توليف الأحماض الأمينية المعدلة مع الكربونيل التفاعلي في السيليكو لتقييم التأثيرات الهيكلية باستخدام محاكاة الديناميات الجزيئية

يوضح عملنا طريقا لإنشاء الأحماض الأمينية الكربونية في السيليكو مع المنتجات النهائية لبيروكسيد الدهون وكيفية دمجها في البروتين. يمكن أن يساعدنا ذلك في فهم كيف يمكن لهذا التعديل اللاحق للترجمة أن يغير الوظيفة التركيبية للبروتينات الكربونيلية. تعد البرامج القائمة على خوارزميات الذكاء الاصطناعي أقوى الأدوات الحسابية اليوم للتنبؤ بالبنية الثلاثية للبروتين.

ومع ذلك ، فإنها لا تتعرف بعد على الأحماض الأمينية الكربونية ، وبالتالي ، لا يمكنها التنبؤ بآثارها على بنية البروتين. لدراسة تأثير التعديل اللاحق للترجمة على بنية ووظيفة البروتين ، تتوفر مجموعة واسعة من طرق المعلمات التي يتم دمجها مع الأساليب الحسابية لتسريع وتعميق النتيجة المرجوة. هناك تحديات مهمة يجب مواجهتها في دراسة التعديل اللاحق للترجمة للبروتينات ، سواء في الجسم الحي أو في المختبر أو في السيليكو.

على مستوى السيليكو ، لا تزال هناك حاجة إلى تحسين مجالات القوة وبرامج تحليل البيانات ، إلى جانب إنشاء معلمات جديدة. نظرا للزيادة في البروتينات الكربونية في الالتهابات الأيضية والأمراض المرتبطة بالشيخوخة ، من بين أشياء أخرى كثيرة ، يمكن أن تساهم نتائجنا في فهم التغيير الهيكلي الذي يحدث في هذا وكيف يمكن أن يؤثر ذلك على الوظيفة في السيليكو