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Wir präsentieren detaillierte Protokolle für die Durchführung von Kleinwinkel-Röntgenbeugungsexperimenten mit intakten Mausskelettmuskeln. Mit der breiten Verfügbarkeit von transgenen Mausmodellen für menschliche Krankheiten kann diese experimentelle Plattform ein nützliches Prüffeld für die Aufklärung der strukturellen Grundlagen genetischer Muskelerkrankungen bilden.
Transgene Mausmodelle waren wichtige Werkzeuge für die Untersuchung der Beziehung des Genotyps zum Phänotyp für menschliche Krankheiten, einschließlich der skelettierten Muskeln. Es hat sich gezeigt, dass der Skelettmuskel der Maus hochwertige Röntgenbeugungsmuster auf Synchrotronstrahllinien der dritten Generation erzeugt, die die Möglichkeit bieten, Veränderungen auf der Ebene des Genotyps mit funktionellen Phänotypen in Gesundheit und Krankheit zu verknüpfen, indem die strukturellen Folgen genetischer Veränderungen. Wir präsentieren detaillierte Protokolle für die Vorbereitung von Proben, das Sammeln der Röntgenmuster und das Extrahieren relevanter struktureller Parameter aus den Röntgenmustern, die Experimentatoren helfen können, die solche Experimente selbst durchführen möchten.
Synchrotron-Kleinwinkel-Röntgenbeugung ist die Methode der Wahl, um die nm-Skalastruktur von aktiv anklebenden Muskelpräparaten unter physiologischen Bedingungen zu untersuchen. Wichtig ist, dass strukturelle Informationen aus lebenden oder gehäuteten Muskelpräparaten synchron mit physiologischen Daten wie Muskelkraft- und Längenänderungen gewonnen werden können. Das Interesse an der Anwendung dieser Technik ist gestiegen, um die strukturelle Nerbbasis von erblichen Muskelerkrankungen zu untersuchen, die ihre Grundlage in Punktmutationen in sarkomischen Proteinen haben. Die Muskelbiophysik-Gemeinschaft war sehr aktiv bei der Generierung transgener Mausmodelle für diese menschlichen Erkrankungen, die ideale Testbetten für Strukturstudien bieten könnten. Jüngste Veröffentlichungen aus unserer Gruppe1,2,3 und andere4,5 haben gezeigt, dass die Röntgenmuster aus dem Mausextensor digitorum longus (EDL) und soleus Muskeln alle Beugungsinformationen von traditionelleren Modellorganismen wie Frosch- und Kaninchenpsoas Skelettmuskel. Ein Vorteil der Maus Skelettmuskelvorbereitung ist die einfache Zerlegung und Durchführung grundlegender membranintakter, ganzer muskelphysiologischer Experimente. Die Abmessungen des sezierten Muskels haben genügend Masse, um sehr detaillierte Muskelmuster in sehr kurzen Röntgenbelichtungszeiten (Millisekunde pro Frame) auf Röntgenstrahllinien der dritten Generation zu ergeben.
Muskel-Röntgen-Beugungsmuster bestehen aus den äquatorialen Reflexionen, den Meridionalreflexionen sowie den Schichtlinienreflexionen. Das äquatoriale Intensitätsverhältnis (Verhältnis der Intensität der äquatorialen Reflexionen 1,1 und 1,0, I11/I10), ist eng korreliert mit der Anzahl der angebrachten Querbrücken, die proportional zur Kraft ist, die im Skelettmuskel der Maus erzeugt wird. 2. Die Meridionalreflexionen, die Periodizitäten innerhalb der dicken und dünnen Filamente melden, können verwendet werden, um die Erweiterbarkeit des Filaments1,3,6,7zu schätzen. Beugungsmerkmale, die nicht am Meridian und am Äquator liegen, werden Schichtlinien genannt, die aus den etwa helisch geordneten Myosinköpfen auf der Oberfläche des dicken Filamentrückgrats sowie den etwa helisch geordneten dünnen Filamenten entstehen. Die Intensität der Myosin-Schichtlinien ist eng mit dem Grad der Reihenfolge der Myosinköpfe unter verschiedenen Bedingungen2,8verbunden. Alle diese Informationen können verwendet werden, um das Verhalten von sarkomischen Proteinen in situ bei Gesundheit und Krankheit zu untersuchen.
Synchrotron-Röntgenbeugung des Muskels wurde in der Vergangenheit von Teams von hochspezialisierten Experten durchgeführt, aber Fortschritte in der Technologie und die Verfügbarkeit neuer Datenreduktionstools zeigen, dass dies nicht immer der Fall sein muss. Die BioCAT Beamline 18ID an der Advanced Photon Source, Argonne National Laboratory verfügt über engagierte Mitarbeiter und Support-Einrichtungen für die Durchführung von Muskel-Röntgen-Beugungsexperimenten, die Neuankömmlingen auf dem Gebiet helfen können, mit diesen Techniken zu beginnen. Viele Benutzer entscheiden sich für eine formelle Zusammenarbeit mit BioCAT-Mitarbeitern, aber immer mehr Anwender finden, dass sie die Experimente und Analysen selbst durchführen können, um die Belastung des Beamline-Personals zu verringern. Das primäre Ziel dieses Papiers ist es, Schulungen anzubieten, die potenziellen Experimentatoren die Informationen liefern, die sie benötigen, um Experimente am Skelettmuskelsystem der Maus entweder an der BioCAT-Beamline oder an anderen Hochflussstrahllinien um die Welt, in der diese Experimente möglich wären.
Alle Tierversuchsprotokolle wurden vom Illinois Institute of Technology Institutional Animal Care and Use Committee (Protokoll 2015-001, Genehmigungsdatum: 3. November 2015) genehmigt und folgten dem NIH "Guide for the Care and Use of Laboratory Animals"9 .
1. Vorbereitung vor dem Experiment
2. Muskelvorbereitung
3. Röntgenbeugung
HINWEIS: Die folgende Beschreibung gilt für Röntgenbeugungsexperimente, die mit dem Kleinwinkel-Röntgenbeugungsgerät an der BioCAT-Beamline 18ID am Advanced Photon Source, Argonne National Laboratory durchgeführt wurden, aber ähnliche Methoden könnten auf anderen Beamlines angewendet werden. wie ID 02 beim ESRF (Frankreich) und BL40XU bei SPring8 (Japan). Beamline 18ID wird mit einer festen Röntgenstrahlenergie von 12 keV (0,1033 nm Wellenlänge) mit einem einfallenden Fluss von 1013 Photonen pro Sekunde im Vollstrahl betrieben.
4. Muskelbehandlung nach dem Experiment
Isometrische tetanische Kontraktion. Jede Art von klassischen muskelmechanischen Experimenten, wie isometrische oder isotonische Kontraktionen, kann bei gleichzeitiger Erfassung von Röntgenmustern durchgeführt werden. Abbildung 1 A zeigt den Versuchsaufbau für mechanische und Röntgenexperimente. Eine Beispielkraftspur für eine isometrische tetanische Kontraktion ist in Abbildung 1Bdargestellt. Der Muskel wurde bei der Ruhe für 0,5 s gehalten, bevor für 1 s aktiviert. Die mechanische Aufnahme stoppt 1 s nach dem Stimulus. Die Röntgenmuster wurden kontinuierlich während des Protokolls bei 1 ms Belichtungszeit bei 500 Hz gesammelt.
Röntgenbeugungsmuster. Das Muskel-Röntgen-Beugungsmuster kann Nanometer-Auflösung strukturelle Informationen von Strukturen innerhalb des Sarcomere geben. Muskel-Röntgen-Beugungsmuster bestehen aus vier äquivalenten Quadranten geteilt durch den Äquator und den Meridian. Das äquatoriale Muster ergibt sich aus der Myofilament-Verpackung innerhalb des Sarcomeres senkrecht zur Faserachse, während die Meridionalmuster strukturelle Informationen aus den Myofilamenten entlang der Muskelachse melden. Die übrigen Reflexionen, die nicht auf dem Äquator oder dem Meridian stehen, werden Als Schichtlinien bezeichnet. Schichtlinien (z. B. Merkmale mit den Bezeichnungen MLL4 und ALL6 in Abbildung 2A) ergeben sich aus der annähernd-helischen Anordnung molekularer Untereinheiten innerhalb des Myosins, das dicke Filamente und den Aktin mit dünnen Filamenten enthält. Die myosinbasierten Schichtlinien sind stark und scharf in Mustern aus ruhenden Muskeln (Abbildung 2A), während aktinbasierte Schichtlinien in Mustern aus der Ankiskung von Muskelgruppen stärker hervortreten (Abbildung 2B). Differenzmuster, die durch Subtraktion des Ruhemusters vom Kontraktusmuster (Abbildung 2C) gewonnen werden, können Licht auf strukturelle Veränderungen während der Kraftentwicklung bei gesunden und kranken Muskeln werfen. Durch die Verfolgung dieser strukturellen Veränderungen auf der Millisekunden-Zeitskala der molekularen Ereignisse während der Muskelkontraktion können die Röntgenbeugungsmuster wesentliche strukturelle Informationen offenbaren (Abbildung 2D).
Datenanalyse mit MuscleX. Hier ist ein Beispiel für äquatoriale Reflexionsanalysen mit der "Äquator"-Routine im MuscleX-Paket (Abbildung 3). MuscleX ist ein Open-Source-Analyse-Softwarepaket, das bei BioCAT13entwickelt wurde. Das äquatoriale Intensitätsverhältnis (I1,1/I1,0) ist ein Indikator für die Nähe von Myosin zu Actin im ruhenden Muskel (Abbildung 3A), während es eng mit der Anzahl der angebrachten Querbrücken in der Kontraktion korreliert ( Abbildung 3B) muriner Skelettmuskel2. Das Intensitätsverhältnis, I1,1/I1,0, beträgt etwa 0,47 im ruhenden Muskel und etwa 1,2 bei der Muskelkontraktion. Der Abstand zwischen den beiden 1,0 Reflexionen (2*S1,0) hängt umgekehrt mit dem Zwischenfilamentabstand zusammen. Ausführliche Dokumentationen und Handbücher für MuscleX sind online verfügbar13.
Abbildung 1 : Mechanische und Röntgenexperiment Setup und Protokoll. (A) Der Muskel ist an einem Ende an einem Haken innerhalb der Versuchskammer und am anderen Ende an einem Dual-Mode-Motor/Kraftwandler befestigt. Es wird zwischen zwei Kapton-Filmfenstern gehalten, damit die Röntgenstrahlen passieren können. Die Kammer wird mit Ringer-Lösung gefüllt, die während des Experiments mit 100% Sauerstoff durchsetzt ist. (B) Das mechanische Protokoll für Röntgenexperimente an einem Muskel während der tetanischen Kontraktion. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 2 : EDL-Röntgenbeugungsmuster. EDL Muskel Röntgen beugung Muster aus der Ruhe (A) und Kontraktion (B) Muskel. (C) Das Unterschiedsmuster zwischen Ruhe- und Kontraktmuster. Der blaue Bereich zeigt eine hohe Intensität im Ruhemuster an, während der gelbe Bereich eine hohe Intensität im Kontraktmuster darstellt. (D) Röntgenbeugungsmuster aus einer 1 ms Exposition mit EDL-Muskel. MLL1 = Myosin-Layer-Linie erster Ordnung; MLL4 = Vierte Reihenfolge Myosin-Layer-Linie; ALL1 = Aktin-Layer-Linie erster Ordnung ALL6 = Aktin-Layer-Linie sechster Ordnung; ALL7 = Aktin-Layer-Linie siebter Ordnung; Tm = Tropomyosin-Reflexion (angezeigt durch eine weiße Box); M3 = Meridionalreflexion dritter Ordnung; M6 = Meridionalreflexion der sechsten Ordnung. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 3 : Datenanalyse äquatorialer Muster mit MuscleX. Das im Hintergrund subtrahierte äquatoriale Intensitätsverhältnisprofil (während Fläche) und die ersten fünf Orders (grüne Linien) waren geeignet, die Intensität jedes Peaks zu berechnen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Jüngste Veröffentlichungen unserer Gruppe zeigten, dass Röntgenmuster aus dem Mausskelettmuskel verwendet werden können, um lichtdurcht sarkomische Strukturinformationen aus Der muskuehrlichen Gesundheit und Krankheit1,2,3 vor allem mit die erhöhte Verfügbarkeit genetisch veränderter Mausmodelle für verschiedene Myopathien. Hochauflösende mechanische Studien an einzelnen Fasern oder kleinen Bündeln in Kombination mit Röntgenbeugung werden am besten von Experten durchgeführt. Wenn jedoch bescheidenere mechanische Informationen für Ihre Zwecke ausreichen, ermöglicht die gesamte Muskelvorbereitung das Sammeln detaillierter Röntgenmuster aus einer einfachen Zubereitung.
Eine saubere Sezierung ist der Schlüssel zu einem erfolgreichen kombinierten mechanischen und Röntgenexperiment. Es ist sehr wichtig, nicht auf dem Zielmuskel sowie andere Muskeln mit dem Sohle oder EDL Muskeln während der Zerlegung verbunden ziehen, da dies Teile des Muskels reißen und zu reduzierter Kraft führen könnte. Es kann auch zu beschädigten inneren Struktur führen, die die Röntgenmuster verschlechtern wird. Da alles im Röntgenstrahl streuen wird, ist es wichtig, jedes zusätzliche Fett, das Kollagen in Faszien sowie alle Haare oder lose Teile des Gewebes zu reinigen, während das folgende Protokoll zu tun. Um die zusätzliche Compliance in der Muskelvorbereitung zu reduzieren, ist es auch wichtig, die Sehnen sicher an die Haken zu binden, so nah wie möglich am Muskelkörper, ohne ihn zu beschädigen.
Verschiedene Röntgenbelichtungszeiten können verschiedene Arten von Informationen aus dem gleichen Muskel liefern. Mit dem Vollstrahl auf 18ID kann ein analyzierbares äquatoriales Muster in einer 1 ms Exposition erhalten werden (siehe Abbildung 2D). Für eine analyzierbare erste Myosin-Schicht-Linienreflexion ist in der Regel eine Gesamtbelichtungszeit von 10 ms erforderlich. Um Merireflexionen höherer Ordnung wie m15 (2,8 nm Myosin-Merireflexion) und 2,7 nm Aktin-Merireflexion zu sammeln, ist in der Regel mindestens 1 s Gesamtbelichtung erforderlich, aber mehr als 2 s Gesamtbelichtung wird für hohe Genauigkeit empfohlen Messungen.
Die Wahl des optimalen Röntgendetektors für das Experiment ist wichtig. Für die detailliertesten Röntgenmuster kann ein kundenspezifischer CCD-Detektor, wie der bei BioCAT mit ca. 40-m-Pixeln und Punktstreufunktionen von ca. 65 m im Phosphor, Muster mit hohem Dynamikumfang und guter räumlicher Auflösung liefern, kann aber jeweils nur einen Frame aufnehmen. Für zeitaufgelöste Experimente kann der Photonenzählpixel-Array-Detektor bei BioCAT Röntgenmuster bei 500 Hz sammeln. Die 172-mm-Pixelgröße mit diesem Detektor bietet jedoch keine ausreichende räumliche Auflösung für detaillierte Untersuchungen des inneren Teils des Meridians, ist aber für die meisten anderen Zwecke ausreichend. BioCAT erwarb einen hochauflösenden Photonenzähldetektor mit einer realen Auflösung von 75 m bei einer maximalen Bildrate von 9.000 Hz. Ähnliche Detektoren dieses Typs sollen in den nächsten Jahren Stromdetektoren für Muskelstudien verdrängen.
Angesichts der sehr hohen Röntgenströme bei Synchrotronen der dritten Generation ist eine Strahlenschädigung ein ernstes Problem. Es ist immer eine gute Wahl, den Strahl zu dämpfen, um nicht mehr Strahl zu liefern, als benötigt wird, um die gewünschten Beugungsmerkmale zu beobachten. Die gleiche Gesamt-Röntgenexposition kann erreicht werden, indem die Belichtungszeit von einem abgeschwächten Strahl verlängert wird. Ein Vorteil von Photonenzählpixel-Array-Detektoren ist, dass einzelne Frames ohne Rauschstrafe zusammengefasst werden können. Auch dann sind Strahlenschäden möglich. Anzeichen von Strahlungsschäden sind Tropfen der maximalen Kraft der Kontraktion, Verschmieren von SchichtLinie Reflexionen, sogar Änderung der Muskelfarbe.
Eine der Einschränkungen der intakten Maus Skelettmuskelvorbereitung ist die Schwierigkeit, Sarcomere Länge aus dem intakten Muskel während der Experimente zu erhalten. Die Muskeln sind zu dick für Videomikroskopie und Laserbeugung. Während es bei zukünftigen Entwicklungen möglich sein könnte, die Sarcomere-Länge direkt aus den Beugungsmustern14abzuschätzen, besteht kurzfristig die einzige Möglichkeit darin, sie nach dem Hier beschriebenen Experiment zu messen.
Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden finanziellen Interessen haben.
Diese Forschung nutzte Ressourcen der Advanced Photon Source, einer Us-Energieabteilung (DOE) Office of Science User Facility, die für das DOE Office of Science von Argonne National Laboratory unter Vertrag Nr. DE-AC02-06CH11357. Dieses Projekt wurde durch das Stipendium P41 GM103622 vom National Institute of General Medical Sciences der National Institutes of Health unterstützt. Die Verwendung des Pilatus 3 1M Detektors erfolgte durch Zuschuss 1S10OD018090-01 von NIGMS. Der Inhalt liegt allein in der Verantwortung der Autoren und spiegelt nicht unbedingt die offizielle Meinung des National Institute of General Medical Sciences oder der National Institutes of Health wider.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
#5 forceps | WPI | 500342 | |
4/0 surgical suture | Braintree Sci | SUT-S 108 | |
Aquarium air stone | uxcell | a regular air stone from a pet store would be fine | |
CaCl2 | Sigma-Aldrich | C5670 | |
CCD detector | Rayonix Inc | MAR 165 CCD | |
Data acquisition system | Aurora Scientific Inc | 610A | |
Elastomer compound | Dow Corning | Sylgard 184 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
High resolution photon counting detector | Dectris Inc | EIGER X 500K | |
High-power bi-phasic current stimulator | Aurora Scientific Inc | 701 | |
Iris Scissors | WPI | 501263-G | |
KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
MgSO4 | Sigma-Aldrich | M7506 | |
Micro scissor | WPI | 503365 | |
Motor/force transducer | Aurora Scientific Inc | 300C-LR | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888 | |
Petri dish | Sigma-Aldrich | CLS430167 | |
Photon counting detector | Dectris Inc | Pilatus 3 1M | |
Stainless Steel wire | McMaster-carr | 8908K21 | |
Suture Tying Forceps | WPI | 504498 | |
Video sarcomere length measuring system | Aurora Scientific Inc | 900B |
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