免疫沉淀是一种非常强大的技术,用于分离和纯化靶蛋白。在平滑条件下,蛋白质、调节器或基质可以共同免疫沉淀。然后,可能会发现一个新的交互网络。
免疫沉淀蛋白的活性也可以评估。特别是,激酶的活性可以通过P32-ATP标签在不同基材上进行测试。然而,针对与疾病有关激酶的抑制剂的活性可以进行评估。
它们可能构成开发新药的铅化合物。这种方法可以从哺乳动物扩展到酵母或细菌。这种技术并不难。
要点:确保具有负控制,以确保检测到的交互是特定的,并仔细选择解解条件以保持相互作用和活动。小细节和手势对于确保这项技术的成功非常重要,它们永远不会在文章的材料和方法中描述。演示程序将是法比安戈丁,一个技术员从我们的实验室。
在生物安全柜内的细胞培养室中准备细胞后,使用10毫升移液器将介质从盘子中去除,并丢弃在带漂白剂的专用废物瓶中。然后,加入10毫升新鲜补充的DMEM,并在37摄氏度时将盘子放回孵化器。为了准备转染混合物,在15毫升管中,在pH 7.5下加入450微升10毫摩尔三氧化盐溶液,辅以1毫摩尔EDTA和50微升2.5摩尔氯化钙溶液。
通过反转混合。进入管中,加入一个对应于10微克血浆DNA的体积,由DNA中滴答包扩增,并稀释与该试剂盒的洗脱缓冲液,其浓度已确定。反转管子混合。
然后,在涡流搅拌器上平滑搅拌,缓慢地加入500微升的 BES 缓冲盐水2X浓缩物,一滴一滴地滴入管中。小心移动,不要干扰DNA和磷酸钙之间的复杂形成。在室温下孵育至少15分钟,或长达45分钟。
现在,将板从培养箱转移到安全柜。将准备好的DNA复合物一滴一滴地添加到盘子表面的细胞上。在37摄氏度的孵化器中孵育24至72小时。
为了防止蛋白质降解,在冰上准备解液缓冲液,考虑每个转染板的四毫升解液缓冲液。从培养箱中取出带转染细胞的盘子。取出介质并将其丢弃在专用漂白剂废瓶中。
要清洗细胞,在板的一侧添加三毫升的冷PBS滴滴,以避免分离转染细胞。轻轻旋转板,将缓冲液铺到表面上。倾斜板以取出 PBS 并将其丢弃到废瓶中。
重复一次洗涤。将盘子放在冰上。最后,小心地拆下 PBS 的其余部分。
接下来,在转染洗涤细胞中加入500微升的冷解缓冲液。摊在盘子表面。在冰上孵育10分钟。
不时地将缓冲液铺在板面上。之后,使用细胞铲刮掉表面的细胞,并在微离心管中收集。在10,000倍的G和4摄氏度下进行10分钟的离心机。
将上流液酸盐收集到新的微离心管中,并收集该分数的 50 微升等分,再收集另一个新的微离心管。此等分物将用于检查转染蛋白是否表达良好。将颗粒丢弃在垃圾桶中。
首先,轻轻重新暂停与适当抗体相结合的阿加罗斯珠的库存溶液。切开 200 微升尖端的端,使开口 1 到 2 毫米。将尖端连接到微管,并绘制 40 微升溶液,让珠子进入尖端。
向上和向下移液珠数次,使珠子饱和,以确保珠子的正确体积,并转移珠子到微离心管。加入500微升TNET缓冲液,通过反转混合,在1000倍的G和4摄氏度下离心两分钟。小心地取出上流液,并添加 500 微升的 TNET 缓冲液。
在旋转轮上孵育至少一小时,温度为4摄氏度。然后,在1000倍的G和4摄氏度下将管子离心两分钟,然后用500微升的解液缓冲液通过倒置和离心两次清洗珠子。洗涤后,将先前收集的总馏分将酸盐放入管中,并在四摄氏度的旋转轮上孵育两到四个小时。
现在,在1000倍的G和4摄氏度下,将含有免疫沉淀珠的管子离心两分钟。通过倒置和离心,用500微升的解解缓冲液洗涤珠子五次。清洗珠子时,注意不要离珠子太近,同时去除上一液。
否则,珠子将被吸气,在实验结束时,将没有更多的珠子。对于洗脱,第一台离心机在1000度G和4摄氏度下进行两分钟的离心机。使用一毫升微管小心地取出上一液。
然后,用装有水泥针的汉密尔顿注射器,取出上一滴,以避免珠子吸入。接下来,添加 40 微升 4X Laemmli 缓冲液。轻轻敲击管子,使其均匀。
在室温下孵育五分钟。然后,在10,000倍的G和室温下进行5分钟的离心机。使用汉密尔顿注射器,将上流水液转移到新的微离心管中。
储存在零下80摄氏度。HEK-293 细胞被未标记的 LIMK 2-1 或 LIMK 2 的 HA 标记等构形式之一转染。LIMK 2-1 在不同的条件下表达良好。
抗 LIMK 2-1 抗体不识别 LIMK 2a 和 LIMK 2b 等构形式,并且是特异性的,因为与控制小干扰RNA相比,当细胞与 LIMK2 小干扰RNA进行转染时,其信号会降低。在各种人类细胞系中,LIMK 2-1似乎在 HEK-293 和 HeLa 中表达,但在 C6 中不表达。利用共生沉淀实验评估LIMK2-1与上游激酶岩石的相互作用。通过转染载体编码的每个不同的蛋白质都表达得很好。
LIMK2 的三个等同形式以及幼虫 6 被有效免疫沉淀。在水线中,检测到 ROCK,因此与 LIMK2 的三个等构形式共生,但与 larp6 不一起沉淀。然后检测到的交互是特定的。
通过伽玛P32 ATP标签测试了共生素LIMK 2-1的激酶活性。LIMK 2-1没有磷酸酯共生素,而它做磷酸化米林基本蛋白,或MBP。LIMK 2-1 在此测试中有效免疫沉淀。
在进行免疫沉淀时进行负控制至关重要,以确保相互作用是特定的。必须仔细设置解液缓冲液的组成,以保持相互作用和活动。在免疫沉淀时,可评估激酶活性以计算不同的基质。
突变可能很容易引入,并可能解开特定残留物的作用。也可以进行功能研究,以了解新的突出相互作用的生理作用。细胞必须在生物安全柜内的专用培养室中培养。
P32 ATP 必须谨慎处理。防护罩可防止辐射、盖革计数器、特定废物收集、个人乳房和手指徽章,以检测放射性暴露和过滤提示。