Bu çalışma NIH hibe (R15DA029863) tarafından desteklenmiştir, Florida Atlantic Üniversitesi lisans araştırma bursu (M30014) ve Veterinerlik Araştırma hibe Ross Üniversitesi. Biz bu iş için (±) 3,4-metilendioksimetamfetamin (± MDMA) sağlamak için Uyuşturucu Bağımlılığı Ulusal Enstitüsü (Rockville, MD) teşekkür etmek istiyorum.

Aşağıda açıklanan Hayvan kullanım prosedürleri Veteriner Ross Üniversitesi Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) ve Florida Atlantic University tarafından onaylanmıştır. Steril teknikler ve eldiven gerekli olmasına rağmen, bu protokolü kullanarak, RNaz içermeyen ortamda gerekli değildir. 1. Hazırlık <ol><li> Doku hazırlanması ve kesit <ol><li> Üç gruba rastgele Fareleri atama:;, SAL / öneki ve / 3,4-metilendioksimetamfetamin önüne taze / tuz (% 0.9 NaCI SAL) (MDMA, Tablo 1&#39;de ayrıntıları bakınız). </li><li> 2 saat aralığında SAL ve MDMA grupları, intraperitonal, sırası ile 1 ml / kg SAL ve 10 mg / kg MDMA üç doz uygulayın. Hayvanlar 6 gün boyunca tedavi hayatta izin verin. </li><li> 7. günde, 5 mg kombinasyon halinde 100 mg / kg ketamin uygulama / periton içine derin bir anestezi için sıçanlarda (kadar ksilazin kg, yani kornea yanıp sönme ve ta kaybıil) refleksleri çimdik. </li><li> Taze / SAL grubunda, hızlı fareleri başını kesmek ve (referans 5 detaylarını görmek) taze beyin testi için beyin kaldırmak. </li><li> SAL / öneki ve öneki / MDMA grupları için, sternum yaklaşık 10 -12 cm boyunca bir kesim yapmak ve daha sonra sternum sonunu maruz. </li><li> Hemostatla sternum ucunu tutun ve keskin bir makas ile her iki tarafta yanal diyafram kesilmiş ve sonra akciğerlere kaburga ve paralel boyunca yukarı kesti. </li><li> Tek bir el ile, küçük forseps ile kalbin ventral ucunu tutun. Öte yandan ile, 18 G şırınga iğnesiyle sol ventrikül delmek (buz soğukluğunda SAL ve paraformaldehit konteyner ve peristaltik pompa için bir Y-şekilli silikon hortum ile bağlantılı olan iğne bağdaştırıcı yönüne dikkat edin, bakınız, referans 9). </li><li> Akış hızı (~ 5 ml / dk) orta düzeyde SAL pompası açın ve getiri circ kaçmasını sağlamak için forseps ile sağ atrium delinmeulation. 30 dakika boyunca SAL perfüzyon koruyun. </li><li> Orta düzeyde paraformaldehid pompası açın ve buz gibi soğuk% 4 paraformaldehid 30 dakika süreyle hayvan serpmek için izin verir. </li><li> Perfüzyon aleti çıkarın ve hayvan başını kesmek. Kafatası orta hat boyunca kesilmiş bir posteroanterior yapın ve sonra kafatası boşluğu 10 maruz kafatası flap. </li><li> Kafatası boşluğundan bir spatula ile beyin çıkarın ve 25 ml% 4 paraformaldehid içeren 50 ml&#39;lik bir santrifüj tüpüne beyin yerleştirin. 24 saat süreyle 4 ° C buzdolabı da paraformaldehid içeren tüp içinde beyin tutun. </li><li> 3 gün boyunca 4 ° C&#39;de% 30 sukroz çözeltisi 25 ml içeren 50 ml&#39;lik bir santrifüj tüpü içine beyin taşıyın. Son olarak, kullanıcı kadar -80 ° C&#39;de plastik torbalar içinde beyin saklayın. </li><li> Gömme medya ile bir aynanın üzerinde beyin takın ve -26 ºC sıcaklıkta bir kriyostat beyin içeren gömme medya dondurma. Taze dondu Cutn 20 mikron bölüme beyin ve 10 mikron bölüme beyin paraformaldehid-öneki. Bölümüne slayt dokunarak RT mikroskop lamı bölümü aktarın. </li><li> Hava, kuru 4 saat oda sıcaklığında karıştırıldı. Kullanım kadar -80 ° C&#39;de sıkı kapatılmış torbaya bölümü slaytlar saklayın. </li></ol></li><li> Dehidrasyon <ol><li> -80 ° C derin dondurucuda slaytları alın ve üç testleri içine bölümleri atayın: HT2A, ppiB (pozitif kontrol) ya da dapB (negatif kontrol); işareti ve bir tükenmez kalem ile etiket bölümleri (kalem kullanmayın). 5 dakika boyunca oda sıcaklığında% 100 alkol slaytlar daldırın. Davlumbaz 5 dakika boyunca slaytlar kurulayın. </li></ol></li><li> Tedavi öncesi <ol><li> Pipet slaytlar bölümlerine Tedavi öncesi-1 reaktif 20 ul (alkalin fosfataz inaktivasyonu). Bir nem tepsisine bir raf ray üzerinde slaytlar yerleştirin (tepsi reaksiyon solutio buharlaşma önlemek için yüksek nem korumak için bir kapak ile örtülü olduğuna dikkatn). </li><li> Yavaşça 10 dakika için düşük hızda yatay çalkalayıcı üzerinde nem tepsisini sallayın. 2 dakika boyunca iki kez damıtılmış su (GKD 2 O) ile iki kez slaytlar yıkayın. (Paraformaldehid sabitleme ile indüklenen çapraz-bağların kırılması) ön tedavi-2 reaktifin 150 ml içeren 200 ml&#39;lik bir cam slayt daldırın. 100 ° C (RNA yapısı 11 ısı ile indüklenen restorasyonu) 5 dakika toplam slaytlar kaynatılır. </li><li> 2 dakika boyunca GKD 2 O ile iki kez slaytlar yıkayın. 5 dakika boyunca% 100 alkol slaytlar yerleştirin. Bir çeker ocak içinde 5 dakika için slaytlar kurutun. Doku bölümünde seçilen alanın etrafında bir daire çizmek için bir hidrofobik kalem kullanın (örneğin, Şekil 2&#39;de belirtildiği gibi talamus ve hipotalamus dahil olmayan kortikal yapılar). </li><li> Pipet Ön İşlem-3 reaktifi Seçilen her alana (prob penetrasyon artış) 10 ul ve kapaklı nem tepsisini kapatın. Hibridizasyon fırında tepsi yerleştirinYatay çalkalayıcı ile donatılmış ve 40 ºC de fırın sıcaklığını ayarlamak; yavaşça 30 dakika süreyle tepsiyi sallayın. 2 dakika boyunca GKD 2 O ile iki kez slaytlar yıkayın. </li></ol></li></ol> 2. Hibridizasyon ve amplifikasyon <ol><li> Pipet seçilmiş alanlarda sırasıyla htr2a ppiB ve dapB prob reaktifler 10 ul,. Reaktifin buharlaşmasını önlemek için kapaklı nem tepsisini örtün. Yavaşça düşük hızda ayarlanmış yatay çalkalayıcı üzerinde sallayın. 2 saat boyunca fırında 40 ºC &#39;de slaytlar inkübe edin. </li><li> 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. Pipet seçilen her alanda Amplifikasyon-1 reaktif 10 ul, sallamak ve 30 dakika boyunca 40 ºC de slaytlar kuluçkaya yatmaktadır. </li><li> 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. Pipet seçilen her alanda Amplifikasyon-2 reaktif 10 ul, sallamak ve 15 dakika boyunca 40 ºC de slaytlar kuluçkaya yatmaktadır. </li><li> İki kez w slaytlar yıkayın2 dakika için bir yıkama tamponu i. Pipet seçilen her alanda Amplifikasyon-3 reaktif 10 ul, sallamak ve 30 dakika boyunca 40 ºC de slaytlar kuluçkaya yatmaktadır. </li><li> 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. Pipet seçilen her alanda Amplifikasyon-4 reaktif 10 ul, sallamak ve 15 dakika boyunca 40 ºC de slaytlar kuluçkaya yatmaktadır. </li><li> 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. Pipet seçilen her alanda amplifikasyonu-5 reaktifi 10 ul sarsıntı ve 30 dakika boyunca oda sıcaklığında inkübe slaytlar. </li><li> 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. Pipet seçilen her alanda amplifikasyonu-6 reaktifi 10 ul sarsıntı ve 15 dakika boyunca oda sıcaklığında inkübe slaytlar. 2 dakika için bir yıkama tamponu ile iki kez slaytlar yıkayın. </li></ol> 3. Sinyal Algılama <ol><li> Seçilen her alana Kırmızı reaktif Pipet 10 ul (reaktif kırmızı-B ve Kızıl-A karışımı bir 1:60 oranında ve i kullanılması gerektiğini unutmayınmmediately). RT&#39;de yatay çalkalayıcı üzerinde nem tepsisine slayt yerleştirin ve 10 dakika boyunca düşük bir hızda yavaşça sallayın. </li><li> 10 dakika boyunca (GKD 2 O) ile iki kez slaytlar yıkayın. 15 dakika fırında 60 ºC &#39;de slaytlar kurulayın. 5 dakika boyunca davlumbaz altında ksilen slaytlar yerleştirin. Pipet 20 Seçilen her alanda ksilen bazlı montaj medya ul ve bir lamel ile kaplayın. </li></ol> 4. Görüntü Yakalama <ol><li> 4 × ve 20 × objektif lens büyütme ile seçilmiş alanlarda (örneğin, hipotalamus, 1 ve 3 Şekiller) dijital Mikro fotoğraflar çekin. Görüntü dosyasını kaydedin. </li></ol> 5. Görüntü Parçacık Analizi <ol><li> Sürükle ve ana ImageJ penceresinin içine görüntü dosya açılır. Menü çubuğuna gidin ve &#39;Resmi&#39; seçeneğini, yanındaki açılır menüden &#39;Tip&#39; seçin ve &#39;8-bit&#39; seçeneğini seçin. </li><li> Seçin &#39;Thr seçin&#39; ayarlama &#39;eshold &#39;iletişim kutusunu açmak için. Istenmeyen arka plan çıkarılır, böylece iletişim kutusunda alt bar değerini ayarlayın. Daha sonra ikinci bir iletişim kutusunu açmak için &#39;Parçacıklar Analiz&#39; seçeneğini menü çubuğuna gidin ve &#39;Analiz&#39; seçeneğini seçin. </li><li> 10&#39;da partikül boyutunu ayarlama, yanındaki &#39;Show özetliyor&#39; seçin ve &#39;sonuçlarını görüntüle &quot;ve&quot; özetlemek&#39; kutularını seçin. Son olarak, iletişim kutularındaki parçacık verileri görüntülemek için &#39;Tamam&#39; ı tıklatın. </li></ol> 6. Çizelge Hesaplama <ol><li> Excel sayfası içine verileri girin ve bir başlangıç ​​olarak SAL grubundaki parçacıkların sayıları ortalama. Her bölümün yüzde düzeyini hesaplamak ve bir grafik buna göre (Şekil 4) yapmak. </li></ol>

<ol>
	<li>Muzyk, A. J., Jakel, R. J., Preud'homme, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Serotonin+syndrome+after+a+massive+overdose+of+controlled-release+paroxetine.">Serotonin syndrome after a massive overdose of controlled-release paroxetine.</a> Psychosomatics. 51, 437-442 (2010).</li><li>Davies, O., Batajoo-Shrestha, B., Sosa-Popoteur, J., Olibrice, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Full+recovery+after+severe+serotonin+syndrome,+severe+rhabdomyolysis,+multi-organ+failure+and+disseminated+intravascular+coagulopathy+from+MDMA.">Full recovery after severe serotonin syndrome, severe rhabdomyolysis, multi-organ failure and disseminated intravascular coagulopathy from MDMA.</a> Heart Lung. 43, 117-119 (2014).</li><li>Bosch, O. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Verbal+memory+deficits+are+correlated+with+prefrontal+hypometabolism+in+18FDG+PET+of+recreational+MDMA+users.">Verbal memory deficits are correlated with prefrontal hypometabolism in 18FDG PET of recreational MDMA users.</a> PLoS On. 8, e61234 (2013).</li><li>Smithies, V., Broadbear, J., Verdejo-Garcia, A., Conduit, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dysfunctional+overnight+memory+consolidation+in+ecstasy+users.">Dysfunctional overnight memory consolidation in ecstasy users.</a> J Psychopharmaco. 28, 751-762 (2014).</li><li>Winzer-Serhan, U. H., Broide, R. S., Chen, Y., Leslie, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+sensitive+radioactive+in+situ+hybridization+using+full+length+hydrolyzed+riboprobes+to+detect+&#945;2+adrenoceptor+subtype+mRNAs+in+adult+and+developing+rat+brain.">Highly sensitive radioactive in situ hybridization using full length hydrolyzed riboprobes to detect &#945;2 adrenoceptor subtype mRNAs in adult and developing rat brain.</a> Brain Res Brain Res Proto. 3, 229-241 (1999).</li><li>Zoeller, R. T., Fletcher, D. L., Butnariu, O., Lowry, C. A., Moore, F. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=N-ethylmaleimide+(NEM)+can+significantly+improve+in+situ+hybridization+results+using+35S-labeled+oligodeoxynucleotide+or+complementary+RNA+probes.">N-ethylmaleimide (NEM) can significantly improve in situ hybridization results using 35S-labeled oligodeoxynucleotide or complementary RNA probes.</a> J Histochem Cytoche. 45, 1035-1041 (1997).</li><li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNAscope:+a+novel+in+situ+RNA+analysis+platform+for+formalin-fixed,+paraffin-embedded+tissues.">RNAscope: a novel in situ RNA analysis platform for formalin-fixed, paraffin-embedded tissues.</a> J Mol Diag. 14, 22-29 (2012).</li><li>Wang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNAscope+for+in+situ+detection+of+transcriptionally+active+human+papillomavirus+in+head+and+neck+squamous+cell+carcinoma.">RNAscope for in situ detection of transcriptionally active human papillomavirus in head and neck squamous cell carcinoma.</a> J Vis E. , (2014).</li><li>Gage, G. J., Kipke, D. R., Shain, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Whole+animal+perfusion+fixation+for+rodents.">Whole animal perfusion fixation for rodents.</a> J Vis E. , (2012).</li><li>Mishra, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+pericytes+and+capillary+diameter+in+brain+slices+and+isolated+retinae.">Imaging pericytes and capillary diameter in brain slices and isolated retinae.</a> Nat Proto. 9, 323-336 (2014).</li><li>Shi, S. R., Cote, R. J., Taylor, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigen+retrieval+techniques:+current+perspectives.">Antigen retrieval techniques: current perspectives.</a> J Histochem Cytoche. 49, 931-937 (2001).</li><li>Qin, Y., Heine, V. M., Karst, H., Lucassen, P. J., Joels, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+expression+patterns+in+rat+dentate+granule+cells:+comparison+between+fresh+and+fixed+tissue.">Gene expression patterns in rat dentate granule cells: comparison between fresh and fixed tissue.</a> J Neurosci Method. 131, 205-211 (2003).</li><li>Carter, B. S., Fletcher, J. S., Thompson, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+messenger+RNA+expression+by+in+situ+hybridization+using+RNA+probes+synthesized+via+in+vitro+transcription.">Analysis of messenger RNA expression by in situ hybridization using RNA probes synthesized via in vitro transcription.</a> Method. 52, 322-331 (2010).</li><li>Mijnster, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regional+and+cellular+distribution+of+serotonin+5-hydroxytryptamine2a+receptor+mRNA+in+the+nucleus+accumbens,+olfactory+tubercle,+and+caudate+putamen+of+the+rat.">Regional and cellular distribution of serotonin 5-hydroxytryptamine2a receptor mRNA in the nucleus accumbens, olfactory tubercle, and caudate putamen of the rat.</a> J Comp Neuro. 389, 1-11 (1997).</li><li>Li, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brain+region-specific+alterations+of+5-HT2A+and+5-HT2C+receptors+in+serotonin+transporter+knockout+mice.">Brain region-specific alterations of 5-HT2A and 5-HT2C receptors in serotonin transporter knockout mice.</a> J Neuroche. 84, 1256-1265 (2003).</li><li>Horner, K. A., Gilbert, Y. E., Noble, E. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+regulation+of+5-HT2A+receptor+mRNA+expression+following+withdrawal+from+a+chronic+escalating+dose+regimen+of+D-amphetamine.">Differential regulation of 5-HT2A receptor mRNA expression following withdrawal from a chronic escalating dose regimen of D-amphetamine.</a> Brain Re. 1390, 10-20 (2011).</li><li>Mocci, G., Jimenez-Sanchez, L., Adell, A., Cortes, R., Artigas, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+5-HT2A+receptors+in+prefrontal+cortex+pyramidal+neurons+projecting+to+nucleus+accumbens.+Potential+relevance+for+atypical+antipsychotic+action.">Expression of 5-HT2A receptors in prefrontal cortex pyramidal neurons projecting to nucleus accumbens. Potential relevance for atypical antipsychotic action.</a> Neuropharmacolog. 79, 49-58 (2014).</li><li>Reneman, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+acute+and+chronic+effects+of+MDMA+('Ecstasy')+on+cortical+5-HT2A+receptors+in+rat+and+human.">The acute and chronic effects of MDMA ('Ecstasy') on cortical 5-HT2A receptors in rat and human.</a> 26, 387-396 (2002).</li></ol>

Yazarlar hiçbir rakip mali çıkarlarını var olduğunu beyan ederiz.

One of the major concerns of in situ hybridization test is to choose appropriate techniques used for RNA preservation because of RNase enzymes. It is well known that these enzymes are widely present in the cells and environment which can affect the results. However, enzyme activity can be quickly distinguished by placing the tissue in the dry ice/alcohol solution5,12. Although quick preservation is critical for hybridization using a riboprobe13, little is known about experimental conditions...

Serotonin (5-hydroxytryptamine; 5-HT) syndrome is an acute neurologic disorder caused by 5-HT-promoting drugs such as antidepressants1, while also occurring in situations of MDMA use for recreational purposes2. Molecular mechanisms responsible for mood swings, learning and memory deficits that occur in association with the acute syndrome are not well understood3,4. In situ hybridization is a powerful research tool allowing the detection and quantification of specific mRNAs expressed potentially at a single-cell level. The conventional way to perform in situ hybridization is to utilize a radioactive-labeled riboprobe that specifically hybridizes the gene of interest. However, a major drawback is that the method requires complicated and time-consuming probe preparation and hybridization steps, as well as access to fresh frozen tissues maintained in an RNase-free environment5,6. 
Oligonucleotide probes have been recently developed to hybridize shorter RNA fragments than those required for riboprobes7. Furthermore, the probes produce a low background signal without sacrificing specificity8. This newly-developed probe technology can be used in situ hybridization on paraformaldehyde-prefixed brain tissues commonly available in immunocytochemical laboratories.
Here, we describe a protocol for in situ hybridization using oligonucleotide probes on paraformaldehyde-prefixed rat brain and compare findings with those noted in a fresh frozen brain5,6. This protocol is used to test the hypothesis that MDMA substance abuse causes changes in 5-HT2A receptor gene htr2a mRNA in the brain. We began the procedure with MDMA treatment followed by paraformaldehyde tissue perfusion of the animal, in situ hybridization of the thr2a probe, and data analysis. Note that dapB (the bacterial gene coding for dihydrodipicolinate reductase) is used as a negative control, and ppiB (housekeeping gene coding for peptidylprolyl isomerase B) as a positive control.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="873">
	<tbody>
		<tr>
			<td>RNAscope Negative Control Probe-DapB</td>
			<td>Advanced cell diagnostic, INC</td>
			<td>310098</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope Pretreat 4</td>
			<td>Advanced cell diagnostic, INC</td>
			<td>320046</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope 2.0 HD Reagent Kit - Red</td>
			<td>Advanced cell diagnostic, INC</td>
			<td>310036</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAscope Probe - Rn-Ppib</td>
			<td>Advanced cell diagnostic, INC</td>
			<td>313921</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rat Htr2a</td>
			<td>Advanced cell diagnostic, INC</td>
			<td>300031</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cryostat</td>
			<td>Leica</td>
			<td>CM 1850</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Horizontal shaker</td>
			<td>VWR</td>
			<td>88032-088</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hybridization oven</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>222000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Superfrost Plus microscope slide</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-550-15</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrophobic pen</td>
			<td>Vector</td>
			<td>H-4000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>Provis AX70</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

rapid in situ hybridization using oligonucleotide probes on paraformaldehyde-prefixed brain of rats with serotonin syndrome

3,4-Methylenedioxymethamphetamine (MDMA; ecstasy) toxicity may cause region-specific changes in serotonergic mRNA expression due to acute serotonin (5-hydroxytryptamine; 5-HT) syndrome. This hypothesis can be tested using in situ hybridization to detect the serotonin 5-HT2A receptor gene htr2a. In the past, such procedures, utilizing radioactive riboprobe, were difficult because of the complicated workflow that needs several days to perform and the added difficulty that the technique required the use of fresh frozen tissues maintained in an RNase-free environment. Recently, the development of short oligonucleotide probes has simplified in situ hybridization procedures and allowed the use of paraformaldehyde-prefixed brain sections, which are more widely available in laboratories. Here, we describe a detailed protocol using non-radioactive oligonucleotide probes on the prefixed brain tissues. Hybridization probes used for this study include dapB (a bacterial gene coding for dihydrodipicolinate reductase), ppiB (a housekeeping gene coding for peptidylprolyl isomerase B), and htr2a (a serotonin gene coding for 5-HT2A receptors). This method is relatively simply, cheap, reproducible and requires less than two days to complete.

Oligonükleotid RNA sondaları (&lt;25 nt) kullanılarak, hibridizasyon paraformaldehit önekli ve taze dondurulmuş beyinlerinden hazırlanan hipotalamik hücrelerde kırmızı noktalar halinde tespit edilebilir. Htr2a mRNA molekülleri (bir katı oklar ile gösterilmektedir), bazı hücrelerde mevcut olan, ancak diğerleri (açık oklar) görülmektedir. Biz paraformaldehıt-öneki ve taze donmuş dokular (Şekil 1) arasında hiçbir fark olmadığını gözlemledik. Başarılı bir melezleş...

Watch this Scientific Journal Video about Rapid In Situ Hybridization using Oligonucleotide Probes on Paraformaldehyde-prefixed Brain of Rats with Serotonin Syndrome at JoVE.com

Rapid In Situ Hybridization using Oligonucleotide Probes on Paraformaldehyde-prefixed Brain of Rats with Serotonin Syndrome

This protocol describes a rapid and simplified in situ hybridization method ideal forparaformaldehyde-prefixed brain, thus reducing the need for prolonged complex steps while using fresh frozen tissues. The method is validated using the identification of the serotonin 5-HT2A receptor gene htr2a in rats.

Çabuk<em&gt; In Situ</emSerotonin Sendromu ile Ratlarda Paraformaldehyde-öneki Beyin oligonükleotid Problar kullanarak&gt; Melezleme

3,4-Methylenedioxymethamphetamine (MDMA; ecstasy) toxicity may cause region-specific changes in serotonergic mRNA expression due to acute serotonin ...

rapid-situ-hybridization-using-oligonucleotide-probes-on

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Rapid In Situ Hybridization using Oligonucleotide Probes on Paraformaldehyde-prefixed Brain of Rats with Serotonin Syndrome

8.8K Görüntüleme.  Ross University School of Veterinary Medicine. This protocol describes a rapid and simplified in situ hybridization method ideal forparaformaldehyde-prefixed brain, thus reducing the need for prolonged complex steps while using fresh frozen tissues. The method is validated using the identification of the serotonin 5-HT2A receptor gene htr2a in rats.