Este trabalho foi apoiado pelo NIH grant DK32083, JDRF Grants 2-SRA-2015-51-Q-R e 2-SRA-2018-533-S-B.

O protocolo de pesquisa foi aprovado pelo Colorado Multiple Institutional Review Board.
1. Preparação do tampão
<ol><li>Faça o tampão de rotulagem (2x PBS, pH 7,9). Usando 400 mL de água destilada deionizada (DD), adicione 100 mL de 10x PBS. Para ajustar o pH da solução, adicione NaOH até atingir 7,9.</li>
	<li>Crie biotina de 3 mM dissolvendo 1 mg de biotina em 588 μL de tampão de marcação criado anteriormente. Faça 3 mM Ru Sulfo-NHS dissolvendo 150 nmol de Ru Sulfo-NHS em 50 μL de tampão de rotulagem.</li>
	<li>Fazer o tampão antigénio (1% BSA) tomando 500 ml de 1x PBS e adicionando 5 g de albumina sérica bovina (BSA) à solução. Preparar 0,5 M de solução de ácido acético. Prepare o tampão Tris-HCl de 1 M usando a Base Trizma e ajustando o pH para 9,0.</li>
	<li>Para o tampão de revestimento (Bloqueador A a 3%), tome 500 mL de PBS 1x e adicione 15 g de Bloqueador A. Prepare o tampão de lavagem (0,05% Tween 20, PBST) misturando 5000 mL de PBS 1x com 2,5 mL de Tween 20. Crie um buffer de leitura (2x Read Buffer T com surfactante) adicionando 500 mL de água DD e 500 mL de 4x Read Buffer T com surfactante. NOTA: Para manter a consistência entre os ensaios, é importante que as soluções de biotina e Ru Sulfo-NHS sejam criadas imediatamente antes do procedimento de rotulagem e não sejam criadas e armazenadas para uso futuro.</li>
</ol>2. Marcação de cada proteína antigénica com biotina e Ru Sulfo-NHS separadamente
NOTA: Para ter uma reação de marcação mais eficaz, use uma concentração de proteína de antígeno de ≥0,5 mg/mL.
<ol><li>Calcule o número molar de cada proteína antigénica e os números molares da biotina e Ru Sulfo-NHS. Adicione uma quantidade adequada de biotina ou Ru Sulfo-NHS à proteína do antígeno para a reação de marcação de acordo com a proporção molar da proteína do antígeno para a biotina ou Ru Sulfo-NHS.<ol><li>Para o antígeno que tem o menor peso molecular (≤10 kDa), como a proteína proinsulina, use uma proporção molar de 1:5 (antígeno: biotina e Ru Sulfo-NHS). Para o antígeno que tem o maior peso molecular (>50 kDa), como a proteína GAD, use uma proporção molar de 1:20. Para o antígeno que tem um peso molecular médio (10-50 kDa), use uma razão molar ajustada entre 1:5-1:20.</li>
	</ol></li>
	<li>Tanto para a biotina quanto para o Ru Sulfo-NHS, divida o peso de cada antígeno por seus pesos moleculares correspondentes para obter o número molar do antígeno para cada um. Divida o número molar pela concentração para obter o volume de biotina. Repita isso para Ru Sulfo-NHS.</li>
	<li>Misturar a proteína antigénica com biotina utilizando a razão molar adequada, determinada no passo 2.2. Em seguida, faça o mesmo para Ru Sulfo-NHS. NOTA: Para a eficiência da reação de rotulagem, quaisquer produtos químicos redutores como Tris ou glicina no sistema tampão precisam ser trocados por 2x tampão PBS, pH 7,9 pela coluna de rotação de dimensionamento. Os protocolos de rotulagem para biotina e Ru Sulfo-NHS são idênticos.</li>
	<li>Cubra os tubos de reação com papel alumínio e incube-os à temperatura ambiente (RT) por 1 h. A razão que cobre os tubos de reação com papel alumínio é porque tanto a biotina quanto os reagentes Ru Sulfo-NHS são sensíveis à luz.</li>
	<li>Pressione a coluna de spin de 2 mL ou 5 mL enquanto os tubos de reação estão incubando (o tamanho da coluna de spin é determinado pelo volume carregado na coluna). Encha a coluna de rotação com 2x buffer PBS e, em seguida, centrifuga-a a 1.000 x g por 2 min de cada vez, para um total de três vezes.</li>
	<li>Pare a reação de marcação após os tubos de reação terem terminado de incubar. Para parar a reação, purifique a proteína do antígeno marcada, passando-a através da coluna de spin uma vez. Em seguida, centrifugar a coluna a 1.000 x g por 2 min.</li>
	<li>Calcular a concentração total de antígenos marcados dividindo a quantidade de proteína do antígeno presente pelo volume final. Aliquot 50 μL da proteína do antigénio marcada purificada por tubo e armazenar as alíquotas a -80 °C para utilização a longo prazo. NOTA: É importante estar ciente de que, para cada vez que a coluna de spin passa a proteína do antígeno, haverá cerca de uma taxa de retenção de 90-95%.</li>
</ol>3. Definir a melhor concentração e proporções para os dois antígenos marcados para o ensaio (ensaio quadriculado)
NOTA: Uma vez que o ensaio ECL-IAA neste ensaio 7-Plex requer tratamento ácido de amostras de soro, o ensaio quadriculado para cada antígeno deve passar por esta etapa antes de incubar com a mistura de antígeno marcada.
<ol><li>Aplique o ensaio quadriculado para cada antígeno separadamente antes de executar o ensaio multiplex. As etapas 3.2-3.6 usarão o GAD65 como exemplo.</li>
	<li>Calcular a diluição da proteína GAD65 marcada. A concentração alvo recomendada da primeira solução de mistura de GAD65 biotinilado é de 2000 ng/mL e Ru Sulfo-NHS marcada com GAD65 é de 1000 ng/mL. Se a concentração de GAD65 biotinilado e marcado com Ru Sulfo-NHS em solução de estoque for de 1,0 μg/μL, o volume necessário para GAD65 biotinilado em 560 μL de solução de trabalho será de 1,12 μL e o volume necessário para Ru Sulfo-NHS rotulado GAD65 em 700 μL de solução de trabalho será de 0,7 μL.</li>
	<li>Misture 1,12 μL de proteína GAD65 biotinilada com 240 μL de ligante conjugado com estreptavidina 1 em um tubo e 160 μL de BSA a 1%. Incubar a mistura à temperatura ambiente durante 30 min. Adicionar 160 μL de solução de paragem ao tubo e incubar a mistura à temperatura ambiente durante mais 30 minutos.</li>
	<li>Faça uma diluição em série. Tomar 280 μL da mistura para um novo tubo e adicionar 280 μL de solução de paragem para fazer uma diluição de 1:2. Prepare vários tubos novos. Repita esta etapa para executar uma diluição serial horizontal para o antígeno GAD65 marcado com biotina (consulte a publicação anterior12).</li>
	<li>Misture 0,7 μL da proteína GAD65 (1 μg/μL) marcada com Ru Sulfo-NHS com 700 μL de solução stop. Em seguida, tome 350 μL da mistura para um novo tubo e adicione 350 μL de solução de parada para fazer uma diluição de 1:2. Prepare vários tubos novos, repita esta etapa para executar uma diluição serial vertical para o antígeno GAD65 marcado com Ru Sulfo-NHS.</li>
	<li>Preparar duas amostras de soro, uma amostra altamente positiva para GADA e uma amostra negativa para GADA, cada uma com um volume de 0,75 mL. Aliquota de 15 μL de soro positivo em cada poço na metade esquerda da placa de PCR de 96 poços. Aliquota de 15 μL de soro negativo em cada poço na metade direita da placa de PCR de 96 poços.</li>
	<li>Adicionar 18 μL de ácido acético 0,5 M em cada alvéolo e misturar. Incubar por 45 min no RT. Prepare uma nova placa de PCR de 96 poços. Adicionar 17,5 μL do antígeno marcado com biotina e 17,5 μL do antígeno marcado com Ru Sulfo-NHS em cada poço de acordo com as diluições seriadas (consulte a publicação anterior12).</li>
	<li>Continue o restante das etapas de ensaio descritas nas etapas 5.2 a 9.1.</li>
	<li>Determine a relação de sinal das amostras positivas altas contra os sinais de amostra negativos correspondentes. Selecione a melhor concentração para o antígeno marcado com biotina e o antígeno marcado com Ru Sulfo-NHS, identificando o ponto que tem a maior ou perto da maior proporção de sinal positivo para negativo. Neste cálculo da razão, considere o sinal de fundo baixo obtido a partir das amostras negativas. NOTA: As concentrações óptimas de Ru Sulfo-NHS e proteínas antigénicas marcadas com biotina dos ensaios quadriculados são apresentadas abaixo: 30 ng/ml e 200 ng/ml para GAD65, 120 ng/ml e 120 ng/ml para proinsulina, 10 ng/ml e 42 ng/ml para IA-2, 80 ng/ml e 80 ng/ml para TG, 8 ng/ml e 16 ng/ml para TPO, 31 ng/mL e 31 ng/mL para ThG, e 12 ng/mL e 12 ng/mL para IFNα.</li>
</ol>4. Criar a solução de antígeno acoplado ao ligador misto
<ol><li>Selecione a concentração ideal para cada antígeno com base no ensaio quadriculado. Diluir a biotina e o antígeno marcado com Ru Sulfo-NHS para a concentração racional de trabalho.</li>
	<li>Ligue diferentes ligadores a cada uma das proteínas de antígeno exclusivamente biotiniladas. Para um ensaio de placa de 96 poços, misture 4 μL de proteína biotinilada GAD65, TPO, tTG, ThG, proinsulina, IFN-α e IA-2 com 240 μL de ligante conjugado com estreptavidina 1, 2, 3, 4, 8, 9 e 10 em tubo separado (Figura 1). Em seguida, adicione 156 μL de PBS/1% BSA por tubo. Incubar a mistura à temperatura ambiente durante 30 min.</li>
	<li>Adicionar 160 μL de solução de paragem em cada tubo e incubá-los à temperatura ambiente durante mais 30 minutos. Pegue 400 μL de antígeno acoplado ao ligador de cada tubo e combine todos os 7 antígenos juntos. Adicionar 1,2 mL de solução stop e, em seguida, adicionar 4 μL de Ru Sulfo-NHS marcado GAD65, TPO, tTG, ThG, proinsulina, IFN-α e antígeno IA-2 à mistura. Agora a solução de antígeno está pronta para ser usada no ensaio.</li>
</ol>5. Incubar amostras de soro com o antigénio marcado
NOTA: Uma vez que o ensaio ECL-IAA neste ensaio 7-Plex requer tratamento ácido de amostras de soro, cada soro requer a etapa de tratamento ácido antes de incubar com mistura de antígeno marcada para este ensaio 7-Plex.
<ol><li>Aliquota de 15 μL de soro por poço para uma placa de PCR de 96 poços. Adicionar 18 μL de ácido acético 0,5 M em cada alvéolo e misturar. Incubar por 45 min no RT. Prepare uma nova placa de PCR de 96 poços e alíquota de 35 μL de solução de antígeno em cada poço.</li>
	<li>Enquanto a placa ainda está incubando, adicione 13 μL de 1 M Tris pH 9,0 tampão a cada poço na placa de antígeno. Adicione tampão ao lado de cada poço para limitar a mistura de tampão Tris e antígeno. Após a conclusão da incubação, tome 25 μL do soro tratado com ácido e pipete-o imediatamente em cada poço na placa de antígeno. Agite a solução e cubra a placa com folha de vedação por PCR para evitar a exposição à luz.</li>
	<li>No RT, coloque a placa em um agitador, ajustado a uma velocidade baixa, por 1 h. Depois, conservar a placa a 4 °C e deixar incubar a placa durante 18-24 h.</li>
</ol>6. Prepare a placa multiplex
<ol><li>Pegue uma placa multiplex do refrigerador de 4 °C e deixe a placa chegar ao RT. Uma vez que a placa multiplex esteja em RT, adicione 150 μL de 3% de Bloqueador A a cada poço. Cubra a placa multiplex com folha de vedação. Incubar a placa num frigorífico a 4 °C durante a noite. NOTA: O Dia de Ensaio 1 inclui as Etapas 4 a 6.</li>
</ol>7. Transferir soro/antígeno incuba para a placa multiplex
<ol><li>No dia seguinte, coloque toalhas de papel sobre a mesa e retire a placa multiplex de incubação da geladeira. Esvazie todo o buffer da placa. Para fazer isso, vire a placa de cabeça para baixo e bata-a nas toalhas de papel preparadas até que não haja tampão presente em nenhum dos poços.</li>
	<li>Lave a placa multiplex adicionando 150 μL de PBST em cada poço. Descarte o buffer, como mencionado na etapa 7.1., e repita essa etapa três vezes. Adicione 30 μL de incubados de soro/antígeno em cada poço na placa multiplex. Cubra a placa com papel alumínio para limitar sua exposição à luz. Coloque a placa sobre um agitador de placas, ajustado para uma velocidade baixa, a RT por 1 h.</li>
</ol>8. Lave a placa e adicione o tampão de leitura
<ol><li>Remova as incubações de soro/antígeno da placa multiplex, segurando a placa de cabeça para baixo e sacudindo a solução. Adicionar 150 μL de PBST em todos os poços e remover o tampão da placa, segurando novamente a placa de cabeça para baixo e sacudindo a solução. Repita esta etapa três vezes. Após a conclusão da terceira lavagem, adicione 150 μL de tampão de leitura em cada poço. NOTA: As bolhas de ar interferem na capacidade da máquina leitora de placas de analisar com precisão os resultados da placa e devem ser evitadas a todo custo.</li>
</ol>9. Leia a placa e analise os dados
<ol><li>Conte a placa preparada na máquina leitora de placas, lendo todos os valores em contagens por segundo (CPS).</li>
	<li>Calcule o índice relativo para o ensaio, utilizando os níveis de anticorpos obtidos da máquina leitora de placas, com a seguinte equação: Valor do índice = [CPS (amostra) - CPS (padrão negativo)] / [CPS (padrão positivo) - CPS (padrão negativo)].</li>
	<li>Determine quais resultados de anticorpos são negativos ou positivos usando os pontos de corte que foram estabelecidos. NOTA: O Dia 2 do Ensaio inclui as Etapas 7 a 9.</li>
</ol>

<ol>
	<li>Harjutsalo, V., Sjoberg, L., Tuomilehto, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Time+trends+in+the+incidence+of+type+1+diabetes+in+Finnish+children:+a+cohort+study.">Time trends in the incidence of type 1 diabetes in Finnish children: a cohort study.</a> Lancet. 371 (9626), 1777-1782 (2008).</li><li>Vehik, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Increasing+incidence+of+type+1+diabetes+in+0-+to+17-year-old+Colorado+youth.">Increasing incidence of type 1 diabetes in 0- to 17-year-old Colorado youth.</a> Diabetes Care. 30 (3), 503-509 (2007).</li><li>Atkinson, M. A., Eisenbarth, G. S., Michels, A. 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G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=3+Screen+ELISA+for+High-Throughput+Detection+of+Beta+Cell+Autoantibodies+in+Capillary+Blood.">3 Screen ELISA for High-Throughput Detection of Beta Cell Autoantibodies in Capillary Blood.</a> Diabetes Technology &amp; Therapeutics. 18 (11), 687-693 (2016).</li><li>Schlosser, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diabetes+Antibody+Standardization+Program:+evaluation+of+assays+for+insulin+autoantibodies.">Diabetes Antibody Standardization Program: evaluation of assays for insulin autoantibodies.</a> Diabetologia. 53 (12), 2611-2620 (2010).</li><li>Zhao, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+multiplex+assay+combining+insulin,+GAD,+IA-2+and+transglutaminase+autoantibodies+to+facilitate+screening+for+pre-type+1+diabetes+and+celiac+disease.">A multiplex assay combining insulin, GAD, IA-2 and transglutaminase autoantibodies to facilitate screening for pre-type 1 diabetes and celiac disease.</a> Journal of Immunological Methods. 430, 28-32 (2016).</li></ol>

Os autores não têm nada a revelar.

Em numerosos ensaios clínicos nacionais e internacionais para diabetes tipo 1, o desempenho do ensaio único de ECL para detectar autoanticorpos de ilhotas e autoanticorpos para transglutaminase (TGA) para doença celíaca tem sido comprovado 8,9,10,11. Ao longo dessas trilhas, este ensaio aumentou a sensibilidade e a especificidade para a detecção de autoantígenos quando avaliado em relação ao RBA padrão 'ouro' existente. A especificidade aumentada da doença pode ser observada quando se discriminam autoanticorpos de ilhotas de alta afinidade e alto risco de sinais de baixo risco e baixa afinidade, entre o ensaio de ECL único e a RBA14,15,16,17. Com base no único ensaio de ECL, apresentamos um novo ensaio de autoanticorpos de ECL multiplexado de alto rendimento, para nos permitir rastrear o DM1, bem como várias doenças autoimunes aplicáveis ao mesmo tempo.
O ensaio de ECL multiplex usa a placa multiplex, que pode combinar até 10 ensaios de autoanticorpos em um único poço. Para o presente estudo, 7 ensaios de autoanticorpos são combinados. Os autoanticorpos compreendem 3 IAbs (IAA, GADA, e IA-2A), 2 autoanticorpos autoimunes da doença tireoidiana (TPOA e ThGA), autoanticorpos da doença celíaca (TGA) e autoanticorpos APS-1 para interferon alfa (IFNαA). O mecanismo de ensaio é, em geral, baseado em um único ensaio de ECL como publicado anteriormente 9,10,12,18 com algumas modificações. A principal diferença de um ensaio de ECL multiplex de um único ensaio de ECL é que cada complexo anticorpo-antígeno formado na fase fluida é restrito a um ligador específico (Figura 1). O antígeno marcado com biotina é incubado com a estreptavidina conjugada, um ligador usado para formar um complexo específico antígeno-ligador. O complexo imune anticorpo-antígeno se forma após a incubação com soro do paciente e é capturado em um local específico através do sistema ligador específico em cada poço da placa multiplex. O antígeno marcado com Ru Sulfo-NHS capturado por anticorpos ao mesmo tempo fornece o sinal com eletroquimioluminescência. A máquina leitora de placas pode detectar até 10 sinais diferentes das fontes pontuais localizadas em cada poço. Para manter os ensaios de autoanticorpos consistentes entre as placas e durante a realização de estudos de longo prazo, sugerimos que o mesmo ligador seja usado.
Antes de configurar um ensaio de ECL multiplex, os ensaios de ECL único para cada autoanticorpo precisam ser otimizados em uma placa multiplex, respectivamente, e validados em relação aos ensaios de RBA e ECL único em uma placa ECL regular. Para aprimorar o ensaio quadriculado, para o ensaio de autoanticorpos relacionados na placa multiplex, um paciente positivo alto e uma amostra de paciente negativa foram usados. Após a realização do ensaio quadriculado, as concentrações mais ideais para o antígeno marcado com Ru Sulfo-NHS e biotina foram calculadas para cada um dos 7 ensaios de autoanticorpos. Apresentam-se estas concentrações: 30 ng/ml e 200 ng/ml para GAD65, 120 ng/ml e 120 ng/ml para proinsulina, 10 ng/ml e 42 ng/ml para IA-2, 80 ng/ml e 80 ng/ml para TG, 8 ng/ml e 16 ng/ml para TPO, 31 ng/ml e 31 ng/ml para ThG, 31 ng/ml para ThG, e 12 ng/mL e 12 ng/mL, respectivamente, para IFNα13. As concentrações de alguns dos antígenos do ensaio quadriculado podem precisar ser ajustadas de acordo com os resultados no ensaio multiplex real depois de combinar todos os ensaios.
Como o IAA está incluído no presente ensaio de ECL multiplex, o tratamento ácido de amostras de soro é obrigatório antes da incubação do soro com antígeno, conforme relatado no estudo anterior12. Geralmente, quando um autoanticorpo extra é adicionado a um ensaio multiplex, o fundo do ensaio é afetado e um sinal extremamente alto de um ponto, no poço, pode obstruir os resultados de pontos próximos via crosstalk. Portanto, o CPS máximo precisa ser limitado a 20.000 contagens para cada autoanticorpo, ou menos, para as amostras positivas mais altas. Do nosso conhecimento, a fim de reduzir a quantidade de crosstalk envolvido, os autoanticorpos que têm um fundo inferior devem ser separados, ao projetar o mapa de pontos, longe de pontos com maior frequência de contagens.
Controles positivos e negativos altos foram usados internamente em cada ensaio para calcular um índice preciso para as amostras desconhecidas que estavam sendo testadas. Para avaliar e monitorar com precisão a sensibilidade do ensaio, foram utilizados controles positivos baixos, ajustados perto do limite superior do ensaio. Esses controles positivos e negativos padrão foram criados a granel e alíquota para uso a longo prazo e armazenados a -20 °C ou menos, para consistência entre os ensaios. Para fins de garantia de qualidade, as amostras foram executadas duas vezes em cada ensaio e cada resultado positivo foi repetido e confirmado pela execução da amostra em um novo ensaio de ECL no dia seguinte. Se houvesse alguma discordância com o primeiro e o segundo ensaio confirmatório, um terceiro ensaio era necessário. Dos três ensaios realizados, os resultados dos dois ensaios que concordam (por exemplo, +, + ou -,-), determinaram o resultado final (positivo ou negativo) da amostra.
Na última década, muitos grupos de estudo estão buscando um ensaio de alto rendimento utilizando o método multiplex para combinar vários ensaios de autoanticorpos juntos em um poço para rastrear grandes populações. Existem alguns estudos que estão utilizando diferentes tipos de tecnologias para realizar ensaios de autoanticorpos multiplex 19,20,21,22, mas não há comparação para nenhum desses ensaios em sensibilidade e especificidade com o atual padrão 'ouro' RBA, quando se estuda DM1. Esses diferentes tipos de plataformas usadas não são validados através do workshop internacional Islet Autoantibody Standardization Program (IASP) ou através do teste de grandes coortes em ensaios clínicos. Em uma recente triagem geral de base populacional na Alemanha, um ensaio combinado de alto rendimento, 3 Screen ICATM ELISA distribuído pela Kronus, está sendo usado como uma ferramenta para triagem de primeira linha para detectar três IAbs, GADA, IA-2A e ZnT8A, para alcançar o diagnóstico precoce de DM1infantil 23. O ensaio ELISA de 3 telas mede 3 autoanticorpos em 3 poços separados, consumindo um grande volume de soro, ou em um único poço com todos os 3 ensaios misturados. Se um poço no ensaio ELISA de 3 telas for positivo, não será possível distinguir qual dos três autoanticorpos está presente. A maior desvantagem deste ensaio é a sua incapacidade de incluir a medição IAA. Todos os resultados do IAA realizados pelo ELISA, comprovados em oficinas do IASP, não apresentam sensibilidade e especificidade aceitáveis24. IAA é geralmente o primeiro IAb a aparecer e tem uma alta prevalência entre crianças pequenas. O rastreamento de IAb, com IAA, é necessário para crianças e não é considerado aceitável realizar esse rastreamento sem IAA para avaliar o risco de DM1 na comunidade. Além disso, não há estudos ou dados publicados que mostrem o ensaio do kit Kronus IAb como sendo mais específico da doença T1D e capaz de discriminar IAbs de alto risco de baixo risco. O ensaio de ECL 7-Plex, no presente estudo, foi validado por meio de uma grande coorte de pacientes recém-diagnosticados comDM13 13. Em comparação com o RBA padrão atual e o ensaio de ECL único bem estabelecido, o ensaio 7-Plex é capaz de reter 100% de positividade com a mesma especificidade do ensaio (Tabela 4). Atualmente, o ensaio de ECL 4-Plex, paralelo com o RBA padrão, está sendo aplicado a um grande ensaio clínico em andamento: o estudo Autoimmunity Screening for Kids (ASK). Este estudo rastreia crianças na população em geral, da área metropolitana de Denver, para DM1 e doença celíaca. Em comparação com a RBA padrão usada no estudo ASK, o ensaio de ECL multiplex está mostrando excelente sensibilidade e uma maior especificidade da doença, idêntica aos nossos relatórios anteriores usando o estudo único ECL25. Além disso, nosso ensaio de ECL 4-Plex demonstrou uma redução pronunciada no trabalho de parto, custo e volume sérico em 70%, em comparação com os 4 ensaios únicos correspondentes para ECL e RBA. Usando o ensaio de ECL multiplexado, podemos personalizar cada poço com números diferentes, representando diferentes autoanticorpos (até 10), para testar diferentes doenças autoimunes que são específicas para as necessidades de um determinado local clínico.
Existem algumas limitações observadas, mostradas no presente estudo, para um ensaio de ECL multiplexada utilizando a placa multiplex. A diluição final do soro, incubada com antígeno, não pode ser ajustada para produzir as condições mais ideais para cada ensaio de autoanticorpos que é combinado em um único poço. Nove amostras (9/1026), de pacientes com DM1, apresentaram um resultado falso negativo para determinados autoanticorpos. Dos falsos negativos, 7 foram para TPOA e 2 para ThGA, no ensaio de 7-Plex ECL, mas resultados positivos elevados foram exibidos tanto no ensaio de ECL único quanto no RBA (Figuras 2 e 3). Após posterior diluição de todas as 9 amostras, elas se tornaram positivas na placa multiplex. Esse resultado é causado pelo que descrevemos como o fenômeno da "prozona". Esse fenômeno faz com que a amostra apresente um resultado falso negativo porque os altos títulos de anticorpos estão afetando a formação de redes antígeno-anticorpo. Ao configurar um ensaio multiplex, recomenda-se que as amostras com títulos muito elevados, para cada um dos autoanticorpos combinados, tenham pré-testes executados para identificar a diluição opcional do soro para incubação de antígenos. Alternativamente, ensaios de autoanticorpos com condições otimizadas semelhantes devem ser selecionados para formar um ensaio combinado a partir do qual a melhor sensibilidade e especificidade do ensaio é alcançada para cada autoanticorpo. No presente estudo, 7 amostras (7/1022), de controles normais saudáveis, resultaram em falsos positivos para múltiplos autoanticorpos no ensaio 7-Plex, mas após a execução de um único ensaio de ECL e RBA (Figura 2 e 3) esses autoanticorpos foram considerados negativos em ambos os ensaios. As razões por trás desses resultados falso-positivos que ocorrem na placa multiplex, para esse pequeno subconjunto de amostras, são atualmente desconhecidas. Para a aplicação atual do ensaio de ECL multiplex, todas as amostras positivas são repetidas com seu ensaio de ECL único correspondente para confirmar a positividade, o que remove esse erro falso positivo do ensaio de ECL multiplex.

O diabetes tipo 1 (DM1) é uma doença crônica grave que é mais comum na infância. Atualmente, cerca de 1,4 milhão de pessoas têm o DM1 nos Estados Unidos; surpreendentemente, a incidência de DM1 está aumentando constantemente a 3-5% a cada ano em todo o mundo e dobrou nas últimas duas décadas, especialmente em crianças pequenas 1,2. Os autoanticorpos das ilhotas (IAbs) na circulação sanguínea são o biomarcador mais confiável no momento. Os IAbs podem aparecer anos antes do desenvolvimento clínico do DM13. Atualmente, quatro IAbs principais são amplamente utilizados no diagnóstico de DM1 e triagem de risco, incluindo autoanticorpos contra insulina (IAA), glutamato descarboxilase-65 (GADA), insulinoma antígeno-2 (IA-2A) e transportador de zinco-8 (ZnT8A). Esses quatro IAbs são igualmente importantes na predição do desenvolvimento do DM1. A classificação do DM1 foi redefinida recentemente como a presença de ≥2 de quaisquer 4 IAbs com metabolismo normal da glicose como o estágio da doença 14.
No Diabetes Autoimmunity Study in the Young (DAISY), foi revelado que uma em cada quatro crianças em risco de DM1 provavelmente progrediria para autoimunidade de ilhotas, celíacas, tireoides ou reumatoides e, mais surpreendentemente, aproximadamente 40% dos pacientes que foram diagnosticados com DM1 eventualmente desenvolveram uma condição autoimune adicional 5,6,7 . A identificação de autoanticorpos é essencial para a predição e diagnóstico dessas doenças autoimunes e deve proporcionar um melhor atendimento clínico aos pacientes. Não há uma maneira fácil e barata no momento de rastrear essas múltiplas condições autoimunes. Os métodos de triagem atuais usando o ensaio de radioligação padrão (RBA), com uma única medida de autoanticorpos, são trabalhosos e ineficientes para uma triagem em larga escala.
Aqui, descreveremos o recém-desenvolvido ensaio de ECL multiplexado simples, que autenticamos usando uma única plataforma de ensaio de ECL 8,9,10,11. O ensaio de ECL multiplex combina 7 testes de autoanticorpos em um único poço, usando apenas 15 μL de soro, e é capaz de rastrear DM1 e múltiplas doenças autoimunes relevantes simultaneamente, incluindo doença celíaca, doença autoimune da tireoide e SAF-1. Um ensaio de ECL ZnT8A não havia sido desenvolvido na época e não foi incluído no ensaio multiplexado. O ensaio de ECL multiplex fornece uma excelente ferramenta para alto rendimento na triagem da população em geral para DM1 e múltiplas doenças autoimunes.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>4 &#176;C refrigerator</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#8211;80 &#176;C and -20 &#176;C freezers</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well Plate Shaker</td>
			<td>Wallac - Delfi</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well round bottom plate</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>8408220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetic acid solution</td>
			<td>Fisher</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aluminum foil</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Antigen proteins</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Human GAD65 full length protein</td>
			<td>Diamyd</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Human ThG full length protein</td>
			<td>BioMart</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Human TPO full length protein</td>
			<td>BioMart</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IA-2 intracellular domain protein</td>
			<td>BioMart</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IFN-&#945; protein</td>
			<td>Abcam</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Proinsulin protein</td>
			<td>AmideBio</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>tTG protein</td>
			<td>DiaRect</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bottle-Top 500 mL , Filter Units</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>0974064A or B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A-7906</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Distilled deionized (DD) water</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HCl</td>
			<td>Fisher</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ice maker</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ice trays</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MSD Sector</td>
			<td>Perkin-Elmer</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multi-channel pipette</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaOH</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paper tower</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pH meter</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipette-Aid</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipettes/tips</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ru Sulfo-NHS</td>
			<td>MSD (R91AN)</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trizma Base</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>BP152-5</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tween 20</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P-1379</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uplex Development Kit</td>
			<td>MSD</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96-well UPlex plate</td>
			<td>MSD</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blocker A</td>
			<td>MSD</td>
			<td>R93AA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Linker-Streptavidin</td>
			<td>MSD</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Read buffer</td>
			<td>MSD</td>
			<td>R92TC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stop Solution</td>
			<td>MSD</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex mixer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZeBa Column</td>
			<td>Pierce</td>
			<td>89892</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a high-throughput electrochemiluminescence 7-plex assay simultaneously screening for type 1 diabetes and multiple autoimmune diseases

Os autoanticorpos das ilhotas (IAbs) são amplamente utilizados no diagnóstico e predição do diabetes tipo 1 (DM1). Quatro IAbs principais para insulina (IAA), glutamato descarboxilase-65 (GADA), insulinoma antígeno-2 (IA-2A) e transportador de zinco-8 (ZnT8A) são igualmente importantes na predição da doença. Atualmente, até 40% dos pacientes diagnosticados com DM1 desenvolvem outros distúrbios autoimunes. Infelizmente, os métodos de triagem atuais que usam um único autoanticorpo para medição são trabalhosos e ineficientes para estudos de triagem em larga escala. Recentemente, desenvolvemos um ensaio simples de eletroquimioluminescência multiplexada (ECL) para abordar esses problemas atuais. O ensaio combina todos os 7 testes de autoanticorpos em um poço. Cada poço inclui três IAbs (IAA, GADA, e IA-2A), autoanticorpos para a peroxidase da tireoide (TPOA) e globulina tireoidiana (ThGA) para detectar doença autoimune da tireoide, autoanticorpos para transglutaminase tecidual (TGA) para doença celíaca e autoanticorpos para interferon alfa (IFNαA) para síndrome poliglandular autoimune-1 (APS-1); todos os quais rastreiam o DM1 e outras doenças autoimunes relevantes, simultaneamente. O ensaio de ECL multiplex é baseado na única plataforma de ensaio de ECL, mas em vez disso usa a placa multiplex combinando vários ensaios de autoanticorpos, até 10, em um único poço. A principal diferença em relação ao ensaio único de ECL é que cada complexo anticorpo-antígeno formado na fase fluida é contido em um ponto específico em cada poço através de um sistema de ligação na placa multiplex. O ensaio de ECL 7-Plex, no presente estudo, é validado em relação aos ensaios padrão de radioligação (RBA) e ensaios de ECL únicos, usando uma grande coorte de pacientes com DM1 recém-diagnosticados e controles saudáveis pareados por idade, resultando em excelente sensibilidade e especificidade do ensaio.

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A High-Throughput Electrochemiluminescence 7-Plex Assay Simultaneously Screening for Type 1 Diabetes and Multiple Autoimmune Diseases

Modelamos um ensaio de ECL multiplexado simples que combina 7 ensaios de autoanticorpos juntos. O ensaio é capaz de rastrear DM1 e várias outras doenças autoimunes, simultaneamente, incluindo doença celíaca, doença tireoidiana autoimune e síndrome poliglandular autoimune 1.

Um ensaio de eletroquimioluminescência de alto rendimento 7-plex rastreando simultaneamente diabetes tipo 1 e múltiplas doenças autoimunes

Islet autoantibodies (IAbs) are widely used in type 1 diabetes (T1D) diagnosis and prediction. Four major IAbs to insulin (IAA), glutamate ...

a-high-throughput-electrochemiluminescence-7-plex-assay

Research

JoVE Journal

Medicine

2.3K visualizações.  University of Colorado School of Medicine. Modelamos um ensaio de ECL multiplexado simples que combina 7 ensaios de autoanticorpos juntos. O ensaio é capaz de rastrear DM1 e várias outras doenças autoimunes, simultaneamente, incluindo doença celíaca, doença tireoidiana autoimune e síndrome poliglandular autoimune 1.

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Mouse Eye Enucleation for Remote High-throughput Phenotyping

The mouse eye is an important genetic model for the translational study of human ophthalmic disease. Blinding diseases in humans, such as macular degeneration, photoreceptor degeneration, cataract, glaucoma, retinoblastoma, and diabetic retinopathy have been recapitulated in transgenic mice.1-5 Most transgenic and knockout mice have been generated by laboratories to study non-ophthalmic diseases, but genetic conservation between organ systems suggests that many of the same genes may also play a role in ocular development and disease. Hence, these mice represent an important resource for discovering new genotype-phenotype correlations in the eye. Because these mice are scattered across the globe, it is difficult to acquire, maintain, and phenotype them in an efficient, cost-effective manner. Thus, most high-throughput ophthalmic phenotyping screens are restricted to a few locations that require on-site, ophthalmic expertise to examine eyes in live mice. 6-9 An alternative approach developed by our laboratory is a method for remote tissue-acquisition that can be used in large or small-scale surveys of transgenic mouse eyes. Standardized procedures for video-based surgical skill transfer, tissue fixation, and shipping allow any lab to collect whole eyes from mutant animals and send them for molecular and morphological phenotyping. In this video article, we present techniques to enucleate and transfer both unfixed and perfusion fixed mouse eyes for remote phenotyping analyses.

The dissection technique illustrates enucleation of the mouse eye for tissue fixation to perform phenotyping in high-throughput screens.

Enucleação Rato Olho para fenotipagem de alta capacidade remota

The mouse eye is an important genetic model for the translational study of human ophthalmic disease. Blinding diseases in humans, such as macular ...

Medicina

High Content Screening in Neurodegenerative Diseases

The functional annotation of genomes, construction of molecular networks and novel drug target identification, are important challenges that need to be addressed as a matter of great urgency1-4. Multiple complementary 'omics' approaches have provided clues as to the genetic risk factors and pathogenic mechanisms underlying numerous neurodegenerative diseases, but most findings still require functional validation5. For example, a recent genome wide association study for Parkinson's Disease (PD), identified many new loci as risk factors for the disease, but the underlying causative variant(s) or pathogenic mechanism is not known6, 7. As each associated region can contain several genes, the functional evaluation of each of the genes on phenotypes associated with the disease, using traditional cell biology techniques would take too long. 
	There is also a need to understand the molecular networks that link genetic mutations to the phenotypes they cause. It is expected that disease phenotypes are the result of multiple interactions that have been disrupted. Reconstruction of these networks using traditional molecular methods would be time consuming. Moreover, network predictions from independent studies of individual components, the reductionism approach, will probably underestimate the network complexity8. This underestimation could, in part, explain the low success rate of drug approval due to undesirable or toxic side effects. Gaining a network perspective of disease related pathways using HT/HC cellular screening approaches, and identifying key nodes within these pathways, could lead to the identification of targets that are more suited for therapeutic intervention.
	High-throughput screening (HTS) is an ideal methodology to address these issues9-12. but traditional methods were one dimensional whole-well cell assays, that used simplistic readouts for complex biological processes. They were unable to simultaneously quantify the many phenotypes observed in neurodegenerative diseases such as axonal transport deficits or alterations in morphology properties13, 14. This approach could not be used to investigate the dynamic nature of cellular processes or pathogenic events that occur in a subset of cells. To quantify such features one has to move to multi-dimensional phenotypes termed high-content screening (HCS)4, 15-17. HCS is the cell-based quantification of several processes simultaneously, which provides a more detailed representation of the cellular response to various perturbations compared to HTS. 
	HCS has many advantages over HTS18, 19, but conducting a high-throughput (HT)-high-content (HC) screen in neuronal models is problematic due to high cost, environmental variation and human error. In order to detect cellular responses on a 'phenomics' scale using HC imaging one has to reduce variation and error, while increasing sensitivity and reproducibility. 
	Herein we describe a method to accurately and reliably conduct shRNA screens using automated cell culturing20 and HC imaging in neuronal cellular models. We describe how we have used this methodology to identify modulators for one particular protein, DJ1, which when mutated causes autosomal recessive parkinsonism21. 
	Combining the versatility of HC imaging with HT methods, it is possible to accurately quantify a plethora of phenotypes. This could subsequently be utilized to advance our understanding of the genome, the pathways involved in disease pathogenesis as well as identify potential therapeutic targets.

We describe a methodology combining automated cell culturing with high-content imaging to visualize and quantify multiple cellular processes and structures, in a high-throughput manner. Such methods can aid in the further functional annotation of genomes as well as identify disease gene networks and potential drug targets.

Screening alto teor em Doenças Neurodegenerativas

The functional annotation of genomes, construction of molecular networks and novel drug target identification, are important challenges that need to be ...

A Modified Precipitation Method to Isolate Urinary Exosomes

Identification of biomarkers that allow early detection of kidney diseases in urine and plasma has been an area of active interest for several years. Urinary exosome vesicles, 40-100 nm in size, are released into the urine under normal conditions by cells from all nephron segments and may contain protein, mRNA and microRNA representative of their cell type of origin. Under conditions of renal dysfunction or injury, exosomes may contain altered proportions of these components, which may serve as biomarkers for disease. There are currently several methods available for isolation of urinary exosomes, and we have previously conducted an experimental comparison of each of these approaches, including three based on ultracentrifugation, one using a nanomembrane ultrafiltration concentrator, one using a commercial precipitation reagent and one using a modification of the precipitation technique using ExoQuick reagent that we developed in our laboratory. We found the modified precipitation method produced the highest yield of exosome particles, miRNA, and mRNA, making this approach suitable for the isolation of exosomes for subsequent RNA profiling. We conclude that the modified exosome precipitation method offers a quick, scalable, and effective alternative for the isolation of exosomes from urine. In this report, we describe our modified precipitation technique using ExoQuick reagent for isolating exosomes from human urine.

This manuscript describes a protocol for isolating exosomes from human urine using a modified precipitation technique.

Um método de precipitação de modificação para isolar exossomas urinária

Identification of biomarkers that allow early detection of kidney diseases in urine and plasma has been an area of active interest for several years. ...

An Organotypic High Throughput System for Characterization of Drug Sensitivity of Primary Multiple Myeloma Cells

In this work we describe a novel approach that combines ex vivo drug sensitivity assays and digital image analysis to estimate chemosensitivity and heterogeneity of patient-derived multiple myeloma (MM) cells. This approach consists in seeding primary MM cells freshly extracted from bone marrow aspirates into microfluidic chambers implemented in multi-well plates, each consisting of a reconstruction of the bone marrow microenvironment, including extracellular matrix (collagen or basement membrane matrix) and stroma (patient-derived mesenchymal stem cells) or human-derived endothelial cells (HUVECs). The chambers are drugged with different agents and concentrations, and are imaged sequentially for 96 hr through bright field microscopy, in a motorized microscope equipped with a digital camera. Digital image analysis software detects live and dead cells from presence or absence of membrane motion, and generates curves of change in viability as a function of drug concentration and exposure time. We use a computational model to determine the parameters of chemosensitivity of the tumor population to each drug, as well as the number of sub-populations present as a measure of tumor heterogeneity. These patient-tailored models can then be used to simulate therapeutic regimens and estimate clinical response.

We describe a high-throughput drug sensitivity assay for primary multiple myeloma cells. It consists of a reconstruction of the bone marrow microenvironment (including extracellular matrix and stroma) in multi-well plates, and a non-invasive method for longitudinal quantification of cell viability.

Um Sistema Organotípicas alta taxa de transferência para Caracterização de Drogas de sensibilidade de células de mieloma múltiplo primárias

In this work we describe a novel approach that combines ex vivo drug sensitivity assays and digital image analysis to estimate chemosensitivity and ...

TRUE Gene Silencing: Screening of a Heptamer-type Small Guide RNA Library for Potential Cancer Therapeutic Agents

TRUE gene silencing (termed after tRNase ZL-utilizing efficacious gene silencing) is one of the RNA-directed gene silencing technologies, which utilizes an artificial small guide RNA (sgRNA) to guide tRNA 3&#8242; processing endoribonuclease, tRNase ZL, to recognize a target RNA. sgRNAs can be taken up by cells without any transfection reagents and can downregulate their target RNA levels and/or induce apoptosis in human cancer cells. We have screened an sgRNA library containing 156 heptamer-type sgRNAs for the effect on viability of human myeloma and leukemia cells, and found that 20 of them can efficiently induce apoptosis in at least one of the cancer cell lines. Here we present a protocol for screening of a heptamer-type sgRNA library for potential therapeutic drugs against blood cancers. The protocol includes how to construct the sgRNA library, how to assess the effect of each sgRNA on cell viability, and how to further evaluate the effective sgRNAs by flow cytometry. Around 2,000 hits would be expected to be obtained by screening the full-scale sgRNA library composed of 16,384 heptamers.

Here we present a protocol for screening of a heptamer-type sgRNA library for potential therapeutic drugs against blood cancers.

VERDADEIRO silenciamento gênico: Triagem de um heptâmero tipo Guia de pequeno RNA Biblioteca de agentes terapêuticos potenciais Câncer

TRUE gene silencing (termed after tRNase ZL-utilizing efficacious gene silencing) is one of the RNA-directed gene silencing technologies, which utilizes ...

A High Throughput, Multiplexed and Targeted Proteomic CSF Assay to Quantify Neurodegenerative Biomarkers and Apolipoprotein E Isoforms Status

Many neurodegenerative diseases are&#160;still lacking effective treatments. Reliable biomarkers for identifying and classifying these diseases will be important in the development of future novel therapies. Often&#160;potential new biomarkers do not make it&#160;into the clinic&#160;due to limitations&#160;in their development and&#160;high costs.&#160;However,&#160;targeted proteomics using Multiple Reaction Monitoring Liquid Chromatography-tandem/Mass Spectrometry (MRM LC-MS/MS), specifically using triple quadrupole mass spectrometers, is one method that can be used to rapidly evaluate and validate biomarkers&#160;for clinical translation into diagnostic laboratories. Traditionally, this platform has been used extensively for measurement of small molecules&#160;in clinical laboratories, but it is the potential to analyze proteins, that makes it an attractive alternative to ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)-based methods. We describe here how targeted proteomics can be used to measure multiplexed markers of dementia, including the detection and quantitation of the known risk factor apolipoprotein E isoform 4 (ApoE4).
In order to make the assay suitable for translation, it is designed to be rapid, simple, highly specific and cost effective. To achieve this, every step in the development of the assay must be optimized for the individual proteins and tissues they are analyzed in. This method describes a typical workflow including various tips and tricks to developing a targeted proteomics MRM LC-MS/MS for translation.
The method development is optimized using custom synthesized versions of tryptic quantotypic peptides, which calibrate&#160;the MS for detection and then spiked into CSF to determine correct identification of the endogenous peptide in the chromatographic separation prior to analysis in the MS. To achieve absolute quantitation, stable isotope-labeled internal standard versions of the peptides with short amino acid sequence tags and containing a trypsin cleavage site, are included in the assay.

We describe a high-throughput, multiplex, and targeted proteomic cerebrospinal fluid (CSF) assay developed with potential for clinical translation. The test can quantitate potential markers and risk factors for neurodegeneration, such as the apolipoprotein E variants (E2, E3 and E4), and measure their allelic expression.

A High Throughput, multiplexados e alvejado proteômica CSF Ensaio para quantificar Neurodegenerativas Biomarkers e apolipoproteína E isoformas Estado

Many neurodegenerative diseases are&#160;still lacking effective treatments. Reliable biomarkers for identifying and classifying these diseases will be ...

High-throughput Nitrobenzoxadiazole-labeled Cholesterol Efflux Assay

Atherosclerosis leads to cardiovascular disease (CVD). It is still unclear whether cholesterol-HDL (cHDL) concentration plays a causal role in atherosclerosis development. However, an important factor in early stages of atheroma plaque formation is cholesterol efflux capacity to HDL (the ability of HDL particles to accept cholesterol from macrophages) in order to avoid foam cell formation. This is a key step in avoiding the accumulation of cholesterol in the endothelium and a part of reverse cholesterol transport (RCT) to eliminate cholesterol through the liver. Cholesterol efflux capacity to serum or plasma in macrophage cell models is a promising tool that can be used as biomarker for atherosclerosis. Traditionally, [3H]-cholesterol has been used in cholesterol efflux assays. In this study, we aim to develop a safer and faster strategy using fluorescent labelled-cholesterol (NBD-cholesterol) in a cellular assay to trace the cholesterol uptake and efflux process in THP-1-derived macrophages. Finally, we optimize and standardize the NBD-cholesterol efflux method and develop a high-throughput analysis using 96-well plates.

Measurement of in vitro cholesterol efflux capacity to serum or plasma in macrophage cell models is a promising tool as a biomarker for atherosclerosis. In the present study, we optimize and standardize a fluorescent NBD-cholesterol efflux method and develop a high-throughput analysis using 96-well plates.

Ensaio de efluxo de colesterol Nitrobenzoxadiazole-etiquetadas do elevado-throughput

Atherosclerosis leads to cardiovascular disease (CVD). It is still unclear whether cholesterol-HDL (cHDL) concentration plays a causal role in ...

An Improved and High Throughput Respiratory Syncytial Virus (RSV) Micro-neutralization Assay

Respiratory syncytial virus-specific neutralizing antibodies (RSV NAbs) are an important marker of protection against RSV. A number of different assay formats are currently in use worldwide so there is a need for an accurate and high-throughput method for measuring RSV NAbs. We describe here an imaging-based micro-neutralization assay that has been tested on RSV subgroup A and can also be adapted for RSV subgroup B and different sample types. This method is highly reproducible, with inter-assay variations for the reference antiserum being less than 10%. We believe this assay can be readily established in many laboratories worldwide at relatively low cost. Development of an improved, high-throughput assay that measures RSV NAbs represents a significant step forward for the standardization of this method internationally as well as being critical for the evaluation of novel RSV vaccine candidates in the future.

An Improved and High Throughput Respiratory Syncytial Virus RSV Micro-neutralization Assay

This study describes a high throughput, imaging-based micro-neutralization assay to determine the titer of neutralizing antibodies specific for respiratory syncytial virus (RSV). This assay format has been tested on different sample types.

Um ensaio de Microneutralização do vírus sincicial respiratório (VSR) melhorada e alta taxa de transferência

Respiratory syncytial virus-specific neutralizing antibodies (RSV NAbs) are an important marker of protection against RSV. A number of different assay ...

High-Throughput Analysis of Optical Mapping Data Using ElectroMap

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we present, in a step-by-step guide, the use of ElectroMap for analysis, quantification, and mapping of high-resolution voltage and calcium datasets acquired by optical mapping. ElectroMap analysis options cover a wide variety of key electrophysiological parameters, and the graphical user interface allows straightforward modification of pre-processing and parameter definitions, making ElectroMap applicable to a wide range of experimental models. We show how built-in pacing frequency detection and signal segmentation allows high-throughput analysis of entire experimental recordings, acute responses, and single beat-to-beat variability. Additionally, ElectroMap incorporates automated multi-beat averaging to improve signal quality of noisy datasets, and here we demonstrate how this feature can help elucidate electrophysiological changes that might otherwise go undetected when using single beat analysis. Custom modules are included within the software for detailed investigation of conduction, single file analysis, and alternans, as demonstrated here. This software platform can be used to enable and accelerate the processing, analysis, and mapping of complex cardiac electrophysiology.

This protocol describes the setup and use of ElectroMap, a MATLAB-based open-source software platform for analysis of cardiac optical mapping data. ElectroMap provides a versatile high-throughput tool for analysis of optical mapping voltage and calcium datasets across a wide range of cardiac experimental models.

Análise de alto throughput de dados de mapeamento óptico usando o ElectroMap

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we ...

A High-Throughput In Situ Method for Estimation of Hepatocyte Nuclear Ploidy in Mice

When the liver is injured, hepatocyte numbers decrease, while cell size, nuclear size and ploidy increase. The expansion of non-parenchymal cells such as cholangiocytes, myofibroblasts, progenitors and inflammatory cells also indicate chronic liver damage, tissue remodeling and disease progression. In this protocol, we describe a simple high-throughput approach for calculating changes in the cellular composition of the liver that are associated with injury, chronic disease and cancer. We show how information extracted from two-dimensional (2D) tissue sections can be used to quantify and calibrate hepatocyte nuclear ploidy within a sample and enable the user to locate specific ploidy subsets within the liver in situ. Our method requires access to fixed/frozen liver material, basic immunocytochemistry reagents and any standard high-content imaging platform. It serves as a powerful alternative to standard flow cytometry techniques, which require disruption of freshly collected tissue, loss of spatial information and potential disaggregation bias.

We present a robust, cost-effective, and flexible method for measuring changes in hepatocyte number and nuclear ploidy within fixed/cryopreserved tissue samples that does not require flow cytometry. Our approach provides a powerful sample-wide signature of liver cytology ideal for tracking the progression of liver injury and disease.

Um método de alta produtividade in situ para estimação da ploidiii y nuclear hepatocida em camundongos

When the liver is injured, hepatocyte numbers decrease, while cell size, nuclear size and ploidy increase. The expansion of non-parenchymal cells such as ...