Kardiyovasküler Hastalıklarla Bağlantılı Varyasyon Modellerini ve Moleküler Süreçleri Ortaya Çıkarmak için Denetimsiz Çoklu Oksijen Faktör Analizinin Uygulanması

İş akışımız, farklı çözünürlüklerdeki karmaşık multi-omik veri kümelerini kolayca analiz etmeyi mümkün kılar. Yaklaşım, benzersiz olan veya belirli veri türleriyle paylaşılan ana varyant desenlerini ayıklar ve bunları toplar. Ortaya çıkan sözde faktörler daha sonra moleküler süreçlere ve klinik veya teknik ortak değişkenlere bağlanabilir.

Analizimiz, MOFA modelini birden fazla numunenin çoklu omik ve tek hücreli verilerine uygulayan ilk kişiler arasındaydı. Daha da önemlisi, bu örnekler kalp krizi geçiren hastalardan oluşan bir klinik kohorttan geliyordu. Bu, sonuç ve hastalık durumu ile ilişkili çok hücreli bağışıklık imzalarını tanımlamamıza izin verdi.

Bu nedenle, tek hücreli ve multi-omik veri setlerinin kullanılabilirliği artar, ancak çoğu zaman bu veri setlerinin özellikleri yalnızca ayrı ayrı analiz edilir. Bu, içgörüleri sınırlar, çünkü genellikle biyolojik süreçler, birden fazla özellik ve hücre tipi arasındaki etkileşimlerin sonucudur. Protokollerimizle, kullanıcılar tüm veri kümesinin entegre bir analizini kolayca gerçekleştirebilir ve bu çok hücreli programları tanımlayabilir.

Bu protokolün ek multi-omik veri setlerine uygulanmasının diğer hastalıklar veya bağlamlar hakkında yeni bilgiler üreteceğini düşünüyoruz. Bu bilgiler daha sonra gelecekteki biyobelirteç veya terapötik çalışmaları bilgilendirecektir.