Method Article
* Эти авторы внесли равный вклад
Молекулярное воображение с матрицы с помощью лазерной десорбции/ионизации основе изображений масс-спектрометрия (MALDI-IMS) позволяет одновременное отображение нескольких аналитов в биологических образцах. Здесь мы представляем протокол обнаружения и визуализации белка амилоида β на ткани мозга болезнь Альцгеймера и Церебральный амилоидные ангиопатии образцов с помощью MALDI-IMS.
Невропатология болезни Альцгеймера (AD) характеризуется накоплением и агрегирования пептиды амилоида β (значения) в внеклеточной бляшек головного мозга. Aβ пептиды, состоящий из 40 аминокислот, создаются из белков амилоида прекурсоров (APP), β - и γ-secretases. Значения наносится не только в мозговой паренхимы, но и в лептоменингеальных и церебральной сосудистой стенки, известный как Церебральный амилоидные ангиопатии (УГА). Хотя были выявлены различные значения пептиды, подробные производство и распространение отдельных значения пептидов в патологических тканей AD и УГА не были полностью учтены. Здесь мы разрабатываем протокол при содействии матрицы лазерной десорбции/ионизации основе изображений масс-спектрометрии (MALDI-IMS) на ткани мозга человека вскрытия для получения всеобъемлющей белка сопоставления. Для этой цели человека корковых образцы были получены от мозга банка в Токио Метрополитен Института геронтологии. Замороженные cryosections вырезать и переданы Индий Оксидно оловянные (ИТО)-покрытие стеклянных скольжениях. Спектры приобретаются с использованием системы MALDI с пространственным разрешением до 20 мкм. Синапиновая кислота (SA) равномерно наносится на слайде с помощью автоматического или ручного распылителя. С текущей технические преимущества MALDI-IMS типичный набор данных различных видов значения в пределах те же разделы мозг человека autopsied можно получить без конкретных зондов. Кроме того с высоким разрешением (20 мкм) изображений AD и головного мозга тяжелой УГА пример четко показывает, что Aβ1-36-Aβ1-41 были зачислены на лептоменингеальных судов, в то время как Aβ1-42 и Aβ1-43 были сданы на хранение в мозговой паренхимы как старческое налета (SP). Это возможно принять MALDI-IMS как стандартный подход в сочетании с клинической, генетические и патологических наблюдений в понимании патологии AD, CAA, и других неврологических заболеваний на основе текущей стратегии.
Чтобы сделать диагностику и понимать патогенез нейродегенеративных расстройств, точное определение молекулярных патологических отложений имеет важное значение1. В ходе AD, значения производится сделать СФМ в мозговой паренхимы и хранение в сосудах задолго до болезнь начала2,3,4,5,6. В то время как Aβ1-42 является преобладающим пептида в SP AD мозги, другие варианты значения, такие как N-терминала или C-терминал усечены или изменение Aβs, также определены в затрагиваемых AD мозги7,8,9, 10. Полную картину из широкого диапазона значения видов в мозг человека, особенно с AD и Церебральный амилоидные ангиопатии (УГА)11, поможет ученым понять значения производства, метаболизм и осаждения.
Как классический подход невропатология иммуногистохимия (IHC) был наиболее убедительных метод, чтобы определить расположение Aβs в14,13,12,тканей мозга15. В общем ИГХ не может различать молекулы, когда несколько эпитопов сосуществуют одновременно. Напротив возникающих массы на основе спектрометрии протеомного анализа является ценным подход особенно для анализа различных видов значения в тканях мозга, которые не смогите быть продифференцировано с антитела16,17. Обычных массовых спектрометрии-анализ мозга лизатов и иммуно осаждают образцов не удается обнаружить незначительные значения пептидов и теряет распределения информации значения в ткани мозга.
В более ранних работах визуализации значения вкладов в мозг мыши успешно используя трансгенных животных модель AD, например APP23. Однако этот процесс по-прежнему нуждается в технических достижений для сравнения IMS и IHC отношении разрешение и чувствительность18,,19-20. Невропатология объявления должны быть изучены на человеческий мозг, и мы использовали технологию MALDI-IMS на ткани мозга человека вскрытия для получения всеобъемлющей белка сопоставления21. Для этой цели мы разработали протокол для расширенный тип масс-спектрометрии, которая имеет преимущества в своей быстротой, чувствительность и воспроизводимость.
Здесь в Токио Метрополитен гериатрической больнице, которая обеспечивает медицинское обслуживание на базе общин для пожилого населения в Японии были собраны образцы тканей. Мозг вскрытие образцы, используемые в исследовании были зарегистрированы в мозг банк старение научных исследований (Просветляющим) с осознанного согласия родственников погибшего. Просветляющим утверждается Комитетом по этике Токио Метрополитен гериатрической больницы и Институт геронтологии. Для всех мозги, зарегистрированный в банке мозга мы получили письменное информированное согласие для их использования в медицинских исследований от пациентов или их семей. Пациенты были размещены в комнате холодно (4 ° C) в течение 2 ч после смерти для уменьшения посмертные изменения в мозге. Все методы, описанные здесь были одобрены Дошиша университета и мозг банка для старения исследований, Токио Метрополитен гериатрической больницы и Институт геронтологии.
1. Подготовка разделов ткани для IMS
2. MALDI-IMS
3. обработка данных
Спорадические АД у больных с УГА (n = 5; средний возраст = 83,2 y) и возрасте предметы с старческое доска бесплатно (SP O) и УГА (n = 5; средний возраст = 77,2 y) были проанализированы (Таблица 1). УГА фенотипов пациента #3 были наиболее известных в этом исследовании. Распределение Aβ1-40 и Aβ1-42 депозитов в ткани мозга от пациента #3 были визуализированы с MALDI-IMS (рис. 1). Были без существенных сигналов в nonpathological управления мозги (пациенты #9 и #10), как показано на рисунке 1. Здесь MALDI-IMS четко визуализируется, что Aβ1-42 преференциально сдан как СФМ в мозговой паренхимы. Напротив короче Aβs, например Aβ1-36-1-41, преференциально были депонированы на лептоменингеальных сосудистых областях (рис. 1).
Распределение Aβ40 и Aβ42 были дополнительно подтверждена с IHC использование прилегающих Замороженные разделы тканей. Антитела анти Aβ40 помечены УГА (стрелки на рис. 2B), который четко отличается от распределения Aβ42 в мозговой паренхимы как СФМ. Для Aβ1-41 мы первыми обнаружить этот фрагмент в человеческий мозг, и мы породили специфические антитела, которые могут дифференцировать Aβ41 от Aβ40 andAβ4221.
Пространственное разрешение MALDI-IMS Обычно является наиболее важным фактором для быть улучшены. На рисунке 1 и Рисунок 2 Показать MALDI-IMS с разрешением 100 мкм шаг и получить общий профиль распределения для относительно широкую площадь21. Трудно определить амилоида осаждения ровно в субарахноидальное пространство, в том числе сосудистые структуры. Изобразить тонкой ткани структур субарахноидальное судов и поверхности коры, с высоким разрешением MALDI imaging (40 мкм: цифра 3; 20 мкм: Рисунок 4 и 5) была выполнена. В результате MALDI-IMS четко продемонстрировали, что короче Aβs, например Aβ1-36-1-41, распространяются в стенках артерий, что сопоставимо с МГС.
MALDI-IMS продемонстрировал Подробное распределение Aβx-40 и Aβx-42 (x = 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9 и 11pE) в AD, с умеренной УГА мозга. Например в то время как Aβx-40 видов показал аналогичный профиль распределения Aβ1-40, Aβx-42 видов показан шаблон другой дистрибутив с Aβ1-4221. Текущий протокол один Ион изображения отдельных значения пептидов, наблюдается с MALDI-IMS присваиваются значения видов. Напротив приобретенные изображения, которые данные могут быть исследованы с помощью многомерного статистического анализа без присмотра с целью получения сегментации изображений анатомических областей, представляющих интерес для дальнейшего анализа не определено белков. Рисунок 5 показывает карту сегментации, полученные с рассекает k средства анализа применительно к той же статьи21пациент #3. Этот метод кластеризации успешно определены налета подобных структур в паренхиме (синий цвет в рисунке 5 c) и сосудистых структур в субарахноидальном пространстве (зеленый цвет в рисунке 5 c). Это интересно найти небольшой круговой области в паренхиме, который обнаруживается только вокруг небольшой противовоспали паренхимы, а также в субарахноидальное пространство (фиолетовый в рисунке 5 c). Это подтверждается один Ион изображения этих отдельных значения пептидов в рисунке 5 d-5F.
Рисунок 1: MALDI-IMS замороженных AD/УГА мозга разделе. Различные C-терминал усечение значения пептидов в AD, сопровождающих тяжелой УГА (пациент #3) отображаются в левой панели и элементы управления (пациент #9 на право и пациент #10 на все изображения слева) в правой панели. Aβ1-36-Aβ1-41 залегают преимущественно в лептоменингеальных кровеносных сосудов, в то время как Aβ1-42 и Aβ1-43 залегают в мозговой паренхимы как старческое бляшек в случае #3, хотя не было сигнала управления пациентов мозги (случаи #9 и #10). Резолюция = 100 мкм. Шкалы бар = 5 мм. Эта цифра была изменена с разрешения Какудский et al.21. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2: MALDI-IMS замороженных AD/УГА мозг разделов и прилегающих затылочной коры от AD мозги. (A - C) замороженные разделы мозга AD/УГА и (D и E) смежные разделы затылочной коры от AD мозги были иммунной окрашенных и сосредоточена на артериолы и мозговой паренхимы, с использованием антител против Aβ40 (D: BA27) или Aβ42 (E: анти Aβ42 поликлональных). Оба анализы показали, что Aβ40 преференциально хранение в лептоменингеальных кровеносных сосудов (стрелки на панели D) и артериол в субарахноидальное пространство и мозговой паренхимы, образуя УГА. В противоположность этому Aβ42 главным образом на хранение в СПС. Для IMS, резолюции = 100 мкм. Шкалы бар = 5 мм (A, Bи C) = 5 мм, 500 (D и E). Эта цифра была изменена с разрешения Какудский et al.21. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3: MALD-IMS замороженных AD/УГА мозг секции (пациент #3) с разрешением 40 µm. Различные C- и N-терминала усекается и изменение значения пептидов в AD сопровождающих тяжелой УГА (пациент #3). Aβ1-36-Aβ1-41 преференциально на хранение в лептоменингеальных кровеносных сосудов, в то время как Aβ1-42 и Aβ1-43 залегают в мозговой паренхимы как старческое бляшек. Масштаб баров = 1 мм (A-B), 2 (вверху слева). Резолюция = 40 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 4: MALDI-IMS замороженных AD/УГА мозг секции (пациент #3) с разрешением 20 мкм. Эта панель показывает различные C- и N-терминала усекается и изменение значения пептидов в AD сопровождающих тяжелой УГА (пациент #3). Aβ1-36-Aβ1-41 преференциально на хранение в лептоменингеальных кровеносных сосудов, в то время как Aβ1-42 и Aβ1-43 залегают в мозговой паренхимы как старческое бляшек. Масштаб баров = 200 мкм (a, b, c), 1 мм (вверху слева). Резолюция = 20 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 5: сегментация карта, получаемая MALDI-IMS замороженной секции мозга AD, показывает предполагаемые старческое налета, большой субарахноидальное судно структуры и малых Паренхиматозный артериол. (A) карта сегментации, полученные из анализа многофакторного изображения данных MALDI-IMS. (B) Bisecting k средства кластеризации анализа выявленных налета как и сосуд подобных структур в затылочной коре. Кластеры и каркасов и их отношения отображаются как узлы (e.g.,1-0-0). (C) различные значения пептид локализации шаблонов, напоминающих таблички (синий), субарахноидальное судов (зеленый) и структуры артериолы (красный). Обратите внимание, что несколько красных кластеров также распространяются в субарахноидальное пространство. Это подтверждается один Ион образы эти отдельные значения пептиды с разрешением 20 мкм: (D) значения 1-40, значения 1-41, (Е) и (F) значения 1-42. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Дело | Пол | Возраст в момент смерти | Браак SP | УГА |
1 | M | 83 | C | 0.5 |
2 | M | 88 | C | 1 |
3 | M | 84 | C | 2 |
4 | M | 78 | C | 1 |
5 | M | 83 | C | 1 |
6 | M | 84 | O | 0 |
7 | M | 78 | O | 0 |
8 | M | 70 | O | 0 |
9 | M | 73 | O | 0 |
10 | M | 81 | O | 0 |
Таблица 1: клинические и патологические данные AD с УГА случаев и возрасте SP O предметов. Человека корковых образцов для IMS и МГС были получены из мозга банка в Токио Метрополитен Института геронтологии. Каждый мозг образец был взят из затылочной коры пяти пациентов AD и пять элементов управления, соответствует возрасту. Степени амилоида осаждения как показывает значения моноклональных антител определяется Браак SP (амилоид) этапов. На стадии O есть почти не старческий бляшки во всем isocortex. На этапе C страдают практически все области isocortical. Мозги AD неизменны на этапе C. Эта таблица была изменена с разрешения Какудский et al.21.
Здесь мы продемонстрировали подробный протокол и результаты визуализации значения и его изоформы от нескольких autopsied мозги с AD и УГА с MALDI-IMS. Осаждения профиль Aβs резко изменилось с Aβ1-42 на его вариации N - и C-терминала. Aβ1-41 была впервые выявленных и визуализирована в человеческий мозг с нынешним протоколом и была дополнительно подтверждена с IHC21. Учитывая, что морфология хранение значения в IMS с высоким разрешением анализ (20 мкм) должны быть в хорошем согласии с МГС, IMS и IHC равной степени способствуют отличительные значения вкладов их расположение и содержание белка, а также их морфологии. Как описано здесь весь эксперимент проводился в затылочной коре, изучая локализация различных видов бета амилоида во всех регионах мозга будет обобщена с будущие эксперименты с использованием текущего протокола.
Важнейшие шаги в рамках Протокола являются шаги подготовки ткани для получения эффективной ионизации агрегированных белков в тканях мозга человека. Для поглощения лазерной энергии и побудить десорбции и ионизации аналитов требуется слой матрицы. В этом процессе Секция весь ткань покрыта однородно маленькие кристаллы. Однородная cocrystallization аналита с матрица имеет решающее значение для высокой чувствительности и артефакт свободных изображений. Каждый из трех спрей методов имеет свои преимущества. Покрасочная покрытие является одним из наиболее часто используемых методов. Аэрограф удобно; Однако это требует умелого операции. Как точные и воспроизводимые Экспериментальная техника имеет важное значение, рекомендуется использовать Ультразвуковые распылители или автоматическое распыление, как описано в текущем протоколов. Отношении ультразвуковой распылитель он будет не быть под влиянием влажности и температуры в помещении потому, что он является впрыскивается в камеру. Тем временем с автоматической опрыскиватель, получается относительно хорошо сохранившихся пространственное разрешение с хорошей воспроизводимостью. Как правило пространственным разрешением, полученные с трех методов увеличения порядка 1) распылитель, 2) автоматическое устройство и 3) Ультразвуковые распылители.
Самое главное этот протокол был первоначально создан для обнаружения и визуализации Aβs в мозг человека autopsied образцов. Визуализация Aβs с MALDI-IMS для APP23 мышей, который генерируется как животной модели объявления, основанные на шведском типа мутации человеческой приложения, ранее сообщал другими с существующего метода18,19. Однако бывший протокол применяется к APP23 не был достаточно, чтобы визуализировать значения его латеральное разрешение и чувствительность. Более ранних работах обсуждали, что высокие значения концентрации за пределами границ ткани являются явно артефакты в APP23 изображений с их протокол18,19. Это означает, что так называемые «пятно» между реальным СФМ и IMS изображения из-за добычи шаг матрицы было неизбежным с визуализации MALDI-типа. Однако в текущем протоколе, размытия исчез, и каждый спектра представлял каждый один SP в паренхиме мозга.
Как показано здесь, мы можем проследить Aβ1-41 для в первый раз в AD и УГА мозги MALDI-IMS, а также с МГС, с специфическим антителом собственного поколения21. Согласно модели обработки значения Aβ1-38 вытекает из Aβ1-45 через Aβ1-42, в то время как Aβ1-41, является производным от Aβ1-45, γ-secretase ступенчатой расщепления27,28,,2930,31 . Это означает, что текущий протокол поддерживает эту модель. Что касается ограничения этой техники мы должны учитывать неоднородность образцов от мозга человека вскрытия. Наиболее важным этапом, в некотором смысле, является оценка квалифицированных вскрытие мозговой ткани с этической доказательство. С нынешнего протокола в тех тканях мозга квалифицированных вскрытия MALDI-IMS индивидуально можно отслеживать весь распределение сложных молекул, имеющих несколько модификаций, а также неизвестных factor(s), регулирующих патогенеза AD, что еще предстоит определены. Кроме того в понимании общий патогенез различных невропатология в возрасте мозг человека, он должен быть возможным принять MALDI-IMS как стандартный подход, в сочетании с клинической, генетические и патологических наблюдений в неврологических заболеваний .
Еще один важный шаг MALDI-IMS является процесс интеллектуального анализа данных из полученного набора данных, который всегда много времени. Интеллектуального анализа данных вручную каждого пик распределения требует от пользователей, нажмите кнопку через каждое изображение и искать дистрибутивов, которые могут сопоставлять морфологии анализируемого образца. Автоматическая пространственных Сегментация может использоваться в качестве первого шага данных интеллектуального анализа, обеспечивая обзор набора данных и позволяя быстрое обнаружение характерных особенностей. В этом подходе статистически определяются сходства между спектрами данного региона, и аналогичные спектры группируются в один кластер. Все пикселы цветом согласно их назначение кластера (Рисунок 5). В настоящем исследовании AD/УГА область интересов является пространство значения осаждения в Паренхиматозный налета и субарахноидальное и Паренхиматозный сосудистых структур. Две отличительные пики, которые были дополнительно подтверждена с МГС были m/z значения из Aβ1-40 и Aβ1-4221. Таким образом это легко найти colocalized m/z с Aβ1-40 и Aβ1-42, который уже был аннотированный N - и C-терминал усеченного значения, а также неизвестные пептиды, для дальнейшего анализа.
Веллер и коллеги сообщили, что значения накапливается в стенах судна, более вокруг артерий, чем вокруг вен21. Кроме того было предложено, что межклеточной жидкости (ISF) включает в себя Aβs, экскретируется из мозговой паренхимы к лимфатических узлов через периваскулярной дренажные пути22,23,24,25 ,26. Текущий протокол для создания карты сегментации, основанный на наборе данных MALDI-IMS на 20 мкм резолюции поддерживает возможное существование периваскулярной дренажа путей головного мозга (рис. 5), которые в значительной степени способствовать ВГА в AD21 , 32. Кроме того, мы можем обнаружить маркер белки colocalized с налета и субарахноидальное сосудистую путем вычисления корреляции каждого значения m/z. В понимании общий патогенез различных невропатология в возрасте мозг человека, он должен быть возможным принять MALDI-IMS как мощный подход в сочетании с установленным данным ИГХ клинических, генетических и патологических наблюдений в неврологических заболевания.
Авторы не имеют ничего сообщать.
Эта работа частично поддержали целевые субсидии для проведения научных исследований в инновационных областях (старение мозга белка и слабоумие управления 26117004; м.и. и т.м.). Это исследование, частично, было поддержано стратегической программы исследований для мозга наук от японского агентства для медицинских исследований и развития (AMED). Все эксперименты проводились в соответствии с руководящими принципами прибытия.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены