Профилирование эпитопов поверхностных белков на вирусных частицах с помощью мультиплексной стратегии двойного репортера

Протеомный анализ оболочечного вируса показал, что белки хозяина встраиваются в новообразованный вирус, влияя на репликацию, инфекционность и патогенез. Наши исследования сосредоточены на профилировании поверхностных белков в вирусных частицах для поиска ключевых элементов взаимодействия вируса и хозяина, что приводит к появлению новых мишеней для противовирусных препаратов и вакцин. Иммуноэлектронная микроскопия является единственным методом визуализации, позволяющим непосредственно визуализировать вирус, подавляющий белки.

Тем не менее, масс-спектрометрия, иммунозахват с помощью магнитных шариков и биометрия нового потока в настоящее время чаще используются для обеспечения более широкого протеомного профилирования и скрининга большого количества вирусных частиц. В нашем методе используются шарики Luminex с цветовой кодировкой и двойное лазерное считывание для иммунозахвата. Это позволяет проводить мультиплексное профилирование поверхностных белков хозяина на интактных вирионах и скрининг антител и противовирусных препаратов на нескольких вирусах и антигенах одновременно.

Масс-спектрометрия и аффинная протеомика являются мощными инструментами для идентификации как вирусных, так и родительских белков на поверхности вириона. Описываемая нами стратегия приведет к лучшему пониманию роли белков хозяина в вирусных частицах, что позволит проводить высокопроизводительное профилирование инфицированных образцов в различных экспериментальных установках.