Method Article
هذا عالية الإنتاجية، telemetric، كله-- النباتات المياه العلاقات gravimetric طريقة الظاهري تمكن قياسات مباشرة ومتزامنة في الوقت الحقيقي، فضلا عن تحليل الصفات الفسيولوجية متعددة ذات الصلة بالغلة المشاركة في التفاعلات الحيوية النباتية والبيئية.
10 - يشكل الأمن الغذائي لسكان العالم المتزايدين مصدر قلق كبير. والبيانات التي توفرها الأدوات الجينومية تتجاوز بكثير ما توفره من بيانات فينبتيبيك، مما يخلق فجوة معرفية. ولمقابلة التحدي المتمثل في تحسين المحاصيل من أجل إطعام سكان العالم المتزايدين، يجب سد هذه الفجوة.
تعتبر السمات الفسيولوجية سمات وظيفية رئيسية في سياق الاستجابة أو الحساسية للظروف البيئية. 10- وتستند تقنيات الفينوتيب العالية الإنتاجية (HTP) التي أدخلت مؤخراً إلى الاستشعار عن بعد أو التصوير، وهي قادرة على قياس الصفات المورفولوجية بشكل مباشر، ولكنها تقيس المعلمات الفسيولوجية بشكل رئيسي بشكل غير مباشر.
هذه الورقة تصف طريقة للphenotyping الفسيولوجية المباشرة التي لديها العديد من المزايا للذهون الوظيفية للتفاعلات النباتية والبيئة. فهو يساعد المستخدمين على التغلب على العديد من التحديات التي تواجهها في استخدام أنظمة gravimetric خلايا الحمل وتجارب وعاء. وستمكن التقنيات المقترحة المستخدمين من التمييز بين وزن التربة ووزن النبات ومحتوى مياه التربة، مما يوفر طريقة للقياس المستمر والمتزامن للتربة الديناميكية والظروف النباتية والغلاف الجوي، إلى جانب قياس السمات الفسيولوجية الرئيسية. هذه الطريقة تسمح للباحثين بتقليد سيناريوهات الإجهاد الميداني عن كثب مع الأخذ في الاعتبار آثار البيئة على فسيولوجيا النباتات. هذا الأسلوب يقلل أيضا من آثار وعاء، والتي هي واحدة من المشاكل الرئيسية في ظاهري ما قبل الميدان. وهو يتضمن نظام تغذية الظهر الرتض الذي يتيح تصميم تجريبية عشوائية حقا في كثافة النباتات مثل الحقل. ويرصد هذا النظام عتبة الحد من محتوى التربة والماء (θ) ويسمح بترجمة البيانات إلى المعارف من خلال استخدام أداة تحليلية آنية ومورد إحصائي على الإنترنت. هذه الطريقة لقياس سريع ومباشر من الاستجابات الفسيولوجية من النباتات متعددة إلى بيئة ديناميكية لديه إمكانات كبيرة لاستخدامها في الفحص لالصفات المفيدة المرتبطة الاستجابات للإجهاد اللاأحيائي، في سياق تربية ما قبل الحقول وتحسين المحاصيل.
ضمان الأمن الغذائي لأعداد سكانية متزايدة في العالم في ظل تدهور الظروف البيئية هو حاليا أحد الأهداف الرئيسية للبحوث الزراعية1،2،3. وقد عزز توافر الأدوات الجزيئية الجديدة إلى حد كبير برامج تحسين المحاصيل. ومع ذلك، في حين توفر الأدوات الجينومية كمية هائلة من البيانات، فإن الفهم المحدود لالصفات الظاهرية الفعلية يخلق فجوة معرفية كبيرة. سد هذه الفجوة هو واحد من أكبر التحديات التي تواجه العلوم النباتية الحديثة4،5،6. لمواجهة التحديات التي تنشأ في عملية تحسين المحاصيل وتقليل الفجوة المعرفية نوعي جيني، يجب علينا أن نوازن نهج genotypic مع واحد فينوسنتي7،8.
في الآونة الأخيرة، جعلت مختلف عالية الإنتاجية الظاهري (HTP) منصات ممكن الظاهري غير تدميرية من مجموعات النباتات الكبيرة مع مرور الوقت وهذه المنصات قد تساعدنا على الحد من الفجوة المعرفة نوعي نوعيالجيلي 6،8،9،10. وتسمح تقنيات فحص HTP بقياس الصفات في أعداد هائلة من النباتات خلال فترة زمنية قصيرة نسبياً، وذلك بفضل الروبوتات والأحزمة الناقلة أو الزنايات المستخدمة لنقل النباتات أو أجهزة الاستشعار (على التوالي)، بدلاً من التقنيات التي يتم تشغيلها يدوياً على أساس تبادل الغاز أو التصوير. ومع ذلك، فإن الكميات الهائلة من البيانات التي تنتجها أنظمة المشاركة في الاتصالات تطرح تحديات إضافية في معالجة البيانات وتحليلاً11،12.
معظم هذه المنصات HTP تنطوي على تقييم سمات فينبتيبيك من خلال أجهزة الاستشعار الإلكترونية أو الحصول على صورة الآلي13,14. يتضمن فينوميات الميدان المتقدمة نشر أجهزة الاستشعار القريبة وتقنيات التصوير في الميدان، فضلا عن مقياس قياسي عالي الدقة والدقة والكبر من السكان. يجب دمج بيانات الاستشعار والصور مع بيانات أخرى متعددة النظم لإنشاء نهج فينومي كلي من الجيل الثاني16. ومع ذلك، فإن التقدم المنهجي في الحصول على البيانات، والتعامل معها ومعالجتها أصبحت ذات أهمية متزايدة، حيث أن تحديات ترجمة المعلومات المتعلقة بأجهزة الاستشعار إلى معارف قد استُهلت بشكل كبير خلال السنوات الأولى من بحوث الفينومات النباتية13. ومع ذلك ، فإن موثوقية ودقة تقنيات التصوير المتاحة حاليا للphenotyping في عمق التفاعلات الديناميكية نوعي البيئة واستجابات الإجهاد النباتي مشكوك فيها17،18. وعلاوة على ذلك، فإن النتائج الناتجة عن البيئات الخاضعة للرقابة كثيرا ما تكون مختلفة جدا عن تلك التي لوحظت في الميدان، ولا سيما عندما يتعلق الأمر بالجفاف والإجهاد الظاهري. ويرجع ذلك إلى الاختلافات في الوضع الذي تعاني منه النباتات من حيث حجم التربة، وبيئة التربة، ومقاومة الميكانيكا بسبب انخفاض رطوبة التربة أثناء الإجهاد الناجم عن الجفاف. ولذلك، فإن النتائج من البيئات الخاضعة للرقابة يصعب استقراء إلى الميدان19. وأخيراً، فإن سعر دخول أنظمة المشاركة القائمة على الصور مرتفع جداً، ليس فقط بسبب سعر أجهزة الاستشعار، ولكن أيضاً بسبب الروبوتات والأحزمة الناقلة والملطّجة، التي تتطلب أيضاً معايير أعلى من البنية التحتية لمرفق النمو والصيانة الكبيرة (العديد من الأجزاء المتحركة التي تعمل في بيئة الدفيئة).
في هذه الورقة، نقدم منصة ظاهرية قياسي بالمشاركة مصممة لحل العديد من المشاكل المذكورة أعلاه. وتتيح تكنولوجيا القياس عن بعد القياس الآلي ونقل البيانات من المصدر (المصادر) عن بُعد إلى محطة استقبال لأغراض التسجيل والتحليل. هنا ، نبرهن على منصة HTP-telemetric غير تدميرية تتضمن مقاييس وزن متعددة (نظام gravimetric) وأجهزة استشعار بيئية. ويمكن استخدام هذا النظام لجمع مجموعة واسعة من البيانات وحسابها الفوري (لا حاجة إلى تحليل الصور) مثل كسب الكتلة الحيوية للنباتات الكاملة، ومعدلات التتحين، والتسحال الدوّانة، وتدفقات الجذور، وكفاءة استخدام المياه. ويمثل التحليل في الوقت الحقيقي للبيانات الضخمة التي يتم تغذيتها مباشرة إلى البرنامج من وحدة التحكم في النظام خطوة هامة في ترجمة البيانات إلى المعرفة14 التي لها قيمة كبيرة في صنع القرار العملي، مما يوسع إلى حد كبير المعرفة التي يمكن الحصول عليها من تجارب التحلل البيئي الخاضعة للرقابة، بشكل عام، ودراسات الاحتباس الحراري للإجهاد على الجفاف، على وجه الخصوص.
ومن المزايا الأخرى لمنصة القياس عن بعد قابلية التوسع وسهولة التركيب ومتطلباتها الدنيا من البنية التحتية لمرفق النمو (أي يمكن تركيبها بسهولة في معظم مرافق النمو). وعلاوة على ذلك، وبما أن هذا النظام القائم على أجهزة الاستشعار لا يحتوي على أجزاء متحركة، فإن تكاليف الصيانة منخفضة نسبيا، بما في ذلك كل من سعر الدخول وتكاليف الصيانة الطويلة الأجل. فعلى سبيل المثال، فإن سعر نظام قياس الجرافيمترات الذي يضم 20 وحدة، بما في ذلك نظام تغذية التغذية المرتدة لكل محطة ومحطة للأرصاد الجوية والبرامجيات، سيكون مماثلا لسعر نظام واحد محمول لتبادل الغازات لعلامة تجارية رائدة.
الأرز(Oryza sativa L.) كان يستخدم كمحصول نموذجي والجفاف هو العلاج فحص. وقد تم اختيار الأرز لأنه محصول الحبوب الرئيسية مع التنوع الوراثي واسعة وأنه هو الغذاء الرئيسي لأكثر من نصف سكان العالم20. الجفاف هو عامل إجهاد بيئي غير أحيائي رئيسي يمكن أن يضعف نمو النبات وتنميتها، مما يؤدي إلى انخفاض غلة المحاصيل21. وقد استُخدم هذا الجمع بين المعالجة المحصولية لبيان قدرات المنصة وكمية ونوعية البيانات التي يمكن أن تنتجها. لمزيد من المعلومات حول الخلفية النظرية لهذه الطريقة، يرجى الاطلاع على 22.
في هذا البروتوكول، أشرنا إلى 4 أوعية L محملة على 20 سم × 20 سم، مع كل وعاء يحتوي على مصنع واحد. نفس البروتوكول قابل للتطوير بسهولة ويمكن استخدامه مع الأواني أكبر بكثير (ما يصل إلى 25 لتر محملة على 40 سم × 40 سم المقاييس، مع التكيف الخطية فقط لتدابير البروتوكول) والعديد من النباتات في وعاء. لذلك البروتوكول يستطيع كنت بسهولة كيّفت لمحطات من كثير أنواع وأحجام. الرجاء الرجوع إلى الشكل 1 و 2 لمكونات النظام.
1. إعداد الأواني للتجربة
2. تنمو النباتات
3. تحسين مستوى الإشارة إلى الضوضاء
ملاحظة: تحسن الخطوات التالية جودة القياسات وتخفض مستويات الضوضاء.
4. إعداد التجربة
ملاحظة: تم تصميم عملية إعداد التجربة لتأخذ في الاعتبار وزن جميع أجزاء النظام، وهي وزن وسيط بوتينغ (بما في ذلك وزن التربة والمياه في سعة وعاء) والوزن الأولي للشتلات. اتبع الخطوات التالية:
5. بدء التجربة
ملاحظة: سيتم استخدام البيانات التي تم جمعها في هذه المرحلة كقيم مرجعية لبقية التجربة. ولذلك، من المهم اتباع الخطوات التالية بعناية.
6. تغيير الجدول النباتات
7. تشغيل التجربة
8. تحليل البيانات باستخدام برنامج تحليل البيانات
وكانت مدة التجربة 29 يوما. وقد اجريت التجربة فى اغسطس عندما يكون الطقس المحلى دافئا ومستقرا والايام طويلة . تم استخدام سيناريوهين مختلفين للري لإثبات قدرة منصة الفينوتيب على مقارنة السلوك الفسيولوجي لثلاثة أنواع مختلفة من الأرز (أي إنديكا وكارلا وريسوتو) في وجود الإجهاد الجفاف. كان هناك علاجان لجفاف الإجهاد: (1) الري الأمثل [حتى وصل كل وعاء إلى طاقته في الليل بعد الري (السيطرة)] و (2) جفاف بدأ بعد 5 أيام من بدء التجربة، واستمر لمدة 14 يوما، وأعقبته فترة نقاهة مدتها 10 أيام (الري الأمثل، أيام 19-29). من أجل البساطة ، لا تظهر جميع الأصناف والمجموعات في الأرقام المعروضة هنا. وأظهرت النتائج أن نظام القياس عبر القياسات عبر الاتصالات يمكن أن يقيس بكفاءة التغيرات في الأحوال الجوية والتربة وعلم وظائف الأعضاء في النباتات.
الظروف البيئية
وقد تم رصد الظروف البيئية [الإشعاع النشط ضوئياً (PAR) والعجز في ضغط البخار (VPD)] طوال التجربة من خلال مسبار جوي. وتشير البيانات التي تم جمعها إلى أن PAR و VPD ظلت متشابهة على مدى الأيام المختلفة وعلى مدار اليوم (الشكل 4).
تم قياس VWC للأوعية المعالجة بالجفاف بواسطة مسابير التربة طوال الفترة التجريبية. بيانات VWC التي تم جمعها من سيرة ذاتية واحدة معالجة الجفاف. يتم رسمها مصنع Indica في الشكل 5.
المعلمات الفسيولوجية
ازداد النتح اليومي تدريجياً في جميع العلاجات الأربعة (كارلا- مكافحة, كارلا-الجفاف, ريسوتو السيطرة وريزوتو الجفاف) خلال المرحلة الأولى من التجربة, خلالها كانت جميع النباتات المروية جيدا. وفي وقت لاحق، حدث انخفاض في النتح الذي ارتبط بفترة الجفاف (اليوم الخامس إلى اليوم 18) في العلاجين المحرومين من المياه. وفي وقت لاحق، خلال فترة الانتعاش (من اليوم 18 فصاعدا)، ازداد النتح اليومي مرة أخرى في المجموعتين المحرومتين من المياه، ولكن إلى مستوى أقل بكثير من المستوى الذي لوحظ قبل معالجة الجفاف(الشكل التكميلي 9B).
ارتفع متوسط الوزن النباتي المحسوب (أي معدل زيادة وزن النبات) بشكل مستمر بين كل من Karla - ControlومعالجاتKarla-drought أثناء المرحلة الأولى من التجربة ، عندما تلقت جميع النباتات ريًا مماثلًا (أيام 1-5). عندما تم تطبيق معالجة الجفاف على السيرة الذاتية. نباتات كارلا (أيام 5-18)، توقفت تلك النباتات عن اكتساب الوزن ولم تستأنف اكتساب الوزن حتى مرحلة الانتعاش. في تلك المرحلة، كانت هناك زيادة في الوزن التي سارت ببطء أكثر مما لوحظ للسيطرة. في المقابل، فإن أوزان كارلا-مصانع التحكم زادت بشكل مستمر طوال الفترة التجريبية(الشكل 6).
الشكل 1: مكونات وإعداد نظام الظاهري gravimetric.
(أ) وزنها lysimeter. يتضمن مقياس الحمولة خلية التحميل، التي تحول الحمل الميكانيكي للجسم إلى شحنة كهربائية، ومنصة معدنية تغطي الجزءين العلوي والسفلي من خلية التحميل، بحيث يمكن قياس وزن الجسم بشكل صحيح. (ب) يتم تغطية الlysimeter مع كتلة البوليسترين وغطاء من البلاستيك للعزل الحراري. (C) أجزاء مقياس. يتم وضع خزان مياه (حاوية خضراء) على غطاء مقياس المزيج لجمع السائل الذي يستنزف من الوعاء. ويقترن الحاوية الخضراء إلى غطاء أخضر، الذي لديه فتحة مستديرة كبيرة من خلالها يتم إدراج وعاء. يتم إرفاق طوقا مطاطي أسود إلى جانب واحد من الغطاء الأخضر، ويتم إرفاق وعاء إلى الجانب الآخر، لتقليل فقدان المياه عن طريق التبخر من الحاوية. الغطاء الأخضر اثنين من الثقوب أخذ العينات (صغيرة وكبيرة) فوق تمديد الصرف الصحي، والتي يتم مختومة مع المقابس المطاطية. (D) المقابس. الحاوية لديها تمديد الصرف مع أربعة ثقوب (مع المقابس) في ارتفاعات مختلفة، والتي يمكن استخدامها لضبط مستوى المياه في الحاوية بعد الصرف من خلال توقف حفرة معينة (حجم المياه الاحتياطي). وسيعتمد حجم المياه المرغوب فيه على الأنواع النباتية، ونوع واسطة البوتينغ المستخدمة، واحتياجات النباتات من المياه (أي حجم النتح اليومي المقدر). (E) وحدة التحكم تتكون من مربع مستطيل أخضر يحتوي على وحدة تحكم إلكترونية وصمامات اللولبي. هناك ثقوب من خلالها حل الرتيج يمكن أن تدخل وتخرج الأواني، فضلا عن مآخذ لتوصيل خلية الحمل وأجهزة استشعار مختلفة. ويمكن تطبيق العلاجات المختلفة، مثل مستويات مختلفة من الملوحة أو تكوينات معدنية مختلفة، عن طريق محلول الرتيب. يتم توصيل حامل معدني بوحدة التحكم، ليمسك بالأنابيب والكابلات ويمنعها من لمس الأواني وإضافةالوزن. المكونات الأخرى المطلوبة هي (F) مسبارات التربة (على سبيل المثال، الرطوبة ودرجة الحرارة وأجهزة الاستشعار EC - 5TE)، اختياري (G)متعددة منافذ الناقط (للانقاذ و / أو تطبيقات العلاج) و (H) مسابير الغلاف الجوي [لقياس العجز في ضغط البخار (VPD) والإشعاع]. (I) مجموعة واحدة مجهزة تجهيزا كاملا. (J) صفيف مجهز بالكامل في الدفيئة، والأسهم الصفراء التي تشير إلى مسابير الغلاف الجوي التي تمكن تطبيع السفح على أساس الظروف الجوية المحلية. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2: الأجزاء المطلوبة لإعداد وعاء واحد.
(أ - ج) وهناك حاجة إلى المكونات التالية: واحد وعاء 4 L، واحد وعاء 4 لتر مع عدم وجود أسفل لتكون بمثابة حامل صافي، قطعة واحدة دائرية من شبكة النايلون (حجم المسام = 60 شبكة) مع قطر مزدوج أن من الجزء السفلي من وعاء، غطاء واحد مع الثقوب المعينة لقطر النباتات والري، واحد 60 سم، عصا الألياف الزجاجية البيضاء (القطب) واحد خاتم طوقا أسود. (D) مثال على خطة الجدول التي تم فيها عشوائية الأواني. في الدفيئة، وكان كل جدول 1-18 أعمدة وأربعة صفوف، وهنا استخدمنا 24 مواقف. ومع ذلك، يمكن بسهولة تعديل بنية الصفيف إلى أي شكل استناداً إلى حجم الدفيئة الخاصة. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 3: إعداد وعاء.
( أ) النباتات التي تنمو في الصواني تجويف. (شتلات الطماطم المعروضة هنا ليست سوى مثال؛ العديد من أنواع النباتات الأخرى يمكن زراعتها بنفس الطريقة). (ب) يلقي من قوالب لـ (C) خلق تجاويف في وسط بوتينغ التي سوف (D) تناسب بشكل وثيق المقابس التربة الجذرية من الشتلات، لضمان زرع ناجحة من (ه) الشتلات في الأواني. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 4: الظروف الجوية على مدار التجربة.
يُظهر المحور الصادي على اليمين عجز ضغط البخار اليومي (VPD) والمحور y على اليسار يظهر الإشعاع النشط الضوئي (PAR) على مدى الأيام الـ 29 المتتالية من التجربة. تم إنتاج هذا الرسم البياني من قبل برنامج تحليل البيانات. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 5: المحتوى المائي الحجمي (VWC) الذي يقاس بمسبار التربة على مدار التجربة.
تمثل البيانات قيم VWC لسيرة واحدة. مصنع إنديكا الذي خضع لمعالجة الجفاف طوال فترة التجربة، بما في ذلك الانتعاش. تم إنتاج هذا الرسم البياني من قبل برنامج تحليل البيانات. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 6: أوزان النبات الكامل (تعني ± SE) خلال الفترة التجريبية بأكملها للسيرة الذاتية. كارلا تحت جيدا المروية (السيطرة) وظروف الجفاف.
وتمت مقارنة المجموعات باستخدام ANOVA (هـ س. توكي) ( ANOVA)؛ و "هـزات" من "10000" (ANOVA) (من SSD من Tukey; p < 0.05). كل يعني ± SE يمثل ما لا يقل عن أربعة مصانع. وقد تم إنتاج الرسم البياني والتحليل الإحصائي من خلال برنامج تحليل البيانات. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل التكميلي 1: تشغيل إطارات البرامج لإعداد تجربة. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 2: جدول "النباتات" كجداول بيانات؛ برامج التشغيل. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 3: نافذة البرمجيات لحساب الوزن الجاف للتربة؛ برامج التشغيل. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 4: نافذة البرمجيات لإقامة معالجة الري؛ برامج التشغيل. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 5: إطار عارض الرسم البياني لتحليل البيانات. في تجربتنا، استخدمنا ثلاثة أصناف من الأرز (أي إنديكا وكارلا وريسوتو) وسيناريو ري مختلفين، وهما (السيطرة) والمروية بشكل جيد والجفاف. وكشفت البيانات الخام الاختلاف في وزن النباتات على مدى التجربة. كل خط يمثل مصنع واحد / وعاء. خلال النهار ، والنباتات تبين ، وبالتالي فإن النظام يفقد الوزن ، كما يمكن أن نرى في منحدرات المنحنيات اليومية. كانت الأواني تروى كل ليلة بكامل طاقتها ، كما تمثل القمم في المنحنيات. وأعقب حدث الري تصريف أي مياه زائدة بعد أن تشبعت وسطة بوتينغ. في البداية، كانت جميع النباتات مروية بشكل جيد (السيطرة). ومنذ 7 آب/أغسطس 2018، خضع نصف المصانع لمعالجة الجفاف. وفي الوقت نفسه، ظلت بقية المصانع تتلقى الري الأمثل. وتحققت عملية استعادة تفاضلية من خلال إعادة الري إلى النباتات المعالجة بالجفاف، ابتداء من 20 آب/أغسطس 2018 (مما سمح لكل مصنع بالتجربة بدرجة مماثلة من الإجهاد) والاستمرار في نهاية التجربة. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
تمكن أداة الري الراجعة الخاصة بالنظام المستخدم من تصميم برامج الري لكل وعاء على حدة على أساس الوقت أو وزن الوعاء أو البيانات من مستشعر التربة (مثل VWC) أو نتح النبات خلال اليوم السابق. يمكن ري كل مصنع بشكل فردي بطريقة مخصصة بناءً على أدائه الخاص. ويقلل هذا الري التفاضلي من الفوارق بين محتويات مياه التربة في المصانع، بحيث تتعرض جميع النباتات لمعالجة الجفاف الخاضعة للرقابة بغض النظر عن احتياجاتها الفردية من المياه.
الشكل التكميلي 6: نافذة تحليل البيانات لتحليل البيانات. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 7: نافذة الرسم البياني لتحليل البيانات. ويبين هذا الشكل تمثيلا بيانيا لتوزيع قيم النتح اليومي في أصناف الأرز الثلاث المختلفة (أي إنديكا وكاريلا وريسوتو) في ظروف (مراقبة) مروية جيدا. الرسم البياني السفلي يمثل تصور خريطة الحرارة من النباتات يوميا النتح على أساس الموقع المادي للأوعية على الطاولة. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 8: نافذة اختبار T لتحليل البيانات. الخطوط تمثل الاختلافات في النتح اليومي (سمة فسيولوجية أساسية ومهمة) بين صنفين من أصناف الأرز (أي كارلا وريسوتو) في ظروف (مراقبة) مروية بشكل جيد. تظهر النافذة الينتح اليومي للنباتات الفردية (أعلى اليمين) ومقارنة الوسائل ± SE لكل مجموعة أجريت باستخدام اختبار الطالب t-test (أسفل اليمين). وقد تم إجراء التحليل الإحصائي تلقائيا من قبل البرنامج. النقاط الحمراء تمثل اختلافات كبيرة بين العلاجات وفقا للطالب t-الاختبارات; p < 0.05. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 9: إطار ANOVA لتحليل البيانات. (أ) التمثيل البياني للاختلافات في النتح اليومي بين صنفين من الأرز (مثل كارلا وريسوتو) في ظروف (مكافحة) المروية جيداً والجفاف على مدى فترة التجربة بأكملها. بدأت معالجة الجفاف بعد 5 أيام من بدء التجربة. النقر على أي يوم سوف تقدم (ب) مقارنة المجموعات باستخدام ANOVA (هس دي توكي; ف < 0.05) ، هنا في 12TH AUG. كل يعني ± SE يمثل ما لا يقل عن أربعة مصانع. ويمكن أيضاً تقديم نفس المجموعات على أنها (ج) معدل التتحّد النباتي الكامل المستمر (وسائل ± SE) على مدى الفترة التجريبية بأكملها. وقد تم إنتاج الرسوم البيانية والتحليل الإحصائي من خلال برنامج تحليل البيانات. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
الشكل التكميلي 10: تحليل البيانات قطعة الحكمة منحنى إطار خطي. تُظهر هذه النافذة المنحنيات الخطية الحكيمة للقطعة لثلاثة أصناف أرز (أي إنديكا وكارلا وريسوتو) في ظروف الجفاف. يمكن للبرنامج إجراء تحليل تناسب خطية قطعة الحكمة من العلاقة بين أي معلمة الفسيولوجية (هنا، ومحتح يومي) ومحتوى المياه الحجمي المحسوب (VWC) من النباتات التي تخضع لمعالجة الجفاف. الرجاء النقر هنا لتحميل هذا الرقم.
مواد تكميلية. الرجاء الضغط هنا لتحميل هذه المواد.
متوسط | وصف | |
رمل خشن | رمل السيليكا 20-30 (شاشات الشبكة العلوية والسفلى التي تم تمرير الرمال من خلالها: 0.841 و 0.595 مم، على التوالي) | |
الرمل الناعم | رمل السيليكا 75-90 (شاشات الشبكة العليا والسفلى التي تم تمرير الرمال من خلالها: 0.291 و 0.163 مم، على التوالي) | |
التربة القائمة على الخث | Klasmann 686 | |
التربة اللّاميّة (التربة الطبيعية) | التربة الرملية التي أخذت من الطبقة العليا من قطعة أرض في مزرعة تجريبية لكلية الزراعة والأغذية والبيئة، رحوفوت، إسرائيل | |
الفيرميكوليت | فيرميكوليت 3G | |
بيرليت | Perlite 212 (حجم النطاق: 0.5-2.5 ملم) | |
السماد | بينتال 11 بوتينغ التربة | |
مسامية، خزفية، متوسطة صغيرة الحجم | الملف الشخصي السيراميك المسامية 20-50 (شاشات الشبكة العلوية والسفلى التي تم تمرير السيراميك الأرض من خلالها: 0.841 و 0.297 ملم، على التوالي) | |
مسامية، سيراميك، متوسطة ذات حجم مختلط | الملف الشخصي السيراميك المسامية 50% 20-50 شبكة و 50% 20-6 شبكة, 0.841 – 3.36 مم |
الجدول 1: وسائل الإعلام بوتينغ.
نوع وسائط التربة / المعلمات | رمل خشن | الرمل الناعم | لوام التربة | بيرليت | الفيرميكوليت | السيراميك المسامي المختلط الحجم | السيراميك المسامية الصغيرة الحجم | التربة القائمة على الخث | السماد |
إجمالي المياه (TW، مل) | 860 ± 7.2 (واو) | 883.1 ± 24 (واو) | 1076.3 ± 35.9 (E) | 1119-9 ± 8-5 (هـ) | 1286 ± 22.4 (دال) | 1503.6 ± 15.4 (ج) | 1713 ± 25.9 (باء) | 1744.3 ± 8-2 (باء) | 2089.6 ± 61.6 (أ) |
محتوى الماء الحجمي (VWC، مل3/مل3) | 0.26 (واو) | 0.27 (واو) | 0.33 (هـ) | 0.35 (هـ) | 0.4 (دال) | 0.46 (ج) | 0.53 (باء) | 0.54 (باء) | 0.65 (أ) |
كثافة السوائب (BD، ز/ سم3) | 1-7 (ألف) | 1-6 (باء) | 1.5(C) | 0.1 (H) | 0.2 (واو) | 0.8 (دال) | 0.7 (E) | 0.2 (ز) | 0.1 (ز) |
استقرار وزن التربة (SWS, g/d) | ±2.3 ± 0.3 (باء) | ±4.3 ± 0.3 (باء) | ±2.9 ± 0.9 (باء) | ±14.9 ± 0.7 (أ) | ±7.6 ± 2.8 (باء) | ±1.3 ± 0.1 (باء) | ±1.9 ± 0.4 (باء) | ±6.7 ± 0.8 (باء) | ±4.3 ± 1-2 (باء) |
التربة استقرار الوزن مع المياه المحجوزة في الحمام (ز / يوم؛ يرجى الاطلاع على القسم 6.14) | 3 ± 0.4 (باء) | 3.3 ± 0.4 (باء) | 3-2 ± 1-2 (باء) | 6.3 ± 0.5 (أ) | 2.7 ± 0.8 (باء) | 1.6 ± 0.3 (باء) | 1.9 ± 0.3 (باء) | 10.6 ± 3 (أ) | 1.5 ± 0.3 (باء) |
محتوى الرطوبة gravimetric سعة وعاء (SWC؛ يرجى الاطلاع على القسم 8.2) | 0.18 (زاي) | 0.23 (زاي) | 0.23 (زاي) | 3-79 (ج) | 3.0 (دال) | 0.74 (واو) | 0.99 (هـ) | 4-25 (باء) | 6-13 (أ) |
قدرة الصرف النسبي | ممتازة | متوسط | متوسطة - منخفضة | ممتازة | ممتازة | ممتازة | ممتازة | منخفضه | متوسط |
الوقت النسبي للوصول إلى سعة وعاء | سريع | سريع | سريع | بطيئه | بطيئه | سريع | سريع | بطيئه | بطيئه |
قدرة تبادل الcation النسبية (CEC) | منخفضه | منخفضه | منخفضه | منخفضه | عاليه | عاليه | عاليه | عاليه | عاليه |
التوافق مع: | |||||||||
غسل الجذر (في نهاية التجربة) | ++ | ++ | + | ++ | + | ++ | ++ | - | - |
معالجة المغذيات/المنشطة البيولوجية | ++ | ++ | - | ++ | + | + | + | - | - |
علاجات الملوحة | ++ | ++ | + | ++ | + | ++ | ++ | + | - |
قياس دقيق لمعدلات النمو | ++ | ++ | + | -,+ | + | ++ | +++ | + | + |
استعادة الهيكل المادي للتربة بعد الجفاف | +++ | +++ | ++ | + | - | +++ | +++ | -,+ | - |
* إجمالي الماء (TW، مل) = التربة الوزن الرطب (في وعاء القدرات) – التربة الجافة الوزن. محتوى الماء الحجمي (VWC) = حجم التربة/الطاقة الحرارية. | |||||||||
كثافة السوائب (BD) = التربة الجافة الوزن / حجم التربة. استقرار وزن التربة (SWS) = متوسط التغير في الوزن الرطب للتربة على مدى 4 أيام متتالية (متوسطة السعة وعاء مع عدم وجود نبات بعد الري الماضي). | |||||||||
وعاء قدرة gravimetric الرطوبة المحتوى (SWC); للحسابات، يرجى الاطلاع على القسم 7.2. |
الجدول 2: الخصائص العامة لـ 9 وسائط مختلفة من وسائل اغصاء الأراضي وتوافقها مع منصة gravimetric. وقد اتخذت القياسات باستخدام 4-L الأواني مليئة 3.2 لتر من المتوسط في قدرة الحقل (وعاء القدرة). وتظهر البيانات كوسيلة ± SE. تشير الحروف المختلفة في الأعمدة إلى اختلافات كبيرة بين وسائل الإعلام، وفقًا لاختبار HSD من Tukey(P < 0.05; 3 ≤ n ≤ 5).
مكونات الرتيج | التركيز النهائي (جزء في المليون) | التركيز النهائي (mM) |
NaNO3 | 195.8 | 2.3 |
H3PO4 | 209 | 0.000969 |
KNO3 | 271.4 | 2.685 |
مغسمو4 | 75 | 0.623 |
ZnSO4 | 0.748 | 0.0025 |
الاتحاد الـ4 | 0.496 | 0.00198 |
MoO3 | 0.131 | 0.00081 |
MnSO4 | 3.441 | 0.0154 |
البوراكس | 0.3 | 0.00078 |
C10H12N2NaFeo8 (Fe) | 8.66 | 0.0204 |
وتختلف درجة الـ PH من محلول الري النهائي من النازل (بعد التخفيف مع ماء الصنبور) بين 6.5 و 7. |
الجدول 3: مكونات الرتيجيشن.
تعكس فجوة المعرفة في النمط الجيني -النمط الظاهري تعقيد التفاعلات البيئية من النمط الجيني x (التي استعرضها18،24). قد يكون من الممكن سد هذه الفجوة من خلال استخدام عالية الدقة، HTP-telemetric التشخيص ومنصات الفرز الظاهري التي يمكن استخدامها لدراسة الأداء الفسيولوجي للنبات كله والمياه- حركية العلاقة8,9. تعقيد التفاعلات البيئية النمط الجيني x يجعل الظاهري تحديا، لا سيما في ضوء مدى سرعة النباتات استجابة لبيئاتها المتغيرة. وعلى الرغم من توافر نظم مختلفة للدّينات في الوقت الراهن، فإن معظم تلك النظم يعتمد على الاستشعار عن بعد وتقنيات التصوير المتقدمة. وعلى الرغم من أن هذه النظم توفر قياسات متزامنة، فإن قياساتها تقتصر إلى حد ما على الصفات المورفولوجية والفيزيولوجية غير المباشرة25. الصفات الفسيولوجية مهمة جدا في سياق الاستجابة أو الحساسية للظروف البيئية26. لذلك ، يمكن أن توفر القياسات المباشرة التي يتم اتخاذها باستمرار وفي وقت واحد بدقة عالية جدًا (على سبيل المثال ، 3 دقائق) وصفًا دقيقًا جدًا للسلوك الفسيولوجي للنبات. وعلى الرغم من تلك المزايا الكبيرة لنظام قياس الموارد، يجب أيضاً أن تؤخذ في الاعتبار حقيقة أن هذا النظام ينطوي على بعض العيوب المحتملة. وتنجم المساوئ الرئيسية عن الحاجة إلى العمل مع الأواني وفي ظروف الدفيئة، التي يمكن أن تشكل تحديات كبرى أمام تنظيم المعالجة (لا سيما تنظيم معالجة الجفاف) وقابلية التكرار التجريبي.
من أجل معالجة هذه القضايا، ينبغي للمرء أن توحيد الضغوط المطبقة، وخلق بنية تجريبية عشوائية حقا، والحد من آثار وعاء ومقارنة السلوكيات الديناميكية متعددة من النباتات في ظل الظروف البيئية المتغيرة في غضون فترة قصيرة من الزمن. 10- يتناول نهج ال PHTP-telemetric العملي الظاهر الوارد وصفه في هذه الورقة تلك المسائل كما هو مبين أدناه.
من أجل ربط استجابة المصنع الديناميكية مع بيئتها الديناميكية والتقاط صورة كاملة وكبيرة للتفاعلات المعقدة بين النبات والبيئة ، يجب قياس الظروف البيئية (الشكل 4) والاستجابات النباتية (الشكل التكميلي 9B) بشكل مستمر. هذه الطريقة تمكن من قياس التغيرات المادية في بوتينغ المتوسطة والغلاف الجوي بشكل مستمر وفي وقت واحد، جنبا إلى جنب مع الصفات النباتية (التربة - النبات - الغلاف الجوي المستمر، SPAC).
للتنبؤ على أفضل وجه كيف ستتصرف النباتات في هذا المجال ، من المهم تنفيذ عملية الفينوتيب في ظل ظروف مماثلة قدر الإمكان لتلك الموجودة في الحقل18. نقوم بإجراء التجارب في دفيئة تحت ظروف شبه خاضعة لتقليد الظروف الميدانية قدر الإمكان. واحدة من أهم الشروط هو نمو أو بوتينغ المتوسطة. اختيار أنسب بوتينغ المتوسطة لتجربة نظام gravimetric أمر بالغ الأهمية. من المستحسن اختيار وسط التربة التي تستنزف بسرعة، ويسمح لتحقيق سريع للقدرة وعاء ولديه قدرة وعاء مستقرة للغاية، كما أن هذه الميزات تسمح لقياسات أكثر دقة من قبل نظام gravimetric. بالإضافة إلى ذلك، يجب أيضا النظر في العلاجات المختلفة التي سيتم تطبيقها في التجربة. على سبيل المثال، تتطلب العلاجات التي تتضمن الأملاح أو الأسمدة أو المواد الكيميائية استخدام وسيط صيّغ خامل، ويفضل أن يكون ذلك باستخدام قدرة منخفضة على التبادل. ومن شأن علاجات الجفاف المطبقة على الأنواع النباتية المنخفضة الاضاءة أن تعمل على أفضل نحو مع وسائط البوتينغ ذات المستويات المنخفضة نسبياً من VWC. وعلى النقيض من ذلك، فإن علاجات الجفاف البطيئة المطبقة على النباتات عالية التهيئة ستعمل بشكل أفضل مع وسائل الإعلام بوتينغ مع مستويات VWC عالية نسبيا. إذا كانت الجذور مطلوبة لتحليل ما بعد التجربة (مثل مورفولوجيا الجذر، والوزن الجاف، وما إلى ذلك)، فإن استخدام وسيط ذي محتوى منخفض نسبياً من المواد العضوية (أي الرمل أو السيراميك المسامي أو البيرلايت) سيجعل من الأسهل غسل الجذور دون الإضرار بها. بالنسبة للتجارب التي ستستمر لفترات أطول ، من المستحسن تجنب الوسائط الغنية بالمواد العضوية ، لأن هذه المادة العضوية قد تتحلل مع مرور الوقت. يرجى الاطلاع على الجدول 1 والجدول 2 للحصول على معلومات أكثر تفصيلاً عن هذا الموضوع.
المجال الظاهرية والظاهرة الدفيئة (ما قبل الميدان) لها أهدافها الخاصة وتتطلب مجموعة تجريبية مختلفة. يساعد الانتقاء الظاهري قبل الميدانية على اختيار الأنماط الجينية المرشحة الواعدة التي لديها احتمال كبير في القيام بعمل جيد في الميدان ، للمساعدة في جعل التجارب الميدانية أكثر تركيزًا وفعالية من حيث التكلفة. ومع ذلك ، قبل الحقل الظاهري ينطوي على عدد من القيود (على سبيل المثال ، آثار وعاء) التي يمكن أن تسبب النباتات لأداء مختلف مما كانت عليه في ظل الظروف الميدانية18،27. حجم وعاء صغير، وفقدان المياه عن طريق التبخر والتدفئة من المقاييس هي أمثلة على العوامل في تجارب الاحتباس الحراري التي قد تؤدي إلى آثار وعاء18. تم تصميم الأسلوب الموضح هنا لتقليل تلك التأثيرات المحتملة بالطريقة التالية:
(أ) يتم اختيار حجم الوعاء على أساس النمط الجيني الذي سيتم فحصه. النظام قادر على دعم أحجام مختلفة وعاء (تصل إلى 25 لتر) ومعالجات الري، مما يتيح فحص أي نوع من النباتات المحاصيل.
(ب) يتم عزل الأواني ومقاييس الموازين لمنع نقل الحرارة وأي ارتفاع في درجة حرارة الأواني.
(ج) ينطوي هذا النظام على نظام للري والصرف مصمم بعناية.
(د) هناك وحدة تحكم منفصلة لكل وعاء، لتمكين التعشية الحقيقية مع الري الذاتي والعلاجات التي تخضع للمراقبة الذاتية.
(هـ) يأخذ البرنامج في الاعتبار VPD المحلية المصانع في حساب القذف المظلة. يرجى الاطلاع على توطين محطات VPD المتعددة في الشكل 1J.
يتضمن هذا النظام قياسات فسيولوجية مباشرة في كثافات النباتات الشبيهة بالميدان ، مما يلغي الحاجة إلى إما مساحات كبيرة بين النباتات أو تحريك النباتات للphenotyping القائم على الصور. ويشمل هذا النظام تحليل البيانات في الوقت الحقيقي، فضلا عن القدرة على الكشف بدقة نقطة الإجهاد الفسيولوجية (بلانت) لكل مصنع. وهذا يمكن الباحث من مراقبة النباتات واتخاذ القرارات بشأن كيفية إجراء التجربة وكيفية جمع أي عينات على مدار التجربة. تسهل معايرة الوزن السهلة والبسيطة للنظام عملية معايرة فعالة. نظم عالية الإنتاجية تولد كميات هائلة من البيانات، والتي تقدم إضافية معالجة البيانات والتحديات التحليلية11،12. تحليل في الوقت الحقيقي من البيانات الضخمة التي يتم تغذيتها مباشرة إلى البرنامج من وحدة تحكم خطوة هامة في ترجمة البيانات إلى المعرفة14 التي لها قيمة كبيرة لاتخاذ القرارات العملية.
قد تكون طريقة ال PHTP-telemetric الفيزيولوجية هذه مفيدة لإجراء تجارب الاحتباس الحراري في ظروف قريبة من الميدان. النظام قادر على قياس وحساب الاستجابات الفسيولوجية ذات الصلة بالمياه مباشرة من النباتات إلى بيئتها الحيوية، مع التغلب على معظم المشاكل المرتبطة تأثير وعاء بكفاءة. قدرات هذا النظام هي في غاية الأهمية في مرحلة ما قبل الميدان الظاهري، لأنها توفر إمكانية التنبؤ بعقوبات العائد خلال المراحل المبكرة من نمو النبات.
ليس لدى أصحاب البلاغ ما يكشفون عنه.
وقد تم دعم هذا العمل من قبل برنامج البحوث المشتركة بين المؤسسة الدولية للعلوم والتكنولوجيا والشؤون الاجتماعية (منحة رقم 2436/18) كما تم دعمه جزئيا من قبل وزارة الزراعة والتنمية الريفية الإسرائيلية (مراكز يوجين كاندل المعرفية) كجزء من جذر المسألة - مركز المعرفة لمنطقة الجذر للاستفادة من الزراعة الحديثة.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Atmospheric Probes | SpectrumTech/Meter group | 3686WD | Watchdog 2475 |
40027 | VP4 | ||
Array Randomizer | None | The software "Array Randomizer" can be used for creating an experimental design of a randomized block design, or fully random design. It was developed to have better control over the random distribution of the experimental samples (plants) in order to normalize the atmospheric microvariation inside the greenhouse. | |
Free download and more information, please click on the following link: https://drive.google.com/open?id=1y4QbTpxRK5Lx430xzu1RFdrlcL8pz_1q | |||
Cavity trays | Danish size with curved rim for nursery | 30162 | 4X4X7 Cell, 84 cell per tray https://desch.nl/en/products/seed_propagation_trays/danish-size-with-curved-rim-for-nursery~p92 |
Coarse sand | Negev Industrial Minerals Ltd., Israel | ||
Compost | Tuff Marom Golan, Israel | ||
Data Analysis software | Plant-Ditech Ltd., Israel | SPAC Analytics | |
Drippers | Netafim | 21500-001520 | PCJ 8L/h |
Fine sand | Negev Industrial Minerals Ltd., Israel | ||
Loamy soil (natural soil) | |||
Nylon mesh | Not relevant (generic products) | ||
Operating software | Plant-Ditech Ltd., Israel | Plantarray Feedback Control (PFC) | |
Peat-based soil | Klasmann-Deilmann GmbH, Germany | ||
Perlite | Agrekal , Israel | ||
Plantarray 3.0 system | Plant-Ditech Ltd., Israel | SCA400s | Weighing lysimeters |
PLA300S | Planter unit container | ||
CON100 | Control unit | ||
part of the planter set | Fiberglass stick | ||
part of the planter set | Gasket ring | ||
Operating software | |||
SPAC Analytics software | |||
Porous, ceramic, mixed-sized medium | Greens Grade, PROFILE Products LLC., USA | ||
Porous, ceramic, small-sized medium | Greens Grade, PROFILE Products LLC., USA | ||
Pots | Not relevant (generic products) | ||
Soil | Bental 11 by Tuff Marom Golan | ||
Soil Probes | Meter group | 40567 | 5TE |
40636 | 5TM | ||
40478 | GS3 | ||
Vermiculite | Agrekal , Israel |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved