Aplicação de análise fatorial multiômica não supervisionada para descobrir padrões de variação e processos moleculares ligados a doenças cardiovasculares

Nosso fluxo de trabalho possibilita analisar facilmente conjuntos de dados multiômicos complexos de diferentes resoluções. A abordagem extrai os principais padrões de variantes que são exclusivas ou compartilhadas com os tipos de dados específicos e os agrega. Os chamados fatores resultantes podem então ser ligados a processos moleculares e covariáveis clínicas ou técnicas.

Nossa análise foi uma das primeiras a aplicar o modelo MOFA a dados multiômicos e de célula única de várias amostras. É importante ressaltar que essas amostras eram de uma coorte clínica de pacientes com ataque cardíaco. Isso nos permitiu identificar assinaturas imunes multicelulares associadas ao resultado e ao estado da doença.

Portanto, a disponibilidade de conjuntos de dados de célula única e multiômica aumenta, mas muitas vezes, os recursos desses conjuntos de dados são analisados apenas separadamente. Isso limita os insights porque, geralmente, os processos biológicos são o resultado das interações entre vários recursos e tipos de células. Com nossos protocolos, os usuários podem facilmente realizar uma análise integrada do conjunto de dados completo e identificar esses programas multicelulares.

Acreditamos que a aplicação deste protocolo a conjuntos de dados multiômicos adicionais gerará novos insights sobre outras doenças ou contextos. Esses insights informarão futuros estudos terapêuticos ou de biomarcadores.