与其他方法相比,在不知道水稀释结构和目标蛋白的形成的情况下,在定量和质量上更容易发现新的拮抗剂、激动剂和同性调节器。该协议效率高、易于处理、经济实惠且具有商业性。将这种高通量筛选方法与 ITC 分析相结合,可定量、定性地获得功能小肽。
演示程序将是赵颖和王强,我们实验室的研究生。要开始此过程,请以每毫升 10 微克的浓度在涂层缓冲液中准备 FGFR2 溶液。将溶液的一毫升加入 35 平方厘米的盘子中,反复旋转,直到表面完全湿润。
在四摄氏度下孵育过夜,摇晃。第二天,倒掉涂层溶液,加入准备好的阻解溶液。在四摄氏度下孵育至少一小时,然后丢弃阻塞溶液,用TBST快速洗盘子六次,同时确保盘子不会干涸。
在一毫升的TBST中重建原始噬菌板库,并将其添加到涂层盘中。在室温下轻轻摇动摇床板两小时。在此之后,丢弃上经剂,用TBST洗10次。
将一毫升0.2摩尔甘油HCL加入盘中,在室温下轻轻摇动10分钟,使装订的噬菌蛋白斑。将洗入消毒的微离心管中,并在 pH 9.1 下用 100 微升一摩尔 Tris-HCL 将其中和。首先,在使用前至少一小时,在37摄氏度下预热准备好的LB和IPTG X-Gal板。
使用带滤芯的移液器尖端,在 LB 中准备 100 微升十倍稀释的 Eluent。在准备好的大肠杆菌培养达到中原阶段后,将培养的200微升分液放入消毒的微离出管中,每次洗出一个洗出的稀释液。要启动感染,在含有大肠杆菌培养的管子中加入每次稀释的50微升。涡流快速孵化,在室温下孵育五分钟。
然后使用涂层棒将 LB 和 IPTG X-GAL 板涂覆为 90 微升的混合物。五分钟后,将盘子倒置,在37摄氏度下孵育。当斑块出现时,计算斑块数数。
首先,在250毫升的埃伦迈尔烧瓶中稀释20毫升LB的隔夜培养。加入未增塑的伊卢,在37摄氏度下孵育,剧烈摇晃4-1~2小时。接下来,在12,000倍G和4摄氏度的离心,10分钟。
将上一液转移到新鲜管中。使用相同条件再次离心并丢弃颗粒。将上半液的上部80%转移到新鲜管中,并加入20%聚乙烯二醇和2.5摩尔氯化钠的1/6体积。
让噬菌菌在摄氏四度下过夜。第二天,将沉淀的噬菌(金)在12,000倍和4摄氏度的温度下离心15分钟。使用相同的条件再次丢弃上一代和离心机。
使用移液器去除残留的上流液。将颗粒重新在一毫升 TBS 中,将上一液转移到微离心管中。在12,000倍G和4摄氏度的离心机5分钟。
将上流液转移到新鲜的微离心管中,再加入1/6体积的20%聚乙二醇和2.5摩尔氯化钠,再次沉淀。在冰上孵育15至60分钟。接下来,在12,000倍的G和4摄氏度的离心机10分钟。
使用相同的条件再次丢弃上一代和离心机。使用移液器去除残留的上流液。将颗粒重新在 200 微升 TBS 和离心机中再多一分钟,以去除杂质。
然后将上流液转移到新鲜的微离心管中,以获得放大的吸水器。在这项研究中,噬菌蛋白的数量保持不变,而FGFR2蛋白的涂层浓度逐渐减少。噬菌体滴度结果表明,恢复的噬菌体数量逐渐增加,三轮后,与第一轮相比增加了65倍。
然后进行 ITC 实验,以测量小肽与 FGFR2 的亲和力。结果表明,SP1肽对FGFR2具有很高的亲和力。此数据证明了筛选协议的效率。
为了研究SP1肽的生物活性,使用CCK-8试剂盒进行成纤维细胞增殖测定。BALB/C3T3与SP1肽在不同浓度下孵育。结果表明,SP1肽抑制细胞的生长。
这里必须避免野生型噬菌体的污染。确保使用防气溶胶移液器尖端。而通过获得噬菌的扩增而生长。
此过程还可用于筛选与碳水化合物、培养细胞和组织结合的小肽。这些肽可以进一步放大诊断和靶向