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JoVE Journal

Environment

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In Situ Chemotaxis Assay to Examine Microbial Behavior in Aquatic Ecosystems

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07:23 min

May 5th, 2020

May 5th, 2020

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0:04

Introduction

0:51

Chemical of Interest Preparation and In Situ Chemotaxis Assay (ISCA) Filling for Lab Deployment

1:49

Lab Deployment

2:37

Laboratory Sample Retrieval

3:09

Field Chemoattractant Preparation

4:12

Field Deployment

5:55

Results: Representative In Vitro and Field Microbial Chemotaxis Analyses

6:41

Conclusion

Transcrição

Our protocol enables us to robustly quantify microbial chemotaxis directly in their home habitat. And thereby we can isolate microorganisms and we can better quantify and understand the metabolic potential. The in situ chemotaxis assay, or ISCA in

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Presented here is the protocol for an in situ chemotaxis assay, a recently developed microfluidic device that enables studies of microbial behavior directly in the environment.

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