Анализ различных ориентаций эмбрионов данио-рерио в хорионе с помощью многоракурсной визуализации

Начните со сборки держателя для образцов, чтобы найти эмбрион. Вставьте трубку с эмбрионами непосредственно в капилляр нужного диаметра. Теперь начните сканирование в реальном времени и осуществляйте навигацию с помощью навигатора образцов для выбора первого вида.

Задайте интервал между срезами, за которым последуют первый и последний срезы Z-стека в этом представлении. Измените угол в навигаторе образцов для перехода к следующему виду. Настройте Z-стек для второго представления и добавьте информацию в диалоговом окне с несколькими представлениями.

После установки всех видов сохраните эту информацию в текстовом файле, содержащем информацию о Z-стеке, координаты трубы и спецификации угла для каждого вида. Затем очистите все позиции в диалоговом окне с несколькими представлениями. Затем перейдите в другую Y-координату вдали от эмбриона, где видны бусины.

Добавьте эту позицию в диалоговое окно с несколькими видами и сохраните ее в новом текстовом файле. Затем перейдите в папку, где сохранены текстовые файлы, и скопируйте файл Embryo Positions в новый файл с именем Beads Positions. Замените координату Y для всех видов в файле Положения бусин на координату Y из файла Бисер Y.

После этого вернитесь в программное обеспечение для работы с изображениями и загрузите файл «Положения бусин». Если опция временных рядов активирована, выберите один цикл и начните эксперимент. Сохранять изображения бусин как бусины", чтобы регистрировать различные виды во время обработки изображений.

Затем очистите позиции и загрузите исходный файл Embryo Positions в программу, установите желаемое количество циклов с подходящим временным интервалом и начните эксперимент.