通过融合对化学物种反应的计算三维几何建模。是研究树突脊柱内和外树突的受体贩运机制的有用方法，是做突触可塑性。此技术的优点是创建丰富的环境，用于对具有大量变量的非线性系统进行假设和预测。
使用修改后的球体创建具有脊柱头和脊柱颈部的单个树突脊柱的网格。第一次打开搅拌机。在键盘上已安装 Cell Blender 并按 5 键，从透视更改为正交视图。
按 1 更改为前视图，按 Shift C 以居中光标。要创建脊柱头部，请按 Shift A 打开"网格"调色板，然后选择"网格"。选择 UV 球体并在添加 UV 球体中，将大小设置为 0.25，将环设置为 32。
要使头部顶部平坦，请按 Tab 将搅拌机从对象模式切换到"编辑"模式。按 B 选择球体的前三个季度，然后按"删除"，选择"顶点"和"输入"以删除顶点。按 B 并选择球体的顶部。
按 E、S、0 和 Enter 以密封仍所选的顶点的顶部。向下移动蓝色箭头以对齐脊柱头的顶部。要增加脊柱顶部的网格分辨率，请选择"工具和刀"，然后使用刀在顶部中心周围切割一个圆圈。
然后选择"工具和循环切割"并滑动四次，以围绕顶部中心创建四个同心圆。要创建脊柱颈部，请按 B 并选择网格的底部。按"删除顶点"和"B"并选择网格的底部。
按 E 和 Z 并选择负 0.45 以在负 0.45 微米时创建到 Z 轴位置的拉伸。要使网格与 M 单元格兼容，请按 Ctrl T 对网格进行三角测量，然后选择"工具"和"删除双倍"。要创建多个脊椎 Dendrite，请按 Shift A 打开网格调色板并选择"网格"和"圆柱"。
在"添加圆柱体"菜单中，将半径 0.3 微米和深度设置为两微米，然后按 Enter。 按 R 并输入 90 以旋转圆柱体 90 度，然后使用蓝色箭头将圆柱体拖动到脊柱底部。按 3 可获取圆柱体的前视图，然后按 Z 使网格透明。
使用蓝色法线箭头将脊柱底部移动到圆柱体内部，右键单击以选择 Dendrite。选择修改器和添加修改器，然后选择"布尔"，"操作联合"，然后选择对象脊柱。单击"应用"以创建登狄石和脊柱的关节网格。
然后使用鼠标选择隔离脊柱的网格，更改位置和角度以将每个新脊柱插入生理位置。要创建 AMPAR，请选择分子并插入新分子。将名称更改为 AMPAR，将分子类型更改为表面分子。
然后将扩散常数 0.05 倍 10 更改为 8 平方厘米/秒。要绘制与 AMPAR 绑定的锚点，在基础条件期间在 PSD1 下，请打开"绘图输出设置"并按以定义分子。然后将分子设置为Anchor_AMPAR，将对象设置为登狄石，将区域设置为 PSD1。
要运行基础条件模拟，请选择"运行模拟"。将迭代设置为 30，000，将时间步长设置为 1 倍 10 到负 3 秒。单击"导出并运行"并等待模拟结束。
在模拟结束时，选择"重新加载可视化数据"、播放动画、绘制输出设置和绘图以可视化空间时间结果。要运行同性突触电位条件，选择分子放置rel_anchorLTP_psd1。选择rel_anchorLTP_psd1，将"数量"更改为"200"。
然后将"数量"更改为"释放"为"零"。选择rel_anchor_psd1。将数量更改为零，并运行模拟，正如刚才演示的。
突触可塑性可以通过每个脊柱锚点固定数量的 AMPAR 数量的变化大致验证。用于精确计算突触可塑性的发生。建议计算突触上锚定和自由安培的总数的变化。
AMPAR同性突触和凹陷可以通过分别增加和减少锚定安培的数量来验证，这些安培的亲和力与基底条件相比，由锚点引起的亲和力发生变化。例如，单一脊柱的同性突触长期电能诱导，在相邻脊柱上产生异质突触长期抑郁效应。按照此过程，可以扩展模型，以调查登得利脊柱的 LTP 和 LTD 感应过程。
此方法允许测试有关具有大量变量的复杂非线性系统功能的假设。
