R01AA016837 (JCB) ve P20AA017828 (AGD ve JCB): Bu çalışmalar Ulusal Sağlık Enstitüleri, Ulusal Alkolizm ve Alkol Bağımlılığı Enstitüsü hibe ile desteklenmiştir.

Tahlil önce Günü&#39;nde gerçekleştirin 1. Adım <ol><li> Taze nematod büyüme ortamına L4 aşamada solucanlar almak (NGM) plakaları OP50 E. bir çim ekildi 20 CO / N de coli, ve kültür onları. Her deney koşulu 10 solucan gerektirir; solucanlar O / N kaybı sağlamak için solucan fazlalığı almak. <ol><li> İlk gün yetişkin Yalnızca tahlil hayvanlar; Birçok mutantlar vahşi tip daha yavaş bir hızda büyür. Test edilen tüm hayvanların ilk gün yetişkin böylece gelişimsel gecikmelere sahip suşlar için toplama zamanlamasını ayarlayın. </li></ol></li></ol> 2. Adım Tahlil günü gerçekleştir <ol><li> Deney için hazırlanması: <ol><li> Standart giremeyen 60 x 15 mm NGM plakalar üzerinde tahlilleri gerçekleştirin. Plakalar her kapak kapalı olarak, 2 saat süre ile 37 ° C&#39;de kullanılacak kurutun. Her deneysel deneme için, dört kurutulmuş NGM tabak kullanın; Bu 0 mM ve 400 mM etanol tahlil plakaları ve beraberindeki alıştırma plakaları olacaktır. NOT:NGM plakalar kullanımı Burada önemli olan; plakalarının bileşimin farklılıklar özellikle bunların ozmolarite, güçlü bir davranışı üzerinde etanol doz etkisini etkileyebilir, bu hayvanlar 20 biriken miktarda etanol değişiklikler, en azından kısmen, kaynaklanmaktadır. NGM agar 160 mOsm. </li><li> Kurutma işleminden sonra, giremeyen NGM plakalar, her deneyde kullanılan ve ağırlığı dikkat edilmesi tartın. Boş levha ağırlığına göre plakalarda ortamın hacmini belirler. Hacme agar ağırlıkça dönüşümünü tahmin etmek üzere ortam su, eşit hacimde aynı ağırlığa sahip olduğunu varsayalım. Not: En tutarlı sonuçlar, orijinal 10 ml hacim 8,3-8,9 ml arasında bir post-kurutma hacmi yeterince dehidrate olan NGM ortamı ile tespit edilmiştir. 2 saat kuru zaman bir alternatif plakalar kuluçka farklılıkları hesaba bu hacim aralığı ulaşana kadar kurumaya olduğunu. </li><li> 4 bakır halkaları (1 iç çapı eritin.Ve 6 cm) levhaların her birinin yüzeyi, yaklaşık 3 için bir alev farklı genotipler ve worms.Grasp her forseps ile bir halka, ve ısı ve tedavi grupları için corrals (Bunsen brülör güçlü bir alev çalışır) olarak hareket halinde sn. Hala &#39;atlama&#39; önlemek için forseps ile halka tutarak hemen bir plaka üzerinde halka yerleştirin. <ol><li> Halka halka üzerinde birkaç noktada forseps ile hafifçe bastırarak agar yüzeyine karşı düz aittir emin olun. Halka yerleştirirken, ek bir üç yüzük için odayı terk etmek dikkatli olun. </li><li> Dört kameranın görüş alanı içerisinde olacak şekilde olduğu gibi birbirine yakın zamanda yerleştirmek için özen levhanın yüzeyine üç ek bakır halkalar eritin. NOT: agar ile iyi bir sızdırmazlık yapma tahlil sırasında halkalarda solucanlar tutmak esastır. Plaka etrafında atlamak Yüzükler agar ile doğru mühür yapmak olası değildir vesolucanlar yuva sağlar ve solucanlar görselleştirmek müdahale ağar, yara olabilir. </li><li> Her tahlil plaka için kurutulmuş ve dereceye giremeyen ve hiçbir etanol alacaksınız gereken eşlik eden &quot;alıştırma&quot; plaka hazırlamak. Bu plakalar üzerinde dört bakır yüzük yerleştirin. </li></ol></li><li> Halkanın kendisinin görüş alanında yazma için özen, aşağıdaki halka kullanılacak solucan suşu ile her bir halkada plakaların alt etiketleyin. Eşlik eden aklimasyonundan plaka tahlil plaka üzerindeki etiketleri eşleştirin. </li><li> Nihai konsantrasyon 0 mM ya da 400 mM metanol (hacim için ağırlık), böylece her bir deney plakası eklemek için% 100 etanol miktarını hesaplayın. Her deney için (n = 1), bir 0 mM ve bir 400 mM etanol plaka olacaktır; alışma plakaları etanol almıyorsunuz. Plaka yüzeyinde etrafında pipetleme, etanol ekleyin. Plaka sızdırmaz laboratuar filmi kullanın ve 2 saat süre ile, bir tezgah üstünde dengelenmeye gelmeye bırakın. </li><li> 1.5 saat geçtikten sonra, tahlil, adım 2.2 aklimasyonundan adımını başlar. </li></ol></li><li> Hareket deneyi yapın: Deney plakaları <ol><li> Dikkatle aklimasyonundan plaka üzerinde bir bakır halka merkezine her deney grubu 10 solucanlar aktarmak. Solucan çekme hafifçe kazıyarak bu noktada agar üzerinde görünür herhangi bir gıda çıkarın. Aynı suşları çalışmalar boyunca aynı sırayla plakalar koymak değil böylece deney grubu deneysel çalışmalar boyunca plakalar koymak sırayı Vary. Not: hedef alıştırma levha gıda deney plakasına aktarılır ise solucanlar gıda ve hareket yeteneği üzerindeki ilacın etkisini gizlenir etrafında birikir, çünkü yemek az miktarda plakaya hayvanlar transfer edilmesidir. </li><li> Bu solucanlar yuva sağlayacak ve tahlil bozacak gibi, çekme ile agar yüzeyine kırmak için değil dikkatli olun. 30 dakika boyunca oda sıcaklığında solucanlar inkübe edin. </li><li> Her plaka insiyatifleri arasında uygun bir aralık olduğundan emin olun. Deneyimli bir deneyci 40 hayvan, 4 yüzük &lt;1.5 dakika boyunca 10 / halka taşıyabilirsiniz, ancak 2 dakika kadar herhangi bir aralık kabul edilebilir. Standart tahlil 10-12 dakika ve 0 mM ve 400 mM etanol hem de maruz 30-32 dk kayıt filmleri vardır. </li><li> 0 mM maruz kalma aklimasyonundan plaka ve yaklaşık 2 dk 30 sn dışında ikinci filmi başlamalıdır ilk önce film dosyasının tasarrufu sağlamak için 400 mM maruz kalma aklimasyonundan plaka başlatın. </li><li> 30 dakikalık bir alışma süresinden sonra, deney plakalarına alıştırma levhalarından solucanlar aktarın. Her plakanın tamamlama arasındaki zamanlama takip, alıştırma plakaya ilave edildi sırayla deney plakalarına dişli (0 mM ya da 400 mM etanol) aktarın. Buharlaşma etanol kaybını en aza indirmek için laboratuvar film ile plaka Seal. </li><li> Udüzleştirilmiş çekme üstüne solucanlar toplamak için ince kenarlı basık solucan kıracağıyla bir çekiş hareketi se. Bu çekme solucanı yapıştırıcı yardımcı olarak yaygın solucan aktarılması kullanılan bakteri, kullanılmadan analiz plakasına giremeyen alıştırma plaka solucanlar transferini gerçekleştirir. Not: plaka ilk solucanlar plakaya eklenmiştir son solucanlar daha uzun etanol maruz çünkü hayvanlar bu aşamada transfer edildiği hızı çok önemlidir, ve daha önceki zaman noktalarında, bazı zamana bağlı etkilere sahip olur. Bu suşlar, deneysel çoğaltır genelinde ilk plaka üzerine yerleştirilir döndürülmesi için önemli nedenidir. </li></ol></li><li> Hareket Testi gerçekleştirin: Film Çekme <ol><li> Böyle bir 2048x2048 7.4 ile bir 0.5x mikroskop objektif, 0.8x büyütme ve bir kamera gibi görüş alanı (yaklaşık 42x42 mm 2 kare), tüm dört yüzük eşzamanlı görüntüleme için izin veren bir mikroskop / kamera arada kullanın81 m piksel CCD. </li><li> Yoğunluk eşik adımında nesne tanıma yardımcı olan görüş alanı, üzerinde bile aydınlatma kullanarak (aşağı bakınız). Bir 3 &quot;x3&quot; arka iyi çalışıyor. </li><li> Görüntü ışık kaynağı bulaşan geleneksel mikroskop ile karşılaştırıldığında arka kullanarak kaybolur kontrastı üreten bir plaka yerleştirilmiş medya tarafı yukarı solucanlar (kapak aşağı). </li><li> Hareketli solucanlar zaman atlamalı filmleri yakalamak için görüntü analiz yazılımı hazırlayın. 2-min (120 kare) film olarak, 12-bit gri ölçekli görüntüler, her 1 sn yakalamak için yazılım ayarlayın. Hala yeterli görüntü çözünürlüğü korurken, çıktı dosyasının boyutunu azaltmak için, 1024x1024 piksel görüntü yakalamak için bir 2x2 binning modunu kullanın. </li><li> Film kaydetmek. Son solucanlar 10 dakika sonra o plaka yerleştirildi ilk plaka (0 mM etanol) 120 kare film kayıt başlayın. Film dosyayı kaydedin. </li><li> İkinci plaka (400 mM etanol) kaydedin. Için bu işlemi tekrarlayınSon solucanlar işleminden 30 dakika sonra başlayan, her iki levha her teşhir için, 30-32 dakikalık bir zaman noktaları yakalamak için birinci plaka (0 mM etanol) yerleştirildi. NOT: analiz edilecek bir sonraki plaka kaydı başlamadan önce her yakalama seansından sonra görüntü dosyalarını kaydetmek için yeterli zaman tanıyın. </li><li> Arşivlenmiş film geleceğe prova ve 8-bit 256 gri skala TIFF dosyaları için her filmin bir kopyasını dönüştürmek, bu filmler açıldı ve ImageJ 28 gibi diğer kamu alanı, açık kaynak kodlu yazılım programları görüntüleme, analiz edilecek izin vermek. NOT: Burada anlatılan görüntü analiz yazılımı özel bir dosya biçimini kullanır. </li></ol></li><li> ImagePro yazılımını kullanarak film analizi. <ol><li> Yakalanan kez, Image-Pro yazılımı veya eşdeğer Artı kullanarak film analiz. NOT: Diğer nesne izleme yazılımı çeşitli başarıyla birden C izlemek için kullanılır olmuştur ki mevcut tek seferde 29 ve böyle de elegansYazılım makul nesne tanımlama adımlar benzer ilkelere dayalı olarak burada tarif için yerine olabilir. açıklanan yöntem küçük farklılıklar olabilir Resim-Pro Plus yazılımı sürümleri 6,0-6,3 ve 7.0, Resim-Pro Plus yazılımının yeni sürümlerini ilgilidir. </li><li> 2-min (120 kare) segmentlerde filmleri analiz. İlk olarak, arka plan düzleştirmek ve solucan nesnelerin kontrastı artırmak için görüntülere bir filtre uygulamak. Aşağıdaki gibi filtre seçin: Menü&gt; İşlem&gt; Filtreler&gt; Donanım&gt; Flatten: Parametreler: Arka plan = Karanlık; Genişlik = 20 Pix Özellik. </li><li> Filtreleme aşamasından sonra film yeniden kaydetmek ama her zaman kendi filtresiz formda orijinal film korumak. <ol><li> Yerleştirilir ve bakır halka ile üst üste büyüklükte faiz (ROI) bir dairesel bölge ile ayrı ayrı halka hayvanların lokomosyonu analiz. Belirlemek ve Menü&gt; Tedbir ile solucanlar izlemek&gt; Parça ... komutunu Nesneleri; Bu Takibi D getirirata Tablo penceresi. Takip Seçenekleri düğmesi belirli parçalar hariç olmak üzere ve herhangi bir deneysel eserler sınırlamak için olanak sağlar. </li></ol></li><li> Otomatik Takip sekmesinde, aşağıdaki parametreleri kullanın: Parça Parametreleri: Hız sınırını (arama yarıçapı) = 400 mm / çerçeve, İvme sınırı = Otomatik, Minimum toplam hat uzunluğu = 400 mikron, Baskın hareket type = kaotik; Parça parametreleri nesneler: kısmi parçalar = yes, Min uzunluğu = 21 kare, İzleme tahmin derinliği = 1 çerçeve izin verin. </li><li> Izleme sürecini başlatmak için, otomatik olarak tüm parçalar Bul Kont / Boyut seçenekleri iletişim kutusunu ve İzleme iletişim kutusunu getirmek için düğmeye işlev tıklayın. Analiz için bir solucan nesne vurgulamak ve hafif arka plan pikselleri görmezden solucan piksel gri ölçekli yoğunluğunu kullanan önemli eşik adım sağlar Kont / Boyutu iletişim kutusunda, içinde Intensity Range Seçimi Manuel seçeneğini seçin. <ol><li> Yoğunluk eşik SLI ayarlayınders, tüm karanlık nesneleri vurgular kapsayıcı bir dizi oluşturmak için (bir alt sınırını ayarlamak için, bir üst sınırını ayarlamak için). 0-4,095 bir ölçekte 0-1,500 bir dizi ince ayar için iyi bir başlangıç ​​noktasıdır. </li><li> Bakır halka ve plakalar üzerinde herhangi bir enkaz gibi tek bir solucan nesnesi daha büyük ve daha küçük nesneleri, dışlamak için bir boyut filtresini uygulayın. Tedbir ile duruşlar çeşitli bireysel solucanlar için boyutları kapsayan bunu yapmak için iki boyut parametrelerini ayarlayın&gt; Kont / Boyut seçenekleri iletişim kutusunda seçin Ölçümler menü öğesi. (Alan aralığı: 28,000-120,000 mikron 2 ve Çevre aralığı: 600-2,500 um). </li><li> Bir mutant suş analiz edilecek plaka üzerinde önemli ölçüde daha küçük ya da diğer hayvanlara göre daha büyükse ayarları değiştirilebilir olması gerekmez, böylece ilk hayvanları izleme önce suşları farklı boyutlarda uyum nesne tanıma için filtre ayarları aralığını genişletmek orta analizi. </li></ol> &lt;/ Li&gt; <li> Takip iletişim kutusunda Devam tıklayarak izleme işlemini tamamlayın. Görme otomatik filtre ayarlarına göre bunu dışlamak için geçerli bir neden olmadıkça, her solucan temsil sağlamak için filmde her solucanın ilerleme çıkış parçaları karşılaştırın. Manuel boyutu filtre kriterlerini doğruladı olmayan solucan nesnelerin varlığı ile üretilen parçaları silin. </li><li> Her çerçeve arasındaki her solucanın hızını hesaplamak için yazılımını kullanın (mesafe kareler arasında 1 saniyede bir nesnenin sentroidinden için gitti) ve solucanlar nüfus için tüm parçalar arasında her parça için ortalama hız ve ortalama hızı görüntüler bakır halka. Bu son ortalama deneysel çalışmalarda açısından n = 1 olmak düşünün. İstatistiksel analizler ve veri arşivleme için bir elektronik tablo programı veri ihracat. </li><li> Veri plakasında ilk halka kaydedildi edildikten sonra, bir sonraki halkaya yatırım getirisini taşımak veparametrelerden birini değiştirmeden, izleme işlemini tekrarlayın. </li><li> Lokomosyon ile göreceli hız hesaplayın: </li><li> Bağıl hız (%) = işlenmiş işlenmemiş (400 mM) hız / (0 mM) hız x 100. NOT: Farklı genetik manipülasyonlar genellikle hayvanların bazal lokomosyon oranını değiştirmek. Hayvanların hareket hızına etanol etkiyi tespit etmek ve farklı genotipler ve koşullar arasında, bu etkilerini karşılaştırmak mümkün olması için, göreceli hızını hesaplar. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Prescott, C. A., Kendler, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+and+environmental+contributions+to+alcohol+abuse+and+dependence+in+a+population-based+sample+of+male+twins.">Genetic and environmental contributions to alcohol abuse and dependence in a population-based sample of male twins.</a> Am. J. Psychiatry. 156, 34-40 (1999).</li><li>Schuckit, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetics+of+the+risk+for+alcoholism.">Genetics of the risk for alcoholism.</a> Am. J. Addict. Article Review. 9, 103-112 (2000).</li><li>Heath, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+differences+in+alcohol+sensitivity+and+the+inheritance+of+alcoholism+risk.">Genetic differences in alcohol sensitivity and the inheritance of alcoholism risk.</a> Psychol. Med. 29, 1069-1081 (1999).</li><li>Rodriguez, L. A., Wilson, J. R., Nagoshi, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Does+psychomotor+sensitivity+to+alcohol+predict+subsequent+alcohol+use.">Does psychomotor sensitivity to alcohol predict subsequent alcohol use.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 17, 155-161 (1993).</li><li>Schuckit, M. A., Smith, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+8-year+follow-up+of+450+sons+of+alcoholic+and+control+subjects.">An 8-year follow-up of 450 sons of alcoholic and control subjects.</a> Arch. Gen. Psychiatry. 53, 202-210 (1996).</li><li>Kalu, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Heritability+of+level+of+response+and+association+with+recent+drinking+history+in+nonalcohol-dependent+drinkers.">Heritability of level of response and association with recent drinking history in nonalcohol-dependent drinkers.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 36, 522-529 (2012).</li><li>Davis, S. J., Scott, L. L., Hu, K., Pierce-Shimomura, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conserved+single+residue+in+the+BK+potassium+channel+required+for+activation+by+alcohol+and+intoxication+in.">Conserved single residue in the BK potassium channel required for activation by alcohol and intoxication in.</a> C. elegans. J. Neurosci. 34, 9562-9573 (2014).</li><li>Raabe, R. C., Mathies, L. D., Davies, A. G., Bettinger, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Omega-3+Fatty+Acid+Eicosapentaenoic+Acid+Is+Required+for+Normal+Alcohol+Response+Behaviors+in+C.+elegans.">The Omega-3 Fatty Acid Eicosapentaenoic Acid Is Required for Normal Alcohol Response Behaviors in C. elegans.</a> PLoS ONE. 9, e105999 (2014).</li><li>Topper, S. M., Aguilar, S. C., Topper, V. Y., Elbel, E., Pierce-Shimomura, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alcohol+disinhibition+of+behaviors+in+C.+elegans.">Alcohol disinhibition of behaviors in C. elegans.</a> PLoS ONE. 9, e92965 (2014).</li><li>Bhandari, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chloride+intracellular+channels+modulate+acute+ethanol+behaviors+Drosophila,Caenorhabditis+elegans+and+mice.">Chloride intracellular channels modulate acute ethanol behaviors Drosophila,Caenorhabditis elegans and mice.</a> Genes Brain Behav. 11, 387-397 (2012).</li><li>Davies, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+central+role+of+the+BK+potassium+channel+in+behavioral+responses+to+ethanol+in+C.+elegans.">A central role of the BK potassium channel in behavioral responses to ethanol in C. elegans.</a> Cell. 115, 655-666 (2003).</li><li>Davies, A. G., Bettinger, J. C., Thiele, T. R., Judy, M. E., McIntire, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Natural+variation+in+the+npr-1+gene+modifies+ethanol+responses+of+wild+strains+of+C.+elegans.">Natural variation in the npr-1 gene modifies ethanol responses of wild strains of C. elegans.</a> Neuron. 42, 731-743 (2004).</li><li>Kapfhamer, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Loss+of+RAB-3/A+in+Caenorhabditis+elegans+and+the+mouse+affects+behavioral+response+to+ethanol.">Loss of RAB-3/A in Caenorhabditis elegans and the mouse affects behavioral response to ethanol.</a> Genes Brain Behav. 7, 669-676 (2008).</li><li>Speca, D. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conserved+role+of+unc-79+in+ethanol+responses+in+lightweight+mutant+mice.">Conserved role of unc-79 in ethanol responses in lightweight mutant mice.</a> PLoS Genet. 6, e1001057 (2010).</li><li>Thiele, T. E., Badia-Elder, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+role+for+neuropeptide+Y+in+alcohol+intake+control:+evidence+from+human+and+animal+research.">A role for neuropeptide Y in alcohol intake control: evidence from human and animal research.</a> Physiol. Behav. 79, 95-101 (2003).</li><li>Treistman, S. N., Martin, G. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BK+Channels:+mediators+and+models+for+alcohol+tolerance.">BK Channels: mediators and models for alcohol tolerance.</a> Trends Neurosci. 32, 629-637 (2009).</li><li>Han, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrating+GWASs+and+human+protein+interaction+networks+identifies+a+gene+subnetwork+underlying+alcohol+dependence.">Integrating GWASs and human protein interaction networks identifies a gene subnetwork underlying alcohol dependence.</a> Am. J. Hum. Genet. 93, 1027-1034 (2013).</li><li>Kendler, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genomewide+association+analysis+of+symptoms+of+alcohol+dependence+in+the+molecular+genetics+of+schizophrenia+(MGS2)+control+sample.">Genomewide association analysis of symptoms of alcohol dependence in the molecular genetics of schizophrenia (MGS2) control sample.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 35, 963-975 (2011).</li><li>Schuckit, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Autosomal+linkage+analysis+for+the+level+of+response+to+alcohol.">Autosomal linkage analysis for the level of response to alcohol.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 29, 1976-1982 (2005).</li><li>Alaimo, J. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethanol+metabolism+and+osmolarity+modify+behavioral+responses+to+ethanol+in+C.+elegans.">Ethanol metabolism and osmolarity modify behavioral responses to ethanol in C. elegans.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 36, 1840-1850 (2012).</li><li>Morgan, P. G., Sedensky, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mutations+affecting+sensitivity+to+ethanol+in+the+nematode,+Caenorhabditis+elegans.">Mutations affecting sensitivity to ethanol in the nematode, Caenorhabditis elegans.</a> Alcohol. Clin. Exp. Res. 19, 1423-1429 (1995).</li><li>Mitchell, P. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+concentration-dependent+effects+of+ethanol+on+Caenorhabditis+elegans+behaviour.">The concentration-dependent effects of ethanol on Caenorhabditis elegans behaviour.</a> Pharmacogenomics J. 7, 411-417 (2007).</li><li>Vidal-Gadea, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Caenorhabditis+elegans+selects+distinct+crawling+and+swimming+gaits+via+dopamine+and+serotonin.">Caenorhabditis elegans selects distinct crawling and swimming gaits via dopamine and serotonin.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 108, 17504-17509 (2011).</li><li>Bettinger, J. C., Leung, K., Bolling, M. H., Goldsmith, A. D., Davies, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+environment+modulates+the+development+of+acute+tolerance+to+ethanol+in+Caenorhabditis+elegans.">Lipid environment modulates the development of acute tolerance to ethanol in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS ONE. 7, e35129 (2012).</li><li>Davies, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Different+genes+influence+toluene-+and+ethanol-induced+locomotor+impairment+in+C.+elegans.">Different genes influence toluene- and ethanol-induced locomotor impairment in C. elegans.</a> Drug Alcohol Depend. 122, 47-54 (2012).</li><li>Newlin, D., Thomson, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alcohol+challenge+with+sons+of+alcoholics:+a+critical+review+and+analysis.">Alcohol challenge with sons of alcoholics: a critical review and analysis.</a> Psychol. Bull. 108, 383-402 (1990).</li><li>Ponomarev, I., Crabbe, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+method+to+assess+initial+sensitivity+and+acute+functional+tolerance+to+hypnotic+effects+of+ethanol.">A novel method to assess initial sensitivity and acute functional tolerance to hypnotic effects of ethanol.</a> J. Pharmacol. Exp. Ther. 302, 257-263 (2002).</li><li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=NIH+Image+to+ImageJ:+25+years+of+image+analysis.">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nat Methods. 9, 671-675 (2012).</li><li>Husson, S. J., Costa, W. S., Schmitt, C., Gottschalk, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Keeping+track+of+worm+trackers.">Keeping track of worm trackers.</a> WormBook. , (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

C. mevcut basit nörobiyoloji ve genetik araçlar elegans solucan davranışı üzerinde etanol etkilerinin moleküler temellerini incelemek için hangi mükemmel bir model olun. Burada, 8,10,20,24,25 etanol akut davranış tepkisinin farklı moleküler ve çevre mediatörleri tanımlamak için kullanılan bir analiz tanımlamaktadırlar. Bu yöntem, bu arada, memelilerde tepki seviyesine bileşik fenotip modeli, farklılaşması ve iki farklı etanol tepki davranışı fenotipleri ilk duyar...

Alcohol use disorders (AUD) are widespread and produce serious health, social, and economic problems. In humans, the susceptibility to developing an AUD is heavily influenced by both genetics and the environment1,2. A strong physiological predictor of abuse liability is the initial level of response (LR) to alcohol (ethanol) that is exhibited by na&#239;ve drinkers3-5. This LR phenotype is influenced by genetics and non-genetic components6. Determining the molecular mechanisms that influence the LR to ethanol is an important goal of the study of ethanol response behaviors.
The nematode, Caenorhabditis elegans, has been increasingly used as a model for studying the effects of ethanol on behavior7-9. There is strong molecular conservation in the machinery of nervous system function between worms and mammals, and several genes that have been shown to influence the LR to ethanol in worms have been shown to influence LR to ethanol in mammals10-16, and have been implicated in abuse liability in humans17-19. 
Ethanol intoxicates worms, which is reflected in a decrease in their locomotion speed. Several different laboratories have developed behavioral assays that differ in several ways, for example, the locomotion behavior that they study (crawling versus swimming11,12,14,20,21) or in the composition of the solutions in which the assays are performed (nematode growth medium versus Dent&#8217;s saline20,22). Interestingly, these diverse assays have yielded somewhat different dose response profiles for the effects of ethanol. These results have pointed to important differences in the underlying behaviors of crawling and swimming9,23, as well as a role for the environmental variable osmolarity in ethanol responses20, and have highlighted the importance of describing experimental detail of the various assays.
An assay to measure the acute effects of ethanol on crawling behavior is presented here. This assay has been used extensively to study the genetic and environmental influences on the LR to ethanol8,10,20,24,25. The mammalian LR phenotype is a composite of at least two components, initial sensitivity to ethanol and acute functional tolerance to ethanol26,27. In worms, the LR phenotype has been shown to be separable into these two components through the use of this behavioral assay. The influences of genetic and environmental manipulations on both phenotypes can be examined using this single assay. Importantly, these two phenotypes are genetically separable.

<table><tbody><tr><td>C. elegans strains</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td></td><td></td></tr><tr><td>60 x 15 mm Petri plates, triple vented</td><td>Greiner Bio-One</td><td>628161</td><td>Other plate brands will suffice.</td></tr><tr><td>NGM agar</td><td>Various</td><td></td><td>NaCl (3 g/L), agar (17 g/L), peptone (2.5 g/L), 1 ml cholesterol (5 mg/ml in ethanol), 1 ml (1 M) MgSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;, 1 ml (1 M) CaCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;, 25 ml (1 M) KPO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;, pH=6, 975 ml H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td></tr><tr><td>Forceps</td><td>Various</td><td></td><td>&lt;I&gt;e.g.&lt;/I&gt;, Fisher Scientific #10300</td></tr><tr><td>37 &amp;deg;C Incubator</td><td>Various</td><td></td><td>For drying agar</td></tr><tr><td>Digital balance</td><td>Various</td><td></td><td>For determining plate weights and agar volume</td></tr><tr><td>Copper rings</td><td>Plumbmaster</td><td>STK#35583 (48 cap thread gasket)</td><td>1.6 cm inner diameter, 1.8 cm outer diameter copper rings</td></tr><tr><td>100% ethanol</td><td>Various</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Parafilm M</td><td>Bemis</td><td>PM996</td><td></td></tr><tr><td>CCD camera</td><td>QImaging</td><td>RET-4000R-F-M-12</td><td>This camera has a large field of view.</td></tr><tr><td>Stereomicroscope with C-mount and 0.5X objective</td><td>Leica</td><td>MZ6</td><td>Discontinued model, M60 is current equivalent.</td></tr><tr><td>Light source</td><td>Schott</td><td>A08923</td><td>3&amp;rdquo;x3&amp;rdquo;&amp;nbsp; backlight for even illumination across the field of view</td></tr><tr><td>Imaging and tracking software</td><td>Media Cybernetics</td><td>ImagePro-Plus v6.0-6.3</td><td>Newer versions of the software have tracking functions.</td></tr></tbody></table>

an assay for measuring the effects of ethanol on the locomotion speed of caenorhabditis elegans

Alcohol use disorders are a significant public health concern, for which there are few effective treatment strategies. One difficulty that has delayed the development of more effective treatments is the relative lack of understanding of the molecular underpinnings of the effects of ethanol on behavior. The nematode, Caenorhabditis elegans (C.&#160;elegans), provides a useful model in which to generate and test hypotheses about the molecular effects of ethanol. Here, we describe an assay that has been developed and used to examine the roles of particular genes and environmental factors in behavioral responses to ethanol, in which locomotion is the behavioral output. Ethanol dose-dependently causes an acute depression of crawling on an agar surface. The effects are dynamic; animals exposed to a high concentration demonstrate an initial strong depression of crawling, referred to here as initial sensitivity, and then partially recover locomotion speed despite the continued presence of the drug. This ethanol-induced behavioral plasticity is referred to here as the development of acute functional tolerance. This assay has been used to demonstrate that these two phenotypes are distinct and genetically separable. The straightforward locomotion assay described here is suitable for examining the effects of both genetic and environmental manipulations on these acute behavioral responses to ethanol in C.&#160;elegans.

Birkaç farklı genotipleri ve eşleştirilmiş kontrollerden Temsilcisi verileri (Şekil 1) 8,24 sunulmuştur; veri özel tahlil hayvanlarda bu vurgu farklılıkları seçildi. maruziyet 10 dakika sonra etki derecesi Şekil 1B-G sol eksen üzerinde gösterilen bir soyu, ilk duyarlılık olarak kabul edilir. 10 dakika sonra kontrole göre daha büyük bir göreceli hızla mutant suşları, etanol (Şekil 1F, G) karşı dirençli olduğu kabul ederken ...

Watch this Scientific Journal Video about An Assay for Measuring the Effects of Ethanol on the Locomotion Speed of Caenorhabditis elegans at JoVE.com

An Assay for Measuring the Effects of Ethanol on the Locomotion Speed of Caenorhabditis elegans

C. elegans is a useful model for studying the effects of ethanol on behavior. We present a behavioral assay that quantifies the effects of ethanol on the locomotion speed of crawling worms; both initial sensitivity and the development of acute functional tolerance to ethanol can be measured with this assay.

Locomotion Speed ​​Etanol Etkilerinin Ölçülmesi için bir Testi<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Alcohol use disorders are a significant public health concern, for which there are few effective treatment strategies. One difficulty that has delayed the ...

an-assay-for-measuring-effects-ethanol-on-locomotion-speed

Research

JoVE Journal

Neuroscience

An Assay for Measuring the Effects of Ethanol on the Locomotion Speed of Caenorhabditis elegans

8.6K Görüntüleme.  Virginia Commonwealth University. C. elegans is a useful model for studying the effects of ethanol on behavior. We present a behavioral assay that quantifies the effects of ethanol on the locomotion speed of crawling worms; both initial sensitivity and the development of acute functional tolerance to ethanol can be measured with this assay. 

Video: An Assay for Measuring the Effects of Ethanol on the Locomotion Speed of Caenorhabditis elegans

A Simple Way to Measure Ethanol Sensitivity in Flies

Low doses of ethanol cause flies to become hyperactive, while high doses are sedating. The sensitivity to ethanol-induced sedation of a given fly strain is correlated with that strain s ethanol preference, and therefore sedation is a highly relevant measure to study the genetics of alcohol responses and drinking. We demonstrate a simple way to expose flies to ethanol and measure its intoxicating effects. The assay we describe can determine acute sensitivity, as well as ethanol tolerance induced by repeat exposure. It does not require a technically involved setup, and can therefore be applied in any laboratory with basic fly culture tools.

A simple assay to measure the sedating effects of ethanol on Drosophila flies, based on the loss of righting reflex, is described.

Sinekler Etanol Hassasiyet Tedbir Basit Yolu

Low doses of ethanol cause flies to become hyperactive, while high doses are sedating. The sensitivity to ethanol-induced sedation of a given fly strain ...

Nörobilim

Measuring Caenorhabditis elegans Sensitivity to the Acetylcholine Receptor Agonist Levamisole

At the neuromuscular junction (NMJ), the binding of the excitatory neurotransmitter acetylcholine (ACh) to postsynaptic receptors leads to muscle contraction. As in vertebrate skeletal muscle, cholinergic signaling in the body wall muscles of the model organism Caenorhabditis elegans is required for locomotion. Exposure to levamisole, a pharmacological agonist of one class of ACh receptors on the body wall muscles, causes time-dependent paralysis of wild-type animals. Altered sensitivity to levamisole suggests defects in signaling at the NMJ or muscle function. Here, a protocol for a liquid levamisole assay performed on C. elegans grown in 24-well plates is presented. Vigorous swimming of the animals in liquid allows for the assessment and quantitation of levamisole-induced paralysis in hundreds of worms over a one-hour time period without requiring physical manipulation. This procedure can be used with both wild-type and mutants that have altered sensitivity to levamisole to demonstrate the functional consequences of altered signaling at the NMJ.

Measuring Caenorhabditis elegans Sensitivity to the Acetylcholine Receptor Agonist Levamisole

The present protocol describes an assay to determine response to levamisole, a pharmacological agonist of one class of Caenorhabditis elegans acetylcholine receptors. In this liquid levamisole swim assay, researchers visually observe and quantitate the time-dependent paralysis of animals cultivated in 24-well plates.

Caenorhabditis elegans Ölçümü Asetilkolin Reseptör Agonisti Levamisol'a duyarlılık

At the neuromuscular junction (NMJ), the binding of the excitatory neurotransmitter acetylcholine (ACh) to postsynaptic receptors leads to muscle ...

Genetik

Methods for Studying the Mechanisms of Action of Antipsychotic Drugs in Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans is a simple genetic organism amenable to large-scale forward and reverse genetic screens and chemical genetic screens. The C. elegans genome includes potential antipsychotic drug (APD) targets conserved in humans, including genes encoding proteins required for neurotransmitter synthesis and for synaptic structure and function. APD exposure produces developmental delay and/or lethality in nematodes in a concentration-dependent manner. These phenotypes are caused, in part, by APD-induced inhibition of pharyngeal pumping1,2. Thus, the developmental phenotype has a neuromuscular basis, making it useful for pharmacogenetic studies of neuroleptics. Here we demonstrate detailed procedures for testing APD effects on nematode development and pharyngeal pumping. For the developmental assay, synchronized embryos are placed on nematode growth medium (NGM) plates containing APDs, and the stages of developing animals are then scored daily. For the pharyngeal pumping rate assay, staged young adult animals are tested on NGM plates containing APDs. The number of pharyngeal pumps per unit time is recorded, and the pumping rate is calculated. These assays can be used for studying many other types of small molecules or even large molecules.

Methods for Studying the Mechanisms of Action of Antipsychotic Drugs in Caenorhabditis elegans

Approaches for testing the effects of antipsychotic drugs (APDs) in Caenorhabditis elegans are demonstrated. Assays are described for testing drug effects on development and viability and on pharyngeal pumping rate. These methods are also applicable for pharmacogenetic experiments with drug classes other than APDs.

Antipsikotik İlaçların Etki Mekanizmaları incelenmesi için Yöntemleri<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Caenorhabditis elegans is a simple genetic organism amenable to  large-scale forward and reverse genetic screens and chemical genetic screens. The C.  ...

High-Throughput Method for Measuring Alcohol Sedation Time of Individual Drosophila melanogaster

Drosophila melanogaster provides an excellent model to study the genetic underpinnings of alcohol sensitivity. In contrast to studies in human populations, the Drosophila model allows strict control over genetic background, and virtually unlimited numbers of individuals of the same genotype can be reared rapidly under well-controlled environmental conditions without regulatory restrictions and at relatively low cost. Flies exposed to ethanol undergo physiological and behavioral changes that resemble human alcohol intoxication, including loss of postural control, sedation, and development of tolerance. Here, we describe a simple, low-cost, high-throughput assay for assessing alcohol sedation sensitivity in large numbers of single flies. The assay is based on video recording of single flies introduced without anesthesia in 24-well cell culture plates in a set-up that enables synchronous initiation of alcohol exposure. The system enables a single person to collect individual ethanol sedation data on as many as 2,000 flies within an 8 h work period. The assay can, in principle, be extended to assess the effects of exposure to any volatile substance and applied to measure effects of acute toxicity of volatiles on other insects, including other fly species.

High-Throughput Method for Measuring Alcohol Sedation Time of Individual Drosophila melanogaster

Current methods to measure alcohol sensitivity in Drosophila are designed to test groups of flies. We present a simple, low-cost, high-throughput assay for assessing alcohol sedation sensitivity in large numbers of single flies. The method does not require specialized tools and can be performed in any laboratory using common materials.

Bireysel Drosophila melanogaster Alkol Sedasyon Süresini Ölçmek için Yüksek İşLenme Yöntemi

Drosophila melanogaster provides an excellent model to study the genetic underpinnings of alcohol sensitivity. In contrast to studies in human ...

Davranış

Comparative Analysis of Experimental Methods to Quantify Animal Activity in Caenorhabditis elegans Models of Mitochondrial Disease

Caenorhabditis elegans is widely recognized for its central utility as a translational animal model to efficiently interrogate mechanisms and therapies of diverse human diseases. Worms are particularly well-suited for high-throughput genetic and drug screens to gain deeper insight into therapeutic targets and therapies by exploiting their fast development cycle, large brood size, short lifespan, microscopic transparency, low maintenance costs, robust suite of genomic tools, mutant repositories, and experimental methodologies to interrogate both in vivo and ex vivo physiology. Worm locomotor activity represents a particularly relevant phenotype that is frequently impaired in mitochondrial disease, which is highly heterogeneous in causes and manifestations but collectively shares an impaired capacity to produce cellular energy. While a suite of different methodologies may be used to interrogate worm behavior, these vary greatly in experimental costs, complexity, and utility for genomic or drug high-throughput screens. Here, the relative throughput, advantages, and limitations of 16 different activity analysis methodologies were compared that quantify nematode locomotion, thrashing, pharyngeal pumping, and/or chemotaxis in single worms or worm populations of C. elegans at different stages, ages, and experimental durations. Detailed protocols were demonstrated for two semi-automated methods to quantify nematode locomotor activity that represent novel applications of available software tools, namely, ZebraLab (a medium-throughput approach) and WormScan (a high-throughput approach). Data from applying these methods demonstrated similar degrees of reduced animal activity occurred at the L4 larval stage, and progressed in day 1 adults, in mitochondrial complex I disease (gas-1(fc21)) mutant worms relative to wild-type (N2 Bristol) C. elegans. This data validates the utility for these novel applications of using the ZebraLab or WormScan software tools to quantify worm locomotor activity efficiently and objectively, with variable capacity to support high-throughput drug screening on worm behavior in preclinical animal models of mitochondrial disease.

Comparative Analysis of Experimental Methods to Quantify Animal Activity in Caenorhabditis elegans Models of Mitochondrial Disease

This study presents protocols for two semi-automated locomotor activity analysis approaches in C. elegans complex I disease gas-1(fc21) worms, namely, ZebraLab (a medium-throughput assay) and WormScan (a high-throughput assay) and provide comparative analysis among a wide array of research methods to quantify nematode behavior and integrated neuromuscular function.

Caenorhabditis elegans Mitokondriyal Hastalık Modellerinde Hayvan Aktivitesini Ölçmek için Deneysel Yöntemlerin Karşılaştırmalı Analizi

Caenorhabditis elegans is widely recognized for its central utility as a translational animal model to efficiently interrogate mechanisms and therapies of ...

An Inexpensive, Scalable Behavioral Assay for Measuring Ethanol Sedation Sensitivity and Rapid Tolerance in Drosophila

Alcohol use disorder (AUD) is a serious health challenge. Despite a large hereditary component to AUD, few genes have been unambiguously implicated in their etiology. The fruit fly, Drosophila melanogaster, is a powerful model for exploring molecular-genetic mechanisms underlying alcohol-related behaviors and therefore holds great promise for identifying and understanding the function of genes that influence AUD. The use of the Drosophila model for these types of studies depends on the availability of assays that reliably measure behavioral responses to ethanol. This report describes an assay suitable for assessing ethanol sensitivity and rapid tolerance in flies. Ethanol sensitivity measured in this assay is influenced by the volume and concentration of ethanol used, a variety of previously reported genetic manipulations, and also the length of time the flies are housed without food immediately prior to testing. In contrast, ethanol sensitivity measured in this assay is not affected by the vigor of fly handling, sex of the flies, and supplementation of growth medium with antibiotics or live yeast. Three different methods for quantitating ethanol sensitivity are described, all leading to essentially indistinguishable ethanol sensitivity results. The scalable nature of this assay, combined with its overall simplicity to set-up and relatively low expense, make it suitable for small and large scale genetic analysis of ethanol sensitivity and rapid tolerance in Drosophila.

An Inexpensive, Scalable Behavioral Assay for Measuring Ethanol Sedation Sensitivity and Rapid Tolerance in Drosophila

Straightforward assays for measuring ethanol sensitivity and rapid tolerance in Drosophila facilitate the use of this model organism for investigating these important ethanol-related behaviors. Here, a relatively simple, scalable assay for measuring ethanol sensitivity and rapid tolerance in flies is described.

Etanol sedasyon Hassasiyet ve hızlı Hoşgörü Ölçüm Ucuz bir, Ölçeklenebilir Davranış Deneyi<em&gt; Drosophila</em

Alcohol use disorder (AUD) is a serious health challenge. Despite a large hereditary component to AUD, few genes have been unambiguously implicated in ...

C. elegans Chemotaxis Assay

Many organisms use chemotaxis to seek out food sources, avoid noxious substances, and find mates. Caenorhabditis elegans has impressive chemotaxis behavior.
 The premise behind testing the response of the worms to an odorant is to place them in an area and observe the movement evoked in response to an odorant. Even with the many available assays, optimizing worm starting location relative to both the control and test areas, while minimizing the interaction of worms with each other, while maintaining a significant sample size remains a work in progress 1-10. The method described here aims to address these issues by modifying the assay developed by Bargmann et al.1. A Petri dish is divided into four quadrants, two opposite quadrants marked "Test" and two are designated "Control". Anesthetic is placed in all test and control sites. The worms are placed in the center of the plate with a circle marked around the origin to ensure that non-motile worms will be ignored. Utilizing a four-quadrant system rather than one 2 or two 1 eliminates bias in the movement of the worms, as they are equidistant from test and control samples, regardless of which side of the origin they began. This circumvents the problem of worms being forced to travel through a cluster of other worms to respond to an odorant, which can delay worms or force them to take a more circuitous route, yielding an incorrect interpretation of their intended path. This method also shows practical advantages by having a larger sample size and allowing the researcher to run the assay unattended and score the worms once the allotted time has expired.

C. elegans Chemotaxis Assay

A method of quantitatively evaluating the chemotactic response of Caenorhabditis elegans is described. A chemotactic index (CI) was employed as a way to precisely evaluate the response of worms to certain targets, and serve as a platform of comparison between strains and compounds of interest.

C. elegans Kemotaksis Deneyi

Many organisms use chemotaxis to seek out food sources, avoid noxious substances, and find mates.  Caenorhabditis elegans has impressive chemotaxis ...

Biyoloji

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

C. elegans egg-laying behavior is affected by environmental cues such as osmolarity1 and vibration2. In the total absence of food C. elegans also cease egg-laying and retain fertilized eggs in their uterus3. However, the effect of different sources of food, especially pathogenic bacteria and particularly Enterococcus faecalis, on egg-laying
	behavior is not well characterized. The egg-in-worm (EIW) assay is a useful tool to quantify the effects of different types of bacteria, in this case E. faecalis, on egg- laying behavior.
	
	EIW assays involve counting the number of eggs retained in the uterus of C. elegans4. The EIW assay involves bleaching staged, gravid adult C. elegans to remove the cuticle and separate the retained eggs from the animal. Prior to bleaching, worms are exposed to bacteria (or any type of environmental cue) for a fixed period of time. After bleaching, one is very easily able to count the number of eggs retained inside the uterus of the worms. In this assay, a quantifiable increase in egg retention after E. faecalis exposure can be easily measured. The EIW assay is a behavioral assay that may be used to screen for potentially pathogenic bacteria or the presence of environmental toxins. In addition, the EIW assay may be a tool to screen for drugs that affect neurotransmitter signaling since egg-laying behavior is modulated by neurotransmitters such as serotonin and acetylcholine5-9.

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

An egg-in-worm (EIW) assay is a useful method to quantify egg-laying behavior. Alterations in egg laying can be a behavioral response of the model organism Caenorhabditis elegans to potentially harmful environmental substances such as those produced by pathogenic bacteria.

Üzerinde Bakterilerin Etkilerinin Ölçme<em&gt; C. Elegans</emBir Yumurta Tutma Testi Kullanma&gt; Davranış

C. elegans egg-laying behavior is  affected by environmental cues such as osmolarity1 and  vibration2. In the total absence of food C. elegans also cease ...

Touch Habituation Assay: A Method to Study Non-Associative Learning in C. elegans

Source: Mersha, M. D., et al. <a href="https://www.jove.com/video/56771/long-term-behavioral-reproductive-consequences-embryonic-exposure-to">Long-term Behavioral and Reproductive Consequences of Embryonic Exposure to Low-dose Toxicants.</a> J. Vis. Exp. (2018).
This video introduces the touch habituation assay, a C. elegans behavioral method of assessing mechanosensation and quantifying time to habituation.

Dokunma Alışkanlığı Testi: C. elegans'ta İlişkisel Olmayan Öğrenmeyi İncelemek İçin Bir Yöntem

Source: Mersha, M. D., et al. Long-term Behavioral and Reproductive Consequences of Embryonic Exposure to Low-dose Toxicants. J. Vis. Exp. (2018).
This ...

JoVE Encyclopedia of Experiments

Caenorhabditis elegans (solucan)

Electrotaxis Assay: A Method to Observe Locomotion in C. elegans

Source: Tong, J,&#160;et al. <a href="https://www.jove.com/video/50226/microfluidic-based-electrotaxis-for-on-demand-quantitative-analysis">Microfluidic-based Electrotaxis for On-demand Quantitative Analysis of&#160;Caenorhabditis elegans&#39; Locomotion.</a>&#160;J. Vis. Exp.&#160;(2013).
Researchers can trigger on-demand movement in C. elegans by applying an electric field that worms sense and respond to.&#160; This video introduces electrotactic behavior and shows a sample protocol that is done in a microfluidic device.

Elektrotaksi Deneyi: C. elegans'ta Hareketi Gözlemlemek İçin Bir Yöntem

Source: Tong, J,&#160;et al. Microfluidic-based Electrotaxis for On-demand Quantitative Analysis of&#160;Caenorhabditis elegans&#39; Locomotion.&#160;J. ...

Locomotion Speed Etanol Etkilerinin Ölçülmesi için bir Testi

Özet

Daha Fazla Video Keşfet

Bu videodaki bölümler

Sinekler Etanol Hassasiyet Tedbir Basit Yolu

Caenorhabditis elegans Ölçümü Asetilkolin Reseptör Agonisti Levamisol'a duyarlılık

Antipsikotik İlaçların Etki Mekanizmaları incelenmesi için Yöntemleri

Bireysel Drosophila melanogaster Alkol Sedasyon Süresini Ölçmek için Yüksek İşLenme Yöntemi

Caenorhabditis elegans Mitokondriyal Hastalık Modellerinde Hayvan Aktivitesini Ölçmek için Deneysel Yöntemlerin Karşılaştırmalı Analizi

Etanol sedasyon Hassasiyet ve hızlı Hoşgörü Ölçüm Ucuz bir, Ölçeklenebilir Davranış Deneyi

C. elegans Kemotaksis Deneyi

Üzerinde Bakterilerin Etkilerinin Ölçme

Dokunma Alışkanlığı Testi: C. elegans'ta İlişkisel Olmayan Öğrenmeyi İncelemek İçin Bir Yöntem

Elektrotaksi Deneyi: C. elegans'ta Hareketi Gözlemlemek İçin Bir Yöntem

Locomotion Speed ​​Etanol Etkilerinin Ölçülmesi için bir Testi

Özet

Daha Fazla Video Keşfet

Bu videodaki bölümler

Sinekler Etanol Hassasiyet Tedbir Basit Yolu

Caenorhabditis elegans Ölçümü Asetilkolin Reseptör Agonisti Levamisol'a duyarlılık

Antipsikotik İlaçların Etki Mekanizmaları incelenmesi için Yöntemleri

Bireysel Drosophila melanogaster Alkol Sedasyon Süresini Ölçmek için Yüksek İşLenme Yöntemi

Caenorhabditis elegans Mitokondriyal Hastalık Modellerinde Hayvan Aktivitesini Ölçmek için Deneysel Yöntemlerin Karşılaştırmalı Analizi

Etanol sedasyon Hassasiyet ve hızlı Hoşgörü Ölçüm Ucuz bir, Ölçeklenebilir Davranış Deneyi

C. elegans Kemotaksis Deneyi

Üzerinde Bakterilerin Etkilerinin Ölçme

Dokunma Alışkanlığı Testi: C. elegans'ta İlişkisel Olmayan Öğrenmeyi İncelemek İçin Bir Yöntem

Elektrotaksi Deneyi: C. elegans'ta Hareketi Gözlemlemek İçin Bir Yöntem

Locomotion Speed Etanol Etkilerinin Ölçülmesi için bir Testi