A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
تصف هذه الورقة رنا مفصلة وفعالة للغاية في بروتوكول التهجين الموضعي وخاصة بالنسبة لمستوى منخفض الجينات مستقبلات رائحة، فضلا عن الجينات الأخرى، في هوائيات الحشرات باستخدام ديجوكسيجينين (ديغ) - الملصقة أو تحقيقات المسمى البيوتين.
وقد طورت الحشرات أنظمة استقبال شمية متطورة لتشعر بإشارات كيميائية خارجية. يتم ترانزدوسد هذه الإشارات الكيميائية من قبل الخلايا العصبية مستقبلات الشمية (أورنز) الموجود في هياكل تشبه الشعر، ودعا تشيموسنسيلا، من الهوائيات. على الأغشية أورنس، ويعتقد أن مستقبلات أودورانت (أورس) أن تشارك في ترميز الرائحة. وبالتالي، فإن القدرة على تحديد الجينات المترجمة إلى أورن ضروري للاعتراف أو الجينات، ويوفر أساسا أساسيا لمزيد من الدراسات الوظيفية في الموقع . مستويات التعبير الحمض النووي الريبي من أور أور محددة في هوائيات الحشرات منخفضة جدا، والحفاظ على الأنسجة الحشرية للأنسجة هو التحدي. وبالتالي، فإنه من الصعب توطين أور إلى نوع معين من سنسيلا باستخدام الحمض النووي الريبي في التهجين الموضع . في هذه الورقة، يتم عرض رنا مفصلة وفعالة للغاية في بروتوكول التهجين الموضعي وخاصة بالنسبة منخفضة التعبير أو الجينات من الحشرات. بالإضافة إلى ذلك، أور محددة جين واs التي تم تحديدها عن طريق إجراء مزدوجة اللون الفلورسنت في الموقع التهجين التجارب باستخدام المشترك التعبير عن الجينات مستقبلات، أوركو ، كعلامة.
يتم تغطية هوائيات الحشرات، والتي هي أهم الأجهزة الحسية الكيميائية، مع العديد من الهياكل تشبه الشعر - دعا سنسيلا - التي يتم إدارتها من قبل الخلايا العصبية مستقبلات الشمية (أورنس). على غشاء أورنس الحشرات، يتم التعبير عن مستقبلات أودورانت (أورس)، وهو نوع من البروتين يحتوي على سبعة مجالات الغشاء، مع كورسيبتور (أوركو) لتشكيل هيتيرومر الذي يعمل كقناة أيون الرائحة بوابات 1 ، 2 ، 3 . استجابات مختلفة تستجيب لمجموعات مختلفة من المركبات الكيميائية 4 ، 5 ، 6 .
الجراد ( لوكستا ميغراتوريا ) تعتمد أساسا على العظة حاسة الشم لتحريك السلوكيات الهامة 7 . الجراد الصحراوي الجراد هي العوامل الرئيسية لفهم آليات الشمية الجزيئية. إضفاء الطابع المحلي على الجينات أو الجينات المحددة على الخلايا العصبيةنوع سينسيلوم محددة شكليا من قبل الحمض النووي الريبي في الموقع التهجين (رنا إيش) هو الخطوة الأولى في استكشاف وظيفة أورس.
يستخدم رنا إيش التحقيق المسمى الحمض النووي الريبي التكميلي لقياس وتوطين تسلسل الحمض النووي الريبي معين في قسم من الأنسجة والخلايا أو يتصاعد كله في الموقع ، وتوفير رؤى في العمليات الفسيولوجية والمرض المرضية. وقد استخدمت على نطاق واسع ديغوكيجينين المسمى (ديغ المسمى) وتحقيقات رنا البيوتين المسمى على نطاق واسع في التهجين الحمض النووي الريبي. يمكن إعداد رنا وضع العلامات مع ديغوكيجينين-11-أوتب أو البيوتين 16-أوتب عن طريق النسخ في المختبر مع SP6 و T7 رنا بوليميراز. DIG- والبيوتين المسمى الحمض النووي الريبي تحقيقات لها المزايا التالية: غير المشعة. آمنة؛ مستقرة. حساس للغاية؛ محددة للغاية؛ وسهلة لإنتاج باستخدام ير والنسخ في المختبر . DIG- وبيوتين المسمى رنا تحقيقات يمكن أن يكون الكروموجيني وكشف فلورزنتلي. يمكن الكشف عن تحقيقات رنا المسمى ديغ مع مكافحة ديغوكيجينين القلوين فوسفاتيز (أب) الأجسام المضادة -conjugated التي يمكن تصور إما مع ركائز تشيميلومينسنت حساسة للغاية نيتروبلو كلوريد تيترازوليوم / 5 برومو 4-كلورو 3-إندوليل الفوسفات الملح التولودين (نبت / بسيب) باستخدام المجهر الضوئي أو مع 2 -hydroxy-3-نفتوك أسيد-2'-فنيلانيليد الفوسفات (هنب) إلى جانب 4-كلورو-2-ميثيل بنزينزيونيوم نصف كلوريد الزنك الملح (سريع الأحمر) باستخدام المجهر متحد البؤر. يمكن الكشف عن تحقيقات رنا البيوتين المسمى مع مكافحة البيوتين ستريبتافيدين الفجل الحصان البيروكسيديز (هرب) الأجسام المضادة -conjugated التي يمكن تصور مع فلوريسئين-تيراميدس باستخدام المجهر متحد البؤر. وهكذا، يمكن أن يؤديها ثنائي اللون الفلورسنت في التهجين الموضعي للكشف عن اثنين من الجينات المستهدفة في شريحة واحدة باستخدام DIG- والبيوتين المسمى الحمض النووي الريبي تحقيقات.
وقد استخدمت إيش رنا مع DIG- و / أو تحقيقات البيوتين المسمى بنجاح لتوطين الجينات ذات الصلة حاسة الشم، مثل أور ، مستقبلات المؤلمة، بروتين ملزمة الرائحةوبروتين غشاء الخلايا العصبية الحسية، في هوائيات الحشرات، ولكن ليس على سبيل الحصر، ذبابة الفاكهة ميلانوغاستر ، الأنوفيلة غامبيا ، L. ميغراتوريا والجراد الصحراوي ششيستوسيرا غريغاريا 8 ، 9 ، 10 ، 11 ، 12 ، 13 ، 14 ، 15 ، 16 . ومع ذلك، هناك اثنين من التحديات الكبيرة عند تنفيذ إيش الحمض النووي الريبي ل أورس الحشرات: (1) أو الجينات (باستثناء أوركو ) وأعرب عن مستويات منخفضة وفقط في عدد قليل من الخلايا، مما يجعل الكشف عن إشارة صعبة للغاية، و (2) الحفاظ على الأنسجة الحشرات ل الأنسجة، بحيث يتم الحفاظ على التشكل والضجيج الخلفية منخفضة، يمكن أن يكون تحديا. في هذا البحث ورقة مفصلة وفعالة تصف إيش الحمض النووي الريبي لتوطين أو الجينات في الحشراتيتم عرض هوائيات، بما في ذلك كل من كروموجينيك وتيراميد إشارة التضخيم (تسا) الكشف.
ملاحظة: للحد من تدهور الحمض النووي الريبي، وإعداد الحلول باستخدام الماء المقطر تعقيمها الرطبة (عند 121 درجة مئوية لمدة 60 دقيقة) وأيضا مواد الأوتوكلاف الرطب.
1. إعداد الحمض النووي الريبي إيش التحسس والمسببات تحسس
2. إعداد أقسام البرد
3. تحديد الأقسام
4. التهجين
5. تلطيخ
6 - الملاحظة
مع الكشف الكروموجيني، تم تعيين مجموعة فرعية صغيرة من خلايا أنتينال في كل قسم أنتينال الكبار من قبل LmigOR1 ديغ المسمى و LmigOR2 تحقيقات مضادات ( الشكل 3 ). رنا إيش على أقسام متتالية لتوطين LmigOR1 و LmigOR2 أظهرت أن خلاي...
من الصعب إجراء رنا إيش لتوطين أو جينات في هوائيات الحشرات لأن مستويات التعبير من الجينات أور، باستثناء أوركو ، منخفضة جدا والحفاظ على شرائح نسيجية من هوائيات الحشرات من الصعب جدا. وبالإضافة إلى ذلك، كشف تسا هو أيضا صعبة جدا. ولمعالجة هذه المشاكل، ينبغي اتخاذ الت...
المؤلفين ليس لديهم ما يكشف أو أي تضارب المصالح الأخرى.
ويدعم هذا العمل من منحة من مؤسسة العلوم الطبيعية الوطنية في الصين (No.31472037). إن ذكر الأسماء التجارية أو المنتجات التجارية في هذه المقالة هو فقط لغرض تقديم معلومات محددة ولا يعني التوصية.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Materials | |||
2×TSINGKETM Master Mix | TSINGKE, China | TSE004 | |
RNase-free H2O | TIANGEN, China | RT121-02 | |
REGULAR AGAROSE G-10 | BIOWEST, SPAIN | 91622 | |
Binding buffer | TIANgel Midi Purification Kit, TIANGEN, China | DP209-02 | |
Balance buffer | TIANgel Midi Purification Kit, TIANGEN, China | DP209-02 | |
Wash solution | TIANgel Midi Purification Kit, TIANGEN, China | DP209-02 | |
T Vector | Promega, USA | A362A | |
T4 DNA Ligase | Promega, USA | M180A | |
Escherichia coli DH5α | TIANGEN, China | CB101 | |
Ampicillin | Sigma, USA | A-6140 | |
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside | Inalco, USA | 1758-1400 | |
5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside | SBS Genetech, China | GX1-500 | |
Nco I | BioLabs, New England | R0193S | |
Spe I | BioLabs, New England | R0133M | |
DIG RNA Labeling Kit | Roche, Switzerland | 11175025910 | |
Biotin RNA Labeling Kit | Roche, Switzerland | 11685597910 | |
DNase | DIG RNA Labeling Kit, Roche, Switzerland | 11175025910 | |
LiCl | Sinopharm, China | 10012718 | |
Ethanol | Sinopharm, China | 10009257 | |
Acetic acid | BEIJING CHEMICAL REGENTS COMPANY, China | 10000292 | |
Tissue-Tek O.C.T. Compound | Sakura Finetek Europe, Zoeterwoude, Netherlands | 4583 | |
Slides | TINA JIN HAO YANG BIOLOGCAL MANUFACTURE CO., LTE, China | FISH0010 | |
HCl | Sinopharm, China | 80070591 | |
Millex | Millipore, USA | SLGP033RS | |
Tween 20 | AMRESCO, USA | 0777-500ML | |
Nitroblue tetrazolium chloride / 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-phosphate toluidine salt | Roche, Switzerland | 11175041910 | |
Glycerol | Sinopharm, China | 10010618 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Solutions | |||
1×Tris-acetate-EDTA | Sigma, USA | V900483-1KG | 0.04mol/L Tris-Base |
1×Tris-acetate-EDTA | BEIJING CHEMICAL REGENTS COMPANY, China | 10000292 | 0.12%acetic acid |
1×Tris-acetate-EDTA | Sigma, USA | 03677 | Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt (EDTA) |
Luria-Bertani (LB) liquid medium | Sinopharm, China | 10019392 | 10g/L NaCl |
Luria-Bertani (LB) liquid medium | MERCK, Germany | VM335231 | 10g/L Peptone from casein (Tryptone) |
Luria-Bertani (LB) liquid medium | MERCK, Germany | VM361526 | 5g/L Yeast extract |
LB solid substrate plate | Sinopharm, China | 10019392 | 10g/L NaCl |
LB solid substrate plate | MERCK, Germany | VM335231 | 10g/L Peptone from casein (Tryptone) |
LB solid substrate plate | MERCK, Germany | VM361526 | 5g/L Yeast extract |
LB solid substrate plate | WISENT ING, Canada | 800-010-CG | 15g/L Agar Bacteriological Grade |
10×phosphate buffer saline (pH7.1) | Sinopharm, China | 10019392 | 8.5%NaCl |
10×phosphate buffer saline (pH7.1) | Sigma, USA | V900041-500G | 14mM KH2PO4 |
10×phosphate buffer saline (pH7.1) | Sigma, USA | V900268-500G | 80mM Na2HPO4 |
10×Tris buffered saline (pH7.5) | Sigma, USA | V900483-1KG | 1M Tris-Base |
10×Tris buffered saline (pH7.5) | Sinopharm, China | 10019392 | 1.5M NaCl |
Detection Buffer (DAP) chromogenic detection pH9.5 TSA detection pH8.0 | Sigma, USA | V900483-1KG | 100mM Tris-Base |
Detection Buffer (DAP) chromogenic detection pH9.5 TSA detection pH8.0 | Sinopharm, China | 10019392 | 100mM NaCl |
Detection Buffer (DAP) chromogenic detection pH9.5 TSA detection pH8.0 | Sigma, USA | V900020-500G | 50mM MgCl2·6H2O |
20×saline-sodium citrate (pH7.0) | Sinopharm, China | 10019392 | 3M NaCl |
20×saline-sodium citrate (pH7.0) | Sigma, USA | V900095-500G | 0.3M Na-Citrate |
4% paraformaldehyde solution (pH9.5) | Sigma, USA | V900894-100G | 4% paraformaldehyde |
4% paraformaldehyde solution (pH9.5) | Sigma, USA | V900182-500G | 0.1M NaHCO3 |
Sodium Carbonate Buffer (pH10.2) | Sigma, USA | V900182-500G | 80mM NaHCO3 |
Sodium Carbonate Buffer (pH10.2) | Sigma, USA | S7795-500G | 120mM Na2CO3 |
Formamide Solution (pH10.2) | MPBIO, USA | FORMD002 | 50% Deionized Formamide |
Formamide Solution (pH10.2) | 5×saline-sodium citrate | ||
Blocking Buffer in Tris buffered saline | Roche, Switzerland | 11175041910 | 1% Blot |
Blocking Buffer in Tris buffered saline | AMRESCO, USA | 0694-500ML | 0.03% Triton X-100 |
Blocking Buffer in Tris buffered saline | 1×Tris buffered saline | ||
Alkaline phosphatase solution | Roche, Switzerland | 11175041910 | 1.5 U/ml anti-digoxigenin alkaline phosphatase conjugated antibody |
Alkaline phosphatase solution | Blocking Buffer in Tris buffered saline | ||
Alkaline phosphatase/ horse radish peroxidase solution | Roche, Switzerland | 11175041910 | 1.5 U/ml anti-digoxigenin alkaline phosphatase conjugated antibody |
Alkaline phosphatase/ horse radish peroxidase solution | TSA kit, Perkin Elmer, USA | NEL701A001KT | 1% anti-biotin streptavidin horse radish peroxidase- conjugated antibody |
Alkaline phosphatase/ horse radish peroxidase solution | Blocking Buffer in Tris buffered saline | ||
Hybridization Buffer | MPBIO, USA | FORMD002 | 50% Deionized Formamide |
Hybridization Buffer | 2×saline-sodium citrate | ||
Hybridization Buffer | Sigma, USA | D8906-50G | 10% dextran sulphate |
Hybridization Buffer | invitrogen, USA | AM7119 | 20 µg/ml yeast t-RNA |
Hybridization Buffer | Sigma, USA | D3159-10G | 0.2 mg/ml herring sperm DNA |
2-hydroxy-3-naphtoic acid-2'-phenylanilide phosphate/ 4-chloro-2-methylbenzenediazonium hemi-zinc chloride salt substrate | Roche, Switzerland | 11758888001 | 1% 2-hydroxy-3-naphtoic acid-2'-phenylanilide phosphate (10mg/ml) |
2-hydroxy-3-naphtoic acid-2'-phenylanilide phosphate/ 4-chloro-2-methylbenzenediazonium hemi-zinc chloride salt substrate | Roche, Switzerland | 11758888001 | 1% 4-chloro-2-methylbenzenediazonium hemi-zinc chloride salt (25mg/ml) |
2-hydroxy-3-naphtoic acid-2'-phenylanilide phosphate/ 4-chloro-2-methylbenzenediazonium hemi-zinc chloride salt substrate | Detection Buffer | ||
Tyramide signal amplification substrate | TSA kit, Perkin Elmer, USA | NEL701A001KT | 2% fluorescein-tyramides |
Tyramide signal amplification substrate | TSA kit, Perkin Elmer, USA | NEL701A001KT | Amplification Diluent |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Instrument | |||
Freezing microtome | Leica, Nussloch, Germany | Jung CM300 cryostat | |
Spectrophotometer | Thermo SCIENTIFIC, USA | NANODROP 2000 | |
Optical microscope | Olympus, Tokyo, Japan | Olympus IX71microscope | |
Confocal microscope | Olympus, Tokyo, Japan | Olympus BX45 confocal microscope |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved