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Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133<sup>+</sup> Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Despite improved treatments options for melanoma available today, patients with advanced malignant melanoma still have a poor prognosis for ...

Charité - Universitätsmedizin Berlin

Les ions calcium sont tr&egrave;s versatiles spatiales et temporelles des signaux intracellulaires de cellules non excitables et ont un impact important sur presque tous les aspects de la vie cellulaire contr&ocirc;lant la croissance cellulaire, m&eacute;tabolisme, s&eacute;cr&eacute;tions, traitement de l&#39;information, transcription, l&#39;apoptose et la motilit&eacute;. Neurones et cellules gliales r&eacute;pondent &agrave; des stimuli, y compris les neurotransmetteurs, neuromodulateurs et hormones, ce qui augmentent la concentration de calcium intracellulaire. On ne conna&icirc;t pas la fonction du calcium intracellulaire dans les gliomes. Beaucoup de m&eacute;dicaments utilis&eacute;s tous les jours peut agir par l&#39;interm&eacute;diaire de r&eacute;cepteurs qui peuvent &ecirc;tre reli&eacute;s au syst&egrave;me de calcium intracellulaire et donc susceptibles d&#39;influencer la biologie de gliome.

Cellules de glioblastome exprimant des r&eacute;cepteurs de membrane de la cellule fonctionnelle activ&eacute;es par m&eacute;dicaments utilis&eacute;s quotidiennes.

Gli ioni di calcio sono altamente versatile spaziali e temporali segnali intracellulari delle cellule non eccitabili e avere un impatto importante su quasi ogni aspetto della vita cellulare, controllo della crescita cellulare, metabolismo, secrezione di fluida, elaborazione dell&#39;informazione, trascrizione, apoptosi e motilit&agrave;. Glia e neuroni rispondono agli stimoli, tra cui neurotrasmettitori, neuromodulatori e ormoni, che aumentano la concentrazione di calcio intracellulare. La funzione del calcio intracellulare in gliomi &egrave; sconosciuta. Un sacco di farmaci usati quotidiane pu&ograve; agire tramite i recettori che possono essere collegati al sistema di calcio intracellulare e quindi potrebbe influenzare la biologia glioma.

Glioblastoma a cellule esprimono recettori di membrana cellulare funzionale attivati dal quotidiani farmaci usati.

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Calcium ions are highly versatile spacial and temporal intracellular signals of non-excitable cells and have an important impact on nearly every aspect of cellular life controlling cell growth, metabolism, fluid secretion, information processing, transcription, apoptosis, and motility. Neurons and glia respond to stimuli, including neurotransmitters, neuromodulators, and hormones, which increase the intracellular calcium concentration. The function of intracellular calcium in gliomas is unknown. Lots of daily used drugs may act via receptors that can be linked to the intracellular calcium system and therefore could influence glioma biology.

Glioblastoma cells express functional cell membrane receptors activated by daily used medical drugs.

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Glioblastoma &#xC138;&#xD3EC; &#xB9E4;&#xC77C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC758;&#xB8CC; &#xC57D;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC138;&#xD3EC; &#xB9C9; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4;&#xB97C; &#xD45C;&#xD604;.

Los iones de calcio son altamente vers&aacute;tiles se&ntilde;ales intracelulares espaciales y temporales de las c&eacute;lulas no excitables y tienen un impacto importante en casi todos los aspectos de la vida celular, controlar el crecimiento de la c&eacute;lula, metabolismo, secreci&oacute;n de l&iacute;quido, procesamiento de informaci&oacute;n, transcripci&oacute;n, apoptosis y motilidad. Las neuronas y gl&iacute;a responden a est&iacute;mulos, incluyendo neurotransmisores, neuromoduladores y hormonas, que aumentan la concentraci&oacute;n de calcio intracelular. Se desconoce la funci&oacute;n del calcio intracelular en gliomas. Muchos f&aacute;rmacos de uso diarios pueden actuar a trav&eacute;s de receptores que pueden vincularse con el sistema del calcio intracelular y por lo tanto podr&iacute;an influir en biolog&iacute;a de glioma.

C&eacute;lulas de glioblastoma expresan receptores de membrana de la c&eacute;lula funcional activados por diarios medicamentos usados.

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&#x795E;&#x7ECF;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C98;&#x9644;&#x5206;&#x5B50;&#x9F3B;&#x606F;&#x8089; 140 &#x4EBA;&#x8111;&#x80F6;&#x8D28;&#x7624;&#x4E16;&#x536B;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7B49;&#x7EA7;&#x7684;&#x4E0A;&#x5347;&#x4E0E;&#x4E0B;&#x964D;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x5165;&#x4FB5;&#x533A;&#x591A;&#x79CD;&#x80F6;&#x8D28;&#x548C;&#x8111;&#x8F6C;&#x79FB;&#x7624;&#x7684;&#x6307;&#x6807;&#x3002;

Gliomas are highly invasive neuroepithelial tumors with a propensity of malignant transformation and very restricted treatment options. The neural cell adhesion molecule (NCAM) modulates cellular migration, proliferation, and synaptic plasticity by homophilic and heterophilic interactions. Hereby, we investigated its relevance as a glioma tissue marker for the biological aggressiveness of these tumors and compared these features with the carcinoma brain metastasis invasion zone.

Neural cell adhesion molecule isoform 140 declines with rise of WHO grade in human gliomas and serves as indicator for the invasion zone of multiform glioblastomas and brain metastases.

Les gliomes sont les tumeurs neuro&eacute;pith&eacute;liales tr&egrave;s envahissante avec une propension de la transformation maligne et options de traitement tr&egrave;s restreinte. La mol&eacute;cule d&#39;adh&eacute;rence de cellules neurales (NCAM) module migration cellulaire, la prolif&eacute;ration et la plasticit&eacute; synaptique en homophile et interactions h&eacute;t&eacute;rophiles. Par la pr&eacute;sente, nous avons examin&eacute; sa pertinence en tant que marqueur de tissus de gliome pour l&#39;agressivit&eacute; biologique de ces tumeurs et compar&eacute; ces fonctionnalit&eacute;s avec la zone d&#39;invasion carcinome cerveau m&eacute;tastases.

Neural cell adhesion mol&eacute;cule isoforme 140 diminue avec l&#39;augmentation de grade WHO gliomes humains et sert d&#39;indicateur pour la zone d&#39;invasion des glioblastomes multiformes et les m&eacute;tastases c&eacute;r&eacute;brales.

Gliomi sono tumori neuroepithelial altamente invasiva con una propensione di trasformazione maligna e opzioni di trattamento molto ristretto. La molecola di adesione delle cellule neurali (NCAM) modula la migrazione cellulare, la proliferazione e la plasticit&agrave; sinaptica da omofilo e interazioni eterofili. Con la presente, abbiamo indagato la sua rilevanza come un marcatore di tessuto glioma per l&#39;aggressivit&agrave; biologica di questi tumori e rispetto queste caratteristiche con la zona di invasione Metastasi cerebrali carcinoma.

Adesione delle cellule neurali molecola isoforma 140 declina con l&#39;aumento del grado WHO in gliomi umani e funge da indicatore per la zona di invasione dei glioblastomi multiformi e metastasi al cervello.

&#x795E;&#x7D4C;&#x81A0;&#x816B;&#x306F;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x4FB5;&#x8972;&#x7684;&#x306A;&#x4E0A;&#x76AE;&#x816B;&#x760D;&#x60AA;&#x6027;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x5236;&#x9650;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6CBB;&#x7642;&#x6CD5;&#x306E;&#x9078;&#x629E;&#x80A2;&#x306E;&#x50BE;&#x5411;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x63A5;&#x7740;&#x5206;&#x5B50; NCAM &#x7D30;&#x80DE;&#x3001;&#x5897;&#x6B96;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B7;&#x30CA;&#x30D7;&#x30B9;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30DB;&#x30E2;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x5909;&#x8ABF;&#x3068;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x653B;&#x6483;&#x6027;&#x306E;&#x795E;&#x7D4C;&#x81A0;&#x816B;&#x7D44;&#x7E54;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x6027;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x6A5F;&#x80FD;&#x764C;&#x8133;&#x8EE2;&#x79FB;&#x306E;&#x4FB5;&#x5165;&#x30BE;&#x30FC;&#x30F3;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x795E;&#x7D4C;&#x7D30;&#x80DE;&#x63A5;&#x7740;&#x5206;&#x5B50;&#x30A2;&#x30A4;&#x30BD; &#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0; 140 &#x3072;&#x3068;&#x795E;&#x7D4C;&#x81A0;&#x816B;&#x306E; WHO &#x5E74;&#x751F;&#x306E;&#x4E0A;&#x6607;&#x3068;&#x4E0B;&#x843D;&#x3057;&#x3001;&#x4FB5;&#x5165;&#x30BE;&#x30FC;&#x30F3;&#x591A;&#x5F62;&#x795E;&#x7D4C;&#x81A0;&#x82BD;&#x816B;&#x3068;&#x8133;&#x8EE2;&#x79FB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6307;&#x6A19;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Gliomas&#xB294; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xCE68;&#xB7B5; &#xC801; neuroepithelial &#xC885;&#xC591; &#xC545;&#xC131; &#xBCC0;&#xD658; &#xBC0F; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xCE58;&#xB8CC; &#xC635;&#xC158;&#xC758; &#xC131;&#xD5A5;. &#xC2E0;&#xACBD; &#xC138;&#xD3EC; &#xC811;&#xCC29; &#xBD84;&#xC790; (&#xC5EC;) &#xC5EC; homophilic &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xB9C8;&#xC774;&#xADF8;&#xB808;&#xC774;&#xC158;, &#xD655;&#xC0B0;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC2DC; &#xB0C5; &#xC2A4;&#xAC00; &#xC18C;&#xC131; &#xBCC0;&#xC870; &#xBC0F; heterophilic &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;. &#xC774;&#xB85C;&#xC368;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC774; &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xC0DD;&#xD654;&#xD559; &#xACF5;&#xACA9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC870;&#xC9C1; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xB85C; &#xAD00;&#xB828;&#xC131;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558; &#xACE0; &#xC554; &#xB1CC; &#xC804;&#xC774; &#xCE68;&#xACF5; &#xC601;&#xC5ED;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xBE44;&#xAD50;.

&#xC2E0;&#xACBD; &#xC138;&#xD3EC; &#xC811;&#xCC29; &#xBD84;&#xC790; isoform 140 &#xC778;&#xAC04;&#xC758; gliomas WHO &#xD559;&#xB144;&#xC758; &#xC99D;&#xAC00; &#xD568;&#xAED8; &#xAC10;&#xC18C; &#xD558; &#xACE0; &#xBAA8;&#xC591;&#xC758; glioblastomas &#xBC0F; &#xB1CC; &#xC804;&#xC774;&#xC758; &#xCE68;&#xC785; &#xC601;&#xC5ED;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC9C0;&#xD45C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9;.

Los gliomas son tumores neuroepiteliales altamente invasiva con una propensi&oacute;n de transformaci&oacute;n maligna y opciones de tratamiento muy restringido. La mol&eacute;cula de adhesi&oacute;n celular neural (NCAM) modula la migraci&oacute;n celular, la proliferaci&oacute;n y la plasticidad sin&aacute;ptica por homophilic e interacciones heterof&iacute;licos. Por la presente, investigamos su relevancia como un marcador de tejido de glioma para la agresividad biol&oacute;gica de estos tumores y en comparaci&oacute;n con estas caracter&iacute;sticas con la zona de invasi&oacute;n met&aacute;stasis de carcinoma cerebral.

Isoforma de mol&eacute;cula de adhesi&oacute;n celular neuronal 140 disminuye con el aumento del grado de WHO gliomas humanos y sirve como indicador para la zona de invasi&oacute;n de glioblastomas multiformes y las met&aacute;stasis del cerebro.

&#x826F;&#x597D;&#x7684;&#x516C;&#x5171;&#x8D44;&#x52A9;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x6570;&#x636E;&#x7684;&#x53EF;&#x8BBF;&#x95EE;&#x6027;&#x81F3;&#x5173;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#x786E;&#x4FDD;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5F00;&#x653E;&#x7684;&#x79D1;&#x5B66;&#x4F53;&#x7CFB;&#x548C;&#x6700;&#x7EC8;&#x6210;&#x4E3A;&#x5F3A;&#x5236;&#x6027; [&#x97E6;&#x5C14;&#x79D1;&#x59C6;&#x4FE1;&#x6258;&#x5C06;&#x60E9;&#x7F5A;&#x79D1;&#x5B66;&#x5BB6;&#x8C01;&#x4E0D;&#x8981;&#x62E5;&#x62B1;&#x6253;&#x5F00;&#x8BBF;&#x95EE;&#x3002;&#x536B;&#x62A5; 2012 &#x5E74;]&#x3002;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x65B9;&#x6CD5;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x7814;&#x7A76;&#x9886;&#x57DF;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x7269;&#x7406;&#x5B66;&#x5230;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#xFF0C;&#x7531;&#x5927;&#x578B;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x5408;&#x662F;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x539F;&#x6599;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8D8A;&#x6765;&#x8D8A;&#x91CD;&#x8981;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x7531;&#x9488;&#x5BF9;&#x5F00;&#x653E;&#x8BBF;&#x95EE;&#x516C;&#x5171;&#x8D44;&#x52A9;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x6570;&#x636E;&#x901A;&#x8FC7;&#x6FC0;&#x52B1;&#x63AA;&#x65BD;&#x6216;&#x4E49;&#x52A1;&#x6765;&#x5171;&#x4EAB;&#x6570;&#x636E;&#x7684;&#x56FD;&#x9645;&#x548C;&#x56FD;&#x5BB6;&#x673A;&#x6784;&#x5236;&#x5B9A;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#x3002;&#x8D44;&#x91D1;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x5982;&#x82F1;&#x56FD; Wellcome Trust &#x56E0;&#x6B64;&#x5236;&#x5B9A;&#x4E86;&#x6570;&#x636E;&#x5171;&#x4EAB;&#x653F;&#x7B56;&#xFF0C;&#x5E76;&#x8981;&#x6C42;&#x81F4;&#x529B;&#x4E8E;&#x6570;&#x636E;&#x7BA1;&#x7406;&#x548C;&#x5171;&#x4EAB;&#x4E2D;&#x6388;&#x4E88;&#x5E94;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;&#x589E;&#x52A0;&#x7684;&#x5F15;&#x6587;&#x7387;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6DF1;&#x523B;&#x7684;&#x8BBA;&#x70B9;&#x5171;&#x4EAB;&#x53D1;&#x5E03;&#x6570;&#x636E;&#x3002;&#x4ED8;&#x5370;&#x524D;&#x5206;&#x4EAB;&#x53EF;&#x80FD;&#x901A;&#x8FC7;&#x6570;&#x5B57;&#x5BF9;&#x8C61;&#x6807;&#x8BC6;&#x7B26; (&#x96BE;&#x53D7;) &#x6700;&#x521D;&#x5DF2;&#x88AB;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x5BF9;&#x8C61;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x5F15;&#x6587;&#x4FE1;&#x7528;&#x4F53;&#x7CFB;&#x53D7;&#x5230;&#x5609;&#x5956;&#x3002;&#x9664;&#x4E86;&#x653F;&#x7B56;&#x548C;&#x6FC0;&#x52B1;&#x63AA;&#x65BD;&#xFF0C;&#x5728;&#x6570;&#x636E;&#x7BA1;&#x7406;&#x4E2D;&#x597D;&#x7684;&#x505A;&#x6CD5;&#x662F;&#x5FC5;&#x4E0D;&#x53EF;&#x5C11;&#x7684;&#x3002;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x9002;&#x5F53;&#x7684;&#x5927;&#x578B;&#x9879;&#x76EE;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#xFF0C;&#x5728;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x6570;&#x636E;&#x7BA1;&#x7406;&#x5236;&#x5EA6;&#x5F88;&#x96BE;&#x627E;&#x5230;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7ED9;&#x9009;&#x5B9A;&#x7684;&#x88AB;&#x8BC1;&#x660E;&#x6210;&#x529F;&#x5730;&#x8FD0;&#x7528;&#x5728;&#x5927;&#x578B;&#x9879;&#x76EE;&#x4E2D;&#x6253;&#x5F00;&#x6E90;&#x6570;&#x636E;&#x7BA1;&#x7406;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x6982;&#x8FF0;&#x3002;

&#x8DE8;&#x56FD;&#x5927;&#x578B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x9879;&#x76EE;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x7BA1;&#x7406;&#x7B56;&#x7565;&#x3002;

Good accessibility of publicly funded research data is essential to secure an open scientific system and eventually becomes mandatory [Wellcome Trust will Penalise Scientists Who Don't Embrace Open Access. The Guardian 2012]. By the use of high-throughput methods in many research areas from physics to systems biology, large data collections are increasingly important as raw material for research. Here, we present strategies worked out by international and national institutions targeting open access to publicly funded research data via incentives or obligations to share data. Funding organizations such as the British Wellcome Trust therefore have developed data sharing policies and request commitment to data management and sharing in grant applications. Increased citation rates are a profound argument for sharing publication data. Pre-publication sharing might be rewarded by a data citation credit system via digital object identifiers (DOIs) which have initially been in use for data objects. Besides policies and incentives, good practice in data management is indispensable. However, appropriate systems for data management of large-scale projects for example in systems biology are hard to find. Here, we give an overview of a selection of open-source data management systems proved to be employed successfully in large-scale projects.

Data management strategies for multinational large-scale systems biology projects.

Bonne accessibilit&eacute; des donn&eacute;es de recherche financ&eacute;s par l&#39;&Eacute;tat est essentielle pour garantir un syst&egrave;me scientifique ouvert et finit par devenir obligatoire [Wellcome Trust va p&eacute;naliser les scientifiques qui ne pas embrasser Open Access. Le Guardian 2012]. Par l&#39;utilisation de m&eacute;thodes de haut-d&eacute;bit dans de nombreux domaines de recherche de la physique &agrave; la biologie des syst&egrave;mes, des collections de donn&eacute;es de grande taille sont plus en plus importantes comme mati&egrave;re premi&egrave;re pour la recherche. Nous pr&eacute;sentons ici les strat&eacute;gies &eacute;labor&eacute;es par les institutions internationales et nationales ciblant l&#39;acc&egrave;s ouvert aux donn&eacute;es de recherche financ&eacute;s par l&#39;&eacute;tat via des incitations ou des obligations &agrave; partager des donn&eacute;es. Organismes de financement tels que le britannique Wellcome Trust, donc ont mis au point des politiques de partage des donn&eacute;es et demander l&#39;engagement de la gestion des donn&eacute;es et partage de demandes de subvention. Taux de citation accrue sont un argument profond pour le partage de donn&eacute;es de publication. Pr&eacute;publication de partage pourrait &ecirc;tre r&eacute;compens&eacute; par un syst&egrave;me de cr&eacute;dit de r&eacute;f&eacute;rence donn&eacute;es par l&#39;interm&eacute;diaire des identificateurs d&#39;objet num&eacute;rique (DOI) qui ont &eacute;t&eacute; initialement utilis&eacute;s pour les objets de donn&eacute;es. Outre les politiques et mesures d&#39;incitation, les bonnes pratiques dans la gestion des donn&eacute;es est indispensable. Cependant, des syst&egrave;mes appropri&eacute;s de gestion des donn&eacute;es des projets &agrave; grande &eacute;chelle, par exemple en biologie des syst&egrave;mes sont difficiles &agrave; trouver. Ici, nous donnons un aper&ccedil;u d&#39;une s&eacute;lection de syst&egrave;mes de gestion de donn&eacute;es open source s&#39;est av&eacute;r&eacute; &ecirc;tre employ&eacute;s avec succ&egrave;s dans des projets &agrave; grande &eacute;chelle.

Strat&eacute;gies de gestion de donn&eacute;es pour les projets de biologie des syst&egrave;mes &agrave; grande &eacute;chelle multinationale.

Buona accessibilit&agrave; dei dati pubblici di ricerca &egrave; essenziale per garantire un sistema scientifico aperto e alla fine diventa obbligatorio [Wellcome Trust si penalizzano gli scienziati che Don&#39;t abbracciare Open Access. Il Guardian 2012]. Mediante l&#39;uso di metodi di alto-rendimento in molti settori di ricerca dalla fisica alla biologia dei sistemi, raccolte di dati di grandi dimensioni sono sempre pi&ugrave; importante come materia prima per la ricerca. Qui di seguito, presentiamo strategie elaborate da istituzioni nazionali e internazionali targeting accesso aperto ai dati di ricerca finanziata attraverso incentivi o obblighi di condivisione dei dati. Finanziamento di organizzazioni come il britannico Wellcome Trust pertanto hanno sviluppato politiche di condivisione dei dati e richiesta di impegno per la gestione dei dati e la condivisione nel concedere le applicazioni. Citazione aumento tassi sono un argomento profondo per la condivisione dei dati di pubblicazione. Condivisione di pre-pubblicazione potrebbe essere ricompensata da un sistema di credito citazione dei dati tramite gli identificatori di oggetto digitale (DOIs) che inizialmente sono state in uso per gli oggetti dati. Oltre a politiche e incentivi, buone prassi nella gestione dei dati sono indispensabile. Tuttavia, un adeguato sistema di gestione dei dati di progetti su larga scala, ad esempio in biologia dei sistemi &egrave; difficile da trovare. Qui, noi diamo una panoramica di una selezione di sistemi di gestione dati open source ha dimostrato di essere impiegato con successo in progetti su larga scala.

Strategie di gestione dei dati per progetti di biologia di sistemi su larga scala multinazionale.

&#x516C;&#x7684;&#x8CC7;&#x91D1;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B9;&#x304C;&#x826F;&#x597D;&#x3067;&#x3001;&#x30AA;&#x30FC;&#x30D7;&#x30F3;&#x306E;&#x79D1;&#x5B66;&#x7684;&#x306A;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x30BB;&#x30AD;&#x30E5;&#x30EA;&#x30C6;&#x30A3;&#x3067;&#x4FDD;&#x8B77;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3001;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x306F;&#x5FC5;&#x9808;&#x3068;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059; [Wellcome &#x306E;&#x4FE1;&#x983C;&#x306F;&#x51E6;&#x7F70;&#x79D1;&#x5B66;&#x8005;&#x8AB0; don&#39;t &#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x5165;&#x308C;&#x308B;&#x3092;&#x958B;&#x304F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B9;&#x3002;&#x30AC;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A2;&#x30F3; 2012 &#x5E74;]&#x3002;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x65B9;&#x6CD5;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x306B;&#x7269;&#x7406;&#x5B66;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x5206;&#x91CE;&#x3067;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x5927;&#x91CF;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF; &#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x539F;&#x6599;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x307E;&#x3059;&#x307E;&#x3059;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x56FD;&#x969B;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x56FD;&#x5185;&#x6A5F;&#x95A2;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x3084;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x7FA9;&#x52D9;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x516C;&#x7684;&#x8CC7;&#x91D1;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3078;&#x306E;&#x30AA;&#x30FC;&#x30D7;&#x30F3; &#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B9;&#x3092;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x50CD;&#x3044;&#x305F;&#x6226;&#x7565;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x82F1;&#x56FD;&#x30A6;&#x30A7;&#x30EB;&#x30AB;&#x30E0; &#x30C8;&#x30E9;&#x30B9;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x5171;&#x6709;&#x30DD;&#x30EA;&#x30B7;&#x30FC;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x7BA1;&#x7406;&#x3078;&#x306E;&#x30B3;&#x30DF;&#x30C3;&#x30C8;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x8981;&#x6C42;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x8CC7;&#x91D1;&#x8ABF;&#x9054;&#x3068;&#x306E;&#x5171;&#x6709;&#x30A2;&#x30D7;&#x30EA;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x4ED8;&#x4E0E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5897;&#x52A0;&#x5F15;&#x7528;&#x7387;&#x306F;&#x30D1;&#x30D6;&#x30EA;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3; &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x6DF1;&#x523B;&#x306A;&#x5F15;&#x6570;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x51FA;&#x7248;&#x524D;&#x5171;&#x6709;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF; &#x30AA;&#x30D6;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x3067;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30C7;&#x30B8;&#x30BF;&#x30EB; &#x30AA;&#x30D6;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x8B58;&#x5225;&#x5B50; (Doi) &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x5F15;&#x7528;&#x4FE1;&#x7528;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x304C;&#x5831;&#x308F;&#x308C;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x653F;&#x7B56;&#x3068;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x306E;&#x307B;&#x304B;&#x306B;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x7BA1;&#x7406;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30B0;&#x30C3;&#x30C9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30B9;&#x306F;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x7BA1;&#x7406;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x306E;&#x5927;&#x578B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306E;&#x9069;&#x5207;&#x306A;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x306F;&#x96E3;&#x3057;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x30AA;&#x30FC;&#x30D7;&#x30F3; &#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x7BA1;&#x7406;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x304C;&#x6B63;&#x5E38;&#x306B;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x304C;&#x63A1;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x8A3C;&#x660E;&#x306E;&#x9078;&#x629E;&#x306E;&#x6982;&#x8981;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

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&#xB2E4;&#xAD6D;&#xC801; &#xB300;&#xD615; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xAD00;&#xB9AC; &#xC804;&#xB7B5;.

Buena accesibilidad de los datos de investigaci&oacute;n de financiaci&oacute;n p&uacute;blica es esencial para garantizar un sistema cient&iacute;fico abierto y eventualmente se convierte en obligatorio [Wellcome Trust a penalizar a los cient&iacute;ficos que Don&#39;t abrazar abrir acceso. El Guardian 2012]. Por el uso de m&eacute;todos de alto rendimiento en muchas &aacute;reas de investigaci&oacute;n de f&iacute;sica para Biolog&iacute;a de sistemas, colecciones de datos de gran tama&ntilde;o son cada vez m&aacute;s importantes como materia prima para la investigaci&oacute;n. Aqu&iacute;, presentamos estrategias elaboradas por instituciones nacionales e internacionales dirigidas a libre acceso a datos de la investigaci&oacute;n financiada con fondos p&uacute;blicos mediante incentivos u obligaciones para compartir datos. Financiaci&oacute;n de organizaciones tales como el brit&aacute;nica Wellcome Trust, por tanto, han desarrollado pol&iacute;ticas de intercambio de datos y solicitar el compromiso con la gesti&oacute;n de datos y compartiendo en conceden aplicaciones. Citaci&oacute;n aumento tarifas muestran una profunda discusi&oacute;n para compartir datos de publicaci&oacute;n. Compartir antes de la publicaci&oacute;n podr&iacute;a ser recompensado con un sistema de cr&eacute;dito de citaci&oacute;n de datos mediante identificadores de objetos digitales (DOIs) que hayan sido inicialmente en el uso de objetos de datos. Adem&aacute;s de pol&iacute;ticas e incentivos, buenas pr&aacute;cticas en la gesti&oacute;n de datos es indispensable. Sin embargo, los sistemas apropiados para la gesti&oacute;n de datos de proyectos a gran escala, por ejemplo en biolog&iacute;a de sistemas son dif&iacute;ciles de encontrar. Aqu&iacute;, le damos una visi&oacute;n general de una gran variedad de sistemas de gesti&oacute;n de datos de c&oacute;digo abierto demostrado ser empleadas con &eacute;xito en proyectos a gran escala.

Christian R.A. Regenbrecht

Institute of Pathology,
Laboratory of Molecular Tumor Pathology,
Laboratory for Functional Genomics Charité (LFGC),
Comprehensive Cancer Center Charité,
Institute of Pathology, Laboratory of Molecular Tumor Pathology

Charité - Universitätsmedizin Berlin

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133⁺ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Christian R.A. Regenbrecht

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Institute of Pathology,Laboratory of Molecular Tumor Pathology,Laboratory for Functional Genomics Charité (LFGC),Comprehensive Cancer Center Charité,Institute of Pathology, Laboratory of Molecular Tumor Pathology

Charité - Universitätsmedizin Berlin

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133+ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma

Institute of Pathology,
Laboratory of Molecular Tumor Pathology,
Laboratory for Functional Genomics Charité (LFGC),
Comprehensive Cancer Center Charité,
Institute of Pathology, Laboratory of Molecular Tumor Pathology

Patient Derived Cell Culture and Isolation of CD133⁺ Putative Cancer Stem Cells from Melanoma