Когда молекула мРНК транспортируется из ядра в цитозоль, по мере появления конца её праймера 5 из ядерной поры, рибосома начинает транслировать его. Данная тестовая трансляция проверяет мРНК на ошибки и отмечает неверно обработанную мРНК для деградации. В этом механизме слежения за мРНК, называемый процессом Нонсенс-опосредованного распад мРНК-или NMD-рибосома может определить наличие в молекуле мРНК нонсенс-или стоп-кодона в неправильном месте.

Как правило, пре-мРНК может содержать стоп-кодоны внутри интронов вдобавок к обычно присутствующему стоп-кодону. При сращивании этой пре-мРНК и её перерабатке в ядре, комплексы соединения экзонов или ЕJC-привязывают мРНК в каждом сайте сращивания. В тестовом раунде трансляции, EJC комплексы были перемещены движущейся рибосомой.

При нормальном сращивании мРНК, этот стоп кодон-отмеченный последовательностью UAA, UAG или UGA-лежит в пределах последнего экзона. Так что, когда рибосома достигает его и трансляция прекращается, там нет связанных EJC. Например, когда мРНК проходит проверку качества, гона становится доступной для дальнейших раундов трансляции.

Неполностью склеенные мРНК все еще имеют нонсенс кодоны, присутствующие в рамке для чтения мРНК. Это явление наблюдается чаще в организмах с более длинными интронами. В то время как рибосома Когда молекула мРНК транспортируется из ядра в цитозоль, по мере появления конца её праймера 5 из ядерной поры, рибосома начинает транслировать его.

Данная тестовая трансляция проверяет мРНК на ошибки и отмечает неверно обработанную мРНК для деградации. В этом механизме слежения за мРНК, называемый процессом Нонсенс-опосредованного распад мРНК-или NMD-рибосома может определить наличие в молекуле мРНК нонсенс-или стоп-кодона в неправильном месте. Как правило, пре-мРНК может содержать стоп-кодоны внутри интронов вдобавок к обычно присутствующему стоп-кодону.

При сращивании этой пре-мРНК и её перерабатке в ядре, комплексы соединения экзонов или ЕJC-привязывают мРНК в каждом сайте сращивания. В тестовом раунде трансляции, EJC комплексы были перемещены движущейся рибосомой. При нормальном сращивании мРНК, этот стоп кодон-отмеченный последовательностью UAA, UAG или UGA-лежит в пределах последнего экзона.

Так что, когда рибосома достигает его и трансляция прекращается, там нет связанных EJC. Например, когда мРНК проходит проверку качества, гона становится доступной для дальнейших раундов трансляции. Неполностью склеенные мРНК все еще имеют нонсенс кодоны, присутствующие в рамке для чтения мРНК.

Это явление наблюдается чаще в организмах с. более длинные интроны. Как рибосома транслирует эту мРНК, она достигает стоп кодона до взаимодействия с последним EJC.

Эта зашедшая в тупик рибосома заканчивает трансляцию преждевременно, в то время как процесс активирует ответ NMD. Связанный EJC служит в качестве платформы привязки для NMD факторов, в том числе смещающих вверх белков UPF1, UPF2 и UPF3, и фосфорилирующего фермента-SMG. Эти белки рекрутируют экснуклеазы, которые деградируют неисправную мРНК.

Наблюдение NMD критически важно при выборе генетических комбинаций, которые произвели бы функциональный белок.