A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
وصفنا إجراءات لوضع العلامات والتنميط الجيني الفئران حديثي الولادة وتوليد الثقافات العصبية الأولية منها. والتنميط الجيني هو سريع وفعال وموثوق بها، ويسمح لاستخراج-نوكليك حمض الآلي. وهذا مفيد خصوصا بالنسبة للفئران المميتة neonatally وثقافاتهم التي تتطلب استكمال مسبق من التنميط الجيني.
وغالبا ما يتطلب تحليل عالية الدقة من التشكل وظيفة الخلايا العصبية الثدييات والتنميط الجيني للحيوانات الفردية تليها تحليل الثقافات الأولية من الخلايا العصبية. نحن تصف مجموعة من الإجراءات ل: وصفها الفئران حديثي الولادة ليتم مرمزة، التنميط الجيني السريع، وإنشاء الثقافات منخفض الكثافة من الخلايا العصبية في الدماغ من هذه الفئران. وصفت الفئران الفردية عن طريق الوشم، والذي يسمح لتحديد المدى الطويل الأمد في مرحلة البلوغ. التنميط الجيني بواسطة بروتوكول وصف سريع وفعال، ويسمح لاستخراج الآلي للحامض النووي مع موثوقية جيدة. وهذا مفيد في ظل الظروف التي تكون فيها الوقت الكافي للالتنميط الجيني التقليدي غير متوفر، على سبيل المثال، في الفئران التي تعاني من الفتك حديثي الولادة. يتم إنشاؤها الثقافات العصبية الأولية في منخفض الكثافة، والتي تمكن تجارب التصوير في قرار مكانية عالية. تتطلب هذه الطريقة ثقافة إعداد طبقات المغذية الدبقية قبل طلاء الخلايا العصبية. عيتم تطبيق rotocol في مجملها إلى نموذج الفأر من خلل التوتر اضطراب حركة DYT1 (ΔE-torsinA الضربة القاضية في الفئران)، ويتم إعداد الثقافات العصبية من الحصين، القشرة الدماغية والجسم المخطط من هذه الفئران. ويمكن تطبيق هذا البروتوكول على الفئران مع طفرات وراثية أخرى، وكذلك للحيوانات من الأنواع الأخرى. وعلاوة على ذلك، والمكونات الفردية للبروتوكول يمكن استخدامها لعزل المشاريع الفرعية. وبالتالي هذا البروتوكول سيكون لها تطبيقات واسعة، ليس فقط في علم الأعصاب ولكن أيضا في مجالات أخرى من مجالات العلوم البيولوجية والطبية.
وقد أثبتت نماذج القوارض من الأمراض الوراثية مفيدة في إنشاء الوظائف الفسيولوجية للبروتينات طبيعية والأحماض النووية، وكذلك العواقب المرضية من العيوب في هذه. وتشمل الأمثلة الفئران ناقص لالبروتينات المشاركة في الوظائف الخلوية الرئيسية، وكذلك نماذج الماوس من الاضطرابات مثل مرض الزهايمر. ومع ذلك، يمكن بعض التلاعب الجيني يؤدي إلى الفتك حديثي الولادة بفترة وجيزة أو بعد بضعة أيام من الولادة. في هذه الحالات، والثقافات الخلية الأولية هي أداة مهمة لخلايا حية يمكن الحصول عليها من الجراء الجنينية أو حديثي الولادة قبل الموت، فإنها يمكن أن يستمر على الأقل لبضعة أسابيع في المختبر، وخلال هذا الوقت اللازم لتطوير الخلايا العصبية في وقت مبكر يمكن أن يتبعه الكيمياء الحيوية والوظيفية والمورفولوجية التجارب. لالثقافات الأولية، يمكن أن يكون مفيدا لوحة الخلايا العصبية في منخفض الكثافة. هذا يجعل من الممكن تصور somata الفردي، التشعبات، ومهاوي محور عصبي وtermi العصبيةالاشارات في قرار مكانية عالية. ومع ذلك، فإن البقاء على قيد الحياة والتفريق بين الخلايا العصبية في منخفض الكثافة عادة ما يتطلب أنهم مطلي على طبقة المغذية الدبقية، وشارك في تربيتها مع الخلايا الدبقية في غياب الاتصال الجسدي معهم، أو مثقف في المتوسط مشروطة الدبقية 1.
يمكن إنشاء منخفض الكثافة الثقافات العصبية على طبقات المغذية الدبقية أن يعتمد على التنميط الجيني سريعة وموثوق بها مسبقا - في غضون بضع ساعة وعلى النقيض من بضعة أيام. السرعة هي أهمية خاصة عندما يحتاج النمط الجيني الخلايا العصبية لتكون مطابقة لتلك التي من طبقة المغذية الدبقية أعدت مسبقا. وكمثال عملي أكثر، قد يكون من الضروري أن تقرر أي الجراء منها الوراثي لاستخدامها في توليد الثقافات، لتحسين كفاءة تجربة.
نحن هنا لشرح بروتوكول العمل التي استخدمت لسرعة، مبسط وموثوق بها الماوس التنميط الجيني في المنشورات السابقة 2-6. ذيول الماوس ووتستخدم مجموعة المتاحة تجاريا. ويشمل هذا البروتوكول خطوة واحدة استخراج الأحماض النووية من الأنسجة، ويتطلب يست تنقية خطوة نوكليك حمض ولا استخدام منطقة عازلة إنهاء ('وقف الحل'). ويتضح موثوقية هذه الطريقة التنميط الجيني من خلال تقديم نتائج سلسلة من الاختبارات عندما يتم إدخال الخلافات مع الاحترام لكمية بدءا من العينات، وعمر الحيوانات وطول amplicons PCR. هذه المجموعة تقدم مزايا استخراج الآلي والموثوقية.
من أجل أن تكون شاملة، ويتجلى أيضا استخدام الوشم لتحديد المدى الطويل من الفئران مرمزة. ويتحقق من خلال تطبيق الوشم الحبر الوشم إلى الأدمة من الجلد (تحت البشرة) 7. ووصف إجراءات الوشم منصات مخلب من الفئران حديثي الولادة أو 1 يوم القديمة، على الرغم من أن الوشم يمكن تطبيقها على أجزاء أخرى من الجسم، مثل ذيول وأصابع القدمين، وأنيمالمرض من جميع الأعمار. وبالإضافة إلى ذلك، سيتم عرض إجراءات الطلاء وزراعة الخلايا العصبية الماوس في مناطق ذات كثافة منخفضة، استنادا إلى إعداد الأمثل من أنواع مختلفة من طبقات المغذية الدبقية 2،8.
نحن نستخدم نموذج الجيني الماوس للالموروثة اضطراب عصبي DYT1 خلل التوتر - اضطراب حركة جسمية مهيمنة الناجمة عن طفرة في الجين TOR1A (c.904_906delGAG / c.907_909delGAG، p.Glu302del / p.Glu303del) 9. البروتين المشفرة، torsinA، ينتمي إلى "ATPases المرتبطة بأنشطة متنوعة الخلوية" (AAA +) عائلة من البروتينات، التي عموما على أداء مهام مثل كوصي، والمساعدة في الأعضاء: البروتين تتكشف، البروتين معقدة التفكيك، والاتجار الغشاء، والانصهار الحويصلة 10-13. نتائج طفرة في الحذف في إطار كودون لحمض الجلوتاميك، ويمكن أن يؤدي إلى مظهر من مظاهر "المبكر بداية المعمم خلل التوتر معزولة" 14،15. ومع ذلك، فإن مسارآليات ophysiological المسؤولة عن هذا الاضطراب لا تزال غير مفهومة تماما. في نموذج الفأر المغلوب في، أليل متحولة هو Tor1a tm2Wtd، المذكورة فيما بعد باسم Tor1a ΔE. متخالف ΔE-torsinA الضربة القاضية في الفئران هي المرضى من البشر قابلة للحياة وتقليد وراثيا مع DYT1 خلل التوتر، في حين متماثلة اللواقح الضربة القاضية في الفئران تموت بعد الولادة 16،17، مع الكمون حتى الموت بعد الولادة تتأثر الخلفية الوراثية 18. الوفاة المبكرة لمتماثل الفئران الضربة القاضية في يقتضي أن كلا من التنميط الجيني للحيوانات وإنشاء الثقافات العصبية يتم الانتهاء بسرعة. وكمثال آخر على التنميط الجيني، Tfap2a (عامل النسخ AP-2α، وتفعيل محسن البروتين 2α ملزمة) وسوف تستخدم. البروتين المشفرة بواسطة هذا الجين مهم في تنظيم العمليات الخلوية متعددة، مثل انتشار، والتمايز والبقاء وموت الخلايا المبرمج 19.
ملاحظة: تمت الموافقة على جميع الإجراءات الحيوان أجريت في هذه الدراسة من قبل لجنة رعاية واستخدام الحيوان المؤسسي من جامعة ولاية ايوا.
1. تحديد المدى الطويل من الفئران عن طريق الوشم على وسادات باو
2. الفئران انماط الوليد باستخدام PCR التنميط الجيني السريع كيت
3. الثقافة الابتدائية من الفأر الدماغ العصبيةالصورة على الدبقية طبقة الطاعم
ملاحظة: إجراءات تشريح الدماغ والتفكك الخلية (3.1) هي مشتركة بين جميع الإجراءات اللاحقة. يتم وصف إجراءات الثقافات الماوس الدبقية (3.2)، والثقافات الدبقية الفئران (3.3)، والماوس الثقافات العصبية (3.4) بشكل منفصل بعد ذلك.
كمثال لتطبيق هذا البروتوكول، وتظهر نتائج ممثلة لوصفها الفئران عن طريق الوشم، والتنميط الجيني يمكن الاعتماد عليها تحت ظروف تجريبية مختلفة، وإنشاء الثقافات العصبية الأولية على طبقات المغذية الدبقية.
الوشم
بروتوكول المعروضة هنا يشمل إجراءات الوشم لتسمية / تحديد الفئران، لالتنميط الجيني الفئران من نصائح الذيل، وزراعة الخلايا العصبية مخ الفأر في منخفض الكثافة. في جولة واحدة من التجارب باستخدام 6-8 الجراء، وعادة ما تتطلب هذه الإجراءات ~ 0.5 ساعة، ~ 4 ساعة و ~ 2 ساعة، على التوال...
The author (Zhengmin Huang) is the president of EZ BioResearch LLC that produces reagents described in this article.
The authors thank researchers at the University of Iowa, Drs. Luis Tecedor, Ines Martins and Beverly Davidson for instructions and helpful comments regarding striatal cultures, and Drs. Kara Gordon, Nicole Bode and Pedro Gonzalez-Alegre for genotyping assistance and discussions. We also thank Dr. Eric Weyand (Animal Identification and Marking Systems) for helpful comments regarding tattooing, and Dr. Shutaro Katsurabayashi (Fukuoka University) for helpful comments regarding the mouse culture. This work was supported by grants from the American Heart Association, the Department of Defense (Peer Reviewed Medical Research Program award W81XWH-14-1-0301), the Dystonia Medical Research Foundation, the Edward Mallinckrodt, Jr. Foundation, the National Science Foundation, and the Whitehall Foundation (N.C.H.).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
REAGENTS - tattooing | |||
Machine Cleanser | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NMCR3 | This is used to clean the needles and the holder after tattooing. |
Machine Drying Agent | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NDAR4 | This is used to dry the needles and holder after cleaning. |
Neonate Tattoo Black Pigment | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NBP01 | |
Skin Prep Applicator | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NSPA1 | Q-tip. |
Skin Prep solution | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NSP01 | This reagent delivers a thin layer of oil that enhances the efficiency of tattooing and prevents tattoo fading, by (information from vendor): 1) preventing non-tattooed skin from being stained temporarily, thereby allowing the quality of a paw pad tattoo to be easily evaluated before the pup is returned to its home cage – the stained skin surface can be confused with the tattooed skin, 2) reducing skin damage during tattooing – softening the skin and lubricating the needle will help the needle penetrate the skin without causing skin damage, and 3) preventing molecular oxygen from entering the skin, thereby reducing inflammatory responses to reactive oxygen species that can be generated. |
REAGENTS - genotyping | |||
EZ Fast Tissue/Tail PCR Genotyping Kit (Strip Tube Format) | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | |
2X PCR Ready Mix II | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | A red, loading dye for electrophoresis is included in the 2X PCR Ready Mix solution. |
Tissue Lysis Solution A | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Prepare DNA Extraction Solution by mixing 20 µl of Tissue Lysis Solution A and 180 µl of Tissue Lysis Solution B per specimen. |
Tissue Lysis Solution B | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Prepare DNA Extraction Solution by mixing 20 µl of Tissue Lysis Solution A and 180 µl of Tissue Lysis Solution B per specimen. |
Acetic acid, glacial | VWR | BDH 3092 | |
Agarose optimized grade, molecular biology grade | rpi | A20090-500 | We use 2% agarose gels in TAE buffer containing the SYBR Safe DNA gel stain (diluted 10,000-fold) or ethidium bromide (0.5 µg/ml gel volume). |
Ethidium bromide | Sigma-Aldrich | E7637-1G | |
Ethylenediamine tetraacetic acid, disodium salt dihydrate (EDTA) | Fisher | BP120-500 | |
Filtered Pipet Tips, Aerosol-Free, 0.1-10 µl | Dot Scientific Inc | UG104-96RS | Use pipette tips that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. For all steps involving DNA, use filtered pipette tips to avoid cross-contamination. |
Filtered Pipet Tips, Premium Fit Filter Tips, 0.5-20 µl | Dot Scientific Inc | UG2020-RS | Use pipette tips that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. For all steps involving DNA, use filtered pipette tips to avoid cross-contamination. |
Filtered Pipet Tips, Premium Fit Filter Tips, 1-200 µl | Dot Scientific Inc | UG2812-RS | Use pipette tips that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. For all steps involving DNA, use filtered pipette tips to avoid cross-contamination. |
Molecular weight marker, EZ DNA Even Ladders 100 bp | EZ BioResearch LLC | L1001 | We use either of these three molecular weight markers. |
Molecular weight marker, EZ DNA Even Ladders 1000 bp | EZ BioResearch LLC | L1010 | |
Molecular weight marker, TrackIt, 100 bp DNA Ladder | GIBCO-Invitrogen | 10488-058 | |
PCR tubes, 8-tube strips with individually attached dome top caps, natural, 0.2 ml | USA Scientific | 1402-2900 | Use tubes that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. An 8-tube strip is easy to handle and to group the specimens than individual tubes. |
PCR tubes, Ultraflux Individual | rpi | 145660 | Use tubes that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. |
Seal-Rite 0.5 ml microcentrifuge tube, natural | USA Scientific | 1605-0000 | Use tubes that are sterile and free of DNA, RNase and DNase. |
SYBR Safe DNA gel stain * 10,000x concentration in DMSO | GIBCO-Invitrogen | S33102 | |
Tris base | rpi | T60040-1000 | |
Primers for amplifying Tor1a gene in ΔE-torsinA knock-in mice | 5'-AGT CTG TGG CTG GCT CTC CC-3' (forward) and 5'-CCT CAG GCT GCT CAC AAC CAC-3' (reverse) (reference 18). These primers were used at a final concentration of 1.0 ng/µl (~0.16 µM) (reference 2). | ||
Primers for amplifying Tfap2a gene in wild-type mice | 5'-GAA AGG TGT AGG CAG AAG TTT GTC AGG GC-3' (forward), 5'-CGT GTG GCT GTT GGG GTT GTT GCT GAG GTA-3' (reverse) for the 498-bp amplicon, 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (forward), 5'-AGA CAC TCG GGC TTT GGA GAT CAT TC-3' (reverse) for the 983-bp amplicon, and 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (forward), 5'-ACA GTG TAG TAA GGC AAA GCA AGG AG-3' (reverse) for the 1990-bp amplicon. These primers are used at 0.5 µM. | ||
REAGENTS - cell culture | |||
5-Fluoro-2′-deoxyuridine | Sigma-Aldrich | F0503-100MG | See comments section of uridine for more information. |
B-27 supplement | GIBCO-Invitrogen | 17504-044 | |
Cell Culture Dishes 35 x 10 mm Dishes, Tissue Culture-treated | BD falcon | 353001 | |
Cell Culture Flasks, T25, Tissue Culture-treated, Canted-neck, plug-seal cap, 25 cm2 Growth Area, 70 ml | BD falcon | 353082 | |
Cell Culture Flasks, T75, Tissue Culture-treated, Canted-neck, vented cap, 75 cm2 Growth Area, 250 ml | BD falcon | 353136 | |
Conical Tube, polypropylene, 15 ml | BD falcon | 352095 | |
Countess (cell number counter) chamber slides | GIBCO-Invitrogen | C10312 | |
Cytosine β-D-Arabinofuranoside hydrochloride (Ara-C hydrochloride) | Sigma-Aldrich | C6645-100mg | |
D-(+)-Glucose (Dextrose) anhydrous, SigmaUltra, 99.5% (GC) | Sigma-Aldrich | G7528-250G | |
Dish, Petri glass 100 x 15 mm | Pyrex | 3160-101 | |
Distilled water | GIBCO-Invitrogen | 15230-147 | |
DNase Type II | Sigma-Aldrich | D4527-200KU | Stock solution is prepared at 1,500 units/20 μl = 75,000 units/ml in distilled water. |
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), high glucose, GlutaMAX, pyruvate | GIBCO-Invitrogen | 10569-010, 500 ml | |
Fast PES Filter Unit, 250 ml, 50 mm diameter membrane, 0.2 µm Pore Size | Nalgene | 568-0020 | |
Fast PES Filter Unit, 500 ml, 90 mm diameter membrane, 0.2 µm Pore Size | Nalgene | 569-0020 | |
Fetal bovine serum (FBS) | GIBCO-Invitrogen | 26140-079 | |
Glass coverslip, 12 mm Round, thickness 0.09–0.12 mm, No. 0 | Carolina | 633017 | |
GlutaMAX-I | GIBCO-Invitrogen | 35050-061 | |
Hanks' Balanced Salts | Sigma-Aldrich | H2387-10X | |
HEPES, ≥99.5% (titration) | Sigma-Aldrich | H3375-250G | |
Hydrochloric acid, 37%, A.C.S reagent | Sigma-Aldrich | 258148-100 ML | |
Insulin | Sigma-Aldrich | I5500-250 mg | |
Magnesium sulfate heptahydrate, MgSO4•(7H2O), BioUltra, ≥99.5% (Fluka) | Sigma-Aldrich | 63138-250G | |
Matrigel Basement Membrane Matrix solution, Phenol Red-Free | BD Biosciences | 356237 | This is the coating material for coverslips and flasks. 1) To prepare it, thaw the Matrigel Basement Membrane Matrix solution on ice, which usually takes ~1 day. Using a pre-cooled pipette, aliquot the thawed solution into pre-cooled T25 flasks on ice, and store the flasks at -20 °C. To prepare the working Matrigel solution, thaw the aliquotted Matrigel in a flask on ice, dilute 50-fold by adding pre-cooled MEM solution and keep the diluted solution at 4 °C. It is important to pre-cool all cultureware and media that come into contact with Matrigel, except during and after the coating of coverslips, to prevent it from prematurely forming a gel. 2) To coat the glass coverslips or culture flasks with Matrigel, apply the Matrigel solution to the surface. Before plating cells, it is important to completely dry up the surface. For this purpose, it might be helpful to aspirate Matrigel during the cellular centrifugation immediately before plating the cells and to allow enough time for drying. |
Minimum Essential Medium (MEM) | GIBCO-Invitrogen | 51200-038 | |
MITO+ Serum Extender, 5 ml | BD Biosciences | 355006 | |
Multiwell Plates, Tissue Culture-treated 24-well plate | BD falcon | 353047 | |
Multiwell Plates, Tissue Culture-treated 6-well plate | BD falcon | 353046 | |
Neurobasal-A Medium (1X), liquid | GIBCO-Invitrogen | 10888-022 | |
Nitric Acid | VWR | bdh 3044 | |
NS (Neuronal Supplement) 21 | prepared in the lab | Source: reference 69 | |
Pasteur pipets, 5 ¾” | Fisher | 13-678-6A | Use this cotton-plugged 5 ¾” Pasteur pipette for cellular trituration. Fire-polish the tip beforehand to smooth the cut surface and to reduce the internal diameter to 50-80% of the original. Too small a tip will disrupt the cells and reduce cell viability, but too large a tip will decrease the efficiency of trituration. |
Pasteur pipets, 9” | Fisher | 13-678-6B | |
Potassium chloride (KCl), SigmaUltra, ≥99.0% | Sigma-Aldrich | P9333-500G | |
Serological pipet, 2 ml | BD falcon | 357507 | |
Serological pipet, 5 ml | BD falcon | 357543 | |
Serological pipet, 10 ml | BD falcon | 357551 | |
Serological pipet, 25 ml | BD falcon | 357525 | |
Serological pipet, 50 ml | BD falcon | 357550 | |
Sodium bicarbonate (NaHCO3, Sodium hydrogen carbonate), SigmaUltra, ≥99.5% | Sigma-Aldrich | S6297-250G | |
Sodium chloride (NaCl), SigmaUltra, ≥99.5% | Sigma-Aldrich | S7653-250G | |
Sodium hydroxide (NaOH), pellets, 99.998% trace metals basis | Sigma-Aldrich | 480878-250G | |
Sodium phosphate dibasic heptahydrate (Na2HPO4•(7H2O)), ≥99.99%, Aldrich | Sigma-Aldrich | 431478-250G | |
Sucrose, SigmaUltra, ≥99.5% (GC) | Sigma-Aldrich | S7903-250G | |
Syringe filter, sterile, 0.2 µm | Corning | 431219 | |
Syringe, 3 ml | BD falcon | 309585 | |
Transferrin, Holo, bovine plasma | Calbiochem | 616420 | |
Trypan Blue stain, 0.4% | GIBCO-Invitrogen | T10282 | This is used for counting live/dead cells. Renew an old trypan blue solution if it is re-used many times (e.g. several times a week for several weeks), because it will form precipitates and result in erroneous readouts of cellular density. |
Trypsin, type XI | Sigma-Aldrich | T1005-5G | |
Trypsin-EDTA solution, 0.25% | GIBCO-Invitrogen | 25200-056 | |
Uridine | Sigma-Aldrich | U3003-5G | Stock solution is prepared at 50-mg 5-fluoro-2'-deoxyuridine and 125 mg uridine in 25 ml DMEM (8.12 and 20.48 mM, respectively). |
REAGENTS - immunocytochemistry | |||
Antibody, rabbit polyclonal anti-MAP2 | Merck Millipore | AB5622 | |
Antibody, mouse monoclonal anti-GFAP cocktail | Merck Millipore | NE1015 | |
EQUIPMENT - tattooing | |||
AIMS | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NEO–9 | This Neonate Rodent Tattooing System is an electric system that works by rapidly moving 1- or 3-point tattoo needles vertically into the skin. Activate the tattoo machine once for approximately 0.5 sec, while the tattoo needle tips are kept perpendicular to the skin surface. We prefer three-needle tattooing to maximize the tattooed area, but one-needle tattooing is effective on narrower areas, e.g. the toes, or if fine mechanical control is necessary, e.g. when numbers are tattooed. Two rounds of tattooing at the slowest speed (setting "1" out of 3 steps) are typically sufficient to produce a visible and long-lasting tattoo of the paw pads. |
EQUIPMENT - genotyping | |||
Electrophoresis system, horizontal, Wide Mini–Sub Cell GT | BIO–RAD | 170–4405 | Typical electrophoresis parameters are electrical field strength at 6 V/cm and 25 min duration for a 10 cm gel. |
FluorChem 8800 | ProteinSimple | FluorChem 8800 | |
PCR, MJ Mini Thermal Cycler | BIO-RAD | PTC-1148EDU | Our PCR reactions for the Tor1a gene in ΔE-torsinA knock-in mice are as follows: 1 cycle of denaturation at 94 °C for 3 min, 35 cycles of denaturation at 94 °C for 30 sec, annealing at 58 °C for 30 sec, extension at 72 °C for 2 min. This is followed by final extension at 72 °C for 10 min, and holding at 4 °C. |
Power supply, PowerPac Basic | BIO-RAD | 164-5050 | |
EQUIPMENT - cell culture | |||
Automated cell counter, Countess | GIBCO-Invitrogen | C10310 | This automated cell counter separately measures the densities of live and dead cells (non stained and stained by trypan blue, respectively). It is important to know the optimal range of density measurements: the counter that we use has the highest accuracy in the range from 1 x 105 to 4 x 106 cells/ml. If the measured cell density values fall outside the recommended range, adjust the resuspension volume appropriately. |
Biological Safety Cabinet, Class II, Type A2 | NUAIRE | NU-425-400 | This hood is used for all cell culture procedures, except for brain dissection. |
CO2 Incubator, AutoFlow, Humidity Control Water Jacket | NUAIRE | NU-4850 | |
Horizontal Clean Bench | NUAIRE | NU-201-330 | This clean bench is used for brain dissection (steps 3.1.1 and 3.1.2 of "Brain Dissection and Cellular Dissociation)". |
Orbit LS Low Speed Shaker | Labnet | S2030-LS-B | |
SORVALL RC-6 Plus Superspeed Centrifuge | Fisher | 46910 (centrifuge)/46922 (rotor) |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved