Анализ изображений светлого поля и флуоресцентных изображений срезов мозга мыши для эпона после встраивания коррелятивного света и электронной микроскопии

Для начала сделайте снимки светлопольных и флуоресцентных изображений тканей мозга мышей, экспрессирующих mScarlet. Найдите исходные данные, чтобы создать навигационную карту из нескольких изображений Brightfield с различными полями зрения в ImageJ. Затем откройте ImageJ, перейдите по плагинам, нажмите «Сшивание» и выберите «Сшивание сетки» или «Сшивка коллекций».

Щелкните тип сетки змейки по столбцу, выберите порядок вверх и влево и нажмите установить размер среза. Перейдите к выбору пути к данным и нажмите «Задать имя файла», а затем проверьте отображение слияния. Чтобы импортировать последовательные изображения Brightfield определенной ячейки, нажмите «Файл» и выберите «Импорт», а затем последовательность изображений.

Для проекции суммарной интенсивности этих изображений перейдите к изображению, выберите стеки, щелкните Z-проекцию, а затем выберите итоговые срезы. Затем выберите «Редактировать» и нажмите «Инвертировать», чтобы инвертировать проекционное изображение суммарной интенсивности и улучшить видимость наночастиц золота. Затем импортируйте последовательные флуоресцентные изображения.

Чтобы создать проекционное изображение суммарной интенсивности, щелкните изображение и выберите Стеки. Затем перейдите в Z-проекцию, нажмите «Суммарные срезы» и сохраните изображения в формате TIF. Откройте проекционные изображения суммарной интенсивности как для светлого поля, так и для флуоресцентного изображения.

Перейдите к изображению, выберите цвет и нажмите кнопку Объединить каналы, чтобы объединить проекцию суммарной интенсивности изображения Brightfield с изображением Fluorescence. После этого выберите изображение и нажмите «Тип», а затем «Цвет RGB», чтобы преобразовать формат составного изображения в RGB. Наночастицы золота будут казаться зелеными, а флуоресцентный белок — красными.

Затем сохраните изображение в виде файла TIF.