;&#xC77C; &#xC804;&#xB7B5; &#xBC0F; &#xD658;&#xACBD; &#xCD9C;&#xCC98;&#xB97C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; 5 &#xAE4A;&#xC774; &#xBD84;&#xAE30; clades&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; 70 &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xB2E8;&#xC77C; &#xBCF5;&#xC0AC; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBE44;&#xB85D; &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xC57D;&#xAC04;&#xC758; &#xC608;&#xCE21; &#xB2A5;&#xB825;&#xC774; &#xC81C;&#xACF5; &#xB2E4;&#xC18C; &#xC758;&#xC678;&#xB85C;, phylogenetic &#xD2B8;&#xB9AC; &#xD1A0;&#xD3F4;&#xB85C;&#xC9C0; &#xAC8C;&#xB188; &#xD2B9;&#xC131; &#xB610;&#xB294; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;/&#xD1B5;&#xB85C;&#xC758; &#xBD84;&#xD3EC; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC815;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xCD5C;&#xACE0;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Heterotrophy, photoheterotrophy &#xB610;&#xB294; autotrophy, &#xC99D;&#xAC70;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xACA9;&#xB9AC; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC124;&#xB9BD; &#xB41C; &#xB77C;&#xC774;&#xD504; &#xC2A4;&#xD0C0;&#xC77C; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB294;&#xC774; &#xD608;&#xD1B5;&#xC5D0; &#xC9C4; &#xB808; &#xD37C; &#xD1A0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xC124;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD658;&#xACBD; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C; &#xAC01; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC778;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xCF58;&#xD150;&#xCE20;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC57D;&#xD55C; &#xC608;&#xCE21; &#xB2A5;&#xB825;&#xC774; &#xC788;&#xC5C8;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;/&#xD1B5;&#xB85C; &#xC778; &#xC218;&#xC9D1;&#xACFC; chemotaxis &#xBC29;&#xD5A5;&#xC871; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xC800;&#xD558;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C; &#xBD84;&#xD3EC;&#xB97C; &#xC124;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4;. &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xD574;&#xC591; &#xC0D8;&#xD50C;&#xB9C1; metagenomic &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC5C5;&#xCCB4; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC77C;&#xBD80; Roseobacter &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xC138;&#xACC4;&#xC801;&#xC778; &#xADDC;&#xBAA8; &#xC9C0;&#xB9AC;&#xC801; &#xC2E0;&#xD638;&#xAC00; &#xAC1C;&#xBCC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBE44;&#xAD50; &#xAC8C;&#xB188; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2E0;&#xD765; &#xC8FC;&#xC694; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xD608;&#xD1B5;&#xC758; &#xD68C;&#xC6D0; &#xBA87; &#xC0DD;&#xD0DC;&#xD559;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB85C; &#xC27D;&#xAC8C; &#xCD95;&#xC18C; &#xB420; &#xC218; &#xC5C6;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; (&#xC989;, &#xAC70;&#xAE30; &#xB9CE;&#xC740; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xACA9;&#xB9AC;&#xB85C;); &#xAC8C;&#xB188; &#xCF58;&#xD150;&#xCE20; &#xC608;&#xCE21;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB294; trophic &#xC804;&#xB7B5;, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC544;&#xBB34; &#xB2E8;&#xC77C; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C; &#xC81C;&#xACF5; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xC608;&#xCE21;; &#xBC0F; proteorhodopsin &#xAE30;&#xBC18;&#xC758; H(2) &#xC0B0;&#xD654;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C0;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; homologs phototrophy, xanthorhodpsin phototrophy, &#xBC0F; CO(2) &#xACE0;&#xC815; &#xD3FC; IC ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574;&#xC774; &#xD604;&#xC800; &#xD558; &#xAC8C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC138;&#xADE0;&#xC131; &#xD608;&#xD1B5;&#xC5D0; &#xC5D0;&#xB108;&#xC9C0;&#xC640; &#xD0C4;&#xC18C; &#xC218;&#xC9D1;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xD655;&#xC7A5;.

&#xC77C;&#xBC18; &#xD574;&#xC591; &#xC138;&#xADE0; &#xD608;&#xD1B5;&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xD2B9;&#xC131;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los miembros de la ascendencia marina Roseobacter se han caracterizado como generalistas ecol&#xF3;gicos, lo que sugiere que no habr&#xE1; problemas en la asignaci&#xF3;n de funciones bien delimitadas y funciones ecol&#xF3;gicas biogeoqu&#xED;micos para el tax&#xF3;n. Para solucionar este problema, las secuencias del genoma de 32 cepas Roseobacter se analizaron los patrones en las caracter&#xED;sticas del genoma, el inventario de genes y genes individuales / v&#xED;a de distribuci&#xF3;n con tres marcos de predicci&#xF3;n: el origen de las relaciones filogen&#xE9;ticas, la estrategia de estilo de vida y del medio ambiente de la cepa. Para el primer marco, una filogenia contiene cinco clados profundamente ramificaci&#xF3;n se obtuvo de una concatenaci&#xF3;n de 70 conservadas genes de copia &#xFA;nica. Sorprendentemente, el &#xE1;rbol filogen&#xE9;tico de topolog&#xED;a no era el mejor modelo para las caracter&#xED;sticas del genoma de la organizaci&#xF3;n o los patrones de distribuci&#xF3;n de genes individuales y v&#xED;as, a pesar de que proporcionan un poder de predicci&#xF3;n. El marco de vida, establecida mediante la agrupaci&#xF3;n de aislamientos de acuerdo con la evidencia de heterotrof&#xED;a, photoheterotrophy o autotrofia, explica m&#xE1;s del repertorio de genes en este linaje. El marco de medio ambiente tuvo un d&#xE9;bil poder de predicci&#xF3;n del contenido global del genoma de cada cepa, pero se explica la distribuci&#xF3;n de varios genes y v&#xED;as, incluidas las relacionadas con la adquisici&#xF3;n de f&#xF3;sforo, la quimiotaxis y la degradaci&#xF3;n del compuesto arom&#xE1;tico. Secuencias sin montar en los datos globales del oc&#xE9;ano metagen&#xF3;mica de muestreo verificada de manera independiente esta se&#xF1;al geogr&#xE1;fica a escala mundial en algunos genes Roseobacter. Las principales conclusiones que surgen de este an&#xE1;lisis comparativo del genoma es que los miembros del linaje no puede ser f&#xE1;cilmente se derrumb&#xF3; en tan s&#xF3;lo unos pocos grupos ecol&#xF3;gicos diferenciados (es decir, hay grupos casi tantos como los aislamientos), el mayor marco para predecir el contenido del genoma es la estrategia tr&#xF3;fica , pero no solo marco ofrece predicciones s&#xF3;lidas, y hom&#xF3;logos a los genes hasta ahora desconocidas para H (2) la oxidaci&#xF3;n, fototrof&#xED;a proteorodopsina basado en fototrof&#xED;a xanthorhodpsin basado, y el CO (2) la fijaci&#xF3;n por el formulario de CI ribulosa-1 ,5-bisfosfato carboxilasa / oxigenasa (Rubisco) ampliar los mecanismos posibles para la energ&#xED;a y la adquisici&#xF3;n de carbono en este linaje de bacterias muy vers&#xE1;til.

Caracter&#xED;sticas del genoma de un linaje Marina Generalista bacteriana

&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178; &#xFF08;DMSP&#xFF09; &#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x6765;&#x6E90;&#xFF0C;&#x51CF;&#x5C11;&#x7684;&#x786B;&#x548C;&#x78B3;&#x7684;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7FA4;&#x843D;&#xFF0C;(DMS) &#x6C14;&#x5019;&#x6D3B;&#x6027;&#x6C14;&#x4F53;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x7684;&#x524D;&#x4F53;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528; metatranscriptomic &#x6D4B;&#x5E8F;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x7684;&#x767E;&#x6155;&#x5927;&#x5927;&#x897F;&#x6D0B;&#x65F6;&#x95F4;&#x7CFB;&#x5217;&#x7814;&#x7A76; (&#x8759;&#x8760;) &#x7AD9;&#x548C; DMSP &#x77ED;&#x671F;&#x81F4;&#x5BCC;&#x65E0;&#x5730;&#x8868;&#x6C34;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7EC4;&#x5408; &#xFF08;25 nM &#x4E3A; 30 &#x5206;&#x949F;&#xFF09;&#x3002;303 143 &#x8BFB;&#x53D6;&#x7684;&#x5E73;&#x5747;&#x83B7;&#x5F97;&#x6BCF;&#x6B21;&#x6CBB;&#x7597;&#x4F7F;&#x7528; 454 &#x7126;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6280;&#x672F;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D; 51%&#x662F;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x7F16;&#x7801;&#x5E8F;&#x5217;&#x3002;&#x4ECE; Gammaproteobacteria &#x548C; Bacteroidetes &#x589E;&#x52A0; DMSP &#x52A0;&#x6CD5;&#x7684;&#x76F8;&#x5BF9;&#x4E30;&#x5EA6;&#x5374;&#x53D8;&#x5316;&#x4E0D;&#x5927;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6D6E;&#x6E38;&#x7EC6;&#x83CC;&#x8D21;&#x732E;&#x8A8A;&#x672C;&#x7FA4;&#x4F53;&#x5DF2;&#x77E5; DMSP &#x964D;&#x89E3;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;Roseobacter &#x548C; SAR11 &#x7684;&#x4F53;&#x5916;&#x57F9;&#x517B;&#x7684;&#x6210;&#x5458;&#x6E2F;&#x53E3;&#x3002;DMSP &#x589E;&#x52A0;&#x5BFC;&#x81F4;&#x6D53;&#x7F29;&#x8A8A;&#x672C;&#x652F;&#x6301;&#x5F02;&#x517B;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x548C;&#x67AF;&#x7AED;&#x7684;&#x90A3;&#x4E9B;&#x7F16;&#x7801;&#x4E0E;&#x5149;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x80FD;&#x6E90;&#x53D1;&#x7535;&#x3002;C3 &#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x964D;&#x89E3;&#x57FA;&#x56E0;&#x662F;&#x5927;&#x5927;&#x4EFB;&#x804C;&#x540E; DMSP &#x53E6;&#x5916;&#xFF0C;&#x53EF;&#x80FD;&#x53CD;&#x6620;&#x4EE3;&#x8C22;&#x7684; DMSP &#x7684; C3 &#x7EC4;&#x4EF6;&#x3002;&#x5C06;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8BB0;&#x5F55;&#x6620;&#x5C04;&#x5230;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x751F;&#x5316;&#x9014;&#x5F84;&#x8868;&#x793A; acetyl-CoA &#x548C;&#x9170; CoA &#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x5E38;&#x89C1;&#x7684;&#x4E09;&#x7FA7;&#x9178;&#x5FAA;&#x73AF;&#x5230;&#x6B64;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x5207;&#x5165;&#x70B9;&#x3002;&#x6781;&#x8D2B;&#x8425;&#x517B;&#x9A6C;&#x5C3E;&#x85FB;&#x6D77;&#x4E2D;&#x7684;&#x77ED;&#x65F6;&#x95F4;&#x5E27; (30 &#x5206;&#x949F;)&#xFF0C;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x4F7F;&#x7528; DMSP &#x7684;&#x78B3;&#x548C;&#x786B;&#x7684;&#x6765;&#x6E90;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6D77;&#x6D0B;&#x6D6E;&#x6E38;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x3002;

&#x5BBF;&#x4E3B;&#x5BCC;&#x542B;&#x4E8C;&#x7532;&#x57FA;&#x786B;&#x4E19;&#x9178;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7EC6;&#x83CC;&#x83CC;&#x7FA4;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) is an important source of reduced sulfur and carbon for marine microbial communities, as well as the precursor of the climate-active gas dimethylsulfide (DMS). In this study, we used metatranscriptomic sequencing to analyze gene expression profiles of a bacterial assemblage from surface waters at the Bermuda Atlantic Time-series Study (BATS) station with and without a short-term enrichment of DMSP (25â€‰nM for 30â€‰min). An average of 303â€‰143 reads were obtained per treatment using 454 pyrosequencing technology, of which 51% were potential protein-encoding sequences. Transcripts from Gammaproteobacteria and Bacteroidetes increased in relative abundance on DMSP addition, yet there was little change in the contribution of two bacterioplankton groups whose cultured members harbor known DMSP degradation genes, Roseobacter and SAR11. The DMSP addition led to an enrichment of transcripts supporting heterotrophic activity, and a depletion of those encoding light-related energy generation. Genes for the degradation of C3 compounds were significantly overrepresented after DMSP addition, likely reflecting the metabolism of the C3 component of DMSP. Mapping these transcripts to known biochemical pathways indicated that both acetyl-CoA and succinyl-CoA may be common entry points of this moiety into the tricarboxylic acid cycle. In a short time frame (30â€‰min) in the extremely oligotrophic Sargasso Sea, different gene expression patterns suggest the use of DMSP by a diversity of marine bacterioplankton as both carbon and sulfur sources.

Transcriptomic analysis of a marine bacterial community enriched with dimethylsulfoniopropionate.

Dim&#xE9;thylsulfoniopropionate (DMSP) est une source importante de soufre r&#xE9;duit et de carbone pour les communaut&#xE9;s microbiennes marines, de m&#xEA;me que le pr&#xE9;curseur de la dim&#xE9;thylsulfure climatique li&#xE9; aux gaz actif (DMS). Dans cette &#xE9;tude, nous avons utilis&#xE9; le s&#xE9;quen&#xE7;age m&#xE9;tatranscriptomiques pour analyser les profils d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique d&#x26;#39;un assemblage bact&#xE9;rienne des eaux de surface &#xE0; l&#x26;#39;Atlantique, aux Bermudes &#xE9;tude sur s&#xE9;rie chronologique (BATS) station avec et sans enrichissement &#xE0; court terme de DMSP (25 nM pendant 30 min). Une moyenne de 303 143 lectures ont &#xE9;t&#xE9; obtenus par traitement &#xE0; l&#x26;#39;aide la technologie 454 pyros&#xE9;quen&#xE7;age, dont 51% &#xE9;taient des potentiels codant une prot&#xE9;ine suites. Transcriptions de Gammaproteobacteria et Bacteroidetes augment&#xE9; en abondance relative plus DMSP, mais il y avait peu de changement dans la contribution de deux groupes dont les bact&#xE9;rioplancton culture membres h&#xE9;berger g&#xE8;nes connus de d&#xE9;gradation DMSP, Roseobacter et SAR11. L&#x26;#39;ajout DMSP conduit &#xE0; un enrichissement des transcriptions soutien &#xE0; l&#x26;#39;activit&#xE9; h&#xE9;t&#xE9;rotrophe, et un appauvrissement de la couche de ceux de production d&#x26;#39;&#xE9;nergie de codage de lumi&#xE8;re li&#xE9;e. Les g&#xE8;nes de la d&#xE9;gradation des compos&#xE9;s C3 ont &#xE9;t&#xE9; largement surrepr&#xE9;sent&#xE9;s apr&#xE8;s addition DMSP, ce qui refl&#xE8;te probablement le m&#xE9;tabolisme de la composante C3 de DMSP. La cartographie de ces transcriptions pour conna&#xEE;tre les voies biochimiques ont indiqu&#xE9; que les deux ac&#xE9;tyl-CoA et du succinyl-CoA peut &#xEA;tre des points d&#x26;#39;entr&#xE9;e communs de cette fraction dans le cycle de Krebs. Dans un court laps de temps (30 min) dans la mer des Sargasses extr&#xEA;mement oligotrophes, diff&#xE9;rents profils d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique sugg&#xE8;rent l&#x26;#39;utilisation du DMSP par une diversit&#xE9; du bact&#xE9;rioplancton marin en tant que sources de carbone et de soufre &#xE0; la fois.

Analyse du transcriptome d&#x26;#39;une communaut&#xE9; maritime bact&#xE9;rienne Enrichi en dim&#xE9;thylsulfoniopropionate

Dimethylsulfoniumpropionats (DMSP) ist eine wichtige Quelle f&uuml;r reduzierte Schwefel und Kohlenstoff f&uuml;r marine mikrobielle Gemeinschaften sowie der Vorl&auml;ufer von der Klima-aktiv-Gas-Dimethylsulfide (DMS). In dieser Studie verwendeten wir Metatranscriptomic Sequenzierung Gen-Ausdruck-Portraits von einer bakteriellen Gef&uuml;ge von Oberfl&auml;chengew&auml;ssern in der Bermuda Atlantic Zeitreihen zu studieren (FLEDERM&Auml;USE)-Station mit und ohne eine kurzfristige Bereicherung der DMSP analysieren (25 nM f&uuml;r 30 min). Durchschnittlich 303 143 mal gelesen wurden erzielt pro Behandlung mit 454 Pyrosequencing-Technologie, von denen 51 % waren potenzielle Protein-Codierung Sequenzen. Abschriften aus Gammaproteobacteria und Bacteroides erh&ouml;ht in relative H&auml;ufigkeit &uuml;ber DMSP-Zusatz, doch gab es kaum Ver&auml;nderungen in den Beitrag der beiden Bacterioplankton Gruppen deren kultivierten Mitglieder-Hafen DMSP Abbau Gene, Roseobacter und SAR11 bekannt. Der DMSP-Zusatz f&uuml;hrte zu eine Bereicherung der Transkripte heterotrophe Aktivit&auml;t und eine Entleerung dieser Codierung Licht-bezogene Energiegewinnung zu unterst&uuml;tzen. Gene beim Abbau des C3-Verbindungen waren nach DMSP hinaus wahrscheinlich reflektieren den Stoffwechsel der C3-Komponente der DMSP deutlich &uuml;berrepr&auml;sentiert. Zuordnung dieser Abschriften zu bekannten biochemischen Bahnen angedeutet, dass Acetyl-CoA und Succinyl-CoA gemeinsame Einstiegspunkte von dieser Gruppe in den Tricarboxylic S&auml;ure Zyklus sein k&ouml;nnen. In einem kurzen Zeitrahmen (30 min) in der extrem oligotrophen Sargassosee schlagen verschiedene Genausdruck Muster der DMSP-Nutzung durch eine Vielfalt von marine Bacterioplankton als Kohlenstoff und Schwefel Quellen.

Transcriptomic Analyse einer marine bakterielle Gemeinschaft mit Dimethylsulfoniumpropionats angereichert.

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) &egrave; un&#39;importante fonte di zolfo ridotto e carbonio per comunit&agrave; microbiche marine, cos&igrave; come il precursore del clima-active gas dimethylsulfide (DMS). In questo studio, abbiamo usato metatranscriptomic sequenziamento per analizzare i profili di espressione genica di un assemblaggio batterico da acque di superficie presso la stazione di Bermuda Atlantic Time-series studio (PIPISTRELLI) con e senza un arricchimento a breve termine del DMSP (25 nM per 30 min). Una media di 303 143 letture sono state ottenute per trattamento utilizzando la tecnologia pyrosequencing 454, di cui 51% erano potenziale proteina-codifica sequenze. Trascrizioni da Gammaproteobacteria e Bacteroidetes aumentato in abbondanza relativa aggiunta DMSP, eppure c&#39;era piccolo cambiamento nel contributo di bacterioplankton due gruppi di cui porto colta membri noti geni di degradazione DMSP, Roseobacter e SAR11. L&#39;aggiunta di DMSP ha portato ad un arricchimento delle trascrizioni sostenendo attivit&agrave; eterotrofi e un impoverimento di quelli codifica la generazione di energia luce-correlati. Geni per la degradazione di composti C3 sono stati significativamente sovrarappresentati dopo aggiunta DMSP, probabilmente riflettendo il metabolismo della componente C3 del DMSP. Mapping tra queste trascrizioni conosciute vie biochimiche indicato che sia acetil-CoA e succinil-CoA pu&ograve; essere comuni punti di ingresso di questo gruppo funzionale nel ciclo dell&#39;acido tricarbossilico. In un breve lasso di tempo (30 min) nel Mar dei Sargassi estremamente oligotrofe, modelli di espressione del gene differenti suggeriscono l&#39;utilizzo di DMSP da una diversit&agrave; di bacterioplankton marini come fonti sia carbonio e zolfo.

Approfondimento analisi di una comunit&agrave; batterica Marina arricchita con dimethylsulfoniopropionate.

&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30F3;&#x9178;&#xFF08;DMSP&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x6D77;&#x6D0B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7FA4;&#x96C6;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;&#x6C17;&#x5019;&#x6D3B;&#x6027;&#x30AC;&#x30B9;&#x306E;&#x786B;&#x5316;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#xFF08;DMS&#xFF09;&#x306E;&#x524D;&#x99C6;&#x4F53;&#x306E;&#x9084;&#x5143;&#x786B;&#x9EC4;&#x3068;&#x70AD;&#x7D20;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6E90;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;DMSP&#x306E;&#x77ED;&#x671F;&#x6FC3;&#x7E2E;&#xFF08;30&#x5206;&#x3001;25 nM&#xFF09;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x304D;&#x3068;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x306A;&#x3044;&#x30D0;&#x30DF;&#x30E5;&#x30FC;&#x30C0;&#x5927;&#x897F;&#x6D0B;&#x6642;&#x7CFB;&#x5217;&#x7814;&#x7A76;&#xFF08;BATS&#xFF09;&#x99C5;&#x3067;&#x5730;&#x8868;&#x6C34;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x7FA4;&#x96C6;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;metatranscriptomic&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002; 303 143&#x8AAD;&#x307F;&#x53D6;&#x308A;&#x306E;&#x5E73;&#x5747;&#x306F;51&#xFF05;&#x304C;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x914D;&#x5217;&#x305D;&#x306E;&#x3046;&#x3061;454&#x30D1;&#x30A4;&#x30ED;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6280;&#x8853;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6CBB;&#x7642;&#x3054;&#x3068;&#x306B;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x30AC;&#x30F3;&#x30DE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2;&#x3068;Bacteroidetes&#x304B;&#x3089;&#x8EE2;&#x5199;&#x7269;&#x306F;&#x3001;DMSP&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x4E0A;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x91CF;&#x304C;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x3001;&#x307E;&#x3060;&#x57F9;&#x990A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x304C;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;DMSP&#x5206;&#x89E3;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;Roseobacter&#x3068;SAR11&#x3092;&#x62B1;&#x3044;&#x3066;2 bacterioplankton&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x306F;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x5909;&#x5316;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; DMSP&#x306E;&#x6DFB;&#x52A0;&#x306F;&#x3001;&#x5F93;&#x5C5E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D3;&#x30C6;&#x30A3;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7B26;&#x53F7;&#x5316;&#x5149;&#x95A2;&#x9023;&#x306E;&#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30FC;&#x751F;&#x6210;&#x306E;&#x67AF;&#x6E07;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x3063;&#x305F;&#x3002; C3&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x5206;&#x89E3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x9AD8;&#x3044;DMSP&#x306E;C3&#x6210;&#x5206;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3057;&#x3066;&#x3001;DMSP&#x3092;&#x6DFB;&#x52A0;&#x3057;&#x305F;&#x5F8C;&#x4EE3;&#x8868;&#x8005;&#x306E;&#x591A;&#x904E;&#x304E;&#x308B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;-CoA&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B9;&#x30AF;&#x30B7;&#x30CB;&#x30EB;-CoA&#x30EC;&#x30C0;&#x30AF;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x304C;&#x30C8;&#x30EA;&#x30AB;&#x30EB;&#x30DC;&#x30F3;&#x9178;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x90E8;&#x5206;&#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x8CA7;&#x6804;&#x990A;&#x30B5;&#x30EB;&#x30AC;&#x30C3;&#x30BD;&#x30FC;&#x6D77;&#x3067;&#x77ED;&#x3044;&#x6642;&#x9593;&#x67A0;&#xFF08;30&#x5206;&#xFF09;&#x3067;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x70AD;&#x7D20;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x786B;&#x9EC4;&#x6E90;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6D77;&#x6D0B;bacterioplankton&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x306B;&#x3088;&#x308B;DMSP&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3092;&#x304A;&#x52E7;&#x3081;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30CB;&#x30AA;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D4;&#x30AA;&#x30F3;&#x9178;&#x3068;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7D30;&#x83CC;&#x7FA4;&#x96C6;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) &#xD574;&#xC591; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xCEE4;&#xBBA4;&#xB2C8;&#xD2F0;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD0C4;&#xC18C; &#xAC10;&#xC18C; &#xC720;&#xD669;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC18C;&#xC2A4; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xAE30;&#xD6C4; &#xD65C;&#xC131; &#xAC00;&#xC2A4; dimethylsulfide (&#xB514; &#xC5E0;&#xC5D0; &#xC2A4;)&#xC758; &#xC804;&#xC870; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xBC84;&#xBBA4;&#xB2E4; &#xB300;&#xC11C;&#xC591; &#xC2DC;&#xACC4;&#xC5F4; &#xACF5;&#xBD80; (&#xBC15;&#xC950;) &#xC5ED; &#xBC0F; DMSP &#xB2E8;&#xAE30; &#xB18D;&#xCD95; &#xBB3C; &#xD45C;&#xBA74;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138;&#xADE0;&#xC131; &#xC870;&#xB9BD;&#xC758; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C;&#xD544;&#xC744; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; metatranscriptomic &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; (25 30 &#xBD84; &#xB3D9;&#xC548; nM). 303 143 &#xC77D;&#xAE30; &#xD3C9;&#xADE0; &#xB2F9; &#xCE58;&#xB8CC;&#xB294; 51%&#xAC00; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; 454 pyrosequencing &#xAE30;&#xC220;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC00;&#xC838;&#xC628; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;. Gammaproteobacteria&#xC640; Bacteroidetes &#xB450; bacterioplankton&#xC758; &#xAE30;&#xC5EC;&#xC5D0; &#xC57D;&#xAC04;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654; &#xD588;&#xB2E4; &#xC544;&#xC9C1; DMSP &#xC774;&#xC678;&#xC5D0; &#xC0C1;&#xB300; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC99D;&#xAC00; &#xC131;&#xC801; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; DMSP &#xC800;&#xD558; &#xC720;&#xC804;&#xC790;, Roseobacter &#xBC0F; sar11&#xC758; &#xAD50;&#xC591;&#xB41C; &#xD68C;&#xC6D0; &#xD558;&#xBC84;&#xB97C; &#xADF8;&#xB8F9;&#xD654; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. DMSP &#xCD94;&#xAC00; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; heterotrophic &#xD65C;&#xB3D9; &#xBC0F; &#xC870;&#xBA85; &#xAD00;&#xB828; &#xC5D0;&#xB108;&#xC9C0; &#xC0DD;&#xC131; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xB4E4; &#xACE0;&#xAC08; &#xC9C0;&#xC6D0;&#xC758; &#xB18D;&#xCD95;&#xC744; &#xC774;&#xB04C;&#xC5C8;&#xB2E4;. C 3 &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC758; &#xC800;&#xD558;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD588;&#xB2E4; &#xD06C;&#xAC8C; overrepresented DMSP &#xCD94;&#xAC00; &#xD6C4; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; DMSP C3 &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xC758; &#xC2E0;&#xC9C4; &#xB300;&#xC0AC;&#xB97C; &#xBC18;&#xC601; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC0DD;&#xD654;&#xD559; &#xACBD;&#xB85C; &#xB9E4;&#xD551; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD2F8; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; succinyl CoA tricarboxylic &#xC0B0; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074;&#xB85C;&#xC774; moiety&#xC758; &#xACF5;&#xD1B5; &#xC9C4;&#xC785;&#xC810;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9E4;&#xC6B0; oligotrophic &#xC0AC;&#xB974;&#xAC00;&#xC18C; &#xBC14;&#xB2E4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9E7;&#xC740; &#xC2DC;&#xAC04; &#xD504;&#xB808;&#xC784; (30 &#xBD84;), &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xD604; &#xD328;&#xD134; &#xD0C4;&#xC18C;&#xC640; &#xC720;&#xD669; &#xC18C;&#xC2A4;&#xB85C; &#xD574;&#xC591; bacterioplankton&#xC758; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; DMSP &#xC0AC;&#xC6A9;&#xC744; &#xAD8C;&#xD574; &#xB4DC;&#xB9BD;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Dimethylsulfoniopropionate&#xC640; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xD574;&#xC591; &#xC138;&#xADE0; &#xC0AC;&#xD68C;&#xC758; Transcriptomic &#xBD84;&#xC11D;.

Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) es una fuente importante de azufre reducido y el carbono para las comunidades microbianas marinas, as&#xED; como el precursor del sulfuro de dimetilo del gas clim&#xE1;tico-activo (DMS). En este estudio, hemos utilizado la secuencia metatranscriptomic para analizar los perfiles de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica de un conjunto de bacterias de las aguas superficiales en el Atl&#xE1;ntico, las Bermudas de series de tiempo de estudio (BATS) la estaci&#xF3;n con y sin un enriquecimiento a corto plazo de DMSP (25 nM durante 30 min). Un promedio de 303 143 Lecturas fueron obtenidos por tratamiento utilizando la tecnolog&#xED;a de pirosecuenciaci&#xF3;n 454, de los cuales 51% eran posibles secuencias que codifican prote&#xED;nas. Las transcripciones de Gammaproteobacteria y Bacteroidetes aumento en la abundancia relativa en la adici&#xF3;n de DMSP, sin embargo, hubo pocos cambios en la contribuci&#xF3;n de los dos grupos, cuyos miembros bacterioplancton culta albergar genes conocidos DMSP degradaci&#xF3;n, Roseobacter y SAR11. La adici&#xF3;n DMSP dio lugar a un enriquecimiento de las transcripciones de apoyo a la actividad heterotr&#xF3;fica, y una disminuci&#xF3;n de la generaci&#xF3;n de los que la codificaci&#xF3;n energ&#xED;a de la luz relacionada. Los genes para la degradaci&#xF3;n de compuestos C3 fueron significativamente sobrerrepresentados despu&#xE9;s de la adici&#xF3;n de DMSP, reflejando probablemente el metabolismo del componente C3 del DMSP. Cartograf&#xED;a de estas transcripciones de las v&#xED;as bioqu&#xED;micas conocidas indicaron que tanto la acetil-CoA y succinil-CoA pueden ser puntos de entrada comunes de esta fracci&#xF3;n en el ciclo del &#xE1;cido tricarbox&#xED;lico. En un corto per&#xED;odo de tiempo (30 min) en el Mar de los Sargazos muy oligotr&#xF3;ficas, diferentes patrones de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica sugieren el uso de la DMSP por la diversidad del bacterioplancton marino tanto de fuentes de carbono y azufre.

An&#xE1;lisis transcript&#xF3;mico de una comunidad bacteriana marina enriquecida con Dimethylsulfoniopropionate

&#x6709;&#x5927;&#x91CF;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x8BC1;&#x660E;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x5728; dimethylsulphoniopropionate &#xFF08;DMSP&#xFF09; &#x4F7F;&#x7528;&#x7387;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x51CF;&#x5C11;&#x786B;&#x7684;&#x6765;&#x6E90;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x53F6;&#x7EFF;&#x7D20;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x53EA;&#x662F;&#x5728;&#x6700;&#x8FD1;&#x6240;&#x8FF0;&#xFF0C;&#x4E86;&#x89E3;&#x751A;&#x5C11;&#x5176;&#x8D21;&#x732E; DMSP &#x6D88;&#x8D39;&#x548C;&#x8C03;&#x5236;&#x7684;&#x9633;&#x5149;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x6F5C;&#x529B;&#x3002;&#x5728;&#x5C1D;&#x8BD5;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x4E0E;&#x5FAE;&#x5FAE;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269; osmoheterotrophic &#x5438;&#x6536;&#x7684; DMSP &#x786B;&#x66B4;&#x9732;&#x5728;&#x81EA;&#x7136;&#x5149;&#x7167;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#x7684;&#x76F8;&#x5BF9;&#x5B9A;&#x91CF;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5B75;&#x5316;&#x897F;&#x5317;&#x5730;&#x4E2D;&#x6D77;&#x6C34;&#x57DF;&#x4E0B;&#x5404;&#x79CD;&#x5149;&#x5B66;&#x8FC7;&#x6EE4;&#x5668;&#x548C;&#x4F7F;&#x7528;&#x5927;&#x5BB9;&#x91CF;&#x7684;&#x6570;&#x7EC4;&#x548C;&#x6DFB;&#x52A0; (35) S DMSP &#x7684;&#x5355;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x6D3B;&#x52A8;&#x65B9;&#x6CD5;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x7684;&#x547D;&#x8FD0;&#x3002;&#x6392;&#x5E8F;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x7684;&#x9ED1;&#x6697; (35) S &#x6D41;&#x6D41;&#x5F0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4EEA;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5438;&#x6536;&#x7684;&#x8FD1;&#x6D77;&#x3001; &#x7EC6;&#x957F;&#x548C;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#xFF0C;&#x540E;&#x8005;&#x662F;&#x6548;&#x7387;&#x6700;&#x9AD8;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x6570;&#x91CF;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x4E0A;&#x5438;&#x6536;&#x3002;&#x6839;&#x636E;&#x5145;&#x5206;&#x7684;&#x9633;&#x5149;&#x7167;&#x5C04;&#xFF0C;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x7EC6;&#x957F;&#x7684;&#x76F8;&#x5BF9;&#x8D21;&#x732E;&#x5927;&#x5927;&#x52A0;&#x5F3A;&#x4E86;&#xFF0C;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5F02;&#x517B;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;Microautoradiography &#x7EC6;&#x957F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x79EF;&#x6781;&#x5411;&#x4E0A; (35) S DMSP&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5145;&#x6EE1;&#x9633;&#x5149;&#x66B4;&#x9732;&#x540E;&#x4F5C;&#x51FA;&#x79EF;&#x6781;&#x7EC6;&#x83CC;&#x603B;&#x6570;&#x7684; 15%&#x7684;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x663E;&#x793A;&#x7684;&#x5F3A;&#x52B2;&#x589E;&#x957F;&#x3002;(3) H-&#x4EAE;&#x6C28;&#x9178;&#x4E0E;&#x5E73;&#x884C;&#x5B75;&#x5316;&#x4E00;&#x822C;&#x5448;&#x5149;&#x6CA1;&#x6709;&#x660E;&#x786E;&#x54CD;&#x5E94;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x540C;&#x7C92;&#x5F84;&#x7684;&#x540C;&#x5316;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x8868;&#x660E;&#x76F8;&#x6BD4;&#xFF0C;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x7684;&#x591C;&#x665A;&#x6BD4;&#x767D;&#x5929;&#x66F4;&#x5927;&#x76F8;&#x5BF9;&#x84DD;&#x85FB;&#x540C;&#x5316;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x9996;&#x6B21;&#x663E;&#x793A;&#x8C03;&#x8282;&#x81EA;&#x517B;&#x548C;&#x5F02;&#x517B;&#x8D85;&#x5FAE;&#x578B;&#x7684;&#x65E5;&#x5E38;&#x548C;&#x5B63;&#x8282;&#x6027;&#x65F6;&#x6807;&#x7684; DMSP &#x5438;&#x6536;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x7ADE;&#x4E89;&#x5728;&#x9633;&#x5149;&#x4EA7;&#x751F;&#x91CD;&#x5927;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

&#x9633;&#x5149;&#x8C03;&#x8282;&#x5F02;&#x517B;&#x83CC;&#x4E0E;&#x5FAE;&#x5FAE; DMSP &#x786B;&#x5438;&#x6536;&#x578B;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x76F8;&#x5BF9;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3002;

There is a large body of evidence supporting a major role of heterotrophic bacteria in dimethylsulphoniopropionate (DMSP) utilisation as a source of reduced sulphur. However, a role for phototrophic microorganisms has been only recently described and little is known about their contribution to DMSP consumption and the potential modulating effects of sunlight. In an attempt to ascertain the relative quantitative roles of heterotrophic bacteria and picophytoplankton in the osmoheterotrophic uptake of DMSP-sulphur upon exposure to natural sunlight conditions, we incubated northwestern Mediterranean waters under various optical filters and used an array of bulk and single-cell activity methods to trace the fate of added (35)S-DMSP. Flow cytometry cell sorting confirmed dark (35)S uptake by Prochlorococcus, Synechococcus and heterotrophic bacteria, the latter being the most efficient in terms of uptake on a cell volume basis. Under exposure to full sunlight, however, the relative contribution of Synechococcus was significantly enhanced, mainly because of the inhibition of heterotrophic bacteria. Microautoradiography showed a strong increase in the proportion of Synechococcus cells actively taking up (35)S-DMSP, which, after full sunlight exposure, made up to 15% of total active Bacteria. Parallel incubations with (3)H-leucine generally showed no clear responses to light. Finally, size-fractionated assimilation experiments showed greater relative cyanobacterial assimilation during the day than at night compared with that of heterotrophic bacteria. Our results show for the first time a major influence of sunlight in regulating the competition among autotrophic and heterotrophic picoplankton for DMSP uptake at both the daily and seasonal time scales.

Sunlight modulates the relative importance of heterotrophic bacteria and picophytoplankton in DMSP-sulphur uptake.

Il y a un grand nombre de preuves soutenant un r&ocirc;le majeur des bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes dans utilisation du dim&eacute;thylsulfoniopropionate (DMSP) comme source de soufre r&eacute;duit. Toutefois, un r&ocirc;le pour les micro-organismes phototrophes a &eacute;t&eacute; r&eacute;cemment d&eacute;crit et on conna&icirc;t leur contribution &agrave; la consommation de DMSP et la possibilit&eacute; de moduler les effets du soleil. Pour tenter de d&eacute;terminer les r&ocirc;les relatifs quantitatives des bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes et picophytoplankton dans l&#39;absorption de l&#39;osmoheterotrophic de DMSP-soufre lors de l&#39;exposition &agrave; des conditions de lumi&egrave;re naturelle du soleil, nous avons incub&eacute; Nord-Ouest m&eacute;diterran&eacute;en des eaux sous divers filtres optiques et utilis&eacute; une gamme de produits en vrac et m&eacute;thodes de cellule unique activit&eacute; de retracer le destin d&#39;ajout&eacute; DMSP-S (35). Cellule d&#39;&eacute;coulement cytometry tri dark confirm&eacute;e (35) S absorption par Prochlorococcus, Synechococcus et bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes, ce dernier &eacute;tant le plus efficace en termes d&#39;absorption en volume cellulaire. Au titre de l&#39;exposition au plein soleil, cependant, la contribution relative des Synechococcus est consid&eacute;rablement accrue, principalement en raison de l&#39;inhibition des bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes. Microautoradiographie a montr&eacute; une forte augmentation dans la proportion de cellules de Synechococcus activement reprenant le S-DMSP (35), qui, apr&egrave;s une exposition plein soleil, faites jusqu&#39;&agrave; 15 % du total des bact&eacute;ries actives. Des incubations parall&egrave;les avec (3) H-leucine ne montraient g&eacute;n&eacute;ralement aucuns r&eacute;ponses claires &agrave; la lumi&egrave;re. Enfin, les exp&eacute;riences de l&#39;assimilation fractionn&eacute;s taille ont montr&eacute; une plus grande assimilation de cyanobact&eacute;ries relative durant le jour que la nuit compar&eacute;e &agrave; celle des bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes. Nos r&eacute;sultats montrent pour la premi&egrave;re fois une grande influence de la lumi&egrave;re du soleil dans la r&eacute;gulation de la concurrence entre le picoplancton autotrophe et h&eacute;t&eacute;rotrophe pour l&#39;absorption du DMSP tant aux &eacute;chelles de temps quotidiens et saisonniers.

Lumi&egrave;re solaire module l&#39;importance relative des bact&eacute;ries h&eacute;t&eacute;rotrophes et picophytoplankton &agrave; l&#39;absorption de soufre-DMSP.

Es gibt ein gro&szlig;er K&ouml;rper der Nachweise f&uuml;r eine Hauptrolle heterotrophe Bakterien im Dimethylsulphoniopropionate (DMSP) Nutzung als Quelle der reduzierten Schwefelgehalt. Jedoch eine Rolle f&uuml;r phototrophe Mikroorganismen ist erst vor kurzem beschrieben worden und ist wenig bekannt &uuml;ber ihren Beitrag, DMSP-Verbrauch und seiner m&ouml;glichen Modulation Effekte des Sonnenlichts. In einem Versuch, die relativen quantitativen Rollen heterotrophe Bakterien und Picophytoplankton in die Osmoheterotrophic Aufnahme von DMSP-Schwefel auf Gef&auml;hrdung durch nat&uuml;rliches Sonnenlicht Bedingungen festzustellen, wir inkubiert nordwestlichen Mittelmeer Gew&auml;sser unter verschiedenen optischen Filtern und verwendet ein Array von Massen und einzellige Aktivit&auml;t Methoden das Schicksal der Ablaufverfolgung hinzugef&uuml;gt (35) S-DMSP. Flie&szlig;en Cytometry Zelle Sortieren best&auml;tigten dunkel (35) S Aufnahme durch Prochlorococcus marinus, Synechococcus und heterotrophe Bakterien, wobei die effizienteste im Hinblick auf die Aufnahme auf Datentr&auml;gerbasis Zelle. Unter Gef&auml;hrdung durch volles Sonnenlicht war jedoch der relative Anteil des Synechococcus deutlich, vor allem wegen der Hemmung der heterotrophe Bakterien verbessert. Microautoradiography zeigte eine starke Zunahme des Anteils der Synechococcus Zellen aktiv Aufnahme (35) S-DMSP, die, nachdem Sie volles Sonnenlicht ausgesetzt, bis zu 15 % der gesamten aktiven Bakterien gemacht. Parallele Inkubationen mit (3) H-Leucin zeigte im Allgemeinen keine klaren Antworten zu Licht. Schlie&szlig;lich ergab Gr&ouml;&szlig;e fraktioniert Assimilation Experimente st&auml;rkere relative Cyanobakterien Assimilation im Laufe des Tages als nachts im Vergleich mit der heterotrophe Bakterien. Unsere Ergebnisse zeigen zum ersten Mal einen gro&szlig;en Einfluss von Sonnenlicht bei der Regulierung des Wettbewerbs unter den autotrophen und heterotrophe Picoplankton f&uuml;r DMSP-Aufnahme auf die t&auml;glichen und saisonbedingten Zeitskalen.

Sonnenlicht moduliert die relative Bedeutung der heterotrophe Bakterien und Picophytoplankton in DMSP-Schwefel-Aufnahme.

C&#39;&egrave; un grande corpo di prove a sostegno di un ruolo importante di batteri eterotrofi in dimethylsulphoniopropionate (DMSP) utilizzazione come fonte di zolfo ridotto. Tuttavia, un ruolo per i microorganismi phototrophic solo recentemente &egrave; stato descritto e poco si sa circa il loro contributo al consumo DMSP ed il potenziale modulando gli effetti della luce solare. Nel tentativo di accertare il relativi ruoli quantitativi di batteri eterotrofi e Odum in osmoheterotrophic captazione del DMSP-zolfo all&#39;esposizione a condizioni di luce solare naturale, abbiamo incubato nordoccidentale mediterranea acque sotto vari filtri ottici e utilizzata una matrice di massa e aggiunti a cella singola attivit&agrave; metodi per tracciare il destino di S-DMSP (35). Flusso cytometry cella Ordinamento confermato scuro (35) S assorbimento da Pseudomonas, Acinetobacter e batteri eterotrofi, quest&#39;ultimo &egrave; il pi&ugrave; efficiente in termini di assorbimento sulla base del volume di cella. Sotto esposizione alla luce solare completa, tuttavia, il contributo relativo di Acinetobacter &egrave; stato notevolmente migliorato, soprattutto a causa dell&#39;inibizione dei batteri eterotrofi. Microautoradiography ha mostrato un forte aumento della percentuale di cellule Prochlorococcus marinus attivamente prendendo S-DMSP (35), che, dopo l&#39;esposizione al sole pieno, fatto fino al 15% del totale batteri attivi. Incubazioni parallele con H-leucina (3) in genere ha mostrato Nessun risposte chiaro alla luce. Infine, assimilazione frazionata dimensione esperimenti hanno mostrato una maggiore assimilazione cianobatterica relativa durante il giorno che di notte rispetto a quella di batteri eterotrofi. I nostri risultati mostrano per la prima volta una maggiore influenza della luce solare nel regolare la concorrenza tra autotrofi ed eterotrofi picoplankton per assorbimento DMSP presso entrambe le scale di tempo giornaliera e stagionale.

Luce solare modula l&#39;importanza relativa di batteri eterotrofi e Odum assorbimento DMSP-zolfo.

&#x9084;&#x5143;&#x578B;&#x786B;&#x9EC4;&#x6E90;&#x3068;&#x3057;&#x3066; dimethylsulphoniopropionate &#xFF08;dmsp &#x885B;&#x661F;&#xFF09; &#x306E;&#x5229;&#x7528;&#x306E;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x8A3C;&#x62E0;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x30DC;&#x30C7;&#x30A3;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x5149;&#x5408;&#x6210;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x306F;&#x6700;&#x8FD1;&#x8A18;&#x8F09;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x5C11;&#x3057; DMSP &#x6D88;&#x8CBB;&#x3068;&#x65E5;&#x5149;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306E;&#x5909;&#x8ABF;&#x30DD;&#x30C6;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E3;&#x30EB;&#x306B;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068; DMSP &#x786B;&#x9EC4;&#x306E; osmoheterotrophic &#x5438;&#x53CE;&#x81EA;&#x7136;&#x306A;&#x65E5;&#x5149;&#x306E;&#x6761;&#x4EF6;&#x3078;&#x306E;&#x9732;&#x51FA;&#x306B;&#x76F4;&#x6210;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x628A;&#x63E1;&#x3059;&#x308B;&#x8A66;&#x307F;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x5317;&#x897F;&#x30A4;&#x30F3;&#x30AD;&#x30E5;&#x30D9;&#x30FC;&#x30C8;&#x5730;&#x4E2D;&#x6D77;&#x6C34;&#x306E;&#x4E0B;&#x3067;&#x69D8;&#x3005; &#x306A;&#x5149;&#x5B66;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x30D0;&#x30EB;&#x30AF;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x306E;&#x904B;&#x547D;&#x3092;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B9;&#x3059;&#x308B;&#x5358;&#x4E00;&#x7D30;&#x80DE;&#x6D3B;&#x6027;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x8FFD;&#x52A0; (35) S DMSP&#x3002;&#x6D41;&#x308C; cytometry &#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6697;&#x3044; (35) S &#x3092;&#x9078;&#x5225;&#x3001;&#x5F8C;&#x8005;&#x306F;&#x5438;&#x53CE;&#x30BB;&#x30EB; &#x30DC;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30E0;&#x3054;&#x3068;&#x306E;&#x9762;&#x3067;&#x6700;&#x3082;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x53D6;&#x308A;&#x8FBC;&#x307F; Prochlorococcus&#x3001;&#x5C0E;&#x5165;&#x3068;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x3002;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x65E5;&#x5149;&#x3078;&#x306E;&#x9732;&#x51FA;&#x306E;&#x4E0B;&#x3067;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x5C0E;&#x5165;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x7684;&#x306A;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x3001;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x6291;&#x5236;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x4E3B;&#x306B;&#x5F37;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30AA;&#x30FC;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B8;&#x30AA;&#x30B0;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x5F37;&#x3044;&#x5897;&#x52A0;&#x3092;&#x7A4D;&#x6975;&#x7684;&#x306B;&#x53D6;&#x3063;&#x3066; (35) S - &#x306F;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x65E5;&#x5149;&#x66B4;&#x9732;&#x5F8C;&#x7DCF;&#x6D3B;&#x6027;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E; 15% &#x307E;&#x3067;&#x4F5C;&#x3063;&#x305F; DMSP &#x30A2;&#x30C3;&#x30D7;&#x3001;&#x5C0E;&#x5165;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5272;&#x5408;&#x3067;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B; (3) H-&#x30ED;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x3068;&#x4E26;&#x5217;&#x306E;&#x5B75;&#x5316;&#x306F;&#x5149;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x660E;&#x78BA;&#x306A;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3092;&#x793A;&#x3055;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x5206;&#x753B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x540C;&#x5316;&#x5B9F;&#x9A13;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x76F8;&#x5BFE;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE; &#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x306E;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x6BD4;&#x3079;&#x3066;&#x591C;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x663C;&#x306B;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x521D;&#x3081;&#x3066;&#x72EC;&#x7ACB;&#x6804;&#x990A;&#x3068;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x30D4;&#x30B3;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3; DMSP &#x53D6;&#x308A;&#x8FBC;&#x307F;&#x6BCE;&#x65E5;&#x3068;&#x5B63;&#x7BC0;&#x306E;&#x6642;&#x9593;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x7AF6;&#x4E89;&#x3092;&#x898F;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x65E5;&#x5149;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x65E5;&#x5149;&#x306E;&#x5F93;&#x5C5E;&#x6804;&#x990A;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x76F4;&#x6210; DMSP &#x786B;&#x9EC4;&#x5438;&#x53CE;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x7684;&#x306A;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xAC10;&#xC18C; &#xB41C; &#xC720;&#xD669;&#xC758; &#xC18C;&#xC2A4;&#xB85C; dimethylsulphoniopropionate (DMSP) &#xD65C;&#xC6A9;&#xB3C4;&#xC5D0; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC9C0; &#xC6D0;&#xD558;&#xB294; &#xC99D;&#xAC70;&#xC758; &#xD070; &#xAE30;&#xAD00;&#xC774; &#xC774;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xAD11;&#xD569;&#xC131; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC740; &#xCD5C;&#xADFC;&#xC5D0; &#xC124;&#xBA85; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC57D;&#xAC04; DMSP &#xC18C;&#xBE44;&#xC640; &#xD587;&#xBE5B;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xBCC0;&#xC870; &#xD558;&#xB294; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xB825;&#xC5D0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xACF5;&#xD5CC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. Heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC640; &#xC790;&#xC5F0;&#xC801;&#xC778; &#xD587;&#xBE5B; &#xC870;&#xAC74;&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C; &#xB418; &#xBA74; DMSP &#xC720;&#xD669; osmoheterotrophic &#xD1B5;&#xD48D; &#xAD00;&#xC5D0; picophytoplankton&#xC758; &#xC0C1;&#xB300;&#xC801;&#xC778; &#xC591;&#xC801; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD558;&#xB294; &#xC2DC;&#xB3C4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC; incubated &#xBD81;&#xC11C;&#xBD80; &#xC9C0;&#xC911;&#xD574; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xAD11;&#xD559; &#xD544;&#xD130; &#xC544;&#xB798; &#xBC14;&#xB2E4;&#xC640; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB300;&#xB7C9; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC138;&#xD3EC; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xC6B4;&#xBA85;&#xC744; &#xCD94;&#xC801; &#xBC29;&#xBC95; (35) S DMSP &#xCD94;&#xAC00;. &#xD750;&#xB984; cytometry &#xC140; &#xC815;&#xB82C; &#xD655;&#xC778;&#xB41C; &#xB2E4;&#xD06C; (35) S &#xD1B5;&#xD48D; &#xAD00; Prochlorococcus, Synechococcus &#xBC0F; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD6C4;&#xC790; &#xB418; &#xC140; &#xBCFC;&#xB968; &#xB2E8;&#xC704;&#xB85C; &#xC774;&#xD574; &#xCE21;&#xBA74;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xC804;&#xCCB4; &#xD587;&#xBE5B;&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C;,, Synechococcus&#xC758; &#xC0C1;&#xB300;&#xC801; &#xAE30;&#xC5EC;&#xB3C4; &#xD06C;&#xAC8C; &#xD5A5;&#xC0C1;, heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xC5B5;&#xC81C; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC8FC;&#xB85C;. Microautoradiography &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; (35) S-DMSP, &#xC804;&#xCCB4; &#xD587;&#xBE5B; &#xB178;&#xCD9C; &#xD6C4; &#xB9CC;&#xB4E0; &#xCD1D; &#xD65C;&#xC131; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; 15%&#xB97C; &#xCC28;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; Synechococcus &#xC140;&#xC758; &#xBE44;&#xC728;&#xC5D0; &#xAC15;&#xD55C; &#xC99D;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. (3) H &#xC2E0;&#xC744; &#xBCD1;&#xB82C; &#xC678;&#xD53C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBA85;&#xD655;&#xD55C; &#xBB34;&#xBC18;&#xC751;&#xC5D0; &#xBE5B;&#xC744; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xD06C;&#xAE30; fractionated &#xB3D9;&#xD654; &#xC2E4;&#xD5D8; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC758; &#xADF8;&#xAC83;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xBC24; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB0AE; &#xB354; &#xD070; &#xC0C1;&#xB300; cyanobacterial &#xB3D9;&#xD654;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xCC98;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC77C;&#xC77C; &#xBC0F; &#xACC4;&#xC808; &#xC2DC;&#xAC04; &#xC2A4;&#xCF00;&#xC77C;&#xC5D0;&#xC11C; DMSP &#xD1B5;&#xD48D; &#xAD00;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; autotrophic &#xBC0F; heterotrophic picoplankton &#xAC04;&#xC758; &#xACBD;&#xC7C1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xD587;&#xBE5B;&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900;&#xB2E4;.

&#xD587;&#xBE5B; heterotrophic &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xBC0F; DMSP &#xC720;&#xD669; &#xD1B5;&#xD48D; &#xAD00;&#xC5D0; picophytoplankton&#xC758; &#xC0C1;&#xB300;&#xC801; &#xC911;&#xC694;&#xB3C4;&#xB97C; &#xBCC0;&#xC870; &#xD55C;&#xB2E4;.

Hay un gran cuerpo de evidencia que apoya de manera importante de bacterias heter&oacute;trofas en la utilizaci&oacute;n de dimethylsulphoniopropionate (DMSP) como fuente de azufre reducido. Sin embargo, se ha descrito solamente recientemente un papel para microorganismos fototr&oacute;ficas y poco se sabe sobre su contribuci&oacute;n al consumo de DMSP y el potencial de modular los efectos del sol. En un intento de determinar los roles relativos cuantitativos de bacterias heterotr&oacute;ficas y picophytoplankton en la asimilaci&oacute;n de la osmoheterotrophic del DMSP-azufre sobre la exposici&oacute;n a condiciones de luz natural, incubamos noroeste Mediterr&aacute;neo aguas bajo varios filtros &oacute;pticos y utiliza una matriz de bulto y m&eacute;todos de actividad unicelular para rastrear el destino de agregado S-DMSP (35). Celda de citometr&iacute;a de flujo Clasificaci&oacute;n confirmada oscuro (35) S captaci&oacute;n por Prochlorococcus, Synechococcus y bacterias heter&oacute;trofas, siendo este &uacute;ltimo el m&aacute;s eficiente en t&eacute;rminos de absorci&oacute;n en una base de volumen de la c&eacute;lula. Bajo exposici&oacute;n a pleno sol, sin embargo, la contribuci&oacute;n relativa de Synechococcus fue mejorada significativamente, principalmente debido a la inhibici&oacute;n de bacterias heter&oacute;trofas. Microautoradiography mostraron un fuerte aumento en la proporci&oacute;n de c&eacute;lulas de Synechococcus activamente tomar S-DMSP (35), que, despu&eacute;s de exposici&oacute;n a pleno sol, hasta el 15% del activo total de bacterias. Paralelas incubaciones con H-leucina (3) demostraron generalmente no hay respuestas claras a la luz. Finalmente, asimilaci&oacute;n de tama&ntilde;o-fraccionado experimentos demostraron una mayor asimilaci&oacute;n de cianobacterias relativa durante el d&iacute;a que por la noche en comparaci&oacute;n con la de bacterias heter&oacute;trofas. Nuestros resultados demuestran por primera vez una gran influencia de la luz solar en la regulaci&oacute;n de la competencia entre picoplancton autotr&oacute;fico y heterotr&oacute;fico para absorci&oacute;n DMSP en ambas las escalas de tiempo diarias y estacionales.

Maria Vila-Costa

Department of Marine Sciences

University of Georgia (UGA)

Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics