This project was funded by the Government of Canada through Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (OGI-046), and Ontario Research Fund&#8211;Global Leadership in Genomics and Life Sciences GL2-01-035 (to M.G. and V.G.). T.V.L. is a postdoctoral fellow of the Fund for Scientific Research Flanders (FWO).

Örümcek Mite Nüfus 1. Bakım NOT: Örümcek akarları (Phaseolus vulgaris) Kaliforniya kırmızı barbunya fasulye yetiştirilir. <ol><li> Önce istilası 2-3 hafta süreyle tohum fasulye bitkileri büyütün. </li><li> Istila bitkilerle Intermix bu bitkiler; Yetişkin akarlar hızla taze bitki materyali kolonize edecek. </li><li> Taze bitkiler ile bunların yerine, her 7-10 gün eski musallat fasulye bitkileri sökün. </li></ol> 2.. Yetişkin Kadın Akarlar Toplama <ol><li> Yıkama Yöntemi kullanılarak Koleksiyon mite <ol><li> Akarları toplamak için, 1-2 gün önce deney enfekte bitkiler ile temas halinde olan bir taze fasulye bitki yer. </li><li> 1,000 2,000 yetişkin dişi akarları toplamak için 20 ila 30 taze fasulye bitkileri kullanın. </li><li> Oda sıcaklığında musluk suyu ile% 0.001 Tween 20 ihtiva eden bir çözelti hazırlayın. </li><li> Her seferinde 2-3 bitkileri kullanarak, Tween 20 çözeltisi içinde istila edilmiş fasulye bitkileri yıkayın. </li><li&gt; Her bitki yapraklarından tüm akarları toplamak için 2-3x yıkanır. </li><li> Komple adım akarı ölümlerini önlemek için 10 dakika içinde 2.1.4. </li></ol></li><li> Tanımlı Mesh Boyutu Elek ile Mite Süspansiyon Filtrasyon ile Yetişkin Kadın Akarlar İzolasyonu <ol><li> Aşağıdaki örgü boyutları elekler hazırlayın: 500 mikron (enkaz kaldırmak için) ve 300 mikron (dişi yetişkin akarları toplamak için) (Şekil 1A). </li><li> 500 um elekten süspansiyon filtre. </li><li> 300 um elekten süspansiyon Refilter. Yetişkin dişi akarlar muhafaza edilecektir. </li><li> Tween 20 kaldırmak için temiz musluk suyu, yetişkin dişi akarları ile 300 mikron elek batırın. </li><li> Eleğin altındaki bir tek kat olarak akarlar yayıldı. </li><li> Eleğin ağ gözü ve taraftan fazla suyu almak için kağıt havlu kullanın. NOT: akarları kurtarmak için hızla kurumasını gerekir, çünkü bu yapılır. </li><li> Şekil 1 &#39;de gösterildiği gibi bir montaj hazırlayınB; Bu akarlar serbestçe hareket sağlayacak, ama onları kaçmasını önleyecektir. </li><li> Bir destek olarak kullanılan elek üstünde akarları elek yerleştirin. </li><li> Dağılmasını akarları önlemek için su ile alt elek Surround. NOT: Akarlar sonra yaklaşık 5 dakika kurtarma başlayacak. Yaklaşık 30 dakika sonra, hareketli akar sayısı toplama (Şekil 1D) başlatmak için yeterlidir. Onlar koleksiyonu ile engel olacak ipek üretmek gibi Akarlar, 1 saat içinde alınmalıdır. </li></ol></li></ol> Akarlar ile 3. Bitki istila NOT: Erişkin dişi kene iyileşti sonra, onlar bitki istilası için kullanılabilir. A) ince bir fırça (protokol bölüm 3.1) kullanılarak ve b) bir pompa veya vakum hattı (protokol bölüm 3.2) kullanılarak: Erişkin dişi kene ile deneysel bitkileri istila etmek için kullanılan 2 yöntem vardır. <ol><li> Bir fırça kullanarak Akar istila NOT: Örümcek istilasıBir fırça bitki başına 30 kadar akar uygulanması için kullanılan ile. <ol><li> Büyüklüğü 00 veya daha ince bir yumuşak saçlar yuvarlak sanat fırça kullanın. </li><li> RT musluk suyu ile fırça ıslatın. </li><li> Yavaşça fırça ucu kullanarak elekten akarları pick up ve tesisine aktaracaktır. </li></ol></li><li> Bir Pompa kullanarak Infestationu mite NOT: 30&#39;dan akarlar tatbik edildiğinde, bir pompa / vakum hattı ile toplanmıştır akarları ile bitki istilası kullanılır. Bu yöntem için, mikro-elektronik bileşenler alıcı veya bir vakum hattı için bir vakum pompası kullanılabilir. Bu hava akımı sabit ve yeterli mukavemet (2-4 psi) tutmak için önemlidir. <ol><li> Pompa / vakum tüpü ile ucu arasında bir adaptör olarak altındaki bir 1.5 ml santrifüj tüpü kesme kullanılarak pompa ya da vakum hattına bağlayan bir tüpe 1 ml pipet takın. </li><li> Pipet ve adaptörü (1.5 ml santrifüj tüpü) arasında kağıt havlu bir parça yerleştirin. Not: Bu amaçla t içine tuzak akarları içino aspirasyon işlemi sırasında pipet ucu ve aynı zamanda hava akımı (Şekil 1C) azaltmak için. </li><li> Pipet kullanarak elekten doğrudan akarları toplayın. </li><li> Seçenek olarak ise, bir Stereoskop kullanılarak Sirayet ettirilmiş yapraklardan akarları tek tek toplar. </li><li> Akarların gerekli sayıda alındıktan sonra, pipet ucu arkasında kağıt havlu parçası rahatsız olduğundan emin olun, tüpten pipet çıkarın. </li><li> Pipet dokunarak ve birlikte akarları kümeleyerek akarları toplayın. Daha sonra, yaprak üzerine koyun; saniye içinde, akarlar yaprak dağılmaya başlar. </li></ol></li></ol> 4.. Kayıt ve değerlendirilmesi Bitki Hasar <ol><li> Kayıt Bitki Hasar NOT: A için thaliana, bitki hasar akar besleme 4 gün sonra değerlendirilir. Hasar klorotik noktaların toplam yüzey alanı olarak kaydedilir. Hasar ölçümü için, tüm rozet kesilir ve taranır.Açıklanan tarama parametreleri Epson V30 tarayıcı için ancak benzer herhangi bir masaüstü tarayıcı için iyi bir başlangıç ​​noktası olarak hareket edecektir. Sağlayan tüm deneyler için sabit tarama parametrelerini tutmak bireysel deneme seferleri arasında karşılaştırma. <ol><li> Bitki materyali ile tarayıcı yüzeydeki önlemek için şeffaflık levha ile tarayıcı yatak örtün. </li><li> Yani yaprakların adaxial (üst) taraf tarayıcı ışık kaynağı ve yakalama elemanı karşı karşıya tarayıcı yatağına bütün bir rozet ve yeri kesin. Alternatif olarak, rozet tarayıcı yatağa koymadan önce tek tek yaprakların veya ince makas ile örtüşmeyen yaprakları gruba rozet teşrih, örtüşme olmadan bireysel yaprakları yakalamak için çok yoğun eğer. Çoklu prizler aynı anda taranabilir. </li><li> Bağlılık ve tarayıcı kapağının kirlenmesini önlemek için beyaz bir kağıt parçası ile rozet veya örtün. </li><li> Yakın tarayıcı kapağı ve aşağıdaki parametreler ile bir tarama gerçekleştirin: Çözünürlük: 1,200 dpi; Renk modu: Adobe RGB; Parlaklık: +25; Dosya türü: maksimum kalite JPEG. </li><li> Sonraki zarar analiz için görüntü dosyaları kaydedin. </li></ol></li><li> Bitki Hasar miktarının NOT: hasar alan elle Photoshop kullanılarak hesaplanır. Nedeniyle akarı beslenme sonucu yaprak şekli ve semptomların renk yoğunluğundaki büyük farklılıklara bağlı olarak, otomatik yöntemler güvenilmez. Bu durumda, bir ızgara yöntem bitki hasarı değerlendirmek için kullanılır: <ol><li> Photoshop ile bitkinin görüntü açın. </li><li> (- Show - Izgara, klavye kısayolu Ctrl + &#39;görüntüleme veya Display), yeni bir katman oluşturun, sonra da 0.25 mm x 0.25 mm bölünmeleri bir ızgara ile taranan görüntüyü kaplayabilirsiniz. </li><li> Kalıplı bir katmanda, bir nokta (&quot;Kalem Aracı&quot;, klavye kısayolu B kullanımı) kullanarak hasarlı yaprak alanları işaretleyin. Izgara birimi birden fazla yarısını kapsayan bir hasar var olduğu aşağıdaki ızgaranın her bir kare için bir tek bir nokta kullanın. Nokta büyüklüğü (piksel tanımlanır, yani, </em&gt; Nokta başına 52 piksel). </li><li> Katmanda piksel sayısını belirlemek için - ızgara ünitesinin en az yarısını kaplayan bitki zarar göstermek ızgara tüm kareler bir nokta ile işaretli olduğunda, histogram aracı (Histogram Penceresi) kullanabilirsiniz. Histogram aracı, piksel sayısını ölçmek için bir izin verir. Her bir nokta piksel sabit ve belli bir sayı ile temsil edildiğinden, histogram aracı, uzantısı, noktaların toplam sayısını temsil eden toplam piksel sayısını ölçmek ve işaretlenmiş olan kareler toplam sayısı. </li><li> Formül kullanılarak işaretlenen &quot;nokta&quot; sayısını hesaplayın: Nokta sayısı = nokta başına piksel piksel sayısı / toplam sayısı. </li><li> Bir nokta ızgara bir kare karşılık olarak, ızgara 1 kare alanı ile görüntü üzerinde işaretlenen noktaların sayısını çarparak hasar toplam alanı hesaplayın. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Jeppson, L. R., Keifer, H. H., Baker, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Mites injurious to economic plants. , (1975).</li><li>Migeon, A., Dorkeld, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spider+Mites+Web:+a+comprehensive+database+for+the+Tetranychidae.">Spider Mites Web: a comprehensive database for the Tetranychidae.</a> http://www.montpellier.inra.fr/CBGP/spmweb. , (2013).</li><li>Croft, B. A., Vandebaan, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecological+and+Genetic-Factors+Influencing+Evolution+of+Pesticide+Resistance+in+Tetranychid+and+Phytoseiid+Mites.">Ecological and Genetic-Factors Influencing Evolution of Pesticide Resistance in Tetranychid and Phytoseiid Mites.</a> Exp Appl Acarol. 4, 277-300 (1988).</li><li>Van Leeuwen, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+heteroplasmy+and+the+evolution+of+insecticide+resistance:+Non-Mendelian+inheritance+in+action.">Mitochondrial heteroplasmy and the evolution of insecticide resistance: Non-Mendelian inheritance in action.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 5980-5985 (2008).</li><li>Van Leeuwen, T., Vontas, J., Tsagkarakou, A., Dermauw, W., Tirry, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acaricide+resistance+mechanisms+in+the+two-spotted+spider+mite+Tetranychus+urticae+and+other+important+Acari:+A+review.">Acaricide resistance mechanisms in the two-spotted spider mite Tetranychus urticae and other important Acari: A review.</a> Insect Biochem Molec. 40, 563-572 (2010).</li><li>Dermauw, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cys-loop+ligand-gated+ion+channel+gene+family+of+Tetranychus+urticae:+Implications+for+acaricide+toxicology+and+a+novel+mutation+associated+with+abamectin+resistance.">The cys-loop ligand-gated ion channel gene family of Tetranychus urticae: Implications for acaricide toxicology and a novel mutation associated with abamectin resistance.</a> Insect Biochem Molec. 42, 455-465 (2012).</li><li>Van Leeuwen, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Population+bulk+segregant+mapping+uncovers+resistance+mutations+and+the+mode+of+action+of+a+chitin+synthesis+inhibitor+in+arthropods.">Population bulk segregant mapping uncovers resistance mutations and the mode of action of a chitin synthesis inhibitor in arthropods.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 109, 4407-4412 (2012).</li><li>Dearden, P. K., Donly, C., Grbic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+pair-rule+gene+homologues+in+a+chelicerate:+early+patterning+of+the+two-spotted+spider+mite+Tetranychus+urticae.">Expression of pair-rule gene homologues in a chelicerate: early patterning of the two-spotted spider mite Tetranychus urticae.</a> Development. 129, 5461-5472 (2002).</li><li>Khila, A., Grbic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+silencing+in+the+spider+mite+Tetranychus+urticae:+dsRNA+and+siRNA+parental+silencing+of+the+Distal-less+gene.">Gene silencing in the spider mite Tetranychus urticae: dsRNA and siRNA parental silencing of the Distal-less gene.</a> Development genes and evolution. 217, 241-251 (2007).</li><li>Grbic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mity+model:+Tetranychus+urticae,+a+candidate+for+chelicerate+model+organism.">Mity model: Tetranychus urticae, a candidate for chelicerate model organism.</a> BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 29, 489-496 (2007).</li><li>Grbic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genome+of+Tetranychus+urticae+reveals+herbivorous+pest+adaptations.">The genome of Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations.</a> Nature. 479, 487-492 (2011).</li><li>Kliebenstein, D., Pedersen, D., Barker, B., Mitchell-Olds, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+analysis+of+quantitative+trait+loci+controlling+glucosinolates,+myrosinase+and+insect+resistance+in+Arabidopsis+thaliana.">Comparative analysis of quantitative trait loci controlling glucosinolates, myrosinase and insect resistance in Arabidopsis thaliana.</a> Genetics. 161, 325-332 (2002).</li><li>Abe, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Function+of+jasmonate+in+response+and+tolerance+of+Arabidopsis+to+thrip+feeding.">Function of jasmonate in response and tolerance of Arabidopsis to thrip feeding.</a> Plant &amp; cell physiology. 49, 68-80 (2008).</li><li>Whiteman, N. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mining+the+plant-herbivore+interface+with+a+leafmining+Drosophila+of+Arabidopsis.">Mining the plant-herbivore interface with a leafmining Drosophila of Arabidopsis.</a> Molecular ecology. 20, 995-1014 (2011).</li><li>Goodspeed, D., Chehab, E. W., Min-Venditti, A., Braam, J., Covington, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Arabidopsis+synchronizes+jasmonate-mediated+defense+with+insect+circadian+behavior.">Arabidopsis synchronizes jasmonate-mediated defense with insect circadian behavior.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 109, 4674-4677 (2012).</li><li>Kim, J. H., Lee, B. W., Schroeder, F. C., Jander, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+indole+glucosinolate+breakdown+products+with+antifeedant+effects+on+Myzus+persicae+(green+peach+aphid).">Identification of indole glucosinolate breakdown products with antifeedant effects on Myzus persicae (green peach aphid).</a> The Plant journal : for cell and molecular biology. 54, 1015-1026 (2008).</li><li>Adio, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biosynthesis+and+defensive+function+of+Ndelta-acetylornithine,+a+jasmonate-induced+Arabidopsis+metabolite.">Biosynthesis and defensive function of Ndelta-acetylornithine, a jasmonate-induced Arabidopsis metabolite.</a> Plant Cell. 23, 3303-3318 (2011).</li><li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+tomato+homolog+of+CORONATINE-INSENSITIVE1+is+required+for+the+maternal+control+of+seed+maturation,+jasmonate-signaled+defense+responses,+and+glandular+trichome+development.">The tomato homolog of CORONATINE-INSENSITIVE1 is required for the maternal control of seed maturation, jasmonate-signaled defense responses, and glandular trichome development.</a> Plant Cell. 16, 126-143 (2004).</li><li>Kant, M. R., Ament, K., Sabelis, M. W., Haring, M. A., Schuurink, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+timing+of+spider+mite-induced+direct+and+indirect+defenses+in+tomato+plants.">Differential timing of spider mite-induced direct and indirect defenses in tomato plants.</a> Plant Physiol. 135, 483-495 (2004).</li><li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NIH+Image+to+ImageJ:+25+years+of+image+analysis.">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nat Methods. 9, 671-675 (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Bu video izole etmek ve yetişkin dişi kene, çok sayıda bitkileri istila için kullanılan protokoller gösterir. Biz A. kullanarak bu protokolü sunulmasına rağmen thaliana, herhangi bir bitki örümcek akarı etkileşim sistemi için kullanılabilir ve halen başarılı bir şekilde, domates ve üzüm (Vitis vinifera) bitkiler üzerinde de tatbik edilmektedir. Toplanan akar (Şekil 3) benzer fizyolojik durumu olduğuna işaret protokol verimleri tekrarlanabilir sonuçla...

Bitki-böcek etkileşimi büyük bilimsel ve ekonomik öneme sahip bir konudur. Bu tarihsel (örneğin domates gibi) hem de bitki ve bitki modeli, A. kullanılarak incelendi thaliana. Her iki durumda da, otobur için bitki duyarlılık otobur saldırı sonrasında ya da dolaylı zararlı performans değerlendirmesi yoluyla doğrudan bitki fenotip değerlendirilmesi yoluyla ölçülebilir. Bitki duyarlılık doğrudan ölçümleri çeşitli yöntemler kullanılarak böcek pest türlerin bir dizi için daha önce kullanılmıştır. Örneğin, lepidopteran larvaların herbivory bir ızgara 12 yardımıyla, çıplak göz ile Plutella xylostella (diamondback moth) veya Trichoplusia ni (Lahana kurdu) tarafından tüketilen ya da bitki dokusunun bir bölümünün bir tahmin olarak ölçülür. Ayrıca, daha sonra kantitatif görüntü analizi ile yaprak hasarı dijital görüntüleme kullanan yöntem vardır. Bu yöntemler kullanılmıştırA. çalışmaları Frankliniella occidentalis (batı çiçek bitleri) 13, Scaptomyza flava (yaprak-madencilik Drosophila) 14 ve T. ile thaliana&#39;nın etkileşim ni 15. Bitki duyarlılık dolaylı ölçümleri yaygın bitki-böcek etkileşimi çalışmalarında kullanılmaktadır. A. Örnek olarak, duyarlılık herbivory persicae yaprak biti Myzus şeftali thaliana&#39;nın genellikle haşere doğurgan ve etkileşim 16,17 sonra bitkinin brüt morfolojisi açıklaması analizi ile değerlendirilir. A. başka tipik dolaylı gösterge Bir haşereye thalianadan duyarlılık otçulun kuru veya ıslak ağırlık değerlendirmedir. Bu parametre genellikle böyle Pieris rapae (küçük beyaz), P. gibi lepidoterans arasında herbivory, karakterize etmek için kullanılır xylostella, veya T. onların larva veya pupa da ni 15,17 aşamaları. Örümcek akarları hücre içeriğini fe vardıreders. Mite kaynaklı hasar soluk yeşil rengi beyazdan aralığı klorotik noktalar topluluğu olarak kabul edilmektedir. Örümcek akarı herbivory bir bitki konakçının duyarlılığı önceden örümcek akarı performans günlerin analizi yoluyla dolaylı olarak değerlendirildi sonrası istila 18,19, ya da doğrudan bitkiler hafta sonrası istilası 18 brüt morfolojisini kullanarak veya maruz kalan yaprakların bir dijital görüntüleme kullanarak sonraki otomatik görüntü analizi 19 gün boyunca akarları için. Bu yöntemler geliştirilmiş ve domates bitki ve T. arasındaki etkileşimleri çalışmaları için kullanılmaya başlandı urticae, ve tipik olarak karma akar popülasyonundan toplandı ve yumuşak bir fırça ile yaprak yüzeyine yerleştirildi örümcek akarlarının az sayıda (tedavi başına 5-15) kullanılmıştır. Bununla birlikte, bu yöntemler, akarların daha fazla sayıda uygulanması gereken çalışmalar için uygun değildir. Buna ek olarak, yaprak ise görüntülerin doğrudan işleme resim analiz yazılımıAdobe Photoshop (San Jose, CA) veya ImageJ 20 domates hasar analizi için kullanılabilen gibi, bu protokol yüzeyinin daha büyük bir yansıtma yapabilirliği vardır veya açık renkli ve yüksek görünür trikomlar, var (yapraklara uygulanması için değişiklik ihtiyacı bitki hasar işaretlemek klorotik noktalar otomatik seçim ile müdahale, örneğin, A. thaliana). Bundan başka, hali hazırda önceki yöntemlerle kullanılabilir örümcek akarlarının gelişim aşamasında, en yaygın ve kolayca tanımlanabilir yetişkin kadın sınırlı değildir ve diğer gelişim aşamaları kullanımını önleyen edilir. Bitki örümcek akarı etkileşimi yüksek verimlilik analizi doğru ilk kritik adım örümcek akarları ile bitkiler meydan ve güvenilir bir etkileşim sonuçlarını değerlendirmek için tekrarlanabilir, basit ve sağlam protokoller kurmaktır. Bu video, büyük bir num hızlı ve kolay toplanması için etkin bir yöntem olarakber yetişkin dişi akarlar, bir deney tesisi ana ve bağlı örümcek akarı beslenmeye bitki zarar değerlendirilmesine ilişkin uygulama açıklanmıştır. Sunulan protokol takip eden deney uygulama için kullanılabilecek herhangi bir gelişim aşamasında (yumurta, larva, kurtçuklar, yetişkin erkek ve kadın) bireyler yüzlerce hızlı ve etkin bir toplama sağlar. Buna ek olarak, bu protokoller bir akarı ana bitkiye uygulanabilir, ama özellikle A. durumunda gösterilmektedir thaliana.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1157">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Plant material:</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">California red kidney bean</td>
			<td style="width:275px;">Stokes, Thorold, ON, Canada</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Two week old, well infested with spider mites two or three days before use. Other cultivars of Phaseolus vulgaris can be used.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Chemicals:</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Tween 20</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">P9416</td>
			<td style="width:527px;">1% stock solution is prepared to simplify aliquoting</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Tap water</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">At room temperature, heat- and cold-shock affect mite survival rate and peformance</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Other materials and equipment:</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Plastic tray</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Set of scissors</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">2 L beakers</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Paper towels</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Sets of sieves</td>
			<td style="width:275px;">Manufactured in house</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Detailed instructions are available</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Thin brush</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Pipettes</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Pipette tips</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">0.2 and 1 mL</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">1.5 mL centrifuge tubes</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Air pump</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Aquarium type pump with inverted air flow. Vacuum line can be used. Required pressure drop is approx. 2-4 psi</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Stereoscope</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Scanner</td>
			<td>Epson</td>
			<td style="width:125px;">V30</td>
			<td style="width:527px;">Any flatbed scanner allowing necessary degree of control over scan quality. We use Epson V30 for our experiments.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Computer</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Windows or OS X PC which is compatible with scanner hardware and Adobe Photoshop software.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Adobe Photoshop software</td>
			<td style="width:275px;">Adobe Systems Inc., San Jose, CA, USA</td>
			<td style="width:125px;">various</td>
			<td style="width:527px;">Any version with Histogram tool included.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

application of two-spotted spider mite tetranychus urticae for plant-pest interaction studies

Iki benekli örümcek, Tetranychus urticae, ekonomik değeri 150&#39;den fazla olan türlerin derece geniş bir dizi, beslenen bir yerde polifag Eklembacaklıların otobur olduğunu. Bu, özellikle Solanaceae ve Cucurbitaceae mısır, pamuk gibi (örneğin, domates, patlıcan, biber, salatalık, kabak) ve sera süs bitkileri (örneğin, gül, krizantem, karanfil), yıllık tarla bitkileri (içinde, sera bitkileri önemli bir zararlı olduğunu soya, şeker pancarı), ve çok yıllık kültürler (yonca, çilek, üzüm, narenciye, ve erik) 1,2. Önemli bir tarımsal böcek, T. yapan uç polyphagy ek olarak, urticae, kontrolü 3-7 için kullanılan insektisit ve akarisit geniş bir yelpazeye karşı direnç geliştirmek için bir eğilim vardır. T. urticae o (27 ° C&#39;de 7 gün) hızlı bir yaşam döngüsüne sahip olarak, mükemmel bir deneysel organizmadırve kolay bir şekilde, laboratuarda, yüksek yoğunlukta muhafaza edilebilir. (In situ hibridizasyon ve antikor lekelemesi de dahil) gen ekspresyonunu analiz etmek için ve RNA girişimi kullanılarak örümcek kenesi, endojen genlerin ekspresyonunu etkisiz hale getirmek için yöntemler 8-10 geliştirilmiştir. Son zamanlarda, T. bütün genom sekansı, urticae zaten konukçu bitkiler (Arabidopsis thaliana ve domates Solanum lycopersicum) 11 bazı mevcut eşdeğer genomik kaynaklara sahip bir model organizma olarak bu haşere otobur geliştirmek için bir fırsat yaratma, rapor edilmiştir. Birlikte, bu model organizmalar bitki-böcek etkileşimleri moleküler üsleri içgörüler sağlayabilir. Burada, hızlı ve kolay bir yetişkin dişi kene, çok sayıda toplama, deneysel bitki ev sahibi üzerindeki uygulama ve nedeniyle örümcek akarı beslenme için bitki hasar değerlendirmesi için etkili bir yöntem tarif edilmiştir. Tr sunulan protokoldaha sonra deney uygulama için kullanılabilecek herhangi bir gelişim aşamasında (yumurta, larva, kurtçuklar, yetişkin erkek ve kadın) bireyler yüzlerce hızlı ve etkin bir toplama ables.

20 ile 30 musallat fasulye bitkileri kullanarak bir elekler kullanılarak yaklaşık 2.000 yetişkin dişi akarları toplayabilirsiniz. Keneden aktarmak için bir fırça kullanıyorsanız, bitki başına 20 akarları ile 10 bitkilerin istila için gerekli süre yaklaşık olarak 15 dk. Toplanması ve uygulama yöntemleri kombinasyonları, Şekil 2&#39;de gösterilmiştir. Bu protokol toplanan akarları benzer fizyolojik durumuna ve bitki örümcek akarı etkileşim çalış...

Watch this Scientific Journal Video about Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies at JoVE.com

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

Örümcek akarları, deney bitkilerin istilası ve bitki hasar değerlendirme homojen numune etkili hazırlanması için protokoller, bitki-zararlı etkileşim çalışmaları için gerekli olan geliştirilmiştir.

İki-benekli örümcek kenesi Uygulama<em&gt; Tetranychus urticae</em&gt; Bitki-belâ Etkileşim Çalışmaları

The two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, is a ubiquitous polyphagous arthropod herbivore that feeds on a remarkably broad array of species, with ...

application-two-spotted-spider-mite-tetranychus-urticae-for-plant

Research

JoVE Journal

Environment

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

17.6K Görüntüleme.  The University of Western Ontario.  Örümcek akarları, deney bitkilerin istilası ve bitki hasar değerlendirme homojen numune etkili hazırlanması için protokoller, bitki-zararlı etkileşim çalışmaları için gerekli olan geliştirilmiştir. 

Video: Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

Physical, Chemical and Biological Characterization of Six Biochars Produced for the Remediation of Contaminated Sites

The physical and chemical properties of biochar vary based on feedstock sources and production conditions, making it possible to engineer biochars with specific functions (e.g. carbon sequestration, soil quality improvements, or contaminant sorption). In 2013, the International Biochar Initiative (IBI) made publically available their Standardized Product Definition and Product Testing Guidelines (Version 1.1) which set standards for physical and chemical characteristics for biochar. Six biochars made from three different feedstocks and at two temperatures were analyzed for characteristics related to their use as a soil amendment. The protocol describes analyses of the feedstocks and biochars and includes: cation exchange capacity (CEC), specific surface area (SSA), organic carbon (OC) and moisture percentage, pH, particle size distribution, and proximate and ultimate analysis. Also described in the protocol are the analyses of the feedstocks and biochars for contaminants including polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), polychlorinated biphenyls (PCBs), metals and mercury as well as nutrients (phosphorous, nitrite and nitrate and ammonium as nitrogen). The protocol also includes the biological testing procedures, earthworm avoidance and germination assays. Based on the quality assurance / quality control (QA/QC) results of blanks, duplicates, standards and reference materials, all methods were determined adequate for use with biochar and feedstock materials. All biochars and feedstocks were well within the criterion set by the IBI and there were little differences among biochars, except in the case of the biochar produced from construction waste materials. This biochar (referred to as Old biochar) was determined to have elevated levels of arsenic, chromium, copper, and lead, and failed the earthworm avoidance and germination assays. Based on these results, Old biochar would not be appropriate for use as a soil amendment for carbon sequestration, substrate quality improvements or remediation.

Biochar is a carbon-rich material used as a soil amendment with the ability to sustainably sequester carbon, improve substrate quality and sorb contaminants. This protocol describes the 17 analytical methods used for the characterization of biochar, which is required prior to large scale implementation of these amendments in the environment.

Fiziksel, Kimyasal ve için üretilen Altı Biochars Biyolojik Karakterizasyonu Kontamine Siteleri İyileştirilmesi

The physical and chemical properties of biochar vary based on feedstock sources and production conditions, making it possible to engineer biochars with ...

Çevre

Characterization and Application of Passive Samplers for Monitoring of Pesticides in Water

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study provides a protocol for the passive sampler preparation, calibration, extraction method and instrumental analysis. Sampling rates (RS) and passive sampler-water partition coefficients (KPW) were calculated for silicone rubber, polar organic chemical integrative sampler POCIS-A, POCIS-B, SDB-RPS and C18 disk. The uptake of the selected compounds depended on their physicochemical properties, i.e., silicone rubber showed a better uptake for more hydrophobic compounds (log octanol-water partition coefficient (KOW) &#62; 5.3), whereas POCIS-A, POCIS-B and SDB-RPS disk were more suitable for hydrophilic compounds (log KOW &#60; 0.70).

A protocol about the characterization and application of five different passive sampling devices is presented.

Suda Pestisitlerin İzleme Karakterizasyonu ve Pasif Numune Uygulama

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study ...

Remote Sensing Evaluation of Two-spotted Spider Mite Damage on Greenhouse Cotton

The objective of this study was to evaluate a ground-based multispectral optical sensor as a remote sensing tool to assess foliar damage caused by the two-spotted spider mite (TSSM), Tetranychus urticae Koch, on greenhouse grown cotton. TSSM is a polyphagous pest which occurs on a variety of field and horticultural crops. It often becomes an early season pest of cotton in damaging proportions as opposed to being a late season innocuous pest in the mid-southern United States. Evaluation of acaricides is important for maintaining the efficacy of and preventing resistance to the currently available arsenal of chemicals and newly developed control agents. Enumeration of spider mites for efficacy evaluations is laborious and time consuming. Therefore, subjective visual damage rating is commonly used to assess density of spider mites. The NDVI (Normalized Difference Vegetation Index) is the most widely used statistic to describe the spectral reflectance characteristics of vegetation canopy to assess plant stress and health consequent to spider mite infestations. Results demonstrated that a multispectral optical sensor is an effective tool in distinguishing varying levels of infestation caused by T. urticae on early season cotton. This remote sensing technique may be used in lieu of a visual rating to evaluate insecticide treatments.

This manuscript describes a multispectral optical sensor that effectively detected damage to early season cotton artificially infested with varying densities of the two-spotted spider mite populations.

Sera Pamuk İki benekli Örümcek akarı Hasarın Uzaktan Algılama Değerlendirilmesi

The objective of this study was to evaluate a ground-based multispectral optical sensor as a remote sensing tool to assess foliar damage caused by the ...

Modification and Application of a Leaf Blower-vac for Field Sampling of Arthropods

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropod populations in rice. When used in combination with an enclosure, application of this sampling device provides absolute estimates of the populations of arthropods as numbers per standardized sampling area. The sampling efficiency depends critically on the sampling duration. In a mature rice crop, a two-minute sampling in an enclosure of 0.13 m2 yields more than 90% of the arthropod population. The device also allows sampling of arthropods dwelling on the water surface or the soil in rice paddies, but it is not suitable for sampling fast flying insects, such as predatory Odonata or larger hymenopterous parasitoids. The modified blower-vac is simple to construct, and cheaper and easier to handle than traditional suction sampling devices, such as D-vac. The low cost makes the modified blower-vac also accessible to researchers in developing countries.

Assessment of arthropod abundance in crops is critical for investigating population dynamics and species interactions. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropods in rice.

Modifikasyon ve Arthropodların Saha Örnekleme için bir Yaprak Blower-vac Uygulama

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the ...

Use of a Filter Cartridge for Filtration of Water Samples and Extraction of Environmental DNA

Recent studies demonstrated the use of environmental DNA (eDNA) from fishes to be appropriate as a non-invasive monitoring tool. Most of these studies employed disk fiber filters to collect eDNA from water samples, although a number of microbial studies in aquatic environments have employed filter cartridges, because the cartridge has the advantage of accommodating large water volumes and of overall ease of use. Here we provide a protocol for filtration of water samples using the filter cartridge and extraction of eDNA from the filter without having to cut open the housing. The main portions of this protocol consists of 1) filtration of water samples (water volumes &#8804;4 L or &gt;4 L); (2) extraction of DNA on the filter using a roller shaker placed in a preheated incubator; and (3) purification of DNA using a commercial kit. With the use of this and previously-used protocols, we perform metabarcoding analysis of eDNA taken from a huge aquarium tank (7,500 m3) with known species composition, and show the number of detected species per library from the two protocols as the representative results. This protocol has been developed for metabarcoding eDNA from fishes, but is also applicable to eDNA from other organisms.

We describe a protocol for filtration of water samples with a filter cartridge and extraction of environmental DNA (eDNA) without having to cut open the housing to remove the filter. This protocol is developed for metabarcoding eDNA from fishes, but is also applicable to eDNA from other organisms.

Filtrasyon Su Örnekleri ve Çevre DNA Ekstraksiyon için bir Filtre Kartuşu Kullanımı

Recent studies demonstrated the use of environmental DNA (eDNA) from fishes to be appropriate as a non-invasive monitoring tool. Most of these studies ...

Vegetated Treatment Systems for Removing Contaminants Associated with Surface Water Toxicity in Agriculture and Urban Runoff

Urban stormwater and agriculture irrigation runoff contain a complex mixture of contaminants that are often toxic to adjacent receiving waters. Runoff may be treated with simple systems designed to promote sorption of contaminants to vegetation and soils and promote infiltration. Two example systems are described: a bioswale treatment system for urban stormwater treatment, and a vegetated drainage ditch for treating agriculture irrigation runoff. Both have similar attributes that reduce contaminant loading in runoff: vegetation that results in sorption of the contaminants to the soil and plant surfaces, and water infiltration. These systems may also include the integration of granulated activated carbon as a polishing step to remove residual contaminants. Implementation of these systems in agriculture and urban watersheds requires system monitoring to verify treatment efficacy. This includes chemical monitoring for specific contaminants responsible for toxicity. The current paper emphasizes monitoring of current use pesticides since these are responsible for surface water toxicity to aquatic invertebrates.

This article summarizes the design attributes and the effectiveness of treatment systems that treat urban stormwater and agriculture irrigation runoff to remove pesticides and other contaminants associated with aquatic toxicity.

Tarım ve Kentsel Akışta Yüzeysel Su Zehirlenmesiyle İlişkili Kirleticilerin Ortadan Kaldırılması İçin Vejetaryan Arıtma Sistemleri

Urban stormwater and agriculture irrigation runoff contain a complex mixture of contaminants that are often toxic to adjacent receiving waters. Runoff may ...

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current measures to combat such pathogens have proved too conservative and, thus, not sufficiently effective, and they can potentially pose environmental risks. Therefore, it is extremely necessary to identify host-resistance factors to assist in controlling plant diseases naturally through the identification of resistant germplasm, the isolation and characterization of resistance genes, and the molecular breeding of resistant cultivars. In this regard, there is need to establish an accurate, rapid, and large-scale inoculation method to breed and develop plant resistance genes. The rice blast fungal pathogen Magnaporthe grisea causes severe disease symptoms and yield losses. Recently, M. grisea has emerged as a model organism for studying the mechanisms of plant-fungal pathogen interactions. Hence, we report the development of a plant virulence test method that is specific for M. grisea. This method provides for both spray inoculation with a conidial suspension and wounding inoculation with mycelium cubes or droplets of conidial suspension. The key step of the wounding inoculation method for detached rice leaves is to make wounds on plant leaves, which avoids any interference caused by host penetration resistance. This spray/wounding protocol contributes to the rapid, accurate, and large-scale screening of the pathotypes of M. grisea isolates. This integrated and systematic plant infection method will serve as an excellent starting point for gaining a broad perspective of issues in plant pathology.

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Here, we present a protocol to test plant virulence with the plant pathogen Magnaporthe grisea. This report will contribute to the large-scale screening of the pathotypes of fungi isolates and serve as an excellent starting point for understanding the resistant mechanisms of plants during molecular breeding.

Bitki enfeksiyon Test: Sprey ve bitki patojeni Magnaporthe Grisea ile aşı yara-aracılı

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are also a useful scientific model to study motion vision and flight dynamics in a controlled laboratory setting. As the larvae develop in organically polluted water, they are useful models for investigating investment in microbial immunity. While large scale commercial breeding for agriculture already occurs, there are no standardized protocols for maintaining captive populations for scientific studies. This is important as commercial captive breeding programs focusing on mass output during peak pollination periods may fail to provide a population that is consistent, stable and robust throughout the year, as is often needed for other research purposes. Therefore, a method to establish, maintain and refresh a captive research population is required. Here, we describe the utilization of an artificial hibernation cycle, in addition to the nutritional and housing requirements, for long term maintenance of Eristalis tenax. Using these methods, we have significantly increased the health and longevity of captive populations of E. tenax compared to previous reports. We furthermore discuss small scale rearing methods and options for optimizing yields and manipulating population demographics.

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

The overall goal of these procedures is to establish, maintain and refresh a captive population of Eristalis tenax in a research setting.

Yetiştirme ve araştırma çalışmaları için Eristalis tenax Hoverflies uzun vadeli bakım

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and toxicological studies. Using automated digital tracking platforms, recent efforts in neuropharmacology are leveraging larval fish locomotor behaviors to identify potential therapeutic targets for novel small molecules. Similar to these efforts, research in the environmental sciences and comparative pharmacology and toxicology is examining various behaviors of fish models as diagnostic tools in tiered evaluation of contaminants and real-time monitoring of surface waters for contaminant threats. Whereas the zebrafish is a popular larval fish model in the biomedical sciences, the fathead minnow is a common larval fish model in ecotoxicology. Unfortunately, fathead minnow larvae have received considerably less attention in behavioral studies. Here, we develop and demonstrate a behavioral profile protocol using caffeine as a model neurostimulant. Though photomotor responses of fathead minnows were occasionally affected by caffeine, zebrafish&#160;were markedly more sensitive for photomotor and locomotor endpoints, which responded at environmentally relevant levels. Future studies are needed to understand comparative behavioral sensitivity differences among fish with age and time of day, and to determine whether similar behavioral effects would occur in nature and be indicative of adverse outcomes at the individual or population levels of biological organization.

Here, we present a protocol to examine larval zebrafish and fathead minnow locomotor activities and photomotor responses (PMR) using an automated tracking software. When incorporated in common toxicology bioassays, analyses of these behaviors provide a diagnostic tool to examine chemical bioactivity. This protocol is described using caffeine, a model neurostimulant.

Davranışsal yanıt profilleri larva balık incelenmesi için deneysel protokol: nöro-uyarıcı kafein uygulamaya

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Generating Homo- and Heterografts Between Watermelon and Bottle Gourd for the Study of Cold-responsive MicroRNAs

MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs of about 20 - 24 nt, known to play important roles in plant development and adaptation. There is an accumulating evidence showing that the expressions of certain miRNAs are altered when grafting, an agricultural practice commonly used by farmers to improve crop tolerance to biotic and abiotic stresses. Bottle gourd is an inherently climate-resilient crop compared to many other major cucurbits, including watermelon, rendering it one of the most widely used rootstocks for the latter. The recent advancement of high-throughput sequencing technologies has provided great opportunities to investigate cold-responsive miRNAs and their contributions to heterograft advantages; yet, adequate experimental procedures are a prerequisite for this purpose. Here, we present a detailed protocol for efficiently generating homo- and heterografts between the cold-susceptible watermelon and the cold-tolerant bottle gourd, in addition to methods of tissue sampling, data generation, and data analysis. The presented methods are also useful for other plant-grafting systems, to interrogate miRNA regulations under various environmental stresses, such as heat, drought, and salinity.

Here we present a detailed protocol for efficiently making homo- and heterografts between watermelon and bottle gourd, in addition to methods of tissue sampling, data generation, and data analysis, for the investigation of cold-responsive microRNAs.

Homo - ve Heterografts arasında karpuz ve kabak şişe soğuk duyarlı mikroRNA'lar çalışma için oluşturma

MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs of about 20 - 24 nt, known to play important roles in plant development and adaptation. There is ...