JoVE Logo
发表
联系我们

登录

需要订阅 JoVE 才能查看此. 登录或开始免费试用。

本文内容

  • Erratum Notice
  • 摘要
  • 摘要
  • 引言
  • 研究方案
  • 结果
  • 讨论
  • 披露声明
  • 致谢
  • 材料
  • 参考文献
  • Erratum
  • 转载和许可

Erratum Notice

Important: There has been an erratum issued for this article. Read More ...

摘要

在这里, 我们提出一个协议, 以可视化发展的心在斑马鱼在4维 (4)。4维成像, 通过光片荧光显微镜 (LSFM), 采取3维 (3 维) 图像随着时间的推移, 重建发展的心脏。我们定性和定量地显示, 剪切应力激活心内膜凹槽信号在室发展期间, 促进心脏 trabeculation。

摘要

心脏所经历的血流动力学影响心脏发育, 特别是 trabeculation, 形成 outgrowths 的分支网络。缺口信号级联的遗传程序缺陷涉及心室缺损, 如左心室非压实性心肌病或发育不良左心综合征。利用该协议, 可以确定剪切应力驱动 trabeculation 和凹槽信号相互关联。使用光片荧光显微术, 可视化开发斑马鱼心脏是可能的。在这篇手稿中, 评估了血流动力学是否通过凹槽信号调节 trabeculation 的启动, 从而影响收缩功能的发生。对于定性和定量的剪切应力分析, 在斑马鱼心脏形态发生过程中获得4维 (3 维 + 时间) 图像, 并采用4维同步的集成光片荧光显微术捕获心室运动。通过gata1a-吗啉代寡核苷酸 (MO) 微注射降低了血液粘度, 减少了剪切应力, 从而降低了凹槽信号和衰减 trabeculation。Nrg1 mRNA 与gata1a的联合注射可挽救缺口相关基因, 以恢复 trabeculation。为了确定剪切应力驱动的凹槽信号对 trabeculation 的影响, 心肌细胞收缩进一步通过tnnt2a, 以减少血流动力学, 从而, 降低调节缺口靶基因, 以发展非 trabeculated心肌。最后, 通过将内皮细胞置于脉动流中, 对剪切应激反应切口基因表达模式进行了佐证。因此, 4 维光片显微镜揭示了血流动力学的力量, 基础凹槽信号和 trabeculation 与临床相关性的非压实性心肌病。

引言

生物力学的力量, 如血流动力学剪切应力, 密切参与心脏形态发生。为响应血流动力学的剪切力, 心肌脊和凹槽在波状小梁网络中发育, 与整个房室 (AV) 阀1的剪切应力方向一致。心脏 trabeculation 是必要的, 以增加收缩功能和心肌肿块2。切口信号通路的突变导致人类和其他脊椎动物先天性心脏缺损3。例如, gata1a4和tnnt2a5吗啉代寡核苷酸 (MO) 已被证明可以减少红细胞, 而促红细胞生成素 mRNA (EPO)6和异丙肾上腺素 (ISO)7增加红血细胞和心率分别, 因此壁面剪切应力 (WSS)。此外, ErbB2 信号, 在凹槽下游, 促进心肌细胞增殖和分化产生收缩力, 进而激活缺口信号8,9。建议剪切应力控制凹槽信号驱动 trabeculation 的心室发育。目前, 有许多研究试图进一步了解导致先天性心脏病 (CHD)10,11,12的基因编程事件, 但很少有人在研究如何机械力影响形成的心脏。

为了研究心内膜的机械力, 需要在发育期进行密切观察。然而, 由于传统显微学13的固有特性,在体内跳动的样品中获得良好的质量图像具有挑战性。为了观察在样本中的发展时间, 物理切片和染色, 因此, 需要发生13,14,15。虽然共焦显微术被广泛用于图像的3维结构14,16, 这些成像系统的采集仍然受到缓慢扫描速度的限制。

光片荧光显微镜 (LSFM) 是一种独特的成像技术, 允许在体内动态事件的可视化, 长工作距离13。这个技术使用光片荧光显微镜对光学部分样品17。由于在样品上只有一张薄薄的光的照明, 有减少的光漂白和照片毒性13,18。大的视野和长的工作距离允许大样本保持完好, 因为它们是成像13,14,17。低放大率允许更大的区域被成像, 而长的工作距离允许更厚的样品被成像而不损害信噪比。许多组使用 LSFM 图像的整个胚胎17, 大脑14,18, 肌肉和心脏19在其他组织中, 显示各种类型的样本, 可以成像。

虽然先前的研究表明, 通过阻断斑马鱼心脏的流入或流出轨迹来减少血流动力学的剪切力, 信息是完全定性的。它导致一个异常的第三室, 减少心脏循环, 和受损的瓣膜形成20。4维 LSFM 图像为血流动力学剪切力影响心脏组织发育的途径提供了新的视角。这些机械力可能激活力敏感的信号分子, 并诱发小梁脊的形成。由于4维成像的增加时间方面, 人们能够实时跟踪开发中的变化, 这可能导致以前未被注意到的新的启示。斑马鱼是一种理想的成像模型, 因为科学家可以观察整个脊椎动物与仅细胞间的相互作用。氧气也可以通过整个胚胎扩散, 这使得发育不依赖于血管系统而发生, 不同于哺乳动物的发育。虽然斑马鱼的心脏缺乏肺器官, 需要一个四腔心脏, 有大量的心脏基因保存在斑马鱼和人之间21。

在这篇手稿中, 我们描述了如何使用光片荧光显微图像的发展骨小梁在斑马鱼的心脏在不同的情况下。首先, 注射gata1a4或tnnt2a5 MOs 用于降低血液粘度, 因此 WSS。然后记录下心脏的形态学。在一组单独的鱼类中, 我们通过管理EPO mRNA6或异丙肾上腺素7增加了 WSS, 并观察了结果。我们还进行了细胞研究, 具有不同的脉动或振荡流速。在对每个组进行成像后, 我们发现心内膜通过凹槽信号感知到的 WSS 会启动 trabeculation。

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

研究方案

下面的方法是按照 IACUC 和加州大学洛杉矶分校的协议进行的。这些实验组用于转基因Tg (cmlc2: gfp), wea 里 (弱心房)或索菲特克洛什突变体: (a) 野生型 (小波) 控制, (b) gata1a钼和 (c) tnnt2a钼注射液 (表 1)。

模型名字改良基因表参考
控制野生型没有N/A
Tg (cmlc2: gfp)心肌肌球蛋白轻链在心肌中特别表达的绿色荧光34
减小壁面剪切应力弱心房 (wea 里) 突变体心房特异肌球蛋白 heacy 链心房不能收缩, 紧凑的心室, 厚的心肌壁, 狭窄的腔, dialated 心房,37
索菲特克洛什突变体N/A完全清除心内膜, unaturally 大心房小心室, 不存在心脏 cushins41
gata1a莫 gata1a 缺血红细胞贫血4
tnnt2a莫tnnt2a39
增加壁面剪切应力 EPO mRNA没有严重红细胞增多症, 循环血细胞数量增加, 粘度增加6
Isoprotenerol没有心率增加7

表 1: 斑马鱼的描述。试验用斑马鱼的定义和描述。

1. 研究设置

  1. 为 trabeculation 抢救准备Nrg1和EPO mRNA。
    1. 从捐赠质粒中获得人Nrg1 cDNA 和放大。
      注:人类Nrg1 cDNA 是来自斯坦福大学的威廉。
      1. 取出必要的试剂和材料, 即 pcr mastermix (储存在-20 °c), 底漆 (见表 2) (储存在-20 °c), PCR 板 (储存在室温) 和 20 ul 吸管 (储存在室温下)。参见材料表例如产品。
        figure-protocol-1851
        表 2: 人类Nrg1克隆的底漆。
      2. 使用 20 ul 吸管, 为每一个底漆集准备 mastermix。对于1套 triplicates, 使用 37.5 ul 的 mastermix, 3 ul 的无 DNA 的水, 4.5 ul 的底漆。对于更多的 triplicates, 只需乘以样本数即可。
      3. 稀释工作溶液人类Nrg1 cDNA (20 ng/微克浓度) 在底漆带与无 DNA 的水, 以便有 10 ul 总计每一个样本。
        注:确保步骤1.1.1 下的每个解决方案均分布均匀。通过上下吹打混合每个解决方案来做到这一点。为防止交叉污染, 使用一个吸管提示只用于一个样本。
      4. 整除Nrg1 cDNA 与 10 ul 多通道吸管的理想井在 PCR 板。
      5. 将 mastermix 的 14.5 ul 添加到井中的 cDNA 中。将粘附在 pcr 板上, 密封井, 放入 pcr 机中。
      6. 启动 PCR 机, 确保循环达到适当的温度根据酶和底漆使用。
    2. 将Nrg1 cdna 克隆成质粒 pCS2+在 BamHI 和 EcoRI 部位使用过量的酶 BamHI 和 EcoRI, 以确保 cdna 被结扎在所有粒。
      1. Nrg1 cDNA 与捐赠质粒 pCS2+, 商业上可用的主混合溶液和底漆 (表 2)。
        注:总反应量应为 50 ul 与 25 ul 的主混合, 3 ul 的底漆和 1 ul 的 20 ng/ul 捐赠质粒与Nrg1 cDNA。
      2. 将混合从步骤1.1.2.1 在 PCR 机和设置参数, 以满足以下规格:98 °c 十年代, 55 °c 5 或十五年代, 72 °c 5 s/kb。
      3. 根据制造商的说明, 使用净化试剂盒纯化 PCR 产品。将产品洗脱 50 ul 的洗脱缓冲器。
      4. 将纯化的 PCR 产物和5微克的 pCS2+与 BamHI 和 EcoRI 分别在37°c 为 2 h 在 200 ul 反应容量。用商业套件和洗脱在 20 ul 和 100 ul (pH 8.5) 上分别纯化产生的消化。
      5. 结扎 4 ul Nrg1 cDNA 和 2 ul 的消化 pCS2+质粒在 25 ul 反应与 1 ul 的连接酶催化剂在16°c 过夜。
        注:这个程序可以在这里停止过夜孵化。
      6. 使用 2 ul 的结扎解决方案从步骤1.1.2.5 和转化为 50 ul 的大肠杆菌细菌细胞适合克隆 (见材料表)。
    3. 通过 PCR 筛选Nrg1 cDNA 克隆进行了验证。随机选择克隆并添加到特定引物、聚合酶和 deoxyribonucleotide triphosphates (dNTPs) 的溶液中。
      注:控制是向量 (pCS2+) 与和没有插入 (人的 cDNA)。不要选择太大的菌落, 因为过量的细菌可以抑制 PCR。
      1. 利用表 2中的 PCR 引物从转化和筛 pCS2+Nrg1 克隆中选取8个菌落。
      2. 培养一克隆与Nrg1 cDNA 分离 pCS2+Nrg1 质粒 DNA。接种与 100 ul大肠杆菌细菌与 pCS2+Nrg1 质粒成100毫升的 LB 介质, 和文化的震动 (160-225 RPM) 在37°c。
    4. 染纯化 pCS2+Nrg1 质粒成 HEK-293 细胞在6井板使用商业转染试剂后, 制造商的指示。
    5. 24 h 转染后, 溶解细胞使用裂解缓冲液, 通过 SDS 页凝胶, 转移到凝胶膜, 然后用抗Nrg1抗体22染色。使用西方印迹验证Nrg1蛋白的表达。
      注:该控制是一个空的 pCS2+质粒。可以在这里暂停, 如果凝胶膜转移发生过夜。
    6. 使用类似于材料表中的商业产品合成Nrg1 mRNA, 并按照制造商的说明进行操作。
      1. 采取 5 ul 的 pCS2+Nrg1 的 DNA 从细菌分离的文化, 并消化与 NotI 200 ul 反应2小时37°c, 以进行线性化质粒。
      2. 用商业试剂盒和洗脱在 20 ul 的三盐酸 (pH 8.5) 上纯化线性化质粒。
      3. 在 20 ul 反应中用一个商业 RNA 隔离套件进行体外转录, 使用 5 ul 的线性化质粒在制造商的指导下进行。
      4. 将体外转录Nrg1到 350 ul 的 rna 裂解缓冲液中, 然后用 RNA 隔离试剂盒进行纯化。将 RNA 洗脱为 60 ul (pH 8.5)。
      5. 测量 RNA 浓度和存储在-80 °c, 以供将来使用。
    7. 按照上述步骤 1.1.6.1-1.1.6.5 以上的EPO cDNA 和 mRNA 的准备, 但克隆的 cdna 到 pCS2+ 质粒在 EcoRI 和 XhoI 的网站代替。
  2. 向斑马鱼注射吗啉代
    1. 设计23采用在线工具 (材料表) 对gata1a4 (5′-CTGCAAGTGTAGTATTGAAGATGTC 3′) 和tnnt2a5 (5′-CATGTTTGCTCTGATCTGACACGCA-3′) 的 ATG 序列进行钼注射液。
    2. 将gata1a和tnnt2a钼分别添加到核酸酶的水中, 以使最终浓度分别为 8 ng/nl 和4。重复使用EPO mRNA, 最后浓度为 20 pg/nL。确保最终音量为1毫升。
    3. 在1至4细胞阶段, 将tnnt2a钼的 4 gata1a和 1 nl 的 8 ng/nl 注入 1 nl, 以减少心室壁剪应力 (WSS)24。为了增加 WSS, 在1至4细胞阶段, 向斑马鱼胚胎注射 1 nL 20 pg/nl 的EPO mRNA6 。
  3. 化学治疗斑马鱼抑制 trabeculation
    1. 使用20毫升吸管, 稀释10毫克/毫升 AG1478 在1% 亚砜 E3 中的最终浓度5微米 30 hpf 成15毫升管。作为一种控制, 只用1% 亚砜对待每条鱼。
    2. 在1% 亚砜 (100 微米) 中加入 n-[n-(35-Difluorophenactyl)-l--丙]-乙酸 t 丁基酯 (DAPT), 在15毫升管中 E3 培养基, 以类似的方式抑制 40 hpf 的凹槽信号。作为对照, 只处理1% 亚砜。

2. 成像技术

  1. 基于同步算法的4维心脏 LSFM 成像
    1. 使用以下步骤, 将整个鱼胚的2维图像用于多个心跳循环 (图 1)。确保光片厚度约为5微米。采用500个 x y 帧, 曝光时间为10毫秒. 根据采样原理25, 将 z 扫描设置为无损数字采样。
      1. 创建 1% (w/v) 琼脂糖凝胶, 添加1克琼脂糖到100毫升和加热, 直到所有琼脂糖溶解。用 20 ul 吸管将小塑料管与胚胎和琼脂糖装在一起, 并将其固定在舞台上。
      2. 打开图像查看软件, 然后单击 "实时" 查看示例的实时视图。使用旋钮调整目标, 使样品处于焦点。同样, 移动舞台, 使样本的实况视图显示胚胎的顶端。
      3. 使用显微镜的软件26, 以10X 倍的比例拍摄图像500次5秒。
      4. 移动舞台使用马达到一个新的层 (z 轴1微米), 并重复成像过程。
      5. 重复以上2个步骤, 直到整个心脏完全成像。
    2. 通过忽略第一个和最后一个心脏循环图像来确保数据完整性。通过匹配在同一时间点在心脏周期, 但在不同时期的图像, 找到心脏循环的周期。使用已开发的以下公式来查找期间:
      figure-protocol-6206(1)
      其中D是用于拟合周期假设的成本函数,我 是捕获的图像, τ图像被捕获的时间, zk 图像的 z 方向索引, xm 是向量的像素指数, T '是周期性假说。
    3. 使用下面的公式可以在类似的阶段查找两幅图片之间的相对移位:
      figure-protocol-6487(2)
      其中 Qk ', k表示一个相对移位的成本函数, R是可能的空间邻域, L是捕获图像的总时间, x是像素索引, zk 和zk '是第一和第二 z 方向切片, t是时间, s是相对移位假说。
    4. 将相对移位转换为第一个图像的绝对移位, 并用伪逆方法求解线性方程, 以找到与前面描述的27图像的下一节对齐的绝对关系。
    5. 最后的4维图像是使用图像处理软件 (材料表) 处理的。
      1. 将2维图像堆叠成3维
        1. 打开商业图像处理软件。
        2. 单击 "打开数据"。
        3. 选择要堆叠到3维 > 单击 "加载" 的所有图像。
        4. 添加在体素大小为 0.65 x 0.65 x 1 > 单击确定。
        5. 单击 "多平面视图" 框以可视化3维图像。
        6. 右键单击蓝色slice_1. tiff框 > 选择显示> 选择Volren。
        7. 单击 "编辑" > "选择选项" > "选择编辑色彩映射"。
        8. 使用红色 > 中概述的框调整颜色, 单击 "确定"。
      2. 将3维转换为4维
        1. 单击 "文件> 打开时间序列数据"。
        2. 选择刚刚制作的3维 tiffs > 单击 "加载"。
        3. 输入与以前相同的体素大小。
        4. 右键单击蓝色slice_1. tiff框 > 选择 "显示" > "选择Volren"。
        5. 单击 "编辑" > "选择选项" > "选择编辑色彩映射"。使用框调整颜色 > 单击"确定"。
        6. 右键单击时间序列控件> 单击电影制作者 > 按下播放按钮以观看影片。
        7. 添加文件名、帧大小、帧速率、质量等于 1, 键入Monoscopic > 单击 "应用"
        8. 导出视频。在适当的软件中打开视频。

3. qRT PCR 分析

  1. 斑马鱼的心脏 RNA 分离, 以量化缺口配体, 受体和目标基因的表达
    1. 牺牲斑马鱼, 使他们的过量 tricaine 甲醇28,29。使用以前描述的协议30, 斑马鱼的心脏被切除了并且准备了为 RNA 分离。
    2. 分离总 RNA, 并根据制造商的指示, 使用 cdna 合成试剂盒合成 cdna。
    3. 为缺口配体Jag1、 Jag2、 Dll4、受体Notch1b和信号相关基因Nrg1和ErbB2设计 PCR 引物。见表3我们使用的底漆。
    4. 添加引物从步 3.1.3, 分离的 mRNA 从步3.1.2 和商业 mastermix 到 PCR 板材。根据所使用的酶, 在适当的温度和时间运行 qRT PCR。将结果规范化到斑马鱼的α肌动蛋白。
      注:这将计算每个配体、受体和基因的表达水平。

4.体外人主动脉内皮细胞 (HAEC) 实验

  1. 动态剪切应力模型
    1. 培养 HAEC 细胞, HAEC 培养培养基。一旦完全汇合, 暴露细胞到层流和脉动流 23 x 10-5 N 的速率为1赫兹为 24 h。
      1. 热身 EC 媒体/DMEM 10% 在水浴中的20分钟的血清。
      2. 从液氮罐中检索 HAEC 细胞, 将瓶子放到水浴中直到融化。
      3. 使用 1000 ul 吸管, 取出解冻的细胞, 并把它们放在15毫升管与3-5 毫升的介质。离心细胞溶液在 53 x g 3 分钟。
      4. 将解吸出, 并添加足够的介质, 总体积为10毫升。将细胞溶液添加到无菌 T75 烧瓶中, 将瓶子盖上, 并将细胞均匀地分布在盘子的底部。
      5. 用缩写、日期、细胞类型和通道号标记瓶子。孵化的烧瓶在37°c, 5% CO2, 直到细胞80% 汇合。记得每2-3 天更换一次媒体。
      6. 使用商用泵, 将油管连接到烧瓶, 并在步骤 4.1.131、32、33中设置上述参数。
    2. 在最终浓度为5微米的30分钟内加入 GI254023X 到50毫升的 HAEC 培养基。
    3. 与预混合 GI254023X, 一种抑制凹槽信号的 ADAM10 抑制剂, 进行相同的层流流或脉动流实验, 如在4.1.1。
    4. 用 qRT PCR 方法对四组 HAEC 样品 (层流、层流 + GI254023X、脉动流、Jag1、 Jag2和Dll4) 和缺口靶基因 (有毛和增强剂) 进行量化.脉动流 + GI254023X) 描述前32。

5. 切口信号的抢救和过度表达

  1. 在 1-4 细胞阶段, 以gata1a钼为过度表达 tshr 缺口靶基因24, 在 5 pg/nL (从步骤 1.1.6) 的浓度中注入1的Nrg1 mRNA。
  2. 以类似的方式将Nrg1 mRNA 的 1 nL 注入wea 里突变体24。
  3. 双浓度的 Nrg1 mRNA (10 pg), 并注入24 1 nL 到斑马鱼, 以观察心室形态。
  4. 在1至4细胞阶段, 向斑马鱼胚胎注入 20 pg/nl6的 1 nL, 以增强造血, 增加心室 WSS, 如前所示24。
  5. 注射 1 nL 50 微米异丙肾上腺素7, 增加收缩率, 到 E3 培养基为 24 h, 而斑马鱼养殖如前所示24。
  6. 对每个组执行4维 LSFM 成像。按照步骤 2.1. 1-2. 1.5. 2.8 中的说明进行操作。

6. 随着时间的推移, 分数缩短和体积变化的量化

  1. 对每组50、75和 100 hpf 执行4维 LSFM 成像。按照步骤 2.1. 1-2. 1.5. 2.8 的指示执行。分割每个图像, 使每一个有600个节点的心脏壁运动复制。
  2. 使用以下公式测量舒张和收缩期间心室直径的变化:
    figure-protocol-10536(3)
    用可视化软件在每0.1 秒加载3维心室图像并测量音量。
  3. 绘制每个实验组在 75 hpf 和 100 hpf 时的体积变化。

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

结果

为了获得高分辨率的2维和3维图片, LSFM 在这篇手稿中被使用。如图 1A和1B所示, 照明透镜在样品上指示光片。由于光片的薄, 只有一张飞机被照亮。该检测透镜的定位垂直于照明透镜, 并聚焦于所述照明平面 (图 1B)。光照透镜上的光片然后从左向右扫描样本 (图 1C)。扫描可以减少照片漂白, 光毒?...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

讨论

在本协议中, 我们已经表明, 4 维成像可以用来跟踪小梁网络的发展, 以应对生物力学的变化。特别是, 内皮细胞所经历的剪切应力会引发凹槽信号级联, 进而促进 trabeculation。在这篇手稿中, 我们已经表明 (1) gata1a钼注射液减少造血, 因此减少了壁面剪应力, (2) tnnt2a钼注射液抑制心室收缩功能, 以减少壁面剪应力, (3) wea 里突变体缺乏心房收缩, 从而降低了应用于心室的血流动力学力...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

披露声明

作者没有什么可透露的。

致谢

作者希望向斯坦福大学的威廉.Nrg1cDNA 和黛博拉 Yelon 从 UCSD 提供wea 里变种人。作者还要感谢辛西娅. 陈对图像采集的帮助。这项研究得到了 NIH HL118650 (T.K. Hsiai) 的资助, HL083015 (至 T.K. Hsiai)、HD069305 (至北卡罗来纳州和 T.K. Hsiai)、HL111437 (T.K. Hsiai 和北卡罗来纳州)、HL129727 (T.K. Hsiai)、T32HL007895 (R.R. Sevag)、HL 134613 (至五 Messerschmidt) 和德克萨斯大学系统明星资助 (j. 李).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

材料

NameCompanyCatalog NumberComments
Clontech Hifi PCR pre-mix Takara 639298PCR mastermix
1.1.1.1, 1.1.1.2, 1.1.1.5, 1.1.2.1, 3.1.4
Human Nrg1 cDNAGift from William Talbot, Stanford University, Stanford, California, USAN/AUsed for trabeculation rescue
1.1.1.3, 1.1.1.4, 1.1.2.1
CFX Connect™ Real-Time PCR Detection SystemBio-Rad1855201PCR Machine
1.1.1.5, 1.1.1.6, 1.1.2.2, 1.1.3.2
pCS2+GE HealthPlasmid used to synthesize mRNA
1.1.2.1, 1.1.2.4, 1.1.2.5
Nucleospin purification kit  Clontech740609.25DNA Purification
1.1.2.3, 1.1.2.4, 1.1.6.2
T4 DNA ligase Clontech2011APCR Ligation solution
1.1.2.5
Stellar competent cellsClontech636763E. coli cells used for transformation
1.1.2.6, 1.1.3.1, 1.1.3.2
Lipofectamine 2000 transfection reagentLife Technologies11668027Transfection reagent
1.1.4
mMessage SP6 kitInvitrogenAM1340Kit used to synthesize mRNA
1.1.6.3
Aurum Total RNA Mini KitBio-Rad7326820Purifies RNA 
1.1.6.4, 3.1.2
GeneTools 4.3.8GeneToolsN/ASoftware for primer design
1.2.1, 3.1.3
EPO cDNACreative BiogeneCDFH006026Increases WSS
1.2.2, 1.2.3, 1.1.7
AG1478Sigma-Aldrich T4182ErbB inhibitor
1.3.1
E3 mediumTo grow embryos
1.3.1, 1.3.2, 5.1.5
DAPTSigma-Aldrich D5942γ-secretase inhibitor
1.3.2
Agarose Sigma-Aldrich A9539Used for mounting embryos
2.1.1.1
ORCA-Flash4.0 LT Digital CMOS cameraHamamatsu PhotonicsC11440-42UUsed to capture Images
2.1.1.2, 2.1.1.3
Amira SoftwareFEI SoftwareN/AVisualized and Analysed images into 3D, and 4D
2.1.5.1.1-2.1.5.2.8
Tricaone mesylate Sigma-Aldrich 886-86-2Used to humanely sedated or sacrifice embryos
3.1.1
iScript cDNA Synthesis KitBio-Rad1708890Synthesizes cDNA
3.1.2
Eppendorf 5424 microcentrifugeEppendorf05-400-005Microcentrifuge
4.1.1.3
GI254023XSigma-Aldrich 260264-93-5ADAM10 inhibitor
4.1.2, 4.1.3 
Isoprenaline hydrochlorideSigma-Aldrich I5627Isoproterenol increases WSS
5.1.5
MATLABMathworksN/ACardiac mechanics analysis

参考文献

  1. Lee, J., et al. Moving domain computational fluid dynamics to interface with an embryonic model of cardiac morphogenesis. PLoS One. 8 (8), e72924(2013).
  2. Peshkovsky, C., Totong, R., Yelon, D. Dependence of cardiac trabeculation on neuregulin signaling and blood flow in zebrafish. Dev Dyn. 240 (2), 446-456 (2011).
  3. High, F. A., Epstein, J. A. The multifaceted role of Notch in cardiac development and disease. Nat Rev Genet. 9 (1), 49-61 (2008).
  4. Galloway, J. L., Wingert, R. A., Thisse, C., Thisse, B., Zon, L. I. Loss of Gata1 but Not Gata2 Converts Erythropoiesis to Myelopoiesis in Zebrafish Embryos. Developmental Cell. 8 (1), 109-116 (2005).
  5. Chi, N. C., et al. Cardiac conduction is required to preserve cardiac chamber morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences. 107 (33), 14662(2010).
  6. Paffett-Lugassy, N., et al. Functional conservation of erythropoietin signaling in zebrafish. Blood. 110 (7), 2718(2007).
  7. De Luca, E., et al. ZebraBeat: a flexible platform for the analysis of the cardiac rate in zebrafish embryos. Scientific Reports. 4, 4898(2014).
  8. Liu, J., et al. A dual role for ErbB2 signaling in cardiac trabeculation. Development. 137 (22), 3867-3875 (2010).
  9. Samsa, L. A., et al. Cardiac contraction activates endocardial Notch signaling to modulate chamber maturation in zebrafish. Development. 142 (23), 4080-4091 (2015).
  10. Li, Y., et al. Global genetic analysis in mice unveils central role for cilia in congenital heart disease. Nature. 521, 520(2015).
  11. Sifrim, A., et al. Distinct genetic architectures for syndromic and nonsyndromic congenital heart defects identified by exome sequencing. Nature Genetics. 48, 1060(2016).
  12. Hu, Z., et al. A genome-wide association study identifies two risk loci for congenital heart malformations in Han Chinese populations. Nature Genetics. 45, 818(2013).
  13. Huisken, J., Stainier, D. Y. R. Selective plane illumination microscopy techniques in developmental biology. Development (Cambridge, England). 136 (12), 1963-1975 (2009).
  14. Panier, T., et al. Fast functional imaging of multiple brain regions in intact zebrafish larvae using Selective Plane Illumination Microscopy. Frontiers in Neural Circuits. 7, 65(2013).
  15. Lee, E., et al. ACT-PRESTO: Rapid and consistent tissue clearing and labeling method for 3-dimensional (3D) imaging. Scientific Reports. 6, 18631(2016).
  16. Kelley, L. C., et al. Live-cell confocal microscopy and quantitative 4D image analysis of anchor-cell invasion through the basement membrane in Caenorhabditis elegans. Nature Protocols. 12, 2081(2016).
  17. Lee, J., et al. 4-Dimensional light-sheet microscopy to elucidate shear stress modulation of cardiac trabeculation. The Journal of Clinical Investigation. 126 (5), 1679-1690 (2016).
  18. Lavagnino, Z., et al. 4D (x-y-z-t) imaging of thick biological samples by means of Two-Photon inverted Selective Plane Illumination Microscopy (2PE-iSPIM). Scientific Reports. 6, 23923(2016).
  19. Huisken, J., Swoger, J., Del Bene, F., Wittbrodt, J., Stelzer, E. H. K. Optical Sectioning Deep Inside Live Embryos by Selective Plane Illumination Microscopy. Science. 305 (5686), 1007(2004).
  20. Hove, J. R., et al. Intracardiac fluid forces are an essential epigenetic factor for embryonic cardiogenesis. Nature. 421 (6919), 172-177 (2003).
  21. Bakkers, J. Zebrafish as a model to study cardiac development and human cardiac disease. Cardiovascular Research. 91 (2), 279-288 (2011).
  22. BioRad. General Protocol for Western Blotting. 6376, http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_6376.pdf (2018).
  23. GeneTools. Gene Tools Oligo Design Website. , https://oligodesign.gene-tools.com/request/ (2018).
  24. Mullins, M. Zebrafish Course. , ed University of Chicago (2013).
  25. Grenander, U. Probability and Statistics: The Harald Cramér Volume. , Alqvist & Wiksell. (1959).
  26. Fei, P., et al. Cardiac Light-Sheet Fluorescent Microscopy for Multi-Scale and Rapid Imaging of Architecture and Function. Scientific Reports. 6, 22489(2016).
  27. Liebling, M., Forouhar , A. S., Gharib, M., Fraser, S. E., Dickinson, M. E. Four-dimensional cardiac imaging in living embryos via postacquisition synchronization of nongated slice sequences. Journal of Biomedical Optics. 10 (5), (2005).
  28. Adeoye, A. A., et al. Combined effects of exogenous enzymes and probiotic on Nile tilapia (Oreochromis niloticus) growth, intestinal morphology and microbiome. Aquaculture. 463, 61-70 (2016).
  29. Matthews, M., Varga, Z. M. Anesthesia and Euthanasia in Zebrafish. ILAR Journal. 53 (2), 192-204 (2012).
  30. Singleman, C., Holtzman, N. G. Heart Dissection in Larval, Juvenile and Adult Zebrafish, Danio rerio. Journal of Visualized Experiments : JoVE. (55), e3165(2011).
  31. Li, R., et al. Disturbed Flow Induces Autophagy, but Impairs Autophagic Flux to Perturb Mitochondrial Homeostasis. Antioxidants & Redox Signaling. 23 (15), 1207-1219 (2015).
  32. Li, R., et al. Shear Stress-Activated Wnt-Angiopoietin-2 Signaling Recapitulated Vascular Repair in Zebrafish Embryos. Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology. 34 (10), 2268-2275 (2014).
  33. Baek, K. I., et al. Flow-Responsive Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-Protein Kinase C Isoform Epsilon Signaling Mediates Glycolytic Metabolites for Vascular Repair. Antioxidants & Redox Signaling. 28 (1), 31-43 (2018).
  34. Huang, C. J., Tu, C. T., Hsiao, C. D., Hsieh, F. J., Tsai, H. J. Germ-line transmission of a myocardium-specific GFP transgene reveals critical regulatory elements in the cardiac myosin light chain 2 promoter of zebrafish. Developmental Dynamics. 228 (1), 30-40 (2003).
  35. Vermot, J., et al. Reversing blood flows act through klf2a to ensure normal valvulogenesis in the developing heart. PLoS Biol. 7 (11), (2009).
  36. Grego-Bessa, J., et al. Notch signaling is essential for ventricular chamber development. Dev Cell. 12 (3), 415-429 (2007).
  37. Berdougo, E., Coleman, H., Lee, D. H., Stainier, D. Y. R., Yelon, D. Mutation of weak atrium/atrial myosin heavy chain disrupts atrial function and influences ventricular morphogenesis in zebrafish. Development. 130 (24), 6121(2003).
  38. Arnaout, R., et al. Zebrafish model for human long QT syndrome. Proc Natl Acad Sci U S A. 104 (27), 11316-11321 (2007).
  39. Chi, N. C., et al. Genetic and physiologic dissection of the vertebrate cardiac conduction system. PLoS Biol. 6 (5), e109(2008).
  40. Liao, W., et al. The zebrafish gene cloche acts upstream of a flk-1 homologue to regulate endothelial cell differentiation. Development. 124 (2), 381-389 (1997).
  41. Stainier, D. Y., Weinstein, B. M., Detrich, H. W. 3rd, Zon, L. I., Fishman, M. C. Cloche, an early acting zebrafish gene, is required by both the endothelial and hematopoietic lineages. Development. 121 (10), 3141-3150 (1995).
  42. Santi, P. A. Light Sheet Fluorescence Microscopy: A Review. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 59 (2), 129-138 (2011).
  43. Engelbrecht, C. J., Stelzer, E. H. Resolution enhancement in a light-sheet-based microscope (SPIM). Optics Letters. 31 (10), 1477-1479 (2006).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Erratum


Formal Correction: Erratum: Light-sheet Fluorescence Microscopy to Capture 4-Dimensional Images of the Effects of Modulating Shear Stress on the Developing Zebrafish Heart
Posted by JoVE Editors on 9/03/2018. Citeable Link.

An erratum was issued for: Light-sheet Fluorescence Microscopy to Capture 4-Dimensional Images of the Effects of Modulating Shear Stress on the Developing Zebrafish Heart. Additional author names were added, and an author affiliation was updated.

The author list was updated from:

Victoria Messerschmidt*1, Zachary Bailey*1, Kyung In Baek2, Richard Bryant1, Rongsong Li2, Tzung K. Hsiai2, Juhyun Lee1

to:

Victoria Messerschmidt*1, Zachary Bailey*1, Kyung In Baek2, Yichen Ding2, Jeffrey J. Hsu2, Richard Bryant1, Rongsong Li2, Tzung K. Hsiai2, Juhyun Lee1

The author affiliation for Rongsong Li was updated from:

Department of Medicine (Cardiology) and Bioengineering, UCLA

to:

College of Health Science and Environmental Engineering, Shenzhen Technology University

转载和许可

请求许可使用此 JoVE 文章的文本或图形

请求许可

探索更多文章

138trabeculation4

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

政策

使用条款

隐私

联系我们

向图书馆推荐

JoVE 新闻简报

科研

教育

发表

图书馆员

关于 JoVE

版权所属 © 2025 MyJoVE 公司版权所有，本公司不涉及任何医疗业务和医疗服务。