Reguladores de transcrição mestres são proteínas reguladoras que são predominantemente responsáveis pela regulação da expressão de múltiplos genes. Muitas vezes estes genes trabalham em conjunto para guiar um processo complexo. A ativação de um regulador de transcrição mestre pode levar a uma cascata de ativação transcricional necessária para obter esse resultado. Estes reguladores podem ligar-se diretamente às sequências de regulação dos vários genes envolvidos, ou podem regular indiretamente a transcrição, ligando-se a sequências de regulação de reguladores transcricionais adicionais e induzindo a sua produção. A expressão de um fenótipo específico em um organismo está frequentemente sob o controlo de um ou dois reguladores de transcrição mestres. A importância desses reguladores no funcionamento dos organismos e expressão de fenótipos de doenças fazem deles alvos ideais para a investigação do desenvolvimento de fármacos.

O MEF2C é um regulador de transcrição mestre que é predominantemente responsável pelo desenvolvimento do cancro da mama. Pertence à família Mef2 de ativadores de transcrição responsáveis pela diferenciação celular e desenvolvimento. Existem várias características do MEF2C que demonstram a sua função como regulador de transcrição mestre. Ele é composto por dois domínios de ligação ao DNA – Mef2 e MADS-box. O domínio Mef2 é conhecido pela sua ligação ao DNA com alta afinidade e função de dimerização. O MEF2C também possui locais de ligação para TEAD1, um corregulador responsável por aumentar a transcrição; MAPK7, um factor de transcrição que regula a proliferação e diferenciação celular; EP300, um factor de transcrição envolvido na regulação do crescimento e divisão celular; e várias desacetilases de histonas, como HDAC4, HDAC7, e HDAC9.

A análise experimental mostrou que o MEF2C pode regular diretamente muitos genes responsáveis pelo fenótipo oncogénico. Ele também pode regular indiretamente o fenótipo ativando outros factores de transcrição: 1896 genes e 2156 interações de regulação de segunda ordem e 5852 genes e 18801 interações de terceira ordem.