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* Estos autores han contribuido por igual
Los protocolos aquí descritos proporcionan una guía para visualizar y cuantificar la actividad de las proteasas de neutrófilos en el esputo humano. Las aplicaciones de este tipo de análisis abarcan desde la evaluación de tratamientos antiinflamatorios hasta la validación de biomarcadores, el cribado de fármacos y los estudios clínicos de cohortes grandes.
Las proteasas son reguladores de innumerables procesos fisiológicos y la investigación precisa de sus actividades sigue siendo un desafío biomédico intrigante. Entre las ~600 proteasas codificadas por el genoma humano, las proteasas de serina de neutrófilos (NSP) se investigan a fondo por su implicación en la aparición y progresión de afecciones inflamatorias, incluidas las enfermedades respiratorias. De manera única, los NSP secretados no solo difunden dentro de los fluidos extracelulares, sino que también se localizan en las membranas plasmáticas. Durante la formación de trampa extracelular de neutrófilos (NETs), los NSP se convierten en una parte integral de la cromatina secretada. Tal comportamiento complejo hace la comprensión de la fisiopatología NSPs una tarea desafiadora. Aquí, se muestran protocolos detallados para visualizar, cuantificar y discriminar las actividades libres y unidas a membrana de la elastasa de neutrófilos (NE) y la catepsina G (CG) en muestras de esputo. Ne y CG son NSP cuyas actividades tienen papeles pleiotrópicos en la patogénesis de la fibrosis quística (FQ) y la enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC): promueven la remodelación de los tejidos, regulan las respuestas inmunes aguas abajo y se correlacionan con la gravedad de la enfermedad pulmonar. Los protocolos muestran cómo separar el fluido y la fracción celular, así como el aislamiento de neutrófilos del esputo humano para la cuantificación de la actividad enzimática a través de reporteros basados en la transferencia de energía de resonancia Förster de molécula pequeña (FRET). Para recopilar información específica sobre el papel relativo de las actividades ne y cg, una lectura fret se puede medir por diferentes tecnologías: i) mediciones de lector de placas in vitro permiten un alto rendimiento y la detección a granel de la actividad de la proteasa; ii) la microscopia confocal espaciotemporal resuelve actividad membrana-limitada en la superficie celular; iii) la citometría de flujo FRET de molécula pequeña permite la evaluación rápida de tratamientos antiinflamatorios a través de la cuantificación y fenotipado de la actividad de la proteasa unicelular. La implementación de tales métodos abre las puertas para explorar la patobiología de los NSP y su potencial como biomarcadores de la gravedad de la enfermedad para la FQ y la EPOC. Dado su potencial de estandarización, su sólida lectura y la simplicidad de la transferencia, las técnicas descritas se pueden compartir inmediatamente para su implementación entre laboratorios de investigación y diagnóstico.
La elastasa de neutrófilos (NE), la catepsina G (CG), la proteinasa 3 (PR3) y la proteasa de serina de neutrófilos 4 (NSP4) son las cuatro proteasas de serina de neutrófilos (NSP)1. Se almacenan, junto con mieloperoxidasa, dentro de gránulos neutrófilos primarios o azurófilos. Debido a su elevado contenido proteolítico, la secreción de gránulos primarios está estrechamente regulada y los neutrófilos tienen que ser desafiados secuencialmente con estímulos cebados y activadores2.
Dentro del fagolinosoma, los NSP funcionan como agentes bactericidas intracelulares3. Cuando se secretan, los NSP se convierten en fuertes mediadores de la inflamación: escinden citoquinas y receptores superficiales, activando vías proinflamatorias paralelas3. Es importante destacar que las condiciones inflamatorias presentan una secreción incontrolada de NSP. Por ejemplo, dentro de las vías respiratorias inflamadas, la actividad excesiva de NE causa hipersecreción de moco, metaplasia de células caliciformes, inactivación de CFTR y remodelación de la matriz extracelular4,5. La catepsina G también participa en la inflamación: escinde y activa específicamente dos componentes de la familia IL-1, IL-36α e IL-36β6. En concierto con NE, CG escinde los receptores activados por proteasa en el epitelio de las vías respiratorias y también activa TNF-α e IL-1β.
Las antiprotasas endógenas como la alfa-1-antitripsina, la alfa-1-antiquimotripsina y el inhibidor secretor de la proteasa leucocitaria regulan la actividad neutrophil elastasa y la catepsina G5. Sin embargo, en el transcurso de la progresión de la enfermedad pulmonar, la secreción continua de proteasas excede estequiométricamente el escudo antiprotease, lo que lleva a la neutrofilia no resolutiva en las vías respiratorias, empeoramiento de la inflamación y daño tisular5,7. Aunque la concentración de NE y la actividad en fracciones solubles de las vías respiratorias de los pacientes ha demostrado ser un biomarcador prometedor de la gravedad de la enfermedad8,NE y CG también se asocian a la membrana plasmática de neutrófilos y al ADN extracelular a través de interacciones electrostáticas9,10 donde se vuelven menos accesibles a las anti-proteasas. Es importante destacar que los estudios preclínicos definieron un escenario en el que la actividad de la proteasa asociada a la superficie celular aparece antes y/o independientemente de su contraparte soluble4,11. De hecho, para llegar a ser detectable, la actividad libre de la proteasa primero necesita abrumar el escudo de la anti-proteasa. En cambio, en la superficie celular, la actividad de la proteasa unida a la membrana permanece al menos parcialmente intacta debido a la inaccesibilidad de los inhibidores grandes de la membrana plasmática celular12. Tal comportamiento complejo de la proteasa tiene consecuencias importantes sobre inicio y la propagación neutrófilo-mediados de la inflamación, y por lo tanto necesita ser investigado con las herramientas exactas e informativas.
A lo largo de los años, las sondas basadas en la transferencia de energía de resonancia de Förster (FRET) encontraron numerosas aplicaciones biomédicas como herramientas que evalúan de manera eficiente y rápida una actividad proteasa específica en muestras humanas13. Para funcionar, los reporteros de proteasas se componen de un motivo de reconocimiento (es decir, un péptido), que es reconocido por la enzima diana y se basan en FRET, un proceso físico donde, tras la excitación, un fluoróforo donante transfiere energía a una molécula aceptora. El procesamiento operado por la enzima en el reportero, es decir, la escisión de la parte de reconocimiento, da lugar a que el aceptor se difunda lejos del donante: por lo tanto, la actividad enzimática se mide como un cambio dependiente del tiempo en el donante sobre la fluorescencia del aceptor. Dicha lectura es auto-normalizante y ratiométrica, por lo tanto, sólo marginalmente afectada por condiciones ambientales como el pH y la concentración local de la sonda. NEmo-114 y sSAM15 son sondas FRET que informan específicamente sobre la actividad NE y CG, respectivamente. Sin embargo, tales reporteros no localizan específicamente a ningún compartimiento celular, por lo tanto se emplean para supervisar la actividad de la proteasa presente en líquidos humanos. Con el fin de monitorear la actividad de la proteasa de una manera espacialmente localizada, nosotros y otros desarrollamos sondas FRET que se asocian a componentes subcelulares a través de etiquetas moleculares14,15,16,17,18,19. Tal estrategia sintética permitió el desarrollo de NEmo-2 y mSAM, dos sondas FRET equipadas con anclajes lipídicos que se localizan en la membrana plasmática. Estos reporteros impulsaron una comprensión más profunda de las proteasas NE y CG en la fibrosis quística y las enfermedades pulmonares obstructivas crónicas14,15.
Aquí, se proporcionan protocolos detallados para la visualización y cuantificación de actividades solubles y unidas a membranas NE y CG en esputo humano por medio de la serie NEmo y SAM de sondas FRET. Para abordar diversos aspectos de la fisiopatología NSP y proporcionar una serie de métodos que se pueden emplear de acuerdo con la necesidad específica del usuario, se muestra el análisis a través de espectroscopia de fluorescencia, microscopía de fluorescencia y citometría de flujo.
Los siguientes protocolos describen el análisis realizado en esputo humano. El manejo de muestras en humanos fue aprobado por el comité de ética de la Universidad de Heidelberg y se obtuvo el consentimiento informado por escrito de todos los pacientes o de sus padres/tutores legales (S-370/2011) y controles sanos (S-046/2009).
NOTA: Los siguientes protocolos describen la preparación de la muestra y la cuantificación de la actividad de las proteasas de serina de neutrófilos (NSP). Los procedimientos experimentales presentados aquí se centran en el esputo humano y la elastasa14,20,21 (NE) o la medición de la actividad de la catepsina G15 (CG). Sin embargo, las adaptaciones leves en el protocolo de la preparación de la muestra hacen el análisis de las células sangre-derivadas y de los homogenados del tumor posibles. Además, las actividades de la metaloproteinasa 12 y de la catepsina S de la matriz se pueden investigar semejantemente por medio de las puntas de prueba dedicadas22,23,24,25,26.
1. Preparación de la muestra: aislamiento celular y separación de sobrenadantes
NOTA: Si es posible, el tratamiento del esputo debe llevarse a cabo dentro de los 120 minutos después de la expectoración y el esputo debe almacenarse en el hielo hasta su posterior procesamiento.
2. Medición de la actividad de la proteasa de la serina de neutrófilos
NOTA: Aquí, se introducen diferentes métodos para cuantificar la actividad de los NSP por medio de reporteros FRET. La elección de la tecnología está dictada por la pregunta biomédica específica y el propósito del experimento. Las sondas presentadas fueron ampliamente probadas para su especificidad contra un conjunto de enzimas pulmonares relevantes14,15. Aunque las sondas son específicas hacia su enzima diana, compruebe siempre la especificidad de la sonda en la muestra clínica de interés. Esto se puede lograr incubando la muestra con un inhibidor específico de la proteasa antes de la adición de la sonda, que debe abolir cualquier aumento en la relación D/A.
Figura 1:Imágenes representativas y cuantificación de la actividad del NE unido a la membrana en neutrófilos aislados del esputo del paciente con FQ. a)Imágenes representativas de microscopía confocal de neutrófilos preincubados (panel superior) durante 10 min con 100 μM de Sivelestat (w/) o no tratados (sin o) (panel inferior) antes de la adición del reportero NEmo-2 (2 μM). La primera columna de la izquierda muestra la mancha nuclear, la segunda el canal donante, la tercera el canal aceptor y la última la relación D/A calculada obtenida dividiendo los canales donante y aceptor píxel por píxel. Los bordes de la región de interés (neutrófilo único) se representan como una línea discontinua. Se indican la escala (10 μm) y las barras de calibración (relación D/A). b)Diagramas de caja y puntos que muestran la relación D/A de neutrófilos de esputo de un paciente representativo con FQ. Las células incubadas con células inhibidoras y no tratadas se muestran en gris y azul, respectivamente. Cada punto representa una célula (N: con inhibidor = 113 y sin inhibidor = 96). Haga clic aquí para ver una versión más amplia de esta figura.
Figura 2:Estrategia de gating y gráficas representativas de la actividad ne unida a la membrana medida en neutrófilos aislados del esputo de los pacientes con FQ. a)Para gatear neutrófilos de esputo se utilizan los siguientes anticuerpos: CD14 (1:50), CD16 (1:50), CD45 (1:33) y CD66b (1:50). Los neutrófilos están bloqueados como 7-AAD-CD45+CD14-CD16+CD66b+ eventos. Los eventos cerrados se analizan para su donante (λexc= 405 nm, λem= 450/50 nm) y aceptor (λexc= 405 nm, λem= 585/42 nm) intensidades medias de fluorescencia (IMF). b)Histogramas representativos de neutrófilos de esputo CF analizados por su actividad ne unida a la membrana. La columna izquierda muestra la señal donante, la columna derecha muestra la señal aceptora. La fila superior muestra las intensidades medias de fluorescencia de las células tratadas con Sivelestat (w/) durante 10 min antes de la adición del reportero. La fila inferior muestra células no tratadas (sin o) cuya fluorescencia del reportero se mide inmediatamente (0 min, gris) y 10 min (azul) después de la adición del reportero. Los neutrófilos están bloqueados de acuerdo con la estrategia mostrada en el panel a. c)La tabla de datos muestra un conjunto de datos representativo que consiste en IMF crudas para el donante y la señal aceptora en neutrófilos medidos en varios puntos de tiempo (0-3-5-10-15-20 min), así como la relación D/A calculada. La relación D/A se puede normalizar, es decir, al punto de tiempo de 0 min (fuente blanca). 0 min indica una grabación realizada tan pronto como sea posible después de la adición del reportero al tubo de flujo con células de esputo teñidas. Los datos de las IMF se muestran como desviación estándar media ± para 1000 neutrófilos. Haga clic aquí para ver una versión más amplia de esta figura.
Los resultados mostrados en la Figura 1a ilustran un conjunto de datos de microscopía representativo. La señal nuclear se utiliza para identificar neutrófilos por sus característicos núcleos segmentados. La región de interés (ROI) se selecciona manualmente (línea discontinua en la Figura 1a). La imagen de la relación D/A se calcula dividiendo las intensidades del canal donante por las intensidades del canal aceptor píxel por píxel. En el último paso se calcula la relación D/A media por celda (ROI). En la Figura 1b cada punto representa la media de un ROI (neutrófilo). Se recomienda tomar imágenes y evaluar unas 100 células por condición.
En la Figura 2ase muestra una estrategia representativa de gating de citometría de flujo. Tal gating permite discriminar y estudiar neutrófilos del esputo. Para evitar derrames de fluorescencia o artefactos de compensación, se recomienda dedicar una línea láser (por ejemplo, láser azul) a la detección de fluorescencia de la sonda FRET. La compensación de fluorescencia de citometría de flujo debe realizarse para los anticuerpos y no para la sonda FRET. La Figura 2b representa la distribución de la IMF a 0 y 10 minutos después de la adición del reportero. Cada fila de la Figura 2c indica los valores medios de las IMF donante y aceptor para 1000 neutrófilos de esputo. La relación D/A se calcula dividiendo las IMF donante y aceptora. El curso del tiempo en la Figura 2c en el lado derecho muestra la progresión de la medición: después de un rápido aumento inicial, la relación D/A alcanza una meseta, de acuerdo con la actividad de la enzima unida a la membrana.
Los protocolos divulgados explican diversos acercamientos para cuantificar la actividad de la elastasa y de la catepsina G del neutrófilo en muestras humanas del esputo. Los puntos críticos para una medición exitosa de la actividad enzimática son el i) el momento preciso y la estandarización del procedimiento operativo y ii) el uso de controles negativos y positivos confiables. Si se cumplen estas condiciones, los métodos descritos no se limitan al esputo, sino que también se pueden adaptar fácilmente al análisis de la actividad de la proteasa en sangre, líquidos de lavado broncoalveolares y secciones de tejido u homogeneados.
Cada una de las tres técnicas tiene sus fortalezas y limitaciones, que a menudo se complementan entre sí. Por ejemplo, la citometría de flujo permite el análisis rápido de poblaciones celulares raras, así como el fenotipado celular, pero carece de información de resolución espacial, que se puede lograr mediante microscopía. En su lugar, las mediciones del lector de placas permiten la evaluación paralela de varias muestras o condiciones de una manera de alto rendimiento. Dado que las células de esputo frescas no se pueden congelar y almacenar, los tres métodos requieren que las muestras se procesen rápidamente después de la expectoración. Esto limita la flexibilidad o el rendimiento de las mediciones de actividad ligadas a la membrana. El desarrollo de un protocolo de citometría de flujo que permita fijar las células después de la adición de la sonda y la escisión enzimática se abriría a la medición paralela de un mayor número de tubos. Además, se debe prestar especial atención a la manipulación y el almacenamiento de las sondas FRET. De hecho, algunos aminoácidos presentes en el sustrato peptídico, como la metionina, experimentan oxidación que conduce a una disminución de la sensibilidad del reportero. Para aumentar la vida útil del reportero (estimado en unos tres meses a 20 °C), se pueden almacenar en alícuotas de pequeño volumen (1-2 μL) bajo gas inerte como nitrógeno o argón.
En la FQ y otras enfermedades pulmonares inflamatorias crónicas es importante detectar la inflamación lo antes posible, y los biomarcadores confiables tienen el potencial de lograr tal objetivo. La posibilidad de detectar la actividad de los PNS unidos a la superficie, que se ha demostrado que es perjudicial para el tejido circundante, también en condiciones en las que no hay actividad libre de NE o es escasa, añade otro nivel de información valiosa, que difícilmente puede lograrse mediante otros métodos existentes4,11.
Los reporteros se pueden utilizar para estudiar el vínculo de la actividad asociada membrana-limitada de NSP con severidad y la progresión de la enfermedad pulmonar, especialmente en su temprano-inicio. Los métodos se pueden utilizar para supervisar la eficacia del tratamiento (por ejemplo, tratamientos antiinflamatorios o moduladores y potenciadores de CFTR altamente efectivos28)e investigar la amortiguación resultante de la inflamación impulsada por neutrófilos. Además, los protocolos se basan en procedimientos de muestra no invasivos que conllevan un riesgo muy bajo para el paciente y, por lo tanto, se pueden utilizar a una escala muy amplia y abrir las puertas a numerosas aplicaciones interesantes.
Los autores declaran que no hay conflicto de intereses.
Este proyecto contó con el apoyo de subvenciones del Ministerio alemán de Educación e Investigación (FKZ 82DZL004A1 a M.A.M) y la Fundación Alemana de Investigación (SFB-TR84TP B08 a M.A.M). El trabajo descrito en este manuscrito fue apoyado por el Centro Alemán de Investigación Pulmonar (DZL) y el EMBL Heidelberg a través de una beca de doctorado para M.G. Agradecemos a J. Schatterny, S. Butz y H. Scheuermann su asistencia técnica experta.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
100 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431752 | |
2300 EnSpire (Multilabel Plate Reader) | PerkinElmer | ||
35x10mm Dish, Nunclon Delta | Thermo Fisher Scientific | 150318 | |
40 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431750 | |
50 mL tubes | Sarstedt | 10535253 | |
7-AAD, viability dye | Bio Legend | 420404 | 5 µL/100 µL |
Balance | OHAUS Instruments (Shanghai) Co., Ltd. | PR124 | |
BD Falcon Round-Bottom Tubes 5 mL | BD Bioscience | 352054 | |
BD LSRFortessa cell analyzer | BD Bioscience | ||
black flat bottom 96 well half area plate | Corning Life Science | 3694 | |
Cathepsin G | Elastin Products Company | SG623 | |
Cathepsin G Inhibitor I | Merck KGaA | 219372 | |
Centrifuge 5418R | Eppendorf AG | EP5401000137 | |
Combitips advanced 1.0 mL | Eppendorf AG | 0030 089 430 | |
cOmplete proteinase inhibitor | Roche | 11697498001 | |
Countig chambers improved Neubauer | Glaswarenfabrik Karl Hecht GmbH & Co KG | 40442 | |
coverslips Ø 25mm | Thermo Fisher Scientific | MENZCB00250RA003 | |
Cytospin 4 | Thermo Fisher Scientific | ||
DRAQ5 (nuclear stain) | BioStatus Limited | DR50050 | 1:10000 |
FACSDiva software, v8.0.1 | BD Bioscience | ||
FcBlock | BD Bioscience | 564219 | |
Fiji (Fiji Is Just ImageJ) | fiji.sc | ||
Flow Jo software, v10 | TreeStar | ||
FluoQ Plugin, v3-97 | |||
Heraeus Megafuge 16R | Thermo Fisher Scientific | ||
Human Sputum Leucocyte Elastase | Elastin Products Company | SE563 | |
Leica SP8 confocal microscope | Leica Microsystems | ||
Mini Rock-Shaker | PEQLAB Biotechnologie GmbH | MR-1 | |
mouse anti-human CD14, Pe-Cy7, clone M5E2 | BD Bioscience | 557742 Lot:8221983 | 1:50 |
mouse anti-human CD16, AF700, clone 3G8 | BD Bioscience | 557820 Lot:8208791 | 1:50 |
mouse anti-human CD45, APC-Cy7, clone 2D1 | BD Bioscience | 557833 Lot:8059688 | 1:33 |
mouse anti-human CD66b, PE/Dazzel 594, clone G10F5 | BioLegend | 305122 Lot:B241921 | 1:50 |
mSAM | in house | 2 mM | |
Multipette plus | Eppendorf AG | ||
NEmo-1 | SiChem | SC-0200 | 1 mM |
NEmo-2E | SiChem | SC-0201 | 2 mM |
Pari Boy SX with an LC Sprint jet nebulizer | Pari | 085G3001 | |
phosphate buffered saline | Gibco | 10010-015 | |
ROTI Histokitt (mounting medium) | Carl Roth GmbH + Co.KG | 6638.1 | |
Salbutamol | Teva GmbH | ||
Sivelestat | Cayman Chemicals | 17779 | |
Sputolysin | Calbiochem | 560000-1SET | |
sSAM | in house | 2 mM | |
SuperFrost Plus Adhesion slides | Thermo Fisher Scientific | 10149870 | |
Trypan Blue solution | Sigma-Aldrich | T8154 |
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