DNAメチル化のバイオインフォマティクス分析へのサンプル調製:肥満および関連形質研究の関連戦略

肥満は生活習慣に直接関連しており、脂肪生成および脂質貯蔵プロセスの変化を引き起こす可能性のあるDNAメチル化変化と関連しており、疾患の発症に寄与する。我々は、肥満の有無にかかわらず、患者の選択からエピジェネティックなデータ分析までの完全なプロトコルを実証する。プロトコルのすべてのステップは、パイロットスタディでテストおよび検証されました。32人の女性がこの研究に参加し、15人がボディマス指数(BMI)(45.1 ± 5.4kg/^m2)に従って肥満に分類された。17人がBMIに従って肥満なしに分類された(22.6±1.8kg/^m2)。肥満の群では、脂肪量に関連する564のCpGサイトが線形回帰分析によって同定された。CpGサイトはプロモーター領域にあった。鑑別解析では、肥満患者において470のCpGs低メチル化部位と94の高メチル化部位が見つかった。最も低メチル化された濃縮経路は、 RUNX、 WNT シグナル伝達、および低酸素症に対する応答であった。高メチル化経路は、インスリン分泌、グルカゴンシグナル伝達、および^Ca2+に関連していた。我々は、このプロトコルがDNAメチル化パターンおよび形質関連DNAメチル化を効果的に同定したと結論付ける。これらのパターンは、脂肪生成および脂質貯蔵に影響を及ぼす遺伝子発現の変化と関連している可能性がある。その結果、肥満のライフスタイルがヒトDNAのエピジェネティックな変化を促進する可能性があることが確認されました。