反応性カルボニルをin silicoで修飾したアミノ酸を合成し、分子動力学シミュレーションを用いた構造効果の評価

私たちの研究は、脂質過酸化最終産物を用いたカルボニル化アミノ酸のin silico生成のルートと、それらをタンパク質に組み込む方法を示しています。これは、この翻訳後修飾がカルボニル化タンパク質の構造機能をどのように変化させるかを理解するのに役立ちます。人工知能アルゴリズムに基づくプログラムは、タンパク質の三次構造を予測するための今日最も強力な計算ツールです。

しかし、彼らはまだカルボニル化アミノ酸を認識していないため、タンパク質構造への影響を予測することはできません。翻訳後修飾がタンパク質の構造と機能に及ぼす影響を研究するために、幅広いパラメータ法が利用可能であり、これらを計算アプローチと組み合わせて、目的の所見を加速および深化させます。タンパク質の翻訳後修飾の研究には、in vivo、in vitro、in silicoの両方で直面しなければならない重要な課題があります。

インシリコレベルでは、力場とデータ分析プログラムの改善、および新しいパラメータの作成が依然として必要です。代謝感染症や老化関連疾患など、多くのカルボニル化タンパク質の増加により、私たちの結果は、この構造変化で発生する構造変化と、それがin silicoの機能にどのように影響するかを理解するのに役立ちます