После прогона LCMS экстрактов корней растений изучите общую ионную хроматограмму сканирований Q1 и Q3, включая сканирование ионов продуктов, зависящее от данных. Наблюдайте за родительской массой обильных ионов с тропановыми алкалоидоподобными свойствами, включая массу менее 500 Дальтон для положительно заряженного иона, как правило, четного числа. Время удержания от двух до 22 минут, а фрагменты соответствуют значениям основного заряда, соответствующим тропановым алкалоидам.
Изучите хроматограмму или канал сканирования ионов-предшественников, специально предназначенный для задающего заряда 124, и определите, какие пики или ионы при каком времени удержания образуют этот конкретный фрагмент. Нажимайте скан за сканированием, просматривайте хроматограмму и просматривайте полные спектры MS-MS из сканирования ионов продукта, зависящего от данных, особенно для менее распространенных веществ. Затем проанализируйте хроматограммы ионного сканирования прекурсора вместе для ведущего заряда 122 и 140, которые указывают на дизамещенные тропановые алкалоиды, и основного заряда 138 и 156, указывающих на тризамещенные тропановые алкалоиды.
Изучите хроматограмму сканирования нейтральных потерь или каналы для заряда 160 и 166. Определите, какие пики или ионы приводят к нейтральным потерям, и отметьте время их удержания. Кликайте скан за сканированием по хроматограмме и сравнивайте с индукцией ионного сканирования в зависимости от данных, особенно для менее распространенных веществ.
Используйте комбинацию данных сканирования ионов предшественников и сканирования нейтральных потерь, подкрепленных результатами сканирования ионов продукта, зависящими от данных, для создания предполагаемых аннотаций наблюдаемых алкалоидов. Начните с наименьшей массы тропана, затем добавьте потери нейтрали и учтите оставшуюся массу. Сравните аннотации алкалоидов с теми, которые описаны в литературе, чтобы определить схему замещения тропановых алкалоидов.
Кроме того, для подтверждения используйте коммерчески доступные стандарты распространенных тропановых алкалоидов. Полная хроматограмма Q1 экстракта корня дурмана метель показала различные тропановые алкалоиды с различным содержанием. Характеристики основного заряда 124, 122, 140, 138 и 156 указывали на наличие тропановых алкалоидов.
Многие из этих тропановых алкалоидов были ацетилированными, тиглоилированными или полученными из фенольной или тропной кислоты, о чем свидетельствуют сигналы на хроматограммах сканирования нейтральных потерь. Использование спектральных данных позволило аннотировать конкретные алкалоиды, в частности, идентифицировать соединение с видимой массой основного заряда 224. Метод позволил вывести сложную структуру через характер ее фрагментации и нейтральных потерь, подтвердив наличие тиглоильных групп в качестве замещений.
Исследование водного экстракта метанола из семян дурмана странчатого дала полную пиковую хроматограмму сканирования Q1, идентифицировав высокораспространенный монозамещенный тропановый алкалоид, вероятно, гиосциамин. Спектр MS-MS с высоким разрешением также позволяет идентифицировать новые алкалоиды из семян Datura stramonium.
