Bu çalışma Virginia Üniversitesi ve Jeffress Memorial Trust (J-971) tarafından finanse edildi. Biz yararlı tartışmalar ve elyazmasının eleştirel okuma L. Columbus, K. Jain ve P. Randolph ederim.

1. Şekerler Azaltılması Benedict Testi <ol><li> 940 mM susuz sodyum karbonat, 588 mM sodyum sitrat dihidrat, 68 mM bakır (II) sülfat pentahidrat - Benedict&#39;in reaktif uygun bir miktar hazırlayın. Bu reaktif tepkime içinde değişiklik fark ile, en az altı ay boyunca oda sıcaklığında (RT) saklanabilir. </li><li> Yukarıdaki reaktif 6x olduğunu. Örnek test edilecek başına Böylece, 600 ul reaksiyonlar için, temiz bir 1.5 mL mikrosantrifüj tüpü (örn., Eppendorf marka) ile Benedict&#39;in reaktif 100 ul ilave edin. </li><li> 10 ul bu tüpüne örnek 500 ul yere ekleyin; optimum ses bir ilk deneme vadede renk oluşumu yoğunluğuna göre tespit edilebilir. Yeterli numune mevcut ise, daha sonraki deneylerde daha sonra seyreltik maksimum olası örnek hacmi (yani, toplam reaksiyon hacmi beş-sixths, bu durumda, örnek 500 ul) bu tür denemeler başlar, ve. </li><li> Tu için GKD 2 O ekleyinvorteks veya pipetleme çözüm karıştırmak; 600 ul son hacim getirmek olacak. </li><li> Bir kaynar su banyosu içinde 20 dakika için örnekler inkübe edin. </li><li> Banyosundan ısıtmalı örnek çıkarın ve 10 dakika oda sıcaklığında soğumaya bırakın. </li><li> &gt; 9,300 de örnek tüpü santrifüjleyin xg amacıyla sediman herhangi bir partikül madde için 5 dakika (bir FA45-24-11 Eppendorf sabit açılı rotor ~ 10.000 rpm), bu adımı nitelikten ziyade niceliği çalışmalar için daha da önemlidir. </li><li> Temiz bir küvet içine bu tüpten tablet süpernatant. </li><li> Su ile uv-vis spektrofotometre Boşluk. </li><li> 475 nm&#39;de Bu örnek absorbansları ölçülür. </li></ol> 2. Pentoz şekerler için Bial Orcinol Assay <ol><li> . Taze Bial reaktif uygun bir miktar hazırlayın - 24.2 mM orcinol monohidrat (bu bileşiğin yapısı için bakınız Şekil 2b), 6 M HCl ile% 0.025 w / v demir klorür hekzahidrat Not:Uzun süreli depolama için, Bial reaktif iki ayrı stok solüsyonlar olarak hazırlanabilir: (i) Reaktif A [konsantre HCI içinde% 0.05 w / v FeCl3 • 6H 2 O] ve (ii) Reaktif B [422 mM orcinol monohidrat 95&#39;de hazırlanmış % etanol]. Reaktif A altı ay için RT saklanabilir; Reaktif B ışığa maruz kalma sınırı folyo ile kaplı, bir ay boyunca 4 ° C&#39;de saklanabilir. Kullanımdan önce 1 (B) v / v oranı: Bu stok çözeltinin 15 (A) &#39;da karıştırılır. </li><li> Yukarıdaki reaktif 2x. Örnek test edilecek başına Böylece, bir 1.0 ml reaksiyonlar için, temiz bir 1.5 ml mikrosantrifüj tüpüne Bial reaktif 500 ul ilave edin. </li><li> Bu tüp 10 ul numune 500 ul yere ekleyin. Örnek yeterli olup olmadığını not 1.3 başına gibi (yukarıdaki), daha sonra maksimum olası örnek hacmi (yani, yarım toplam reaksiyon hacmi, bu durumda, örnek 500 ul) ile test reaksiyonları başlar ve oradan seyreltin. </li><li> F getirmek için tüp GKD 2 O ekleyin1.0 ml inal hacim; vorteks veya pipetleme çözüm karıştırmak. </li><li> Bir kaynar su banyosu içinde 20 dakika için örnekler inkübe edin. </li><li> Banyosundan ısıtmalı örnek çıkarın ve 10 dakika oda sıcaklığında soğumaya bırakın. </li><li> &gt; 9,300 de örnek tüpü santrifüjleyin xg amacıyla sediman herhangi bir partikül madde için 5 dakika (bir FA45-24-11 Eppendorf sabit açılı rotor ~ 10.000 rpm), bu adımı nitelikten ziyade niceliği çalışmalar için daha da önemlidir. </li><li> Görsel inceleme için temiz bir küvet içine bu tüpten tablet süpernatant. </li><li> Yarı-kantitatif analiz için, boş uv-vis su ile spektrofotometre ve 660 nm küvetini numune absorbansı ölçülür. </li></ol> 3. 2&#39;-deoxypentose Şekerler için Dische en Difenilamin Assay <ol><li> 60 mM difenilamin, 11 M glasiyal asetik asit, 179 mM sülfürik asit, v / v ethanol 62 -% Dische en difenilamin reaktif uygun bir miktar hazırlayın. Bu reaktif önceden edilebilirönceden pared ve karanlık bir kap içinde oda sıcaklığında saklanabilir veya ışığa maruz kalma sınırı, folyo ile kaplanmıştır. Pratikte reaktivitede görünen hiçbir değişiklik ile her iki-üç ayda hazırlanabilir olsa ışık hassasiyeti nedeniyle reaktif, süresiz muhafaza edilmemelidir. </li><li> Yukarıdaki reaktif 2x. Örnek test edilecek başına Böylece, bir 1.0 ml reaksiyonlar için, temiz bir 1.5 ml mikrosantrifüj tüpüne Dische reaktifi 500 ul ilave edin. </li><li> Bu tüp 10 ul numune 500 ul yere ekleyin. Örnek yeterli olup olmadığını not 1.3 başına gibi (yukarıdaki), daha sonra maksimum olası örnek hacmi (yani, yarım toplam reaksiyon hacmi, bu durumda, örnek 500 ul) ile test reaksiyonları başlar ve oradan seyreltin. </li><li> 1.0 ml son hacim getirmek için tüp GKD 2 O ekleyin; vorteks veya pipetleme çözüm karıştırmak. </li><li> Bir kaynar su banyosu içinde 20 dakika için örnekler inkübe edin. </li><li> Banyo ve allo gelen ısıtmalı örnek kaldır10 dk için oda sıcaklığında soğumasına o w. </li><li> &gt; 9,300 de örnek tüpü santrifüjleyin xg amacıyla sediman herhangi bir partikül madde için 5 dakika (bir FA45-24-11 Eppendorf sabit açılı rotor ~ 10.000 rpm), bu adımı nitelikten ziyade niceliği çalışmalar için daha da önemlidir. </li><li> Görsel inceleme için temiz bir küvet içine bu tüpten tablet süpernatant. </li><li> Yarı-kantitatif analiz için, boş uv-vis su ile spektrofotometre ve 600 nm küvetini numune absorbansı ölçülür. </li></ol> 4. Diğer Kullanım Notları <ol><li> Moleküllerin aşağıdaki sınıflar her bir deney için pozitif ve negatif kontrol reaksiyonları için uygun referans bileşikler şunlardır: <ul><li> Benedict&#39;in - Olumlu = ücretsiz riboz, fruktoz, glikoz; Negatif = RNA, DNA, ATP, vb. (Ücretsiz bir indirgen şeker işlevselliği olmayan herhangi bir sakarit) </li><li> Bial - Olumlu = RNA (örneğin ekmek mayası ekstresi), riboz, ATP, UMP; Negatif = sığır serum albümin (BSA), ya da başka herhangi bir protein </li><li> Dische sitesi - Olumlu = DNA (örn. calf thymus); Negatif = RNA, ATP, vb. (Herhangi bir non-2&#39;-deoksijenlenmedeki nükleotid) </li></ul></li><li> Örneğin NaCl, (NH4) 2 SO 4 ve K, 2 SO 4 müdahale etmediği gibi, örneğin genel tuzları, ve reaksiyon tarafından etkilenmez görünür; bu ölçümlerin daha çok protein saflaştırma kullanılan bileşikler için oldukça esnek olduğu tespit edilmiştir seyreltici içeriği. PH yüksek derecede bazik ise Deterjanlar veya üre gibi kaotropik ajanlar testlerinin reaktivite etkileyebilir, bir asidik pH aralığında nötr (metin ve protonlar görmek çünkü temel reaksiyon kimyası genellikle Bial ve Dische en deneyleri için en uygunudur Şekil 2b, c). Potansiyel olarak optimal reaksiyon koşulları, şüpheli interferents, vb. pozitif ve negatif kontrol deneyleri w kullanarak, bir vaka tarafından ayrı ayrı test edilmelidiri&#39;inci referans bileşikleri. </li></ol>

<ol>
	<li>De Mey, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+DNA+and+RNA+quantification+methods+suitable+for+parameter+estimation+in+metabolic+modeling+of+microorganisms.">Comparison of DNA and RNA quantification methods suitable for parameter estimation in metabolic modeling of microorganisms.</a> Anal. Biochem. 353, 198-203 (2006).</li><li>Desjardins, P., Conklin, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NanoDrop+Microvolume+Quantitation+of+Nucleic+Acids.">NanoDrop Microvolume Quantitation of Nucleic Acids.</a> J. Vis. Exp. (45), e2565 (2010).</li><li>Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology. , (1999).</li><li>Voet, D., Voet, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biochemistry. , (2011).</li><li>Adams, R. L. P., Knowler, J. T., Leader, D. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The Biochemistry of the Nucleic Acids. , (1986).</li><li>Rice, P. A., Correll, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Protein-nucleic acid interactions: Structural biology. , (2008).</li><li>Bowman, J. C., Lenz, T. K., Hud, N. V., Williams, L. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cations+in+charge:+Magnesium+ions+in+RNA+folding+and+catalysis.">Cations in charge: Magnesium ions in RNA folding and catalysis.</a> Curr. Opin. Struct. Biol. , (2012).</li><li>Balandina, A., Kamashev, D., Rouviere-Yaniv, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+bacterial+histone-like+protein+HU+specifically+recognizes+similar+structures+in+all+nucleic+acids.+DNA,+RNA,+and+their+hybrids.">The bacterial histone-like protein HU specifically recognizes similar structures in all nucleic acids. DNA, RNA, and their hybrids.</a> J. Biol. Chem. 277, 27622-27628 (1074).</li><li>Graslund, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+production+and+purification.">Protein production and purification.</a> Nat. Methods. 5, 135-146 (2008).</li><li>Pagano, J. M., Clingman, C. C., Ryder, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+approaches+to+monitor+protein-nucleic+acid+interactions+using+fluorescent+probes.">Quantitative approaches to monitor protein-nucleic acid interactions using fluorescent probes.</a> RNA. 17, 14-20 (2011).</li><li>Benedict, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+reagent+for+the+detection+of+reducing+sugars.">A reagent for the detection of reducing sugars.</a> J. Biol. Chem. 277, e5 (1908).</li><li>Endo, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simultaneous+estimation+method+of+DNA+and+RNA+by+the+orcinol+reaction+and+a+study+on+the+reaction+mechanism.">A simultaneous estimation method of DNA and RNA by the orcinol reaction and a study on the reaction mechanism.</a> J. Biochem. 67, 629-633 (1970).</li><li>Almog, R., Shirey, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+modified+orcinol+test+for+the+specific+determination+of+RNA.">A modified orcinol test for the specific determination of RNA.</a> Anal. Biochem. 91, 130-137 (1978).</li><li>Dische, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+color+reactions+for+determination+of+sugars+in+polysaccharides.">New color reactions for determination of sugars in polysaccharides.</a> Methods Biochem. Anal. 2, 313-358 (1955).</li><li>Burton, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+study+of+the+conditions+and+mechanism+of+the+diphenylamine+reaction+for+the+colorimetric+estimation+of+deoxyribonucleic+acid.">A study of the conditions and mechanism of the diphenylamine reaction for the colorimetric estimation of deoxyribonucleic acid.</a> Biochemical Journal. 62, 315-323 (1956).</li><li>Vogel, J., Luisi, B. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hfq+and+its+constellation+of+RNA.">Hfq and its constellation of RNA.</a> Nat. Rev. Microbiol. 9, 578-589 (2011).</li><li>Deckert, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+composition+and+electron+microscopy+structure+of+affinity-purified+human+spliceosomal+B+complexes+isolated+under+physiological+conditions.">Protein composition and electron microscopy structure of affinity-purified human spliceosomal B complexes isolated under physiological conditions.</a> Mol. Cell Biol. 26, 5528-5543 (2006).</li><li>Stevens, S. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Composition+and+functional+characterization+of+the+yeast+spliceosomal+penta-snRNP.">Composition and functional characterization of the yeast spliceosomal penta-snRNP.</a> Mol. Cell. 9, 31-44 (2002).</li><li>Sapan, C. V., Lundblad, R. L., Price, N. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colorimetric+protein+assay+techniques.">Colorimetric protein assay techniques.</a> Biotechnol. Appl. Biochem. 29 (Pt. 2), 99-108 (1999).</li><li>Chomczynski, P., Sacchi, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+single-step+method+of+RNA+isolation+by+acid+guanidinium+thiocyanate-phenol-chloroform+extraction:+twenty-something+years+on.">The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on.</a> Nat. Protoc. 1, 581-585 (2006).</li></ol>

Çıkar çatışması ilan etti.

<html> Kolorimetrik testler hızla gibi daha ileri çalışmalar için hazırlık olarak proteinler, RNA veya tüm hücre lizat gelen kompleksleri arındırıcı karşılaşılan gibi biyomoleküler karışımlar, kimyasal yapısını değerlendirmek için basit bir yaklaşım sunmak Burada sunulan. Yapısal biyoloji gibi örnek heterojenlik gibi daha anadili gibi montajları, giderek büyük sorunlar, izlediği gibi, karmaşık ve çok bileşenli kompleksler oluşturduğu edilecektir. Supramoleküler meclisleri genellik...

Much hücre biyolojisi DNA ve RNA içeren moleküler etkileşimler aracılığıyla gerçekleşir. 4 Bunlar doğal olarak oluşan nükleik asitler (UA) (örneğin, iki değerlikli katyonlar proteinler, 6 ve in vivo küçük molekül bileşiklerinin ve ligandların bir ev sahibi ile, birbiri ile etkileşim 5 7). Etkileşimler olabilir kısa veya (kinetik) uzun ömürlü, düşük afinitesi (termodinamik dayanım) orta yüksek değişebilir, hem de kimyasal özellikleri ve özgüllüğünü önemli çeşitlilik gösterebilmesidir - bazı dernekler (örneğin, DNA oldukça özeldir · · transkripsiyon faktörleri, RNA · · · yapıştırma faktörler), diğer etkileşimleri mutlaka çok daha genel ise (örneğin, DNA · · · bakteriyel histon benzeri HU proteinler 8). UA ile Non-spesifik etkileşimler biomo karışımları içeren in vitro deneylerde pratik sonuçları olabilirlecules, bazı UA, en azından kullanılan deneysel koşullar gibi bir kısmını (iyonik kuvvet, çözeltinin pH, vs) altında, ilgi biyomolekülleri ile ilişkilendirir, mümkünse, ve hatta büyük bir olasılıktır. Escherichia coli hücre kültüründe yeniden birleştirici proteinin heterolog aşırı ekspresyonu vasıtasıyla, örneğin, ilgi (PI) bir proteinin üretimi düşünün, bu tür bir prosedür rutin olarak hemen hemen herhangi bir yapısal biyolojide laboratuvar gerçekleştirilir 9 başka deneyler için hazırlanırken, bu gibi. / biyokimyasal karakterizasyonu biyofiziksel, kristalizasyon, vb., ilk çabalar genellikle ideal olarak, kimyasal olarak homojen ve biyofiziksel monodisperse örnek olarak, mümkün olduğunca saf bir formda olarak da POI yeterli bir miktar elde edilmesi ile ilgili odak gibi. Konak hücre bozulması sonra, tipik bir arıtma akışı erken evrelerinde E. POI izole etmek için amaç coli proteinler, nükleik asitler, hücre duvarı enkaz,ve hücre lizat diğer bileşenler. Ancak konak UA&#39;lar birçok fizikokimyasal nedenlerle POI ile birlikte arındırmak olabilir - çok temel bir İÇN non-spesifik olarak açılan konak DNA / RNA olabilir; POI (örneğin, yukarıda belirtilen HU) genel NA-bağlanma aktivitesi olabilir; POI konak RNA veya DNA ile oldukça spesifik NA-bağlayıcı protein ancak sergi çapraz reaktivite olabilir; böylece ve; ana UA&#39;lar bir kromatografi matris ile etkileşim ve böylece sadece co-elute POI olabilir. NA safsızlıklar olasılıkla mansap deneyler (örneğin, POI • RNA bağlayıcı 10 floresans anizotropi testleri) ile müdahale edecek, çünkü bir İÇN&#39;ye konak UA&#39;lar ayrım gözetmeksizin, yüksek afiniteli bir can sıkıcı sorun teşkil edebilir. Bu tür etkileşimlerin POI nükleik asit bağlama kapasitesi aydınlatmak Alternatif olarak, beklenmeyen POI · · · NA dernekleri de, tesadüfen görülebilir. Her iki şekilde de, UA&#39;lar anahtar bileşenleri veya kirletici olup olmadığını, bir ilk ölçmek gerekir veakış deneyler için hazırlık içinde eş-arındırıcı NAS tipi (DNA, RNA) tanımlar. Çeşitli analitik yöntemler tespit ve bir örnek UA&#39;lar miktarlarının yapılmamış. Mevcut yöntemlerin çoğu (temelde ya (örneğin, tiazol portakal veya NA diğer floresan boya bağlayıcı) florometrik, (örneğin, A 260 absorbans değerleri ve A 260 / A 280 oranları) spektrofotometrik veya kolorimetrik olarak kimyasal reaksiyonlara nükleosidlerin duyarlılık elektromanyetik spektrumun UV-vis bölge) emici verim kromofor olarak son zamanlarda De Mey ve ark tarif. 1 Ancak, RNA veya DNA gibi polinükleotid türünü tanımlamanın önemli adım bu kantitatif çoğunun kapsamı dışındadır yaklaşımlar. Burada hızlı bir protein örnek NA bileşenlerin türleri belirlemek için kolorimetrik analizler kümesi sağlar. Protokoller burada c açıklananverimli bir potansiyel NA safsızlıkların izole ek adımlar yürütülür, ve (Şekiller 1 ve 2) 2&#39;-deoxypentoses arasında şekerler 11, 12,13 pentozlara için orcinol tahlil, difenilamin ve reaksiyon 14,15 azaltılması için Benedict&#39;in tahlil dayanmak edilmesi . Benedict&#39;in testi (Şekil 2a) +, şeker en karbonil birlikte oksidasyon ile olduğu gibi Cu 2 O-, bir karboksilat parçası ve üretim için Cu 2 azaltmak için bir aldoz şeker doğrusal, açık-zincirli (aldehit) formu yeteneği kullanır çözünmeyen kırmızı çökelti. Bu reaksiyon gibi aldoses ve ketoses (hangi enediol ara ile ilgili aldoses dönüştürmek) gibi ücretsiz indirgen şekerler ile pozitif test değil, bir DNA veya RNA polinükleotid arasında kovalent omurga parçası olarak siklik forma kilitli olduğundan pentoz şeker ile. Olacak Bir serbest hemiasetal işlevsellik minimalist gereksinimi, diğer ortak nedeniyleve bu nedenle potansiyel interferents olarak hareket - - Bu testte pozitif test edebilir mpounds α-hidroksi-ketonlar ve kısa oligosakkaritler (örn. disakkarit maltoz) içerir. Her iki Bial orcinol (Şekil 2b) ve Dische en difenilamin (Şekil 2c) reaksiyon polinükleotid omurga başlangıç ​​imha dayanır, nükleosid depurination ve daha fazla asit ya da ebeveyn nükleotidlerin baz-katalizörlü hidroliz yolu ile, furan-2 vermek üzere -karbaldehid (furfural) türevleri, bu türevleri daha sonra bu orcinol (Bial) ya da difenilamin (Dische) &#39;ın tam olarak bilinmemektedir kimyasal yapısının renkli yoğunlaşma ürünleri oluşturmak için reaktifler olarak fenol ya da bir polihidroksi ile reaksiyona girer. Dische en tahlil RNA özgüllüğü karşı DNA pentoz şeker daha diphenylamine ile reaksiyona ω-hydroxylevulinyl aldehit, oksidasyon duyarlı olmak amacıyla 2&#39;-deoksijenlenmedeki olmalıdır gerçeğinden kaynaklanmaktadırasidik koşullar altında bir parlak mavi bir yoğuşma (Şekil 2c) elde edildi. Burada tarif edilen aerodinamik protokolleri kullanılarak bu şeker özgü kolorimetrik reaksiyon, RNA ve DNA arasındaki farkı olabilir ve ayrıca bu tür bir biyomoleküler örnek olarak glikoz, früktoz, riboz ya da serbest gibi indirgeyici şekerler varlığını gösterir olduğunu bulduk.

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktif veya ekipman </td><td> Tedarikçi / şirket </td><td> Katalog numarası </td><td> Yorumlar, notlar </td></tr><tr><td> Susuz sodyum karbonat </td><td> Fisher Scientific </td><td> S263 </td><td></td></tr><tr><td> Sodyum sitrat dihidrat </td><td> Sigma </td><td> S-4641 </td><td></td></tr><tr><td> Bakır (II) sülfat pentahidrat </td><td> VWR </td><td> VW3312-2 </td><td></td></tr><tr><td> Orcinol monohidrat </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> O1875 </td><td></td></tr><tr><td> Konsantre HCI </td><td> VWR </td><td> BDH3030 </td><td></td></tr><tr><td> Demir klorür hekzahidrat </td><td> Sigma </td><td> F-2877 </td><td></td></tr><tr><td> Difenilamin </td><td> Aldrich </td><td> 112763 </td><td></td></tr><tr><td> Asetik sirke asidi </td><td> Fisher Scientific </td><td> A28 </td><td></td></tr><tr><td> Sülfürik asit </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 258105 </td><td></td></tr><tr><td> Etanol </td><td> Koptec </td><td> V1101 </td><td></td></tr><tr><td> Riboz </td><td> Sigma </td><td> R-7500 </td><td> % 1 hazırlık w / H 2 O v </td></tr><tr><td> Ekmek mayası gelen Ribonükleik asit (S. cerevisiae) </td><td> Sigma </td><td> R6750 </td><td> H2O içinde 10 mg / ml &#39;de prep, -20 ° C de saklamak </td></tr><tr><td> Calf thymus gelen deoksiribonükleik asit (sodyum tuzu), </td><td> Sigma </td><td> D1501 </td><td> H2O içinde 10 mg / ml &#39;de prep, 4 ° C de saklamak </td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td> Reaktifler, Ekipmanları ve Güvenlik Malzeme fo listelenenOnlar Protokol bölümünde göründükleri sırayla tabloya llowing. Aksi takdirde (yukarıda) Aksi belirtilmedikçe, tüm reaktifler oda sıcaklığı ve aydınlatma saklanabilir. (Örneğin, mikrosantrifüj tüpleri) Aşağıda listelenen herhangi bir ürün için, her zamanki marka / model / çeşitli standart biyokimyasal laboratuvar bulunan (örn., Eppendorf marka 1.5 ml mikrofuge&#39;de tüpler) kullanılabilir. Standart plastik mikrofüj tüpler santrifüjleme (örneğin, her bir protokol sonuna yakın tortu parçacıklı malzeme için) içeren adımlar için kullanılmalıdır. Tüpler kapalı olabilir sürece hiçbir özel malzeme, tercih edilir; biyokimya laboratuvarlarında bulunan tipik polipropilen tüpler iyi çalışır. Güvenlik kaygıları ve atık bertarafı konusunda, standart laboratuar önlemler (koruyucu gözlük, duman davlumbaz) ile birlikte çalışarak ve konsantre asetik, hidroklorik veya sülfirik asit içeren solüsyonları imha öncesi soyma olunmalıdır. Gibi organik reaktifler için orcinol veya diphenylamine, nitril eldiven ortak lateks (doğal kauçuk) çeşitli tercih edilir. </td></tr></tbody></table>

rapid colorimetric assays to qualitatively distinguish rna and dna in biomolecular samples

Biyokimyasal deneyler genellikle potansiyel olarak heterojen örneklerde doğru nükleik asit erken bir aşamada bilgi,,, protein ve diğer biyomoleküler bileşenleri gerektirir. Nükleik asitler kolayca ayırt edemez rağmen (örneğin, A 260), florometrik (örneğin, floresan boya bağlayıcı), veya kolorimetrik (nükleozid özel kromojenik kimyasal reaksiyonlar). 1 spektrofotometrik olarak analitik yöntemler de dahil olmak üzere birçok yerleşik yaklaşımları ile tespit edilebilir RNA DNA, A 260 de 260 nm ve öncelikle 280 nm civarındaki emer protein yakınındaki ağırlıklı emer nükleik asit, göreli içeriğinin basit ve hızlı 2 değerlendirme sunuyor / A 280 oranı genellikle istihdam edilmektedir. 1.5 3 Rasyolar &lt;saf nükleik asit (NA) oranları ile karakterize iken 0,8, &#39;saf&#39; protein örneklerinin göstergesi olarak alınır&gt;. HoWever, protein / NA içerik olarak açıkça veya güvenilir basit uv-vis spektrofotometrik ölçümler anlaşılan olamaz hangi senaryo vardır. Örneğin, (i) örnek olarak, bazı küçük RNA-bağlayıcı protein ile olduğu gibi, ≈ 280 nm (Trp, Tyr, Phe) de emilim için sorumlu aromatik amino asitler nispeten yoksun olan bir tane ya da daha fazla protein içerir, ve edebilir (ii) numuneleri protein / NA içeriği çok daha az açıktır ve hatta protein ve NA bileşenleri arasındaki bazı yüksek afinite dernek yansıtabilir ara A 260 / A 280 oranları (~ 0.8 &lt;~ 1.5), sergileyebilmektedir. Bu tür senaryolar için, biz hızla RNA, DNA ve biyomoleküllerin potansiyel karışık örnek indirgen şekerler ayırt etmek için burada kolorimetrik testlerin bir paketi açıklamak. Yöntemler Benedict&#39;in için pentozlara ve diğer karbonhidratların diferansiyel duyarlılığı güveniyor, Bial (orcinol) ve Dische nin (diphenylamine) reaktifler; aerodinamik protokolleri com olabilirmaddeleri ayırmak zorunda herhangi bir ek adıma gerek kalmadan, birkaç dakika içinde pleted. Deneyleri de, RNA ve DNA arasındaki farkı olarak, glikoz, früktoz, riboz ve (Şekil 1) gibi serbest indirgeyici şekerler arasında varlığını belirtir paralel olarak gerçekleştirilebilmektedir.

Sonuçlar bilinen referans bileşikleri için bu kolorimetrik tahlillerin uygulama için Şekil 3&#39;te de gösterilmiştir. Örnek nitel veri Benedict&#39;in (a), Bial orcinol, (b) ve en Dische difenilamin (c) deneyleri için gösterilmiştir, ve bu üç deneyleri için standart eğriler Şekil 4 &#39;de gösterilmiştir. Panelleri 3 (ac) &#39;de, sol paneller uygun bir reaktif / reaktif analit ile pozitif / negatif kontrol deneyleri göstermiştir; Protocols 1-3 (yukarıda) tarif edi...

Watch this Scientific Journal Video about Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples at JoVE.com

Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples

Kolorimetrik tahlillerin paketi hızla ayırt edici protein, RNA, DNA, ve potansiyel olarak heterojen biyomoleküler örneklerinde yeniden ducing şekerler için açıklanmıştır.

Rapid Kolorimetrik Tahliller Nitelik Biyomoleküler Örnekleri RNA ve DNA ayırt etmek

Biochemical experimentation generally requires accurate knowledge, at an early stage, of the nucleic acid, protein, and other biomolecular components in ...

rapid-colorimetric-assays-to-qualitatively-distinguish-rna-dna

Research

JoVE Journal

Chemistry

41.5K Görüntüleme.  University of Virginia. Kolorimetrik tahlillerin paketi hızla ayırt edici protein, RNA, DNA, ve potansiyel olarak heterojen biyomoleküler örneklerinde yeniden ducing şekerler için açıklanmıştır.

Video: Rapid Colorimetric Assays to Qualitatively Distinguish RNA and DNA in Biomolecular Samples

Rapid High Throughput Amylose Determination in Freeze Dried Potato Tuber Samples

This protocol describes a high through put colorimetric method that relies on the formation of a complex between iodine and chains of glucose molecules in starch. Iodine forms complexes with both amylose and long chains within amylopectin. After the addition of iodine to a starch sample, the maximum absorption of amylose and amylopectin occurs at 620 and 550 nm, respectively. The amylose/amylopectin ratio can be estimated from the ratio of the 620 and 550 nm absorbance values and comparing them to a standard curve in which specific known concentrations are plotted against absorption values. This high throughput, inexpensive method is reliable and reproducible, allowing the evaluation of large populations of potato clones.&#160;

Freeze Kurutulmuş Patates Yumru Örnekleri Hızlı Yüksek Verimli Amilozlu Belirlenmesi

This protocol describes a high through put colorimetric method that relies on the formation of a complex between iodine and chains of glucose molecules in ...

Kimya

Formation of Ordered Biomolecular Structures by the Self-assembly of Short Peptides

In nature, complex functional structures are formed by the self-assembly of biomolecules under mild conditions. Understanding the forces that control self-assembly and mimicking this process in vitro will bring about major advances in the areas of materials science and nanotechnology. Among the available biological building blocks, peptides have several advantages as they present substantial diversity, their synthesis in large scale is straightforward, and they can easily be modified with biological and chemical entities1,2. Several classes of designed peptides such as cyclic peptides, amphiphile peptides and peptide-conjugates self-assemble into ordered structures in solution. Homoaromatic dipeptides, are a class of short self-assembled peptides that contain all the molecular information needed to form ordered structures such as nanotubes, spheres and fibrils3-8. A large variety of these peptides is commercially available.
This paper presents a procedure that leads to the formation of ordered structures by the self-assembly of homoaromatic peptides. The protocol requires only commercial reagents and basic laboratory equipment. In addition, the paper describes some of the methods available for the characterization of peptide-based assemblies. These methods include electron and atomic force microscopy and Fourier-Transform Infrared Spectroscopy (FT-IR). Moreover, the manuscript demonstrates the blending of peptides (coassembly) and the formation of a &#34;beads on a string&#34;-like structure by this process.9 The protocols presented here can be adapted to other classes of peptides or biological building blocks and can potentially lead to the discovery of new peptide-based structures and to better control of their assembly.

This paper describes the formation of highly ordered peptide-based structures by the spontaneous process of self-assembly. The method utilizes commercially available peptides and common lab equipment. This technique can be applied to a large variety of peptides and may lead to the discovery of new peptide-based assemblies.

Kısa Peptidlerinin Self-meclisi tarafından Sıralı Biyomoleküler Yapıların Oluşumu

In nature, complex functional structures are formed by the self-assembly of biomolecules under mild conditions. Understanding the forces that control ...

Confocal Imaging of Confined Quiescent and Flowing Colloid-polymer Mixtures

The behavior of confined colloidal suspensions with attractive interparticle interactions is critical to the rational design of materials for directed assembly1-3, drug delivery4, improved hydrocarbon recovery5-7, and flowable electrodes for energy storage8. Suspensions containing fluorescent colloids and non-adsorbing polymers are appealing model systems, as the ratio of the polymer radius of gyration to the particle radius&#160;and concentration of polymer control the range and strength of the interparticle attraction, respectively. By tuning the polymer properties and the volume fraction of the colloids, colloid fluids, fluids of clusters, gels, crystals, and glasses can be obtained9.&#160;Confocal microscopy, a variant of fluorescence microscopy, allows an optically transparent and fluorescent sample to be imaged with high spatial and temporal resolution in three dimensions. In this technique, a small pinhole or slit blocks the emitted fluorescent light from regions of the sample that are outside the focal volume of the microscope optical system. As a result, only a thin section of the sample in the focal plane is imaged. This technique is particularly well suited to probe the structure and dynamics in dense colloidal suspensions at the single-particle scale: the particles are large enough to be resolved using visible light and diffuse slowly enough to be captured at typical scan speeds of commercial confocal systems10. Improvements in scan speeds and analysis algorithms have also enabled quantitative confocal imaging of flowing suspensions11-16,37.&#160;In this paper, we demonstrate confocal microscopy experiments to probe the confined phase behavior and flow properties of colloid-polymer mixtures. We first prepare colloid-polymer mixtures that are density- and refractive-index matched. Next, we report a standard protocol for imaging quiescent dense colloid-polymer mixtures under varying confinement in thin wedge-shaped cells. Finally, we demonstrate a protocol for imaging colloid-polymer mixtures during microchannel flow.

Confocal microscopy is used to image quiescent and flowing colloid-polymer mixtures, which are studied as model systems for attractive suspensions. Image analysis algorithms are used to calculate structural and dynamic metrics for the colloidal particles that measure changes due to geometric confinement.

Kuşatılmış Quiescent ve akan Koloidno polimer Karışımlarının Eşodaklı Görüntüleme

The behavior of confined colloidal suspensions with attractive interparticle interactions is critical to the rational design of materials for directed ...

Preparation of Mica and Silicon Substrates for DNA Origami Analysis and Experimentation

The designed nature and controlled, one-pot synthesis of DNA origami provides exciting opportunities in many fields, particularly nanoelectronics. Many of these applications require interaction with and adhesion of DNA nanostructures to a substrate. Due to its atomically flat and easily cleaned nature, mica has been the substrate of choice for DNA origami experiments. However, the practical applications of mica are relatively limited compared to those of semiconductor substrates. For this reason, a straightforward, stable, and repeatable process for DNA origami adhesion on derivatized silicon oxide is presented here. To promote the adhesion of DNA nanostructures to silicon oxide surface, a self-assembled monolayer of 3-aminopropyltriethoxysilane (APTES) is deposited from an aqueous solution that is compatible with many photoresists. The substrate must be cleaned of all organic and metal contaminants using Radio Corporation of America (RCA) cleaning processes and the native oxide layer must be etched to ensure a flat, functionalizable surface. Cleanrooms are equipped with facilities for silicon cleaning, however many components of DNA origami buffers and solutions are often not allowed in them due to contamination concerns. This manuscript describes the set-up and protocol for in-lab, small-scale silicon cleaning for researchers who do not have access to a cleanroom or would like to incorporate processes that could cause contamination of a cleanroom CMOS clean bench. Additionally, variables for regulating coverage are discussed and how to recognize and avoid common sample preparation problems is described.

Reproducible cleaning processes for substrates used in DNA origami research are described, including bench-top RCA cleaning and derivatization of silicon oxide. Protocols for surface preparation, DNA origami deposition, drying parameters, and simple experimental set-ups are illustrated.

DNA Origami Analiz ve Deney için Mika ve Silikon Yüzeyler Hazırlanması

The designed nature and controlled, one-pot synthesis of DNA origami provides exciting opportunities in many fields, particularly nanoelectronics. Many of ...

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins (SIRT2) and Specific Protein-substrates

Acetylation has emerged as an important post-translational modification (PTM) regulating a plethora of cellular processes and functions. This is further supported by recent findings in high-resolution mass spectrometry based proteomics showing that many new proteins and sites within these proteins can be acetylated. However the identity of the enzymes regulating these proteins and sites is often unknown. Among these enzymes, sirtuins, which belong to the class III histone lysine deacetylases, have attracted great interest as enzymes regulating the acetylome under different physiological or pathophysiological conditions. Here we describe methods to link SIRT2, the cytoplasmic sirtuin, with its substrates including both in vitro and in vivo deacetylation assays. These assays can be applied in studies focused on other members of the sirtuin family to unravel the specific role of sirtuins and are necessary in order to establish the regulatory interplay of specific deacetylases with their substrates as a first step to better understand the role of protein acetylation. Furthermore, such assays can be used to distinguish functional acetylation sites on a protein from what may be non-regulatory acetylated lysines, as well as to examine the interplay between a deacetylase and its substrate in a physiological context.

Deacetylation Assays to Unravel the Interplay between Sirtuins SIRT2 and Specific Protein-substrates

This protocol describes the required steps to execute in vitro and in vivo deacetylation assays in order to establish the role of proteins as specific deacetylation substrates for sirtuins and further study the role of reversible - lysine acetylation as a post-translational modification.

Deasilasyon Tahliller Sirtuins arasında karşılıklı etkileşim (SIRT2) ve Özgül Protein yüzeylerde Unravel için

Acetylation has emerged as an important post-translational modification (PTM) regulating a plethora of cellular processes and functions. This is further ...

A Method to Manipulate Surface Tension of a Liquid Metal via Surface Oxidation and Reduction

Controlling interfacial tension is an effective method for manipulating the shape, position, and flow of fluids at sub-millimeter length scales, where interfacial tension is a dominant force. A variety of methods exist for controlling the interfacial tension of aqueous and organic liquids on this scale; however, these techniques have limited utility for liquid metals due to their large interfacial tension.
Liquid metals can form soft, stretchable, and shape-reconfigurable components in electronic and electromagnetic devices. Although it is possible to manipulate these fluids via mechanical methods (e.g., pumping), electrical methods are easier to miniaturize, control, and implement. However, most electrical techniques have their own constraints: electrowetting-on-dielectric requires large (kV) potentials for modest actuation, electrocapillarity can affect relatively small changes in the interfacial tension, and continuous electrowetting is limited to plugs of the liquid metal in capillaries.
Here, we present a method for actuating gallium and gallium-based liquid metal alloys via an electrochemical surface reaction. Controlling the electrochemical potential on the surface of the liquid metal in electrolyte rapidly and reversibly changes the interfacial tension by over two orders of magnitude ( &#820;500 mN/m to near zero). Furthermore, this method requires only a very modest potential (&#60; 1 V) applied relative to a counter electrode. The resulting change in tension is due primarily to the electrochemical deposition of a surface oxide layer, which acts as a surfactant; removal of the oxide increases the interfacial tension, and vice versa. This technique can be applied in a wide variety of electrolytes and is independent of the substrate on which it rests.

We present a method to control the interfacial energy of a liquid metal in an electrolyte via electrochemical deposition (or removal) of a surface oxide layer. This simple method can control the capillary behavior of gallium-based liquid metals by tuning the interfacial energy rapidly, significantly, and reversibly using modest voltages.

Bir Yöntem Yüzey Oksidasyon ve İndirgeme yoluyla Sıvı Metal Yüzey Gerilim işleyin

Controlling interfacial tension is an effective method for manipulating the shape, position, and flow of fluids at sub-millimeter length scales, where ...

Coulomb Explosion Imaging as a Tool to Distinguish Between Stereoisomers

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish between enantiomers (stereoisomers) of simple chiral species on the level of individual molecules. In this approach, a gaseous molecular jet of the sample expands into a vacuum chamber and intersects with femtosecond (fs) laser pulses. The high intensity of the pulses leads to fast multiple ionization, igniting a so-called Coulomb Explosion that produces several cationic (positively charged) fragments. An electrostatic field guides these cations onto time- and position-sensitive detectors. Similar to a time-of-flight mass spectrometer, the arrival time of each ion yields information on its mass. As a surplus, the electrostatic field is adjusted in a way that the emission direction and the kinetic energy after fragmentation lead to variations in the time-of-flight and in the impact position on the detector.
Each ion impact creates an electronic signal in the detector; this signal is treated by high-frequency electronics and recorded event by event by a computer. The registered data correspond to the impact times and positions. With these data, the energy and the emission direction of each fragment can be calculated. These values are related to structural properties of the molecule under investigation, i.e. to the bond lengths and relative positions of the atoms, allowing to determine molecule by molecule the handedness of simple chiral species and other isomeric features.

For small chiral species, Coulomb Explosion Imaging provides a new approach to determine the handedness of individual molecules.

Hipoglisemi arasında ayırt etmek için bir araç olarak Coulomb patlama görüntüleme

This article shows how the COLTRIMS (Cold Target Recoil Ion Momentum Spectroscopy) or the "reaction microscope" technique can be used to distinguish ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the evaluation of DNA-magnetic particles binding via dynamic light scattering (DLS) and electrophoretic light scattering (ELS). Analysis by DLS provides valuable information on the physicochemical properties of particles including particle size, polydispersity, and zeta potential. The latter describes the surface charge of the particle which plays major role in electrostatic binding of materials such as DNA. Here, a comparative analysis exploits three chemical modifications of nanoparticles and microparticles and their effects on DNA binding and elution. Chemical modifications by branched polyethylenimine, tetraethyl orthosilicate and (3-aminopropyl)triethoxysilane are investigated. Since DNA exhibits a negative charge, it is expected that zeta potential of particle surface will decrease upon binding of DNA. Forming of clusters should also affect particle size. In order to investigate the efficiency of these particles in isolation and elution of DNA, the particles are mixed with DNA in low pH (~6), high ionic strength and dehydration environment. Particles are washed on magnet and then DNA is eluted by Tris-HCl buffer (pH = 8). DNA copy number is estimated using quantitative polymerase chain reaction (PCR). Zeta potential, particle size, polydispersity and quantitative PCR data are evaluated and compared. DLS is an insightful and supporting method of analysis that adds a new perspective to the process of screening of particles for DNA isolation.

This protocol describes the synthesis of magnetic particles and evaluation of their DNA-binding properties via dynamic and electrophoretic light scattering. This method focuses on monitoring changes in particle size, their polydispersity and zeta potential of particle surface which play major role in binding of materials such as DNA.

DNA Manyetik Parçacık dinamik ve elektroforetik ışık saçılma göre analiz bağlama

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

The use of nanoprobes such as gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles as detection reagents in bioanalytical assays can enable high sensitivity and convenient colorimetric readout. However, high densities of nanoparticles are typically needed for detection. The available synthesis-based enhancement protocols are either limited to gold and silver nanoparticles or rely on precise enzymatic control and optimization. Here, we present a protocol to enhance the colorimetric readout of gold, silver, silica, and iron oxide nanoprobes. It was observed that the colorimetric signal can be improved by up to a 10000-fold factor. The basis for such signal enhancement strategies is the chemical reduction of Au3+ to Au0. There are several chemical reactions that enable the reduction of Au3+ to Au0. In the protocol, Good&#39;s buffers and H2O2 are used and it is possible to favor the deposition of Au0 onto the surface of existing nanoprobes, in detriment of the formation of new gold nanoparticles. The protocol consists of the incubation of the microarray with a solution consisting of chloroauric acid and H2O2 in 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid pH 6 buffer following the nanoprobe-based detection assay. The enhancement solution can be applied to paper and glass-based sensors. Moreover, it can be used in commercially available immunoassays as demonstrated by the application of the method to a commercial allergen microarray. The signal development requires less than 5 min of incubation with the enhancement solution and the readout can be assessed by naked eye or low-end image acquisition devices such as a table-top scanner or a digital camera.

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

In this work, a protocol for signal enhancement of nanoprobe-based biosensing is presented. The protocol is based on the reduction of chloroauric acid onto the surface of existing nanoprobes that consist of gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles.

Hızlı Nanoprobe sinyal geliştirme içinde in Situ altın nanoparçacık sentezi tarafından

The use of nanoprobes such as gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles as detection reagents in bioanalytical assays can enable high sensitivity ...

Solvothermal Synthesis of MIL-96 and UiO-66-NH2 on Atomic Layer Deposited Metal Oxide Coatings on Fiber Mats

Metal-organic frameworks (MOFs), which contain reactive metal clusters and organic ligands allowing for large porosities and surface areas, have proven effective in gas adsorption, separations, and catalysis. MOFs are most commonly synthesized as bulk powder, requiring additional processes to adhere them to functional devices and fabrics that risk decreasing the powder porosity and adsorption capacity. Here, we demonstrate a method of first coating fabrics with metal oxide films using atomic layer deposition (ALD). This process creates conformal films of controllable thickness on each fiber, while providing a more reactive surface for MOF nucleation. By submerging the ALD coated fabric in solution during solvothermal MOF synthesis, the MOFs create a conformal, well-adhered coating on the fibers, resulting in a MOF-functionalized fabric, without additional adhesion materials that may block MOF pores and functional sites. Here we demonstrate two solvothermal synthesis methods. First, we form a MIL-96(Al) layer on polypropylene fibers using synthetic conditions that convert the metal oxide to MOF. Using initial inorganic films of varying thicknesses, diffusion of the organic linker into the inorganic allows us to control the extent of MOF loading on the fabric. Second, we perform a solvothermal synthesis of UiO-66-NH2 in which the MOF nucleates on the conformal metal oxide coating on polyamide-6 (PA-6) fibers, thereby producing a uniform and conformal thin film of MOF on the fabric. The resulting materials can be directly incorporated into filter devices or protective clothing and eliminate the maladroit qualities of loose powder.

Solvothermal Synthesis of MIL-96 and UiO-66-NH2 on Atomic Layer Deposited Metal Oxide Coatings on Fiber Mats

Metal-organic frameworks are effective in gas storage and heterogeneous catalysis, but typical synthesis methods result in loose powders that are difficult to incorporate into smart materials. We demonstrate a method of first coating fabrics with ALD metal oxides, resulting in conformal films of MOF on the fabrics during solvothermal synthesis.

Solvothermal sentez MIL-96 ve UIO-66-NH2 atom katman üzerinde Metal oksit kaplama Fiber paspaslar üzerine yatırılır.

Metal-organic frameworks (MOFs), which contain reactive metal clusters and organic ligands allowing for large porosities and surface areas, have proven ...