使用电子地图的光映射数据的高通量分析

多阵列和光学制图技术在心脏研究中的应用正在扩大。然而，目前缺乏的是用于分析电生理学数据的稳健、高通量开源软件。这就是为什么我们开发了名为"ElectroMap"的新软件，以帮助研究人员进行分析。

ElectroMap 采用了新的和已建立的方法来分析心脏映射数据，这些数据可以使用多个不同的摄像机、多种不同的荧光染料和不同的采集模式（包括光学映射和多电极阵列系统）从任何物种获取。除了测量标准 AP 参数（如动作电位持续时间、导电测定和形态）外，ElectroMap 还能够分析和量化活动。首先从最新的源代码版本 ElectroMap 从 GitHub 存储库下载所有文件。

将下载的内容解压缩到所需位置。打开 MATLAB 并导航到托管 ElectroMap 源代码的文件夹位置。然后打开文件电图。

m 和按编辑器中的运行以启动 ElectroMap 用户界面。接下来，要加载图像，请按选择文件夹并导航到要分析的数据文件的位置。选择要从接口中加载的文件，然后按加载图像。

加载后，将出现第一帧，红色轮廓将指示图像的自动阈值。如果需要，通过更改图像中用于阈值下拉菜单的选项，根据信号时间路线振幅修改此阈值。请注意，选择阈值后，将应用于整个图像堆栈。

如果需要，请将阈值选项更改为手动选项，该选项将激活滑块以手动调整图像阈值。此外，通过选择阈值选项以下的适当勾选框，选择感兴趣的自定义区域进行分析。请注意，从顶部菜单的 ROI 选择中可以获得感兴趣区域选择的高级选项，例如区域数。

应用适当的阈值后，按进程图像以应用处理。此时，请确保为帧速率和千赫以及像素大小（以千分尺）和信号处理选项（如窗口时间帧、空间和时间滤波）输入正确的摄像机设置。处理文件后，检查组织平均信号中由红色圆圈标记的峰值。

根据检测到的峰值对信号进行分段。按段信号。如果需要，通过放大感兴趣的时间并选择分段信号来应用信号的自定义分段。

处理图像后，生成映射按钮将变为活动状态。按生成图以应用动作电位持续时间、激活时间、传导速度和信噪比分析。从列表框中选择所需的段，以将分析应用于每个段。

接下来，选择获取像素信息以查看图像中任何像素的信号的详细显示，并将像素进行比较以同时绘制来自多达六个位置的信号。要获得对传导速度的更详细的分析，请按压传导。然后按单个向量，使用单向量法分析传导，其中梯度矢量是根据两点之间的延迟灭活时间计算的。

最后，按局部矢量以应用多向量方法，其设置与主接口中的设置相匹配。按激活曲线绘制作为时间函数激活的组织百分比。要使用 ElectroMap 量化其他参数，请从显示地图上方的下拉菜单中选择其他所需分析之一。

按单个文件分析打开专用模块，实现高吞吐量持续时间，并分析文件中每个已识别段的传导分析。对整个图像或所选区域或兴趣点执行分析。要从 ElectroMap 导出数据，请按导出值，以在主用户界面中保存当前显示的地图的值。

然后按导出地图，弹出一个包含当前显示的地图的弹出窗口，然后可以以各种图像格式保存。如果需要，通过选择颜色条图标添加颜色条。通过选择"编辑"然后选择颜色图来设置比例。

最后，按激活视频渲染激活序列的动画，该动画可以保存为动画 GIF 文件。这表明与使用先前报告的电压敏感染料记录的豚鼠心室相比，鼠皮动物的行动潜力形态。尽管动作潜力的形状不同，并且使用两个具有不同帧速率和像素大小的独立光学映射摄像机，但 ElectroMap 可以通过选择适当的参数成功分析两个数据集。

应用合奏平均代替其他方法可以改善SNR从孤立的穆林左阿里亚。起搏频率从3赫兹到10赫兹的变化并没有改变APD时，没有进行合奏平均，但观察到APD在10赫兹起搏时，从合奏平均数据测量。此外，鼠标左 atria 以 120 毫秒周期长度的步长运行，循环长度逐渐缩短 10 毫秒，直到达到 50 毫秒。

ElectroMap 可自动识别起搏周期长度，并相应地对组织平均峰值进行分组。APD 和舒张间隔缩短。光学测量峰值的振幅减少，而峰值时间增加。

该协议演示了如何在 ElectroMap 中安装和设置设置，以便快速分析动作潜在持续时间、传导速度、峰峰值变异性，以及如何组合平均值以提高信噪比。我们希望，这种免费软件的发布将有助于研究人员的分析需求，并导致心脏研究的一些重大发现。我们将继续构建我们开发的任何算法，并鼓励其他人帮助我们进一步扩展 ElectroMap 功能。