该协议非常重要，因为这是一种有效的方法来分离多下游应用的果蝇幼眼组织。这项技术的主要优点是，它允许快速解剖大量的幼眼，而不会损害组织。果蝇幼崽视网膜的解剖对新手来说将是具有挑战性的。
实践技术是提高解剖速度和结果质量的最佳方法。将果蝇放在黑色解剖盘上后，将一块新鲜的双面胶带放在解剖盘上，远离幼崽，并使用一对钳子小心地将幼崽侧放在胶带上。将盘子放在立体显微镜下，用钳子去除每个幼崽的蛋白石。
使用微切除剪刀将每个幼崽皮盒切成片，使其被剥开以露出头部、胸部和前腹部部分，并固定到双面胶带的幼崽箱的边缘。用锋利的钳子刺穿每个幼崽的腹部，然后从幼崽的皮箱中取出幼崽。将幼崽放在解剖盘上，远离胶带，用 400 微升的冰冷 PBS 盖住幼崽。
用钳子抓住腹部的每一个，并使用微切除剪刀，使一个干净的横截面切口通过胸部，将幼崽切割为两半。使用两对细钳，抓住每个胸皮的切边，并逐渐撕开胸部和头部胶囊，暴露眼脑复杂和周围的脂肪组织。然后，在不抓住组织的情况下，用钳子引导每个半透明、白色、哑铃形的眼脑复合物，远离头胶囊的残余物。
解剖6至10个pae后，用干净的剃须刀刀片将微管尖端切成直径约1毫米，然后用PBS和脂肪的混合物润滑尖端。使用润滑的移液器尖端将眼脑复合物转移到冰上含有 400 微升 PBS 的九井玻璃盘中的一个井中，然后将 20 微升 PBS 中的组织转移到至少 250 微升的固定剂中，在冰上孵育 35 分钟。在固定结束时，使用相同的移液器尖端将组织转移到第三个井中，该井含有 400 微升新鲜 PBS，在冰上进行 5 到 10 分钟。
要阻止任何非特异性抗体结合，将眼脑复合物转移到400微升PBS加Triton X中，在冰上孵育10至60分钟。在孵化结束时，将原抗体溶液的10微升等分液放入72孔微井板的必要孔数中，并使用P10空气位移微移子，用PBS加Triton X润滑经过改良的0.5毫米尖端，将不超过5个眼脑复合物和不超过3微升的PBS转移到每口抗体溶液中。在4摄氏度下过夜孵育后，每次洗涤5至10分钟，在400微升PBS加Triton X的一个井中清洗样品，5至10分钟。
第三次洗涤后，将组织转移到100微升适当的二次抗体溶液中，在室温下进行两个小时的保护，然后用3个5到10分钟的PBS微升加Triton X和1个PBS洗涤。然后，在200微升安装介质中平衡样品一至两个小时。在孵化结束时，将样品转移到显微镜幻灯片上，并使用坚固的钨针将眼脑复合物固定在解剖显微镜下的幻灯片上。
然后，使用细钨针将每只眼睛从相关视叶上切开，并操纵每只眼睛到显微镜幻灯片的表面，使眼睛的基底表面与幻灯片相邻。然后，在样品上涂抹一个干净的盖玻片，然后用指甲油密封盖玻片。为了准备西方印迹分析的幼眼组织，首先解剖10至16只幼崽，如先前在两批中展示的，在PBS中相隔10至15分钟，辅以蛋白酶和磷酸酶抑制剂。
在PBS加抑制剂的冰上九孔玻璃盘的单个孔中短暂冲洗分离眼脑复合物两次后，将所有眼脑复合物转移到400微升的冰冷PBS和抑制剂中，并放入干净的黑色解剖盘中。在干净的解剖显微镜下，使用坚固的钨针和细剃刀刀片从视叶上清洁切开每只眼睛，并使用润滑尖端将眼脑复合物转移到五微升的PBS加抑制剂中，放入冰上500微升微离心管中。然后，在管中加入5微升的西组织解液缓冲液和10微升的2倍浓缩蛋白样品缓冲液。
处理用于RNA提取的眼脑复合物，戴上手套，清洁台面、显微镜、解剖工具，以及使用70%乙醇和RNase去污试剂的黑色解剖盘。在允许该区域干燥后，共解剖30至40只幼崽，分批分6至8次。每批眼脑复合物经过解剖后，将眼脑复合物从九井盘转移到400微升的新鲜、冰冷、无核酸的PBS中，用坚固的钨针和细剃刀刀片清洁切出视叶的每只眼睛。
当一批眼睛全部被移除后，将它们转移到无菌的无RNase微离心管中，并在液氮中快速冷冻样品，然后再进入下一批。幼眼是一种易于接近的组织，是研究发育过程（包括驱动形态形成的过程）的极佳模型。在幼崽形成后约40小时，细胞的最终排列达到。
这是一个理想的年龄，用于评估基因突变或改性基因表达的后果。例如，在凋亡的核心抑制剂Diap1的异位表达之后，与在控制视网膜中观察到的晶格细胞数量的增加可以进行比较。通过利用抗体激活死亡木塞-1或使用其他方法来检测垂死的细胞，也可以更直接地评估凋亡。
西方眼酸的印迹分析可用于确定感兴趣的蛋白质的存在或相对表达，或比较不同发育时间点的蛋白质表达。值得注意的是，每基因型或实验条件解剖超过60只眼睛是隔离足够高质量RNA的最佳选择。最重要的是要记住的是，幼崽视网膜是非常脆弱的，在解剖过程中必须非常小心，以确保其完整性。
