الأيزوميرات هي مركبات،تتشابه في صيغتها الجزيئية لكنها تختلف في ترتيبها الهيكلي. يمتاز كل أيزومير بخواص فيزيائية وكيميائية مختلفة. في المركبات التناسقية،من أنواع الأيزومير الملاحظة،الأيزومير الهيكلي.

في الأيزومير الهيكلي،الاتصالية بين الذرات والذرة المركزية الفلزية،تختلف،رغم التشابه في الصيغة الجزيئية. يمكن تصنيفها اكثر إلى:أيزومير مجال-تناسقي،وأيزومير ترابطي. يحدث أيزومير المجال-التناسقي،عندما تبدأ،الربيطة التناسقة مع الفلز المركزي في المجال التناسقي،تبادل الأماكن،مع الأيون المقابل في الشبكية.

بالتالي بينما يبقى الرقم التناسقي للأيون الفلزي ثابتًا،يتغير تركيب كل من،المجال التناسقي،و المركب. في مركب الكوبالت التناسقي،ثمة إمكانية لحدوث أيزوميرين من نوع المجال التناسقي،تكون فيهما الربيطة من البروم أو الكلور. بما أن تركيب المركب مختلف،فإن لكل من هذين الأيزوميرين خواصّكيميائية مختلفة.

عند إذابة كلوريد البنتاأمينبروموكوبالت(II)في الماء،فإنه يولّد أيونات كلوريد،بينما بروميد البنتاأمينكلوروكوبالت(II)يولّد أيونات البروميد في المحلول. في المقابل،يحدث أيزومير الترابط،عندما تستطيع ربيطة أن تتناسق مع الذرة الفلزية المركزية،بتوجهين مختلفين. بالتالي فإن الربيطة أحادية السن،التي تحتوي على أكثر من ذرة مانحة،تكون قادرة على تشكيل أيزومير ترابطي.

يتغير اسم الربيطة وفقًا للذرة المانحة التي تتناسق مع الأيون الفلزي،أيون النترات يحتوي فقط على زوجين من زوج إلكترونات وحيد،أحدهما على ذرة النيتروجين والآخر على ذرة الأكسجين. يستطيع أي منهما تشكيل رابطة تساهمية تناسقية مع الأيون الفلزي المركزي. عندما يتناسق أيون النترات عبر زوج الإلكترونات الوحيدة على ذرة النيتروجين،يُعرف ذلك بربيطة نايترو.

عندما تؤدي ذرة الأكسجين دور الذرة المانحة،يُعرف ذلك باسم ربيطة نتريتية. المركبات التناسقية من الكوبالت الفلزي وأيونات النترات،لديها احتمالين لتكوين أيزومير ترابطي،بنتاأميننيتروكوبالت(III)أصفر اللون،وبنتاأميننيتريتوكوبالت(III)برتقالي اللون.