将配体建模为源自电子冷冻显微镜的图谱

我们感兴趣的是了解整个细胞中发生的生理过程，特别是在膜界面处。我们使用冷冻电镜作为主要技术，并研究各种有趣和具有挑战性的生物学问题，研究多种大分子复合物。几十年前，确定膜蛋白和其他不稳定复合物的结构具有挑战性。

然而，冷冻电镜（一种新型洗涤剂和脂质模拟物）的技术进步为这些复合物的快速结构测定铺平了道路。这些结构现在可以以高分辨率获得，并有可能用于药物发现。在单粒子冷冻电子显微镜中，挑战包括获取稳定和均匀的样本、在薄冰中以随机方向嵌入样本、处理大量低信噪比的图像，以及在 3D 重建过程中准确确定角度取向和分类。

由于数据中固有的噪声以及各向同性且图谱分辨率低、样品异质性和配体灵活性，因此在配体蛋白复合物的冷冻电镜图谱中识别和建模小分子具有挑战性。该协议是在低至中分辨率冷冻电镜中识别和建模配体和溶剂分子的分步指南。