我们的协议使我们能够在它们的家中直接对微生物化学进行可靠的量化。因此,我们可以分离微生物,我们可以更好地量化和理解代谢潜力。原位化学测定,简言之,ISCA是一种灵活、用户友好和简单的设备,能够对微生物行为有新的洞察,从而发现微生物在任何具有液相的环境中的作用和功能。
Estelle Clerc 是实验室和现场部署程序,他目前是我的研究小组的博士生。在准备化学分析器之前,使用 0.2 微米过滤器过滤介质,然后自动解过滤过滤溶液。接下来,在无菌介质的1毫升中准备10毫升的化疗剂溶液,用0.2微米的注射器过滤器过滤化疗溶液,以去除任何颗粒和潜在的污染物。
然后,根据实验方案,对过滤的化学刺激性库存溶液进行系列稀释。要填充 ISCA,请将 27 量针连接到 1 毫升注射器,并加载一个注射器,以处理过滤的化疗物的每个浓度。将设备与端口朝上,缓慢地将物质的每个浓度注入设备一排的五个孔中,直到每个端口的顶部出现一个小液滴。
当所有水井都填好后,将感兴趣的海洋或淡水细菌培养的1.5毫升转移到150毫升的适当细菌培养培养介质中。接下来,在 200 毫升容量托盘的平面上放置两小块双面胶带。将一个 ISCA 固定到每根磁带上。
使用 50 毫升血清移液器,慢慢用细菌溶液填充部署托盘。并允许细菌对感兴趣的化疗反应一小时。要结束分析,请使用新的 50 毫升移液器轻轻地从 ISCA 托盘中取出介质。
要检索样本,请首先定位 ISCA,使端口朝下。接下来,使用无菌的 1 毫升注射器,配备 27 量针,从每一个井中抽出溶液。将相同浓度的每一行样品拉入一根管中。
然后,通过流式细胞学分析样品,以确定每个化疗物浓度吸引的细菌数量。为了准备用于现场部署的 ISCA,首先,从现场一侧收集每个 ISCA 5 毫升的水,并通过 0.2 微米注射器过滤器将水过滤到 50 毫升锥形管中。将注射器过滤水通过亲水性 GP 滤芯两次,每次冲洗后,将滤液收集到新的 50 毫升锥形离心管中。
然后,通过0.02微米注射器过滤器将水过滤到新的50毫升管中。使用滤液的等分,将所有感兴趣的化疗物重新被重新暂停到单个 15 毫升锥形管中所需的浓度。然后使用10毫升注射器,通过单独的0.2微米注射器过滤器过滤重新悬浮的化疗剂,进入无菌的15毫升锥形离心管中,以去除任何不需要的颗粒或水不溶性化合物。
对于 ISCA 现场部署,将每个 ISCA 拧到设备机柜的第 9 块上,然后关闭机柜。用胶带密封外壳,并使用蹦极绳将外壳固定到部署臂和人类制造的结构上。或者,在浅基板上或附着在中上层的网上,可以用少量重量固定外壳。
完全淹没机柜以启动填充,牢牢握住外壳,防止内部过度水运动。一旦水位达到外壳的顶部,请确保内部没有空气。当机柜完全满时,用两个插头密封底部孔和顶孔。
然后,将 ISCA 留在就地 1 到 3 小时。在采样期结束时,从水中拆下外壳。将外壳放在容器上以排出水,并小心地从前孔中取下胶带的上部。
一旦水管通过 ISCA 顶部以下,拆下底部塞子并排干其余水。当 ISCA 仍连接到外壳时,请使用 1 毫升移液器或 1 毫升注射器小心地去除每个 ISCA 顶部的水,并在不接触上表面的情况下取出 ISCA。然后使用一次性擦拭去除表面剩余的液体,并检索样品,如实验室样品检索所示。
在这个具有代表性的体外分析中,1毫摩尔被确定为最佳谷氨酰胺部署浓度,因为它诱发了比过滤的海水控制高18倍的显著化疗反应。谷氨酰胺的浓度较高和较低也诱发显著但较弱的化疗反应。在这项现场部署分析中,在澳大利亚悉尼附近的一个沿海地点部署了5个装满1毫摩尔谷氨酰胺的SCA复制物,进行了1小时。
填充谷氨酰胺的SCA吸引的细菌比充满过滤海水的控制井多近三倍。在实验室和现场部署 ISCA 时,要记住的最重要的事情是避免产生可防止化疗的强流体流。ISCA衍生样品可用于识别特定生物体或基因,描述化疗生物体的基因组潜力,以及针对选择性介质的特定菌株进行定向分离。