Comparing Budding Curves, Flow Cytometry Data, and Experimental Data

通过使用 Python 实用程序函数在新单元格中输入命令，在对齐之前绘制出芽曲线。接下来，绘制对齐后的萌芽曲线。使用 Python 实用程序函数。

使用 Python 实用程序小瓶中提供的绘图折线图比较，对原始、对齐或对齐和插值的数据框执行折线图比较。通过在新单元格中键入命令，使用新单元格中的命令将 CSV 或 TSV 基因列表文件导入笔记本。接下来，使用 Python 实用程序文件中提供的函数图热图比较，通过在新单元格中键入命令，对对齐的插值和相位对齐的数据框执行热图比较。

对比对和未对齐转录组数据的比较表明，在比对之前，微阵列实验的第一个峰表达似乎与RNA-seq实验的第二个峰对齐。但是，在比对后，每个数据集的第一个细胞周期峰会适当对齐。比较不同周期的实验中的细胞周期阶段数据，在未对齐的出芽曲线中显示出可见的周期差异。

虽然时钟对齐使三条曲线看起来非常相似，使得实验数据的比较成为可能，但每个可比较的生命线点的细胞周期阶段数据在两种条件下并不相同。不同时期的实验转录组数据的比较表明，在对齐之前，CDC20的转录本动力学是不重叠的。但是在对齐后，峰出现在相同的细胞周期阶段，但曲线的形状不同。

这些基因被绘制为热图，对于未对齐和对齐的所有三个条件，顺序相同。