Kardiyak araştırmalarda çoklu dizi ve optik haritalama teknolojilerinin kullanımı genişlemektedir. Ancak, şu anda eksik olan elektrofizyoloji verilerinin analizi için sağlam, yüksek iş kaynağı açık kaynak yazılımdır. Bu nedenle araştırmacılara analizlerinde yardımcı olmak için ElectroMap adında yeni bir yazılım geliştirdik.
ElectroMap, birden fazla farklı kamera, birden fazla floresan boya ve optik haritalama ve çok elektrotlu dizi sistemleri de dahil olmak üzere farklı edinme yöntemleri kullanarak herhangi bir türden elde edilebilen kardiyak haritalama verilerini analiz etmek için yeni ve yerleşik yöntemler içermektedir. ElectroMap, eylem potansiyeli süresi, iletken tahlil ve morfoloji gibi standart AP parametrelerini ölçmenin yanı sıra, etkinliği analiz etmeyi ve ölçmeyi de sağlar. GitHub deposundan ElectroMap'in en son kaynak kodu sürümünden tüm dosyaları indirerek başlayın.
İndirilen içeriği istenilen konuma unzip. MATLAB'ı açın ve ElectroMap kaynak kodunu barındıran klasör konumuna gidin. Sonra dosya elektroharitasını açın.
m ve ElectroMap kullanıcı arabirimini başlatmak için editöre basın. Ardından, görüntüyü yüklemek için klasörü seçin ve analiz edilecek veri dosyasının veya dosyaların konumuna gidin. Arayüz içinden yüklenecek dosyayı seçin ve yükleme görüntülerine basın.
Yüklendikten sonra, ilk kare görüntülenir ve kırmızı bir anahat görüntünün otomatik eşiğini gösterir. İstenirse, eşik açılır menüsü için görüntüdeki seçeneği değiştirerek bunu sinyal saati ders genliğini temel alan bir eşiğe değiştirin. Eşik seçildiğinde, tüm görüntü yığını için uygulandığını unutmayın.
İstenirse, görüntü eşiğini el ile ayarlamak için kaydırıcıyı etkinleştirecek olan eşik seçeneğini kılavuza çevirin. Ayrıca, eşik seçeneklerinin altındaki uygun onay kutularını seçerek analiz için özel ilgi çekici bölge seçin. Üst menüden yg seçiminde alan sayısı gibi ilgi alanı seçimi için gelişmiş seçeneklerin mevcut olduğunu unutmayın.
Uygun bir eşik uygulandıktan sonra, işleme uygulamak için işlem görüntülerine basın. Bu noktada, doğru kamera ayarlarının mikrometrelerde kare hızı, kilohertz ve piksel boyutu ve pencere zaman çerçevesi, uzamsal ve zamansal filtreleme gibi sinyal işleme seçenekleri için girildiğinden emin olun. Dosya işlendikten sonra, kırmızı daireler tarafından etiketlenmiş doku ortalaması sinyalindeki zirveleri inceleyin.
Sinyali algılanan zirvelere göre segmente edin. Segment sinyaline basın. İstenirse, ilgi saatini yakınlaştırarak ve segment sinyalini seçerek sinyalin özel bölümlemini uygulayın.
Görüntüler işlendikten sonra, harita oluşturma düğmesi aktif hale gelecektir. Eylem potansiyeli süresi, etkinleştirme süresi, iletim hızı ve gürültü oranı analizini işaret etmek için haritalara basın. Analizleri her birine uygulamak için liste kutusundan istenen segmentleri seçin.
Ardından, görüntüdeki herhangi bir pikselden gelen sinyalin ayrıntılı bir görüntüsünü görmek için piksel bilgilerini alın ve pikselleri altı konuma kadar aynı anda işaretlerle karşılaştırın. İletim hızının daha ayrıntılı analizine erişmek için iletim tuşuna basın. Daha sonra, degrade vektörün iki nokta arasındaki gecikme inaktivasyon süresinden hesaplandığı tek vektör yöntemini kullanarak iletimi analiz etmek için tek vektöre basın.
Son olarak, çoklu vektör yöntemini ana arabirimdekilerle eşleşen ayarlarla uygulamak için yerel vektöre basın. Zaman fonksiyonu olarak aktive doku yüzdesini çizmek için aktivasyon eğrisi basın. ElectroMap kullanarak diğer parametreleri ölçmek için, ekran haritasının üzerindeki açılır menüden istenen diğer analizlerden birini seçin.
Bir dosyada tanımlanan her kesimin yüksek iş yapma süresi ve iletim analizi için özel bir modül açmak için tek dosya analizine basın. Görüntüyün tamamı nda veya seçili bölgelerde veya ilgi çekici noktalarda çözümleme yapın. ElectroMap'ten veri aktarmak için, ana kullanıcı arabiriminde görüntülenen haritanın değerlerini kaydetmek için dışa aktarma değerlerine basın.
Ardından, görüntülenen haritayı içeren ve daha sonra çeşitli görüntü biçimlerinde kaydedilebilen bir açılır pencereyi getirmek için dışa aktarma haritasına basın. İstenirse, renk çubuğu simgesini seçerek bir renk çubuğu ekleyin. Düzenleme sonra renk eşlemi seçerek ölçeği ayarlayın.
Son olarak, animasyonlu GIF dosyası olarak kaydedilebilen etkinleştirme dizisinin animasyonunu işlemek için etkinleştirme videosuna basın. Bu daha önce bildirildiği gibi voltaj duyarlı boyalar kullanılarak kaydedilen kobay ventrikül ile karşılaştırıldığında murine atria eylem potansiyel morfolojisi gösterir. Eylem potansiyelinin farklı şekline ve farklı kare hızlarına ve piksel boyutlarına sahip iki ayrı optik haritalama kamerasının kullanımına rağmen, ElectroMap uygun parametreleri seçerek her iki veri kümesini de başarılı bir şekilde analiz etmek için kullanılabilir.
Diğer yöntemler yerine topluluk ortalama uygulama izole murine sol atria SNR artırabilir. Üç hertz'den 10 hertz'e kadar olan tempo frekansında bir değişiklik, topluluk ortalaması yapılmadığında APD'yi değiştirmedi, ancak topluluk ortalaması veriden ölçüldüğünde 10 hertz pacing'de BEKLENEN BIR AZALMA GÖZlendi. Ayrıca, fare sol atria 120 milisaniyelik bir döngü uzunluğu tempolu ve döngü uzunluğu kademeli olarak 10 milisaniye kadar kısaltılmış oldu 50 milisaniye ulaştı.
ElectroMap otomatik olarak buna göre pacing döngüsü uzunluğu ve grup doku ortalama zirveleri belirlemek. APD ve diyastolik aralık kısaltılmış. Optik olarak ölçülen zirvelerin genliği azalırken, zirveye doğru zaman arttı.
Bu protokol, eylem potansiyelinin süresini, iletim hızını, tepeden tırnağına değişkenliği hızlı bir şekilde analiz etmek için ElectroMap'teki ayarları nasıl yükleyebileceğinizi ve ayarlayabileceğinizi ve ayrıca sinyalin gürültü oranını artırmak için ortalamayı nasıl oluşturabileceğinizi gösterir. Bu serbest çesitli yazilimin yayinlaþmasinun, araþtırma larının analiz ihtiyaçlarında araştırıcılara yardımcı olacak ve kardiyak araştırmalarda bazı büyük keşiflere yol açmasınğ Geliştirdiğimiz algoritmaları oluşturmaya devam edeceğiz ve ElectroMap yeteneklerini daha da genişletmemize yardımcı olması için başkalarını teşvik edeceğiz.
