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Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

PtGen2 is a 26,496 feature cDNA microarray containing amplified loblolly pine ESTs.  The array is produced in our laboratory for use by researchers ...

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An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (<em>P. taeda</em> L.) and Other Conifer Species

Tissues isolated from conifer species, particularly those belonging to the Pinaceae family, such as loblolly pine (Pinus taeda L.), contain high ...

University of Georgia (UGA)

&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x5168;&#x7403;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5206;&#x6790;&#x662F;&#x7531;&#x4E8E;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x5DE5;&#x5177;&#x5177;&#x6709;&#x6311;&#x6218;&#x6027;&#x3002;PtGen2&#xFF0C;26,496 &#x529F;&#x80FD;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#xFF0C;&#x662F;&#x634F;&#x9020;&#xFF0C;&#x5E76;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BC4;&#x4F30;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x7E41;&#x6B96;&#x4F53;&#x6839;&#x5E72;&#x65F1;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x52A0;&#x6743;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x7F51;&#x7EDC;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x5E72;&#x65F1;&#x654F;&#x611F;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x8FA8;&#x522B;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x6297;&#x65F1;&#x6027;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x65E0;&#x6807;&#x5EA6;&#x7F51;&#x7EDC;&#x786E;&#x5B9A;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x5E72;&#x65F1;&#x5F3A;&#x8C03;&#x6839;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x4F53;&#x80B2;&#x706B;&#x70AC; L.&#xFF09; &#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;

Global transcriptional analysis of loblolly pine (Pinus taeda L.) is challenging due to limited molecular tools. PtGen2, a 26,496 feature cDNA microarray, was fabricated and used to assess drought-induced gene expression in loblolly pine propagule roots. Statistical analysis of differential expression and weighted gene correlation network analysis were used to identify drought-responsive genes and further characterize the molecular basis of drought tolerance in loblolly pine.

Microarray analysis and scale-free gene networks identify candidate regulators in drought-stressed roots of loblolly pine (P. taeda L.).

Analyse globale de la transcription de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) est difficile en raison de l&#x26;#39;insuffisance des outils mol&#xE9;culaires. PtGen2, un micror&#xE9;seau d&#x26;#39;ADNc 26496 fonctionnalit&#xE9;, a &#xE9;t&#xE9; fabriqu&#xE9; et utilis&#xE9; pour &#xE9;valuer l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes induite par la s&#xE9;cheresse dans les racines de pins &#xE0; encens de propagules. L&#x26;#39;analyse statistique de l&#x26;#39;expression diff&#xE9;rentielle et l&#x26;#39;analyse de r&#xE9;seau pond&#xE9;r&#xE9;e g&#xE8;ne de corr&#xE9;lation ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour identifier les g&#xE8;nes sensibles &#xE0; la s&#xE9;cheresse et de mieux caract&#xE9;riser la base mol&#xE9;culaire de la tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse chez le pin &#xE0; encens.

Analyse de Microarray et des r&#xE9;seaux de g&#xE8;nes sans &#xE9;chelle identifier des r&#xE9;gulateurs candidats dans la s&#xE9;cheresse de stress Racines de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.)

Transkriptionelle Gesamtanalyse der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.) ist eine Herausforderung aufgrund der begrenzten Molekulare Werkzeuge. PtGen2, ein 26.496 Feature cDNA-Microarray, war hergestellt und zur Bewertung der D&uuml;rre-induzierte Genexpression in Loblolly Pine Diaspore Wurzeln verwendet. Statistische Analyse der differenziellen Ausdruck und gewichteten Gen Korrelation Netzwerkanalyse wurden zur D&uuml;rre-responsive Gene zu identifizieren und weitere charakterisieren die molekulare Basis Trockenheitstoleranz Loblolly Pine.

Microarray Analyse und skalenfreies gen Netzwerke identifizieren Kandidaten Regulatoren in D&uuml;rre-betonte Wurzeln der Weihrauch-Kiefer (p. Taeda L.).

Analisi globale di transcriptional del loblolly pine (Pinus taeda L.) sono difficile a causa della limitata strumenti molecolari. PtGen2, un 26.496 caratteristica cDNA microarray, &egrave; stato fabbricato e utilizzato per valutare l&#39;espressione genica indotta da siccit&agrave; nelle radici propagule loblolly pine. Analisi statistica dell&#39;espressione differenziale e analisi di rete di correlazione ponderata gene sono stati utilizzati per identificare i geni sensibili alla siccit&agrave; e caratterizzare ulteriormente le basi molecolari della tolleranza alla siccit&agrave; in loblolly pine.

Analisi di Microarray e reti scale-free gene identificano regolatori candidato nella siccit&agrave;-ha sottolineato le radici di pino loblolly (p. taeda L.).

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x8EE2;&#x5199;&#x89E3;&#x6790;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x5206;&#x5B50;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6311;&#x6226;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; PtGen2&#x3001;26496&#x6A5F;&#x80FD;cDNA&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306F;&#x3001;&#x88FD;&#x4F5C;&#x3057;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x7E41;&#x6B96;&#x306E;&#x6839;&#x3067;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x3068;&#x91CD;&#x307F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x76F8;&#x95A2;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4E7E;&#x71E5;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x76E4;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;&#x3068;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x30D5;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C4;&#xFF08;P.&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;

&#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; transcriptional &#xBD84;&#xC11D;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC758; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xBD84;&#xC790; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC804; &#xC774;&#xB2E4;. PtGen2, 26,496 &#xAE30;&#xB2A5; cDNA microarray &#xC870;&#xC791; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; propagule &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xD1B5;&#xACC4; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F;&#xAC00; &#xC911;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBD84;&#xC11D; &#xAC00;&#xBB44; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xCD94;&#xAC00; &#xD2B9;&#xC131; &#xAC00;&#xBB44; &#xAD00;&#xC6A9;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;.

Microarray &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xADDC;&#xBAA8; &#xBB34;&#xB8CC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130; (P. taeda L.)&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBFCC;&#xB9AC; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD588;&#xB2E4;.

An&#xE1;lisis global de la transcripci&#xF3;n de pino taeda (Pinus taeda L.) es un reto debido a la escasez de herramientas moleculares. PtGen2, un microarray de 26.496 funci&#xF3;n de ADNc, se fabric&#xF3; y se utiliza para evaluar la sequ&#xED;a inducida por la expresi&#xF3;n de genes en las ra&#xED;ces de pino taeda de prop&#xE1;gulos. El an&#xE1;lisis estad&#xED;stico de la expresi&#xF3;n diferencial y el an&#xE1;lisis ponderado de la correlaci&#xF3;n gen&#xE9;tica de la red se utiliza para identificar genes de respuesta a la sequ&#xED;a y caracterizar las bases moleculares de la tolerancia a la sequ&#xED;a en el pino de incienso.

An&#xE1;lisis de microarrays y redes libres de escala de genes reguladores Identificar candidatos en la sequ&#xED;a estr&#xE9;s ra&#xED;ces del pino tea (P. taeda L.)

Yuan-Sheng Yu

Warnell School of Forestry and Natural Resources

University of Georgia (UGA)

Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (P. taeda L.) and Other Conifer Species

Yuan-Sheng Yu

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Warnell School of Forestry and Natural Resources

University of Georgia (UGA)

Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (P. taeda L.) and Other Conifer Species

Warnell School of Forestry and Natural Resources