This project was funded by the Government of Canada through Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (OGI-046), and Ontario Research Fund&#8211;Global Leadership in Genomics and Life Sciences GL2-01-035 (to M.G. and V.G.). T.V.L. is a postdoctoral fellow of the Fund for Scientific Research Flanders (FWO).

1. תחזוקה של עכביש קרדית האוכלוסייה הערה: קרדית עכביש שגדל על קליפורניה כליה אדומה שעועית (Phaseolus vulgaris). <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לגדל צמחי שעועית מזרעים ל2-3 שבועות לפני שריצה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Intermix הצמחים האלה עם צמחים שורצים; קרדית למבוגרים תהיה במהירות ליישב חומר צמחי טרי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר צמחי שעועית שורצים ישנים כל 7-10 ימים, והחליף אותם עם צמחים טריים. </li></ol> 2. איסוף למבוגרים נקבה קרדית <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קרדית אוסף באמצעות שיטת כביסה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאסוף קרדית, למקם את צמח שעועית טרי במגע עם צמחים נגועים 1 עד 2 ימים לפני הניסוי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש 20-30 צמחי שעועית טריים לאסוף 1,000 עד 2,000 קרדית נקבה בוגרת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן פתרון של Tween 20 ב0.001% משימוש במים ברז ב RT. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שטוף צמחי שעועית נגועות בפתרון Tween 20, באמצעות 2 עד 3 צמחים בכל פעם. </li><li&gt; כל צמח הוא שטף 2-3x לאסוף את כל קרדית מעלים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צעד להשלים 2.1.4 בתוך 10 דקות, כדי למנוע תמותת קרדית. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בידוד של קרדית נקבה הבוגרת על ידי סינון של ההשעיה קרדית דרך מסננות של גודל רשת מוגדרת <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן את מסננות של גדלי הרשת הבאים: 500 מיקרומטר (כדי להסיר שאריות) ו300 מיקרומטר (לאסוף קרדית למבוגרים נקבה) (איור 1 א). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> סנן את ההשעיה דרך מסננת מיקרומטר 500. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Refilter ההשעיה דרך מסננת מיקרומטר 300. קרדית נקבה בוגרת תישמר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טובלים מסננת 300 מיקרומטר עם קרדית נקבה בוגרת במים ברז נקיים כדי להסיר Tween 20. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מורחים קרדית בשכבה אחת בתחתית המסננת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש במגבת נייר כדי להסיר את עודפי מים מהרשת והצדדים של המסננת. הערה: זה נעשה משום קרדית צריכה להתייבש במהירות על מנת להתאושש. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן את ההרכבה כפי שמוצג באיור 1ב &#39;; זה יאפשר קרדית לנוע בחופשיות, אבל ימנע מהם לברוח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את המסננת עם קרדית על גבי המסננת המשמשת כתמיכה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הקף את המסננת תחתונה עם מים כדי למנוע קרדית מהפיזור. הערה: קרדית תתחיל מתאוששת לאחר כ 5 דקות. לאחר כ 30 דקות, מספר קרדית נעה מספיק כדי להתחיל אוסף (1D איור). קרדית צריכה להיות שנאסף במסגרת 1 שעות, כפי שהם מייצרים משי שיפריע לאוסף. </li></ol></li></ol> 3. צמח שריצה עם קרדית הערה: ברגע שקרדית נקבה בוגרת התאוששה, הם יכולים לשמש להתפשטות צמח. ישנן 2 שיטות המשמשות לשורצים צמחים ניסיוניים עם קרדית נקבה בוגרת:) בעזרת מברשת עדינה (סעיף פרוטוקול 3.1) ו ב) באמצעות משאבה או קו ואקום (סעיף פרוטוקול 3.2). <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קרדית ריצתה באמצעות מברשת הערה: התפשטות קרדית עכבישעם מברשת משמשת ליישום של עד 30 קרדית לכל צמח. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש במברשת שיער רכה עגולה אמנות גודל 00 או עדינה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הרטב את המברשת במים ברז RT. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעדינות להרים את קרדית מן המסננת בעזרת קצה המברשת ולהעביר אותם למפעל. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קרדית ריצה באמצעות משאבה הערה: התפשטות צמח עם קרדית שנאסף על ידי קו משאבה / ואקום משמשת כאשר יותר מ 30 קרדית מוחלות. לשיטה זו, ניתן להשתמש במשאבת ואקום לאיסוף רכיבי המיקרואלקטרוניקה או קו ואקום. זה חשוב כדי לשמור על זרימת האוויר הקבוע ושל כוח מספיק (2-4 psi). <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צרף קצה פיפטה 1 מיליליטר לצינור המתחבר לקו משאבת ואקום או באמצעות קיצוץ 1.5 מיליליטר צינור צנטריפוגות בתחתית כמתאם בין צינור משאבה / ואקום והעצה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים פיסת מגבת נייר בין קצה פיפטה והמתאם (צינור צנטריפוגות 1.5 מיליליטר). הערה: המטרה של זה היא לקרדית מלכודת בתוך tהוא פיפטה קצה במהלך תהליך השאיפה וגם כדי להפחית את זרימת האוויר (איור 1 ג). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאסוף קרדית ישירות מהמסננת באמצעות קצה פיפטה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחלופין, לאסוף קרדית אחד אחד מעלים נגועים באמצעות stereoscope. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כאשר המספר הנדרש של קרדית כבר נאסף, הסר את קצה פיפטה מהצינור, ולוודא כי פיסת מגבת נייר בחלק האחורי של קצה פיפטה באין מפריע. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאסוף קרדית על ידי הקשה על קצה פיפטה ומקפץ בקרדית יחד. לאחר מכן, מניח אותם על העלה; בתוך שניות, קרדית תתחיל לפזר על העלה. </li></ol></li></ol> 4. הקלטה ונזק צמח הערכה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> נזק צמח הקלטה הערה: לקבלת א thaliana, צמח נזק מוערך לאחר 4 ימים של האכלת קרדית. נזק נרשם כשטח פנים הכולל של כתמי chlorotic. למדידת נזק, כל שושנה היא לחתוך וסרוק.פרמטרים סריקה תיארו הם עבור סורק Epson V30 אבל ישמשו כנקודת פתיחה טובה לכל סורק דומה. שמור על פרמטרים סריקה קבועים לכל הניסויים המאפשרים השוואה בין ריצות ניסוי בודדות. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כסה מיטת סורק עם גיליון שקיפות כדי למנוע את זיהום פני השטח סורק עם חומר צמחי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חותכים כל שושנה ומניחים על משטח הסורק, כך צד adaxial (עליון) של עלים מול מקור אור הסורק ואלמנט ללכוד. לחלופין, אם רוזטות צפופה מדי מכדי ללכוד עלים בודדים בלי חפיפה, לנתח את שושנה לתוך עלים או קבוצות של עלים שאינם חופפים עם מספריים עדינים בודדים לפני הנחת על מיטת הסורק. ניתן לסרוק רוזטות מרובה בו זמנית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כסה רוזטות או עלים עם פיסת נייר לבן כדי למנוע דבקות וזיהום של מכסה הסורק. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כיסוי לסגור סורק ולבצע סריקה עם הפרמטרים הבאים: רזולוציה: 1,200 dpi; מצב צבע: Adobe RGB; בהירות: +25; סוג קובץ: JPEG באיכות מקסימלית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שמור לניתוח נזק שלאחר מכן קבצי תמונה. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כימות נזק צמח הערה: האזור של נזק מחושב באופן ידני באמצעות Photoshop. בשל הבדלים גדולים בצורת עלה ועוצמת הצבע של הסימפטומים כתוצאה מהאכלת קרדית, שיטות אוטומטיות היו לא אמינות. לפיכך, שיטת רשת משמשת כדי להעריך את נזק צמח: <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פתח את התמונה של הצמח עם פוטושופ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יצירת שכבה חדשה, ולאחר מכן שכבת תמונה סרוקה עם רשת של 0.25 מ&quot;מ x 0.25 חטיבות מ&quot;מ (הצג או תצוגה - הצג - גריד, קיצור מקלדת Ctrl + &quot;). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בשכבה מעולפת, לסמן אזורי עלה פגומים באמצעות נקודה (להשתמש &quot;עיפרון הכלי&quot;, קיצור מקשי B). השתמש בנקודה אחת לכל ריבוע של הרשת שמתחתיו יש נזק המשתרע על יותר ממחצית מיחידת הרשת. הגודל של הנקודה מוגדר בפיקסלים (כלומר, </eמ &#39;&gt; 52 פיקסלים לנקודה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כאשר כל הריבועים של הרשת שמראים נזק צמח מכסה לפחות מחצית מיחידת הרשת מסומנים בנקודה, להשתמש בכלי היסטוגרמה (חלון - היסטוגרמה) כדי לקבוע את המספר הכולל של פיקסלים על השכבה. כלי היסטוגרמה מאפשר לאדם למדוד את מספר הפיקסלים. מאז כל נקודה מיוצגת על ידי מספר קבוע וידוע של פיקסלים, כלי היסטוגרמה יהיה למדוד את המספר הכולל של פיקסלים, המייצג את המספר הכולל של נקודות, ובהרחבה, את המספר הכולל של ריבועים מסומנים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחשב את מספר &quot;נקודות&quot; מסומנות על ידי שימוש בנוסחה: מספר הנקודות = מספר כולל של פיקסלים / מספר פיקסל לנקודה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחשב את השטח הכולל של נזק על ידי הכפלת מספר הנקודות מסומנות בתמונה על ידי השטח של ריבוע 1 של הרשת, כנקודה אחת מתאימה למשבצת הראשונה של הרשת. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Jeppson, L. R., Keifer, H. H., Baker, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Mites injurious to economic plants. , (1975).</li><li>Migeon, A., Dorkeld, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spider+Mites+Web:+a+comprehensive+database+for+the+Tetranychidae.">Spider Mites Web: a comprehensive database for the Tetranychidae.</a> http://www.montpellier.inra.fr/CBGP/spmweb. , (2013).</li><li>Croft, B. A., Vandebaan, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecological+and+Genetic-Factors+Influencing+Evolution+of+Pesticide+Resistance+in+Tetranychid+and+Phytoseiid+Mites.">Ecological and Genetic-Factors Influencing Evolution of Pesticide Resistance in Tetranychid and Phytoseiid Mites.</a> Exp Appl Acarol. 4, 277-300 (1988).</li><li>Van Leeuwen, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+heteroplasmy+and+the+evolution+of+insecticide+resistance:+Non-Mendelian+inheritance+in+action.">Mitochondrial heteroplasmy and the evolution of insecticide resistance: Non-Mendelian inheritance in action.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 5980-5985 (2008).</li><li>Van Leeuwen, T., Vontas, J., Tsagkarakou, A., Dermauw, W., Tirry, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acaricide+resistance+mechanisms+in+the+two-spotted+spider+mite+Tetranychus+urticae+and+other+important+Acari:+A+review.">Acaricide resistance mechanisms in the two-spotted spider mite Tetranychus urticae and other important Acari: A review.</a> Insect Biochem Molec. 40, 563-572 (2010).</li><li>Dermauw, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cys-loop+ligand-gated+ion+channel+gene+family+of+Tetranychus+urticae:+Implications+for+acaricide+toxicology+and+a+novel+mutation+associated+with+abamectin+resistance.">The cys-loop ligand-gated ion channel gene family of Tetranychus urticae: Implications for acaricide toxicology and a novel mutation associated with abamectin resistance.</a> Insect Biochem Molec. 42, 455-465 (2012).</li><li>Van Leeuwen, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Population+bulk+segregant+mapping+uncovers+resistance+mutations+and+the+mode+of+action+of+a+chitin+synthesis+inhibitor+in+arthropods.">Population bulk segregant mapping uncovers resistance mutations and the mode of action of a chitin synthesis inhibitor in arthropods.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 109, 4407-4412 (2012).</li><li>Dearden, P. K., Donly, C., Grbic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+pair-rule+gene+homologues+in+a+chelicerate:+early+patterning+of+the+two-spotted+spider+mite+Tetranychus+urticae.">Expression of pair-rule gene homologues in a chelicerate: early patterning of the two-spotted spider mite Tetranychus urticae.</a> Development. 129, 5461-5472 (2002).</li><li>Khila, A., Grbic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+silencing+in+the+spider+mite+Tetranychus+urticae:+dsRNA+and+siRNA+parental+silencing+of+the+Distal-less+gene.">Gene silencing in the spider mite Tetranychus urticae: dsRNA and siRNA parental silencing of the Distal-less gene.</a> Development genes and evolution. 217, 241-251 (2007).</li><li>Grbic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mity+model:+Tetranychus+urticae,+a+candidate+for+chelicerate+model+organism.">Mity model: Tetranychus urticae, a candidate for chelicerate model organism.</a> BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 29, 489-496 (2007).</li><li>Grbic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genome+of+Tetranychus+urticae+reveals+herbivorous+pest+adaptations.">The genome of Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations.</a> Nature. 479, 487-492 (2011).</li><li>Kliebenstein, D., Pedersen, D., Barker, B., Mitchell-Olds, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+analysis+of+quantitative+trait+loci+controlling+glucosinolates,+myrosinase+and+insect+resistance+in+Arabidopsis+thaliana.">Comparative analysis of quantitative trait loci controlling glucosinolates, myrosinase and insect resistance in Arabidopsis thaliana.</a> Genetics. 161, 325-332 (2002).</li><li>Abe, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Function+of+jasmonate+in+response+and+tolerance+of+Arabidopsis+to+thrip+feeding.">Function of jasmonate in response and tolerance of Arabidopsis to thrip feeding.</a> Plant &amp; cell physiology. 49, 68-80 (2008).</li><li>Whiteman, N. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mining+the+plant-herbivore+interface+with+a+leafmining+Drosophila+of+Arabidopsis.">Mining the plant-herbivore interface with a leafmining Drosophila of Arabidopsis.</a> Molecular ecology. 20, 995-1014 (2011).</li><li>Goodspeed, D., Chehab, E. W., Min-Venditti, A., Braam, J., Covington, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Arabidopsis+synchronizes+jasmonate-mediated+defense+with+insect+circadian+behavior.">Arabidopsis synchronizes jasmonate-mediated defense with insect circadian behavior.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 109, 4674-4677 (2012).</li><li>Kim, J. H., Lee, B. W., Schroeder, F. C., Jander, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+indole+glucosinolate+breakdown+products+with+antifeedant+effects+on+Myzus+persicae+(green+peach+aphid).">Identification of indole glucosinolate breakdown products with antifeedant effects on Myzus persicae (green peach aphid).</a> The Plant journal : for cell and molecular biology. 54, 1015-1026 (2008).</li><li>Adio, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biosynthesis+and+defensive+function+of+Ndelta-acetylornithine,+a+jasmonate-induced+Arabidopsis+metabolite.">Biosynthesis and defensive function of Ndelta-acetylornithine, a jasmonate-induced Arabidopsis metabolite.</a> Plant Cell. 23, 3303-3318 (2011).</li><li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+tomato+homolog+of+CORONATINE-INSENSITIVE1+is+required+for+the+maternal+control+of+seed+maturation,+jasmonate-signaled+defense+responses,+and+glandular+trichome+development.">The tomato homolog of CORONATINE-INSENSITIVE1 is required for the maternal control of seed maturation, jasmonate-signaled defense responses, and glandular trichome development.</a> Plant Cell. 16, 126-143 (2004).</li><li>Kant, M. R., Ament, K., Sabelis, M. W., Haring, M. A., Schuurink, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+timing+of+spider+mite-induced+direct+and+indirect+defenses+in+tomato+plants.">Differential timing of spider mite-induced direct and indirect defenses in tomato plants.</a> Plant Physiol. 135, 483-495 (2004).</li><li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NIH+Image+to+ImageJ:+25+years+of+image+analysis.">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nat Methods. 9, 671-675 (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

וידאו זה מדגים פרוטוקולים משמשים כדי לבודד ושורצים צמחים עם מספר גדול של קרדית נקבה הבוגרת. למרות שהצגנו בפני פרוטוקול זה באמצעות א thaliana, ניתן להשתמש בו לכל מערכת אינטראקציה קרדית צמחים עכביש וכיום הוא מיושם בהצלחה גם על צמחי עגבניות וגפן (vinifera ויטיס). תשואו...

אינטראקציה בין צמחים למזיקים היא נושא בעל חשיבות מדעית וכלכלית גדולה. זה מבחינה היסטורית נחקר באמצעות שני צמחי היבול (כגון עגבניות) וצמח המודל, א &#39; thaliana. בשני המקרים, רגישות של צמח לאוכלי עשב ניתן הייתה למדוד באופן ישיר דרך הערכה של פנוטיפ צמח לאחר התקף אוכלי עשב או בעקיפין באמצעות ההערכה של ביצועי מזיקים. מדידה ישירה של רגישות צמח נוצלו בעבר למספר מיני חרקים מזיקים באמצעות מגוון של שיטות. לדוגמא, herbivory של זחלי lepidopteran נמדד כהערכה של החלק מרקמות צמח שנצרכו על ידי שתי xylostella Plutella (עש Diamondback) או Trichoplusia ni (Looper כרוב) בעין בלתי מזוינת בעזרת רשת 12. כמו כן, ישנן שיטות שעושות שימוש בהדמיה דיגיטלית של נזק עלה עם ניתוח תמונת כמותית שלאחר מכן. שיטות כאלה היו בשימוש במחקריו של א &#39; אינטראקציה thaliana עם Frankliniella occidentalis (תריפס פרחים המערבי) 13, flava Scaptomyza (דרוזופילה כריית עלים) 14, וט ni 15. מדידות עקיפות של רגישות צמח נמצאות בשימוש נרחב במחקרים של אינטראקציה בין צמחים למזיקים. לדוגמא, רגישות של א &#39; thaliana לאפרסק Myzus כנימת persicae herbivory נבחנים בדרך כלל באמצעות ניתוח של פוריות מזיקים ותיאור של מורפולוגיה ברוטו של צמח אחרי האינטראקציה 16,17. עוד אינדיקטור עקיף טיפוסי של א &#39; רגישות thaliana למזיקים היא הערכת משקל יבשה או רטובה של אוכלי העשב. פרמטר זה משמש בדרך כלל כדי לאפיין תזונה צמחונית של lepidoterans, כגון פיאריס ראפא (לבן קטן), פ xylostella, או ט ני בזחל או גלמים שלהם בשלבי 15,17. קרדית עכביש תא התוכן Feeders. נזק הנגרם לקרדית מוכר כאוסף של כתמי chlorotic שטווח צבע לבן חיוורים ירוק. הרגישות של מארח מפעל לherbivory קרדית העכביש הוערכה או בעקיפין בעבר באמצעות הניתוח של ימי ביצועי קרדית עכביש לאחר שריצה-18,19, או ישירות באמצעות מורפולוגיה ברוטו של שבועות צמחים שלאחר שריצה 18 או באמצעות הדמיה דיגיטלית של עלים חשופים לקרדית במשך ימים עם ניתוח תמונה אוטומטי לאחר 19. שיטות אלה היו מפותחות ומשמשות למחקרים של אינטראקציות בין צמחי עגבניות וט urticae, ומשמש בדרך כלל מספר הקטן של קרדית עכביש (5-15 לכל טיפול), שנגבו מאוכלוסיית קרדית המעורבת והונחו על פני העלה בעזרת מברשת זיפים רכה. עם זאת, שיטות אלו אינן מתאימות למחקרים שבם מספר גדול יותר של קרדית צריך להיות מיושם. בנוסף, בעוד שעיבוד ישיר של תמונות עלה בתוכנת ניתוח תמונהכגון Adobe Photoshop (סן חוזה, קליפורניה) או 20 ImageJ יכולה לשמש לניתוח של נזק עגבניות, הפרוטוקולים האלה צריכים שינוי כדי להיות מיושמים על עלים שיש לי רפלקטיביות גדולה יותר של פני השטח או נצבעים באורח קל ויש לי trichomes הבולט מאוד ( למשל, thaliana א &#39;) שמפריעים לבחירה אוטומטית של נקודות chlorotic המציינות נזק צמח. יתר על כן, השלב ההתפתחותי של קרדית עכביש שיכול להיות מנוצל בקלות עם השיטות הקודמות מוגבל לנשים בוגרות והנפוצות ביותר לזיהוי בקלות ומונע ניצול של שלבי התפתחות אחרים. הצעד הקריטי הראשון לקראת ניתוח תפוקה גבוהה של אינטראקציה קרדית צמחים עכביש הוא להקים פרוטוקולים לשחזור, פשוט וחזקים לאתגר את צמחים עם קרדית עכביש ואמין להעריך את תוצאות אינטראקציה. בסרטון הזה, שיטה יעילה לאיסוף מהיר וקל של num גדולבער של קרדית נקבה בוגרת, היישום שלהם על מארח ניסיוני צמח, וההערכה של נזק הצמח בשל האכלת קרדית עכביש מתוארים. הפרוטוקול המובא מאפשר איסוף מהיר ויעיל של מאות אנשים בכל שלב התפתחותי (ביצים, זחלים, נימפות, זכרים בוגרים, ונשים) שיכול לשמש ליישום ניסיוני שלאחר מכן. בנוסף, ניתן ליישם פרוטוקולים אלה לכל צמח מארח קרדית, אבל באופן ספציפי הוכיחו במקרה של א &#39; thaliana.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1157">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Plant material:</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">California red kidney bean</td>
			<td style="width:275px;">Stokes, Thorold, ON, Canada</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Two week old, well infested with spider mites two or three days before use. Other cultivars of Phaseolus vulgaris can be used.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Chemicals:</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Tween 20</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">P9416</td>
			<td style="width:527px;">1% stock solution is prepared to simplify aliquoting</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Tap water</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">At room temperature, heat- and cold-shock affect mite survival rate and peformance</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td colspan="4" height="21" style="height:21px;width:231px;">Other materials and equipment:</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Plastic tray</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Set of scissors</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">2 L beakers</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Paper towels</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Sets of sieves</td>
			<td style="width:275px;">Manufactured in house</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Detailed instructions are available</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Thin brush</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Pipettes</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Pipette tips</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">0.2 and 1 mL</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">1.5 mL centrifuge tubes</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Air pump</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Aquarium type pump with inverted air flow. Vacuum line can be used. Required pressure drop is approx. 2-4 psi</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Stereoscope</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">-</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Scanner</td>
			<td>Epson</td>
			<td style="width:125px;">V30</td>
			<td style="width:527px;">Any flatbed scanner allowing necessary degree of control over scan quality. We use Epson V30 for our experiments.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:231px;">Computer</td>
			<td>Any supplier</td>
			<td style="width:125px;">NA</td>
			<td style="width:527px;">Windows or OS X PC which is compatible with scanner hardware and Adobe Photoshop software.</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:231px;">Adobe Photoshop software</td>
			<td style="width:275px;">Adobe Systems Inc., San Jose, CA, USA</td>
			<td style="width:125px;">various</td>
			<td style="width:527px;">Any version with Histogram tool included.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

application of two-spotted spider mite tetranychus urticae for plant-pest interaction studies

קרדית העכביש שני המנומרת, Tetranychus urticae, הוא אוכלי עשב arthropod polyphagous בכל מקום שייזון ממגוון רחב להפליא של מינים, עם יותר מ 150 של ערך כלכלי. זה מזיקים עיקריים של גידולים בחממות, בעיקר בהסולניים ודלועיים (למשל, עגבניות, חצילים, פלפלים, מלפפונים, קישואים) ונוי חממה (למשל, ורדים, חרציות, ציפורנים), גידולי שדה שנתי (כגון תירס, כותנה, סויה, וסלק סוכר), ובתרבויות רב שנתית (אספסת, תותים, ענבים, הדרים, ושזיפים) 1,2. בנוסף לpolyphagy הקיצוני שהופך אותו למזיק חקלאי חשוב, ט יש urticae נטייה לפתח עמידות למגוון רחב של חומרי הדברה וacaricides המשמשים לשליטתה 3-7. ט urticae הוא אורגניזם ניסיוני מצוין, שכן יש מחזור חיים מהיר (7 ימים ב27 ° C)ויכול להישמר בקלות בצפיפות גבוהה במעבדה. שיטות לassay ביטוי גנים (כולל הכלאה באתרו ומכתים נוגדן) וכדי להשבית את הביטוי של גנים אנדוגניים קרדית עכביש באמצעות התערבות RNA פותחו 8-10. לאחרונה, כל רצף הגנום של ט &#39; urticae כבר דיווח, יצירת הזדמנות לפתח אוכלי עשב המזיק הזה כאורגניזם מודל עם משאבי גנומי מקבילים שכבר קיימים בחלק ממפעליה מארח (thaliana ארבידופסיס וlycopersicum Solanum העגבניות) 11. יחד, אורגניזמים מודל אלה יכולים לספק תובנות לתוך בסיסים מולקולריים של אינטראקציות בין צמחים למזיקים. הנה, שיטה יעילה לאיסוף מהיר וקל של מספר גדול של קרדית נקבה הבוגרת, היישום שלהם על מארח מפעל ניסיוני, וההערכה של נזק הצמח בשל האכלת קרדית עכביש מתוארות. הפרוטוקול המובא enables אוסף מהיר ויעיל של מאות אנשים בכל שלב התפתחותי (ביצים, זחלים, נימפות, זכרים בוגרים, ונשים) שיכול לשמש ליישום ניסיוני שלאחר מכן.

שימוש 20-30 צמחי שעועית שורצים, אחד יכול לאסוף סביב 2,000 קרדית נקבה בוגרת באמצעות הנפות. הזמן הנדרש לשורץ 10 צמחים עם 20 קרדית לכל צמח הוא כ 15 דקות אם בעזרת מברשת להעביר קרדית. שילובים של שיטות איסוף ויישום מוצגים באיור 2. פרוטוק...

Watch this Scientific Journal Video about Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies at JoVE.com

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

פרוטוקולים להכנה יעילה של דגימות אחידות של קרדית עכביש, התפשטות של צמחים ניסיוניים, והערכה של נזק צמח, כפי שנדרש למחקרים של אינטראקציה בין צמחים למזיקים פותחו.

יישום של קרדית העכביש הבחין-Two<em&gt; Tetranychus urticae</em&gt; לאינטראקצית צמח-מזיקים ללימודים

The two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, is a ubiquitous polyphagous arthropod herbivore that feeds on a remarkably broad array of species, with ...

application-two-spotted-spider-mite-tetranychus-urticae-for-plant

Research

JoVE Journal

Environment

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

17.6K Views.  The University of Western Ontario.  פרוטוקולים להכנה יעילה של דגימות אחידות של קרדית עכביש, התפשטות של צמחים ניסיוניים, והערכה של נזק צמח, כפי שנדרש למחקרים של אינטראקציה בין צמחים למזיקים פותחו. 

Video: Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

Physical, Chemical and Biological Characterization of Six Biochars Produced for the Remediation of Contaminated Sites

The physical and chemical properties of biochar vary based on feedstock sources and production conditions, making it possible to engineer biochars with specific functions (e.g. carbon sequestration, soil quality improvements, or contaminant sorption). In 2013, the International Biochar Initiative (IBI) made publically available their Standardized Product Definition and Product Testing Guidelines (Version 1.1) which set standards for physical and chemical characteristics for biochar. Six biochars made from three different feedstocks and at two temperatures were analyzed for characteristics related to their use as a soil amendment. The protocol describes analyses of the feedstocks and biochars and includes: cation exchange capacity (CEC), specific surface area (SSA), organic carbon (OC) and moisture percentage, pH, particle size distribution, and proximate and ultimate analysis. Also described in the protocol are the analyses of the feedstocks and biochars for contaminants including polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), polychlorinated biphenyls (PCBs), metals and mercury as well as nutrients (phosphorous, nitrite and nitrate and ammonium as nitrogen). The protocol also includes the biological testing procedures, earthworm avoidance and germination assays. Based on the quality assurance / quality control (QA/QC) results of blanks, duplicates, standards and reference materials, all methods were determined adequate for use with biochar and feedstock materials. All biochars and feedstocks were well within the criterion set by the IBI and there were little differences among biochars, except in the case of the biochar produced from construction waste materials. This biochar (referred to as Old biochar) was determined to have elevated levels of arsenic, chromium, copper, and lead, and failed the earthworm avoidance and germination assays. Based on these results, Old biochar would not be appropriate for use as a soil amendment for carbon sequestration, substrate quality improvements or remediation.

Biochar is a carbon-rich material used as a soil amendment with the ability to sustainably sequester carbon, improve substrate quality and sorb contaminants. This protocol describes the 17 analytical methods used for the characterization of biochar, which is required prior to large scale implementation of these amendments in the environment.

פיזי, כימי וביולוגי אפיון Biochars שש הופק עבור התיקון של אתרים מזוהמים

The physical and chemical properties of biochar vary based on feedstock sources and production conditions, making it possible to engineer biochars with ...

Characterization and Application of Passive Samplers for Monitoring of Pesticides in Water

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study provides a protocol for the passive sampler preparation, calibration, extraction method and instrumental analysis. Sampling rates (RS) and passive sampler-water partition coefficients (KPW) were calculated for silicone rubber, polar organic chemical integrative sampler POCIS-A, POCIS-B, SDB-RPS and C18 disk. The uptake of the selected compounds depended on their physicochemical properties, i.e., silicone rubber showed a better uptake for more hydrophobic compounds (log octanol-water partition coefficient (KOW) &#62; 5.3), whereas POCIS-A, POCIS-B and SDB-RPS disk were more suitable for hydrophilic compounds (log KOW &#60; 0.70).

A protocol about the characterization and application of five different passive sampling devices is presented.

אפיון ויישום של דוגמים פסיביים עבור ניטור של דברה במים

Five different water passive samplers were calibrated under laboratory conditions for measurement of 124 legacy and current used pesticides. This study ...

Remote Sensing Evaluation of Two-spotted Spider Mite Damage on Greenhouse Cotton

The objective of this study was to evaluate a ground-based multispectral optical sensor as a remote sensing tool to assess foliar damage caused by the two-spotted spider mite (TSSM), Tetranychus urticae Koch, on greenhouse grown cotton. TSSM is a polyphagous pest which occurs on a variety of field and horticultural crops. It often becomes an early season pest of cotton in damaging proportions as opposed to being a late season innocuous pest in the mid-southern United States. Evaluation of acaricides is important for maintaining the efficacy of and preventing resistance to the currently available arsenal of chemicals and newly developed control agents. Enumeration of spider mites for efficacy evaluations is laborious and time consuming. Therefore, subjective visual damage rating is commonly used to assess density of spider mites. The NDVI (Normalized Difference Vegetation Index) is the most widely used statistic to describe the spectral reflectance characteristics of vegetation canopy to assess plant stress and health consequent to spider mite infestations. Results demonstrated that a multispectral optical sensor is an effective tool in distinguishing varying levels of infestation caused by T. urticae on early season cotton. This remote sensing technique may be used in lieu of a visual rating to evaluate insecticide treatments.

This manuscript describes a multispectral optical sensor that effectively detected damage to early season cotton artificially infested with varying densities of the two-spotted spider mite populations.

הערכת חישה מרחוק של נזק עכביש קרדית דו הבחין על כותנה חממה

The objective of this study was to evaluate a ground-based multispectral optical sensor as a remote sensing tool to assess foliar damage caused by the ...

Modification and Application of a Leaf Blower-vac for Field Sampling of Arthropods

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropod populations in rice. When used in combination with an enclosure, application of this sampling device provides absolute estimates of the populations of arthropods as numbers per standardized sampling area. The sampling efficiency depends critically on the sampling duration. In a mature rice crop, a two-minute sampling in an enclosure of 0.13 m2 yields more than 90% of the arthropod population. The device also allows sampling of arthropods dwelling on the water surface or the soil in rice paddies, but it is not suitable for sampling fast flying insects, such as predatory Odonata or larger hymenopterous parasitoids. The modified blower-vac is simple to construct, and cheaper and easier to handle than traditional suction sampling devices, such as D-vac. The low cost makes the modified blower-vac also accessible to researchers in developing countries.

Assessment of arthropod abundance in crops is critical for investigating population dynamics and species interactions. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropods in rice.

שינוי ויישום של VAC מפוח עלים עבור דגימת שדה של פרוקי רגליים

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the ...

Use of a Filter Cartridge for Filtration of Water Samples and Extraction of Environmental DNA

Recent studies demonstrated the use of environmental DNA (eDNA) from fishes to be appropriate as a non-invasive monitoring tool. Most of these studies employed disk fiber filters to collect eDNA from water samples, although a number of microbial studies in aquatic environments have employed filter cartridges, because the cartridge has the advantage of accommodating large water volumes and of overall ease of use. Here we provide a protocol for filtration of water samples using the filter cartridge and extraction of eDNA from the filter without having to cut open the housing. The main portions of this protocol consists of 1) filtration of water samples (water volumes &#8804;4 L or &gt;4 L); (2) extraction of DNA on the filter using a roller shaker placed in a preheated incubator; and (3) purification of DNA using a commercial kit. With the use of this and previously-used protocols, we perform metabarcoding analysis of eDNA taken from a huge aquarium tank (7,500 m3) with known species composition, and show the number of detected species per library from the two protocols as the representative results. This protocol has been developed for metabarcoding eDNA from fishes, but is also applicable to eDNA from other organisms.

We describe a protocol for filtration of water samples with a filter cartridge and extraction of environmental DNA (eDNA) without having to cut open the housing to remove the filter. This protocol is developed for metabarcoding eDNA from fishes, but is also applicable to eDNA from other organisms.

שימוש במחסנית סינון עבור הסינון של מי דוגמאות הפקת DNA הסביבה

Recent studies demonstrated the use of environmental DNA (eDNA) from fishes to be appropriate as a non-invasive monitoring tool. Most of these studies ...

Vegetated Treatment Systems for Removing Contaminants Associated with Surface Water Toxicity in Agriculture and Urban Runoff

Urban stormwater and agriculture irrigation runoff contain a complex mixture of contaminants that are often toxic to adjacent receiving waters. Runoff may be treated with simple systems designed to promote sorption of contaminants to vegetation and soils and promote infiltration. Two example systems are described: a bioswale treatment system for urban stormwater treatment, and a vegetated drainage ditch for treating agriculture irrigation runoff. Both have similar attributes that reduce contaminant loading in runoff: vegetation that results in sorption of the contaminants to the soil and plant surfaces, and water infiltration. These systems may also include the integration of granulated activated carbon as a polishing step to remove residual contaminants. Implementation of these systems in agriculture and urban watersheds requires system monitoring to verify treatment efficacy. This includes chemical monitoring for specific contaminants responsible for toxicity. The current paper emphasizes monitoring of current use pesticides since these are responsible for surface water toxicity to aquatic invertebrates.

This article summarizes the design attributes and the effectiveness of treatment systems that treat urban stormwater and agriculture irrigation runoff to remove pesticides and other contaminants associated with aquatic toxicity.

מערכות טיפול צמחי להסרת מזהמים המשויכים לרעלת פני המים בחקלאות ובנוף העירוני

Urban stormwater and agriculture irrigation runoff contain a complex mixture of contaminants that are often toxic to adjacent receiving waters. Runoff may ...

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current measures to combat such pathogens have proved too conservative and, thus, not sufficiently effective, and they can potentially pose environmental risks. Therefore, it is extremely necessary to identify host-resistance factors to assist in controlling plant diseases naturally through the identification of resistant germplasm, the isolation and characterization of resistance genes, and the molecular breeding of resistant cultivars. In this regard, there is need to establish an accurate, rapid, and large-scale inoculation method to breed and develop plant resistance genes. The rice blast fungal pathogen Magnaporthe grisea causes severe disease symptoms and yield losses. Recently, M. grisea has emerged as a model organism for studying the mechanisms of plant-fungal pathogen interactions. Hence, we report the development of a plant virulence test method that is specific for M. grisea. This method provides for both spray inoculation with a conidial suspension and wounding inoculation with mycelium cubes or droplets of conidial suspension. The key step of the wounding inoculation method for detached rice leaves is to make wounds on plant leaves, which avoids any interference caused by host penetration resistance. This spray/wounding protocol contributes to the rapid, accurate, and large-scale screening of the pathotypes of M. grisea isolates. This integrated and systematic plant infection method will serve as an excellent starting point for gaining a broad perspective of issues in plant pathology.

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Here, we present a protocol to test plant virulence with the plant pathogen Magnaporthe grisea. This report will contribute to the large-scale screening of the pathotypes of fungi isolates and serve as an excellent starting point for understanding the resistant mechanisms of plants during molecular breeding.

הבדיקה זיהום צמח: ריסוס, בתיווך הפצע חיסון עם הפתוגן של צמח Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current ...

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are also a useful scientific model to study motion vision and flight dynamics in a controlled laboratory setting. As the larvae develop in organically polluted water, they are useful models for investigating investment in microbial immunity. While large scale commercial breeding for agriculture already occurs, there are no standardized protocols for maintaining captive populations for scientific studies. This is important as commercial captive breeding programs focusing on mass output during peak pollination periods may fail to provide a population that is consistent, stable and robust throughout the year, as is often needed for other research purposes. Therefore, a method to establish, maintain and refresh a captive research population is required. Here, we describe the utilization of an artificial hibernation cycle, in addition to the nutritional and housing requirements, for long term maintenance of Eristalis tenax. Using these methods, we have significantly increased the health and longevity of captive populations of E. tenax compared to previous reports. We furthermore discuss small scale rearing methods and options for optimizing yields and manipulating population demographics.

Rearing and Long-Term Maintenance of Eristalis tenax Hoverflies for Research Studies

The overall goal of these procedures is to establish, maintain and refresh a captive population of Eristalis tenax in a research setting.

לגידול ואחזקה ארוך טווח של רקבן הבוץ Hoverflies למטרות מחקר

With an estimated 6000 species worldwide, hoverflies are ecologically important as alternative pollinators to domesticated honeybees. However, they are ...

Experimental Protocol for Examining Behavioral Response Profiles in Larval Fish: Application to the Neuro-stimulant Caffeine

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and toxicological studies. Using automated digital tracking platforms, recent efforts in neuropharmacology are leveraging larval fish locomotor behaviors to identify potential therapeutic targets for novel small molecules. Similar to these efforts, research in the environmental sciences and comparative pharmacology and toxicology is examining various behaviors of fish models as diagnostic tools in tiered evaluation of contaminants and real-time monitoring of surface waters for contaminant threats. Whereas the zebrafish is a popular larval fish model in the biomedical sciences, the fathead minnow is a common larval fish model in ecotoxicology. Unfortunately, fathead minnow larvae have received considerably less attention in behavioral studies. Here, we develop and demonstrate a behavioral profile protocol using caffeine as a model neurostimulant. Though photomotor responses of fathead minnows were occasionally affected by caffeine, zebrafish&#160;were markedly more sensitive for photomotor and locomotor endpoints, which responded at environmentally relevant levels. Future studies are needed to understand comparative behavioral sensitivity differences among fish with age and time of day, and to determine whether similar behavioral effects would occur in nature and be indicative of adverse outcomes at the individual or population levels of biological organization.

Here, we present a protocol to examine larval zebrafish and fathead minnow locomotor activities and photomotor responses (PMR) using an automated tracking software. When incorporated in common toxicology bioassays, analyses of these behaviors provide a diagnostic tool to examine chemical bioactivity. This protocol is described using caffeine, a model neurostimulant.

נסיוני לבחינת תגובה התנהגותית פרופילים בדגים זחל: ליישום הקפאין נוירו-ממריץ

Fish models and behaviors are increasingly used in the biomedical sciences; however, fish have long been the subject of ecological, physiological and ...

Generating Homo- and Heterografts Between Watermelon and Bottle Gourd for the Study of Cold-responsive MicroRNAs

MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs of about 20 - 24 nt, known to play important roles in plant development and adaptation. There is an accumulating evidence showing that the expressions of certain miRNAs are altered when grafting, an agricultural practice commonly used by farmers to improve crop tolerance to biotic and abiotic stresses. Bottle gourd is an inherently climate-resilient crop compared to many other major cucurbits, including watermelon, rendering it one of the most widely used rootstocks for the latter. The recent advancement of high-throughput sequencing technologies has provided great opportunities to investigate cold-responsive miRNAs and their contributions to heterograft advantages; yet, adequate experimental procedures are a prerequisite for this purpose. Here, we present a detailed protocol for efficiently generating homo- and heterografts between the cold-susceptible watermelon and the cold-tolerant bottle gourd, in addition to methods of tissue sampling, data generation, and data analysis. The presented methods are also useful for other plant-grafting systems, to interrogate miRNA regulations under various environmental stresses, such as heat, drought, and salinity.

Here we present a detailed protocol for efficiently making homo- and heterografts between watermelon and bottle gourd, in addition to methods of tissue sampling, data generation, and data analysis, for the investigation of cold-responsive microRNAs.

יצירת הומו - ו Heterografts בין אבטיח דלעת הבקבוק לחקר מיקרו Rna קר-תגובה

MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs of about 20 - 24 nt, known to play important roles in plant development and adaptation. There is ...