Выполнив все обходы и получив флуоресцентные изображения проростков арабидопсиса, откройте экспериментальные данные в программном обеспечении анализатора. Чтобы создать маску лотка, выберите опцию Создать новый тип лотка. Затем выберите номер изображения в круге и нажмите «Загрузить изображение» в верхней части экрана.
Далее, чтобы войти в новый режим фигуры, нажмите на любую из множества кнопок, представляющих различные инструменты рисования фигур. Нарисуйте интересующие области на изображении пластины. Выберите различные генотипы на табличке и дайте им соответствующие названия.
Нажмите клавишу Escape, чтобы выйти из режима фигуры. Затем нажмите кнопку Сохранить тип лотка, чтобы сохранить сгенерированную маску лотка. Теперь перейдите к опции изменить по типу лотка и выберите сгенерированную маску.
Для генерации маски растения с высокой точностью используйте изображение, полученное после 180 минут измерения Чтобы установить минимальное пороговое значение интенсивности флуоресцентного сигнала, удалите галочку из автоматического порога. Установите вручную пороговое значение равным нулю и нажмите кнопку предварительного просмотра. Далее выбираем раунд 91.
Нажмите кнопку «Обновить предварительный просмотр» и проверьте, покрывает ли маска массива все генотипы на изображении пластины. Настройте фон изображения и используйте параметры цвета, чтобы выделить маску лотка на изображении пластины. Нажимаем «Выполнить», ставим галочку только на 91 раунде и начинаем анализ.
Как только на экране появится меню «Готово», выберите выполненный раунд и нажмите «Переключить анализатор», чтобы проанализировать данные и экспортировать данные за этот конкретный момент времени. Затем нажмите на значок открытой части экспорта, чтобы извлечь файлы из экспортированного архива. В режиме настройки локального анализа нажмите кнопку Создать новый тип лотка, чтобы войти в меню конструктора масок.
Затем нажмите «Загрузить изображение» и выберите четвертый раунд. В правом верхнем углу экрана нажмите «Загрузить из файла» и загрузите XSEL-файл. Изображение пластины появится с примененной маской лотка.
Введите имя маски растения и выберите Тип лотка магазина. Примените маску растения, выбрав ее имя в опции Изменить по типу лотка. Затем снимите флажок Автоматический порог, чтобы разрешить ручное управление пороговыми значениями.
В меню предварительного просмотра измените значение порога с низкого на высокое до тех пор, пока сгенерированная маска растения не будет идеально соответствовать интересующей области в каждом из генотипов. Затем выберите последний раунд, чтобы проверить, подходит ли маска ко всем раундам измерений. Чтобы выполнить анализ для всех измерительных циклов, нажмите кнопку «Выполнить», а затем начать анализ.
По сравнению с контрольными условиями в присутствии 6-бензиламинопурина, заметные различия наблюдались во время экспоненциальной фазы синтеза хлорофилла у проростков арабидопсиса дикого типа.
