登录

生物标志物提取沉积物-加速溶剂萃取

Overview

资料来源: 实验室的杰夫卡普-马萨诸塞大学阿默斯特

分布的一组称为甘油二烷基甘油-tetraethers (GDGTs),由一套古菌和细菌,产生的有机生物标志物的发现在现代沉积物在回应空气可预测的方式更改或水温度1,2。因此,这些生物标志物在一个序列已知年龄的沉积物的分布可以用于重建的沿革空气和/或水温度对到千禧年代际时间尺度 (图 1)。长高分辨率记录的过去的气候,被称为古气候学,生产取决于数以百计,可能数以千计的样品的快速分析。年长的萃取技术,如超声波或索氏,是太慢。然而,更新的加速溶剂萃取技术的设计与效益就是生命。

Figure 1
图 1。在过去显示在地中海东部的海表温度 (SST) 的变化的古气候记录的示例 ~ 27,000 年3.此记录包括 ~ 115 样品和基于 isoprenoidal GDGT 基于 TEX86 SST 代理。

Procedure

1.收集必要的材料

  1. 抽取样本。(在这种情况下,泥沙) 样品冷冻、 冻干、 压碎,和均质前提取,和提取组将效率最大化。
  2. 根据样本的大小,使用 40 或 60 mL 的收集瓶。对于这个实验中,使用了高硼硅玻璃小瓶 (40 毫升) 和溶剂的安全上限。燃烧瓶、 高硼硅玻璃吸管和称重罐在 6 h 事先以确保可能的有机污染物去除 550 ° C。
  3. 二氯甲烷 (DCM) 和甲醇在大多数有机地球化学实验室都是常见的。单独使用它们,(甲醇第一,其次是 DCM) 冲洗实验室工具和使用前的玻璃器皿。二氯甲烷制甲醇 (甲醇; 9:1) 混合在许多实验室用于有效地提取生物标志物与广泛的极性。溶剂应能自由的有机污染物。
  4. 获得加速溶剂萃取用于这个实验。

2.样品的制备细胞

  1. 组装样品池为每个样品被提取出来,再加上一个空格。
    1. 对于每个单元格,螺杆上的细胞体一端的端盖。
    2. 在每个单元格使用溶剂冲洗镊子燃烧玻璃纤维滤材的地方。然后,轻轻地,慢慢地按住该筛选器使

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

最后提取,还有每个样本总脂提取物 (TLE)。每个小瓶现在包含从沉积物、 土壤或植物组织,可溶有机质。可以分析这些抽,和它们的化学成分确定和量化。

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

提取样本抽包含广泛的不同的有机化合物,包括 GDGTs,用于重建古温度。甘油-二烷基甘油-tetraethers 是显示对生长温度灵敏度的生物标志物的大套房。有两组 GDGTs,分枝和萜,不同性质的分支模式对核心烷基图 3)。在海洋中,古生菌,称为 Thaumarchaeota,大都会组产生 isoprenoidal GDGTs4。分枝的 GDGTs 生产上陆地土壤中5,湖泊,和湖沉积物被身份不明的细菌?...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

References
  1. Schouten, S. et al. Distributional variations in marine crenarchaeotal membrane lipids: a new tool for reconstructing ancient sea water temperatures?, Earth and Planetary Science Letters204(1-2), 265-274 (2002).
  2. Weijers, J. W. H. et al. Environmental controls on bacterial tetraether membrane lipid distribution in soils, Geochimica et Cosmochimica Acta71(3), 703-713 (2007).
  3. Castaneda, I. S. et al. Millennial-scale sea surface temperature changes in the eastern Mediterranean (Nile River Delta region) over the last 27,000 years, Paleoceanography, 25, 13 (2010).
  4. Damste, J. S. S. et al. Crenarchaeol: the characteristic core glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether membrane lipid of cosmopolitan pelagic crenarchaeota, J Lipid Res, 43(10), 1641-1651 (2002).
  5. Hopmans, E. C. et al. A novel proxy for terrestrial organic matter in sediments based on branched and isoprenoid tetraether lipids, Earth and Planetary Science Letters224(1-2), 107-116 (2004).
  6. Tierney, J. E., Russell J. M. Distributions of branched GDGTs in a tropical lake system: Implications for lacustrine application of the MBT/CBT paleoproxy, Organic Geochemistry40(9), 1032-1036 (2009).
  7. Damste, J. S. S. et al. 13,16-Dimethyl Octacosanedioic Acid (iso-Diabolic Acid), a Common Membrane-Spanning Lipid of Acidobacteria Subdivisions 1 and 3, Appl Environ Microb, 77(12), 4147-4154 (2011).
Tags
ExtractionBiomarkersSedimentsAccelerated Solvent ExtractionASE MethodOrganic BiomarkersGeological Sediment SamplesSonicationSoxhletPaleoclimate ReconstructionHigh TemperaturesHigh PressureMultiple SamplesFast Preparation RunVideo TutorialSteel CellsCarouselCollection VialsInternal OvenSolvent Bottle

跳至...

0:00

Overview

1:05

Principles of Accelerated Solvent Extraction

2:23

Collection of Sample Materials and Preparation of ASE Cells

3:48

Preparation of Collection Vials and Extraction

4:49

Applications

6:18

Summary

此集合中的视频:

article

Now Playing

生物标志物提取沉积物-加速溶剂萃取

Earth Science

7.6K Views

article

确定空间方向的岩石层与布伦顿指南针

Earth Science

25.1K Views

article

利用地形图生成地形剖面

Earth Science

31.7K Views

article

制作一个地质剖面

Earth Science

46.6K Views

article

物理性能的一部分: 矿物晶体和劈裂

Earth Science

51.4K Views

article

物理性能的矿物二: 矿物分析

Earth Science

37.8K Views

article

火成岩火成岩

Earth Science

39.4K Views

article

火成岩侵入岩

Earth Science

32.2K Views

article

概述了 bGDGT 古气候学的生物标志物分析

Earth Science

5.4K Views

article

概述了 Paleothermometry 长链生物标志物分析

Earth Science

7.2K Views

article

超声提取沉积物的脂类生物标志物

Earth Science

7.4K Views

article

索氏提取脂类生物标志物的沉积物

Earth Science

18.3K Views

article

转换的脂肪酸甲酯的皂化为 Uk'37 Paleothermometry

Earth Science

10.1K Views

article

总脂提取物与柱层析纯化

Earth Science

12.3K Views

article

去除的分支和循环化合物的尿素络合法为 Uk'37 Paleothermometry

Earth Science

6.4K Views

JoVE Logo

政策

使用条款

隐私

科研

教育

关于 JoVE

版权所属 © 2025 MyJoVE 公司版权所有,本公司不涉及任何医疗业务和医疗服务。