dna-based-fish-species-identification-protocol

DNA-based Fish Species Identification Protocol

We have developed a fast, simple, and accurate DNA-based screening method to identify the fish species present in fresh and processed seafood samples. ...

Agilent Technologies

&#x83B7;&#x5F97;&#x53EF;&#x9760;&#x548C;&#x53EF;&#x91CD;&#x73B0;&#x4E24;&#x8272;&#x5FAE;&#x9635;&#x5217;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x662F;&#x6781;&#x5176;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x7406;&#x89E3;&#x5728;&#x8702;&#x7A9D;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E0A;&#x6240;&#x4F5C;&#x7684;&#x6270;&#x52A8;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x610F;&#x4E49;&#x3002;&#x82AF;&#x7247;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x3001; RNA &#x5236;&#x5907;&#x548C;&#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x6761;&#x4EF6;&#x548C;&#x6570;&#x636E;&#x91C7;&#x96C6;&#x548C;&#x5206;&#x6790;&#x662F;&#x96BE;&#x4EE5;&#x540C;&#x65F6;&#x63A7;&#x5236;&#x7684;&#x53D8;&#x91CF;&#x3002;&#x6709;&#x7528;&#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#xFF0C;&#x7528;&#x4E8E;&#x76D1;&#x6D4B;&#x548C;&#x63A7;&#x5236; experimental &#x95F4;&#x53D8;&#x5F02;&#x662F;&#x666E;&#x904D;&#x5F15;&#x7528; RNA (URR)&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5728;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x82AF;&#x7247;&#x63A2;&#x9488;&#x4F4D;&#x7F6E; (&#x73B0;&#x8D27;) &#x6742;&#x4EA4;&#x4FE1;&#x53F7;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x4E0E;&#x5236;&#x5B9A;&#x3002;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x53C2;&#x8003; RNA &#x9776;&#x5411; RNA &#x7684;&#x6BD4;&#x7387;&#x6D4B;&#x91CF;&#x5728;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x70B9;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E0D;&#x662F;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7EDD;&#x5BF9;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5F3A;&#x5EA6;&#xFF0C;&#x964D;&#x4F4E;&#x53D8;&#x5F02;&#x6027;&#x7684;&#x6B63;&#x5E38;&#x5316;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F93;&#x51FA;&#x7684;&#x4EFB;&#x4F55;&#x4E24;&#x4E2A;&#x989C;&#x8272;&#x6742;&#x4EA4;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x3002;

&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x6807;&#x51C6;&#x82AF;&#x7247;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7684;&#x666E;&#x904D;&#x5F15;&#x7528; RNA&#x3002;

Obtaining reliable and reproducible two-color microarray gene expression data is critically important for understanding the biological significance of perturbations made on a cellular system. Microarray design, RNA preparation and labeling, hybridization conditions and data acquisition and analysis are variables difficult to simultaneously control. A useful tool for monitoring and controlling intra- and inter-experimental variation is Universal Reference RNA (URR), developed with the goal of providing hybridization signal at each microarray probe location (spot). Measuring signal at each spot as the ratio of experimental RNA to reference RNA targets, rather than relying on absolute signal intensity, decreases variability by normalizing signal output in any two-color hybridization experiment.

Universal Reference RNA as a standard for microarray experiments.

Obtention de donn&eacute;es fiables et reproductibles bicolore microarray d&#39;expression g&eacute;nique est essentiel pour comprendre l&#39;importance biologique des perturbations apport&eacute;es sur un syst&egrave;me cellulaire. Conception de microarray, pr&eacute;paration d&#39;ARN et l&#39;&eacute;tiquetage, l&#39;analyse et acquisition de donn&eacute;es et les conditions de l&#39;hybridation sont variables difficiles &agrave; contr&ocirc;ler simultan&eacute;ment. Un outil utile pour la surveillance et le contr&ocirc;le de la variation intra - et inter - experimental est universel r&eacute;f&eacute;rence ARN (URR), d&eacute;velopp&eacute; dans le but de fournir des signaux d&#39;hybridation &agrave; chaque emplacement de sonde de microarray (spot). Signal &agrave; chaque point de mesure comme le ratio du RNA exp&eacute;rimental de r&eacute;f&eacute;rence RNA cibles, plut&ocirc;t que de compter sur l&#39;intensit&eacute; du signal absolu, diminue la variabilit&eacute; en normalisant les signaux de sortie dans toute exp&eacute;rience d&#39;hybridation de deux couleurs.

ARN de r&eacute;f&eacute;rence universelle comme une norme pour les exp&eacute;riences sur biopuces.

Universal-Referenz-RNA als Standard f&#xFC;r die Microarray-Experimente.

Ottenere dati di espressione genica microarray di due colori affidabile e riproducibile &egrave; criticamente importante per comprendere il significato biologico di perturbazioni fatta su un sistema cellulare. Microarray design, preparazione di RNA e di etichettatura, analisi e acquisizione di dati e le condizioni di ibridazione sono variabili difficili da controllare contemporaneamente. Un utile strumento di monitoraggio e controllo variazione intra - e inter - experimental &egrave; universale riferimento RNA (URR), sviluppato con l&#39;obiettivo di fornire il segnale di ibridazione su ciascuna postazione sonda microarray (spot). Segnale in ogni punto di misura come il rapporto tra RNA sperimentale al target di riferimento RNA, piuttosto che basarsi sull&#39;intensit&agrave; del segnale assoluto, diminuisce variabilit&agrave; normalizzando l&#39;uscita del segnale in qualsiasi esperimento di ibridazione di due colori.

RNA di riferimento universale come uno standard per gli esperimenti di microarray.

&#x4FE1;&#x983C;&#x6027;&#x3068;&#x518D;&#x73FE;&#x6027;&#x306E;&#x3042;&#x308B; 2 &#x8272;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9; &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3067;&#x4F5C;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x6442;&#x52D5;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x610F;&#x7FA9;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30C7;&#x30B6;&#x30A4;&#x30F3;&#x3001;RNA &#x306E;&#x6E96;&#x5099;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30E9;&#x30D9;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x4EA4;&#x914D;&#x306E;&#x6761;&#x4EF6;&#x3068;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x96C6;&#x9332;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x89E3;&#x6790;&#x5909;&#x6570;&#x3092;&#x540C;&#x6642;&#x306B;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306F;&#x56F0;&#x96E3;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x76E3;&#x8996;&#x304A;&#x3088;&#x3073; experimental &#x9593;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x4FBF;&#x5229;&#x306A;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x666E;&#x904D;&#x7684;&#x306A;&#x53C2;&#x7167; RNA &#xFF08;&#x5404;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x306E;&#x5834;&#x6240; &#xFF08;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#xFF09; &#x3067;&#x4EA4;&#x914D;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x76EE;&#x6A19;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x958B;&#x767A; URR&#xFF09;&#x3001;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x5404;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3092;&#x53C2;&#x7167; RNA &#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684; RNA &#x306E;&#x6BD4;&#x7387;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3001;&#x7D76;&#x5BFE;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5F37;&#x5EA6;&#x306B;&#x983C;&#x3089;&#x305A;&#x5909;&#x52D5;&#x4FE1;&#x53F7;&#x51FA;&#x529B;&#x4EFB;&#x610F; 2 &#x8272;&#x4EA4;&#x914D;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3067;&#x306E;&#x6B63;&#x898F;&#x5316;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6A19;&#x6E96;&#x3068; RNA&#x3002;

&#xC548;&#xC815;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xC7AC;&#xD604; 2 &#xC0C9; microarray &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xD604; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xAC00;&#xC838;&#xC624;&#xAE30; &#xBB3C;&#xACB0; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC801; &#xC758;&#xBBF8;&#xB97C; &#xC774;&#xD574; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC911;&#xC694; &#xD558;&#xB2E4;. Microarray &#xB514;&#xC790;&#xC778;, RNA &#xC900;&#xBE44;&#xC640; &#xB77C;&#xBCA8;, &#xAD50; &#xC7A1; &#xBC0F; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC218;&#xC9D1; &#xBC0F; &#xBD84;&#xC11D;&#xC740; &#xB3D9;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xC81C; &#xD558;&#xAE30; &#xC5B4;&#xB824;&#xC6B4; &#xBCC0;&#xC218;. &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130;&#xB9C1; &#xBC0F; &#xB0B4;&#xBD80; &#xBC0F; &#xB610;&#xB294; experimental &#xBCC0;&#xD615; &#xC81C;&#xC5B4;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xC720;&#xC6A9;&#xD55C; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xB294; &#xBC94;&#xC6A9; &#xCC38;&#xC870; RNA (URR), &#xAC01; microarray &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xC704;&#xCE58; (&#xC790;&#xB9AC;)&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD50; &#xC7A1; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C; &#xBAA9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC1C;&#xBC1C;. &#xCC38;&#xC870; RNA &#xB300;&#xC0C1; &#xC2E4;&#xD5D8; RNA&#xC758; &#xBE44;&#xC728;&#xB85C; &#xAC01; &#xC790;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xCE21;&#xC815;, &#xC808;&#xB300; &#xC2E0;&#xD638; &#xAC15;&#xB3C4;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xACE0; &#xAC10;&#xC18C; &#xBCC0;&#xD654; &#xC5B4;&#xB5A4; &#xB450; &#xC0C9; &#xAD50; &#xC7A1; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2E0;&#xD638; &#xCD9C;&#xB825;&#xC744; &#xC815;&#xC0C1;&#xD654; &#xD558; &#xC5EC;.

Microarray &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD45C;&#xC900; &#xBC94;&#xC6A9; &#xCC38;&#xC870; RNA.

Obtenci&oacute;n de datos de expresi&oacute;n gen&eacute;tica fiable y reproducible microarray bicolor es de vital importancia para entender el significado biol&oacute;gico de las perturbaciones en un sistema celular. Dise&ntilde;o de microarrays, preparaci&oacute;n de RNA y etiquetado, an&aacute;lisis y adquisici&oacute;n de datos de hibridaci&oacute;n son variables dif&iacute;ciles de controlar simult&aacute;neamente. Una herramienta &uacute;til para el seguimiento y control de variaci&oacute;n intra - y inter - experimentales es Universal referencia RNA (URR), desarrollado con el objetivo de dar la se&ntilde;al de hibridaci&oacute;n en cada ubicaci&oacute;n de la sonda de microarrays (punto). Se&ntilde;al en cada punto de medici&oacute;n como el cociente de ARN experimental a los objetivos de RNA de referencia, en lugar de depender de la intensidad de la se&ntilde;al absoluta, disminuye la variabilidad por la normalizaci&oacute;n de la se&ntilde;al de salida en cualquier experimento de hibridaci&oacute;n de dos colores.

RNA de referencia universal como un est&aacute;ndar para los experimentos de microarrays.

&#x6211;&#x4EEC;&#x5DF2;&#x8BC4;&#x5BA1; RNA &#x6EF4;&#x5B9A;&#x6837;&#x54C1;&#x82AF;&#x7247;&#x5E73;&#x53F0;&#x7684;&#x6027;&#x80FD;&#x548C;&#x4E0D;&#x540C;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x65B9;&#x6CD5;&#x53D6;&#x5F97;&#x7684;&#x6210;&#x679C;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x8FDB;&#x884C;&#x8BC4;&#x4F30;&#x7684;&#x5B9E;&#x7528;&#x7684;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x82AF;&#x7247;&#x8D28;&#x91CF;&#x63A7;&#x5236;&#x9879;&#x76EE;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x67E5;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E24;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684; RNA &#x6837;&#x672C;&#x548C;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x6DF7;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x793A;&#x4F8B;&#x7684;&#x4E94;&#x4E2A;&#x5546;&#x4E1A;&#x82AF;&#x7247;&#x5E73;&#x53F0;&#x7684;&#x6027;&#x80FD;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4FA7;&#x91CD; 12,091 &#x57FA;&#x56E0;&#x5171;&#x540C;&#x8DE8;&#x6240;&#x6709;&#x5E73;&#x53F0;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x6B63;&#x786E;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x53CD;&#x5E94;&#x68C0;&#x6D4B;&#x6837;&#x672C;&#x4E2D;&#x7684;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5E73;&#x53F0;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x6CE8;&#x610F;&#x5230;&#x7531;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x6BD4;&#x7387;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#x5168;&#x7403;&#x504F;&#x79BB;&#x4E86;&#x3002;&#x4FE1;&#x4F7F; RNA &#x76F8;&#x5BF9;&#x91CF;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x53EF;&#x4EE5;&#x89E3;&#x91CA;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5DEE;&#x5F02;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E24;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7ACB;&#x6837;&#x672C;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x603B; RNA &#x7684;&#x4E00;&#x5C0F;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x8DE8;&#x5E73;&#x53F0;&#x7684;&#x5B9A;&#x6027;&#x548C;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5BF9;&#x5E94;&#x5F88;&#x9AD8;&#x3002;&#x603B;&#x4E4B;&#xFF0C;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x6837;&#x54C1;&#x53EF;&#x89C6;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x4EC5;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BC4;&#x4F30;&#x82AF;&#x7247;&#x5E73;&#x53F0;&#x7684;&#x6027;&#x80FD;&#x548C;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E00;&#x4E9B;&#x57FA;&#x7840;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x793A;&#x4F8B;&#x3002;

&#x4F7F;&#x7528; RNA &#x6837;&#x54C1;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x4EE5;&#x8BC4;&#x4F30;&#x82AF;&#x7247;&#x5E73;&#x53F0;&#x6027;&#x80FD;&#x548C;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x6280;&#x672F;&#x3002;

We have assessed the utility of RNA titration samples for evaluating microarray platform performance and the impact of different normalization methods on the results obtained. As part of the MicroArray Quality Control project, we investigated the performance of five commercial microarray platforms using two independent RNA samples and two titration mixtures of these samples. Focusing on 12,091 genes common across all platforms, we determined the ability of each platform to detect the correct titration response across the samples. Global deviations from the response predicted by the titration ratios were observed. These differences could be explained by variations in relative amounts of messenger RNA as a fraction of total RNA between the two independent samples. Overall, both the qualitative and quantitative correspondence across platforms was high. In summary, titration samples may be regarded as a valuable tool, not only for assessing microarray platform performance and different analysis methods, but also for determining some underlying biological features of the samples.

Using RNA sample titrations to assess microarray platform performance and normalization techniques.

Nous avons &eacute;valu&eacute; l&#39;utilit&eacute; des &eacute;chantillons d&#39;ARN titrage pour &eacute;valuer les performances de la plate-forme &laquo; microarray &raquo; et l&#39;impact des m&eacute;thodes diff&eacute;rentes de normalisation sur les r&eacute;sultats obtenus. Dans le cadre du projet &laquo; microarray &raquo; contr&ocirc;le de la qualit&eacute;, nous avons &eacute;tudi&eacute; la performance de cinq plates-formes commerciales &laquo; microarray &raquo; &agrave; l&#39;aide de deux &eacute;chantillons ind&eacute;pendants d&#39;ARN et les deux m&eacute;langes de titrage de ces &eacute;chantillons. En se concentrant sur 12 091 g&egrave;nes communs sur toutes les plateformes, nous avons d&eacute;termin&eacute; la capacit&eacute; de chaque plate-forme pour d&eacute;tecter la r&eacute;ponse de titration correcte dans l&#39;ensemble des &eacute;chantillons. Globales d&eacute;viations par rapport &agrave; la r&eacute;ponse pr&eacute;vues par les ratios de titrage ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;es. Ces diff&eacute;rences pourraient s&#39;expliquer par les variations dans les quantit&eacute;s relatives de l&#39;ARN messager comme une fraction de l&#39;ARN total entre les deux &eacute;chantillons ind&eacute;pendants. Dans l&#39;ensemble, la correspondance &agrave; la fois qualitative et quantitative plates-formes &eacute;tait &eacute;lev&eacute;e. En r&eacute;sum&eacute;, les &eacute;chantillons de titration peuvent &ecirc;tre consid&eacute;r&eacute;es comme un outil pr&eacute;cieux, non seulement pour &eacute;valuer les performances &laquo; microarray &raquo; de la plate-forme et des m&eacute;thodes d&#39;analyse diff&eacute;rentes, mais aussi pour d&eacute;terminer certaines caract&eacute;ristiques biologiques sous-jacentes des &eacute;chantillons.

&Agrave; l&#39;aide de titrages &eacute;chantillon RNA afin d&#39;&eacute;valuer les techniques de microarray platform performance ainsi que la normalisation.

Wir beurteilten die N&uuml;tzlichkeit des RNS-Titration-Proben f&uuml;r die Bewertung von Microarray-Plattform-Performance und die Auswirkungen der verschiedenen Normalisierung Methoden auf die erzielten Ergebnisse. Im Rahmen des Projektes MicroArray Quality Control untersuchten wir die Leistung der f&uuml;nf kommerziellen Microarray Plattformen mit zwei unabh&auml;ngigen RNA-Proben und zwei Titrierung Mischungen dieser Proben. Konzentration auf gemeinsame 12.091 Gene f&uuml;r alle Plattformen, bestimmt wir die F&auml;higkeit jede Plattform, die richtige Titrierung-Antwort &uuml;ber die Proben zu erkennen. Globale Abweichungen von der Antwort vorausgesagten die Titrierung-Verh&auml;ltnisse wurden beobachtet. Diese Unterschiede k&ouml;nnten durch Schwankungen der relativen Anteile von Boten-RNA als Dezimalbruch total RNA zwischen den zwei unabh&auml;ngigen Stichproben erkl&auml;rt werden. Insgesamt war die qualitative und quantitative Korrespondenz &uuml;ber Plattformen hinweg hoch. Zusammenfassend k&ouml;nnen die Titrierung Proben als ein wertvolles Instrument, nicht nur f&uuml;r die Beurteilung der Microarray-Plattform-Performance und verschiedene Analyseverfahren, sondern auch zur Bestimmung einige zugrunde liegenden biologischen Eigenschaften der Proben angesehen werden.

Mithilfe von RNA-Probe-Titrationen Microarray-Plattform-Performance und Normalisierung-Techniken zu beurteilen.

Noi abbiamo valutato l&#39;utilit&agrave; dei campioni del RNA titolazione per valutare le prestazioni della piattaforma microarray e l&#39;impatto dei metodi differenti di normalizzazione sui risultati ottenuti. Come parte del progetto di controllo di qualit&agrave; di MicroArray, abbiamo studiato le prestazioni di cinque piattaforme microarray commerciali utilizzando due campioni indipendenti di RNA e due miscele di titolazione di questi campioni. Concentrandosi su 12.091 geni comuni in tutte le piattaforme, abbiamo determinato la capacit&agrave; di ogni piattaforma di individuare la risposta corretta titolazione attraverso i campioni. Sono state osservate globale deviazioni dalla risposta prevista per i rapporti di titolazione. Queste differenze potrebbero essere spiegate tramite le variazioni nella quantit&agrave; relativa di RNA messaggero come una frazione di RNA totale tra i due campioni indipendenti. Nel complesso, la corrispondenza qualitativa e quantitativa tra le piattaforme era alta. In sintesi, campioni di titolazione possono essere considerati come uno strumento prezioso, non solo per valutare le prestazioni della piattaforma microarray e metodi di analisi diversi, ma anche per la determinazione di alcune caratteristiche biologiche sottostante dei campioni.

Mediante titolazioni campione di RNA per valutare tecniche di prestazioni e di normalizzazione piattaforma microarray.

RNA &#x6EF4;&#x5B9A;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30D1;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x7D50;&#x679C;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x6B63;&#x898F;&#x5316;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E6;&#x30FC;&#x30C6;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C6;&#x30A3;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x54C1;&#x8CEA;&#x7BA1;&#x7406;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306E;&#x4E00;&#x74B0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;2 &#x3064;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F; RNA &#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3068; 2 &#x3064;&#x306E;&#x6EF4;&#x6DF7;&#x5408;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066; 5 &#x3064;&#x306E;&#x5546;&#x696D;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x6027;&#x80FD;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3067;&#x5171;&#x901A;&#x306E; 12,091 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x306B;&#x3001;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x6B63;&#x3057;&#x3044;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x5404;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x504F;&#x5DEE;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x6BD4;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x5FDC;&#x7B54;&#x304B;&#x3089;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x306F; 2 &#x3064;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x9593;&#x306E;&#x7DCF; RNA &#x306E;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x30E1;&#x30C3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B8;&#x30E3;&#x30FC; RNA &#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x7684;&#x306A;&#x91CF;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x307F;&#x3066;&#x3001;&#x5B9A;&#x6027;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x9593;&#x3067;&#x306F;&#x9AD8;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x8981;&#x7D04;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x306F;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30D1;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x89E3;&#x6790;&#x624B;&#x6CD5;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x57FA;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8CB4;&#x91CD;&#x306A;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x307F;&#x306A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3002;

RNA &#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x306F;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30FB; &#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30D1;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x6B63;&#x898F;&#x5316;&#x624B;&#x6CD5;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;

&#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; RNA &#xC801;&#xC815; &#xC0D8;&#xD50C; microarray &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xC131;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xB2E4;&#xB978; &#xC815;&#xADDC;&#xD654; &#xBC29;&#xBC95; &#xC5BB;&#xC740; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C; &#xC720;&#xD2F8;&#xB9AC;&#xD2F0; &#xD3C9;&#xAC00;&#xD55C;. MicroArray &#xD488;&#xC9C8; &#xAD00;&#xB9AC; &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xC758; &#xC77C;&#xD658;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; RNA &#xC0D8;&#xD50C; &#xBC0F; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC758; &#xB450; &#xC801;&#xC815; &#xD63C;&#xD569;&#xBB3C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; 5 &#xAC1C;&#xC758; &#xC0C1;&#xC5C5; microarray &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC758; &#xC131;&#xB2A5;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xACF5;&#xD1B5; 12,091 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xCD08;&#xC810;&#xC744;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD45C;&#xBCF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC62C;&#xBC14;&#xB978; &#xC801;&#xC815; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xAC01; &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xACB0;&#xC815;. &#xC801;&#xC815; &#xBE44;&#xC728;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC608;&#xCE21; &#xD558;&#xB294; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xD3B8;&#xCC28; &#xAD00;&#xCC30; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xCC28;&#xC774; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xCD1D; RNA&#xC758; &#xC77C;&#xBD80;&#xBD84;&#xC73C;&#xB85C; &#xBA54;&#xC2E0;&#xC800; RNA&#xC758; &#xC0C1;&#xB300;&#xC801;&#xC778; &#xC591; &#xBCC0;&#xD654; &#xD558; &#xC5EC; &#xC124;&#xBA85;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xC9C8;&#xC801;, &#xC591;&#xC801; &#xC11C;&#xC2E0;&#xC774; &#xB192;&#xC558;&#xB2E4;. &#xC694;&#xC57D; &#xD558;&#xC790;&#xBA74;, &#xC801;&#xC815; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC758; &#xC77C;&#xBD80; &#xB0B4;&#xBD80; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xACB0;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; microarray &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xC131;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC29;&#xBC95;, &#xD3C9;&#xAC00; &#xB300; &#xD55C; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xADC0;&#xC911; &#xD55C; &#xACF5;&#xAD6C;&#xB85C; &#xAC04;&#xC8FC; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

RNA &#xC0D8;&#xD50C; titrations&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; microarray &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xC131;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xD45C;&#xC900;&#xD654; &#xAE30;&#xBC95;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Hemos determinado la utilidad de las muestras de titulaci&oacute;n de RNA para evaluar la performance de la plataforma de microarrays y el impacto de m&eacute;todos diferentes de la normalizaci&oacute;n de los resultados obtenidos. Como parte del proyecto de Control de calidad de microarrays, investigamos la realizaci&oacute;n de cinco plataformas de microarrays comerciales utilizando dos muestras independientes de RNA y dos mezclas de valoraci&oacute;n de estas muestras. Enfocando 12.091 genes comunes en todas las plataformas, determinamos la capacidad de cada plataforma para detectar la respuesta correcta valoraci&oacute;n a trav&eacute;s de las muestras. Se observaron desviaciones globales de la respuesta predicho por los cocientes de la titulaci&oacute;n. Estas diferencias podr&iacute;an explicarse por variaciones en las cantidades relativas de ARN mensajero como una fracci&oacute;n del ARN total entre las dos muestras independientes. En general, la correspondencia cualitativa y cuantitativa en plataformas fue alta. En Resumen, las muestras de la titulaci&oacute;n pueden considerarse como una herramienta valiosa, no s&oacute;lo para evaluar la performance de la plataforma de microarrays y m&eacute;todos de an&aacute;lisis diferentes, sino tambi&eacute;n para determinar algunas caracter&iacute;sticas biol&oacute;gicas subyacentes de las muestras.

Uso de valoraciones de muestra de RNA para evaluar t&eacute;cnicas de rendimiento y normalizaci&oacute;n de plataforma de microarrays.

&#x8FC7;&#x53BB;&#x5341;&#x5E74;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x5F15;&#x8FDB;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7814;&#x7A76;&#x4EA7;&#x751F;&#x6DF1;&#x523B;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x4E0E;&#x4E0D;&#x540C;&#x6216;&#x5B8C;&#x5168;&#x77DB;&#x76FE;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x82AF;&#x7247;&#x5E73;&#x53F0;&#x6765;&#x5206;&#x6790;&#x76F8;&#x540C;&#x7684; RNA &#x6837;&#x54C1;&#xFF0C;&#x83B7;&#x5F97;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x51FA;&#x7248;&#x7269;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E86;&#x5173;&#x5207;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x53EF;&#x9760;&#x6027;&#x3002;&#x53D1;&#x8D77;&#x82AF;&#x7247;&#x8D28;&#x91CF;&#x63A7;&#x5236; (MAQC) &#x9879;&#x76EE;&#x6765;&#x89E3;&#x51B3;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x95EE;&#x9898;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x5176;&#x4ED6;&#x6027;&#x80FD;&#x548C;&#x6570;&#x636E;&#x5206;&#x6790;&#x95EE;&#x9898;&#x3002;&#x4ECE;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x5F15;&#x7528; RNA &#x6837;&#x54C1;&#x7684;&#x56DB;&#x4E2A;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x6C60;&#x4E0A;&#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x751F;&#x6210;&#x5728;&#x591A;&#x4E2A;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7AD9;&#x70B9;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x82AF;&#x7247;&#x548C;&#x66FF;&#x4EE3;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x5E73;&#x53F0;&#x3002;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x548C;&#x63A2;&#x9488;&#x6620;&#x5C04; MAQC &#x9879;&#x76EE;&#x80CC;&#x540E;&#x7684;&#x52AA;&#x529B;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A; intraplatform &#x4E00;&#x81F4;&#x6027;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7AD9;&#x70B9;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x9AD8;&#x8DE8;&#x7EA7;&#x522B;&#x7684; interplatform &#x7D22;&#x5F15;&#x65B9;&#x9762;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x8D44;&#x6E90;&#xFF0C;&#x8868;&#x793A;&#x4E3A;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x6846;&#x67B6;&#x82AF;&#x7247;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E34;&#x5E8A;&#x548C;&#x7BA1;&#x7406;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x4E2D;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B65;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x8D28;&#x91CF;&#x63A7;&#x5236; (MAQC) &#x9879;&#x76EE;&#x663E;&#x793A;&#x9664;-&#x548C; intraplatform &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6D4B;&#x91CF;&#x7684;&#x53EF;&#x91CD;&#x590D;&#x6027;&#x3002;

Over the last decade, the introduction of microarray technology has had a profound impact on gene expression research. The publication of studies with dissimilar or altogether contradictory results, obtained using different microarray platforms to analyze identical RNA samples, has raised concerns about the reliability of this technology. The MicroArray Quality Control (MAQC) project was initiated to address these concerns, as well as other performance and data analysis issues. Expression data on four titration pools from two distinct reference RNA samples were generated at multiple test sites using a variety of microarray-based and alternative technology platforms. Here we describe the experimental design and probe mapping efforts behind the MAQC project. We show intraplatform consistency across test sites as well as a high level of interplatform concordance in terms of genes identified as differentially expressed. This study provides a resource that represents an important first step toward establishing a framework for the use of microarrays in clinical and regulatory settings.

The MicroArray Quality Control (MAQC) project shows inter- and intraplatform reproducibility of gene expression measurements.

Durant la derni&egrave;re d&eacute;cennie, l&#39;introduction de la technologie des micror&eacute;seaux a eu un impact profond sur la recherche d&#39;expression g&eacute;nique. La publication d&#39;&eacute;tudes avec des r&eacute;sultats dissemblables ou tout &agrave; fait contradictoires, obtenues &agrave; l&#39;aide de puces diff&eacute;rentes plates-formes pour analyser des &eacute;chantillons d&#39;ARN identiques, a soulev&eacute; des pr&eacute;occupations quant &agrave; la fiabilit&eacute; de cette technologie. Le projet de contr&ocirc;le de la qualit&eacute; de &laquo; microarray &raquo; (MAQC) a &eacute;t&eacute; lanc&eacute; pour r&eacute;pondre &agrave; ces pr&eacute;occupations, mais aussi d&#39;autres probl&egrave;mes d&#39;analyse de performance et de donn&eacute;es. Expression donn&eacute;es sur quatre poules de titrage de deux &eacute;chantillons d&#39;ARN de r&eacute;f&eacute;rence distincts ont &eacute;t&eacute; produites sur plusieurs sites d&#39;essai en utilisant une vari&eacute;t&eacute; de plateformes technologiques de puces et autres. Nous d&eacute;crivons ici la conception exp&eacute;rimentale et les efforts de cartographie sonde derri&egrave;re le projet MAQC. Nous montrons intraplatform coh&eacute;rence &agrave; travers les sites de test, mais aussi un haut niveau de concordance interplatform en ce qui concerne les g&egrave;nes identifi&eacute;s comme diff&eacute;rentiellement exprim&eacute;. Cette &eacute;tude fournit une ressource qui repr&eacute;sente une premi&egrave;re &eacute;tape importante vers &eacute;tablissant un cadre pour l&#39;utilisation de puces &agrave; ADN dans des milieux cliniques et r&eacute;glementaires.

Le projet de contr&ocirc;le de la qualit&eacute; de &laquo; microarray &raquo; (MAQC) montre inter- et reproductibilit&eacute; d&#39;intraplatform des mesures d&#39;expression de g&egrave;ne.

In den letzten zehn Jahren hatte die Einf&uuml;hrung der Microarraytechnologie eine profunde Auswirkung auf Genforschung Ausdruck. Die Ver&ouml;ffentlichung von Studien mit unterschiedlicher oder ganz widerspr&uuml;chliche Ergebnisse, mit verschiedenen Microarray Plattformen um identische RNS-Proben zu analysieren hat Bedenken &uuml;ber die Zuverl&auml;ssigkeit dieser Technologie ge&auml;u&szlig;ert. Das MicroArray Quality Control (MAQC) Projekt wurde initiiert, um diese Bedenken, wie auch andere Leistung und Daten-Analyse-Probleme zu beheben. Ausdruck Daten auf vier Titrierung-Pools aus zwei unterschiedlichen RNA-Referenzproben wurden an mehreren Teststandorten, die mit einer Vielzahl von Microarray-basierte und alternative Technologieplattformen generiert. Hier beschreiben wir die Versuchsanordnung und die Sonde Zuordnung Bem&uuml;hungen hinter dem MAQC-Projekt. Wir zeigen Intraplatform Konsistenz Teststandorten sowie ein hohes Niveau der interplatform &Uuml;bereinstimmung in Bezug auf die Gene identifiziert als differenziell ausgedr&uuml;ckt. Diese Studie liefert eine Ressource, die einen wichtigen ersten Schritt zur Schaffung eines Ordnungsrahmens f&uuml;r die Nutzung von Microarrays in Krankenh&auml;usern und regulatorischen darstellt.

Das MicroArray Quality Control (MAQC)-Projekt zeigt, inter- und Intraplatform-Reproduzierbarkeit der Gen-Ausdruck-Messungen.

Nell&#39;ultimo decennio, l&#39;introduzione della tecnologia microarray ha avuto un profondo impatto sulla ricerca di espressione genica. La pubblicazione di studi con risultati complessivamente contraddittorie o dissimili, ottenute mediante microarray diverse piattaforme per analizzare i campioni di RNA identici, ha sollevato preoccupazioni circa l&#39;affidabilit&agrave; di questa tecnologia. Per risolvere questi problemi, come pure altri problemi relativi all&#39;analisi delle prestazioni e dei dati &egrave; stato avviato il progetto di controllo di qualit&agrave; di MicroArray (MAQC). Dati di espressione su quattro piscine di titolazione da due campioni di RNA di riferimento distinti sono stati generati in diversi siti di prova utilizzando una variet&agrave; di piattaforme tecnologiche basate su microarray e alternativi. Qui descriviamo il disegno sperimentale e gli sforzi di mappatura sonda dietro il progetto MAQC. Mostriamo intraplatform consistenza attraverso siti di prova, nonch&eacute; un alto livello di concordanza interplatform in termini di geni identificati come differenzialmente espresso. Questo studio fornisce una risorsa che rappresenta un primo passo importante verso l&#39;istituzione di un quadro per l&#39;uso dei microarrays in contesti clinici e normativi.

Il progetto di controllo di qualit&agrave; di MicroArray (MAQC) mostra inter- e intraplatform riproducibilit&agrave; delle misurazioni di espressione genica.

&#x6700;&#x5F8C;&#x306E;&#x30C7;&#x30A3;&#x30B1;&#x30A4;&#x30C9; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x5C0E;&#x5165;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x7814;&#x7A76;&#x306B;&#x6DF1;&#x3044;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x305F;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x540C;&#x4E00;&#x306E; RNA &#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x7570;&#x7A2E;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x77DB;&#x76FE;&#x3057;&#x305F;&#x7D50;&#x679C;&#x3068;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x51FA;&#x7248;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x4FE1;&#x983C;&#x6027;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306E;&#x61F8;&#x5FF5;&#x3092;&#x8ABF;&#x9054;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x7BA1;&#x7406; (MAQC) &#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x30D1;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x554F;&#x984C;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x61F8;&#x5FF5;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x958B;&#x59CB;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;4 &#x3064;&#x306E;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x30D7;&#x30FC;&#x30EB; 2 &#x3064;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x53C2;&#x7167;&#x306E; RNA &#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;&#x4E0A;&#x306E;&#x5F0F;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30FB; &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x4EE3;&#x66FF;&#x6280;&#x8853;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x306A;&#x30C7;&#x30B6;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6; &#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x52AA;&#x529B; MAQC &#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306E;&#x80CC;&#x5F8C;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; intraplatform &#x4E00;&#x8CAB;&#x6027;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x9AD8;&#x5168;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306B;&#x8868;&#x73FE;&#x8B58;&#x5225;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x9762;&#x3067; interplatform &#x306E;&#x4E00;&#x81F4;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x81E8;&#x5E8A;&#x3068;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x78BA;&#x7ACB;&#x306B;&#x5411;&#x3051;&#x3066;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B69;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x7BA1;&#x7406; (MAQC) &#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059; inter-&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3068; intraplatform &#x518D;&#x73FE;&#x6027;&#x3002;

&#xC9C0;&#xB09C; 10 &#xB144;&#xAC04; microarray &#xAE30;&#xC220; &#xB3C4;&#xC785; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC9C0;&#xB300;&#xD55C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCCE4;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xB958; &#xB610;&#xB294; &#xC544;&#xC608; &#xBAA8;&#xC21C; &#xB41C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC5BB;&#xC740; &#xB2E4;&#xB978; microarray &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; RNA &#xC0D8;&#xD50C;&#xC744; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558;&#xB294; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xCD9C;&#xAC04;&#xC774; &#xAE30;&#xC220;&#xC758; &#xC2E0;&#xB8B0;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6B0;&#xB824;&#xB97C; &#xC81C;&#xAE30; &#xD588;&#xB2E4;. MicroArray &#xD488;&#xC9C8; &#xAD00;&#xB9AC; (MAQC) &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC6B0;&#xB824; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC131;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBD84;&#xC11D; &#xBB38;&#xC81C;&#xB97C; &#xD574;&#xACB0; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC2DC;&#xC791; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xCC38;&#xC870; RNA &#xC0D8;&#xD50C; 4 &#xC801;&#xC815; &#xD480;&#xC5D0; &#xC2DD; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; microarray &#xBC0F; &#xB300;&#xCCB4; &#xAE30;&#xC220; &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xC124;&#xACC4; &#xBC0F; MAQC &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xC758; &#xB4A4;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xB9E4;&#xD551; &#xB178;&#xB825;&#xC744; &#xC124;&#xBA85;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD45C;&#xD604;&#xC73C;&#xB85C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xCE21;&#xBA74;&#xC5D0;&#xC11C; interplatform &#xC0C9;&#xC778;&#xC758; &#xC218;&#xC900; &#xB192;&#xC740; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; intraplatform &#xC77C;&#xAD00;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xC784;&#xC0C1; &#xBC0F; &#xADDC;&#xC81C; &#xC124;&#xC815;&#xC5D0;&#xC11C; microarrays&#xC758; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC218;&#xB9BD; &#xC704;&#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xCCAB; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

MicroArray &#xD488;&#xC9C8; &#xAD00;&#xB9AC; (MAQC) &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC778;&#xD130;-&#xACE0; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xCE21;&#xC815;&#xC758; &#xC7AC;&#xD604;&#xC131; intraplatform.

En la &uacute;ltima d&eacute;cada, la introducci&oacute;n de la tecnolog&iacute;a de microarrays ha tenido un profundo impacto en la investigaci&oacute;n de la expresi&oacute;n del gene. La publicaci&oacute;n de estudios con resultados dis&iacute;miles o contradictorios en conjunto, obtenidos mediante microarrays diferentes plataformas para analizar muestras id&eacute;nticas de RNA, ha expresado su preocupaci&oacute;n acerca de la fiabilidad de esta tecnolog&iacute;a. Se inici&oacute; el proyecto de Control de calidad de microarrays (MAQC) para hacer frente a estas preocupaciones, as&iacute; como otros temas de an&aacute;lisis de datos y rendimiento. Se obtuvieron datos de expresi&oacute;n en cuatro piscinas de titulaci&oacute;n de dos muestras de RNA de referencia distintos en varios sitios de prueba usando una variedad de plataformas tecnol&oacute;gicas basadas en microarrays y alternativa. Aqu&iacute; describimos el dise&ntilde;o experimental y el mapeado de sonda detr&aacute;s del proyecto MAQC. Mostramos intraplatform consistencia a trav&eacute;s de sitios de prueba, as&iacute; como un alto nivel de concordancia interplatform en t&eacute;rminos de genes identificados como diferencialmente expresado. Este estudio proporciona un recurso que representa un primer paso importante hacia el establecimiento de un marco para la utilizaci&oacute;n de microarrays en contextos cl&iacute;nicos y regulatorios.

El proyecto de Control de calidad de microarrays (MAQC) muestra inter- y intraplatform reproducibilidad de las mediciones de expresi&oacute;n g&eacute;nica.

CD14&#xFF0C;&#x8102;&#x591A;&#x7CD6; (LPS) &#x53D7;&#x4F53;&#x5728;&#x819C;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x7A97;&#x4F53; (mCD14) &#x548C;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x7684;&#x7A97;&#x4F53; (sCD14) &#x4E2D;&#x627E;&#x5230;&#x3002;&#x6709;&#x4EBA;&#x5EFA;&#x8BAE;&#xFF0C;sCD14 &#x4E3B;&#x8981;&#x7531;&#x4E1D;&#x6C28;&#x9178;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x8131;&#x843D;&#x91CA;&#x653E;&#x4ECE;&#x8840;&#x6DB2;&#x5355;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3002;&#x56E0;&#x4E3A; 1 &#x53D7;&#x4F53;&#x53CA;&#x5176;-antitrypsin (AAT) &#x7684;&#x4E1D;&#x6C28;&#x9178;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;&#x6291;&#x5236;&#x5242;&#x5DF2;&#x88AB;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x4EBA;&#x5355;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4F53;&#x5916; CD14 &#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x8C03;&#x8282;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5BFB;&#x6C42;&#x8C03;&#x67E5;&#x8840;&#x6D46;&#x5E74;&#x9F84; 30 &#x5C81;&#x4E0E;&#x6B63;&#x5E38; MM &#x7684;&#x79D1;&#x76EE; mCD14 sCD14 &#x548C;&#x5355;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C;&#x6709;&#x7F3A;&#x9677;&#x7684; PiZZ &#x548C;&#x76AE;&#x4EC0;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x7684;&#x5B66;&#x80FD;&#x6D4B;&#x9A8C;&#x3002;

&#x5185;&#x6BD2;&#x7D20;&#x53D7;&#x4F53; CD14 &#x5CF0;&#x963F;&#x5C14;&#x6CD5;-1-antitrypsin &#x7F3A;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x3002;

CD14, a receptor for lipopolysaccharides (LPS), is found in both a membrane-bound form (mCD14) and a soluble form (sCD14). It is suggested that sCD14 is mainly released from blood monocytes by serine protease-mediated shedding. Because alpha1-antitrypsin (AAT), an inhibitor of serine proteases, has been shown to regulate CD14 expression in human monocytes in vitro, we sought to investigate plasma levels of sCD14 and monocyte expression of mCD14 in subjects at age 30 years with normal MM and deficient PiZZ and PiSZ genotypes of AAT.

Endotoxin receptor CD14 in PiZ alpha-1-antitrypsin deficiency individuals.

CD14, un r&eacute;cepteur de lipopolysaccharides (LPS), se trouve dans un formulaire li&eacute; &agrave; la membrane (mCD14) et une forme soluble (sCD14). Il est sugg&eacute;r&eacute; que sCD14 est principalement lib&eacute;r&eacute;e de monocytes sanguins de s&eacute;rine prot&eacute;ase m&eacute;di&eacute;e par excr&eacute;tion. Parce que l&#39;alpha1-antitrypsine (AAT), un inhibiteur des prot&eacute;ases &agrave; s&eacute;rine, a d&eacute;montr&eacute; que la r&eacute;gulation de l&#39;expression de CD14 dans les monocytes humains in vitro, nous avons cherch&eacute; &agrave; enqu&ecirc;ter sur les taux plasmatiques d&#39;expression sCD14 et monocytes de mCD14 chez les sujets &acirc;g&eacute;s de 30 ans avec MM normal et des g&eacute;notypes PiZZ et PiSZ d&eacute;ficientes de l&#39;AAT.

R&eacute;cepteur d&#39;endotoxine CD14 chez les individus en alpha-1 antitrypsine PiZ.

Verwendung CD14, ein Rezeptor f&uuml;r Lipopolysaccharide (LPS), findet sich sowohl in ein membrangebundener Form (mCD14) als auch in eine l&ouml;sliche Form (sCD14). Es wird vorgeschlagen, dass dieser sCD14 haupts&auml;chlich von Blut-Monozyten von Serin Protease-vermittelte vergie&szlig;en freigegeben wird. Da alpha1-Antitrypsin (AAT), ein Inhibitor der Serinproteasen, Verwendung CD14 Ausdruck in in-vitro-menschlichen Monozyten zu regulieren nachweislich, versuchte wir Plasmaspiegel von sCD14 und Monozyte Ausdruck des mCD14 bei Personen im Alter von 30 Jahren mit normalen MM und mangelhaft PiZZ und PiSZ Genotypen von AAT zu.

Endotoxin-Rezeptor Verwendung CD14 bei PiZ-Alpha-1-Antitrypsinmangel-Patienten.

CD14, un recettore per lipopolisaccaridi (LPS), &egrave; trovato in una forma di membrana-limiti (mCD14) e una forma solubile (sCD14). &Egrave; suggerito che sCD14 &egrave; rilasciato principalmente dai monociti del sangue versando serina proteasi-mediata. Perch&eacute; alpha1-antitripsina (AAT), un inibitore della proteasi della serina, ha dimostrato di regolare espressione di CD14 nei monociti umani in vitro, abbiamo cercato di indagare i livelli plasmatici di sCD14 e monociti espressione di mCD14 in soggetti all&#39;et&agrave; di 30 anni con normali MM e carente PiZZ e PiSZ genotipi di AAT.

Recettori endotossine CD14 in individui di alfa-1-antitripsina PiZ.

CD14&#x3001;&#x30EA;&#x30DD;&#x591A;&#x7CD6; (LPS) &#x306E;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x306F;&#x819C;&#x7D50;&#x5408;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0; (mCD14) &#x3068;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027;&#x306E;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0; (sCD14) &#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;&#x767A;&#x898B;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E; sCD14 &#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F;&#x30BB;&#x30EA;&#x30F3;&#x653E;&#x51FA;&#x306B;&#x4E3B;&#x306B;&#x8840;&#x6DB2;&#x5358;&#x7403;&#x304B;&#x3089;&#x89E3;&#x653E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x304A;&#x52E7;&#x3081;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3072;&#x3068;&#x5358;&#x7403;&#x306E; in vitro &#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; CD14 &#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x30A2;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1; 1-&#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3; (AAT) &#x306E;&#x30BB;&#x30EA;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x5264;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x5E74;&#x9F62; 30 &#x6B73;&#x901A;&#x5E38;&#x30DF;&#x30EA;&#x30E1;&#x30FC;&#x30C8;&#x30EB;&#x3068;&#x88AB;&#x9A13;&#x8005;&#x306E; mCD14 &#x306E; sCD14 &#x3068;&#x5358;&#x7403;&#x5F0F;&#x3068; AAT &#x306E;&#x6B20;&#x4E4F; PiZZ &#x3068;&#x30D4;&#x30B7;&#x30E5;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306E;&#x8840;&#x6F3F;&#x4E2D;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6C42;&#x3081;&#x305F;&#x3002;

&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30C8;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x53D7;&#x5BB9; CD14 PiZ &alpha; 1 &#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x6B20;&#x4E4F;&#x500B;&#x4EBA;&#x3002;

CD14, lipopolysaccharides (LPS)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4;&#xB294; &#xB9C9; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xB41C; &#xD3FC; (mCD14) &#xBC0F; &#xC218;&#xC6A9; &#xC131; &#xC591;&#xC2DD; (sCD14)&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xADF8; sCD14 &#xC8FC;&#xB85C; &#xB5A0;&#xB4E4;&#xACE0; &#xD758;&#xB9AC;&#xAE30; protease &#xC911;&#xC7AC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; monocytes &#xD608;&#xC561;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD574;&#xC81C; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Alpha1-antitrypsin (AAT)&#xC758; &#xB5A0;&#xB4E4;&#xACE0; &#xD504;&#xB85C; &#xD14C;&#xC544; &#xC81C; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC81C; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; monocytes &#xCCB4; &#xC678;&#xC5D0;&#xC11C; CD14 &#xC2DD; &#xADDC;&#xC81C;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB098;&#xC774;&#xC5D0; &#xC77C;&#xBC18; m m 30 &#xB144; &#xC8FC;&#xC81C;&#xC5D0; Mcd14&#xC758; sCD14 &#xBC0F; monocyte &#xC2DD; &#xBC0F; AAT&#xC758; &#xACB0;&#xD54D; PiZZ &#xBC0F; &#xD53C; &#xCE20; genotypes &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xC218;&#xC900; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558;&#xACE0;&#xC790; &#xD588;&#xB2E4;.

&#xC11C; &#xC54C;&#xD30C;-1-antitrypsin &#xACB0;&#xD54D; &#xAC1C;&#xC778;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; CD14.

CD14, un receptor de lipopolisac&aacute;ridos (LPS), se encuentra en forma unida a la membrana (mCD14) y una forma soluble (sCD14). Se sugiere que scd14 principalmente se libera de los monocitos de la sangre por serina proteasa mediada por vertimiento. Porque alfa-1-antitripsina (AAT), un inhibidor de proteasas de serina, se ha demostrado que regulan la expresi&oacute;n de CD14 en monocitos humanos in vitro, se intent&oacute; investigar los niveles plasm&aacute;ticos de expresi&oacute;n sCD14 y monocitos de mCD14 en sujetos en edad de 30 a&ntilde;os con MM normal y genotipos PiZZ y PiSZ deficiencias de AAT.

Natalia Novoradovskaya

Agilent Technologies

DNA-based Fish Species Identification Protocol